# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hg01123s2.fasta.nr -Q ../query/KIAA0465.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0465, 4433 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7814119 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9046+/-0.000203; mu= 10.2982+/- 0.011 mean_var=148.1186+/-28.268, 0's: 38 Z-trim: 95 B-trim: 0 in 0/66 Lambda= 0.105383 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 50, opt: 38, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|123244272|emb|CAM20971.1| microtubule-actin cro (4429) 26308 4014.4 0 gi|148698430|gb|EDL30377.1| mCG1040588, isoform CR (5324) 18367 2807.2 0 gi|123244270|emb|CAM20969.1| microtubule-actin cro (5328) 18349 2804.4 0 gi|123244271|emb|CAM20970.1| microtubule-actin cro (7353) 18304 2797.7 0 gi|14285343|sp|Q9QXZ0.1|MACF1_MOUSE RecName: Full= (5327) 18262 2791.2 0 gi|67633286|gb|AAY78553.1| microtubule-actin cross (7354) 18249 2789.4 0 gi|119627683|gb|EAX07278.1| microtubule-actin cros (5406) 17714 2707.9 0 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:::.:::::::::::::::::::::::::::::: ::.:::::: .:::.:::::::::: gi|123 QVLAEELTTKKEQVSEAIKTSQIFLAKHGHKLSEGEKEQISEQLRVLNKTYHDLCDGSAN 600 610 620 630 640 650 670 680 690 700 710 720 KIAA04 QLQQLQSQLAHQTEQKTLQKQQNTCHQQLEDLCSWVGQAERALAGHQGRTTQQDLSALQK :::::::.::.:::::::::::.:::..:::::.::::::::: ::: ...:.: :::. gi|123 QLQQLQSELAQQTEQKTLQKQQDTCHKKLEDLCNWVGQAERALERHQGGASRQELPALQQ 660 670 680 690 700 710 730 740 750 760 770 780 KIAA04 NQSDLKDLQDDIQNRATSFATVVKDIEGFMEENQTKLSPRELTALREKLHQAKEQYEALQ ::::::::: :::...:::::.:::::::.:::::::::.:::::::::::::::::.:: gi|123 NQSDLKDLQGDIQSHSTSFATAVKDIEGFLEENQTKLSPQELTALREKLHQAKEQYEVLQ 720 730 740 750 760 770 790 800 810 820 830 840 KIAA04 EETRVAQKELEEAVTSALQQETEKSKAAKELAENKKKIDALLDWVTSVGSSGGQLLTNLP :.:::::::::::::::::::::::::: ::::::.:::::::::.::::: . ..:: gi|123 ERTRVAQKELEEAVTSALQQETEKSKAATELAENKRKIDALLDWVASVGSSERKPQASLP 780 790 800 810 820 830 850 860 870 880 890 900 KIAA04 GMEQLSGASLEKGALDTTDGYMGVNQAPEKLDKQCEMMKARHQELLSQQQNFILATQSAQ ::::.::: ::: .: .:::.. :::.:: ::.: :.::::::::::::::::.::::.: gi|123 GMEQFSGACLEKQTLAATDGHVDVNQVPETLDRQYELMKARHQELLSQQQNFIVATQSVQ 840 850 860 870 880 890 910 920 930 940 950 960 KIAA04 AFLDQHGHNLTPEEQQMLQQKLGELKEQYSTSLAQSEAELKQVQTLQDELQKFLQDHKEF .:::::.:::::::.: ::.:::::::::..:::.:::::::.:.:.::::::::::::: gi|123 SFLDQHSHNLTPEERQKLQEKLGELKEQYAASLARSEAELKQTQALRDELQKFLQDHKEF 900 910 920 930 940 950 970 980 990 1000 1010 1020 KIAA04 ESWLERSEKELENMHKGGSSPETLPSLLKRQGSFSEDVISHKGDLRFVTISGQKVLDMEN :.::..::.::..:::::::::.: :::::::::::::::::::::::::::::::. :: gi|123 ENWLQQSENELDSMHKGGSSPEALNSLLKRQGSFSEDVISHKGDLRFVTISGQKVLETEN 960 970 980 990 1000 1010 1030 1040 1050 1060 1070 1080 KIAA04 SFKEGKEPSEIGNLVKDKLKDATERYTALHSKCTRLGSHLNMLLGQYHQFQNSADSLQAW .:.::.::: :::..::::::::::.::::: ::::::.::::::.:::.:::::::: gi|123 NFEEGQEPSATRNLVNEKLKDATERYTTLHSKCIRLGSHLSMLLGQYQQFQSSADSLQAW 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1090 1100 1110 1120 1130 1140 KIAA04 MQACEANVEKLLSDTVASDPGVLQEQLATTKQLQEELAEHQVPVEKLQKVARDIMEIEGE . .:::.: 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