# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hf00310.fasta.nr -Q ../query/KIAA0514.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0514, 483 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7824816 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7865+/-0.000195; mu= 9.4784+/- 0.011 mean_var=104.5566+/-20.118, 0's: 28 Z-trim: 33 B-trim: 91 in 1/65 Lambda= 0.125429 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|15079708|gb|AAH11672.1| GPRIN2 protein [Homo sa ( 461) 3147 579.9 4.6e-163 gi|97536293|sp|O60269.2|GRIN2_HUMAN RecName: Full= ( 458) 3043 561.1 2.1e-157 gi|109089061|ref|XP_001082938.1| PREDICTED: hypoth ( 458) 2969 547.7 2.3e-153 gi|149690692|ref|XP_001500796.1| PREDICTED: simila ( 457) 2440 452.0 1.5e-124 gi|76656788|ref|XP_592057.2| PREDICTED: similar to ( 453) 2304 427.4 3.8e-117 gi|149265309|ref|XP_915849.3| PREDICTED: similar t ( 455) 2218 411.8 1.8e-112 gi|109503724|ref|XP_001059778.1| PREDICTED: hypoth ( 545) 2201 408.8 1.8e-111 gi|34877176|ref|XP_224702.2| PREDICTED: hypothetic ( 455) 2188 406.4 8e-111 gi|73953948|ref|XP_546198.2| PREDICTED: similar to ( 422) 1168 221.8 2.8e-55 gi|149431380|ref|XP_001513759.1| PREDICTED: simila ( 547) 669 131.6 5.1e-28 gi|82177691|sp|Q9PWA3|GRIN2_CHICK GRIN2-like prote ( 518) 495 100.1 1.5e-18 gi|109079842|ref|XP_001085023.1| PREDICTED: simila (1013) 324 69.4 4.9e-09 gi|118097390|ref|XP_425207.2| PREDICTED: similar t ( 386) 310 66.5 1.4e-08 gi|126291564|ref|XP_001380934.1| PREDICTED: simila ( 820) 293 63.7 2.1e-07 gi|74738655|sp|Q7Z2K8.1|GRIN1_HUMAN RecName: Full= (1008) 289 63.1 3.9e-07 gi|119605471|gb|EAW85065.1| G protein-regulated in (1008) 289 63.1 3.9e-07 gi|109504667|ref|XP_344572.3| PREDICTED: similar t ( 914) 268 59.2 5.1e-06 gi|5901688|gb|AAD55371.1| GRIN1 [Mus musculus] ( 827) 267 59.0 5.4e-06 gi|97051843|sp|Q3UNH4.2|GRIN1_MOUSE RecName: Full= ( 932) 267 59.1 5.9e-06 gi|74188195|dbj|BAE25773.1| unnamed protein produc ( 932) 267 59.1 5.9e-06 gi|125831747|ref|XP_001338545.1| PREDICTED: simila ( 530) 252 56.1 2.6e-05 gi|109505477|ref|XP_001070221.1| PREDICTED: simila ( 870) 252 56.3 3.7e-05 gi|47211600|emb|CAF94536.1| unnamed protein produc ( 41) 228 50.8 8.1e-05 gi|210121557|gb|EEA69269.1| hypothetical protein B ( 371) 223 50.7 0.00075 gi|47211323|emb|CAF96188.1| unnamed protein produc ( 488) 215 49.4 0.0025 gi|50746821|ref|XP_426298.1| PREDICTED: hypothetic ( 746) 217 49.9 0.0027 >>gi|15079708|gb|AAH11672.1| GPRIN2 protein [Homo sapien (461 aa) initn: 3147 init1: 3147 opt: 3147 Z-score: 3083.7 bits: 579.9 E(): 4.6e-163 Smith-Waterman score: 3147; 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97.614% identity (98.915% similar) in 461 aa overlap (23-483:1-458) 10 20 30 40 50 60 KIAA05 NRLRCCHPTQLHSLPFSLLQAAMSSSHPEPGPWAPLSPRLQPLSQSSSSLLGEGREQRPE ::::.::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|975 MSSSRPEPGPWAPLSPRLQPLSQSSSSLLGEGREQRPE 10 20 30 70 80 90 100 110 120 KIAA05 LHKTASSTMWQAQLGEASTRPQAPEEEGNPPESMKPARASGPKARPSAGGHWRSSTVGNV :.::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::: gi|975 LRKTASSTVWQAQLGEASTRPQAPEEEGNPPESMKPARASGPKARPSAGGHWWSSTVGNV 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 KIAA05 STMGGGDLCRLRAPSAAAMQRSHSDLVRSTQMRGHSGARKASLSCSALGSSPVHRAQLQP :::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|975 STMGGSDLCRLRAPSAAAMQRSHSDLVRSTQMRGHSGARKASLSCSALGSSPVHRAQLQP 100 110 120 130 140 150 190 200 210 220 230 240 KIAA05 GGTSGQGGQAPAGLERDLAPEDETSNSAWMLGASQLSVPPLDLGDTTAHSSSAQAEPKAA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|975 GGTSGQGGQAPAGLERDLAPEDETSNSAWMLGASQLSVPPLDLGDTTAHSSSAQAEPKAA 160 170 180 190 200 210 250 260 270 280 290 300 KIAA05 EQLATTTCHALPPAALLCGMREMREVGAGGCCHALPATGILAFPKLVASVSESGLQAQHG ::::::::::::::::::::::.: ::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|975 EQLATTTCHALPPAALLCGMREVR---AGGCCHALPATGILAFPKLVASVSESGLQAQHG 220 230 240 250 260 270 310 320 330 340 350 360 KIAA05 VKIHCRLSGGLPGHSHCCAHLWGPAGLVPEPGSRTKDVWTMTSANDLAPAEASPLSAQDA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|975 VKIHCRLSGGLPGHSHCCAHLWGPAGLVPEPGSRTKDVWTMTSANDLAPAEASPLSAQDA 280 290 300 310 320 330 370 380 390 400 410 420 KIAA05 GVQAAPVAACKAVATSPSLEAPAALHVFPEVTLGSSLEEAPSPVRDVRWDAEGMTWEVYG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::: gi|975 GVQAAPVAACKAVATSPSLEAPAALHVFPEVTLGSSLEEVPSPVRDVRWDAEGMTWEVYG 340 350 360 370 380 390 430 440 450 460 470 480 KIAA05 AAVDPEVLGVAIQKHLEMQFEQLQRAPASEDSLSVEGRRGPLRAVMQSLRRPSCCGCSGA :::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|975 AAVDLEVLGVAIQKHLEMQFEQLQRAPASEDSLSVEGRRGPLRAVMQSLRRPSCCGCSGA 400 410 420 430 440 450 KIAA05 APE ::: gi|975 APE >>gi|109089061|ref|XP_001082938.1| PREDICTED: hypothetic (458 aa) initn: 1536 init1: 1536 opt: 2969 Z-score: 2909.6 bits: 547.7 E(): 2.3e-153 Smith-Waterman score: 2969; 95.228% identity (98.048% similar) in 461 aa overlap (23-483:1-458) 10 20 30 40 50 60 KIAA05 NRLRCCHPTQLHSLPFSLLQAAMSSSHPEPGPWAPLSPRLQPLSQSSSSLLGEGREQRPE ::::.:::::::::::::::::::::::::::.::::: gi|109 MSSSRPEPGPWAPLSPRLQPLSQSSSSLLGEGQEQRPE 10 20 30 70 80 90 100 110 120 KIAA05 LHKTASSTMWQAQLGEASTRPQAPEEEGNPPESMKPARASGPKARPSAGGHWRSSTVGNV :.:.::::.:::::::::::::::::::::::::. ::::::.::::::::::::::::: gi|109 LRKSASSTVWQAQLGEASTRPQAPEEEGNPPESMELARASGPEARPSAGGHWRSSTVGNV 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 KIAA05 STMGGGDLCRLRAPSAAAMQRSHSDLVRSTQMRGHSGARKASLSCSALGSSPVHRAQLQP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|109 STMGGGDLCRLRAPSAAAMQRSHSDLVRSTQMRGHSGARKASLSCSALGSSPVHRAQLQP 100 110 120 130 140 150 190 200 210 220 230 240 KIAA05 GGTSGQGGQAPAGLERDLAPEDETSNSAWMLGASQLSVPPLDLGDTTAHSSSAQAEPKAA :::::::::: ::::.:::::: ::::::::::::::::::.:::::::::::::::::: gi|109 GGTSGQGGQALAGLEKDLAPEDGTSNSAWMLGASQLSVPPLNLGDTTAHSSSAQAEPKAA 160 170 180 190 200 210 250 260 270 280 290 300 KIAA05 EQLATTTCHALPPAALLCGMREMREVGAGGCCHALPATGILAFPKLVASVSESGLQAQHG ::::::.:::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|109 EQLATTACHALPPAALLCGMREM---GAGGCCHALPATGILAFPKLVASVSESGLQAQHG 220 230 240 250 260 270 310 320 330 340 350 360 KIAA05 VKIHCRLSGGLPGHSHCCAHLWGPAGLVPEPGSRTKDVWTMTSANDLAPAEASPLSAQDA :::::::::::::::::::: :::.:::::::::::::::::::::::::::: :::::: gi|109 VKIHCRLSGGLPGHSHCCAHPWGPTGLVPEPGSRTKDVWTMTSANDLAPAEASLLSAQDA 280 290 300 310 320 330 370 380 390 400 410 420 KIAA05 GVQAAPVAACKAVATSPSLEAPAALHVFPEVTLGSSLEEAPSPVRDVRWDAEGMTWEVYG ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::: gi|109 GVQAAPVAACKAVATSPSLEAPAALHVFPEVTLGSSLEEMPSPVRDVRWDAEGMTWEVYG 340 350 360 370 380 390 430 440 450 460 470 480 KIAA05 AAVDPEVLGVAIQKHLEMQFEQLQRAPASEDSLSVEGRRGPLRAVMQSLRRPSCCGCSGA :::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::.: gi|109 AAVDPEVLGVAIQKHLEMQFEQLQRAPTSEDSLSVEGRRGPLRAVMQSLRRPSCCGCSSA 400 410 420 430 440 450 KIAA05 APE ::: gi|109 APE >>gi|149690692|ref|XP_001500796.1| PREDICTED: similar to (457 aa) initn: 2341 init1: 1366 opt: 2440 Z-score: 2392.3 bits: 452.0 E(): 1.5e-124 Smith-Waterman score: 2440; 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