# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/bj00064.fasta.nr -Q ../query/KIAA0460.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0460, 1452 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7801074 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.3496+/-0.000213; mu= 6.0504+/- 0.012 mean_var=173.7214+/-33.341, 0's: 34 Z-trim: 119 B-trim: 142 in 1/65 Lambda= 0.097308 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|193786970|dbj|BAG51793.1| unnamed protein produ (1461) 9631 1365.5 0 gi|149751211|ref|XP_001489528.1| PREDICTED: simila (1462) 9367 1328.5 0 gi|73981315|ref|XP_540301.2| PREDICTED: similar to (1462) 9341 1324.8 0 gi|73981317|ref|XP_860674.1| PREDICTED: similar to (1480) 8456 1200.6 0 gi|73981313|ref|XP_860613.1| PREDICTED: similar to (1436) 8309 1179.9 0 gi|81892071|sp|Q6NXI6.1|RPRD2_MOUSE RecName: Full= (1469) 7380 1049.5 0 gi|148706887|gb|EDL38834.1| mCG16744, isoform CRA_ (1265) 6712 955.7 0 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