# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hh00601s1.fasta.huge -Q ../query/KIAA0441.ptfa ./tmplib.23147 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0441, 702 aa vs ./tmplib.23147 library 1986803 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.2728+/-0.00715; mu= -0.7703+/- 0.487 mean_var=223.9504+/-55.947, 0's: 0 Z-trim: 83 B-trim: 129 in 1/39 Lambda= 0.085703 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0972 ( 702 res) hj06859 ( 702) 862 119.7 9.2e-28 KIAA1431 ( 891 res) fj00022 ( 891) 841 117.2 6.6e-27 KIAA1611 ( 813 res) fj12627 ( 813) 833 116.2 1.2e-26 KIAA1969 ( 595 res) fk06944 ( 595) 823 114.8 2.3e-26 KIAA1956 ( 680 res) fk08713 ( 680) 823 114.9 2.5e-26 KIAA0326 ( 927 res) hg00579 ( 927) 817 114.3 5.3e-26 KIAA1710 ( 515 res) fj18457 ( 515) 802 112.2 1.3e-25 KIAA2003 ( 460 res) ah02593 ( 460) 800 111.9 1.4e-25 KIAA1396 ( 551 res) hj08221 ( 551) 800 111.9 1.6e-25 KIAA2007 ( 580 res) fj01689 ( 580) 795 111.4 2.5e-25 KIAA0065 ( 848 res) ha00946 ( 848) 798 111.9 2.5e-25 KIAA1829 ( 557 res) hj00069 ( 557) 793 111.1 2.9e-25 KIAA1349 ( 752 res) fj00940 ( 752) 793 111.2 3.6e-25 KIAA1473 ( 574 res) fj03262 ( 574) 789 110.6 4.2e-25 KIAA1962 ( 746 res) hm00158 ( 746) 789 110.7 5e-25 KIAA1852 ( 948 res) fj01514 ( 948) 789 110.8 5.9e-25 KIAA0798 ( 682 res) hk06584 ( 682) 784 110.1 7.2e-25 KIAA1806 ( 481 res) fk00438 ( 481) 780 109.4 7.9e-25 KIAA1947 ( 608 res) fh23660 ( 608) 780 109.5 9.4e-25 KIAA0412 ( 720 res) hg03242 ( 720) 780 109.6 1.1e-24 KIAA2033 ( 766 res) ej00602s1 ( 766) 778 109.4 1.3e-24 KIAA1874 ( 579 res) hk07257s1 ( 579) 772 108.5 1.8e-24 KIAA1982 ( 599 res) fk06527(revised) ( 599) 772 108.5 1.8e-24 KIAA1827 ( 469 res) fk01409 ( 469) 755 106.3 6.6e-24 KIAA1559 ( 544 res) fh19195 ( 544) 754 106.3 8e-24 KIAA1615 ( 484 res) fj13419 ( 484) 752 106.0 8.8e-24 KIAA0426 ( 613 res) hh01274 ( 613) 752 106.1 1e-23 KIAA0628 ( 540 res) hh01433 ( 540) 748 105.5 1.3e-23 KIAA1198 ( 553 res) fg01911 ( 553) 748 105.5 1.4e-23 KIAA1508 ( 573 res) hk06576 ( 573) 746 105.3 1.7e-23 KIAA1588 ( 613 res) fj08823 ( 613) 733 103.7 5.3e-23 KIAA1948 ( 487 res) fh24556 ( 487) 731 103.4 5.3e-23 KIAA0961 ( 530 res) hj05830 ( 530) 724 102.5 1e-22 KIAA1954 ( 468 res) fk02322 ( 468) 703 99.9 5.7e-22 KIAA1141 ( 914 res) hk01833 ( 914) 688 98.3 3.3e-21 KIAA1871 ( 821 res) hj05256s1 ( 821) 680 97.3 6.1e-21 KIAA1015 ( 841 res) hk03609(revised) ( 841) 659 94.7 3.8e-20 KIAA1339 ( 409 res) fj00071 ( 409) 585 85.2 1.3e-17 KIAA1703 ( 1165 res) fj16891 (1165) 587 85.9 2.3e-17 KIAA1979 ( 309 res) fj09511 ( 309) 570 83.3 3.8e-17 KIAA1388 ( 599 res) fj06552 ( 599) 546 80.6 4.7e-16 KIAA0924 ( 617 res) hh02883 ( 617) 544 80.3 5.8e-16 KIAA0557 ( 493 res) hh01334 ( 493) 512 76.3 7.6e-15 KIAA0478 ( 1253 res) hh05955 (1253) 496 74.7 5.8e-14 KIAA1951 ( 679 res) fj05532 ( 679) 484 73.0 1.1e-13 KIAA1231 ( 1061 res) fh08195s1 (1061) 450 68.9 2.7e-12 KIAA1675 ( 1286 res) ae00102 (1286) 434 67.1 1.2e-11 KIAA1993 ( 532 res) bg00180 ( 532) 381 60.1 6e-10 KIAA1485 ( 1104 res) fj07037 (1104) 360 57.8 6.1e-09 KIAA1190 ( 174 res) hg03443a ( 174) 339 54.5 1e-08 >>KIAA0972 ( 702 res) hj06859 (702 aa) initn: 841 init1: 841 opt: 862 Z-score: 590.3 bits: 119.7 E(): 9.2e-28 Smith-Waterman score: 862; 35.714% identity (63.547% similar) in 406 aa overlap (128-521:280-673) 100 110 120 130 140 150 KIAA04 FIYTGYLHASEKSTEQILATAQFLKVYDLVKAYTDFQN--NHSSPKPTTLNTAGAPVVVI ::..: : .:.: . .. 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KIAA09 PYKCNECGKSFCQKGH----LIQHQRTHTGEKPFECSECGKTFSQKSHLSTHQRIHTAEK 430 440 450 460 470 330 340 350 360 370 380 KIAA04 PFKCNECGKGFAQKHSLQVHTRMHTGERPYTCTVCSKALTTKHSLLEHMSLHSGQKSFTC :.::::::: :.:: .:. : :.::::.:: :. :.:... : .: .: .:.:.::: : KIAA09 PYKCNECGKTFVQKSTLRGHQRIHTGEKPYECSECGKTFVQKSTLRDHHRIHTGEKSFQC 480 490 500 510 520 530 390 400 410 420 430 440 KIAA04 DQCGKYFSQNRQLKSHYRVHTGHSLPECKDCHRKFMDVSQLKKHLRTHTGEKPFTCEICG .:::: :.:. .:. : :.:::.. .:..:...: ..: .: .:::::::: :. :: KIAA09 NQCGKTFGQKSNLRIHQRTHTGEKTYQCNECEKSFWRKDHLIQHQKTHTGEKPFKCNECG 540 550 560 570 580 590 450 460 470 480 490 500 KIAA04 KSFTAKSSLQTHIRIHRGEKPYSCGICGKSFSDSSAKRRHCILHTGKKPFSCPECNLQFA :.:. :.:..: ::: ::::..:. :::.: .. : .:::.:::.: .:. :. KIAA09 KTFARTSTLRVHQRIHTGEKPFKCNECGKKFVRKAILSDHQRIHTGEKPFQCNKCGKTFG 600 610 620 630 640 650 510 520 530 540 550 560 KIAA04 RLDNLKAHLKIHSKEKHASDASSISGSSNTEEVRNILQLQPYQLSTSGEQEIQLLVTDSV . .::. : . :: :: KIAA09 QKSNLRIHQRTHSGEKSYECNEYGKLCKKSTLSLYQKIQGEGNPY 660 670 680 690 700 >>KIAA1431 ( 891 res) fj00022 (891 aa) initn: 832 init1: 832 opt: 841 Z-score: 574.9 bits: 117.2 E(): 6.6e-27 Smith-Waterman score: 841; 40.989% identity (66.431% similar) in 283 aa overlap (290-572:603-879) 260 270 280 290 300 310 KIAA04 KRRIWRSVKLKDYKLVGDQEDHGSAKRICGRRKRPGGPEARCKDCGKVFKYNHFLAIHQR .: . : .::.:::.:. : :: : : KIAA14 VHQRIHTGEKPYECDVCRKAFSHHASLTQHQRVHSGEKPFKCKECGKAFRQNIHLASHLR 580 590 600 610 620 630 320 330 340 350 360 370 KIAA04 SHTGERPFKCNECGKGFAQKHSLQVHTRMHTGERPYTCTVCSKALTTKHSLLEHMSLHSG ::::.::.: ::::.:. . .: .: :.::::.:: : :::::.: : : .:.. :.: KIAA14 IHTGEKPFECAECGKSFSISSQLATHQRIHTGEKPYECKVCSKAFTQKAHLAQHQKTHTG 640 650 660 670 680 690 380 390 400 410 420 430 KIAA04 QKSFTCDQCGKYFSQNRQLKSHYRVHTGHSLPECKDCHRKFMDVSQLKKHLRTHTGEKPF .: . : .::: :::. .: .: :::::.. .: .: . : : :. .: : :::..:. KIAA14 EKPYECKECGKAFSQTTHLIQHQRVHTGEKPYKCMECGKAFGDNSSCTQHQRLHTGQRPY 700 710 720 730 740 750 440 450 460 470 480 490 KIAA04 TCEICGKSFTAKSSLQTHIRIHRGEKPYSCGICGKSFSDSSAKRRHCILHTGKKPFSCPE : :::.: .:::: : : : ::::: :..:::.:: .. : .:.::::. : : KIAA14 ECIECGKAFKTKSSLICHRRSHTGEKPYECSVCGKAFSHRQSLSVHQRIHSGKKPYECKE 760 770 780 790 800 810 500 510 520 530 540 550 KIAA04 CNLQFARLDNLKAHLKIHSKEKHASDASSISGSSNTEEVRNILQLQPYQLSTSGEQEIQL : : .. .:. : ..:. :. : . ... . :. .: .: .::. KIAA14 CRKTFIQIGHLNQHKRVHTGER------SYNYKKSRKVFRQTAHLAHHQRIHTGESSTCP 820 830 840 850 860 560 570 580 590 600 610 KIAA04 LVTDSVHNINFMPGPSQGISIVTAESSQNMTADQAANLTLLTQQPEQLQNLILSAQQEQT . .. . ....: KIAA14 SLPSTSNPVDLFPKFLWNPSSLPSP 870 880 890 >>KIAA1611 ( 813 res) fj12627 (813 aa) initn: 825 init1: 825 opt: 833 Z-score: 570.1 bits: 116.2 E(): 1.2e-26 Smith-Waterman score: 833; 44.151% identity (68.302% similar) in 265 aa overlap (295-554:472-735) 270 280 290 300 310 320 KIAA04 RSVKLKDYKLVGDQEDHGSAKRICGRRKRPGGPEARCKDCGKVFKYNHFLAIHQRSHTGE : .:..:.::: : :: :.: :::: KIAA16 HTGEKPYKCNECGKAFSMHSNLATHQVIHTGTKPFKCNECSKVFTQNSQLANHRRIHTGE 450 460 470 480 490 500 330 340 350 360 370 380 KIAA04 RPFKCNECGKGFAQKHSLQVHTRMHTGERPYTCTVCSKALTTKHSLLEHMSLHSGQKSFT .:.:::::::.:. . :: .: .:.::.:: : :.:..: : : : ..:::.: . KIAA16 KPYKCNECGKAFSVRSSLTTHQAIHSGEKPYKCIECGKSFTQKSHLRSHRGIHSGEKPYK 510 520 530 540 550 560 390 400 410 420 430 440 KIAA04 CDQCGKYFSQNRQLKSHYRVHTGHSLPECKDCHRKFMDVSQLKKHLRTHTGEKPFTCEIC :..::: :.:. :: :.:::::.. .:.:: : : : :.: : ::::::. :. : KIAA16 CNECGKVFAQTSQLARHWRVHTGEKPYKCNDCGRAFSDRSSLTFHQAIHTGEKPYKCHEC 570 580 590 600 610 620 450 460 470 480 490 500 KIAA04 GKSFTAKSSLQTHIRIHRGEKPYSCGICGKSFSDSSAKRRHCILHTGKKPFSCPECNLQF :: : .: : :: ::: :::::.:. :::.:: : : ..:::.::..: .:. : KIAA16 GKVFRHNSYLATHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSMHSNLTTHKVIHTGEKPYKCNQCGKVF 630 640 650 660 670 680 510 520 530 540 550 KIAA04 ARLDNLKAHLKIHSKEK-----HASDASSISGSSNTEEVRNILQLQPYQLSTSGEQEIQL .. ..: : . :. :: . . : :. .: .:... . . .::. . :. KIAA16 TQNSHLANHQRTHTGEKPYRCNECGKAFSVRSSLTTHQAIHTGK-KPYKCNECGKVFTQN 690 700 710 720 730 740 560 570 580 590 600 610 KIAA04 LVTDSVHNINFMPGPSQGISIVTAESSQNMTADQAANLTLLTQQPEQLQNLILSAQQEQT KIAA16 AHLANHRRIHTGEKPYRCTECGKAFRVRSSLTTHMAIHTGEKRYKCNECGKVFRQSSNLA 750 760 770 780 790 800 >>KIAA1969 ( 595 res) fk06944 (595 aa) initn: 801 init1: 801 opt: 823 Z-score: 565.1 bits: 114.8 E(): 2.3e-26 Smith-Waterman score: 826; 35.165% identity (62.912% similar) in 364 aa overlap (160-521:122-473) 130 140 150 160 170 180 KIAA04 YTDFQNNHSSPKPTTLNTAGAPVVVIPNKKNDPPKRKRGRPKKVNTLQEEKSELAAEEEI ..:: : . :. :. . ... KIAA19 FLGVAVSKQDPVTCLEQEKEPWNMKRHEMVDEPPAMCSYFTKDLWPEQDIKDSF---QQV 100 110 120 130 140 190 200 210 220 230 240 KIAA04 QLRVNNSVQNRQNFVVKGDSGVLNEQIAAKEKEESEPTCEPSREEEM-PVEKDENYDPKT :: .. .. .:. .. :. ..: . :: . : . . .. : .: . : KIAA19 ILRRYGKCEH-ENLQLRKGSASVDEYKVHKEGYNELNQCLTTTQSKIFPCDKYVKVFHKF 150 160 170 180 190 200 250 260 270 280 290 300 KIAA04 EDGQASQSRYSKRRIWRSVKL-KDYKLVGDQEDHGSAKRICGRRKRPGGPEARCKDCGKV ... ..:.. .. .. : :.. .. .: ::: :.. .:..:::. KIAA19 LNANRHKTRHTGKKPFKCKKCGKSFCMLLHLSQH---KRIHIRENS-----YQCEECGKA 210 220 230 240 250 310 320 330 340 350 360 KIAA04 FKYNHFLAIHQRSHTGERPFKCNECGKGFAQKHSLQVHTRMHTGERPYTCTVCSKALTTK ::. :. :.: ::::.::::.::::.: :. .: .: .::::.:: : :.::.. . KIAA19 FKWFSTLTRHKRIHTGEKPFKCEECGKAFKQSSTLTTHKIIHTGEKPYRCEECGKAFNRS 260 270 280 290 300 310 370 380 390 400 410 420 KIAA04 HSLLEHMSLHSGQKSFTCDQCGKYFSQNRQLKSHYRVHTGHSLPECKDCHRKFMDVSQLK : : .:.:.: . :..::: :.:. :..: .:.:.. .:..: . : : : KIAA19 SHLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLSTHKFIHAGEKPYKCEECDKAFNRFSYLT 320 330 340 350 360 370 430 440 450 460 470 480 KIAA04 KHLRTHTGEKPFTCEICGKSFTAKSSLQTHIRIHRGEKPYSCGICGKSFSDSSAKRRHCI :: ::::: . :: :::.:. .:.: : ::: :::::.: .:::.:..:: : . KIAA19 KHKIIHTGEKSYKCEECGKGFNWSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEVCGKAFNESSNLTTHKM 380 390 400 410 420 430 490 500 510 520 530 540 KIAA04 LHTGKKPFSCPECNLQFARLDNLKAHLKIHSKEKHASDASSISGSSNTEEVRNILQLQPY .:::.::..: ::. : : .: :: ::. :: KIAA19 IHTGEKPYKCEECGKAFNRSPQLTAHKIIHTGEKPYKCEECGKAFSQSSILTTHKRIHTG 440 450 460 470 480 490 550 560 570 580 590 600 KIAA04 QLSTSGEQEIQLLVTDSVHNINFMPGPSQGISIVTAESSQNMTADQAANLTLLTQQPEQL KIAA19 EKPYKCEECGKAFNRSSNLTKHKIIHTGEKSYKCEECGKAFNQSSTLTKHRKIHTRQKPY 500 510 520 530 540 550 >>KIAA1956 ( 680 res) fk08713 (680 aa) initn: 779 init1: 779 opt: 823 Z-score: 564.4 bits: 114.9 E(): 2.5e-26 Smith-Waterman score: 823; 44.534% identity (70.040% similar) in 247 aa overlap (276-521:210-456) 250 260 270 280 290 300 KIAA04 PKTEDGQASQSRYSKRRIWRSVKLKDYKLVGDQEDHGSAKRICGRRKR-PGGPEARCKDC :. :.:.:.. ...: :. : : .: KIAA19 LQEATHTGEKSNSKPECESPFQWGDTHYSCGECMKHSSTKHVFVQQQRLPSREECYCWEC 180 190 200 210 220 230 310 320 330 340 350 360 KIAA04 GKVFKYNHFLAIHQRSHTGERPFKCNECGKGFAQKHSLQVHTRMHTGERPYTCTVCSKAL :: :. .. ::: :::.::..:.::::.:..: :: : :.:::.::: : :.:.. KIAA19 GKSFSKYDSVSNHQRVHTGKRPYECGECGKSFSHKGSLVQHQRVHTGKRPYECGECGKSF 240 250 260 270 280 290 370 380 390 400 410 420 KIAA04 TTKHSLLEHMSLHSGQKSFTCDQCGKYFSQNRQLKSHYRVHTGHSLPECKDCHRKFMDVS . : ::..:. .:.:.. . : .::: :::: : .: :::::. ::..: . : . . KIAA19 SHKGSLVQHQRVHTGERPYECGECGKSFSQNGTLIKHQRVHTGERPYECEECGKCFTQKG 300 310 320 330 340 350 430 440 450 460 470 480 KIAA04 QLKKHLRTHTGEKPFTCEICGKSFTAKSSLQTHIRIHRGEKPYSCGICGKSFSDSSAKRR .: .: : ::.:.:. :: ::: :. :..: : :.: :.:: :: :::::: .. : KIAA19 NLIQHQRGHTSERPYECEECGKCFSQKGTLTEHHRVHTRERPYECGECGKSFSRKGHLRN 360 370 380 390 400 410 490 500 510 520 530 540 KIAA04 HCILHTGKKPFSCPECNLQFARLDNLKAHLKIHSKEKHASDASSISGSSNTEEVRNILQL : :::..:. : ::. .:.: :: : . :. :. KIAA19 HQRGHTGERPYECGECGKSFSRKGNLIQHQRSHTGERPYECRECRKLFRGKSHLIEHQRV 420 430 440 450 460 470 550 560 570 580 590 600 KIAA04 QPYQLSTSGEQEIQLLVTDSVHNINFMPGPSQGISIVTAESSQNMTADQAANLTLLTQQP KIAA19 HTGERPYECNECGKSFQDSSGFRVHQRVHTGEKPFECSECGKSFPQSCSLLRHRRVHTGE 480 490 500 510 520 530 >>KIAA0326 ( 927 res) hg00579 (927 aa) initn: 2901 init1: 781 opt: 817 Z-score: 558.7 bits: 114.3 E(): 5.3e-26 Smith-Waterman score: 817; 37.500% identity (65.116% similar) in 344 aa overlap (226-558:187-527) 200 210 220 230 240 250 KIAA04 SVQNRQNFVVKGDSGVLNEQIAAKEKEESEPTCEPSREEEM---PVEKDENYDPKTEDGQ :. ::: .: . :. .. : .: :. KIAA03 VVPTPSDWTKACEASWQWGALTTWNSPPVVPANEPSLRELVQGRPAGAEKPY-ICNECGK 160 170 180 190 200 210 260 270 280 290 300 KIAA04 ASQSRYSK----RRIWRSVKLKDYKLVGDQEDHGSAKRICGRRKRPGGPEARCKDCGKVF : :..:: .:: . . . . : . . :.. . .: . : .: :::: : KIAA03 -SFSQWSKLLRHQRIHTGERPNTCSECGKSFTQ-SSHLVQHQRTHTGEKPYKCPDCGKCF 220 230 240 250 260 270 310 320 330 340 350 360 KIAA04 KYNHFLAIHQRSHTGERPFKCNECGKGFAQKHSLQVHTRMHTGERPYTCTVCSKALTTKH ... :. :::.::::.:.::.:: :.:.:. .: : : ::::.:: : : .:. . KIAA03 SWSSNLVQHQRTHTGEKPYKCTECEKAFTQSTNLIKHQRSHTGEKPYKCGECRRAFYRSS 280 290 300 310 320 330 370 380 390 400 410 420 KIAA04 SLLEHMSLHSGQKSFTCDQCGKYFSQNRQLKSHYRVHTGHSLPECKDCHRKFMDVSQLKK .:..:.. :.:.: . : .::: :.::..: .: ..:.:.. .: .: ..:.. :.: . KIAA03 DLIQHQATHTGEKPYKCPECGKRFGQNHNLLKHQKIHAGEKPYRCTECGKSFIQSSELTQ 340 350 360 370 380 390 430 440 450 460 470 480 KIAA04 HLRTHTGEKPFTCEICGKSFTAKSSLQTHIRIHRGEKPYSCGICGKSFSDSSAKRRHCIL : ::::::::. : ::::: .:.: : : : : :..: .:::.:. :.. :: KIAA03 HQRTHTGEKPYECLECGKSFGHSSTLIKHQRTHLREDPFKCPVCGKTFTLSATLLRHQRT 400 410 420 430 440 450 490 500 510 520 530 540 KIAA04 HTGKKPFSCPECNLQFARLDNLKAHLKIHSKEKH--ASDA--SSISGSSNTEEVRNILQL :::..:..::::. .:. .:: : .:: :. .: : : .:. .. : KIAA03 HTGERPYKCPECGKSFSVSSNLINHQRIHRGERPYICADCGKSFIMSSTLIRHQRIHTGE 460 470 480 490 500 510 550 560 570 580 590 600 KIAA04 QPYQLSTSGEQEIQLLVTDSVHNINFMPGPSQGISIVTAESSQNMTADQAANLTLLTQQP .::. : :.. :. KIAA03 KPYKCSDCGKSFIRSSHLIQHRRTHTGEKPYKCPECGKSFSQSSNLITHVRTHMDENLFV 520 530 540 550 560 570 >>KIAA1710 ( 515 res) fj18457 (515 aa) initn: 1262 init1: 801 opt: 802 Z-score: 551.9 bits: 112.2 E(): 1.3e-25 Smith-Waterman score: 826; 37.101% identity (65.217% similar) in 345 aa overlap (177-521:70-405) 150 160 170 180 190 200 KIAA04 TAGAPVVVIPNKKNDPPKRKRGRPKKVNTLQEEKSELAAEEEIQLRVNNSVQNRQNFVVK .:: : : .. : . .:. . ::. KIAA17 RTLVLEMAATLLMAGSQAPVTFEDMAMYLTREEWRPLDAAQRDLYR--DVMQENYGNVVS 40 50 60 70 80 90 210 220 230 240 250 260 KIAA04 GDSGVLNEQIAAKEKEESEPTCEPSREEEMPVEKDENYDPKTEDGQASQSRYSKRRIWRS : . .:. . ..: :: . . . : :.:. :. .:..:.: : .: :.:. : . KIAA17 LDFEIRSENEVNPKQEISEDV-QFGTTSERPAENAEE-NPESEEGFESGDR-SERQ-WGD 100 110 120 130 140 150 270 280 290 300 310 320 KIAA04 VKLKDYKLVGDQEDHGSAKRICGRRKRPGGPEARCKDCGKVFKYNHFLAIHQRSHTGERP . ... : . . .. . : :. :::.:. : ::..:::.:: KIAA17 LTAEEWVSYPLQP---VTDLLVHKEVHTGIRYHICSHCGKAFSQISDLNRHQKTHTGDRP 160 170 180 190 200 210 330 340 350 360 370 380 KIAA04 FKCNECGKGFAQKHSLQVHTRMHTGERPYTCTVCSKALTTKHSLLEHMSLHSGQKSFTCD .:: ::::::... : : : ::::::: :. :.:.. . :..:...:.:.: :. KIAA17 YKCYECGKGFSRSSHLIQHQRTHTGERPYDCNECGKSFGRSSHLIQHQTIHTGEKPHKCN 220 230 240 250 260 270 390 400 410 420 430 440 KIAA04 QCGKYFSQNRQLKSHYRVHTGHSLPECKDCHRKFMDVSQLKKHLRTHTGEKPFTCEICGK .::: : . .: .: :.:.:.. ::..: ..: :.: .: ::::::::. :. ::. KIAA17 ECGKSFCRLSHLIQHQRTHSGEKPYECEECGKSFSRSSHLAQHQRTHTGEKPYECNECGR 280 290 300 310 320 330 450 460 470 480 490 500 KIAA04 SFTAKSSLQTHIRIHRGEKPYSCGICGKSFSDSSAKRRHCILHTGKKPFSCPECNLQFAR .:. .:.: : :.: ::.::.: :::.::..: :: :::.::. : ::. .:.: KIAA17 GFSERSDLIKHYRVHTGERPYKCDECGKNFSQNSDLVRHRRAHTGEKPYHCNECGENFSR 340 350 360 370 380 390 510 520 530 540 550 560 KIAA04 LDNLKAHLKIHSKEKHASDASSISGSSNTEEVRNILQLQPYQLSTSGEQEIQLLVTDSVH ...: : . :. :: KIAA17 ISHLVQHQRTHTGEKPYECNACGKSFSRSSHLITHQKIHTGEKPYECNECWRSFGERSDL 400 410 420 430 440 450 >>KIAA2003 ( 460 res) ah02593 (460 aa) initn: 2539 init1: 790 opt: 800 Z-score: 551.2 bits: 111.9 E(): 1.4e-25 Smith-Waterman score: 800; 41.818% identity (69.091% similar) in 275 aa overlap (248-519:187-460) 220 230 240 250 260 270 KIAA04 AKEKEESEPTCEPSREEEMPVEKDENYDPKTEDGQASQSRYSKRRIWR-SVKLKDY--KL .: :.. .. :: :: . : : . KIAA20 NCGEHTKAFSGKHTLVQQQRTLTTERCYICSECGKSFSKSYSLNDHWRLHTGEKPYECRE 160 170 180 190 200 210 280 290 300 310 320 330 KIAA04 VGDQEDHGSAKRICGRRKRPGGPEARCKDCGKVFKYNHFLAIHQRSHTGERPFKCNECGK : . ..:. : :: . . .: .:::.:. . : :.: ::::::..:.:::: KIAA20 CGKSFRQSSSL-IQHRRVHTAVRPHECDECGKLFSNKSNLIKHRRVHTGERPYECSECGK 220 230 240 250 260 270 340 350 360 370 380 390 KIAA04 GFAQKHSLQVHTRMHTGERPYTCTVCSKALTTKHSLLEHMSLHSGQKSFTCDQCGKYFSQ .:.:. .: : .::::::: :. :.: .: . ::..:...:::.. . :..::: ::: KIAA20 SFSQRSALLQHRGVHTGERPYECSECGKFFTYHSSLIKHQKVHSGSRPYECSECGKSFSQ 280 290 300 310 320 330 400 410 420 430 440 450 KIAA04 NRQLKSHYRVHTGHSLPECKDCHRKFMDVSQLKKHLRTHTGEKPFTCEICGKSFTAKSSL : .: :.:::::. .:..: ..: . : : .: .::::.:. : ::: : .::: KIAA20 NSSLIEHHRVHTGERPYKCSECGKSFSQRSALLQHRGVHTGERPYECSECGKFFPYSSSL 340 350 360 370 380 390 460 470 480 490 500 510 KIAA04 QTHIRIHRGEKPYSCGICGKSFSDSSAKRRHCILHTGKKPFSCPECNLQFARLDNLKAHL . : :.: : .:: :. :::::...:. .: .:::.::. : ::. .:.. ..: : KIAA20 RKHQRVHTGSRPYECSECGKSFTQNSGLIKHRRVHTGEKPYECTECGKSFSHNSSLIKHQ 400 410 420 430 440 450 520 530 540 550 560 570 KIAA04 KIHSKEKHASDASSISGSSNTEEVRNILQLQPYQLSTSGEQEIQLLVTDSVHNINFMPGP .:::. KIAA20 RIHSR 460 >>KIAA1396 ( 551 res) hj08221 (551 aa) initn: 2108 init1: 772 opt: 800 Z-score: 550.2 bits: 111.9 E(): 1.6e-25 Smith-Waterman score: 809; 41.391% identity (65.563% similar) in 302 aa overlap (261-554:234-531) 240 250 260 270 280 KIAA04 SREEEMPVEKDENYDPKTEDGQASQSRYSKRRIWRSVKLKDYKLVGDQEDHGSA---KRI .:: . : . : : . ::. .. KIAA13 QHQRIHTGEKPYKCKECRKAFRQPAHLAQHQRIHTGEKPYECKECGKAFSDGSSFARHQR 210 220 230 240 250 260 290 300 310 320 330 340 KIAA04 CGRRKRPGGPEARCKDCGKVFKYNHFLAIHQRS-HTGERPFKCNECGKGFAQKHSLQVHT : ::: .: .:::.:.:: . : :: ::::.::.: .:::.:. . .: .: KIAA13 CHTGKRP----YECIECGKAFRYNTSFIRHWRSYHTGEKPFNCIDCGKAFSVHIGLILHR 270 280 290 300 310 350 360 370 380 390 400 KIAA04 RMHTGERPYTCTVCSKALTTKHSLLEHMSLHSGQKSFTCDQCGKYFSQNRQLKSHYRVHT :.::::.:: : ::.:.... : :. .:.:.: . :: ::: ::.. .: .: :::. KIAA13 RIHTGEKPYKCDVCGKTFSSGSSRTVHQRIHTGEKPYECDICGKDFSHHASLTQHQRVHS 320 330 340 350 360 370 410 420 430 440 450 460 KIAA04 GHSLPECKDCHRKFMDVSQLKKHLRTHTGEKPFTCEICGKSFTAKSSLQTHIRIHRGEKP :.. :::.: . : . .: .::: ::::::. :. :::.: .:.: :: ::: :::: KIAA13 GEKPYECKECGKAFRQNVHLVSHLRIHTGEKPYECKECGKAFRISSQLATHQRIHTGEKP 380 390 400 410 420 430 470 480 490 500 510 520 KIAA04 YSCGICGKSFSDSSAKRRHCILHTGKKPFSCPECNLQFARLDNLKAHLKIHSKEK--HAS : : ::..:.. : .: :::.::. : ::. :.. :: : .::. :: . . KIAA13 YECIECGNAFKQRSHLAQHQKTHTGEKPYECNECGKAFSQTCNLTQHQRIHTGEKPYKCT 440 450 460 470 480 490 530 540 550 560 570 580 KIAA04 D-ASSISGSSNTEEVRNILQLQ-PYQLSTSGEQEIQLLVTDSVHNINFMPGPSQGISIVT . ....: ::. . . . : ::: :. KIAA13 ECGKAFSDSSSCAQHQRLHTGQRPYQCFECGKAFRRKLSLICHQRSHTGEEP 500 510 520 530 540 550 590 600 610 620 630 640 KIAA04 AESSQNMTADQAANLTLLTQQPEQLQNLILSAQQEQTEHIQSLNMIESQMGPSQTEPVHV >>KIAA2007 ( 580 res) fj01689 (580 aa) initn: 1517 init1: 789 opt: 795 Z-score: 546.6 bits: 111.4 E(): 2.5e-25 Smith-Waterman score: 795; 42.688% identity (69.170% similar) in 253 aa overlap (269-521:214-465) 240 250 260 270 280 290 KIAA04 EKDENYDPKTEDGQASQSRYSKRRIWRSVKLKDYKLVGDQEDHGSAKRICGRRKRPGGPE :...: : :.. . . .: : KIAA20 EKAFDCSDSGKSFINHSHLQGHLRTHNGESLHEWKECGRGFIHSTDLAVRIQTHRSEKPY 190 200 210 220 230 240 300 310 320 330 340 350 KIAA04 ARCKDCGKVFKYNHFLAIHQRSHTGERPFKCNECGKGFAQKHSLQVHTRMHTGERPYTCT .::.::: :.:. .: ::. .:::. :..:.::::.:... .: : . ::::.:: : KIAA20 -KCKECGKGFRYSAYLNIHMGTHTGDNPYECKECGKAFTRSCQLTQHRKTHTGEKPYKCK 250 260 270 280 290 300 360 370 380 390 400 410 KIAA04 VCSKALTTKHSLLEHMSLHSGQKSFTCDQCGKYFSQNRQLKSHYRVHTGHSLPECKDCHR :..:.:.. : .::..: :.: . : .:: :... :: : ..::... ::: : . KIAA20 DCGRAFTVSSCLSQHMKIHVGEKPYECKECGIAFTRSSQLTEHLKTHTAKDPFECKICGK 310 320 330 340 350 360 420 430 440 450 460 470 KIAA04 KFMDVSQLKKHLRTHTGEKPFTCEICGKSFTAKSSLQTHIRIHRGEKPYSCGICGKSFSD .: . : :. :.: ::: ::. :. :::.:: .:.: : : : ::.:: : :::.:. KIAA20 SFRNSSCLSDHFRIHTGIKPYKCKDCGKAFTQNSDLTKHARTHSGERPYECKECGKAFAR 370 380 390 400 410 420 480 490 500 510 520 530 KIAA04 SSAKRRHCILHTGKKPFSCPECNLQFARLDNLKAHLKIHSKEKHASDASSISGSSNTEEV :: .: :::.::: : .:. :: .::..::.::. :: KIAA20 SSRLSEHTRTHTGEKPFECVKCGKAFAISSNLSGHLRIHTGEKPFECLECGKAFTHSSSL 430 440 450 460 470 480 540 550 560 570 580 590 KIAA04 RNILQLQPYQLSTSGEQEIQLLVTDSVHNINFMPGPSQGISIVTAESSQNMTADQAANLT KIAA20 NNHMRTHSAKKPFTCMECGKAFKFPTCVNLHMRIHTGEKPYKCKQCGKSFSYSNSFQLHE 490 500 510 520 530 540 702 residues in 1 query sequences 1986803 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:21:43 2008 done: Thu Dec 18 15:21:44 2008 Total Scan time: 0.540 Total Display time: 0.140 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]