# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hg03847.fasta.huge -Q ../query/KIAA0535.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0535, 1047 aa vs ./tmplib.23663 library 1986458 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4967+/-0.00657; mu= 4.5481+/- 0.445 mean_var=171.9855+/-42.792, 0's: 0 Z-trim: 4 B-trim: 87 in 2/38 Lambda= 0.097798 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0835 ( 1167 res) hj05861 (1167) 2484 363.4 9.9e-101 KIAA1050 ( 829 res) hh03308 ( 829) 2468 361.0 3.7e-100 KIAA1106 ( 1154 res) fg01888 (1154) 2249 330.3 9.4e-91 KIAA0681 ( 538 res) hk02748 ( 538) 193 39.9 0.0011 >>KIAA0835 ( 1167 res) hj05861 (1167 aa) initn: 1953 init1: 699 opt: 2484 Z-score: 1900.3 bits: 363.4 E(): 9.9e-101 Smith-Waterman score: 2835; 45.673% identity (67.524% similar) in 1167 aa overlap (1-1047:47-1167) 10 20 30 KIAA05 MDAEAEDKTLRTRSKGTEVPMDSLIQELSV :. : ::: :::::. . : .. .:: KIAA08 FRGELLNQRWTHGGKASSCRTSRHLGRHCKMSLENEDKRARTRSKALRGPPETTAADLSC 20 30 40 50 60 70 40 50 60 KIAA05 A--------------------YDCSMAKKRTAEDQALGVPVNKRKSLLMK---PRHYSPK .: .:::: : :.:::: .: . :. 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KIAA08 EEGEKGLFIQPEDAEEVVEVTTERSQDLCPQSLEDAASEESSKQKGILSHEEEDEEEEEE 260 270 280 290 300 310 220 230 240 250 260 KIAA05 RVPKYVLTDHKKDLLEVPEIKTEGDKFIPCENRCDSETE-------RKDPQNALAE--P- . . ..... : : . : .. :.. . : : ..: ... :. : KIAA08 EEEEEEDEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEAAPDVIFQEDTSHTSAQKAPE 320 330 340 350 360 370 270 280 290 300 310 KIAA05 LDGNAQPSFP-------------DVEEEDSESLAVMTEEGSDLEK--AKGNLSLLEQAIA : : .:: : : ..::..: . . :... ..:::.::::::: KIAA08 LRGPESPS-PKPEYSVIVEVRSDDDKDEDTHSRKSTVTDESEMQDMMTRGNLGLLEQAIA 380 390 400 410 420 430 320 330 340 350 360 KIAA05 LQAERG---CVFHNTYKELDRFLLEHLAGER-RQTKVIDMGGRQIFNNKHSPRPEKRETK :.::. : : ... : :: . .: .: :. . .: : :::: : KIAA08 LKAEQVRTVCEPGCPPAEQSQLGL----GEPGKAAKPLDTV-RKSYYSKDPSRAEKREIK 440 450 460 470 480 370 380 390 400 410 420 KIAA05 CPIPGCDGTGHVTGLYPHHRSLSGCPHKVRVPLEILAMHENVLKCPTPGCTGRGHVNSNR :: ::::::::::::::::::::::::: :.: :::::::::::::::::::.::::::: KIAA08 CPTPGCDGTGHVTGLYPHHRSLSGCPHKDRIPPEILAMHENVLKCPTPGCTGQGHVNSNR 490 500 510 520 530 540 430 440 450 460 470 KIAA05 NTHRSLSGCPIAAAEKLAMSQDKNQLDSPQTGQCPDQAHRTS--------LVKQIEFN-- :::::::::::::::::: :..:.: ::::. :... .: .:::.: KIAA08 NTHRSLSGCPIAAAEKLAKSHEKQQ---PQTGD-PSKSSSNSDRILRPMCFVKQLEVPPY 550 560 570 580 590 600 480 490 500 510 520 530 KIAA05 ---FPSQAITSPRATVSKEQEKFGKVPFDYASFDAQVFGKRPLIQTVQGRKTPPFPESKH :. : ..:::...:: :::.:: :::::::::::::: : .: .: : : KIAA08 GSYRPNVAPATPRANLAKELEKFSKVTFDYASFDAQVFGKRMLAPKIQTSETSP----KA 610 620 630 640 650 540 550 560 570 580 590 KIAA05 FPNPVKFPNRLPSAGAHTQSPGRASSYSYGQCSEDTHIAAAAAILNLSTRCREATDILSN : . ..:.: .: .:.::.: :::::::: : . ::. KIAA08 F-----------------------QCFDYSQDAEAAHMAATA-ILNLSTRCWEMPENLST 660 670 680 690 600 610 620 630 640 KIAA05 KPQSLHAKGAEIEVDENGTLDLSMKKNRILDKSAPLTSSNTSIP---TPSSSPFKTS--- :::.: .:...:::::::::::::.:.: ... : .:: .: : .:..: ..: KIAA08 KPQDLPSKSVDIEVDENGTLDLSMHKHRKRENAFPSSSSCSSSPGVKSPDASQRHSSTSA 700 710 720 730 740 750 650 660 670 680 690 KIAA05 --SILVNAAFYQALCDQEGWDTPINYSK-THGKTEEEKEKDPVS-------------SLE : ... :: :. :: :..:.: .. . :: .:..:.. : : KIAA08 PSSSMTSPQSSQA-SRQDEWDRPLDYTKPSRLREEEPEESEPAAHSFASSEADDQEVSEE 760 770 780 790 800 810 700 710 720 730 740 750 KIAA05 NLEEKKFPGEASIPSPKPKLHARDLKKELITCPTPGCDGSGHVTGNYASHRSVSGCPLAD :.::.:.:::... . : :. ..:.::::.::::::::::::.:::::::::.::::::: KIAA08 NFEERKYPGEVTLTNFKLKFLSKDIKKELLTCPTPGCDGSGHITGNYASHRSLSGCPLAD 820 830 840 850 860 870 760 770 780 790 800 810 KIAA05 KTLKSLMAANSQELKCPTPGCDGSGHVTGNYASHRSLSGCPRARKGGVKMTPTKEEKEDP :.:..::::.: .:::::::::::::.::::::::::::::::.:.:::..:::..:::: KIAA08 KSLRNLMAAHSADLKCPTPGCDGSGHITGNYASHRSLSGCPRAKKSGVKVAPTKDDKEDP 880 890 900 910 920 930 820 830 840 850 860 870 KIAA05 EL-KCPVIGCDGQGHISGKYTSHRTASGCPLAAKRQKENPLNGASLSWKLNKQELPHCPL :: :::: :: : :::::::.:::.::::::::.::::. :::.:.::: :.: : :: KIAA08 ELMKCPVPGCVGLGHISGKYASHRSASGCPLAARRQKEGSLNGSSFSWKSLKNEGPTCPT 940 950 960 970 980 990 880 890 900 910 920 930 KIAA05 PGCNGLGHVNNVFVTHRSLSGCPLNAQVIKKGKVS-EELMTIKLKATGGIESDEEIRHLD :::.: ::.:. :.::::::::: . . ::::.: .:... :.:.. .:.::::..:. KIAA08 PGCDGSGHANGSFLTHRSLSGCPRATFAGKKGKLSGDEVLSPKFKTSDVLENDEEIKQLN 1000 1010 1020 1030 1040 1050 940 950 960 970 980 990 KIAA05 EEIKELNESNLKIEADMMKLQTQITSMESNLKTIEEENKLIEQNNESLLKELAGLSQALI .::..::::: ..:: :..::.::.:::.:::.:::::::::..::.:. ::.::::::: KIAA08 QEIRDLNESNSEMEAAMVQLQSQISSMEKNLKNIEEENKLIEEQNEALFLELSGLSQALI 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1000 1010 1020 1030 1040 KIAA05 SSLADIQLPQMGPISEQNFEAYVNTLTDMYSNLERDYSPECKALLESIKQAVKGIHV .:::.:.::.: :: ::::.:::.:::::::: . :: : :::::::::.::.: KIAA08 QSLANIRLPHMEPICEQNFDAYVSTLTDMYSNQD----PENKDLLESIKQAVRGIQV 1120 1130 1140 1150 1160 >>KIAA1050 ( 829 res) hh03308 (829 aa) initn: 1953 init1: 699 opt: 2468 Z-score: 1890.0 bits: 361.0 E(): 3.7e-100 Smith-Waterman score: 2740; 55.897% identity (75.921% similar) in 814 aa overlap (277-1047:58-829) 250 260 270 280 290 300 KIAA05 ENRCDSETERKDPQNALAEPLDGNAQPSFPDVEEEDSESLAVMTEEGSDLEK--AKGNLS : ..::..: . . :... ..:::. KIAA10 TSAQKAPELRGPESPSPKPEYSVIVEVRSDDDKDEDTHSRKSTVTDESEMQDMMTRGNLG 30 40 50 60 70 80 310 320 330 340 350 360 KIAA05 LLEQAIALQAERG---CVFHNTYKELDRFLLEHLAGER-RQTKVIDMGGRQIFNNKHSPR ::::::::.::. : : ... : :: . .: .: :. . .: : KIAA10 LLEQAIALKAEQVRTVCEPGCPPAEQSQLGL----GEPGKAAKPLDTV-RKSYYSKDPSR 90 100 110 120 130 140 370 380 390 400 410 420 KIAA05 PEKRETKCPIPGCDGTGHVTGLYPHHRSLSGCPHKVRVPLEILAMHENVLKCPTPGCTGR :::: ::: ::::::::::::::::::::::::: :.: :::::::::::::::::::. 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KIAA10 RHSSTSAPSSSMTSPQSSQA-SRQDEWDRPLDYTKPSRLREEEPEESEPAAHSFASSEAD 420 430 440 450 460 690 700 710 720 730 740 KIAA05 ----SLENLEEKKFPGEASIPSPKPKLHARDLKKELITCPTPGCDGSGHVTGNYASHRSV : ::.::.:.:::... . : :. ..:.::::.::::::::::::.:::::::::. KIAA10 DQEVSEENFEERKYPGEVTLTNFKLKFLSKDIKKELLTCPTPGCDGSGHITGNYASHRSL 470 480 490 500 510 520 750 760 770 780 790 800 KIAA05 SGCPLADKTLKSLMAANSQELKCPTPGCDGSGHVTGNYASHRSLSGCPRARKGGVKMTPT ::::::::.:..::::.: .:::::::::::::.::::::::::::::::.:.:::..:: KIAA10 SGCPLADKSLRNLMAAHSADLKCPTPGCDGSGHITGNYASHRSLSGCPRAKKSGVKVAPT 530 540 550 560 570 580 810 820 830 840 850 860 KIAA05 KEEKEDPEL-KCPVIGCDGQGHISGKYTSHRTASGCPLAAKRQKENPLNGASLSWKLNKQ :..:::::: :::: :: : :::::::.:::.::::::::.::::. :::.:.::: :. KIAA10 KDDKEDPELMKCPVPGCVGLGHISGKYASHRSASGCPLAARRQKEGSLNGSSFSWKSLKN 590 600 610 620 630 640 870 880 890 900 910 920 KIAA05 ELPHCPLPGCNGLGHVNNVFVTHRSLSGCPLNAQVIKKGKVS-EELMTIKLKATGGIESD : : :: :::.: ::.:. :.::::::::: . . ::::.: .:... :.:.. .:.: KIAA10 EGPTCPTPGCDGSGHANGSFLTHRSLSGCPRATFAGKKGKLSGDEVLSPKFKTSDVLEND 650 660 670 680 690 700 930 940 950 960 970 980 KIAA05 EEIRHLDEEIKELNESNLKIEADMMKLQTQITSMESNLKTIEEENKLIEQNNESLLKELA :::..:..::..::::: ..:: :..::.::.:::.:::.:::::::::..::.:. ::. KIAA10 EEIKQLNQEIRDLNESNSEMEAAMVQLQSQISSMEKNLKNIEEENKLIEEQNEALFLELS 710 720 730 740 750 760 990 1000 1010 1020 1030 1040 KIAA05 GLSQALISSLADIQLPQMGPISEQNFEAYVNTLTDMYSNLERDYSPECKALLESIKQAVK :::::::.:::.:.::.: :: ::::.:::.:::::::: . :: : :::::::::. 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