# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hh00171.fasta.huge -Q ../query/KIAA0472.ptfa ./tmplib.23147 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0472, 365 aa vs ./tmplib.23147 library 1987140 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.3367+/-0.00563; mu= 15.7525+/- 0.383 mean_var=108.2310+/-26.642, 0's: 0 Z-trim: 41 B-trim: 119 in 1/39 Lambda= 0.123282 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1760 ( 2219 res) af00030 (2219) 260 58.0 5.9e-09 KIAA1264 ( 753 res) hj01058 ( 753) 252 55.8 8.9e-09 KIAA1142 ( 467 res) hh05864 ( 467) 248 54.8 1.1e-08 KIAA1361 ( 1005 res) fj02367 (1005) 250 55.6 1.3e-08 KIAA1278 ( 1311 res) hg03689(revised) (1311) 250 55.8 1.5e-08 KIAA1860 ( 689 res) fh18358 ( 689) 246 54.7 1.8e-08 KIAA0344 ( 2066 res) hg01568 (2066) 250 56.1 1.9e-08 KIAA0881 ( 1064 res) hk07534 (1064) 246 55.0 2.2e-08 KIAA1477 ( 870 res) fj04927 ( 870) 240 53.8 4.2e-08 KIAA1995 ( 1011 res) bh00088 (1011) 236 53.2 7.5e-08 KIAA1297 ( 2242 res) fg03883 (2242) 238 54.1 8.9e-08 KIAA0999 ( 1371 res) fj10213 (1371) 233 52.8 1.3e-07 KIAA0537 ( 698 res) hg03925 ( 698) 229 51.7 1.4e-07 KIAA1765 ( 608 res) fj12188(revised) ( 608) 225 50.9 2.2e-07 KIAA0096 ( 766 res) ha01240s1 ( 766) 226 51.2 2.2e-07 KIAA1459 ( 853 res) fh16961 ( 853) 223 50.7 3.4e-07 KIAA1790 ( 1369 res) fh24104 (1369) 211 48.9 1.9e-06 KIAA0175 ( 656 res) ha02337 ( 656) 205 47.4 2.7e-06 KIAA0781 ( 950 res) hk09678 ( 950) 206 47.8 2.9e-06 KIAA1901 ( 1265 res) hh03635 (1265) 206 48.0 3.4e-06 KIAA1811 ( 715 res) ha06731 ( 715) 203 47.1 3.6e-06 KIAA1639 ( 2584 res) af14886 (2584) 208 48.8 3.9e-06 KIAA0551 ( 1385 res) hh00867s1 (1385) 205 47.9 4e-06 KIAA0904 ( 1535 res) ha00554 (1535) 201 47.2 7e-06 KIAA0787 ( 557 res) hk05521s1 ( 557) 194 45.3 9.6e-06 KIAA0968 ( 527 res) hj06483 ( 527) 192 44.9 1.2e-05 KIAA0965 ( 489 res) hj06174s1 ( 489) 186 43.8 2.4e-05 KIAA0213 ( 1626 res) ha04841s1 (1626) 190 45.3 2.8e-05 KIAA0687 ( 1175 res) hk02992 (1175) 186 44.4 3.8e-05 KIAA0834 ( 453 res) hj05353 ( 453) 180 42.7 4.8e-05 KIAA0369 ( 794 res) hh00177 ( 794) 180 43.0 6.5e-05 KIAA1048 ( 897 res) hh02560 ( 897) 180 43.1 7e-05 KIAA0619 ( 1428 res) hg04117 (1428) 171 41.8 0.00027 KIAA0936 ( 640 res) hh04647 ( 640) 165 40.2 0.00037 KIAA1101 ( 467 res) hk08029 ( 467) 160 39.1 0.00058 KIAA0204 ( 1164 res) ha02801 (1164) 161 39.9 0.00083 KIAA0722 ( 1066 res) hk02030s1 (1066) 155 38.8 0.0017 KIAA0623 ( 1100 res) hg04615 (1100) 153 38.5 0.0022 KIAA0137 ( 801 res) ha02915s1 ( 801) 146 37.0 0.0043 KIAA1124 ( 1760 res) fg05708 (1760) 146 37.5 0.0066 >>KIAA1760 ( 2219 res) af00030 (2219 aa) initn: 157 init1: 119 opt: 260 Z-score: 252.7 bits: 58.0 E(): 5.9e-09 Smith-Waterman score: 260; 25.246% identity (55.738% similar) in 305 aa overlap (34-324:140-428) 10 20 30 40 50 60 KIAA04 VAQEAIESLSASKLAKSICSQFRTRLNSSHEAFAASLRQLEAGHSGRLEKTEDLWLRVRK : ::..:. . : . : : :.:. 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KIAA12 SSQYISTASYLSSLSLSSSTYPPPSWGSSSDQQP--SRVSHEQFRAALQLVVSPGDPREY 430 440 450 460 470 480 90 100 110 120 130 140 KIAA04 LGQ--ELGRGQYGVVYLCDNWGGHFPCALKSVVPPDEKHWNDLALEFHYMRSLPKHERLV :.. ..:.:. :.: . . :.:.. ... . : : ::. .:. .: KIAA12 LANFIKIGEGSTGIVCIATEKHTGKQVAVKKMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDY-HHDNVV 490 500 510 520 530 540 150 160 170 180 190 200 KIAA04 DLHGSVIDYNYGGGSSIAVLLIMERLHRDLYTGLKAGLTLETRL---QIA---LDVVEGI :...: : :. . : .:: :. : . .. .::. ::: :.:.... KIAA12 DMYSS-----YLVGDELWV--VMEFLE----GGALTDIVTHTRMNEEQIATVCLSVLRAL 550 560 570 580 590 210 220 230 240 250 KIAA04 RFLHSQGLVHRDIKLKNVLLDKQNRAKITDLGFC---KPEAMMSGSIVGTPIHMAPELFT .::.::..::::: ..:: ...: :..:.::: . :. :.:::: ::::... KIAA12 SYLHNQGVIHRDIKSDSILLTSDGRIKLSDFGFCAQVSKEVPKRKSLVGTPYWMAPEVIS 600 610 620 630 640 650 260 270 280 290 300 310 KIAA04 G-KYDNSVDVYAFGILFWYICSGSVKLPEAFERCASKDHLWNNVRRGARPERLPVFDEEC : . ::....::. . .: KIAA12 RLPYGTEVDIWSLGIMVIEMIDGEPPYFNEPPLQAMRRIRDSLPPRVKDLHKVSSVLRGF 660 670 680 690 700 710 >>KIAA1142 ( 467 res) hh05864 (467 aa) initn: 196 init1: 151 opt: 248 Z-score: 247.6 bits: 54.8 E(): 1.1e-08 Smith-Waterman score: 253; 28.102% identity (54.015% similar) in 274 aa overlap (93-356:202-435) 70 80 90 100 110 120 KIAA04 KDHAPRLARLSLESRSLQDVLLHRKPKLGQELGRGQYGVVYLCDNWGGHFPCALKSVVPP ..:.:. :.: . .. :.:.. KIAA11 PQRVSHEQFRAALQLVVDPGDPRSYLDNFIKIGEGSTGIVCIATVRSSGKLVAVKKMDLR 180 190 200 210 220 230 130 140 150 160 170 180 KIAA04 DEKHWNDLALEFHYMRSLPKHERLVDLHGSVIDYNYGGGSSIAVLLIMERLHRDLYTGLK ... . : : ::. .:: .:....: : :. . : .:: :. : KIAA11 KQQRRELLFNEVVIMRDY-QHENVVEMYNS-----YLVGDELWV--VMEFLE----GGAL 240 250 260 270 190 200 210 220 230 KIAA04 AGLTLETRL---QIA---LDVVEGIRFLHSQGLVHRDIKLKNVLLDKQNRAKITDLGFC- . .. .::. ::: : :.... ::.::..::::: ..:: ...:.:..:.::: KIAA11 TDIVTHTRMNEEQIAAVCLAVLQALSVLHAQGVIHRDIKSDSILLTHDGRVKLSDFGFCA 280 290 300 310 320 330 240 250 260 270 280 290 KIAA04 --KPEAMMSGSIVGTPIHMAPELFTG-KYDNSVDVYAFGILFWYICSGSVKLPEAFERCA . :. :.:::: :::::.. : ::....::. . .: KIAA11 QVSKEVPRRKSLVGTPYWMAPELISRLPYGPEVDIWSLGIMVIEMVDG------------ 340 350 360 370 380 300 310 320 330 340 350 KIAA04 SKDHLWNNVRRGARPERLPVFDEECWQLMEACWDGDPLKRPLLGIVQPMLQGIMNRLCKS .: : :.: . :. :. : . : :.: :.:...:: KIAA11 -------------EP---PYFNEPPLKAMKMIRDNLPPRLKNLHKVSPSLKGFLDRLLVR 390 400 410 420 430 360 KIAA04 NSEQPNRGLDDST . : KIAA11 DPAQRATAAELLKHPFLAKAGPPASIVPLMRQNRTR 440 450 460 >>KIAA1361 ( 1005 res) fj02367 (1005 aa) initn: 168 init1: 120 opt: 250 Z-score: 246.3 bits: 55.6 E(): 1.3e-08 Smith-Waterman score: 250; 28.037% identity (59.346% similar) in 214 aa overlap (73-272:13-217) 50 60 70 80 90 KIAA04 LEAGHSGRLEKTEDLWLRVRKDHAPRLARLSLESRSLQDVLLHRKP-KLG---QELGRGQ ::.. . ...... : :: .:.:.:. KIAA13 LLSRMPSTNRAGSLKDPEIAELFFKEDPEKLFTDLREIGHGS 10 20 30 40 100 110 120 130 140 150 KIAA04 YGVVYLCDNWGGHFPCALKSVVPPDEK---HWNDLALEFHYMRSLPKHERLVDLHGSVID .:.::. . . :.:.. .. .:.:. : .... . :: .. .: . KIAA13 FGAVYFARDVRTNEVVAIKKMSYSGKQSTEKWQDIIKEVKFLQRI-KHPNSIEYKGCYLR 50 60 70 80 90 100 160 170 180 190 200 210 KIAA04 YNYGGGSSIAVLLIMERL---HRDLYTGLKAGLTLETRLQIALDVVEGIRFLHSQGLVHR . .. :.:: :: : : :. ...:. .:::. ..:: KIAA13 EH-------TAWLVMEYCLGSASDLLEVHKKPLQEVEIAAITHGALQGLAYLHSHTMIHR 110 120 130 140 150 220 230 240 250 260 KIAA04 DIKLKNVLLDKQNRAKITDLGFCKPEAMMSGSIVGTPIHMAPELFT----GKYDNSVDVY ::: :.:: . ...:..:.: : ..:.:::: ::::.. :.::..:::. KIAA13 DIKAGNILLTEPGQVKLADFG-SASMASPANSFVGTPYWMAPEVILAMDEGQYDGKVDVW 160 170 180 190 200 210 270 280 290 300 310 320 KIAA04 AFGILFWYICSGSVKLPEAFERCASKDHLWNNVRRGARPERLPVFDEECWQLMEACWDGD ..:: KIAA13 SLGITCIELAERKPPLFNMNAMSALYHIAQNESPTLQSNEWSDYFRNFVDSCLQKIPQDR 220 230 240 250 260 270 >>KIAA1278 ( 1311 res) hg03689(revised) (1311 aa) initn: 223 init1: 123 opt: 250 Z-score: 245.2 bits: 55.8 E(): 1.5e-08 Smith-Waterman score: 250; 27.273% identity (56.439% similar) in 264 aa overlap (94-344:27-273) 70 80 90 100 110 120 KIAA04 DHAPRLARLSLESRSLQDVLLHRKPKLGQELGRGQYGVVYLCDNWGGHFPCALKSVVPP- .:.:..: :: . ::: .: KIAA12 LFTVSTFFLLRDPETSVMEKYHVLEMIGEGSFGRVYKGRRKYSAQVVALK-FIPKL 10 20 30 40 50 130 140 150 160 170 180 KIAA04 --DEKHWNDLALEFHYMRSLPKHERLVDLHGSVIDYNYGGGSSIAVLLIMERLHRDLYTG .::. .: :.. ::.: .: .: . : .. :... . . .:. KIAA12 GRSEKELRNLQREIEIMRGL-RHPNIVHMLDSF-------ETDKEVVVVTDYAEGELFQI 60 70 80 90 100 190 200 210 220 230 KIAA04 LKA-GLTLETRLQ-IALDVVEGIRFLHSQGLVHRDIKLKNVLLDKQNRAKITDLGFCKP- :. : : ..: :: ..: .. .:::. ..:::.: .:.:: : . :. :.:: . KIAA12 LEDDGKLPEDQVQAIAAQLVSALYYLHSHRILHRDMKPQNILLAKGGGIKLCDFGFARAM 110 120 130 140 150 160 240 250 260 270 280 290 KIAA04 --EAMMSGSIVGTPIHMAPELFTGK-YDNSVDVYAFGILFWYICSGSVKLPEAFERCASK ..:. :: :::..:.::: . ::...:... : ... . :. : . .: KIAA12 STNTMVLTSIKGTPLYMSPELVEERPYDHTADLWSVGCILYELAVGT---PPFY--ATSI 170 180 190 200 210 220 300 310 320 330 340 350 KIAA04 DHLWNNVRRGARPERLPVFDEECWQ-LMEACWDGDPLKR---PLLGIVQPMLQGIMNRLC .: . . . : : : :.. .... :: .: : : . .:.. : KIAA12 FQLVSLILKD--PVRWPSTISPCFKNFLQGLLTKDPRQRLSWPDL-LYHPFIAGHVTIIT 230 240 250 260 270 360 KIAA04 KSNSEQPNRGLDDST KIAA12 EPAGPDLGTPFTSRLPPELQVLKDEQAHRLAPKGNQSRILTQAYKRMAEEAMQKKHQNTG 280 290 300 310 320 330 >>KIAA1860 ( 689 res) fh18358 (689 aa) initn: 178 init1: 125 opt: 246 Z-score: 244.1 bits: 54.7 E(): 1.8e-08 Smith-Waterman score: 246; 26.736% identity (56.944% similar) in 288 aa overlap (64-332:29-299) 40 50 60 70 80 90 KIAA04 EAFAASLRQLEAGHSGRLEKTEDLWLRVRKDHAPRLARLSLESRSLQDVLL--HRKPKLG :..: . :: .: ... ...:..: KIAA18 KMSSRTVLAPGNDRNSDTHGTLGSGRSSDKGPSWSSRSLGARCRNSIASCPEEQPHVG 10 20 30 40 50 100 110 120 130 140 KIAA04 -----QELGRGQYGVVYLCDNWGGHFPCALKSVVPPDEKHWNDLALE--FHYMRSLP--K . .:.:... : : . :.: . :. . : .:. :. .: . . 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