# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hg02974.fasta.nr -Q ../query/KIAA0430.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0430, 1506 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7826587 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4776+/-0.000188; mu= 14.0094+/- 0.010 mean_var=83.8406+/-15.997, 0's: 36 Z-trim: 37 B-trim: 0 in 0/67 Lambda= 0.140071 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|114661174|ref|XP_511188.2| PREDICTED: limkain b (1691) 9958 2023.4 0 gi|114661168|ref|XP_001149081.1| PREDICTED: limkai (1742) 9958 2023.4 0 gi|125950975|sp|Q9Y4F3.4|LKAP_HUMAN RecName: Full= (1741) 9953 2022.4 0 gi|109127681|ref|XP_001108854.1| PREDICTED: simila (1691) 9837 1998.9 0 gi|109127677|ref|XP_001108939.1| PREDICTED: simila (1742) 9837 1998.9 0 gi|73958857|ref|XP_863003.1| PREDICTED: similar to (1739) 9284 1887.2 0 gi|149725909|ref|XP_001489589.1| PREDICTED: simila (1743) 9263 1882.9 0 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2e-89 gi|109487677|ref|XP_001066960.1| PREDICTED: simila ( 322) 1347 282.7 3e-73 gi|21595104|gb|AAH31575.1| 4921513D23Rik protein [ ( 261) 1310 275.2 4.6e-71 gi|189240101|ref|XP_972723.2| PREDICTED: similar t (1280) 1218 257.1 6.1e-65 gi|110767193|ref|XP_392942.3| PREDICTED: similar t (1170) 1192 251.8 2.2e-63 gi|198415080|ref|XP_002129166.1| PREDICTED: simila ( 718) 1154 244.0 3.1e-61 gi|193900146|gb|EDV99012.1| GH13633 [Drosophila gr (1341) 999 212.9 1.3e-51 gi|198139468|gb|EAL33358.2| GA14273 [Drosophila ps (1280) 977 208.4 2.8e-50 gi|193613364|ref|XP_001943860.1| PREDICTED: simila (1527) 963 205.6 2.3e-49 gi|194161311|gb|EDW76212.1| GK15335 [Drosophila wi (1406) 955 204.0 6.5e-49 gi|194147727|gb|EDW63425.1| GJ13178 [Drosophila vi (1340) 952 203.4 9.6e-49 gi|157015200|gb|EAA12622.4| AGAP007823-PA [Anophel (1053) 950 202.9 1.1e-48 gi|194185800|gb|EDW99411.1| GE14372 [Drosophila ya (1292) 936 200.1 8.8e-48 gi|156552882|ref|XP_001600832.1| PREDICTED: simila (1443) 936 200.1 9.6e-48 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init1: 9958 opt: 9958 Z-score: 10865.4 bits: 2023.4 E(): 0 Smith-Waterman score: 9958; 99.934% identity (99.934% similar) in 1506 aa overlap (1-1506:237-1742) 10 20 30 KIAA04 LEEHISQSELTPHLCTNSLHLNVVPPVCLK :::::::::::::::::::::::::::::: gi|114 HKLHQFPSLQGCTSAGYFPCSDFTSGAPGHLEEHISQSELTPHLCTNSLHLNVVPPVCLK 210 220 230 240 250 260 40 50 60 70 80 90 KIAA04 GSLYCEDCLNKPARNSIIDAAKVWPNIPPPNTQPAPLAVPLCNGCGTKGTGKETTLLLAT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|114 GSLYCEDCLNKPARNSIIDAAKVWPNIPPPNTQPAPLAVPLCNGCGTKGTGKETTLLLAT 270 280 290 300 310 320 100 110 120 130 140 150 KIAA04 SLGKAASKFGSPEVAVAGQVLENLPPIGVFWDIENCSVPSGRSATAVVQRIREKFFKGHR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|114 SLGKAASKFGSPEVAVAGQVLENLPPIGVFWDIENCSVPSGRSATAVVQRIREKFFKGHR 330 340 350 360 370 380 160 170 180 190 200 210 KIAA04 EAEFICVCDISKENKEVIQELNNCQVTVAHINATAKNAADDKLRQSLRRFANTHTAPATV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|114 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