# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hg00484s2.fasta.huge -Q ../query/KIAA0516.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0516, 1382 aa vs ./tmplib.23663 library 1986123 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.6769+/-0.0101; mu= -14.0612+/- 0.683 mean_var=427.5193+/-103.477, 0's: 0 Z-trim: 5 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.062029 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1066 ( 1346 res) ah03682 (1346) 2772 263.5 1.9e-70 KIAA0337 ( 1609 res) hg01226 (1609) 420 53.0 4.9e-07 KIAA1626 ( 1284 res) fg01925(revised) (1284) 368 48.3 1e-05 KIAA0294 ( 1405 res) hf00223s1 (1405) 340 45.8 6.3e-05 >>KIAA1066 ( 1346 res) ah03682 (1346 aa) initn: 3804 init1: 1283 opt: 2772 Z-score: 1356.8 bits: 263.5 E(): 1.9e-70 Smith-Waterman score: 4682; 57.132% identity (77.948% similar) in 1374 aa overlap (62-1382:16-1346) 40 50 60 70 80 90 KIAA05 VPARVGSVPCGQVPPLCRRRPGPPARPLATMELEDGVVYQEEPGGSGAVMSERVSGLAGS :. ::: .. ::.:::::::::::: KIAA10 RAALAAAVAAMMEIQMDEGGGVVVYQDDYCSGSVMSERVSGLAGS 10 20 30 40 100 110 120 130 140 150 KIAA05 IYREFERLIGRYDEEVVKELMPLVVAVLENLDSVFAQDQEHQVELELLRDDNEQLITQYE ::::::::: :::::::::::::: ::::::::....:::.:::::::.:::::.:::: KIAA10 IYREFERLIHCYDEEVVKELMPLVVNVLENLDSVLSENQEHEVELELLREDNEQLLTQYE 50 60 70 80 90 100 160 170 180 190 200 210 KIAA05 REKALRKHAEEKFIEFEDSQEQEKKDLQTRVESLESQTRQLELKAKNYADQISRLEEREA ::::::..::::::::::. :::::.:: .:: : :::::::::::::::::::::::. 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KIAA10 KVDQLSGEQEVLRGELEAAKQAKVKLENRIKELEEELKRVKSEAIIARREPKEEAEDVSS 460 470 480 490 500 510 560 570 580 590 600 KIAA05 ---DDSD-IPTAQRKRFTRVEMARVLMERNQYKERLMELQEAVRWTEMIRASRENPAMQE .:: :: :::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:..:: KIAA10 YLCTESDKIPMAQRRRFTRVEMARVLMERNQYKERLMELQEAVRWTEMIRASREHPSVQE 520 530 540 550 560 570 610 620 630 640 650 660 KIAA05 KKRSSIWQFFSRLFSSSSNT--TKKPEPPVNLKYNAPTSHVTPSVKKRSSTLSQLPGDKS ::.:.:::::::::::::. .:.: : ::..:..::. . ..:. .. . . : KIAA10 KKKSTIWQFFSRLFSSSSSPPPAKRPYPSVNIHYKSPTT--AGFSQRRNHAMCPISAG-S 580 590 600 610 620 630 670 680 690 700 710 720 KIAA05 KAFDFLSEETEASLASRREQKREQYRQVKAHVQKEDGRVQAFGWSLPQKYKQVT--NGQG . ..:. .. .: ..::::::::::::. ::...:::.:: ::::: ::::.. .:: KIAA10 RPLEFFPDDDCTS-SARREQKREQYRQVREHVRNDDGRLQACGWSLPAKYKQLSPNGGQE 640 650 660 670 680 690 730 740 750 760 770 780 KIAA05 ENKMKNLPVPVYLRPLDEKDTSMKLWCAVGVNLSGGKTR--DGGSVVGASVFYKDVAGLD ...:::.::::: ::: ::: .::::::.:::::: . :.:. : . .: : KIAA10 DTRMKNVPVPVYCRPLVEKDPTMKLWCAAGVNLSGWRPNEDDAGNGVKPAP-GRDPLTCD 700 710 720 730 740 750 790 800 810 820 830 840 KIAA05 TEGSKQRSASQSSLDKLDQELKEQQKELKNQEELSSLVWICTSTHSATKVLIIDAVQPGN ::. . .....: .: .. ::: ... :: ::: ::: ...::.:::: :::. KIAA10 REGDGEPKSAHTSPEK------KKAKELPEMDATSSRVWILTSTLTTSKVVIIDANQPGT 760 770 780 790 800 850 860 870 880 890 900 KIAA05 ILDSFTVCNSHVLCIASVPGARETDYPAGEDLSESGQVDKASLCGSMTSNSSAETDSLLG ..:.:::::.:::::.:.:.: ..::: :: . .: .. . .:..:. KIAA10 VVDQFTVCNAHVLCISSIPAASDSDYPPGEMFLDSD-----------VNPEDPGADGVLA 810 820 830 840 850 910 920 930 940 950 KIAA05 GITVVGCSAEGVTGAATSPSTNGASPVMDKPPEMEAE--NSEVDENVPTAEEATEATE-G :::.::: : . .. :. : .::.:: : :..:. . : :::::::: KIAA10 GITLVGC-ATRCNVPRSNCSSRGDTPVLDKGQGEVATIANGKVNPSQST-EEATEATEVP 860 870 880 890 900 910 960 970 980 990 1000 1010 KIAA05 NAGSAEDTVDISQTGVYTEHVFTDPLGVQIPEDLSPVYQSSNDSDAYKDQISVLPNEQDL . : .: . . : :::::::: . : . .: : .... :. :. : : . KIAA10 DPGPSEPETATLRPGPLTEHVFTDP--APTPSS-GP--QPGSENGPEPDSSSTRP-EPEP 920 930 940 950 960 1020 1030 1040 1050 1060 1070 KIAA05 VREEAQKMSSLLPTMWLGAQNGCLYVHSSVAQWRKCLHSIKLKDSILSIVHVKGIVLVAL . . :: :::::::::: :::::.::.:.:::::::::::.::.::::: ::::: KIAA10 SGDPTGAGSSAAPTMWLGAQNGWLYVHSAVANWKKCLHSIKLKDSVLSLVHVKGRVLVAL 970 980 990 1000 1010 1020 1080 1090 1100 1110 1120 1130 KIAA05 ADGTLAIFHRGVDGQWDLSNYHLLDLGRPHHSIRCMTVVHDKVWCGYRNKIYVVQPKAMK ::::::::::: :::::::::::.:::.::::::::.::.:.:::::.::..:.:::.:. KIAA10 ADGTLAIFHRGEDGQWDLSNYHLMDLGHPHHSIRCMAVVYDRVWCGYKNKVHVIQPKTMQ 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1140 1150 1160 1170 1180 1190 KIAA05 IEKSFDAHPRKESQVRQLAWVGDGVWVSIRLDSTLRLYHAHTYQHLQDVDIEPYVSKMLG ::::::::::.:::::::::.:::::::::::::::::::::.::::::::::::::::: KIAA10 IEKSFDAHPRRESQVRQLAWIGDGVWVSIRLDSTLRLYHAHTHQHLQDVDIEPYVSKMLG 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1200 1210 1220 1230 1240 KIAA05 TGKLGFSFVRITALMVSCNRLWVGTGNGVIISIPLTET-------------NKTSGVPGN ::::::::::::::.:. .::::::::::.:::::::: :::: . :. KIAA10 TGKLGFSFVRITALLVAGSRLWVGTGNGVVISIPLTETVVLHRGQLLGLRANKTSPTSGE 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1250 1260 1270 1280 1290 1300 KIAA05 --RPGSVIRVYGDENSDKVTPGTFIPYCSMAHAQLCFHGHRDAVKFFVAVPGQVISPQSS :::..:.::::..::... ..::::::::.::::::::::::::::.:::.:.. . KIAA10 GARPGGIIHVYGDDSSDRAA-SSFIPYCSMAQAQLCFHGHRDAVKFFVSVPGNVLA---T 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1310 1320 1330 1340 1350 KIAA05 SSGTDLTGDKAGPSAQEPGSQTP---LKSMLVISGGEGYIDFRMGD-EGGESELLGEDLP .:. : . ::. :.:.. :...::.::::::::::.:: : :.: . :. KIAA10 LNGSVLDSPAEGPGPAAPASEVEGQKLRNVLVLSGGEGYIDFRIGDGEDDETEEGAGDMS 1270 1280 1290 1300 1310 1320 1360 1370 1380 KIAA05 -LEPSVTKAERSHLIVWQVMYGNE ..: ..::::::.::::: : : KIAA10 QVKPVLSKAERSHIIVWQVSYTPE 1330 1340 >>KIAA0337 ( 1609 res) hg01226 (1609 aa) initn: 636 init1: 274 opt: 420 Z-score: 218.2 bits: 53.0 E(): 4.9e-07 Smith-Waterman score: 608; 23.754% identity (51.432% similar) in 943 aa overlap (490-1377:765-1609) 460 470 480 490 500 510 KIAA05 EGADLLGMGREVENLILENTQLLETKNALNIVKNDLIAKVDELTCEKDVLQGELEAVKQA .:: ::. .. : .. .: . .::. KIAA03 LEQSMRENKEKQALSDLMIKPVQRIPRYELLVK-DLLKHTPEDHPDHPLLLEAQRNIKQV 740 750 760 770 780 790 520 530 540 550 560 570 KIAA05 KLKLEEKNRELEEELRKARAEAEDARQKAKDDDDSDIPTAQRKRFTRVEMARVLMERNQY .... : :: :.::. .. . . . .: . : .:: : ::. . . KIAA03 AERINKGVRSAEEAERHARV-LQEIEAHIEGMEDLQAPL---RRFLRQEMVIEVKAIGGK 800 810 820 830 840 580 590 600 610 620 630 KIAA05 KERLMELQEAVRWTEMIRASRENPAMQEKKRSSIWQFFS-RLFSSSSNTT---KKPEPPV :.: . : .:..: . . .:::. . . .....:. : : . KIAA03 KDRSLFL-----FTDLIVCTTLKRKSGSLRRSSMSLYTAASVIDTASKYKMLWKLPLEDA 850 860 870 880 890 900 640 650 660 670 680 690 KIAA05 NLKYNAPTSHVTPSVKKRSSTLSQLPGDKSKAFDFLSEETEASLASRREQKREQYRQVKA .. .: . ...: ..:.: : . .. .:. .: ::. ... . :...: KIAA03 DIIKGASQATNRENIQK---AISRLDEDLT-TLGQMSKLSE-SLGFPHQSLDDALRDLSA 910 920 930 940 950 700 710 720 730 740 750 KIAA05 HVQKEDGRVQAFGWSL---PQKYKQ-VTNGQGENKMKNLPVPVYLRPLDEKDTSMKLWCA .... .. ::. ..: : : . .: .: .. :. . . :. . . : KIAA03 AMHRDLSEKQALCYALSFPPTKLELCATRPEGTDS--------YIFEFPHPDARLGFEQA 960 970 980 990 1000 1010 760 770 780 790 800 810 KIAA05 VGVNLSGGKTRDGGSVVGASVFYKDVAGLDTEGSKQRSASQSSLDKLDQELKEQQKELKN . . : .. : . : : . . :... : : . .:.. . : KIAA03 F--DEAKRKLASSKSCLDPE-FLKAIPIMKTRSGMQFSCAAPTLNSCPEPSPE------- 1020 1030 1040 1050 1060 820 830 840 850 860 KIAA05 QEELSSLVWICTSTHSATKVLIIDAVQPGNILDSFTVCNSHVLCIASVPGA-----RE-- ::.:.: . .: ... .. ..::....:::..::: :: KIAA03 -------VWVCNSDGYVGQVCLLSLRAEPDVEACIAVCSARILCIGAVPGLQPRCHREPP 1070 1080 1090 1100 1110 870 880 890 900 910 KIAA05 ---------TDYPAGEDLSESGQVDKASLCGSMTSNSSAETDSLLG-GITVVGCSAEGVT . ::: .:. . .:. . . . . :. : :. .. .:: KIAA03 PSLRSPPETAPEPAGPELDVEAAADEEAATLAEPGPQPCLHISIAGSGLEMTPGLGEGDP 1120 1130 1140 1150 1160 1170 920 930 940 950 960 KIAA05 GAATSP----STNGASPVMDKPPEMEAENSEV-----DENVPTAEEATEATEGNAGSAED : : . .:: . . .: : . .:..:...::: : .. : KIAA03 RPELVPFDSDSDDESSPSPSGTLQSQASRSTISSSFGNEETPSSKEATAETTSSEEEQEP 1180 1190 1200 1210 1220 1230 970 980 990 1000 1010 1020 KIAA05 TVDISQTGVYTEHVFTDPLGVQIPEDLSPVYQSSNDS---DAYKDQISVLPNEQDLVREE . .: . : :.. : : . .::. : . .: .:: : : KIAA03 GF-LPLSGSFGPG---GPCGTS-PMDGRALRRSSHGSFTRGSLEDLLSVDP--------E 1240 1250 1260 1270 1280 1030 1040 1050 1060 1070 1080 KIAA05 AQKMSSLLPTMWLGAQNGCLYVHSSVAQWRKCLHSIKLKD--SILSIVHVKGIVLVALAD : . : .:::...::..:..: . : .:.::. :. :..... :.:.::. KIAA03 AYQSS-----VWLGTEDGCVHVYQSSDSIRDRRNSMKLQHAASVTCILYLNNQVFVSLAN 1290 1300 1310 1320 1330 1090 1100 1110 1120 1130 1140 KIAA05 GTLAIFHRGVDGQWDLSNYHLLDLGRPHHSIRCMTVVHDKVWCGYRNKIYVVQPKAMKIE : :....: . :: .:.. . :: : :. : ..::: .:.. :..: ....: KIAA03 GELVVYQREAGHFWDPQNFKSVTLGTQGSPITKMVSVGGRLWCGCQNRVLVLSPDTLQLE 1340 1350 1360 1370 1380 1390 1150 1160 1170 1180 1190 KIAA05 KSFDAHPRKESQVRQLAWVGDGVWVSIRLDSTLRLYHAHTYQHLQDVDIEPYVSKML-GT . : . . : .. . ::::... .. . ::: :...: .::. : : .:: :. 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KIAA16 -PVRTLLSLEDAVWASCGPR--VTVLEATTLQPQQSFEAHQDEAVSVTHMVKAGSGVWMA 980 990 1000 1010 1020 1030 1170 1180 1190 1200 1210 1220 KIAA05 IRLDSTLRLYHAHTYQHLQDVDIEPYVSKMLGTGKLGFSFVRITALMVSCNRLWVGTGNG . ...::.:..: .:::...: .. .: : . . .:.:.. . ::::: .: KIAA16 FSSGTSIRLFHTETLEHLQEINIATRTTFLLP----GQKHLCVTSLLICQGLLWVGTDQG 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1230 1240 1250 1260 1270 1280 KIAA05 VIISIPLTETNKTSGVPGNRPGSVIRVYGDENSDKVTPGTFIPYCSMAHAQLCFHGHRDA ::. .:. . :.: ... . : . : .:. . : ... .. KIAA16 VIVLLPVP---RLEGIPKITGKGMVSLNG-----HCGPVAFLAVATSILAPDILRSDQEE 1100 1110 1120 1130 1140 1290 1300 1310 1320 1330 KIAA05 VKFFVAV---P-GQVISPQSSSS-GTDLTGDKA-------GPSAQEPGSQTPLKSMLVIS .. : : ::. :. .: : .:: :. .:. :: :: :: . KIAA16 AEGPRAEEDKPDGQAHEPMPDSHVGRELTRKKGILLQYRLRSTAHLPG---PLLSMREPA 1150 1160 1170 1180 1190 1340 1350 1360 1370 1380 KIAA05 GGEGYIDFRMGDEGGESELLGEDLPL----EPSVTKAERSHLIVWQVMYGNE ..: .. ..: : ...: . .: . :.:... .. :.. 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