# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/pg00625.fasta.nr -Q ../query/KIAA0466.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0466, 1214 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7822608 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1144+/-0.000195; mu= 14.7157+/- 0.011 mean_var=88.2214+/-17.283, 0's: 40 Z-trim: 44 B-trim: 3384 in 3/64 Lambda= 0.136549 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|172046061|sp|O75054.3|IGSF3_HUMAN RecName: Full (1194) 7998 1586.9 0 gi|84040284|gb|AAI10652.1| Immunoglobulin superfam (1195) 7980 1583.3 0 gi|190689969|gb|ACE86759.1| immunoglobulin superfa (1195) 7969 1581.1 0 gi|190691343|gb|ACE87446.1| immunoglobulin superfa (1195) 7963 1580.0 0 gi|73981172|ref|XP_540257.2| PREDICTED: similar to (1232) 7627 1513.8 0 gi|190360178|sp|Q6ZQA6.2|IGSF3_MOUSE RecName: Full (1194) 7538 1496.2 0 gi|31127126|gb|AAH52892.1| Immunoglobulin superfam (1194) 7525 1493.7 0 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( 478) 3003 602.4 2e-169 gi|119577062|gb|EAW56658.1| immunoglobulin superfa ( 833) 2754 553.6 1.7e-154 gi|119889563|ref|XP_001250697.1| PREDICTED: simila ( 490) 2570 517.2 9.7e-144 gi|114578741|ref|XP_001138143.1| PREDICTED: simila ( 800) 2571 517.6 1.2e-143 gi|119577068|gb|EAW56664.1| immunoglobulin superfa (1036) 2115 427.9 1.6e-116 gi|149708908|ref|XP_001496616.1| PREDICTED: simila (1030) 2112 427.3 2.4e-116 gi|114558616|ref|XP_524815.2| PREDICTED: similar t (1021) 2107 426.3 4.6e-116 gi|219521680|gb|AAI71768.1| IGSF2 protein [Homo sa (1021) 2103 425.5 8e-116 gi|55665019|emb|CAH71959.1| immunoglobulin superfa (1021) 2097 424.3 1.8e-115 gi|120660024|gb|AAI30328.1| IGSF2 protein [Homo sa (1021) 2096 424.1 2.1e-115 gi|74762640|sp|Q93033.1|IGSF2_HUMAN RecName: Full= (1021) 2095 423.9 2.4e-115 gi|109014582|ref|XP_001112908.1| PREDICTED: simila (1021) 2067 418.4 1.1e-113 gi|157390470|emb|CAO94507.1| CD101 protein [Mus mu (1033) 2018 408.7 8.9e-111 gi|194036395|ref|XP_001927735.1| 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