# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hh00161.fasta.huge -Q ../query/KIAA0414.ptfa ./tmplib.23147 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0414, 492 aa vs ./tmplib.23147 library 1987013 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5543+/-0.00592; mu= 4.7289+/- 0.400 mean_var=201.6044+/-54.821, 0's: 0 Z-trim: 66 B-trim: 93 in 1/39 Lambda= 0.090328 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1993 ( 532 res) bg00180 ( 532) 630 95.0 1.4e-20 KIAA1572 ( 492 res) fh23424 ( 492) 336 56.6 4.5e-09 KIAA1874 ( 579 res) hk07257s1 ( 579) 305 52.6 8.2e-08 KIAA1956 ( 680 res) fk08713 ( 680) 291 50.9 3.2e-07 KIAA1190 ( 174 res) hg03443a ( 174) 280 48.7 3.9e-07 KIAA1871 ( 821 res) hj05256s1 ( 821) 288 50.6 4.7e-07 KIAA1947 ( 608 res) fh23660 ( 608) 286 50.2 4.7e-07 KIAA1339 ( 409 res) fj00071 ( 409) 281 49.3 5.8e-07 KIAA1827 ( 469 res) fk01409 ( 469) 281 49.4 6.3e-07 KIAA0972 ( 702 res) hj06859 ( 702) 283 49.9 6.7e-07 KIAA1962 ( 746 res) hm00158 ( 746) 279 49.4 1e-06 KIAA1396 ( 551 res) hj08221 ( 551) 276 48.8 1.1e-06 KIAA1431 ( 891 res) fj00022 ( 891) 279 49.5 1.1e-06 KIAA1852 ( 948 res) fj01514 ( 948) 279 49.6 1.2e-06 KIAA0924 ( 617 res) hh02883 ( 617) 276 48.9 1.2e-06 KIAA2007 ( 580 res) fj01689 ( 580) 275 48.7 1.2e-06 KIAA1141 ( 914 res) hk01833 ( 914) 276 49.1 1.5e-06 KIAA1020 ( 638 res) fg00473s1 ( 638) 273 48.5 1.6e-06 KIAA2033 ( 766 res) ej00602s1 ( 766) 274 48.8 1.6e-06 KIAA1948 ( 487 res) fh24556 ( 487) 271 48.1 1.6e-06 KIAA2003 ( 460 res) ah02593 ( 460) 270 48.0 1.7e-06 KIAA0628 ( 540 res) hh01433 ( 540) 271 48.2 1.7e-06 KIAA1508 ( 573 res) hk06576 ( 573) 270 48.1 1.9e-06 KIAA0961 ( 530 res) hj05830 ( 530) 269 47.9 2e-06 KIAA0569 ( 1318 res) hh02356 (1318) 273 49.0 2.4e-06 KIAA1806 ( 481 res) fk00438 ( 481) 266 47.5 2.5e-06 KIAA1615 ( 484 res) fj13419 ( 484) 265 47.3 2.7e-06 KIAA0557 ( 493 res) hh01334 ( 493) 265 47.3 2.8e-06 KIAA1954 ( 468 res) fk02322 ( 468) 264 47.2 2.9e-06 KIAA1611 ( 813 res) fj12627 ( 813) 267 47.9 3.1e-06 KIAA1829 ( 557 res) hj00069 ( 557) 263 47.2 3.6e-06 KIAA1979 ( 309 res) fj09511 ( 309) 256 45.9 4.7e-06 KIAA1982 ( 599 res) fk06527(revised) ( 599) 257 46.4 6.4e-06 KIAA1588 ( 613 res) fj08823 ( 613) 257 46.4 6.5e-06 KIAA0412 ( 720 res) hg03242 ( 720) 258 46.7 6.5e-06 KIAA0065 ( 848 res) ha00946 ( 848) 259 46.9 6.6e-06 KIAA1559 ( 544 res) fh19195 ( 544) 255 46.1 7.2e-06 KIAA1710 ( 515 res) fj18457 ( 515) 252 45.7 9.2e-06 KIAA1388 ( 599 res) fj06552 ( 599) 252 45.8 1e-05 KIAA1015 ( 841 res) hk03609(revised) ( 841) 254 46.2 1e-05 KIAA1349 ( 752 res) fj00940 ( 752) 252 45.9 1.2e-05 KIAA0426 ( 613 res) hh01274 ( 613) 247 45.1 1.6e-05 KIAA0798 ( 682 res) hk06584 ( 682) 247 45.2 1.7e-05 KIAA0354 ( 730 res) hg01842 ( 730) 245 45.0 2.1e-05 KIAA0326 ( 927 res) hg00579 ( 927) 245 45.1 2.5e-05 KIAA0441 ( 702 res) hh00601s1 ( 702) 242 44.6 2.7e-05 KIAA0760 ( 1224 res) hk04642s1 (1224) 242 44.9 3.8e-05 KIAA1969 ( 595 res) fk06944 ( 595) 236 43.7 4.2e-05 KIAA1198 ( 553 res) fg01911 ( 553) 234 43.4 4.9e-05 KIAA1473 ( 574 res) fj03262 ( 574) 233 43.3 5.5e-05 >>KIAA1993 ( 532 res) bg00180 (532 aa) initn: 784 init1: 406 opt: 630 Z-score: 461.4 bits: 95.0 E(): 1.4e-20 Smith-Waterman score: 631; 30.323% identity (58.280% similar) in 465 aa overlap (26-472:31-479) 10 20 30 40 50 KIAA04 NKFIFGLEFVLIFLSLVAPNKICDEMEPGTNSF-RVEFPDFSSTILQKLNQQRQQ .: ..:: . . :..:::.:..::. : : KIAA19 GDWPGAGGGGGGAAGGRCERGALDRVRFMSVEMDSSSFIQFDVPEYSSTVLSQLNELRLQ 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 KIAA04 GQLCDVSIVVQGHIFRAHKAVLAASSPYFCDQVLLKNSRRIVLPDVMNPRVFENILLSSY :.:::. . .::. ::::::::::::::: :. :.. . . . :: :::..: : KIAA19 GKLCDIIVHIQGQPFRAHKAVLAASSPYFRDHSALSTMSGLSISVIKNPNVFEQLLSFCY 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 KIAA04 TGRLVMPAPEIVSYLTAASFLQMWHVVDKCTEVLEG-NPTVLCQKLNHGSDHQSPSSSSY :::. . ..::.::::::::: :.::::..::. . . .. . . : KIAA19 TGRMSLQLKDVVSFLTAASFLQMQCVIDKCTQILESIHSKISVGDVDSVTVGAEENPESR 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 KIAA04 NGLVESFELGSGGHTDFPKAQELRDGENEEESTKDELSSQLTEHEYLPSNSSTEHDRLST ::. .: ... . . : .. : . ::.: . : ::.. ..::. KIAA19 NGVKDSSFFANPVEISPPYCSQGR---------QPTASSDL-RMETTPSKAL--RSRLQE 190 200 210 220 240 250 260 270 280 KIAA04 EMASQDGEEGASDSAEFHYTRPMYSKPSIMAHKRWI---HVKPERLEQ-ACEGMDVHATY : :. : :. . :.. . . ...... : .:: :. .. .: : . KIAA19 EGHSDRGSSGSVSEYEIQIEGD-HEQGDLLVRESQITEVKVKMEKSDRPSCS--DSSSLG 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 KIAA04 DEHQVTESINTVQTEHT-VQPSGVEEDFHIGEKKVEAEFDEQADESNYDEQVDFYGSSME :. :: .. :. . : : . . ... .. . .. . . . : . 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KIAA19 CGKCFPFQGTLNQHLRKNHPGVAEVRSRIESPERTDVYVEQKLENDASASEMGLDSRMEI 470 480 490 500 510 520 >>KIAA1572 ( 492 res) fh23424 (492 aa) initn: 554 init1: 332 opt: 336 Z-score: 254.7 bits: 56.6 E(): 4.5e-09 Smith-Waterman score: 491; 27.079% identity (59.488% similar) in 469 aa overlap (25-492:51-440) 10 20 30 40 50 KIAA04 NKFIFGLEFVLIFLSLVAPNKICDEMEPGTNSFRVEFPDFSSTILQKLNQQRQQ .: .. .. .: ......:::.:. :.. KIAA15 DLFLEGRSSFLNCLSFLKFNLFTFLFFRSAKMSERSDLLHFKFENYGDSMLQKMNKLREE 30 40 50 60 70 80 60 70 80 90 100 110 KIAA04 GQLCDVSIVVQGHIFRAHKAVLAASSPYFCDQVLLKNSRRIVLPDVMNPRVFENILLSSY ...:::..... ..:: :.::.::.. :: ::..::.. . ... .: ...::: : KIAA15 NKFCDVTVLIDDIEVQGHKIVFAAGSPFLRDQFLLNDSREVKISILQSSEVGRQLLLSCY 90 100 110 120 130 140 120 130 140 150 160 170 KIAA04 TGRLVMPAPEIVSYLTAASFLQMWHVVDKCTEVLEGNPTVLCQKLNHGSDHQSPSSSSYN .: : .: :.:.:::::::::: :.:..::..: :. . ..: .:. KIAA15 SGVLEFPEMELVNYLTAASFLQMSHIVERCTQAL--------WKFIKP---KQPMDSK-- 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 KIAA04 GLVESFELGSGGHTDFPKAQELRDGENEEESTKDELSSQLTEHEYLPSNSSTEHDRLSTE :. : :.. :...: ..:. . .: : . : ::..: . . . . KIAA15 ---EGCEPQSAS----PQSKE-QQGDARGSPKQD--SPCI--H---PSEDSMDMEDSDIQ 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 KIAA04 MASQDGEEGASDSAEFHYTRPMYSKPSIMAHKRWIHVKPERLEQACEGMDVHATYDEHQV ... :. .: .: . :: . ....: .: : :.. .:.. KIAA15 IVKV---ESIGDVSE------VRSKKD---QNQFISSEPTAL---------HSSEPQHSL 240 250 260 270 300 310 320 330 340 350 KIAA04 TESINTVQTEHTVQPSGVEEDFHIGEKKVEAEFDEQADESNYDEQVDFYGSSMEEFSGER .: :: :. : : .:.. :. . . . .... . : .: ... : KIAA15 INS--TV--ENRV--SEIEQN-HLHNYAL----SYTGSDNIIMASKDVFGPNIR---G-- 280 290 300 310 360 370 380 390 400 410 KIAA04 SDGNLIGHRQEAALAAGYSENIEMVTGIKEEASHLGFSATDKLYPCQ-CGKSFTHKSQRD : .: :.: . .. ... :.:: . ::. : :::.::.:.. KIAA15 VDKGLQWHHQCP-------KCTRVFRHLENYANHLKMH---KLFMCLLCGKTFTQKGNLH 320 330 340 350 360 420 430 440 450 460 470 KIAA04 RHMSMHLGLRPYGCGVCGKKFKMKHHLVGHMKIHTGIKPYECNICAKRFMWRDSFHRHVT ::: .: :..:. : .::: :..: : :...:.: ::..:: : : . ...:. KIAA15 RHMRVHAGIKPFQCKICGKTFSQKCSLQDHLNLHSGDKPHKCNYCDMVFAHKPVLRKHL- 370 380 390 400 410 420 480 490 KIAA04 SCTKSYEAAKAEQNTTEAN :. .. .. .:..: : KIAA15 ---KQLHGKNSFDNANERNVQDLTVDFDSFACTTVTDSKGCQPQPDATQVLDAGKLAQAV 430 440 450 460 470 480 >>KIAA1874 ( 579 res) hk07257s1 (579 aa) initn: 1224 init1: 260 opt: 305 Z-score: 232.1 bits: 52.6 E(): 8.2e-08 Smith-Waterman score: 320; 28.319% identity (59.735% similar) in 226 aa overlap (256-471:309-514) 230 240 250 260 270 280 KIAA04 TEHDRLSTEMASQDGEEGASDSAEFHYTRPMYSKPSIMAHKRWIHV--KPERLEQACEGM ... :.. ... .:. :: .. ... KIAA18 EKSLKQKSNLMKKQRTYKEKKPHKCNDCGELFTYHSVLIRHQRVHTGEKPYTCNECGKSF 280 290 300 310 320 330 290 300 310 320 330 KIAA04 DVHATYDEHQVTES---INTVQTEHTVQPSG---VEEDFHIGEKKVEA-EFDEQADESNY . .:. .:: :.. .. . ..: :. ... .:.::. : : . ..:.. KIAA18 SHRANLTKHQRTHTRILFECSECKKTFTESSSLATHQRIHVGERPYECNECGKGFNRSTH 340 350 360 370 380 390 340 350 360 370 380 390 KIAA04 DEQVDFYGSSMEEFSGERSDGNLIGHRQEAALAAGYSENIEMVTGIKEEASHLGFSATDK : .. .... . .. : .: . .:: ::.. .: : .: KIAA18 LVQHQLIHTGVKPYECNECDKAFI---HSSAL-------------IKHQRTHTG----EK 400 410 420 430 400 410 420 430 440 450 KIAA04 LYPCQ-CGKSFTHKSQRDRHMSMHLGLRPYGCGVCGKKFKMKHHLVGHMKIHTGIKPYEC : :: :::.:.: :. .:. .: : .:: :. ::: :... ::: :..:::: ::::: KIAA18 PYKCQECGKAFSHCSSLTKHQRVHTGEKPYECSECGKTFSQSTHLVQHQRIHTGEKPYEC 440 450 460 470 480 490 460 470 480 490 KIAA04 NICAKRFMWRDSFHRHVTSCTKSYEAAKAEQNTTEAN : :.: : ..: .: KIAA18 NECGKTFSRSSNFAKHQRIHIGKKPYKCSECGKAFIHSSALIQHQRTHTGEKPFRCNECG 500 510 520 530 540 550 >>KIAA1956 ( 680 res) fk08713 (680 aa) initn: 1571 init1: 259 opt: 291 Z-score: 221.5 bits: 50.9 E(): 3.2e-07 Smith-Waterman score: 302; 26.403% identity (52.145% similar) in 303 aa overlap (200-480:55-347) 170 180 190 200 210 220 KIAA04 SSSYNGLVESFELGSGGHTDFPKAQELRDGENEEESTKDELSSQLTEHEYLPSNSSTEHD :.:: .: .: : . . :. . . . KIAA19 LLSEVQRCLYHDVMLENWVLISSLGCWCGSEDEEAPSKKSISIQRVSQVSTPGAGVSPKK 30 40 50 60 70 80 230 240 250 260 270 KIAA04 RLSTEMASQ---D-----GEEGASDSAEFH----YTRPMYSKPSIMAHKRWIHVKPERLE : :: . : ..:. . ..: . .:.. . ..... :: : KIAA19 AHSCEMCGAILGDILHLADHQGTHHKQKLHRCEAWGNKLYDSSNRPHQNQYLGEKPYR-S 90 100 110 120 130 140 280 290 300 310 320 330 KIAA04 QACEGMDVHATYDEHQVTESINTVQTEHTVQPSG---VEEDFHIGEK---KVEAEFDEQA .. :.. :. : :: .:. . ::. ..: : ::: : : : : KIAA19 SVEEALFVKRC-KFHVSEESSIFIQSGKDFLPSSGLLLQEATHTGEKSNSKPECESPFQW 150 160 170 180 190 200 340 350 360 370 380 390 KIAA04 DESNYDEQVDFYGSSMEEFSGERSDGNLIGHRQEAALAAGYS-ENIEMVTGIKEEASHLG ...:. : :.. : .. .. ... . : : . . ..: KIAA19 GDTHYSC-----GECMKHSSTKHV---FVQQQRLPSREECYCWECGKSFSKYDSVSNHQR 210 220 230 240 250 400 410 420 430 440 KIAA04 FSATDKLYPC-QCGKSFTHKSQRDRHMSMHLGLRPYGCGVCGKKFKMKHHLVGHMKIHTG . . : : .:::::.::.. .:. .: : ::: :: :::.:. : :: :...::: KIAA19 VHTGKRPYECGECGKSFSHKGSLVQHQRVHTGKRPYECGECGKSFSHKGSLVQHQRVHTG 260 270 280 290 300 310 450 460 470 480 490 KIAA04 IKPYECNICAKRFMWRDSF--HRHVTSCTKSYEAAKAEQNTTEAN .::::. :.: : .. :..: . . :: KIAA19 ERPYECGECGKSFSQNGTLIKHQRVHTGERPYECEECGKCFTQKGNLIQHQRGHTSERPY 320 330 340 350 360 370 KIAA19 ECEECGKCFSQKGTLTEHHRVHTRERPYECGECGKSFSRKGHLRNHQRGHTGERPYECGE 380 390 400 410 420 430 >>KIAA1190 ( 174 res) hg03443a (174 aa) initn: 460 init1: 254 opt: 280 Z-score: 220.1 bits: 48.7 E(): 3.9e-07 Smith-Waterman score: 280; 38.043% identity (66.304% similar) in 92 aa overlap (387-477:20-111) 360 370 380 390 400 410 KIAA04 GNLIGHRQEAALAAGYSENIEMVTGIKEEASHLGFSATDKLYPCQ-CGKSFTHKSQRDRH ::... : . :: :::.:. :. :.: KIAA11 KPFRCENCNERFQYKYQLRSHMSIHIGHKQFMCQWCGKDFNMKQYFDEH 10 20 30 40 420 430 440 450 460 470 KIAA04 MSMHLGLRPYGCGVCGKKFKMKHHLVGHMKIHTGIKPYECNICAKRFMWRDSFHRHVTSC :. : : .:: : .:::.: . .. : . ::: ::: :..:..:: . . .. : .: KIAA11 MKTHTGEKPYICEICGKSFTSRPNMKRHRRTHTGEKPYPCDVCGQRFRFSNMLKAHKEKC 50 60 70 80 90 100 480 490 KIAA04 TKSYEAAKAEQNTTEAN . KIAA11 FRVSHTLAGDGVPAAPGLPPTQPQAHALPLLPGLPQTLPPPPHLPPPPPLFPTTASPGGR 110 120 130 140 150 160 >>KIAA1871 ( 821 res) hj05256s1 (821 aa) initn: 1755 init1: 271 opt: 288 Z-score: 218.5 bits: 50.6 E(): 4.7e-07 Smith-Waterman score: 311; 32.530% identity (55.020% similar) in 249 aa overlap (256-480:289-531) 230 240 250 260 270 280 KIAA04 TEHDRLSTEMASQDGEEGASDSAEFHYTRPMYSKPS-IMAHKRWIHV--KPERLEQACEG :.:. : .. :.: ::. :: . .. .. KIAA18 GKAFSQSTDLIIHHRIHTGEKPYECYDCGQMFSQSSHLVPHQR-IHTGEKPLKCNECEKA 260 270 280 290 300 310 290 300 310 320 330 KIAA04 MDVHATYDEHQVTESINTVQTEHTVQP--SGV-----EEDFHIGEKKVEAE--F--DEQA . :. ::: .: . : :: .. .: ::: : : : ::. KIAA18 FRQHSHLTEHQRLHSGEKPYECHRCGKTFSGRTAFLKHQRLHAGEKIEECEKTFSKDEEL 320 330 340 350 360 370 340 350 360 370 380 KIAA04 DES---NYDEQVDFYGSSMEEFSGERSDGNLIGHRQEAALAAGY--SENIEMVTGIKEEA : . .:.. . .. ..:.: :: :: :. . : .: . . .. KIAA18 REEQRIHQEEKAYWCNQCGRNFQGT-SD--LIRHQVTHTGEKPYECKECGKTFNQSSDLL 380 390 400 410 420 430 390 400 410 420 430 440 KIAA04 SHLGFSATDKLYPC---QCGKSFTHKSQRDRHMSMHLGLRPYGCGVCGKKFKMKHHLVGH : . . .: :: .::::: .:. :: .: : .:: :. ::: :... ::: : KIAA18 RHHRIHSGEK--PCVCSKCGKSFRGSSDLIRHHRVHTGEKPYECSECGKAFSQRSHLVTH 440 450 460 470 480 490 450 460 470 480 490 KIAA04 MKIHTGIKPYECNICAKRFMWRDSF--HRHVTSCTKSYEAAKAEQNTTEAN .::::: :::.:. :.: : :. . ::.. : : :: KIAA18 QKIHTGEKPYQCTECGKAFRRRSLLIQHRRIHSGEKPYECKECGKLFIWRTAFLKHQSLH 500 510 520 530 540 550 KIAA18 TGEKLECEKTFSQDEELRGEQKIHQEAKAYWCNQCGRAFQGSSDLIRHQVTHTREKPYEC 560 570 580 590 600 610 >>KIAA1947 ( 608 res) fh23660 (608 aa) initn: 268 init1: 268 opt: 286 Z-score: 218.5 bits: 50.2 E(): 4.7e-07 Smith-Waterman score: 293; 27.000% identity (53.000% similar) in 300 aa overlap (191-471:5-294) 170 180 190 200 210 220 KIAA04 HGSDHQSPSSSSYNGLVESFELGSGGHTDFPKAQELRDGENEEESTKDELSSQLTEHEYL :. : . : .. . : ::.: . . 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KIAA19 FCHQHTLFEHQKIHTEERPYECSECGKLFRYNSDLIKHQRNHTGERPYKCSECGKAFSLK 150 160 170 180 190 200 390 400 410 420 430 440 KIAA04 KEEASHLGFSATDKLYPC-QCGKSFTHKSQRDRHMSMHLGLRPYGCGVCGKKFKMKHHLV . ..: . . .. : : .:::.: .::. .:. .: ::: :. ::: : . ::: KIAA19 YNVVQHQKIHTGERPYECSECGKAFLRKSHLLQHQRIHTRPRPYVCSECGKAFLTQAHLV 210 220 230 240 250 260 450 460 470 480 490 KIAA04 GHMKIHTGIKPYECNICAKRFMWRDSFHRHVTSCTKSYEAAKAEQNTTEAN ::.::::: .:: :: :.: ::. ... :: KIAA19 GHQKIHTGERPYGCNECGKYFMYSSALIRHQKVHTGERPFYCCECGKFFMDSCTLIIHQR 270 280 290 300 310 320 >>KIAA1339 ( 409 res) fj00071 (409 aa) initn: 455 init1: 240 opt: 281 Z-score: 216.8 bits: 49.3 E(): 5.8e-07 Smith-Waterman score: 281; 36.441% identity (63.559% similar) in 118 aa overlap (361-474:243-355) 340 350 360 370 380 KIAA04 ADESNYDEQVDFYGSSMEEFSGERSDGNLIGHRQEAALAA---GYSENIEMVTGIKEEAS :: :: .. : . : . . :... KIAA13 RRAHASERPFRCAQCGRSFSLKISLLLHQRGHAQERPFSCPQCGIDFNGHSAL-IRHQMI 220 230 240 250 260 270 390 400 410 420 430 440 KIAA04 HLGFSATDKLYPC-QCGKSFTHKSQRDRHMSMHLGLRPYGCGVCGKKFKMKHHLVGHMKI : : .. ::: .:.::: .: . : .: : ::..: :::.: ::::. :..: KIAA13 HTG----ERPYPCTDCSKSFMRKEHLLNHRRLHTGERPFSCPHCGKSFIRKHHLMKHQRI 280 290 300 310 320 450 460 470 480 490 KIAA04 HTGIKPYECNICAKRFMWRDSFHRHVTSCTKSYEAAKAEQNTTEAN ::: .:: :. :.. : ...... :. : KIAA13 HTGERPYPCSYCGRSFRYKQTLKDHLRSGHNGGCGGDSDPSGQPPNPPGPLITGLETSGL 330 340 350 360 370 380 >>KIAA1827 ( 469 res) fk01409 (469 aa) initn: 1701 init1: 247 opt: 281 Z-score: 216.2 bits: 49.4 E(): 6.3e-07 Smith-Waterman score: 302; 26.959% identity (57.053% similar) in 319 aa overlap (187-483:94-394) 160 170 180 190 200 210 KIAA04 QKLNHGSDHQSPSSSSYNGLVESFELGSGGHTDFPKAQELRDGENEEESTK-DEL---SS .... . :... ::. . . :.. :: KIAA18 SCSSKLVIHRRMHTGEKPYKCHECGKLFSSNSNLSQHQRIHTGEKPYKCHECDKVFRSSS 70 80 90 100 110 120 220 230 240 250 260 KIAA04 QLTEHEYLPSNSST----EHDRLSTEMAS----QDGEEGASDSAEFHYTRPMYSKPSIMA .:..:. . .. . : :.. ...: : . : . . . ..:. : .: KIAA18 KLAQHQRIHTGEKPYKCHECDKVFNQIAHLVRHQKIHTGEKPYS-CNKCGKVFSRHSYLA 130 140 150 160 170 180 270 280 290 300 310 320 KIAA04 HKRWIHV--KPERLEQACEGMDVHATYDEHQVTESINTVQTEHTVQPSGVEEDFHIGEKK ... .:. :: . :. ....:... ::. :.: . . . : : .:.: KIAA18 EHQTVHTGEKPYKCEECGKAFSVRSSLITHQL---IHTGRKPYKCK----ECDKVFGRKC 190 200 210 220 230 330 340 350 360 370 380 KIAA04 VEAEFDEQADESNYDEQVDFYGSSM--EEFSGERSDGNLIGHRQEAALAAGYSENIEMVT : . .. . :. :: :. . :: ..:: :: ::. . :. : . : KIAA18 ----FLTSHQRIHTRERP--YGCSQCGKIFS-QKSD--LIRHRKTHTDEKPYKCN-KCGT 240 250 260 270 280 390 400 410 420 430 KIAA04 GIKEEA---SHLGFSATDKLYPCQ-CGKSFTHKSQRDRHMSMHLGLRPYGCGVCGKKFKM ...: . .:. . . .: : :. ::: : .::. : .: : .:: :. ::: :. KIAA18 AFREFSDLTAHFLIHSGEKPYECKECGKVFRYKSSLTSHHRIHTGEKPYKCNRCGKVFSR 290 300 310 320 330 340 440 450 460 470 480 490 KIAA04 KHHLVGHMKIHTGIKPYECNICAKRFMWRDSFHRH--VTSCTKSYEAAKAEQNTTEAN . .:: :.::::: :::.:: :.: : . . :: . . . :. .: KIAA18 SSNLVCHQKIHTGEKPYKCNQCGKVFNQASYLTRHQIIHTGERPYRCSKCGKAFRGCSGL 350 360 370 380 390 400 KIAA18 TAHLAIHTEKKSHECKECGKIFTQKSSLTNHHRIHIGEKPYKCTLCSKVFSHNSDLAQHQ 410 420 430 440 450 460 >>KIAA0972 ( 702 res) hj06859 (702 aa) initn: 1737 init1: 255 opt: 283 Z-score: 215.7 bits: 49.9 E(): 6.7e-07 Smith-Waterman score: 283; 26.562% identity (57.422% similar) in 256 aa overlap (236-480:293-536) 210 220 230 240 250 260 KIAA04 TKDELSSQLTEHEYLPSNSSTEHDRLSTEMASQDGEEGASDSAEFHYTRPMYSKPSIMAH .:. :: ...:. :: : .: ... : KIAA09 HPKFQTLEQAFECNKIGKAFNDKANCVKHNSSHTGETSSKDD-EF---RKNCDKKTLFDH 270 280 290 300 310 270 280 290 300 310 320 KIAA04 KRWIHVKPERLEQACEGMDVHATYDEHQVTESINTVQTEHTVQPSG--VEEDFHIGEKKV .: : . . : ..: .:.. ..: .. ..::: .. :. . .. KIAA09 RRTGTGKKHLHLNQCGKSFEKSTVEEYN---KLNMGIKHYELNPSGNNFNRKAHLTDPQT 320 330 340 350 360 370 330 340 350 360 370 KIAA04 EAEFDEQADESNYDEQVDFYGSSMEEFSGERSDGNLIGHRQEAALAAGYSEN------IE : ..:. :: :. .: ..: . . . .:. .. :. : . KIAA09 -AVIEENPLVSNDRTQTWVKSSEYHENKKSYQTSVHRVRRRSHSMMKPYKCNECGKSFCQ 380 390 400 410 420 430 380 390 400 410 420 430 KIAA04 MVTGIKEEASHLGFSATDKLYPC-QCGKSFTHKSQRDRHMSMHLGLRPYGCGVCGKKFKM :... .: : .: . : .:::.:..::. . :. .: . .:: :. ::: : . KIAA09 KGHLIQHQRTHTG----EKPFECSECGKTFSQKSHLSTHQRIHTAEKPYKCNECGKTFVQ 440 450 460 470 480 490 440 450 460 470 480 490 KIAA04 KHHLVGHMKIHTGIKPYECNICAKRFMWRDSF--HRHVTSCTKSYEAAKAEQNTTEAN : : ::..:::: :::::. :.: :. .... :... . ::.. KIAA09 KSTLRGHQRIHTGEKPYECSECGKTFVQKSTLRDHHRIHTGEKSFQCNQCGKTFGQKSNL 500 510 520 530 540 550 KIAA09 RIHQRTHTGEKTYQCNECEKSFWRKDHLIQHQKTHTGEKPFKCNECGKTFARTSTLRVHQ 560 570 580 590 600 610 492 residues in 1 query sequences 1987013 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:20:39 2008 done: Thu Dec 18 15:20:40 2008 Total Scan time: 0.440 Total Display time: 0.100 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]