# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/ff02431.fasta.huge -Q ../query/KIAA0453.ptfa ./tmplib.23147 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0453, 3209 aa vs ./tmplib.23147 library 1984296 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5926+/-0.00535; mu= 17.2526+/- 0.364 mean_var=107.5845+/-25.052, 0's: 0 Z-trim: 3 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.123651 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 46, opt: 34, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0986 ( 1458 res) hj08124 (1458) 288 64.0 5.1e-10 KIAA1421 ( 1463 res) hk08067(revised) (1463) 220 51.9 2.3e-06 KIAA0532 ( 1637 res) hg03377 (1637) 186 45.9 0.00017 >>KIAA0986 ( 1458 res) hj08124 (1458 aa) initn: 391 init1: 143 opt: 288 Z-score: 271.8 bits: 64.0 E(): 5.1e-10 Smith-Waterman score: 572; 21.333% identity (53.725% similar) in 1275 aa overlap (1858-3078:346-1428) 1830 1840 1850 1860 1870 1880 KIAA04 TIGSPSSRTNIIHPQVYFSSLPPVRVVFAVTMEGSARKVITVRSALIVRNRLETPMELRL :.::: : .:.:: . .::.. .:. 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