# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hh00171.fasta.huge -Q ../query/KIAA0472.ptfa ./tmplib.23147 2
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007
Please cite:
 W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

 KIAA0472, 365 aa
 vs ./tmplib.23147 library

1987140 residues in  2037 sequences
  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.3367+/-0.00563; mu= 15.7525+/- 0.383
 mean_var=108.2310+/-26.642, 0's: 0 Z-trim: 41  B-trim: 119 in 1/39
 Lambda= 0.123282

FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2
 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width:  16
The best scores are:                                      opt bits E(2037)
KIAA1760  ( 2219 res)   af00030                    (2219)  260 58.0 5.9e-09
KIAA1264  ( 753 res)   hj01058                     ( 753)  252 55.8 8.9e-09
KIAA1142  ( 467 res)   hh05864                     ( 467)  248 54.8 1.1e-08
KIAA1361  ( 1005 res)   fj02367                    (1005)  250 55.6 1.3e-08
KIAA1278  ( 1311 res)   hg03689(revised)           (1311)  250 55.8 1.5e-08
KIAA1860  ( 689 res)   fh18358                     ( 689)  246 54.7 1.8e-08
KIAA0344  ( 2066 res)   hg01568                    (2066)  250 56.1 1.9e-08
KIAA0881  ( 1064 res)   hk07534                    (1064)  246 55.0 2.2e-08
KIAA1477  ( 870 res)   fj04927                     ( 870)  240 53.8 4.2e-08
KIAA1995  ( 1011 res)   bh00088                    (1011)  236 53.2 7.5e-08
KIAA1297  ( 2242 res)   fg03883                    (2242)  238 54.1 8.9e-08
KIAA0999  ( 1371 res)   fj10213                    (1371)  233 52.8 1.3e-07
KIAA0537  ( 698 res)   hg03925                     ( 698)  229 51.7 1.4e-07
KIAA1765  ( 608 res)   fj12188(revised)            ( 608)  225 50.9 2.2e-07
KIAA0096  ( 766 res)   ha01240s1                   ( 766)  226 51.2 2.2e-07
KIAA1459  ( 853 res)   fh16961                     ( 853)  223 50.7 3.4e-07
KIAA1790  ( 1369 res)   fh24104                    (1369)  211 48.9 1.9e-06
KIAA0175  ( 656 res)   ha02337                     ( 656)  205 47.4 2.7e-06
KIAA0781  ( 950 res)   hk09678                     ( 950)  206 47.8 2.9e-06
KIAA1901  ( 1265 res)   hh03635                    (1265)  206 48.0 3.4e-06
KIAA1811  ( 715 res)   ha06731                     ( 715)  203 47.1 3.6e-06
KIAA1639  ( 2584 res)   af14886                    (2584)  208 48.8 3.9e-06
KIAA0551  ( 1385 res)   hh00867s1                  (1385)  205 47.9   4e-06
KIAA0904  ( 1535 res)   ha00554                    (1535)  201 47.2   7e-06
KIAA0787  ( 557 res)   hk05521s1                   ( 557)  194 45.3 9.6e-06
KIAA0968  ( 527 res)   hj06483                     ( 527)  192 44.9 1.2e-05
KIAA0965  ( 489 res)   hj06174s1                   ( 489)  186 43.8 2.4e-05
KIAA0213  ( 1626 res)   ha04841s1                  (1626)  190 45.3 2.8e-05
KIAA0687  ( 1175 res)   hk02992                    (1175)  186 44.4 3.8e-05
KIAA0834  ( 453 res)   hj05353                     ( 453)  180 42.7 4.8e-05
KIAA0369  ( 794 res)   hh00177                     ( 794)  180 43.0 6.5e-05
KIAA1048  ( 897 res)   hh02560                     ( 897)  180 43.1   7e-05
KIAA0619  ( 1428 res)   hg04117                    (1428)  171 41.8 0.00027
KIAA0936  ( 640 res)   hh04647                     ( 640)  165 40.2 0.00037
KIAA1101  ( 467 res)   hk08029                     ( 467)  160 39.1 0.00058
KIAA0204  ( 1164 res)   ha02801                    (1164)  161 39.9 0.00083
KIAA0722  ( 1066 res)   hk02030s1                  (1066)  155 38.8  0.0017
KIAA0623  ( 1100 res)   hg04615                    (1100)  153 38.5  0.0022
KIAA0137  ( 801 res)   ha02915s1                   ( 801)  146 37.0  0.0043
KIAA1124  ( 1760 res)   fg05708                    (1760)  146 37.5  0.0066


>>KIAA1760  ( 2219 res)   af00030                         (2219 aa)
 initn: 157 init1: 119 opt: 260  Z-score: 252.7  bits: 58.0 E(): 5.9e-09
Smith-Waterman score: 260;  25.246% identity (55.738% similar) in 305 aa overlap (34-324:140-428)

            10        20        30        40        50        60   
KIAA04 VAQEAIESLSASKLAKSICSQFRTRLNSSHEAFAASLRQLEAGHSGRLEKTEDLWLRVRK
                                     :  ::..:. . : .    : :    :.:.
KIAA17 GPEPVGTQEPGPDPIAAAVETAPAPDGGPREEAAATVRKEDEGAAE--AKPEPG--RTRR
     110       120       130       140       150         160       

            70        80        90       100          110          
KIAA04 DHAPRLARLSLESRSLQDVLLHRKPKLGQELGRGQYGVVYL---CDNWGGHFPCAL--KS
       :.  .      . ...   :  :  :.  :::::.. .::     ..:     : :  ..
KIAA17 DEPEEEEDDEDDLKAVATSLDGRFLKFDIELGRGSFKTVYKGLDTETWVEVAWCELQDRK
         170       180       190       200       210       220     

      120       130       140       150         160       170      
KIAA04 VVPPDEKHWNDLALEFHYMRSLPKHERLVDLHGSVIDY--NYGGGSSIAVLLIMERLHRD
       ..  .......   : .....: .:  .: ..    :.  . . :.   ::.        
KIAA17 LTKLERQRFKE---EAEMLKGL-QHPNIVRFY----DFWESSAKGKRCIVLVTELMTSGT
         230          240        250           260       270       

        180       190         200         210       220        230 
KIAA04 LYTGLKAGLTLETRLQIAL--DVVEGIRFLHSQG--LVHRDIKLKNVLLD-KQNRAKITD
       : : ::   ... ..  .   ....:. :::..   ..:::.:  :...    . .:: :
KIAA17 LKTYLKRFKVMKPKVLRSWCRQILKGLLFLHTRTPPIIHRDLKCDNIFITGPTGSVKIGD
       280       290       300       310       320       330       

              240       250       260       270       280       290
KIAA04 LGFCK-PEAMMSGSIVGTPIHMAPELFTGKYDNSVDVYAFGILFWYICSGSVKLPEAFER
       ::.    .: .. :..:::  ::::..  .::.::::::::. .  . ..  . :  . .
KIAA17 LGLATLKRASFAKSVIGTPEFMAPEMYEEHYDESVDVYAFGMCMLEMATS--EYP--YSE
       340       350       360       370       380         390     

              300       310        320       330       340         
KIAA04 CASKDHLWNNVRRGARPERLP-VFDEECWQLMEACWDGDPLKRPLLGIVQPMLQGIMNRL
       : .  ... .:  : .:  .  : : :  ...  :                         
KIAA17 CQNAAQIYRKVTCGIKPASFEKVHDPEIKEIIGECICKNKEERYEIKDLLSHAFFAEDTG
           400       410       420       430       440       450   

     350       360                                                 
KIAA04 CKSNSEQPNRGLDDST                                            
                                                                   
KIAA17 VRVELAEEDHGRKSTIALRLWVEDPKKLKGKPKDNGAIEFTFDLEKETPDEVAQEMIESG
           460       470       480       490       500       510   

>>KIAA1264  ( 753 res)   hj01058                          (753 aa)
 initn: 196 init1: 155 opt: 252  Z-score: 249.5  bits: 55.8 E(): 8.9e-09
Smith-Waterman score: 252;  30.472% identity (60.515% similar) in 233 aa overlap (64-280:455-673)

            40        50        60        70          80           
KIAA04 EAFAASLRQLEAGHSGRLEKTEDLWLRVRKDHAPRLARLSLES--RSLQDVLLHRKPK--
                                     :. :  .:.: :.   .:: :.    :.  
KIAA12 SSQYISTASYLSSLSLSSSTYPPPSWGSSSDQQP--SRVSHEQFRAALQLVVSPGDPREY
          430       440       450         460       470       480  

      90         100       110       120       130       140       
KIAA04 LGQ--ELGRGQYGVVYLCDNWGGHFPCALKSVVPPDEKHWNDLALEFHYMRSLPKHERLV
       :..  ..:.:. :.: .  .       :.:..    ... . :  :   ::.  .:. .:
KIAA12 LANFIKIGEGSTGIVCIATEKHTGKQVAVKKMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDY-HHDNVV
            490       500       510       520       530        540 

       150       160       170       180       190             200 
KIAA04 DLHGSVIDYNYGGGSSIAVLLIMERLHRDLYTGLKAGLTLETRL---QIA---LDVVEGI
       :...:     :  :. . :  .:: :.     :  . .. .::.   :::   :.:....
KIAA12 DMYSS-----YLVGDELWV--VMEFLE----GGALTDIVTHTRMNEEQIATVCLSVLRAL
                  550         560           570       580       590

             210       220       230          240       250        
KIAA04 RFLHSQGLVHRDIKLKNVLLDKQNRAKITDLGFC---KPEAMMSGSIVGTPIHMAPELFT
        .::.::..:::::  ..:: ...: :..:.:::   . :.    :.::::  ::::...
KIAA12 SYLHNQGVIHRDIKSDSILLTSDGRIKLSDFGFCAQVSKEVPKRKSLVGTPYWMAPEVIS
              600       610       620       630       640       650

       260       270       280       290       300       310       
KIAA04 G-KYDNSVDVYAFGILFWYICSGSVKLPEAFERCASKDHLWNNVRRGARPERLPVFDEEC
          : . ::....::.   . .:                                     
KIAA12 RLPYGTEVDIWSLGIMVIEMIDGEPPYFNEPPLQAMRRIRDSLPPRVKDLHKVSSVLRGF
              660       670       680       690       700       710

>>KIAA1142  ( 467 res)   hh05864                          (467 aa)
 initn: 196 init1: 151 opt: 248  Z-score: 247.6  bits: 54.8 E(): 1.1e-08
Smith-Waterman score: 253;  28.102% identity (54.015% similar) in 274 aa overlap (93-356:202-435)

             70        80        90       100       110       120  
KIAA04 KDHAPRLARLSLESRSLQDVLLHRKPKLGQELGRGQYGVVYLCDNWGGHFPCALKSVVPP
                                     ..:.:. :.: .    ..    :.:..   
KIAA11 PQRVSHEQFRAALQLVVDPGDPRSYLDNFIKIGEGSTGIVCIATVRSSGKLVAVKKMDLR
             180       190       200       210       220       230 

            130       140       150       160       170       180  
KIAA04 DEKHWNDLALEFHYMRSLPKHERLVDLHGSVIDYNYGGGSSIAVLLIMERLHRDLYTGLK
        ... . :  :   ::.  .:: .:....:     :  :. . :  .:: :.     :  
KIAA11 KQQRRELLFNEVVIMRDY-QHENVVEMYNS-----YLVGDELWV--VMEFLE----GGAL
             240        250       260              270             

            190             200       210       220       230      
KIAA04 AGLTLETRL---QIA---LDVVEGIRFLHSQGLVHRDIKLKNVLLDKQNRAKITDLGFC-
       . .. .::.   :::   : :....  ::.::..:::::  ..:: ...:.:..:.::: 
KIAA11 TDIVTHTRMNEEQIAAVCLAVLQALSVLHAQGVIHRDIKSDSILLTHDGRVKLSDFGFCA
     280       290       300       310       320       330         

           240       250        260       270       280       290  
KIAA04 --KPEAMMSGSIVGTPIHMAPELFTG-KYDNSVDVYAFGILFWYICSGSVKLPEAFERCA
         . :.    :.::::  :::::..   :   ::....::.   . .:            
KIAA11 QVSKEVPRRKSLVGTPYWMAPELISRLPYGPEVDIWSLGIMVIEMVDG------------
     340       350       360       370       380                   

            300       310       320       330       340       350  
KIAA04 SKDHLWNNVRRGARPERLPVFDEECWQLMEACWDGDPLKRPLLGIVQPMLQGIMNRLCKS
                    .:   : :.:   . :.   :. : .   :  :.: :.:...::   
KIAA11 -------------EP---PYFNEPPLKAMKMIRDNLPPRLKNLHKVSPSLKGFLDRLLVR
                       390       400       410       420       430 

            360                            
KIAA04 NSEQPNRGLDDST                       
       .  :                                
KIAA11 DPAQRATAAELLKHPFLAKAGPPASIVPLMRQNRTR
             440       450       460       

>>KIAA1361  ( 1005 res)   fj02367                         (1005 aa)
 initn: 168 init1: 120 opt: 250  Z-score: 246.3  bits: 55.6 E(): 1.3e-08
Smith-Waterman score: 250;  28.037% identity (59.346% similar) in 214 aa overlap (73-272:13-217)

             50        60        70        80         90           
KIAA04 LEAGHSGRLEKTEDLWLRVRKDHAPRLARLSLESRSLQDVLLHRKP-KLG---QELGRGQ
                                     ::..  . ...... : ::    .:.:.:.
KIAA13                   LLSRMPSTNRAGSLKDPEIAELFFKEDPEKLFTDLREIGHGS
                                 10        20        30        40  

      100       110       120          130       140       150     
KIAA04 YGVVYLCDNWGGHFPCALKSVVPPDEK---HWNDLALEFHYMRSLPKHERLVDLHGSVID
       .:.::.  .   .   :.:..    ..   .:.:.  : .... . ::   .. .:  . 
KIAA13 FGAVYFARDVRTNEVVAIKKMSYSGKQSTEKWQDIIKEVKFLQRI-KHPNSIEYKGCYLR
             50        60        70        80         90       100 

         160       170          180       190       200       210  
KIAA04 YNYGGGSSIAVLLIMERL---HRDLYTGLKAGLTLETRLQIALDVVEGIRFLHSQGLVHR
        .       .. :.::       ::    :  :       :.  ...:. .:::. ..::
KIAA13 EH-------TAWLVMEYCLGSASDLLEVHKKPLQEVEIAAITHGALQGLAYLHSHTMIHR
                    110       120       130       140       150    

            220       230       240       250           260        
KIAA04 DIKLKNVLLDKQNRAKITDLGFCKPEAMMSGSIVGTPIHMAPELFT----GKYDNSVDVY
       :::  :.:: . ...:..:.:     :  ..:.::::  ::::..     :.::..:::.
KIAA13 DIKAGNILLTEPGQVKLADFG-SASMASPANSFVGTPYWMAPEVILAMDEGQYDGKVDVW
          160       170        180       190       200       210   

      270       280       290       300       310       320        
KIAA04 AFGILFWYICSGSVKLPEAFERCASKDHLWNNVRRGARPERLPVFDEECWQLMEACWDGD
       ..::                                                        
KIAA13 SLGITCIELAERKPPLFNMNAMSALYHIAQNESPTLQSNEWSDYFRNFVDSCLQKIPQDR
           220       230       240       250       260       270   

>>KIAA1278  ( 1311 res)   hg03689(revised)                (1311 aa)
 initn: 223 init1: 123 opt: 250  Z-score: 245.2  bits: 55.8 E(): 1.5e-08
Smith-Waterman score: 250;  27.273% identity (56.439% similar) in 264 aa overlap (94-344:27-273)

            70        80        90       100       110       120   
KIAA04 DHAPRLARLSLESRSLQDVLLHRKPKLGQELGRGQYGVVYLCDNWGGHFPCALKSVVPP-
                                     .:.:..: ::      .    :::  .:  
KIAA12     LFTVSTFFLLRDPETSVMEKYHVLEMIGEGSFGRVYKGRRKYSAQVVALK-FIPKL
                   10        20        30        40        50      

              130       140       150       160       170       180
KIAA04 --DEKHWNDLALEFHYMRSLPKHERLVDLHGSVIDYNYGGGSSIAVLLIMERLHRDLYTG
         .::.  .:  :.. ::.: .:  .: .  :         ..  :... .  . .:.  
KIAA12 GRSEKELRNLQREIEIMRGL-RHPNIVHMLDSF-------ETDKEVVVVTDYAEGELFQI
          60        70         80               90       100       

               190        200       210       220       230        
KIAA04 LKA-GLTLETRLQ-IALDVVEGIRFLHSQGLVHRDIKLKNVLLDKQNRAKITDLGFCKP-
       :.  :   : ..: :: ..: .. .:::. ..:::.: .:.:: : .  :. :.:: .  
KIAA12 LEDDGKLPEDQVQAIAAQLVSALYYLHSHRILHRDMKPQNILLAKGGGIKLCDFGFARAM
       110       120       130       140       150       160       

         240       250       260        270       280       290    
KIAA04 --EAMMSGSIVGTPIHMAPELFTGK-YDNSVDVYAFGILFWYICSGSVKLPEAFERCASK
         ..:.  :: :::..:.:::   . ::...:... : ... .  :.   :  .   .: 
KIAA12 STNTMVLTSIKGTPLYMSPELVEERPYDHTADLWSVGCILYELAVGT---PPFY--ATSI
       170       180       190       200       210            220  

          300       310        320       330          340       350
KIAA04 DHLWNNVRRGARPERLPVFDEECWQ-LMEACWDGDPLKR---PLLGIVQPMLQGIMNRLC
        .: . . .   : : :     :.. ....    :: .:   : : . .:.. :      
KIAA12 FQLVSLILKD--PVRWPSTISPCFKNFLQGLLTKDPRQRLSWPDL-LYHPFIAGHVTIIT
            230         240       250       260        270         

              360                                                  
KIAA04 KSNSEQPNRGLDDST                                             
                                                                   
KIAA12 EPAGPDLGTPFTSRLPPELQVLKDEQAHRLAPKGNQSRILTQAYKRMAEEAMQKKHQNTG
     280       290       300       310       320       330         

>>KIAA1860  ( 689 res)   fh18358                          (689 aa)
 initn: 178 init1: 125 opt: 246  Z-score: 244.1  bits: 54.7 E(): 1.8e-08
Smith-Waterman score: 246;  26.736% identity (56.944% similar) in 288 aa overlap (64-332:29-299)

            40        50        60        70        80          90 
KIAA04 EAFAASLRQLEAGHSGRLEKTEDLWLRVRKDHAPRLARLSLESRSLQDVLL--HRKPKLG
                                     :..:  .  :: .:  ...    ...:..:
KIAA18   KMSSRTVLAPGNDRNSDTHGTLGSGRSSDKGPSWSSRSLGARCRNSIASCPEEQPHVG
                 10        20        30        40        50        

                  100       110       120       130         140    
KIAA04 -----QELGRGQYGVVYLCDNWGGHFPCALKSVVPPDEKHWNDLALE--FHYMRSLP--K
            . .:.:... : :  .       :.: .   :. . :  .:.  :. .: .   .
KIAA18 NYRLLRTIGKGNFAKVKLARHILTGREVAIKII---DKTQLNPSSLQKLFREVRIMKGLN
       60        70        80        90          100       110     

            150       160       170        180        190          
KIAA04 HERLVDLHGSVIDYNYGGGSSIAVLLIMERLHR-DLYTGLKA-GLTLETRLQIAL-DVVE
       :  .: :   ::.      .  .. :.::     ...  : . :   : . .  . ..: 
KIAA18 HPNIVKLF-EVIE------TEKTLYLVMEYASAGEVFDYLVSHGRMKEKEARAKFRQIVS
         120              130       140       150       160        

     200       210       220       230       240         250       
KIAA04 GIRFLHSQGLVHRDIKLKNVLLDKQNRAKITDLGFCKPEAMMS--GSIVGTPIHMAPELF
       .... :....::::.: .:.::: .   ::.:.:: .  .. :   .. :.: . :::::
KIAA18 AVHYCHQKNIVHRDLKAENLLLDAEANIKIADFGFSNEFTLGSKLDTFCGSPPYAAPELF
      170       180       190       200       210       220        

       260         270       280       290       300       310     
KIAA04 TGK-YDNS-VDVYAFGILFWYICSGSVKLPEAFERCASKDHLWNNVRRGARPERLPVF-D
        :: ::.  ::....:.... . :::  ::  :.    :. : . : ::    :.: . .
KIAA18 QGKKYDGPEVDIWSLGVILYTLVSGS--LP--FDGHNLKE-LRERVLRGKY--RVPFYMS
      230       240       250           260        270         280 

          320       330       340       350       360              
KIAA04 EECWQLMEACWDGDPLKRPLLGIVQPMLQGIMNRLCKSNSEQPNRGLDDST         
        .: ....     .: ::                                          
KIAA18 TDCESILRRFLVLNPAKRCTLEQIMKDKWINIGYEGEELKPYTEPEEDFGDTKRIEVMVG
             290       300       310       320       330       340 

>>KIAA0344  ( 2066 res)   hg01568                         (2066 aa)
 initn: 160 init1: 125 opt: 250  Z-score: 243.3  bits: 56.1 E(): 1.9e-08
Smith-Waterman score: 250;  25.806% identity (57.661% similar) in 248 aa overlap (89-324:154-391)

       60        70        80        90       100       110        
KIAA04 LRVRKDHAPRLARLSLESRSLQDVLLHRKPKLGQELGRGQYGVVYLCDNWGGHFP---CA
                                     :.  :.:::.. .::   .         : 
KIAA03 EPQEERSQQQDDIEELETKAVGMSNDGRFLKFDIEIGRGSFKTVYKGLDTETTVEVAWCE
           130       140       150       160       170       180   

           120       130       140       150       160       170   
KIAA04 L--KSVVPPDEKHWNDLALEFHYMRSLPKHERLVDLHGSVIDYNYGGGSSIAVLLIMERL
       :  ....  .......   : .....: .:  .: .. :  .   :    . :  .:   
KIAA03 LQDRKLTKSERQRFKE---EAEMLKGL-QHPNIVRFYDSWESTVKGKKCIVLVTELMTS-
           190          200        210       220       230         

           180       190         200         210       220         
KIAA04 HRDLYTGLKAGLTLETRLQIAL--DVVEGIRFLHSQG--LVHRDIKLKNVLLD-KQNRAK
          : : ::   ... ..  .   ....:..:::..   ..:::.:  :...    . .:
KIAA03 -GTLKTYLKRFKVMKIKVLRSWCRQILKGLQFLHTRTPPIIHRDLKCDNIFITGPTGSVK
       240       250       260       270       280       290       

      230        240       250       260       270       280       
KIAA04 ITDLGFCK-PEAMMSGSIVGTPIHMAPELFTGKYDNSVDVYAFGILFWYICSGSVKLPEA
       : :::.    .: .. :..:::  ::::..  :::.::::::::. .  . ..  . :  
KIAA03 IGDLGLATLKRASFAKSVIGTPEFMAPEMYEEKYDESVDVYAFGMCMLEMATS--EYP--
       300       310       320       330       340       350       

       290       300       310        320       330       340      
KIAA04 FERCASKDHLWNNVRRGARPERLP-VFDEECWQLMEACWDGDPLKRPLLGIVQPMLQGIM
       . .: .  ...  :  :..:  .  :   :  ...:.:                      
KIAA03 YSECQNAAQIYRRVTSGVKPASFDKVAIPEVKEIIEGCIRQNKDERYSIKDLLNHAFFQE
           360       370       380       390       400       410   

        350       360                                              
KIAA04 NRLCKSNSEQPNRGLDDST                                         
                                                                   
KIAA03 ETGVRVELAEEDDGEKIAIKLWLRIEDIKKLKGKYKDNEAIEFSFDLERDVPEDVAQEMV
           420       430       440       450       460       470   

>>KIAA0881  ( 1064 res)   hk07534                         (1064 aa)
 initn: 163 init1: 115 opt: 246  Z-score: 242.3  bits: 55.0 E(): 2.2e-08
Smith-Waterman score: 246;  25.292% identity (55.642% similar) in 257 aa overlap (92-333:47-285)

              70        80        90       100       110       120 
KIAA04 RKDHAPRLARLSLESRSLQDVLLHRKPKLGQELGRGQYGVVYLCDNWGGHFPCALKSVV-
                                     .:.:.:..:.::.  .  .    :.:..  
KIAA08 PAGGRAGSLKDPDVAELFFKDDPEKLFSDLREIGHGSFGAVYFARDVRNSEVVAIKKMSY
         20        30        40        50        60        70      

                130       140       150       160       170        
KIAA04 --PPDEKHWNDLALEFHYMRSLPKHERLVDLHGSVIDYNYGGGSSIAVLLIMERL---HR
           ....:.:.  : .....: .:   .. .:  .  .       .. :.::       
KIAA08 SGKQSNEKWQDIIKEVRFLQKL-RHPNTIQYRGCYLREH-------TAWLVMEYCLGSAS
         80        90        100       110              120        

         180       190       200       210       220       230     
KIAA04 DLYTGLKAGLTLETRLQIALDVVEGIRFLHSQGLVHRDIKLKNVLLDKQNRAKITDLGFC
       ::    :  :       ..  ...:. .:::....:::.:  :.::.. . .:. :.:  
KIAA08 DLLEVHKKPLQEVEIAAVTHGALQGLAYLHSHNMIHRDVKAGNILLSEPGLVKLGDFGSA
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         240       250           260       270       280       290 
KIAA04 KPEAMMSGSIVGTPIHMAPELFT----GKYDNSVDVYAFGILFWYICSGSVKLPEAFERC
       .  :  ..:.::::  ::::..     :.::..:::...::    .     . :  :.  
KIAA08 SIMAP-ANSFVGTPYWMAPEVILAMDEGQYDGKVDVWSLGITCIELAE---RKPPLFNMN
      190        200       210       220       230          240    

             300       310            320       330       340      
KIAA04 ASKDHLWNNVRRGARPERLPVFDEECWQ-----LMEACWDGDPLKRPLLGIVQPMLQGIM
       :      . . . :. :  ::..   :.     ....: .  :  ::             
KIAA08 A-----MSALYHIAQNES-PVLQSGHWSEYFRNFVDSCLQKIPQDRPTSEVLLKHRFVLR
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        350       360                                              
KIAA04 NRLCKSNSEQPNRGLDDST                                         
                                                                   
KIAA08 ERPPTVIMDLIQRTKDAVRELDNLQYRKMKKILFQEAPNGPGAEAPEEEEEAEPYMHRAG
      300       310       320       330       340       350        

>>KIAA1477  ( 870 res)   fj04927                          (870 aa)
 initn: 215 init1: 119 opt: 240  Z-score: 237.3  bits: 53.8 E(): 4.2e-08
Smith-Waterman score: 240;  34.752% identity (65.248% similar) in 141 aa overlap (197-332:256-389)

        170       180       190       200       210       220      
KIAA04 LLIMERLHRDLYTGLKAGLTLETRLQIALDVVEGIRFLHSQGLVHRDIKLKNVLLDKQNR
                                     .: .... :.. .::::.: .:.::: .  
KIAA14 LNHPNIGEVFDYLVAHGRMKEKEARAKFRQIVSAVQYCHQKYIVHRDLKAENLLLDGDMN
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KIAA04 AKITDLGFCKPEAMMS--GSIVGTPIHMAPELFTGK-YDNS-VDVYAFGILFWYICSGSV
        ::.:.:: .  .. .   .. :.: . ::::: :: ::.  :::...:.... . ::: 
KIAA14 IKIADFGFSNEFTVGNKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDVWSLGVILYTLVSGS-
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KIAA04 KLPEAFERCASKDHLWNNVRRGARPERLPVF-DEECWQLMEACWDGDPLKRPLLGIVQPM
        ::  :.    :. : . : ::    :.: . . .: .:..     .:.::         
KIAA14 -LP--FDGQNLKE-LRERVLRGKY--RIPFYMSTDCENLLKKLLVLNPIKRGSLEQIMKD
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KIAA14 RWMNVGHEEEELKPYTEPDPDFNDTKRIDIMVTMGFARDEINDALINQKYDEVMATYILL
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>>KIAA1995  ( 1011 res)   bh00088                         (1011 aa)
 initn: 181 init1:  83 opt: 236  Z-score: 232.9  bits: 53.2 E(): 7.5e-08
Smith-Waterman score: 236;  26.236% identity (54.753% similar) in 263 aa overlap (84-333:82-329)

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KIAA04 TEDLWLRVRKDHAPRLARLSLESRSLQDVLLHRKPKLGQELGRGQYGVVYLCDNWGGHFP
                                     ::  :   . :::: .: . :         
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KIAA04 CALKSV--VPPDEKHWNDLALEFHYMRSLPKHERLVDLHGSVIDYNYGGGSSIAVLLIME
        . : :  .  .::.  : ::.   . .: .:. ..  ..  .:       . ..:. .:
KIAA19 VVWKEVDLTRLSEKERRD-ALNEIVILALLQHDNIIAYYNHFMD-------NTTLLIELE
     110       120        130       140       150              160 

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KIAA04 RLHR-DLYTGL--KAGLTLETRLQI--ALDVVEGIRFLHSQGLVHRDIKLKNVLLDKQNR
         .  .::  .  .    .: .. .   ...: ..  .:. :..:::::  :..: : : 
KIAA19 YCNGGNLYDKILRQKDKLFEEEMVVWYLFQIVSAVSCIHKAGILHRDIKTLNIFLTKANL
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        :. : :. :    :  :. ..:::: .:.:::  : ::. . :..: : ... .    .
KIAA19 IKLGDYGLAKKLNSEYSMAETLVGTPYYMSPELCQGVKYNFKSDIWAVGCVIFEL----L
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        : ..:.  ..  .:  .. .: :  ..    .. :  :....: : :: .::       
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Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]