# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hh01274.fasta.huge -Q ../query/KIAA0426.ptfa ./tmplib.23147 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0426, 613 aa vs ./tmplib.23147 library 1986892 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1774+/-0.00695; mu= 3.2421+/- 0.471 mean_var=215.8033+/-52.842, 0's: 0 Z-trim: 78 B-trim: 16 in 1/39 Lambda= 0.087306 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1611 ( 813 res) fj12627 ( 813) 1419 192.0 1.6e-49 KIAA1508 ( 573 res) hk06576 ( 573) 1373 186.0 7.1e-48 KIAA0628 ( 540 res) hh01433 ( 540) 1353 183.5 3.9e-47 KIAA2033 ( 766 res) ej00602s1 ( 766) 1351 183.4 5.8e-47 KIAA1947 ( 608 res) fh23660 ( 608) 1347 182.8 7.1e-47 KIAA1349 ( 752 res) fj00940 ( 752) 1332 181.0 3e-46 KIAA1827 ( 469 res) fk01409 ( 469) 1311 178.1 1.4e-45 KIAA1852 ( 948 res) fj01514 ( 948) 1310 178.4 2.4e-45 KIAA1956 ( 680 res) fk08713 ( 680) 1300 176.9 4.6e-45 KIAA1829 ( 557 res) hj00069 ( 557) 1274 173.6 3.9e-44 KIAA1982 ( 599 res) fk06527(revised) ( 599) 1255 171.2 2.2e-43 KIAA0412 ( 720 res) hg03242 ( 720) 1255 171.3 2.4e-43 KIAA0798 ( 682 res) hk06584 ( 682) 1223 167.2 3.8e-42 KIAA1431 ( 891 res) fj00022 ( 891) 1215 166.4 9.1e-42 KIAA1198 ( 553 res) fg01911 ( 553) 1210 165.5 1e-41 KIAA1473 ( 574 res) fj03262 ( 574) 1208 165.3 1.3e-41 KIAA0961 ( 530 res) hj05830 ( 530) 1199 164.1 2.7e-41 KIAA1871 ( 821 res) hj05256s1 ( 821) 1164 159.9 7.5e-40 KIAA1954 ( 468 res) fk02322 ( 468) 1090 150.3 3.4e-37 KIAA1948 ( 487 res) fh24556 ( 487) 1066 147.3 2.8e-36 KIAA1588 ( 613 res) fj08823 ( 613) 1062 146.9 4.6e-36 KIAA1015 ( 841 res) hk03609(revised) ( 841) 1050 145.6 1.6e-35 KIAA1962 ( 746 res) hm00158 ( 746) 1022 142.0 1.7e-34 KIAA0065 ( 848 res) ha00946 ( 848) 1012 140.8 4.4e-34 KIAA1806 ( 481 res) fk00438 ( 481) 982 136.7 4.2e-33 KIAA1874 ( 579 res) hk07257s1 ( 579) 950 132.8 7.8e-32 KIAA1710 ( 515 res) fj18457 ( 515) 932 130.4 3.5e-31 KIAA1396 ( 551 res) hj08221 ( 551) 922 129.2 8.7e-31 KIAA0972 ( 702 res) hj06859 ( 702) 922 129.3 1e-30 KIAA0326 ( 927 res) hg00579 ( 927) 915 128.6 2.2e-30 KIAA2003 ( 460 res) ah02593 ( 460) 904 126.9 3.7e-30 KIAA2007 ( 580 res) fj01689 ( 580) 903 126.9 4.7e-30 KIAA1615 ( 484 res) fj13419 ( 484) 869 122.5 8.2e-29 KIAA1559 ( 544 res) fh19195 ( 544) 854 120.6 3.3e-28 KIAA1969 ( 595 res) fk06944 ( 595) 840 118.9 1.2e-27 KIAA1141 ( 914 res) hk01833 ( 914) 813 115.8 1.6e-26 KIAA0441 ( 702 res) hh00601s1 ( 702) 752 107.9 2.8e-24 KIAA1979 ( 309 res) fj09511 ( 309) 663 96.3 4e-21 KIAA1339 ( 409 res) fj00071 ( 409) 624 91.5 1.4e-19 KIAA1951 ( 679 res) fj05532 ( 679) 617 90.9 3.6e-19 KIAA0924 ( 617 res) hh02883 ( 617) 572 85.2 1.7e-17 KIAA1703 ( 1165 res) fj16891 (1165) 570 85.3 3.1e-17 KIAA0478 ( 1253 res) hh05955 (1253) 551 82.9 1.7e-16 KIAA0557 ( 493 res) hh01334 ( 493) 534 80.3 4.2e-16 KIAA1675 ( 1286 res) ae00102 (1286) 491 75.4 3.3e-14 KIAA1020 ( 638 res) fg00473s1 ( 638) 446 69.3 1.1e-12 KIAA1285 ( 785 res) hh11563(revised) ( 785) 433 67.8 3.8e-12 KIAA0287 ( 1523 res) fg06332 (1523) 391 62.9 2.2e-10 KIAA1190 ( 174 res) hg03443a ( 174) 361 57.9 7.9e-10 KIAA1388 ( 599 res) fj06552 ( 599) 359 58.3 2e-09 >>KIAA1611 ( 813 res) fj12627 (813 aa) initn: 4188 init1: 899 opt: 1419 Z-score: 981.0 bits: 192.0 E(): 1.6e-49 Smith-Waterman score: 1419; 53.782% identity (76.190% similar) in 357 aa overlap (228-583:309-665) 200 210 220 230 240 250 KIAA04 GNEYGNLKQEVSEEMEPHGKTSSKFENDMSKSARCGETREPEEITEEPSACSREDKQPTC : .::.. . . .: : KIAA16 PYKCSECGKTFTVRSNLTIHQVIHTGEKPYKCHECGKVFRHNSYLATHRRIHTGEKPYKC 280 290 300 310 320 330 260 270 280 290 300 310 KIAA04 DENGVSLTENSDHTEHQRICPGEESYGCDDCGKAFSQHSHLIEHQRIHTGDRPYKCEECG .: : .. .:. : :: : ::. . :..::: :.:.:::: : :::::..::::.::: KIAA16 NECGKAFRGHSNLTTHQLIHTGEKPFKCNECGKLFTQNSHLISHWRIHTGEKPYKCNECG 340 350 360 370 380 390 320 330 340 350 360 370 KIAA04 KAFRGRTVLIRHKIIHTGEKPYKCNECGKAFGRWSALNQHQRLHTGEKHYHCNDCGKAFS ::: :. : :. :::::::::::::::.: : :..:.:.::::: :.::.:::::: KIAA16 KAFSVRSSLAIHQTIHTGEKPYKCNECGKVFRYNSYLGRHRRVHTGEKPYKCNECGKAFS 400 410 420 430 440 450 380 390 400 410 420 430 KIAA04 QKAGLFHHIKIHTRDKPYQCTQCNKSFSRRSILTQHQGVHTGAKPYECNECGKAFVYNSS ....: : ::: ::..:..:.: :.. : :..:. .::: :::.:::::::: :: KIAA16 MHSNLATHQVIHTGTKPFKCNECSKVFTQNSQLANHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSVRSS 460 470 480 490 500 510 440 450 460 470 480 490 KIAA04 LVSHQEIHHKEKCYQCKECGKSFSQ-SGLIQHQRIHTGEKPYKCDVCEKAFIQRTSLTEH :..:: :: :: :.: ::::::.: : : .:. ::.:::::::. : :.: : ..:..: KIAA16 LTTHQAIHSGEKPYKCIECGKSFTQKSHLRSHRGIHSGEKPYKCNECGKVFAQTSQLARH 520 530 540 550 560 570 500 510 520 530 540 550 KIAA04 QRIHTGERPYKCDKCGKAFTQRSVLTEHQRIHTGERPYKCDECGNAFRGITSLIQHQRIH :.::::.::::. ::.::..:: :: :: :::::.:::: :::..:: . : :.::: KIAA16 WRVHTGEKPYKCNDCGRAFSDRSSLTFHQAIHTGEKPYKCHECGKVFRHNSYLATHRRIH 580 590 600 610 620 630 560 570 580 590 600 610 KIAA04 TGEKPYQCDECGKAFRQRKKTSYKEILLKNHSEPQAGVNLLLSSLIPEWQSCFRRDL ::::::.:.:::::: .... . .... KIAA16 TGEKPYKCNECGKAFSMHSNLTTHKVIHTGEKPYKCNQCGKVFTQNSHLANHQRTHTGEK 640 650 660 670 680 690 >>KIAA1508 ( 573 res) hk06576 (573 aa) initn: 3148 init1: 834 opt: 1373 Z-score: 951.4 bits: 186.0 E(): 7.1e-48 Smith-Waterman score: 1384; 44.035% identity (72.017% similar) in 461 aa overlap (130-573:107-560) 100 110 120 130 140 150 KIAA04 LEQFLTILPEELQAWVQEQHPESGEEVVTVLEDLERELDEPGEQVSVHTGEQEMFLQETV :..:.. ::. ::.. :.: :... KIAA15 ILQMIELQASPCGQKLYLGGASRDFWMSSNLHQLQK-LDN-GEKLFKVDGDQASFMMNC- 80 90 100 110 120 130 160 170 180 190 200 KIAA04 RLRKEGEP--------SMSLQSMKAQPKYESPELESQQEQV--LDVETGNE---YGNLKQ :.. :.: ..: : : . .: .: . .. : : :: . : . .. KIAA15 RFHVSGKPFTFGEVGRDFSATSGLLQHQV-TPTIERPHSRIRHLRVPTGRKPLKYTESRK 140 150 160 170 180 190 210 220 230 240 250 260 KIAA04 EVSEE--MEPHGKTSSKFENDMSKSARCGET-REPEEITEEPSACSREDKQPTCDENGVS :. . : ...: : . : ..::.. . . .. .: .: . :.: : : KIAA15 SFREKSVFIQHQRADSG-ERPY-KCSECGKSFSQSSGFLRHRKAHGRT-RTHECSECGKS 200 210 220 230 240 270 280 290 300 310 320 KIAA04 LTENSDHTEHQRICPGEESYGCDDCGKAFSQHSHLIEHQRIHTGDRPYKCEECGKAFRGR ..... :.:::. ::. : :..:::.: : : ::.:::.:::.:::.: ::::.: KIAA15 FSRKTHLTQHQRVHTGERPYDCSECGKSFRQVSVLIQHQRVHTGERPYECSECGKSFSHS 250 260 270 280 290 300 330 340 350 360 370 380 KIAA04 TVLIRHKIIHTGEKPYKCNECGKAFGRWSALNQHQRLHTGEKHYHCNDCGKAFSQKAGLF : : ::. ::. .::.:.::::.:.. . : .: :.::: . :.:..:::::: . :. KIAA15 TNLYRHRSAHTSTRPYECSECGKSFSHSTNLFRHWRVHTGVRPYECSECGKAFSCNIYLI 310 320 330 340 350 360 390 400 410 420 430 440 KIAA04 HHIKIHTRDKPYQCTQCNKSFSRRSILTQHQGVHTGAKPYECNECGKAFVYNSSLVSHQE :: ..:: ..:: :..:.:::...:.: ::: :::: .::::.::::.: .:.: :.. KIAA15 HHQRFHTGERPYVCSECGKSFGQKSVLIQHQRVHTGERPYECSECGKVFSQSSGLFRHRR 370 380 390 400 410 420 450 460 470 480 490 500 KIAA04 IHHKEKCYQCKECGKSFS-QSGLIQHQRIHTGEKPYKCDVCEKAFIQRTSLTEHQRIHTG : : : :.:.:: :::: .. ::.:: .::::.::.:.:: :.::..: : .:: .::. KIAA15 AHTKTKPYECSECEKSFSCKTDLIRHQTVHTGERPYECSVCGKSFIRKTHLIRHQTVHTN 430 440 450 460 470 480 510 520 530 540 550 560 KIAA04 ERPYKCDKCGKAFTQRSVLTEHQRIHTGERPYKCDECGNAFRGITSLIQHQRIHTGEKPY ::::.::.:::...: :.: .:.:.:::::::.: :::..: . ::::. .::::.:: KIAA15 ERPYECDECGKSYSQSSALLQHRRVHTGERPYECRECGKSFTRKNHLIQHKTVHTGERPY 490 500 510 520 530 540 570 580 590 600 610 KIAA04 QCDECGKAFRQRKKTSYKEILLKNHSEPQAGVNLLLSSLIPEWQSCFRRDL .:.::::.: : KIAA15 ECSECGKSFSQSSGLLRHRRVHVQ 550 560 570 >>KIAA0628 ( 540 res) hh01433 (540 aa) initn: 2388 init1: 861 opt: 1353 Z-score: 938.1 bits: 183.5 E(): 3.9e-47 Smith-Waterman score: 1353; 53.079% identity (78.592% similar) in 341 aa overlap (252-591:152-489) 230 240 250 260 270 280 KIAA04 FENDMSKSARCGETREPEEITEEPSACSREDKQPTCDENGVSLTENSDHTEHQRICPGEE .: :::. : .. ..: ::::: ::. KIAA06 IEGEANPCDICGKTFTFNSDLVRHRISHAGEKPYTCDQCGKGFGQSSHLMEHQRIHTGER 130 140 150 160 170 180 290 300 310 320 330 340 KIAA04 SYGCDDCGKAFSQHSHLIEHQRIHTGDRPYKCEECGKAFRGRTVLIRHKIIHTGEKPYKC : :. ::: : ..: ::::::.:.:..:.:: .::::: . ::::. .:: :.:..: KIAA06 LYVCNVCGKDFIHYSGLIEHQRVHSGEKPFKCAQCGKAFCHSSDLIRHQRVHTRERPFEC 190 200 210 220 230 240 350 360 370 380 390 400 KIAA04 NECGKAFGRWSALNQHQRLHTGEKHYHCNDCGKAFSQKAGLFHHIKIHTRDKPYQCTQCN .::::.:.. : : .:::.::::. :.::.:::.: ....:..: .:::. : :.: .:. KIAA06 KECGKGFSQSSLLIRHQRIHTGERPYECNECGKSFIRSSSLIRHYQIHTEVKQYECKECG 250 260 270 280 290 300 410 420 430 440 450 460 KIAA04 KSFSRRSILTQHQGVHTGAKPYECNECGKAFVYNSSLVSHQEIHHKEKCYQCKECGKSFS :.: .:: : .:: .::: .:.:::::::::. .:.:..::.:: :. : :.:::: :: KIAA06 KAFRHRSDLIEHQRIHTGERPFECNECGKAFIRSSKLIQHQRIHTGERPYVCNECGKRFS 310 320 330 340 350 360 470 480 490 500 510 520 KIAA04 Q-SGLIQHQRIHTGEKPYKCDVCEKAFIQRTSLTEHQRIHTGERPYKCDKCGKAFTQRSV : :.. :::::::::: :.:. : :::. . : .::.:::::: :.: .::::: :.. KIAA06 QTSNFTQHQRIHTGEKLYECNECGKAFFLSSYLIRHQKIHTGERVYECKECGKAFLQKAH 370 380 390 400 410 420 530 540 550 560 570 580 KIAA04 LTEHQRIHTGERPYKCDECGNAFRGITSLIQHQRIHTGEKPYQCDECGKAFRQRKKTSYK :::::.::.:.::..: .::.:: ..:. :: :::::::: :. :::.: ::.. . KIAA06 LTEHQKIHSGDRPFECKDCGKAFIQSSKLLLHQIIHTGEKPYVCSYCGKGFIQRSNFLQH 430 440 450 460 470 480 590 600 610 KIAA04 EILLKNHSEPQAGVNLLLSSLIPEWQSCFRRDL . : :.: . KIAA06 Q---KIHTEEKLYECSQYGRDFNSTTNVKNNQRVHQEGLSLSKAPIHLGERSVDKGEHTG 490 500 510 520 530 >>KIAA2033 ( 766 res) ej00602s1 (766 aa) initn: 3040 init1: 843 opt: 1351 Z-score: 935.0 bits: 183.4 E(): 5.8e-47 Smith-Waterman score: 1352; 42.919% identity (71.895% similar) in 459 aa overlap (138-595:158-596) 110 120 130 140 150 160 KIAA04 PEELQAWVQEQHPESGEEVVTVLEDLERELDEPGEQVSVHTGEQEMFLQETVRLRKEGEP :. : . : :...: : .. .. KIAA20 GHEAPMTKIKKLTGSTERYDQSHARNKPIKDQLGSSFHSHLPEMHIFQTEE-KIDNQVVK 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 KIAA04 SMSLQSMKAQPKYESPELESQQEQVLDVETGNEYGNLKQEVSEEMEPHGKTSSKFENDMS :. :. . . .. . . .. . ::.. : .. .....: : . .: :. . : KIAA20 SIHDASLVSTAQ----RISCRPKTHISNNHGNNFWN-SSLLTQKQEVHMREKS-FQCNES 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 KIAA04 KSARCGETREPEEITEEPSACSREDKQPTCDENGVSLTENSDHTEHQRICPGEESYGCDD :.. . . .. . :: :: : .... . . :.: ::. : :.. KIAA20 -----GKAFNYSSLLRKHQIIHLADKYK-CDVCGKLFNQKRNLACHRRCHTGENPYKCNE 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 KIAA04 CGKAFSQHSHLIEHQRIHTGDRPYKCEECGKAFRGRTVLIRHKIIHTGEKPYKCNECGKA :::.::: : : :.:.:::..::::::: :::. ...: ::.:::: :::::::::::. KIAA20 CGKTFSQTSSLTCHRRLHTGEKPYKCEECDKAFHFKSILERHRIIHTEEKPYKCNECGKT 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 KIAA04 FGRWSALNQHQRLHTGEKHYHCNDCGKAFSQKAGLFHHIKIHTRDKPYQCTQCNKSFSRR : . : :..:.::::::: :.::.:::.::.:..: : ..:: .:::.:..:.:.::.. KIAA20 FRQKSILTRHHRLHTGEKPYKCNECGKTFSHKSSLTCHHRLHTGEKPYKCNECGKTFSHK 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 KIAA04 SILTQHQGVHTGAKPYECNECGKAFVYNSSLVSHQEIHHKEKCYQCKECGKSFSQ-SGLI : :: :. .::: :::.:.:: ::. . :.. :..:: ... :.:.::::.::. :.: KIAA20 SSLTCHRRLHTGEKPYKCEECDKAYSFRSNFEIHRKIHTEDNAYKCNECGKTFSRTSSLT 420 430 440 450 460 470 470 480 490 500 510 520 KIAA04 QHQRIHTGEKPYKCDVCEKAFIQRTSLTEHQRIHTGERPYKCDKCGKAFTQRSVLTEHQR :.: ::::.::::. :.::: ...: .:.::::::.::::..:::.:...: :: :.: KIAA20 CHRRRHTGEQPYKCEECDKAFRFKSNLERHRRIHTGEKPYKCNECGKTFSRKSYLTCHHR 480 490 500 510 520 530 530 540 550 560 570 580 KIAA04 IHTGERPYKCDECGNAFRGITSLIQHQRIHTGEKPYQCDECGKAFRQRKKTSYKEILLKN .::::. :::.::...: .:: :.:.:.:::::.: ::::.: : .. :: KIAA20 LHTGEKAYKCNECSKTFSWKSSLTCHRRLHSGEKPYKCKECGKTFNQ-------QLTLKR 540 550 560 570 580 590 600 610 KIAA04 HSEPQAGVNLLLSSLIPEWQSCFRRDL : . ..: : KIAA20 HRRLHSGENPYKCEDSDKAYSFKSNLEIHQKIHTEQNPYKCNECGKTFSRTSSLTCHRRL 590 600 610 620 630 640 >>KIAA1947 ( 608 res) fh23660 (608 aa) initn: 4677 init1: 828 opt: 1347 Z-score: 933.4 bits: 182.8 E(): 7.1e-47 Smith-Waterman score: 1347; 41.667% identity (68.162% similar) in 468 aa overlap (111-573:20-483) 90 100 110 120 130 KIAA04 HQWLRPETHTKEQILELLVLEQFLTILPEELQAWVQEQHPESGEEVVTVLEDL----ERE :. .. :. . : ..:.:. :.. KIAA19 DEEAPSKQCVSVGVSQVTTLKPALSTQKAQPCETCSSLLKDILHLAEHD 10 20 30 40 140 150 160 170 180 190 KIAA04 LDEPGEQVSVHTGEQEMFLQETVRLRKEGEPSMSLQSMKAQPKYESPELESQQEQVLDVE .: . .... ..: :.: . ::.::. .:.. : . ... .. . : . KIAA19 GTHPKRTAKLYLHQKEH-LREKLTRSDEGRPSFVNDSVHLA-KRNLTCMQGGKDFTGDSD 50 60 70 80 90 100 200 210 220 230 240 250 KIAA04 TGNEYGNLKQEVSEEMEPHGKTSSKFENDMSKSARCGETREPEEITEEPSACSREDKQPT .. :.. . . . :: . . .. . ..::. .. : . :.. KIAA19 LQQQ--ALHSGWKPHRDTHGVEAFQSGQNNYSCTQCGKDFCHQHTLFEHQKIHTEERPYE 110 120 130 140 150 160 260 270 280 290 300 310 KIAA04 CDENGVSLTENSDHTEHQRICPGEESYGCDDCGKAFSQHSHLIEHQRIHTGDRPYKCEEC :.: : . ::: .::: ::. : :..:::::: . ....::.::::.:::.: :: KIAA19 CSECGKLFRYNSDLIKHQRNHTGERPYKCSECGKAFSLKYNVVQHQKIHTGERPYECSEC 170 180 190 200 210 220 320 330 340 350 360 370 KIAA04 GKAFRGRTVLIRHKIIHTGEKPYKCNECGKAFGRWSALNQHQRLHTGEKHYHCNDCGKAF :::: .. :..:. ::: .:: :.:::::: . : ::..::::. : ::.::: : KIAA19 GKAFLRKSHLLQHQRIHTRPRPYVCSECGKAFLTQAHLVGHQKIHTGERPYGCNECGKYF 230 240 250 260 270 280 380 390 400 410 420 430 KIAA04 SQKAGLFHHIKIHTRDKPYQCTQCNKSFSRRSILTQHQGVHTGAKPYECNECGKAFVYNS ...:..: :.:: ..:. : .:.: : : :: :::: :::::::::: : : : KIAA19 MYSSALIRHQKVHTGERPFYCCECGKFFMDSCTLIIHQRVHTGEKPYECNECGKFFRYRS 290 300 310 320 330 340 440 450 460 470 480 490 KIAA04 SLVSHQEIHHKEKCYQCKECGKSF-SQSGLIQHQRIHTGEKPYKCDVCEKAFIQRTSLTE .:. ::..: :: :.:.:::: : . : :: :::.:::::::.:. : : : .:.. KIAA19 TLIRHQKVHTGEKPYECSECGKFFMDTSTLIIHQRVHTGEKPYECNKCGKFFRYCFTLNR 350 360 370 380 390 400 500 510 520 530 540 550 KIAA04 HQRIHTGERPYKCDKCGKAFTQRSVLTEHQRIHTGERPYKCDECGNAFRGITSLIQHQRI :::.:.:::::.:..::: :.. .: :::.::::::..:. ::..:: ..: :::: KIAA19 HQRVHSGERPYECSECGKFFVDSCTLKSHQRVHTGERPFECSICGKSFRCRSTLDTHQRI 410 420 430 440 450 460 560 570 580 590 600 610 KIAA04 HTGEKPYQCDECGKAFRQRKKTSYKEILLKNHSEPQAGVNLLLSSLIPEWQSCFRRDL ::::.::.:.:::: ::. KIAA19 HTGERPYECSECGKFFRHNSNHIRHRRNHFGERSFECTECGRVFSQNSHLIRHQKVHTRE 470 480 490 500 510 520 >>KIAA1349 ( 752 res) fj00940 (752 aa) initn: 4014 init1: 848 opt: 1332 Z-score: 922.2 bits: 181.0 E(): 3e-46 Smith-Waterman score: 1358; 48.101% identity (73.671% similar) in 395 aa overlap (196-588:279-662) 170 180 190 200 210 220 KIAA04 EPSMSLQSMKAQPKYESPELESQQEQVLDVETGNEYGNLKQEVSEEMEPH-GKTSSKFEN : :. ... :.......: : :. : .. KIAA13 CNVCGKSFSQCARLNQHQRIQTGEKPYKCSECGKAFSD-KSKLARHQETHNGEKPYKCDD 250 260 270 280 290 300 230 240 250 260 270 280 KIAA04 DMSKSARCGETREPEEITEEPSACSREDKQPTCDENGVSLTENSDHTEHQRICPGEESYG ::.. . . . :.: :.: : :. ... . :::: ::. . KIAA13 -------CGKAFRNKSYLSVHQKTHTEEKPYQCNECGKSFKNTTIFNVHQRIHTGEKPFR 310 320 330 340 350 360 290 300 310 320 330 340 KIAA04 CDDCGKAFSQHSHLIEHQRIHTGDRPYKCEECGKAFRGRTVLIRHKIIHTGEKPYKCNEC :..::::. ..: :: : : :::..::.:.:::::: . . .:. ::::::::::::: KIAA13 CNECGKAYRSNSSLIVHIRTHTGEKPYECNECGKAFNRIANFTEHQRIHTGEKPYKCNEC 370 380 390 400 410 420 350 360 370 380 390 400 KIAA04 GKAFGRWSALNQHQRLHTGEKHYHCNDCGKAFSQKAGLFHHIKIHTRDKPYQCTQCNKSF :::: .: :. :.:.::::: :.:..::::: ....:. : .:::..::: :..:..:: KIAA13 GKAFINYSCLTVHHRMHTGEKPYKCTECGKAFMRSSSLIIHQRIHTEEKPYLCNECGESF 430 440 450 460 470 480 410 420 430 440 450 460 KIAA04 SRRSILTQHQGVHTGAKPYECNECGKAFVYNSSLVSHQEIHHKEKCYQCKECGKSF-SQS .: :: :: .::: :::.:..: .::. .: ::.:: : :.: .::::: ..: KIAA13 RIKSHLTVHQRIHTGEKPYKCTDCERAFTKMVNLKEHQKIHTGVKPYKCYDCGKSFRTKS 490 500 510 520 530 540 470 480 490 500 510 520 KIAA04 GLIQHQRIHTGEKPYKCDVCEKAFIQRTSLTEHQRIHTGERPYKCDKCGKAFTQRSVLTE :: ::: :::::::::. ::::: . ..:: ::: ::::.::::..:::.::. : .. KIAA13 YLIVHQRTHTGEKPYKCNECEKAFTNTSQLTVHQRRHTGEKPYKCNECGKVFTSNSGFNT 550 560 570 580 590 600 530 540 550 560 570 580 KIAA04 HQRIHTGERPYKCDECGNAFRGITSLIQHQRIHTGEKPYQCDECGKAFRQRKKTSYKEIL ::: ::::.:.::..::.:: .. . .::.::.:::::.:: :::::: . :: . KIAA13 HQRTHTGEKPFKCNDCGKAFSQMVHVTEHQKIHSGEKPYKCDVCGKAFR---RGSYLTVH 610 620 630 640 650 590 600 610 KIAA04 LKNHSEPQAGVNLLLSSLIPEWQSCFRRDL ..:. KIAA13 WRTHTGEKPYTCKECGKGCITLSQLTLHQRIHTGERPYKCEECGKAFRTNSDFTVHLRMH 660 670 680 690 700 710 >>KIAA1827 ( 469 res) fk01409 (469 aa) initn: 4517 init1: 850 opt: 1311 Z-score: 910.2 bits: 178.1 E(): 1.4e-45 Smith-Waterman score: 1311; 55.452% identity (77.570% similar) in 321 aa overlap (252-571:135-455) 230 240 250 260 270 280 KIAA04 FENDMSKSARCGETREPEEITEEPSACSREDKQPTCDENGVSLTENSDHTEHQRICPGEE .: : : ... . ..::.: ::. KIAA18 TGEKPYKCHECDKVFRSSSKLAQHQRIHTGEKPYKCHECDKVFNQIAHLVRHQKIHTGEK 110 120 130 140 150 160 290 300 310 320 330 340 KIAA04 SYGCDDCGKAFSQHSHLIEHQRIHTGDRPYKCEECGKAFRGRTVLIRHKIIHTGEKPYKC :.:. :::.::.::.: ::: .:::..::::::::::: :. :: :..::::.::::: KIAA18 PYSCNKCGKVFSRHSYLAEHQTVHTGEKPYKCEECGKAFSVRSSLITHQLIHTGRKPYKC 170 180 190 200 210 220 350 360 370 380 390 400 KIAA04 NECGKAFGRWSALNQHQRLHTGEKHYHCNDCGKAFSQKAGLFHHIKIHTRDKPYQCTQCN .:: :.::: :..:::.:: :. : :..::: ::::. :..: : :: .:::.:..:. KIAA18 KECDKVFGRKCFLTSHQRIHTRERPYGCSQCGKIFSQKSDLIRHRKTHTDEKPYKCNKCG 230 240 250 260 270 280 410 420 430 440 450 460 KIAA04 KSFSRRSILTQHQGVHTGAKPYECNECGKAFVYNSSLVSHQEIHHKEKCYQCKECGKSFS .: . : :: : .:.: :::::.::::.: :.:::.::..:: :: :.:..::: :: KIAA18 TAFREFSDLTAHFLIHSGEKPYECKECGKVFRYKSSLTSHHRIHTGEKPYKCNRCGKVFS 290 300 310 320 330 340 470 480 490 500 510 520 KIAA04 QSG-LIQHQRIHTGEKPYKCDVCEKAFIQRTSLTEHQRIHTGERPYKCDKCGKAFTQRSV .:. :. ::.::::::::::. : :.: : . ::.:: ::::::::.:.:::::: : KIAA18 RSSNLVCHQKIHTGEKPYKCNQCGKVFNQASYLTRHQIIHTGERPYRCSKCGKAFRGCSG 350 360 370 380 390 400 530 540 550 560 570 580 KIAA04 LTEHQRIHTGERPYKCDECGNAFRGITSLIQHQRIHTGEKPYQCDECGKAFRQRKKTSYK :: : ::: .. ..: :::. : .:: .:.::: :::::.: :.:.: KIAA18 LTAHLAIHTEKKSHECKECGKIFTQKSSLTNHHRIHIGEKPYKCTLCSKVFSHNSDLAQH 410 420 430 440 450 460 590 600 610 KIAA04 EILLKNHSEPQAGVNLLLSSLIPEWQSCFRRDL KIAA18 QRVHS >>KIAA1852 ( 948 res) fj01514 (948 aa) initn: 4434 init1: 826 opt: 1310 Z-score: 906.1 bits: 178.4 E(): 2.4e-45 Smith-Waterman score: 1316; 35.427% identity (61.836% similar) in 621 aa overlap (24-591:331-946) 10 20 30 40 50 KIAA04 NTGSSSTAKMASTWAIQAHMDQDEPLEVKIEEEKYTTRQDWDLRKNNTHSREV : : : . : : :. .:. ...: KIAA18 IPAQSIFEEEQSHGMKLERYIWDDPWFSRLEVLGCKDQLEMYHMNQSTAMRQMVFMQKQV 310 320 330 340 350 360 60 70 80 90 100 KIAA04 FRQYFRQFCY--QETSGPREAL--SRLRELCHQWLRPETHTKEQILELLVL-EQFLTILP . : .:: : : . . .:. .. : . .:.::.. . .. . .: KIAA18 LSQRSSEFCGLGAEFSQNLNFVPSQRVSQIEH-FYKPDTHAQSWRCDSAIMYADKVTCEN 370 380 390 400 410 110 120 130 140 150 KIAA04 EELQAWV----QEQHP---ESGEEVVTVLEDLER--ELDEPGEQVSVHTGEQEMFLQETV .. . : : .: ..:... . .. .. . :.. ..::::. . .: KIAA18 NDYDKTVYQSIQPIYPARIQTGDNLFKCTDAVKSFNHIIHFGDHKGIHTGEKLYEYKECH 420 430 440 450 460 470 160 170 180 190 200 KIAA04 RLRKEGEPSMSLQS--MKAQPKYESPELES--------QQEQVLDVETGNEYGNLKQEVS .. ... ::.. . .. .:. : :. ..... :: . .:.. .. . KIAA18 QIFNQS-PSFNEHPRLHVGENQYNYKEYENIFYFSSFMEHQKIGTVEKAYKYNEWEKVFG 480 490 500 510 520 530 210 220 230 240 250 KIAA04 EEMEPHGKTSSKFENDMSKSARCGET---------REPEEITEEPSACSREDK------- . .::. . .:: . .. . :.: :.. : KIAA18 YDSFLTQHTSTYTAEKPYDYNECGTSFIWSSYLIQHKKTHTGEKPYECDKCGKVFRNRSA 540 550 560 570 580 590 260 270 280 290 300 KIAA04 -----------QP-TCDENGVSLTENSDHTEHQRICPGEESYGCDDCGKAFSQHSHLIEH .: :.. : ... :: :.:: ::. : :..:::.:. .:::: : KIAA18 LTKHERTHTGIKPYECNKCGKAFSWNSHLIVHKRIHTGEKPYVCNECGKSFNWNSHLIGH 600 610 620 630 640 650 310 320 330 340 350 360 KIAA04 QRIHTGDRPYKCEECGKAFRGRTVLIRHKIIHTGEKPYKCNECGKAFGRWSALNQHQRLH :: :::..:..: ::::.: . :: : .::::::.::.:: ::: .:::..:.: : KIAA18 QRTHTGEKPFECTECGKSFSWSSHLIAHMRMHTGEKPFKCDECEKAFRDYSALSKHERTH 660 670 680 690 700 710 370 380 390 400 410 420 KIAA04 TGEKHYHCNDCGKAFSQKAGLFHHIKIHTRDKPYQCTQCNKSFSRRSILTQHQGVHTGAK .: : :.:..:::.:: .. :. : . :: .:::.: .:.:.: .:: ::.:. .:.: : KIAA18 SGAKPYKCTECGKSFSWSSHLIAHQRTHTGEKPYNCQECGKAFRERSALTKHEIIHSGIK 720 730 740 750 760 770 430 440 450 460 470 480 KIAA04 PYECNECGKAFVYNSSLVSHQEIHHKEKCYQCKECGKSFSQS-GLIQHQRIHTGEKPYKC :::::.:::. . :: ::. : :: :.:..:::::::: :. :.::::::::::: KIAA18 PYECNKCGKSCSQMAHLVRHQRTHTGEKPYECNKCGKSFSQSCHLVAHRRIHTGEKPYKC 780 790 800 810 820 830 490 500 510 520 530 540 KIAA04 DVCEKAFIQRTSLTEHQRIHTGERPYKCDKCGKAFTQRSVLTEHQRIHTGERPYKCDECG . ::..: . : :.: ::::.::.:..:::::.. : : : : ::::.::::..: KIAA18 NQCERSFNCSSHLIAHRRTHTGEKPYRCNECGKAFNESSSLIVHLRNHTGEKPYKCNHCE 840 850 860 870 880 890 550 560 570 580 590 600 KIAA04 NAFRGITSLIQHQRIHTGEKPYQCDECGKAFRQRKKTSYKEILLKNHSEPQAGVNLLLSS .:: .::: :::.:.::: . :.:::::: .. .. .:::: . KIAA18 KAFCKNSSLIIHQRMHSGEKRFICSECGKAFSGHSALLQHQ---RNHSEEKLN 900 910 920 930 940 610 KIAA04 LIPEWQSCFRRDL >>KIAA1956 ( 680 res) fk08713 (680 aa) initn: 2974 init1: 836 opt: 1300 Z-score: 900.9 bits: 176.9 E(): 4.6e-45 Smith-Waterman score: 1351; 45.980% identity (75.377% similar) in 398 aa overlap (189-573:160-553) 160 170 180 190 200 210 KIAA04 VRLRKEGEPSMSLQSMKAQPKYESPELESQQEQVLDVETGNEY----GNLKQEVS---EE .:. . ...:... : : ::.. :. KIAA19 PHQNQYLGEKPYRSSVEEALFVKRCKFHVSEESSIFIQSGKDFLPSSGLLLQEATHTGEK 130 140 150 160 170 180 220 230 240 250 260 KIAA04 MEPHGKTSSKFE-NDMSKSARCGE----TREPEEITEEPSACSREDKQPTCDENGVSLTE . . . : :. .: : ::: . . .... :::. : : : :... KIAA19 SNSKPECESPFQWGDTHYS--CGECMKHSSTKHVFVQQQRLPSREECY--CWECGKSFSK 190 200 210 220 230 240 270 280 290 300 310 320 KIAA04 NSDHTEHQRICPGEESYGCDDCGKAFSQHSHLIEHQRIHTGDRPYKCEECGKAFRGRTVL .. ..:::. :.. : : .:::.::... :..:::.::: :::.: ::::.: . : KIAA19 YDSVSNHQRVHTGKRPYECGECGKSFSHKGSLVQHQRVHTGKRPYECGECGKSFSHKGSL 250 260 270 280 290 300 330 340 350 360 370 380 KIAA04 IRHKIIHTGEKPYKCNECGKAFGRWSALNQHQRLHTGEKHYHCNDCGKAFSQKAGLFHHI ..:. .::::.::.:.::::.:.. ..: .:::.::::. :.:..::: :.::..:..: KIAA19 VQHQRVHTGERPYECGECGKSFSQNGTLIKHQRVHTGERPYECEECGKCFTQKGNLIQHQ 310 320 330 340 350 360 390 400 410 420 430 440 KIAA04 KIHTRDKPYQCTQCNKSFSRRSILTQHQGVHTGAKPYECNECGKAFVYNSSLVSHQEIHH . :: ..::.: .:.: ::... ::.:. ::: .::::.::::.: .. : .::. : KIAA19 RGHTSERPYECEECGKCFSQKGTLTEHHRVHTRERPYECGECGKSFSRKGHLRNHQRGHT 370 380 390 400 410 420 450 460 470 480 490 500 KIAA04 KEKCYQCKECGKSFSQSG-LIQHQRIHTGEKPYKCDVCEKAFIQRTSLTEHQRIHTGERP :. :.: :::::::..: :::::: ::::.::.: :.: : .. : ::::.:::::: KIAA19 GERPYECGECGKSFSRKGNLIQHQRSHTGERPYECRECRKLFRGKSHLIEHQRVHTGERP 430 440 450 460 470 480 510 520 530 540 550 560 KIAA04 YKCDKCGKAFTQRSVLTEHQRIHTGERPYKCDECGNAFRGITSLIQHQRIHTGEKPYQCD :.:..:::.: . : . :::.::::.:..:.:::..: ::..:.:.::::.::.: KIAA19 YECNECGKSFQDSSGFRVHQRVHTGEKPFECSECGKSFPQSCSLLRHRRVHTGERPYECG 490 500 510 520 530 540 570 580 590 600 610 KIAA04 ECGKAFRQRKKTSYKEILLKNHSEPQAGVNLLLSSLIPEWQSCFRRDL ::::.:.: KIAA19 ECGKSFHQSSSLLRHQKTHTAERPYECRECGKFFSSLLEHRRVHTGERPYECRECGKTFT 550 560 570 580 590 600 >>KIAA1829 ( 557 res) hj00069 (557 aa) initn: 3335 init1: 871 opt: 1274 Z-score: 884.1 bits: 173.6 E(): 3.9e-44 Smith-Waterman score: 1350; 57.778% identity (80.000% similar) in 315 aa overlap (258-571:225-539) 230 240 250 260 270 280 KIAA04 KSARCGETREPEEITEEPSACSREDKQPTCDENGVSLTENSDHTEHQRICPGEESYGCDD :: : ... : :. ::: ::. :.:.: KIAA18 ESHDFSKLLSFHSLFTQHQTTHFGKLPHGYDECGDAFSCYSFFTQPQRIHSGEKPYACND 200 210 220 230 240 250 290 300 310 320 330 340 KIAA04 CGKAFSQHSHLIEHQRIHTGDRPYKCEECGKAFRGRTVLIRHKIIHTGEKPYKCNECGKA ::::::. : :::: : :..::.:.::.:::: . : .:. :::::::. ::::::: KIAA18 CGKAFSHDFFLSEHQRTHIGEKPYECKECNKAFRQSAHLAQHQRIHTGEKPFACNECGKA 260 270 280 290 300 310 350 360 370 380 390 400 KIAA04 FGRWSALNQHQRLHTGEKHYHCNDCGKAFSQKAGLFHHIKIHTRDKPYQCTQCNKSFSRR :.:.. : .:::.::::: :.:..:.::: :.: : .: .::: .:::.:.::.:.:::: KIAA18 FSRYAFLVEHQRIHTGEKPYECKECNKAFRQSAHLNQHQRIHTGEKPYECNQCGKAFSRR 320 330 340 350 360 370 410 420 430 440 450 460 KIAA04 SILTQHQGVHTGAKPYECNECGKAFVYNSSLVSHQEIHHKEKCYQCKECGKSF-SQSGLI :: :: .::: ::..:.::::.: : : : .::.:: :: :.: .::: : ..: : KIAA18 IALTLHQRIHTGEKPFKCSECGKTFGYRSHLNQHQRIHTGEKPYECIKCGKFFRTDSQLN 380 390 400 410 420 430 470 480 490 500 510 520 KIAA04 QHQRIHTGEKPYKCDVCEKAFIQRTSLTEHQRIHTGERPYKCDKCGKAFTQRSVLTEHQR .:.::::::.:..:. : ::: . : .:.: :.::.::.:.::::::. : :..::: KIAA18 RHHRIHTGERPFECSKCGKAFSDALVLIHHKRSHAGEKPYECNKCGKAFSCGSYLNQHQR 440 450 460 470 480 490 530 540 550 560 570 580 KIAA04 IHTGERPYKCDECGNAFRGITSLIQHQRIHTGEKPYQCDECGKAFRQRKKTSYKEILLKN :::::.::.:.:::.::. : :: :::::.:::::.:.:::. : KIAA18 IHTGEKPYECSECGKAFHQILSLRLHQRIHAGEKPYKCNECGNNFSCVSALRRHQRIHNR 500 510 520 530 540 550 590 600 610 KIAA04 HSEPQAGVNLLLSSLIPEWQSCFRRDL KIAA18 ETL 613 residues in 1 query sequences 1986892 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:21:08 2008 done: Thu Dec 18 15:21:09 2008 Total Scan time: 0.500 Total Display time: 0.160 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]