# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hg03820s1.fasta.huge -Q ../query/KIAA0534.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0534, 1028 aa vs ./tmplib.23663 library 1986477 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 3.9441+/-0.00601; mu= 23.8718+/- 0.411 mean_var=129.6624+/-30.498, 0's: 0 Z-trim: 16 B-trim: 8 in 1/39 Lambda= 0.112633 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0548 ( 452 res) hh00769 ( 452) 2273 381.2 1.7e-106 KIAA0817 ( 2785 res) hg01392s2 (2785) 390 76.7 4.8e-14 KIAA0149 ( 830 res) ha01221 ( 830) 238 51.0 7.6e-07 KIAA0533 ( 1645 res) hg03784 (1645) 229 50.1 2.8e-06 KIAA0815 ( 1640 res) sh06087 (1640) 220 48.6 7.8e-06 KIAA1781 ( 974 res) fg06971(revised) ( 974) 204 45.6 3.8e-05 KIAA1857 ( 549 res) fk03350 ( 549) 188 42.6 0.00018 KIAA1907 ( 1737 res) ah00504 (1737) 186 43.2 0.00037 KIAA1780 ( 1192 res) pf01012 (1192) 182 42.2 0.00049 KIAA1332 ( 651 res) fh15405 ( 651) 178 41.1 0.00059 KIAA0818 ( 375 res) hj00220 ( 375) 172 39.7 0.0009 KIAA0163 ( 550 res) ha01059 ( 550) 162 38.3 0.0033 KIAA0813 ( 1618 res) pf00581 (1618) 164 39.5 0.0043 >>KIAA0548 ( 452 res) hh00769 (452 aa) initn: 2261 init1: 1943 opt: 2273 Z-score: 2004.0 bits: 381.2 E(): 1.7e-106 Smith-Waterman score: 2273; 68.000% identity (88.000% similar) in 450 aa overlap (585-1028:3-452) 560 570 580 590 600 610 KIAA05 CMWCSSTKRCVDSNAYIISFPYGQCLEWQTATCSPQNCSGLRTCGQCLEQPGCGWCNDPS .:: :.:::: ::..::::::::::.::: KIAA05 TMSTCPPENCSGYCTCSHCLEQPGCGWCTDPS 10 20 30 620 630 640 650 660 KIAA05 NTGRGHCIEGSSRGPMKL-----IGMHHNEMVLDTNLCPKEKNYEWSFIQCPACQCNGHS :::.:.::::: .::.:. : . . .:....: ... :.::::.:::::::::: KIAA05 NTGKGKCIEGSYKGPVKMPSQAPTGNFYPQPLLNSSMCLEDSRYNWSFIHCPACQCNGHS 40 50 60 70 80 90 670 680 690 700 710 720 KIAA05 TCINNNVCEQCKNLTTGKQCQDCMPGYYGDPTNGGQCTACTCSGHANICHLHTGKCFCTT :::...::.:.::::::.:. :. :.::::::::.: : :.:::..:. .:::::::: KIAA05 KCINQSICEKCENLTTGKHCETCISGFYGDPTNGGKCQPCKCNGHASLCNTNTGKCFCTT 100 110 120 130 140 150 730 740 750 760 770 780 KIAA05 KGIKGDQCQLCDSENRYVGNPLRGTCYYSLLIDYQFTFSLLQEDDRHHTAINFIANPEQS ::.:::.::::. :::: ::::::::::.::::::::::: :::::..:::::.:.:... 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KIAA08 RPRGDLMAYKVPPFVFQAPAPDYHLDYCSMYTDHSVC-SRDP--ECSWCQGACQAAPPPG 550 560 570 580 590 300 310 320 330 340 KIAA05 TNNILRAKCPPKTAASDDRCYRYADCASC------TANTNG---CQWCDDKKCISANSNC : : : :: . . : .:: .: :: : :: : .: KIAA08 TP--LGA-CPAASCLGLGRL--LGDCQACLAFSSPTAPPRGPGTLGWC------VHNESC 600 610 620 630 640 350 360 370 380 390 KIAA05 SMSVKNYTKCHVRNEQICNKL----------TSCKSCSLN-----LNCQWDQRQQECQAL . . ..: :.::: . . :: ..: . :. :. . . KIAA08 -LPRPEQARC--RGEQISGTVGWWGPAPVFVTSLEACVTQSFLPGLHLLTFQQPPNTSQP 650 660 670 680 690 700 400 410 420 430 440 KIAA05 PAHLCGEGWSHIGDACLRVN---SSR----ENYDNAKLYCYNLSGNLASLTTSKEVEFVL . :. .: :.. :.: . :. : ...:.: . . . :..: KIAA08 DKEEVGRWVAHQEKETRRLQRPGSARLFPLPGRDHK--YAVEIQGQLNGSAGPGHSELTL 710 720 730 740 750 760 450 460 470 480 KIAA05 ----------DEI-----QKYTQQKVSPWVG-LRKINISYWGWEDMSPFTNTTLQWLPGE .:: . : ... . . . : . . :: .:..: . : KIAA08 LWDRTGVPGGSEISFFFLEPYRSSSCTSYSSCLGCLADQGCGWC----LTSATCHLRQGG 770 780 790 800 810 490 500 510 520 KIAA05 PN--DSG-----------FCAYLE--RAAVAGLKANPC-----TSMANGLVCEKPVVSPN . :.: .: : : : . : :: . .: . . . KIAA08 AHCGDDGAGGSLLVLVPTLCPLCEEHRDCHACTQDPFCEWHQSTSRKGDAACSRRGRGRG 820 830 840 850 860 870 530 540 550 560 570 580 KIAA05 QNARP--CKKPCSLRTSCSNCTSNGMECMWCSSTKRCVDSNAYIISFPYGQCLEWQTATC : : :: : .: .: .:. .: ::.::. : ::. .:.: : :. .. KIAA08 ALKSPEECPPLCSQRLTCEDCLANSSQCAWCQSTHTCFLFAAYLARYPHGGCRGWDDSVH 880 890 900 910 920 930 590 600 610 620 630 KIAA05 S-PQ--NCSGLRTCGQCLEQPGCGWCNDPSNTGRGHCIEGSSRGPM----------KLIG : :. .:.:. :: .::.. ::::.. .: :.:..:. ::. . .: KIAA08 SEPRCRSCDGFLTCHECLQSHECGWCGNEDNPTLGRCLQGDFSGPLGGGNCSLWVGEGLG 940 950 960 970 980 990 640 650 660 KIAA05 M--------------------------HHNEMVLDTNL---CPKEKNYEWSFI-QC---- . : :.: : : ...:. . : .: KIAA08 LPVALPARWAYARCPDVDECRLGLARCHPRATCLNTPLSYECHCQRGYQGDGISHCNRTC 1000 1010 1020 1030 1040 1050 670 KIAA05 -------------------------------PA-----------CQCNGHSTCINNN--V :: : :. :: : . . KIAA08 LEDCGHGVCSGPPDFTCVCDLGWTSDLPPPTPAPGPPAPRCSRDCGCSFHSHCRKRGPGF 1060 1070 1080 1090 1100 1110 680 690 700 710 720 730 KIAA05 CEQCKNLTTGKQCQDCMPGYYGDPTNGGQCTACTCSGHANI----CHLHTGKCFCTTKGI :..:.. : :..:. : :: .:. :.. : : :.::.. : .: ::: . KIAA08 CDECQDWTWGEHCERCRPGSFGNATGSRGCRPCQCNGHGDPRRGHCDNLSGLCFCQDH-T 1120 1130 1140 1150 1160 1170 740 750 760 770 780 790 KIAA05 KGDQCQLCDSENRYVGNPLRG-TCYYSLLIDYQFTFSLLQEDDRHHTAINFIANPEQSNK .: .::::. : :.: : .:. KIAA08 EGAHCQLCSP--GYYGDPRAGGSCFRECGGRALLTNVSSVALGSRRVGGLLPPGGGAARA 1180 1190 1200 1210 1220 1230 >>KIAA0149 ( 830 res) ha01221 (830 aa) initn: 117 init1: 58 opt: 238 Z-score: 214.8 bits: 51.0 E(): 7.6e-07 Smith-Waterman score: 238; 26.122% identity (47.755% similar) in 245 aa overlap (509-738:117-339) 480 490 500 510 520 530 KIAA05 TNTTLQWLPGEPNDSGFCAYLERAAVAGLKANPCTSMANGLVCEKPVV-SPNQNARPCKK : : . : :: : . .:. : KIAA01 SSRCPGQYWGPDCRESCPCHPHGQCEPATGACQCQADRWGARCEFPCACGPHGRCDPATG 90 100 110 120 130 140 540 550 560 570 580 590 KIAA05 PCSLRTS--CSNCTSNGMECMWCSSTKRCVDSNAYIISFPYGQCLEWQTATCSPQ-NCSG : . . :.: :. ... :: .... . : : : :: . :: : KIAA01 VCHCEPGWWSSTCRR---PCQCNTAAARCEQATGACVCKP-G----WWGRRCSFRCNCHG 150 160 170 180 190 600 610 620 630 640 KIAA05 LRTC----GQCLEQPGCGW---CNDPSNTGRGHCIEGSSRGPMKLIGMHHNEMVLDTNLC : :.: .:: : :.. . ::.: .:.. :.. . : : KIAA01 -SPCEQDSGRCACRPG-WWGPECQQQCECVRGRCSAASGECTCP-PGFRGARCELP---C 200 210 220 230 240 250 650 660 670 680 690 700 KIAA05 PKEKNYEWSFIQCP-AC-QCNGHSTCI-NNNVCEQCKNLTTGKQCQD-CMPGYYGDPTNG : .. .:: .: .:. . : ... ::.:. .: :::. :.:: .:. . KIAA01 PAGSHG----VQCAHSCGRCKHNEPCSPDTGSCESCEPGWNGTQCQQPCLPGTFGESCEQ 260 270 280 290 300 710 720 730 740 750 760 KIAA05 GQCTACTCSGHANICHLHTGKCFCTTKGIKGDQCQLCDSENRYVGNPLRGTCYYSLLIDY :: : :.. :. ::.: : : .:. KIAA01 -QCPHCR---HGEACEPDTGHCQRCDPGWLGPRCEDPCPTGTFGEDCGSTCPTCVQGSCD 310 320 330 340 350 360 770 780 790 800 810 820 KIAA05 QFTFSLLQEDDRHHTAINFIANPEQSNKNLDISINASNNFNLNITWSVGSTAGTISGEET KIAA01 TVTGDCVCSAGYWGPSCNASCPAGFHGNNCSVPCECPEGLCHPVSGSCQPGSGSRDTALI 370 380 390 400 410 420 >>KIAA0533 ( 1645 res) hg03784 (1645 aa) initn: 136 init1: 84 opt: 229 Z-score: 204.5 bits: 50.1 E(): 2.8e-06 Smith-Waterman score: 229; 29.197% identity (56.934% similar) in 137 aa overlap (647-775:1-130) 620 630 640 650 660 670 KIAA05 GRGHCIEGSSRGPMKLIGMHHNEMVLDTNLCPKEKNYEWSFIQCPACQ---CNGH---ST : . .. ...: : .:. :. : KIAA05 CDRCQEGHFGFNGCGGCRPCACGPAAEGSE 10 20 30 680 690 700 710 720 730 KIAA05 CINNNVCEQCKNLTTGKQCQDCMPGYYGDPTNGGQCTACTCSGHANICHLHTGKCFCTTK : .. .:. : : ::..: :::.: : .: : : : : : :::.: : KIAA05 CHPQSGQCHCRPGTMGPQCRECAPGYWGLPEQG--CRRCQCPGGR--CDPHTGRCNCPP- 40 50 60 70 80 740 750 760 770 780 KIAA05 GIKGDQCQLCDSENRYV--GNPLRGTCYYSLLIDYQFTFSLLQEDDRHHTAINFIANPEQ :..:..:. :..... :.:. : . . :. .. ::.. .: KIAA05 GLSGERCDTCSQQHQVPVPGGPV-GHSIHCEVCDHCVVL-LLDDLERAGALLPAIHEQLR 90 100 110 120 130 140 790 800 810 820 830 840 KIAA05 SNKNLDISINASNNFNLNITWSVGSTAGTISGEETSIVSKNNIKEYRDSFSYEKFNFRSN KIAA05 GINASSMAWARLHRLNASIADLQSQLRSPLGPRHETAQQLEVLEQQSTSLGQDARRLGGQ 150 160 170 180 190 200 >>KIAA0815 ( 1640 res) sh06087 (1640 aa) initn: 136 init1: 62 opt: 220 Z-score: 196.6 bits: 48.6 E(): 7.8e-06 Smith-Waterman score: 303; 23.897% identity (42.647% similar) in 544 aa overlap (264-746:793-1286) 240 250 260 270 280 KIAA05 SAVVINGSMYIFGGFSSVLLNDILVYKPPNCKAFRDEELCKNAGP----GIKCVWNKNHC : : . : : . : :..: .. : KIAA08 LGYFGPGCWQACTCPVGVACDSVSGECGKRCPAGFQGEDCGQECPVGTFGVNC---SSSC 770 780 790 800 810 290 300 310 320 330 340 KIAA05 ESWESGNTNNILRAKCPPKTAASDDRCYRYADCASCTANTNGCQW----CDDK-KCISAN . . . .::: .. : : ::: . ::: :. .: . KIAA08 SCGGAPCHGVTGQCRCPPGRTGED--CE--ADCPEGRWGL-GCQEICPACQHAARCDPET 820 830 840 850 860 870 350 360 370 380 390 400 KIAA05 SNCSMSVKNYTKCHVRNEQICNKLTSCKSCSLNLNCQWDQRQQECQALPAHL-CGEGWSH . : . . ... : ...: ::. .: : .:. .: :. ::. 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KIAA17 CHHGGQCDHVT-GQCHCTAGYMGDRCQE--ECPFGSFGFQCSQRCDCHNGGQCSPTTGAC 210 220 230 240 250 260 350 360 370 380 390 400 KIAA05 NCSMSVKNYTKCHVRNEQICNKLTSCKSCSLNLNCQWDQRQQECQALPAHLCGEGWSHIG .: . :. .:. :..: . .:.: :. :. . . : : ::: : KIAA17 ECEPGYKG-PRCQ---ERLCPEGLHGPGCTLPCPCDADNTISCHPVTGACTCQPGWS--G 270 280 290 300 310 410 420 430 440 450 460 KIAA05 DACLRVNSSRENYDNAKLYCYNLSG-NLASLTTSKE-VEFVLDEIQKYTQQKVSPWVGLR : . :. .: : .: . :.: . . . :. . . . KIAA17 HHCNESCPVGYYGDGCQLPCTCQNGADCHSITGGCTCAPGFMGEVCAVSCAAGTYGPNCS 320 330 340 350 360 370 470 480 490 500 510 520 KIAA05 KINISYWGWEDMSPFTNTTLQWLPGEPNDSGFCAYLERAAVAGLKANPCTSMANGLVCEK .: : :: .. . : :. ... ::. : . ::: .: . 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