# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hh00492.fasta.huge -Q ../query/KIAA0477.ptfa ./tmplib.23147 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0477, 1148 aa vs ./tmplib.23147 library 1986357 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.0228+/-0.00921; mu= -7.1385+/- 0.620 mean_var=369.4041+/-90.972, 0's: 0 Z-trim: 37 B-trim: 4 in 1/39 Lambda= 0.066730 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0454 ( 2296 res) bf02274 (2296) 4766 474.2 9.5e-134 KIAA0445 ( 1919 res) hg00102s1 (1919) 328 46.9 3.5e-05 KIAA1074 ( 1715 res) hj06637 (1715) 323 46.3 4.5e-05 KIAA1633 ( 1852 res) fh23696 (1852) 319 46.0 6.2e-05 KIAA1749 ( 1047 res) pj02119y1 (1047) 313 45.1 6.3e-05 KIAA0004 ( 1307 res) ha00065 (1307) 288 42.8 0.00039 KIAA0866 ( 1984 res) hk00546s1 (1984) 283 42.6 0.00072 KIAA1319 ( 1208 res) fh13717 (1208) 274 41.5 0.00094 KIAA1601 ( 690 res) fj10228 ( 690) 257 39.5 0.002 KIAA0336 ( 1635 res) hg01120 (1635) 262 40.4 0.0026 KIAA1000 ( 1956 res) hk09604y2 (1956) 261 40.4 0.0031 KIAA2034 ( 1571 res) ah04445 (1571) 256 39.8 0.0037 KIAA1565 ( 1313 res) bf00184 (1313) 250 39.2 0.0049 KIAA0531 ( 999 res) hg03072 ( 999) 242 38.3 0.007 KIAA0619 ( 1428 res) hg04117 (1428) 243 38.5 0.0083 >>KIAA0454 ( 2296 res) bf02274 (2296 aa) initn: 4766 init1: 4766 opt: 4766 Z-score: 2493.1 bits: 474.2 E(): 9.5e-134 Smith-Waterman score: 4766; 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KIAA16 SDLQQERERLEKDLEEAHREKSKGDCTIRDLRNEVEKLRNEVNEREKAMENRYKSLLSES 450 460 470 480 490 500 610 620 630 640 650 660 KIAA04 YNEIRTQEQNIQHLNHSLSHKEQLLQEFRELLQYRDNSDKTLEANEMLLEKLRQRIHDKA .....::: :.::..: ..:. :::.: : ... : : : : . . : .: KIAA16 NKKLHNQEQVIKHLTESTNQKDVLLQKFNEKDLEVIQQNCYLMAAEDLELRSEGLITEKC 510 520 530 540 550 560 670 680 690 700 710 720 KIAA04 VALERAIDEKFSALEEKEKELRQLRLAVRERDHDL-ERLRDVLSSNEA--TMQSMESLLR . . .. . . :.:.. . . : ....:. .: :. ... ..:. . . KIAA16 SSQQPPGSKTIFSKEKKQSSDYEELIQVLKKEQDIYTHLVKSLQESDSINNLQAELNKIF 570 580 590 600 610 620 730 740 750 760 770 KIAA04 AKGLEVEQLSTTCQNLQWLKEEMETKFSRWQKEQESIIQQLQTS-----LHDRNK-EVED : ..:: . :::. ::. ... : ..:. :. .. ::: :.. :. .:: KIAA16 ALRKQLEQDVLSYQNLRKTLEEQISEIRRREEESFSLYSD-QTSYLSICLEENNRFQVEH 630 640 650 660 670 680 780 790 800 810 820 KIAA04 LSATLLCKLGPGQSEIAEELCQRLQRKERMLQDL---------LSDRNKQVLEHEMEIQG .: : : ....:: :. .. . :: . :: .. . :. . . KIAA16 FSQEELKKKVSDLIQLVKELYTDNQHLKKTIFDLSCMGFQGNGFPDRLASTEQTEL-LAS 690 700 710 720 730 740 830 840 850 860 870 880 KIAA04 LLQSVSTREQESQAAAEKLVQALMERNSELQALRQYLGGRDSLM--SQAPISNQQAEVTP . . . :.. : :.. : .. : . : ... . ... ::. .. .: KIAA16 KEDEDTIKIGEDDEINFLSDQHLQQSNEIMKDLSKG-GCKNGYLRHTESKISDCDGAHAP 750 760 770 780 790 800 890 900 910 920 930 940 KIAA04 TGRLGKQTDQGSMQIPSRDDSTSLT--AKEDV-SIPRSTLGDLDTVAGLEKELSNAKEEL : : .. .. : .....: .. :. .. : : : . :.:.:. :.: KIAA16 -GCL-EEGAFINLLAPLFNEKATLLLESRPDLLKVVRELL--LGQLFLTEQEVSG--EHL 810 820 830 840 850 950 960 970 980 990 1000 KIAA04 ELMAKKERESQMELSALQSMMAVQEEELQVQAADMESLTRNIQIKEDLIKDLQMQLVDPE . ..: ... :: . . . .. . ... . .:.. .. . .:: ..: : : KIAA16 DGKTEKTPKQKGELVHFVQTNSFSKPHDELKLSCEAQLVKAGEVPKVGLKDASVQTVATE 860 870 880 890 900 910 1010 1020 1030 1040 1050 KIAA04 DIPAMERLTQEVL--LLREK----VASVESQGQEISG-NRRQQLLLMLEGLVD---ERSR . :. .:. .:: . :.: . ... : : :: : :... ..:: KIAA16 G--DLLRFKHEATREAWEEKPINTALSAEHRPENLHGVPGWQAALLSLPGITNREAKKSR 920 930 940 950 960 970 1060 1070 1080 1090 1100 KIAA04 LNEALQAERQLYSSLVKFHAHPESSERDRTLQVELEGA--------QVLRSRL---EEVL : .. :.: ... .. : : . .. .::.: . :...: : :. KIAA16 LPILIKPSRSL-GNMYRLPATQEVVTQLQSQILELQGELKEFKTCNKQLHQKLILAEAVM 980 990 1000 1010 1020 1030 1110 1120 1130 1140 KIAA04 -GRSLERLNRLETLAAIGGAAAGDDTEDTSTEFTDSIEEEAAHHSHQQL :: . :.. .:.: . :. . . :.:. .. : :: KIAA16 EGRPTPDKTLLNAQPPVGAAYQDSPGEQKGIKTTSSVWRDKEMDSDQQRSYEIDSEICPP 1040 1050 1060 1070 1080 1090 KIAA16 DDLASLPSCKENPEDVLSPTSVATYLSSKSQPSAKVSVMGTDQSESINTSNETEYLKQKI 1100 1110 1120 1130 1140 1150 >>KIAA1749 ( 1047 res) pj02119y1 (1047 aa) initn: 114 init1: 81 opt: 313 Z-score: 180.3 bits: 45.1 E(): 6.3e-05 Smith-Waterman score: 373; 23.212% identity (57.518% similar) in 685 aa overlap (410-1073:358-1008) 380 390 400 410 420 430 KIAA04 DLCEDYLPLRVQPMTEELLKQQKLNSHETTITQQSVSDSHLAELQEKIQQTEATNKILQE . :.: ..::::...: ... ..: KIAA17 EKIQTLKSRAAGSAQGNNQACNSTSEVKDLLEQKSKLTIEVAELQRQLQLEVKNQQNIKE 330 340 350 360 370 380 440 450 460 470 480 490 KIAA04 KLNEMSY---ELKCAQESSQKQDGTIQN-LKETLKSRERETEELYQVIEGQNDTMAKLRE . ..: ::. .. . ....:.:. :.:. ... :::.:: ... ....:. KIAA17 ERERMRANLEELRSQHNEKVEENSTLQQRLEESEGELRKNLEELFQVKMEREQHQTEIRD 390 400 410 420 430 440 500 510 520 530 540 550 KIAA04 MLHQSQLGQLHS---SEGTSPAQQQVALLDLQSALFCSQLEIQKLQRVVRQKERQLADAK . :.::...:. : : ... ::.. :. .. ..: : ........: . KIAA17 L--QDQLSEMHDELDSAKRSEDREKGALIE---ELLQAKQDLQDLL-IAKEEQEDLLRKR 450 460 470 480 490 500 560 570 580 590 600 610 KIAA04 QCVQFVEAAAHESEQQKEASWKHNQELRKALQQLQEELQNKSQQLRAWEAEKYNEIRTQE . : .: .. ..:.: .:.::. : .: . ::: .... :: : :. ... KIAA17 E----RELTALKGALKEEVS-SHDQEMDKLKEQYDAELQALRESVE--EATKNVEVLASR 510 520 530 540 550 620 630 640 650 660 670 KIAA04 QNIQHLNHSLSH-KEQLLQEFRELLQYRDNSDKTLEANEMLLEKLRQRIHDKAVALERAI .: .. ... .. . .:::: : :: :. : : . .:...:.: .: KIAA17 SNTSEQDQAGTEMRVKLLQEENEKLQGRS------EELERRVAQLQRQIEDLKGDEAKAK 560 570 580 590 600 680 690 700 710 720 KIAA04 DEKFSALEEKEKELRQLRLAV---RERDHDLERLRDVLSSN-EATMQSMESLLRAKGLEV . .:.. : :.:::. :. :..... : .: .. ::.. .. . . . KIAA17 E----TLKKYEGEIRQLEEALVHARKEEKEAVSARRALENELEAAQGNLSQTTQEQKQLS 610 620 630 640 650 660 730 740 750 760 770 780 KIAA04 EQL---STTCQNLQWLKEEMETKFSRWQKEQESIIQQLQTSLHDRNKEVEDLSATLLCKL :.: : ..:. ::.:::.. ::. . :..:: . : . . . : .: KIAA17 EKLKEESEQKEQLRRLKNEMENE--RWHLGKT--IEKLQKEMADIVEASRTSTLELQNQL 670 680 690 700 710 720 790 800 810 820 830 840 KIAA04 GPGQSEIAEELCQRLQR--KERMLQDLLSDRNKQVLEHEMEI-QGLLQSVSTREQESQAA . . .:: . .:: ::. :. : . . .. ::.. . :.. . ..:. . KIAA17 DEYKEKNRRELAE-MQRQLKEKTLEAEKSRLTAMKMQDEMRLMEEELRDYQRAQDEALTK 730 740 750 760 770 850 860 870 880 890 900 KIAA04 AEKLVQALMERNSELQALRQYLGGRDSLMSQAPISNQQAEVTPTGRLGKQTDQGSMQIPS . : :.: . . ::.: . :. :..: . .: :. . ...: : .: : KIAA17 RQLLEQTLKDLEYELEAKSHLKDDRSRLVKQMEDKVSQLEME-LEEERNNSDLLSERI-S 780 790 800 810 820 830 910 920 930 940 950 KIAA04 RDDSTSLTAKEDVSIPRSTLGDL--DTVAGLEKELSNAKEELELMAKKERESQMELSA-L :. ..... :.. :: : .. ::.. .. : .. . . : :. : . . KIAA17 RSREQMEQVRNELLQERAARQDLECDKIS-LERQNKDLKSRIIHLEGSYRSSKEGLVVQM 840 850 860 870 880 890 960 970 980 990 1000 1010 KIAA04 QSMMAVQEEELQVQAADMESLTRNIQIKEDLIKDLQMQLVDPEDIPAMERLTQEVLLLRE .. .: :..:. . : .: . . : .:.: :: :: : . .. : : :. KIAA17 EARIAELEDRLESEERDRANLQLSNRRLERKVKELVMQ-VDDEHLSLTDQKDQLSLRLKA 900 910 920 930 940 950 1020 1030 1040 1050 1060 1070 KIAA04 KVASVESQGQEISGNRRQQLLLMLEGLVDERSRLNEALQAERQLYSSLVKFHAHPESSER .:: .:: .: .. :. ..:. .:: ::.. . ... .... : KIAA17 MKRQVEEAEEEI--DRLESSKKKLQRELEEQMDMNEHLQGQLNSMKKDLRLKKLPSKVLD 960 970 980 990 1000 1010 1080 1090 1100 1110 1120 1130 KIAA04 DRTLQVELEGAQVLRSRLEEVLGRSLERLNRLETLAAIGGAAAGDDTEDTSTEFTDSIEE KIAA17 DMDDDDDLSTDGGSLYEAPVSYTFSKDSTVASQI 1020 1030 1040 >>KIAA0004 ( 1307 res) ha00065 (1307 aa) initn: 228 init1: 90 opt: 288 Z-score: 166.1 bits: 42.8 E(): 0.00039 Smith-Waterman score: 413; 23.588% identity (57.716% similar) in 797 aa overlap (369-1123:495-1232) 340 350 360 370 380 390 KIAA04 KPGPSMTDGVSSGFLNRSLKPLYKTPVSYPLELSDLQELWDDLCEDYLPLRVQPMTEELL ..:.. .. :... ..:. :. .:. KIAA00 LVNELTEKTGKLQQEEVQKKNAEQAATQLKVQLQEAERRWEEV-QSYIRKRT---AEHEA 470 480 490 500 510 520 400 410 420 430 440 450 KIAA04 KQQKLNSHETTITQQSVSDSHLAELQEKIQQTEATNKILQEKLNE-MSYELK--CAQESS :: :.:. . ...... :. :. .: .... :...: . : : : .:: KIAA00 AQQDLQSKFV------AKENEVQSLHSKLTDTLVSKQQLEQRLMQLMESEQKRVNKEESL 530 540 550 560 570 460 470 480 490 500 KIAA04 QKQDGTIQNLKETLKSRERETEELYQVIEGQNDTMAKLREMLHQ------SQLGQLH--- : : : . .:.::. . ..... : .:. . . : : ::. .:. : . KIAA00 QMQVQDILEQNEALKA---QIQQFHSQIAAQT-SASVLAEELHKVIAEKDKQIKQTEDSL 580 590 600 610 620 630 510 520 530 540 550 560 KIAA04 SSEGTSPAQQQVALLDLQSALFCSQLEIQKLQRVVRQKERQLADAKQCVQFVEAAAHESE .:: .... : :.:. : . :.:::: .. .. ::::: : KIAA00 ASERDRLTSKEEELKDIQNMNFLLKAEVQKLQALANEQA--------------AAAHELE 640 650 660 670 570 580 590 600 610 620 KIAA04 QQKEASWKHNQELRKALQQLQEELQNKSQQLRAWEAEKYNEIRTQEQNIQHLNHSLSHKE ..... . .....: .:::.:..:: .... . .. . .... :..: : .:. 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KIAA08 KTQLEELEDELQATEDAKLRLEVNM-QALKGQFERDLQARDEQNE--EKRRQLQRQLHEY 1560 1570 1580 1590 1600 1610 1070 1080 1090 1100 1110 1120 KIAA04 HAHPESSERDRTLQV----ELEGAQVLRSRLEEVLGRSLERLNRLETLAAIGGAAAGDDT ... :. ...:.: . .::: KIAA08 ETELEDERKQRALAAAAKKKLEGDLKDLELQADSAIKGREEAIKQLRKLQAQMKDFQREL 1620 1630 1640 1650 1660 1670 >>KIAA1319 ( 1208 res) fh13717 (1208 aa) initn: 235 init1: 125 opt: 274 Z-score: 159.3 bits: 41.5 E(): 0.00094 Smith-Waterman score: 360; 23.913% identity (54.928% similar) in 690 aa overlap (395-1058:521-1152) 370 380 390 400 410 420 KIAA04 VSYPLELSDLQELWDDLCEDYLPLRVQPMTEELLKQQKLNSHETTITQQSVSDSHLAELQ :.. .: . .... ..:.....: : :. 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KIAA03 DAQQTTLMNMEIADYERLMKELNQKLTNKNNKIEDLE-QEIKIQKQKQETLQEEITSLQS 1110 1120 1130 1140 1150 1160 670 680 690 700 710 720 KIAA04 AIDEKFSALEEKEKELRQLRLAVRERDHDLERLRDVLSSNEATMQSMESLLRAKGLEVE- .... :::. ...:: . ... .: ... ... . :... :.:. .:: KIAA03 SVQQ----YEEKNTKIKQLLVKTKK---ELADSKQAETDHLILQASLKGELEASQQQVEV 1170 1180 1190 1200 1210 730 740 750 760 770 780 KIAA04 ---QLSTTCQNLQWLKEEMETKFSRWQKEQESIIQQLQTSLHDRNKEVEDLSATLLCKLG ::. .. . ..:...:. . :. : :: :.:... . .. .::. .. KIAA03 YKIQLAEITSEKHKIHEHLKTSAEQHQRTL-SAYQQRVTALQEECRAAKAEQATVTSEFE 1220 1230 1240 1250 1260 1270 790 800 810 820 830 840 KIAA04 PGQSEIAEELCQRLQRKERMLQDLLSDRNKQVLEHEMEIQGLLQSVSTREQESQAAAEKL . .. . : :. :.. ... .. :: :: .:. :..... . :.:: . KIAA03 SYKVRVHNVLKQQ---KNKSMSQAETEGAKQEREH-LEM--LIDQLKIKLQDSQNNLQIN 1280 1290 1300 1310 1320 850 860 870 880 890 900 KIAA04 VQALMERNSELQALRQYLGGRDSLMSQAPISNQQAEVTPTGRLGKQTDQGSMQIPSRDDS :. :. .:: ..: . : . : : .: ..::. . :... :. . 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