# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hh00236.fasta.huge -Q ../query/KIAA0416.ptfa ./tmplib.23147 2
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007
Please cite:
 W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

 KIAA0416, 529 aa
 vs ./tmplib.23147 library

1986976 residues in  2037 sequences
  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 3.3856+/-0.00493; mu= 22.8101+/- 0.337
 mean_var=82.3264+/-20.151, 0's: 0 Z-trim: 34  B-trim: 131 in 1/39
 Lambda= 0.141353

FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2
 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width:  16
The best scores are:                                      opt bits E(2037)
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KIAA0814  ( 1559 res)   fh16048                    (1559)  387 89.7 1.7e-18
KIAA0806  ( 1073 res)   hk04165(revised)           (1073)  384 88.8 2.2e-18
KIAA1580  ( 640 res)   fj04979                     ( 640)  351 81.7 1.8e-16
KIAA0813  ( 1618 res)   pf00581                    (1618)  339 79.9 1.5e-15
KIAA1497  ( 730 res)   hg01608                     ( 730)  325 76.5 7.5e-15
KIAA1246  ( 832 res)   hh00149a                    ( 832)  307 72.9   1e-13
KIAA0918  ( 966 res)   hk09360(revised)            ( 966)  279 67.3 5.7e-12
KIAA1854  ( 572 res)   fg02232                     ( 572)  273 65.7   1e-11
KIAA1851  ( 523 res)   hg04492                     ( 523)  272 65.4 1.2e-11
KIAA1465  ( 785 res)   fh13187                     ( 785)  271 65.5 1.6e-11
KIAA1910  ( 760 res)   fh21867                     ( 760)  265 64.3 3.7e-11
KIAA0230  ( 1496 res)   ha02538                    (1496)  254 62.5 2.4e-10
KIAA1904  ( 821 res)   af00058                     ( 821)  249 61.1 3.7e-10
KIAA0606  ( 1369 res)   ph00195                    (1369)  240 59.6 1.7e-09
KIAA1484  ( 700 res)   fj06928                     ( 700)  232 57.5 3.8e-09
KIAA0862  ( 584 res)   hk06532                     ( 584)  230 56.9 4.6e-09
KIAA1916  ( 542 res)   hg01117                     ( 542)  223 55.4 1.2e-08
KIAA1437  ( 811 res)   hk07206                     ( 811)  219 54.9 2.6e-08
KIAA1531  ( 1206 res)   ph00937                    (1206)  214 54.2 6.3e-08
KIAA0405  ( 706 res)   hg01274                     ( 706)  211 53.2 7.4e-08
KIAA1163  ( 437 res)   hj05329                     ( 437)  209 52.4 7.8e-08
KIAA0848  ( 988 res)   hk05607                     ( 988)  211 53.4 8.7e-08
KIAA1469  ( 662 res)   fj01881                     ( 662)  203 51.5 2.2e-07
KIAA0931  ( 1258 res)   bf00159                    (1258)  203 52.0   3e-07
KIAA1225  ( 1371 res)   fh04221s1                  (1371)  187 48.8   3e-06
KIAA1194  ( 575 res)   fg00908                     ( 575)  166 43.9 3.9e-05
KIAA0231  ( 823 res)   fk16230                     ( 823)  167 44.3   4e-05
KIAA0975  ( 1528 res)   hj06890                    (1528)  165 44.4 7.1e-05
KIAA0147  ( 1630 res)   ha01022s1                  (1630)  161 43.6 0.00013
KIAA0012  ( 789 res)   ha00413                     ( 789)  157 42.3 0.00016
KIAA1801  ( 1227 res)   fj21373                    (1227)  140 39.1  0.0022
KIAA0563  ( 1652 res)   fh23589                    (1652)  134 38.1  0.0059
KIAA1674  ( 538 res)   fg03838                     ( 538)  130 36.5  0.0061


>>KIAA0644  ( 887 res)   hj03618                          (887 aa)
 initn: 709 init1: 269 opt: 442  Z-score: 486.7  bits: 100.5 E(): 5.4e-22
Smith-Waterman score: 467;  28.571% identity (52.314% similar) in 497 aa overlap (1-427:50-530)

                                             10        20          
KIAA04                               QPRLNAASNVLRRMGLHFKWPL--GAPMLA
                                     : . ::  .  ::    .. ::  :   . 
KIAA06 AETRAGLRTKDGGGAGRRCEVRKRPFSDSGQAKGNAEETQSRRAKRTIR-PLHAGREAME
      20        30        40        50        60         70        

       30             40         50         60        70           
KIAA04 AIYAMSMVLKM-----LPALGM-ACPPKCRCEK-LLFYCDSQGFHSVPNATDKGS----L
       :  :. ..: .     :: :.  .:: .: :..   . : ..:.. ::....  :    :
KIAA06 AARALRLLLVVCGCLALPPLAEPVCPERCDCQHPQHLLCTNRGLRVVPKTSSLPSPHDVL
       80        90       100       110       120       130        

        80        90       100       110       120       130       
KIAA04 GLSLRHNHITELERDQFASFSQLTWLHLDHNQISTVKEDAFQGLYKLKELILSSNKIFYL
         ::  : ::..   .:  ..::  : :..::: ...  .:. : .:.:: :..: .  :
KIAA06 TYSLGGNFITNITAFDFHRLGQLRRLDLQYNQIRSLHPKTFEKLSRLEELYLGNNLLQAL
      140       150       160       170       180       190        

       140       150       160       170       180       190       
KIAA04 PNTTFTQLINLQNLDLSFNQLSSLHPELFYGLRKLQTLHLRSNSLRTIPVRLFWDCRSLE
          :.. : .:. :  . :..: :    : ::..:  :.: .:.: ..:  .:    .: 
KIAA06 APGTLAPLRKLRILYANGNEISRLSRGSFEGLESLVKLRLDGNALGALPDAVFAPLGNLL
      200       210       220       230       240       250        

       200       210       220                                     
KIAA04 FLDLSTNRLRSLARNGFAGLIKLRELHL-------------------------------E
       .: : .::.: :..:.:: : ::: :.:                               .
KIAA06 YLHLESNRIRFLGKNAFAQLGKLRFLNLSANELQPSLRHAATFAPLRSLSSLILSANSLQ
      260       270       280       290       300       310        

                           230       240       250       260       
KIAA04 H-------------------NQLTKINFAHFLRLSSLHTLFLQWNKISNLTCGMEWTWGT
       :                   ::::..    :  : .:. : :. :..:.:  ..     .
KIAA06 HLGPRIFQHLPRLGLLSLRGNQLTHLAPEAFWGLEALRELRLEGNRLSQLPTALLEPLHS
      320       330       340       350       360       370        

       270       280       290       300       310       320       
KIAA04 LEKLDLTGNEIKAIDLTVFETMPNLKILLMDNNKLNSLDSKILNSLRSLTTVGLSGNLWE
       :: :::.:::..:.  ..:  .  :. : . :: :..:.. :. .  .:  . :.:: : 
KIAA06 LEALDLSGNELSALHPATFGHLGRLRELSLRNNALSALSGDIFAASPALYRLDLDGNGWT
      380       390       400       410       420       430        

       330       340          350       360       370           380
KIAA04 CSARICALASWLGSF--QGRWEHS-ILCHSPDHTQGEDILDAVHGFQL----CWNLSTTV
       :. :. .:  :.:..  :::     . :. :   .:.  :: .   ::    : . : ..
KIAA06 CDCRLRGLKRWMGDWHSQGRLLTVFVQCRHPPALRGK-YLDYLDDQQLQNGSCADPSPSA
      440       450       460       470        480       490       

              390       400       410       420       430       440
KIAA04 TVMATTYRDPTTEYTKRISSSSYHVGDKEIPTTAGIAVTTEEHFPEPDNAIFTQRVITGT
       .. :   :.:       . ...   :..  :  ::.:   ::  :.:             
KIAA06 SLTADRRRQP-------LPTAA---GEEMTPP-AGLA---EELPPQPQLQQQGRFLAGVA
       500              510           520          530       540   

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KIAA04 MALLFSFFFIIFIVFISRKCCPPTLRRIRQCSMVQNHRQLRSQTRLHMSNMSDQGPYNEY
                                                                   
KIAA06 WDGAARELVGNRSALRLSRRGPGLQQPSPSVAAAAGPAPQSLDLHKKPQRGRPTRADPAL
           550       560       570       580       590       600   

>>KIAA0814  ( 1559 res)   fh16048                         (1559 aa)
 initn: 726 init1: 330 opt: 387  Z-score: 424.0  bits: 89.7 E(): 1.7e-18
Smith-Waterman score: 387;  33.043% identity (63.913% similar) in 230 aa overlap (6-230:26-253)

                                   10        20        30          
KIAA04                     QPRLNAASNVLRRMGLHFKWPLGAPMLAAIYA-MSMVLKM
                                :::.  :  .::   :  : . ::. : ....: .
KIAA08 LRRPLPRPPALPARLLGLHASCPAEAASS--RSGALHTMAPGWAGVGAAVRARLALALAL
               10        20          30        40        50        

      40            50        60        70        80        90     
KIAA04 LPALG----MACPPKCRCEKLLFYCDSQGFHSVPNATDKGSLGLSLRHNHITELERDQFA
         .:.    .::: :: :      : . :...:: .  ...  :.: .:.::.. . .::
KIAA08 ASVLSGPPAVACPTKCTCSAASVDCHGLGLRAVPRGIPRNAERLDLDRNNITRITKMDFA
       60        70        80        90       100       110        

         100       110       120       130       140       150     
KIAA04 SFSQLTWLHLDHNQISTVKEDAFQGLYKLKELILSSNKIFYLPNTTFTQLINLQNLDLSF
       ....:  :::. ::.:.... ::: : .:..: :..::.  ::.  : .  .:  :::: 
KIAA08 GLKNLRVLHLEDNQVSVIERGAFQDLKQLERLRLNKNKLQVLPELLFQSTPKLTRLDLSE
      120       130       140       150       160       170        

         160       170       180       190       200       210     
KIAA04 NQLSSLHPELFYGLRKLQTLHLRSNSLRTIPVRLFWDCRSLEFLDLSTNRLRSLARNGFA
       ::....  . : :.  ...:.: .: .  :    :   :.::.: :..: .  .  ..: 
KIAA08 NQIQGIPRKAFRGITDVKNLQLDNNHISCIEDGAFRALRDLEILTLNNNNISRILVTSFN
      180       190       200       210       220       230        

         220       230       240       250       260       270     
KIAA04 GLIKLRELHLEHNQLTKINFAHFLRLSSLHTLFLQWNKISNLTCGMEWTWGTLEKLDLTG
        . :.: :.:. :.:                                             
KIAA08 HMPKIRTLRLHSNHLYCDCHLAWLSDWLRQRRTVGQFTLCMAPVHLRGFNVADVQKKEYV
      240       250       260       270       280       290        

>>KIAA0806  ( 1073 res)   hk04165(revised)                (1073 aa)
 initn: 256 init1: 256 opt: 384  Z-score: 422.0  bits: 88.8 E(): 2.2e-18
Smith-Waterman score: 384;  32.203% identity (62.034% similar) in 295 aa overlap (77-365:203-492)

         50        60        70        80        90       100      
KIAA04 CPPKCRCEKLLFYCDSQGFHSVPNATDKGSLGLSLRHNHITELERDQFASFSQLTWLHLD
                                     : ..: .:... .    : .. .: .:.: 
KIAA08 PRMQLKYLNLSNNRITTLEAGCFDNLSSSLLVVKLNRNRMSMIPPKIF-KLPHLQFLELK
            180       190       200       210       220        230 

        110       120       130       140       150       160      
KIAA04 HNQISTVKEDAFQGLYKLKELILSSNKIFYLPNTTFTQLINLQNLDLSFNQLSSLHPELF
       .:.:. :.  .:::: .:. : .. : :  : . .:  : :...:.:  :.:. ..   .
KIAA08 RNRIKIVEGLTFQGLDSLRSLKMQRNGISKLKDGAFFGLNNMEELELEHNNLTRVNKGWL
             240       250       260       270       280       290 

        170       180       190        200       210       220     
KIAA04 YGLRKLQTLHLRSNSLRTIPVRLFWD-CRSLEFLDLSTNRLRSLARNGFAGLIKLRELHL
       :::: :: :.. .:... :     :. :. :  :::: :.:  : ...:.::  :..:.:
KIAA08 YGLRMLQQLYVSQNAIERISPDA-WEFCQRLSELDLSYNQLTRLDESAFVGLSLLERLNL
             300       310        320       330       340       350

         230       240       250        260         270       280  
KIAA04 EHNQLTKINFAHFLRLSSLHTLFLQWNKIS-NLTCGMEWTWG--TLEKLDLTGNEIKAID
         :..:.:  . :  ::.:.:: :. :.::  .  . :   :  .: :: : ::.::.: 
KIAA08 GDNRVTHIADGVFRFLSNLQTLDLRNNEISWAIEDASEAFAGLTSLTKLILQGNQIKSIT
              360       370       380       390       400       410

            290       300       310       320       330       340  
KIAA04 LTVFETMPNLKILLMDNNKLNSLDSKILNSLRSLTTVGLSGNLWECSARICALASWLGSF
         .:  . .:. : ..:: . :.. . . :   :  . :. .   :. ..  : .::   
KIAA08 KKAFIGLESLEHLDLNNNAIMSIQENAF-SQTHLKELILNTSSLLCDCHLKWLLQWL--V
              420       430        440       450       460         

            350         360       370       380       390       400
KIAA04 QGRWEHSI--LCHSPDHTQGEDILDAVHGFQLCWNLSTTVTVMATTYRDPTTEYTKRISS
       .. ..::.   :  :.   :..::.                                   
KIAA08 DNNFQHSVNVSCAHPEWLAGQSILNVDLKDFVCDDFLKPQIRTHPETIIALRGMNVTLTC
       470       480       490       500       510       520       

>>KIAA1580  ( 640 res)   fj04979                          (640 aa)
 initn: 220 init1: 179 opt: 351  Z-score: 387.6  bits: 81.7 E(): 1.8e-16
Smith-Waterman score: 373;  25.137% identity (57.650% similar) in 366 aa overlap (14-374:14-352)

               10        20        30        40        50          
KIAA04 QPRLNAASNVLRRMGLHFKWPLGAPMLAAIYAMSMVLKMLPALGMACPPKCRCEKLL--F
                    .: .:.  :  :.:... :.....    . ...::  : : . .   
KIAA15 MLNKMTLHPQQIMIGPRFNRALFDPLLVVLLALQLLVVAGLVRAQTCPSVCSCSNQFSKV
               10        20        30        40        50        60

       60        70        80        90       100       110        
KIAA04 YCDSQGFHSVPNATDKGSLGLSLRHNHITELERDQFASFSQLTWLHLDHNQISTVKEDAF
        :  .... ::.. . ..  :.:..:.:  .. ..:  . .:  :.:..:.: :..  ::
KIAA15 ICVRKNLREVPDGISTNTRLLNLHENQIQIIKVNSFKHLRHLEILQLSRNHIRTIEIGAF
               70        80        90       100       110       120

      120       130       140       150       160       170        
KIAA04 QGLYKLKELILSSNKIFYLPNTTFTQLINLQNLDLSFNQLSSLHPELFYGLRKLQTLHLR
       .:: .:. : : .:..  .:: .:. :                         ::. : ::
KIAA15 NGLANLNTLELFDNRLTTIPNGAFVYL------------------------SKLKELWLR
              130       140                               150      

      180       190       200        210       220       230       
KIAA04 SNSLRTIPVRLFWDCRSLEFLDLST-NRLRSLARNGFAGLIKLRELHLEHNQLTKI-NFA
       .: ...::   :    ::. :::.  .::  .....: :: .:: :.:   .: .: :..
KIAA15 NNPIESIPSYAFNRIPSLRRLDLGELKRLSYISEGAFEGLSNLRYLNLAMCNLREIPNLT
        160       170       180       190       200       210      

        240       250       260       270       280       290      
KIAA04 HFLRLSSLHTLFLQWNKISNLTCGMEWTWGTLEKLDLTGNEIKAIDLTVFETMPNLKILL
        ...:. :    :. :..: .  :       :.:: .  ..:..:. ..:... .:  . 
KIAA15 PLIKLDELD---LSGNHLSAIRPGSFQGLMHLQKLWMIQSQIQVIERNAFDNLQSLVEIN
        220          230       240       250       260       270   

        300       310       320       330       340        350     
KIAA04 MDNNKLNSLDSKILNSLRSLTTVGLSGNLWECSARICALASWLGSFQ-GRWEHSILCHSP
       . .:.:. :   ... :. :  . :  : :.:.  :  :. :. ..  .       :..:
KIAA15 LAHNNLTLLPHDLFTPLHHLERIHLHHNPWNCNCDILWLSWWIKDMAPSNTACCARCNTP
           280       290       300       310       320       330   

         360       370       380       390       400       410     
KIAA04 DHTQGEDILDAVHGFQLCWNLSTTVTVMATTYRDPTTEYTKRISSSSYHVGDKEIPTTAG
        . .:. : .  ...  :.                                         
KIAA15 PNLKGRYIGELDQNYFTCYAPVIVEPPADLNVTEGMAAELKCRASTSLTSVSWITPNGTV
           340       350       360       370       380       390   

>>KIAA0813  ( 1618 res)   pf00581                         (1618 aa)
 initn: 711 init1: 339 opt: 339  Z-score: 370.9  bits: 79.9 E(): 1.5e-15
Smith-Waterman score: 339;  31.892% identity (64.865% similar) in 185 aa overlap (46-230:117-301)

          20        30        40        50        60        70     
KIAA04 LHFKWPLGAPMLAAIYAMSMVLKMLPALGMACPPKCRCEKLLFYCDSQGFHSVPNATDKG
                                     :::  : :      : . :....:.   ..
KIAA08 LTPGWGSSAGPVRPELWLLLWAAAWRLGASACPALCTCTGTTVDCHGTGLQAIPKNIPRN
         90       100       110       120       130       140      

          80        90       100       110       120       130     
KIAA04 SLGLSLRHNHITELERDQFASFSQLTWLHLDHNQISTVKEDAFQGLYKLKELILSSNKIF
       .  : :  :.::......::...::  :.: .:::..:.. ::. . .:..: :. :.. 
KIAA08 TERLELNGNNITRIHKNDFAGLKQLRVLQLMENQIGVVERGAFDDMKELERLRLNRNQLH
        150       160       170       180       190       200      

         140       150       160       170       180       190     
KIAA04 YLPNTTFTQLINLQNLDLSFNQLSSLHPELFYGLRKLQTLHLRSNSLRTIPVRLFWDCRS
       .::.  : .   :. :::: : ....  . : :   :..:.: .:..  :    :   :.
KIAA08 MLPELLFQNNQALSRLDLSENAIQAIPRKAFRGATDLKNLQLDKNQISCIEEGAFRALRG
        210       220       230       240       250       260      

         200       210       220       230       240       250     
KIAA04 LEFLDLSTNRLRSLARNGFAGLIKLRELHLEHNQLTKINFAHFLRLSSLHTLFLQWNKIS
       :: : :..: . ..  ..:  . ::: ..:. :.:                         
KIAA08 LEVLTLNNNNITTIPVSSFNHMPKLRTFRLHSNHLFCDCHLAWLSQWLRQRPTIGLFTQC
        270       280       290       300       310       320      

         260       270       280       290       300       310     
KIAA04 NLTCGMEWTWGTLEKLDLTGNEIKAIDLTVFETMPNLKILLMDNNKLNSLDSKILNSLRS
                                                                   
KIAA08 SGPASLRGLNVAEVQKSEFSCSGQGEAGRVPTCTLSSGSCPAMCTCSNGIVDCRGKGLTA
        330       340       350       360       370       380      

>>KIAA1497  ( 730 res)   hg01608                          (730 aa)
 initn: 674 init1: 270 opt: 325  Z-score: 358.5  bits: 76.5 E(): 7.5e-15
Smith-Waterman score: 330;  29.110% identity (57.877% similar) in 292 aa overlap (47-324:46-336)

         20        30        40        50                     60   
KIAA04 HFKWPLGAPMLAAIYAMSMVLKMLPALGMACPPKCRCEKLLFY-------------CDSQ
                                     ::  : ::   ..             :.. 
KIAA14 ARMSFVIAACQLVLGLLMTSLTESSIQNSECPQLCVCEIRPWFTPQSTYREATTVDCNDL
          20        30        40        50        60        70     

            70        80        90       100       110       120   
KIAA04 GFHSVPNATDKGSLGLSLRHNHITELERDQFASFSQLTWLHLDHNQISTVKEDAFQGLYK
        .  .:.  .. .  : :. :.:..   :.. .. .:: : ...:.....:: .. .: .
KIAA14 RLTRIPSNLSSDTQVLLLQSNNIAKTV-DELQQLFNLTELDFSQNNFTNIKEVGLANLTQ
          80        90       100        110       120       130    

           130       140       150       160       170       180   
KIAA04 LKELILSSNKIFYLPNTTFTQLINLQNLDLSFNQLSSLHPELFYGLRKLQTLHLRSNSLR
       :  : :  :.:  . .  . .: :::.: .. ::.:..  . : ::..:  ::: ::.:.
KIAA14 LTTLHLEENQITEMTDYCLQDLSNLQELYINHNQISTISAHAFAGLKNLLRLHLNSNKLK
          140       150       160       170       180       190    

           190       200       210       220       230       240   
KIAA04 TIPVRLFWDCRSLEFLDLSTNRLRSLARNGFAGLIKLRELHLEHNQLTKINFAHFLRLSS
       .:  : : .  .::.: .. : . ..   .:  : .:: : :    :: :    .. :.:
KIAA14 VIDSRWFDSTPNLEILMIGENPVIGILDMNFKPLANLRSLVLAGMYLTDIPGNALVGLDS
          200       210       220       230       240       250    

           250       260       270       280       290        300  
KIAA04 LHTLFLQWNKISNLTCGMEWTWGTLEKLDLTGNEIKAIDLTVFETMPNLKILLMDN-NKL
       :..: .  ::. ..         .:. :::. : :. :.   :..:  :: : ..: ..:
KIAA14 LESLSFYDNKLVKVPQLALQKVPNLKFLDLNKNPIHKIQEGDFKNMLRLKELGINNMGEL
          260       270       280       290       300       310    

            310       320       330       340       350       360  
KIAA04 NSLDSKILNSLRSLTTVGLSGNLWECSARICALASWLGSFQGRWEHSILCHSPDHTQGED
        :.:   :..:  :: .  ..:                                      
KIAA14 VSVDRYALDNLPELTKLEATNNPKLSYIHRLAFRSVPALESLMLNNNALNAIYQKTVESL
          320       330       340       350       360       370    

>>KIAA1246  ( 832 res)   hh00149a                         (832 aa)
 initn: 384 init1: 172 opt: 307  Z-score: 338.1  bits: 72.9 E(): 1e-13
Smith-Waterman score: 309;  35.185% identity (57.870% similar) in 216 aa overlap (33-233:44-255)

             10        20        30        40              50      
KIAA04 RLNAASNVLRRMGLHFKWPLGAPMLAAIYAMSMVLKMLPALGMA------CPPKCRC---
                                     :  .:  : :.:::      ::  : :   
KIAA12 PGSPGAPRSRPRCHPAGGRCCLAQALSDQTMETLLGGLLAFGMAFAVVDACPKYCVCQNL
            20        30        40        50        60        70   

             60        70        80        90       100       110  
KIAA04 -EKLLFYCDSQGFHSVPNATDKGSLGLSLRHNHITELERDQFASFSQLTWLHLDHNQIST
        :.:   : :.:.  ::   :. .. : :  : : .. :..::... :. : :..: :: 
KIAA12 SESLGTLCPSKGLLFVPPDIDRRTVELRLGGNFIIHISRQDFANMTGLVDLTLSRNTISH
            80        90       100       110       120       130   

            120       130       140       150       160        170 
KIAA04 VKEDAFQGLYKLKELILSSNKIFYLPNTTFTQLINLQNLDLSFNQLSSLHPELFYG-LRK
       ..  .:  : .:. : :.::..  : . :.  :.:::.: .. :::...  : :   :  
KIAA12 IQPFSFLDLESLRSLHLDSNRLPSLGEDTLRGLVNLQHLIVNNNQLGGIADEAFEDFLLT
           140       150       160       170       180       190   

             180       190           200       210       220       
KIAA04 LQTLHLRSNSLRTIPVRLFWDCR----SLEFLDLSTNRLRSLARNGFAGLIKLRELHLEH
       :. : :  :.:. .:    ::      .:. :.:. : :  .:.. :: : :: .: :  
KIAA12 LEDLDLSYNNLHGLP----WDSVRRMVNLHQLSLDHNLLDHIAEGTFADLQKLARLDLTS
           200           210       220       230       240         

       230       240       250       260       270       280       
KIAA04 NQLTKINFAHFLRLSSLHTLFLQWNKISNLTCGMEWTWGTLEKLDLTGNEIKAIDLTVFE
       :.: :.                                                      
KIAA12 NRLQKLPPDPIFARSQASALTATPFAPPLSFSFGGNPLHCNCELLWLRRLERDDDLETCG
     250       260       270       280       290       300         

>>KIAA0918  ( 966 res)   hk09360(revised)                 (966 aa)
 initn: 488 init1: 212 opt: 279  Z-score: 306.7  bits: 67.3 E(): 5.7e-12
Smith-Waterman score: 296;  30.342% identity (56.410% similar) in 234 aa overlap (2-228:14-243)

                           10        20        30        40        
KIAA04             QPRLNAASNVLRRMGLHFKWPLGAPMLAAIYAMSMVLKMLPALGMACP
                    : ..  ... :.:  : .: : .  .:.   .    . .   :  : 
KIAA09 RRGAQGGKMHTCCPPVTLEQDLHRKM--H-SWMLQTLAFAVTSLVLSCAETIDYYGEICD
               10        20           30        40        50       

       50            60        70          80        90       100  
KIAA04 PKCRCEK----LLFYCDSQGFHSVPNATDK--GSLGLSLRHNHITELERDQFASFSQLTW
         : ::.    :   :...:. :. . .        : :  : ...:  ..:....  . 
KIAA09 NACPCEEKDGILTVSCENRGIISLSEISPPRFPIYHLLLSGNLLNRLYPNEFVNYTGASI
        60        70        80        90       100       110       

            110       120       130       140       150       160  
KIAA04 LHLDHNQISTVKEDAFQGLYKLKELILSSNKIFYLPNTTFTQLINLQNLDLSFNQLSSLH
       :::  : :. ..  ::.::  :..: :..::.  : . ::  : ::. :....: .: ..
KIAA09 LHLGSNVIQDIETGAFHGLRGLRRLHLNNNKLELLRDDTFLGLENLEYLQVDYNYISVIE
       120       130       140       150       160       170       

            170       180       190       200       210        220 
KIAA04 PELFYGLRKLQTLHLRSNSLRTIPVRLFWDCRSLEFLDLSTNRLRSLARNGF-AGLIKLR
       :. :  :. ::.: : .: : ..:  ::     :  :::  :::. :   :.   . :. 
KIAA09 PNAFGKLHLLQVLILNDNLLSSLPNNLF-RFVPLTHLDLRGNRLKLLPYVGLLQHMDKVV
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KIAA04 ELHLEHNQLTKINFAHFLRLSSLHTLFLQWNKISNLTCGMEWTWGTLEKLDLTGNEIKAI
       ::.::.:                                                     
KIAA09 ELQLEENPWNCSCELISLKDWLDSISYSALVGDVVCETPFRLHGRDLDEVSKQELCPRRL
        240       250       260       270       280       290      

>>KIAA1854  ( 572 res)   fg02232                          (572 aa)
 initn: 408 init1: 171 opt: 273  Z-score: 302.0  bits: 65.7 E(): 1e-11
Smith-Waterman score: 273;  32.292% identity (59.896% similar) in 192 aa overlap (47-228:35-222)

         20        30        40        50            60          70
KIAA04 HFKWPLGAPMLAAIYAMSMVLKMLPALGMACPPKCRCEK----LLFYCDSQGFHSVP--N
                                     :  .: ::.    : . :...:: .:   .
KIAA18 LKMLSGVWFLSVLTVAGILQTESRKTAKDICKIRCLCEEKENVLNINCENKGFTTVSLLQ
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KIAA04 ATDKGSLGLSLRHNHITELERDQFASFSQLTWLHLDHNQISTVKEDAFQGLYKLKELILS
         .     : :  : .:.:  ..:...:. . ::: .: .. ..  ::.::  ::.: :.
KIAA18 PPQYRIYQLFLNGNLLTRLYPNEFVNYSNAVTLHLGNNGLQEIRTGAFSGLKTLKRLHLN
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KIAA04 SNKIFYLPNTTFTQLINLQNLDLSFNQLSSLHPELFYGLRKLQTLHLRSNSLRTIPVRLF
       .::.  : . ::  : .:. :. ..: .:...   :  : ::..: : .: : ..:  .:
KIAA18 NNKLEILREDTFLGLESLEYLQADYNYISAIEAGAFSKLNKLKVLILNDNLLLSLPSNVF
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            :  :::  :::. .    :::...    . :..::.:                  
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KIAA04 LFLQWNKISNLTCGMEWTWGTLEKLDLTGNEIKAIDLTVFETMPNLKILLMDNNKLNSLD
                                                                   
KIAA18 TVFVGEIVCETPFRLHGKDVTQLTRQDLCPRKSASDSSQRGSHADTHVQRLSPTMNPALN
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>>KIAA1851  ( 523 res)   hg04492                          (523 aa)
 initn: 386 init1: 246 opt: 272  Z-score: 301.3  bits: 65.4 E(): 1.2e-11
Smith-Waterman score: 272;  32.979% identity (56.915% similar) in 188 aa overlap (47-230:53-240)

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KIAA04 HFKWPLGAPMLAAIYAMSMVLKMLPALGMACPPKCRCEKLLFYCDSQGFHSVPNATDKGS
                                     :: :: :   :. : . :...::     ..
KIAA18 LVLLGTLLCMLRVGLGTPDSEGFPPRALHNCPYKCICAADLLSCTGLGLQDVPAELPAAT
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KIAA04 LGLSLRHNHITELERDQFASFSQLTWLHLDHNQISTVKEDAFQGLYKLKELILSSNKIFY
         :.: :: . .:.   .: . ::  ::::::..... . .: .   :. : :::: .  
KIAA18 ADLDLSHNALQRLRPGWLAPLFQLRALHLDHNELDALGRGVFVNASGLRLLDLSSNTLRA
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KIAA04 LPNTTFTQLINLQNLDLSFNQLSSLHPELFYGLRKLQTLHLRSNSLRTIPVRLF--WDCR
       :    .  :  :..: :  :.:  :  . :.::: :. :.:  : : ..    .   .  
KIAA18 LGRHDLDGLGALEKLLLFNNRLVHLDEHAFHGLRALSHLYLGCNELASFSFDHLHGLSAT
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        :  ::::.:::  ..   .:.:  . .  :.:..: :                      
KIAA18 HLLTLDLSSNRLGHISVPELAALPAFLKNGLYLHNNPLPCDCRLYHLLQRWHQRGLSAVR
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Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]