# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hg02989s1.fasta.huge -Q ../query/KIAA0520.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0520, 1364 aa vs ./tmplib.23663 library 1986141 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0072+/-0.00475; mu= 17.7998+/- 0.324 mean_var=85.7699+/-20.202, 0's: 0 Z-trim: 4 B-trim: 13 in 1/39 Lambda= 0.138486 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0422 ( 1160 res) hh01205s1 (1160) 682 147.1 1.7e-35 KIAA0511 ( 933 res) he00818 ( 933) 639 138.4 5.7e-33 KIAA0037 ( 1088 res) ha00929 (1088) 624 135.5 5.1e-32 KIAA1060 ( 887 res) hh13580 ( 887) 580 126.6 1.9e-29 >>KIAA0422 ( 1160 res) hh01205s1 (1160 aa) initn: 1217 init1: 667 opt: 682 Z-score: 729.0 bits: 147.1 E(): 1.7e-35 Smith-Waterman score: 1300; 28.939% identity (54.975% similar) in 1206 aa overlap (64-1252:142-1153) 40 50 60 70 80 90 KIAA05 GDSNSVRVKINPKQLSSNSHPKHCKYSISSSCSSSGDSGGVPRRVGGGGRLRRQKKLPQL . ...: . .: : .:: ..: :. KIAA04 DDAFIRRGGPGKGKELGLRAVALGFEDTEVTTTAGGTAEVAPDAVPRSGR-SCWRRLVQV 120 130 140 150 160 170 100 110 120 130 140 150 KIAA05 FERASSRWWDPKFDSVNLEEACLERCFPQTQRRFRYALFYIGFACLLWSIYFAVHMRSRL :. . .: :..::. . : ..: . . .. :: .. .: : KIAA04 FQ-------SKQFRSAKLERLYQRYFFQMNQSSLT---LLMAVLVLLTAVLLAFHAAP-- 180 190 200 210 160 170 180 190 200 210 KIAA05 IVMVAPALCFLLVCVGFFLFTFTKLYARH-YAWTSL-ALTLLVFALTLAAQFQVLTPVSG . :: ::.:.. .. . . :: . :. ... .:... :.: :.: KIAA04 -ARPQPAYVALLACAAALFVGLMVVCNRHSFRQDSMWVVSYVVLGILAAVQ------VGG 220 230 240 250 260 270 220 230 240 250 260 270 KIAA05 RGDSSNLTATARPTDTCLSQVGSFSMC-IEVLFLLYTVMHLPLYLSLCLGVAYSVLFETF :.: : .. : : . ... ::.. . . .. :.. :.: . KIAA04 -----ALAADPRSPSAGL-------WCPVFFVYIAYTLLPIRMRAAVLSGLGLSTLHLIL 280 290 300 310 280 290 300 310 320 KIAA05 GYHFRDEACFPSPGAGALHWELLSRG-LLHGCIHAIGVHLFVMSQVRSRSTFLKVGQSIM .... . :. :. :. . :: : ..::. ..: .:..: .. :. KIAA04 AWQLNR--------GDAFLWKQLGANVLLFLCTNVIGICTHYPAEVSQRQAFQETRGYIQ 320 330 340 350 360 370 330 340 350 360 370 380 KIAA05 HGKDLEVEKALKERMIHSVMPRIIADDLMKQGDEESENSVKRHATSSPKNRKKKSSIQKA :. :. .::.. ::.:. .: .. :. . .: KIAA04 ARLHLQHENRQQERLLLSVLPQHVAMEM-----------------------KEDINTKKE 380 390 400 390 400 410 420 430 440 KIAA05 PIAFRPFKMQQIEEVSILFADIVGFTKMSANKSAHALVGLLNDLFGRFDRLCEETKCEKI . :. . .:. ..:::::::: :::..... .:. :: ::.::.:::.: :..: .: KIAA04 DMMFHKIYIQKHDNVSILFADIEGFTSLASQCTAQELVMTLNELFARFDKLAAENHCLRI 410 420 430 440 450 460 450 460 470 480 490 500 KIAA05 STLGDCYYCVAGCPEPRADHAYCCIEMGLGMIKAIEQFCQEKKEMVNMRVGVHTGTVLCG . ::::::::.: :: :::::.::.:::. ::.:: . ::::::.:.: : :: KIAA04 KILGDCYYCVSGLPEARADHAHCCVEMGVDMIEAISLVREVTGVNVNMRVGIHSGRVHCG 470 480 490 500 510 520 510 520 530 540 550 560 KIAA05 ILGMRRFKFDVWSNDVNLANLMEQLGVAGKVHISEATAKYLDDRYEMEDGKVIERLGQSV .::.:...::::::::.::: :: : ::..::..:: .::. ::.: :. :: .. KIAA04 VLGLRKWQFDVWSNDVTLANHMEAGGRAGRIHITRATLQYLNGDYEVEPGRGGER--NAY 530 540 550 560 570 580 570 580 590 600 610 620 KIAA05 VADQLKGLKTYLISG--QRAKESRCSCAEALLSGFEVIDGSQVSSGPRGQGTASSGNVSD . .: ..:.:: : :. :: . :. . . ..: . :: : : KIAA04 LKEQ--HIETFLILGASQKRKEEKAMLAKLQRTRANSMEGLM----PRW--------VPD 590 600 610 620 630 630 640 650 660 670 680 KIAA05 LAQTVKTFDNLKTCPSCGITFAPKSEAGAEGGAPQNGCQDEHKNSTKASGGPNPKTQNGL ..:. : . : : : .: :. : ::..: KIAA04 -----RAFSRTKDSKA----FR------------QMGIDDSSKD--------NRGTQDAL 640 650 660 690 700 710 720 730 740 KIAA05 LSPPQEEKLTNSQTSLCEILQEKGRWAGVSLDQSALLPLRFKNIREKTDAHFVDVIKEDS :..: .:. : . . ::. .: ...: KIAA04 --NPEDE-----------------------VDE-------F--LSRAIDARSIDQLRKDH 670 680 750 760 770 780 790 800 KIAA05 LMKDYFFKPPINQFSLNFLDQELERSYRTSYQEEVIKNSPVKTFASPTFSSLLDVFLSTT . .: :.: ..::..: . ..: :.. . : . KIAA04 ----------VRRFLLTFQREDLEKKYSRK--------------VDPRFGAYVACALLVF 690 700 710 720 810 820 830 840 850 860 KIAA05 VFLTLSTTCFLKYEAATVPPPPAALAVFSAALLLEVLSLAVSIRMVFFLEDVMACTKRLL :. ::.. : :..... .:: .... . :..: . :. KIAA04 CFI-----CFIQL--LIFPHSTLMLGIYASIFLLLLITVLICA--------VYSCGS-LF 730 740 750 760 870 880 890 900 910 920 KIAA05 EWIAGWLPRHCIGAILVSLPALAVYSHVTSEYETNIHFPVFTGSAALIAVVHYCNFCQLS : : . . : :....: : . . : : :. :.... : ..: KIAA04 PKALQRLSRSIVRSRAHST-AVGIFS-VLLVFTSAIANMYFIGNM-LLSLLASSVFLHIS 770 780 790 800 810 820 930 940 950 960 970 980 KIAA05 SWMRSSLATVVGAGPLLLLYVSLCPDSSVLTSP--LDAVQNFSSERNPCNS-SVPRDLRR : . .. :.: :.:: : : .... . : .:....: . .. . : : KIAA04 SIGKLAMIFVLGLIYLVLLL--LGPPATIFDNYDLLLGVHGLASSNETFDGLDCPAAGRV 830 840 850 860 870 880 990 1000 1010 1020 1030 1040 KIAA05 PASLIGQEVVLVFFLLLLLVWFLNREFEVSYRLHYHGDVEADLHRTKIQSMRDQADWLLR . . ..::: : : : .. : . :: . ..: .. ... .. ::. KIAA04 ALKYMTPVILLVFALALYL---HAQQVESTARLDFLWKLQATGEKEEMEELQAYNRRLLH 890 900 910 920 930 940 1050 1060 1070 1080 1090 KIAA05 NIIPYHVAEQL-----KVSQTYSKNHDSGGVIFASIVNFSEFY---EENYEGGKECYRVL ::.: :: .. . .. : .. . .:.::::.:::::: : : :: :: :.: KIAA04 NILPKDVAAHFLARERRNDELYYQSCECVAVMFASIANFSEFYVELEANNEG-VECLRLL 950 960 970 980 990 1000 1100 1110 1120 1130 1140 1150 KIAA05 NELIGDFDELLSKPDYSSIEKIKTIGATYMAASGLNTAQAQDGSHPQEHLQILFEFAKEM ::.:.::::..:. . ..:::::::.::::::::: :.. : . :. : ..: .. KIAA04 NEIIADFDEIISEERFRQLEKIKTIGSTYMAASGLN-ASTYDQVG-RSHITALADYAMRL 1010 1020 1030 1040 1050 1160 1170 1180 1190 1200 1210 KIAA05 MRVVDDFNSNMLWFNFKLRVGFNHGPLTAGVIGTTKLLYDIWGDTVNIASRMDTTGVECR :. . .: . . ::....:.: ::..:::::. : :::::.:::..::::.::: : KIAA04 MEQMKHINEHSFN-NFQMKIGLNMGPVVAGVIGARKPQYDIWGNTVNVSSRMDSTGVPDR 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1220 1230 1240 1250 1260 1270 KIAA05 IQVSEESYRVLSKMGYDFDYRGTVNVKGKGQMKTYLYPKCTDHRVIPQHQLSISPDIRVQ :::. . :.::. ::... ::.:.:::::.: ::. KIAA04 IQVTTDLYQVLAAKGYQLECRGVVKVKGKGEMTTYFLNGGPSS 1120 1130 1140 1150 1160 1280 1290 1300 1310 1320 1330 KIAA05 VDGSIGRSPTDEIANLVPSVQYVDKTSLGSDSSTQAKDAHLSPKRPWKEPVKAEERGRFG >>KIAA0511 ( 933 res) he00818 (933 aa) initn: 1132 init1: 600 opt: 639 Z-score: 683.8 bits: 138.4 E(): 5.7e-33 Smith-Waterman score: 1289; 31.244% identity (57.413% similar) in 1005 aa overlap (291-1252:14-907) 270 280 290 300 310 320 KIAA05 VAYSVLFETFGYHFRDEACFPSPGAGALHWELLSRGLLHGCIHAIGVHLFVMSQVRSRST :.:. .:. : :.:. . :.. . :.. KIAA05 QQQEELKGMQLLREILANVFLYLCAIAVGIMSYYMADRKHRKA 10 20 30 40 330 340 350 360 370 380 KIAA05 FLKVGQSIMHGKDLEVEKALKERMIHSVMPRIIADDLMKQGDEESENSVKRHATSSPKNR ::.. ::. .:: .. .: .. :..:. .::...:. KIAA05 FLEARQSLEVKMNLEEQSQQQENLMLSILPKHVADEMLKD-------------------- 50 60 70 80 390 400 410 420 430 440 KIAA05 KKKSSIQKAPIAFRPFKMQQIEEVSILFADIVGFTKMSANKSAHALVGLLNDLFGRFDRL ::. :: : . : . :.::::::::::::..:. ::. :: :::.::.:::.: KIAA05 MKKDESQKDQQQFNTMYMYRHENVSILFADIVGFTQLSSACSAQELVKLLNELFARFDKL 90 100 110 120 130 140 450 460 470 480 490 500 KIAA05 CEETKCEKISTLGDCYYCVAGCPEPRADHAYCCIEMGLGMIKAIEQFCQEKKEMVNMRVG . . .:. :::::::. : :. : ::: : : :::.:..:: .. : :.:::: KIAA05 AAKYHQLRIKILGDCYYCICGLPDYREDHAVCSILMGLAMVEAISYVREKTKTGVDMRVG 150 160 170 180 190 200 510 520 530 540 550 560 KIAA05 VHTGTVLCGILGMRRFKFDVWSNDVNLANLMEQLGVAGKVHISEATAKYLDDRYEMEDGK ::::::: :.::..:...::::.::..:: :: :. :.::::..: : ....: : KIAA05 VHTGTVLGGVLGQKRWQYDVWSTDVTVANKMEAGGIPGRVHISQSTMDCLKGEFDVEPGD 210 220 230 240 250 260 570 580 590 600 610 KIAA05 VIERLGQSVVADQL--KGLKTYLISGQRAKESRCSCAEALLSGFEVIDGSQVSSGPRGQG : : : : ::..:::: ... . .. . ..: .:: . .: . KIAA05 -----GGSRC-DYLEEKGIETYLIIASKPEVKKTATQNGL-------NGSALPNG----A 270 280 290 300 620 630 640 650 660 670 KIAA05 TASSGNVSDLAQTVKTFDNLKTCPSCGITFAPKSEAGAEGGAPQNGCQDEHKNSTKASGG ::: . : :. : :.. : . :.. .. .:. .. . KIAA05 PASSKSSS---------------PALIETKEPNGSAHSSGSTSEK--PEEQDAQADNPSF 310 320 330 340 680 690 700 710 720 730 KIAA05 PNPKTQNGLLSPPQEEKLTNSQTSLCEILQEKGRWAGVSLDQSALLPLRFKNIREKTDAH :::. . : . :.. : . .: :. : : . . :. .:. KIAA05 PNPRRRLRL------QDLAD-------------RVVDASEDEHELNQLLNEALLERESAQ 350 360 370 380 390 740 750 760 770 780 KIAA05 FVDVIKEDSLMKDYFFKPPINQFSLNFLDQELERSYRTSYQEE-----------VIKNSP :.:. .. :. .:. :.: :.: : . ... .. .. KIAA05 ---VVKK----RNTFL------LSMRFMDPEMETRYSVEKEKQSGAAFSCSCVVLLCTAL 400 410 420 430 790 800 810 820 830 840 KIAA05 VKTFASPTFSSLLDVFLSTTVFLTLSTTCFLKYEAATVPPP-PAALAVFSAALLLEVLSL :. . .: . . .:. ..: . : : : :: : : :..::. . . KIAA05 VEILIDPWLMTNYVTFMVGEILLLILTICSL---AAIFPRAFPKKLVAFSTWIDRTRWAR 440 450 460 470 480 490 850 860 870 880 890 900 KIAA05 AVSIRMVFFLEDVMACTKRLLEWIAGWLPRHCIGAILVSLPALAVYSHVTSEYETN---I . ...:. ::: . .: :. . : :..:. .::. . KIAA05 NTWAMLAIFIL-VMANVVDMLS---------CLQ--YYTGP-----SNATAGMETEGSCL 500 510 520 530 910 920 930 940 950 KIAA05 HFPVFTGSAALIAVVHYCNFCQLSSWMRSSLATVV-GAGPLLLLY----VSLCPDSSVLT . : . . .:..... . :.: .. .: .: :: . :: : : . . KIAA05 ENPKYYNYVAVLSLIATIMLVQVSHMVKLTLMLLVAGAVATINLYAWRPVFDEYDHKRFR 540 550 560 570 580 590 960 970 980 990 1000 1010 KIAA05 S---PLDAVQNFSSERNPCNSSVPRDLRRPASLIGQEVVLVFFLLLLLVWFLNREFEVSY :. :...... :: ... : :.. . .:.:: :..: ....:. : KIAA05 EHDLPMVALEQMQGF-NPGLNGTDRLPLVPSKY--SMTVMVF-LMMLSFYYFSRHVEKLA 600 610 620 630 640 650 1020 1030 1040 1050 1060 1070 KIAA05 RLHYHGDVEADLHRTKIQSMRDQADWLLRNIIPYHVAEQLKVSQT-----YSKNHDSGGV : . .:. .. .. :: . :. :..: :::... :. ::...: :: KIAA05 RTLFLWKIEVHDQKERVYEMRRWNEALVTNMLPEHVARHFLGSKKRDEELYSQTYDEIGV 660 670 680 690 700 710 1080 1090 1100 1110 1120 KIAA05 IFASIVNFSEFYEENY--EGGKECYRVLNELIGDFDELLSKPDYSSIEKIKTIGATYMAA .:::. ::..:: :. .:: :: : :::.:.::: ::..: . : ::::::.::::: KIAA05 MFASLPNFADFYTEESINNGGIECLRFLNEIISDFDSLLDNPKFRVITKIKTIGSTYMAA 720 730 740 750 760 770 1130 1140 1150 1160 1170 KIAA05 SGLN---------TAQAQDGSHPQ--EHLQILFEFAKEMMRVVDDFNSNMLWFNFKLRVG ::.. ... .: :. . .:: : .:: : .. ..: :. . :: ::.: KIAA05 SGVTPDVNTNGFASSNKEDKSERERWQHLADLADFALAMKDTLTNIN-NQSFNNFMLRIG 780 790 800 810 820 830 1180 1190 1200 1210 1220 1230 KIAA05 FNHGPLTAGVIGTTKLLYDIWGDTVNIASRMDTTGVECRIQVSEESYRVLSKMGYDFDYR .:.: . :::::. : :::::.:::.::::..::: ::: ::. .: ..:. : : KIAA05 MNKGGVLAGVIGARKPHYDIWGNTVNVASRMESTGVMGNIQVVEETQVILREYGFRFVRR 840 850 860 870 880 890 1240 1250 1260 1270 1280 1290 KIAA05 GTVNVKGKGQMKTYLYPKCTDHRVIPQHQLSISPDIRVQVDGSIGRSPTDEIANLVPSVQ : . :::::.. :.. KIAA05 GPIFVKGKGELLTFFLKGRDKLATFPNGPSVTLPHQVVDNS 900 910 920 930 >>KIAA0037 ( 1088 res) ha00929 (1088 aa) initn: 1214 init1: 618 opt: 624 Z-score: 666.8 bits: 135.5 E(): 5.1e-32 Smith-Waterman score: 1305; 30.190% identity (55.969% similar) in 1156 aa overlap (146-1258:28-1078) 120 130 140 150 160 170 KIAA05 LERCFPQTQRRFRYALFYIGFACLLWSIYFAVHMRSRLIVMVAPALCFLLV-----CVGF :.. . .: . .: : ::. ::.. KIAA00 RHACQGWRMPAKGRYFLNEGEEGPDQDALYEKYQLTSQHGPLLLTLLLVAATACVAL 10 20 30 40 50 180 190 200 210 220 KIAA05 FLFTFTKLY-ARHYAWTSLA-LTLLVFA-LTLAAQFQVLTPVSGRGDSSNLTATARPTDT ....:.. .:: : ..: :.: ::: :.. . : : : : : . KIAA00 IIIAFSQGDPSRHQAILGMAFLVLAVFAALSVLMYVECLL-------RRWLRALALLTWA 60 70 80 90 100 110 230 240 250 260 270 KIAA05 CLSQVG--------SFSMCI--EVLFLLYTVMHLPLYLSLCLGVAYSVLFETFGYHF--- :: .: . . : .: :.:. :. . : . . : .: . . :. KIAA00 CLVALGYVLVFDAWTKAACAWEQVPFFLFIVFVVYTLLPFSMRGAVAVGAVSTASHLLVL 120 130 140 150 160 170 280 290 300 310 320 330 KIAA05 -RDEACFPSPGAGALHWELLSRGLLHGCIHAIGVHLFVMSQVRSRSTFLKVGQSIMHGKD . : .:.. . .::. ... : . :. . : ::. : . . :. . KIAA00 GSLMGGFTTPSV-RVGLQLLANAVIFLCGNLTGAFHKHQMQDASRDLFTYTVKCIQIRRK 180 190 200 210 220 340 350 360 370 380 390 KIAA05 LEVEKALKERMIHSVMPRIIADDLMKQGDEESENSVKRHATSS--PKNRKKKSSIQKAPI :..:: .: .. ::.: :. :: . : .:.:. : : KIAA00 LRIEKRQQENLLLSVLPAHISMG-MKLAIIER---LKEHGDRRCMPDNN----------- 230 240 250 260 270 400 410 420 430 440 450 KIAA05 AFRPFKMQQIEEVSILFADIVGFTKMSANKSAHALVGLLNDLFGRFDRLCEETKCEKIST :. . ... ..::::.:::::::..... : . :: .::.:::.::.. . ..: .:. KIAA00 -FHSLYVKRHQNVSILYADIVGFTQLASDCSPKELVVVLNELFGKFDQIAKANECMRIKI 280 290 300 310 320 330 460 470 480 490 500 510 KIAA05 LGDCYYCVAGCPEPRADHAYCCIEMGLGMIKAIEQFCQEKKEMVNMRVGVHTGTVLCGIL ::::::::.: : :: :..::: : .::.: . .:::::.:.:.::::.. KIAA00 LGDCYYCVSGLPVSLPTHARNCVKMGLDMCQAIKQVREATGVDINMRVGIHSGNVLCGVI 340 350 360 370 380 390 520 530 540 550 560 570 KIAA05 GMRRFKFDVWSNDVNLANLMEQLGVAGKVHISEATAKYLDDRYEMEDGKVIERLGQSVVA :.:....::::.::.::: :: :: :.:::.::: :.:: ::.:::. .: . . KIAA00 GLRKWQYDVWSHDVSLANRMEAAGVPGRVHITEATLKHLDKAYEVEDGHGQQR--DPYLK 400 410 420 430 440 450 580 590 600 610 620 630 KIAA05 DQLKGLKTYLISGQRAKESRCSCAEALLSGFEVIDGSQVSSGPRGQGTASSGNVSDLAQT .. ...:::. :... :: :: .: :. KIAA00 EM--NIRTYLVIDPRSQQPP--------------PPSQ--HLPRPKGDAA---------- 460 470 480 640 650 660 670 680 690 KIAA05 VKTFDNLKTCPSCGITFAPKSEAGAEGGAPQNGCQDEHKNSTKASGGPNPKTQNGLLSPP :: : .: .: ..:. : : .. .. :.. .: :: : : KIAA00 ------LKMRASVRMTRYLESWGAARPFAHLNHRESVSSGETHVPNGRRPK------SVP 490 500 510 520 530 700 710 720 730 740 KIAA05 QEEKLTNSQTSLCEILQEKGRWAGVSLDQSALLPLR-FKNIRE---KTDAHFV--DVIKE :... : ... .. ::: : :. : .. ... : :.: .. ... : KIAA00 QRHRRTPDRS-----MSPKGRSEDDSYDDEMLSAIEGLSSTRPCCSKSDDFYTFGSIFLE 540 550 560 570 580 750 760 770 780 790 800 KIAA05 DSLMKDYFFKPPINQFSLNFLDQELERSYRTSYQEEVIKNSPVKTFASPTFSSLLDVF-L .. ..: . : : . .: : . :... : ..: : : KIAA00 KGFEREYRLAP-IPRARHDFACASLI----------FVCILLVHVLLMPRTAALGVSFGL 590 600 610 620 630 810 820 830 840 850 860 KIAA05 STTVFLTLSTTCFLKYEAATVPPPPAALAVFSAALLLEVLSLAVSIRMVFFLEDVMACTK . :. . :: . : . .. . .: :.... . : : . KIAA00 VACVLGLVLGLCFATKFSRCCPARGTLCTISERVETQPLLRLTLAVLTIGSLLTVAIINL 640 650 660 670 680 690 870 880 890 900 910 920 KIAA05 RLLEWIAGWLPRHCIGAILVSLPALAVYSHVTSEYETNIHFPVFTGSAALIAVVHYCN-F :. . . :: .: ::. :.. . : .: .: : .: .. :. : KIAA00 PLMPFQVPELP---VGN---ETGLLAASSKTRALCEP---LPYYTCSCVLGFIA--CSVF 700 710 720 730 740 930 940 950 960 970 980 KIAA05 CQLSSWMRSSLATVVGAGPLLLLYVSLCPDSSVLTSPLDAVQNFSSERNPCNSSVPRDLR ..: . : ::. .. :.:. .: : . . . : . . .. . : .::. 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