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Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0478, 1253 aa vs ./tmplib.23147 library 1986252 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2811+/-0.00862; mu= 14.1703+/- 0.593 mean_var=288.8585+/-72.340, 0's: 0 Z-trim: 65 B-trim: 128 in 1/39 Lambda= 0.075463 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1588 ( 613 res) fj08823 ( 613) 645 84.7 5.1e-17 KIAA1611 ( 813 res) fj12627 ( 813) 628 83.0 2.1e-16 KIAA2007 ( 580 res) fj01689 ( 580) 624 82.3 2.4e-16 KIAA1874 ( 579 res) hk07257s1 ( 579) 602 79.9 1.3e-15 KIAA0961 ( 530 res) hj05830 ( 530) 597 79.3 1.8e-15 KIAA1141 ( 914 res) hk01833 ( 914) 600 80.1 1.8e-15 KIAA1710 ( 515 res) fj18457 ( 515) 594 79.0 2.2e-15 KIAA1871 ( 821 res) hj05256s1 ( 821) 594 79.3 2.7e-15 KIAA0065 ( 848 res) ha00946 ( 848) 584 78.3 5.9e-15 KIAA1956 ( 680 res) fk08713 ( 680) 579 77.6 7.8e-15 KIAA1431 ( 891 res) fj00022 ( 891) 578 77.7 9.5e-15 KIAA0326 ( 927 res) hg00579 ( 927) 556 75.3 5.1e-14 KIAA0798 ( 682 res) hk06584 ( 682) 553 74.7 5.5e-14 KIAA1969 ( 595 res) fk06944 ( 595) 551 74.4 6e-14 KIAA0426 ( 613 res) hh01274 ( 613) 551 74.4 6.1e-14 KIAA0412 ( 720 res) hg03242 ( 720) 544 73.8 1.1e-13 KIAA1948 ( 487 res) fh24556 ( 487) 541 73.2 1.2e-13 KIAA1396 ( 551 res) hj08221 ( 551) 535 72.6 1.9e-13 KIAA1827 ( 469 res) fk01409 ( 469) 515 70.3 8.1e-13 KIAA1198 ( 553 res) fg01911 ( 553) 509 69.8 1.4e-12 KIAA0441 ( 702 res) hh00601s1 ( 702) 496 68.6 4.1e-12 KIAA1954 ( 468 res) fk02322 ( 468) 485 67.0 7.8e-12 KIAA1339 ( 409 res) fj00071 ( 409) 478 66.2 1.2e-11 KIAA1962 ( 746 res) hm00158 ( 746) 480 66.9 1.4e-11 KIAA2003 ( 460 res) ah02593 ( 460) 473 65.7 1.9e-11 KIAA0924 ( 617 res) hh02883 ( 617) 457 64.2 7.4e-11 KIAA1852 ( 948 res) fj01514 ( 948) 459 64.8 7.8e-11 KIAA1615 ( 484 res) fj13419 ( 484) 448 63.0 1.3e-10 KIAA1349 ( 752 res) fj00940 ( 752) 439 62.4 3.2e-10 KIAA1388 ( 599 res) fj06552 ( 599) 416 59.7 1.6e-09 KIAA0236 ( 1696 res) ha04654 (1696) 411 60.0 3.8e-09 KIAA1231 ( 1061 res) fh08195s1 (1061) 378 56.0 3.7e-08 KIAA1508 ( 573 res) hk06576 ( 573) 373 55.0 4e-08 KIAA1829 ( 557 res) hj00069 ( 557) 368 54.4 5.8e-08 KIAA1285 ( 785 res) hh11563(revised) ( 785) 361 53.9 1.2e-07 KIAA1982 ( 599 res) fk06527(revised) ( 599) 331 50.5 9.8e-07 KIAA1473 ( 574 res) fj03262 ( 574) 330 50.3 1e-06 KIAA1979 ( 309 res) fj09511 ( 309) 321 48.9 1.5e-06 KIAA0557 ( 493 res) hh01334 ( 493) 317 48.8 2.6e-06 KIAA0760 ( 1224 res) hk04642s1 (1224) 305 48.2 9.8e-06 KIAA0972 ( 702 res) hj06859 ( 702) 300 47.2 1.1e-05 KIAA0211 ( 1317 res) ha02768 (1317) 293 46.9 2.5e-05 KIAA1782 ( 545 res) aj00273 ( 545) 285 45.4 3e-05 KIAA1806 ( 481 res) fk00438 ( 481) 282 45.0 3.6e-05 KIAA1629 ( 1329 res) fh20517 (1329) 275 45.0 9.8e-05 KIAA1485 ( 1104 res) fj07037 (1104) 269 44.2 0.00014 KIAA1020 ( 638 res) fg00473s1 ( 638) 263 43.1 0.00017 KIAA2033 ( 766 res) ej00602s1 ( 766) 252 42.1 0.00043 KIAA0198 ( 562 res) ha02521 ( 562) 250 41.6 0.00043 KIAA1675 ( 1286 res) ae00102 (1286) 250 42.2 0.00064 >>KIAA1588 ( 613 res) fj08823 (613 aa) initn: 776 init1: 201 opt: 645 Z-score: 397.4 bits: 84.7 E(): 5.1e-17 Smith-Waterman score: 848; 32.741% identity (63.706% similar) in 394 aa overlap (778-1170:238-597) 750 760 770 780 790 800 KIAA04 KSFICKACDKSFHFYCRLKVHMKRCRVAKSKQVQCKECSETKDSKKELDKHQLEAHGAGG :. .:..:... .. : .:. . : : KIAA15 GKRPYHRRDYGVAFKGRPHLTQHMSMYDGRKMHECHQCQKAFTTSASLTRHR-RIHT--G 210 220 230 240 250 260 810 820 830 840 850 860 KIAA04 EPDAPKKKKKRLPVTCDLCGREFAHASGMQYHKLTEHFDEKPFSCEECGAKFAANSTLKN : : :. ::. : :... : : :. ::::.: .:: : . :.:: KIAA15 EK----------PYECSDCGKAFNDPSALRSHART-HLKEKPFDCSQCGNAFRTLSALKI 270 280 290 300 310 870 880 890 900 910 920 KIAA04 HLRLHTGDRPFMCKHCLMTFTQASALAYHTKKKHSEGKMYACQYCDAVFAQSIELSRHVR :.:.:::.::. : .: .. .. : : :. :. . : :. : .: . .:..::: KIAA15 HMRVHTGERPYKCDQCGKAYGRSCHLIAH-KRTHTGERPYECHDCGKAFQHPSHLKEHVR 320 330 340 350 360 370 930 940 950 960 970 980 KIAA04 THTGDKPYVCRDCGKGFRQANGLSIHLHTFHNIEDPYDCKKCRMSFPTLQDHRKHIHEVH .:::.:::.: .:::.:: .....: .. : .: :.::.: :: : ..:::.. .: KIAA15 NHTGEKPYACTQCGKAFRWKSNFNLHKKN-HMVEKTYECKECGKSFGDLVSRRKHMR-IH 380 390 400 410 420 430 990 1000 1010 1020 1030 1040 KIAA04 -SKEYHPCPTCGKIFSAPSMLERHMVTHVGGKPFSCGICNKAYQQLSGLWYHNRTHHPDV :. : ::: : :.:. :: .:.: ::..: .:.::.. :.: : . : KIAA15 IVKKPVECRQCGKTFRNQSILKTHMNSHTGEKPYGCDLCGKAFSASSNLTAHRKIH---- 440 450 460 470 480 1050 1060 1070 1080 1090 1100 KIAA04 FAAQNHRSSKFSSLQCSSCDKTFPNTIEHKKHIKAEHADMKFHECDQCKELFPTPALLQV .:..: .:..: :.: . . ...:... : : :: :: . : . . :.. 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