# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hg03242.fasta.huge -Q ../query/KIAA0412.ptfa ./tmplib.23147 2
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007
Please cite:
 W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

 KIAA0412, 720 aa
 vs ./tmplib.23147 library

1986785 residues in  2037 sequences
  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3095+/-0.00709; mu= 16.4822+/- 0.482
 mean_var=186.1261+/-46.057, 0's: 0 Z-trim: 77  B-trim: 16 in 1/39
 Lambda= 0.094009

FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2
 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width:  16
The best scores are:                                      opt bits E(2037)
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KIAA1956  ( 680 res)   fk08713                     ( 680) 1664 238.5 1.6e-63
KIAA0798  ( 682 res)   hk06584                     ( 682) 1652 236.9   5e-63
KIAA1947  ( 608 res)   fh23660                     ( 608) 1626 233.3 5.4e-62
KIAA0065  ( 848 res)   ha00946                     ( 848) 1605 230.6 4.6e-61
KIAA0326  ( 927 res)   hg00579                     ( 927) 1579 227.2 5.6e-60
KIAA1508  ( 573 res)   hk06576                     ( 573) 1569 225.5 1.1e-59
KIAA2007  ( 580 res)   fj01689                     ( 580) 1553 223.3 5.1e-59
KIAA1349  ( 752 res)   fj00940                     ( 752) 1552 223.4 6.3e-59
KIAA1473  ( 574 res)   fj03262                     ( 574) 1537 221.1 2.3e-58
KIAA1827  ( 469 res)   fk01409                     ( 469) 1526 219.5 5.8e-58
KIAA0628  ( 540 res)   hh01433                     ( 540) 1525 219.5 6.8e-58
KIAA2033  ( 766 res)   ej00602s1                   ( 766) 1523 219.4 9.8e-58
KIAA1852  ( 948 res)   fj01514                     ( 948) 1524 219.7 9.9e-58
KIAA1559  ( 544 res)   fh19195                     ( 544) 1516 218.3 1.6e-57
KIAA1710  ( 515 res)   fj18457                     ( 515) 1513 217.8 2.1e-57
KIAA1969  ( 595 res)   fk06944                     ( 595) 1494 215.3 1.3e-56
KIAA1982  ( 599 res)   fk06527(revised)            ( 599) 1490 214.8 1.9e-56
KIAA1431  ( 891 res)   fj00022                     ( 891) 1462 211.3 3.3e-55
KIAA1948  ( 487 res)   fh24556                     ( 487) 1455 209.9 4.7e-55
KIAA0961  ( 530 res)   hj05830                     ( 530) 1446 208.7 1.1e-54
KIAA1829  ( 557 res)   hj00069                     ( 557) 1408 203.6 4.1e-53
KIAA1198  ( 553 res)   fg01911                     ( 553) 1359 197.0 4.1e-51
KIAA1871  ( 821 res)   hj05256s1                   ( 821) 1337 194.3   4e-50
KIAA2003  ( 460 res)   ah02593                     ( 460) 1302 189.1   8e-49
KIAA1874  ( 579 res)   hk07257s1                   ( 579) 1300 189.0 1.1e-48
KIAA1588  ( 613 res)   fj08823                     ( 613) 1291 187.8 2.6e-48
KIAA1396  ( 551 res)   hj08221                     ( 551) 1290 187.6 2.7e-48
KIAA1962  ( 746 res)   hm00158                     ( 746) 1268 184.8 2.5e-47
KIAA0426  ( 613 res)   hh01274                     ( 613) 1255 182.9 7.7e-47
KIAA1806  ( 481 res)   fk00438                     ( 481) 1219 177.9   2e-45
KIAA1615  ( 484 res)   fj13419                     ( 484) 1197 174.9 1.6e-44
KIAA0972  ( 702 res)   hj06859                     ( 702) 1158 169.9 7.5e-43
KIAA1141  ( 914 res)   hk01833                     ( 914) 1100 162.2   2e-40
KIAA1015  ( 841 res)   hk03609(revised)            ( 841)  977 145.5   2e-35
KIAA1954  ( 468 res)   fk02322                     ( 468)  842 126.7 4.9e-30
KIAA1339  ( 409 res)   fj00071                     ( 409)  801 121.1 2.1e-28
KIAA0441  ( 702 res)   hh00601s1                   ( 702)  780 118.6   2e-27
KIAA1979  ( 309 res)   fj09511                     ( 309)  715 109.2 6.1e-25
KIAA1388  ( 599 res)   fj06552                     ( 599)  680 104.9 2.3e-23
KIAA0924  ( 617 res)   hh02883                     ( 617)  646 100.3 5.6e-22
KIAA1703  ( 1165 res)   fj16891                    (1165)  605 95.2 3.6e-20
KIAA0557  ( 493 res)   hh01334                     ( 493)  593 93.0 7.3e-20
KIAA1951  ( 679 res)   fj05532                     ( 679)  579 91.3 3.2e-19
KIAA0478  ( 1253 res)   hh05955                    (1253)  544 87.0 1.2e-17
KIAA0236  ( 1696 res)   ha04654                    (1696)  444 73.7 1.6e-13
KIAA1285  ( 785 res)   hh11563(revised)            ( 785)  432 71.5 3.5e-13
KIAA1020  ( 638 res)   fg00473s1                   ( 638)  430 71.1 3.8e-13
KIAA1231  ( 1061 res)   fh08195s1                  (1061)  415 69.4   2e-12
KIAA1675  ( 1286 res)   ae00102                    (1286)  383 65.2 4.4e-11


>>KIAA1611  ( 813 res)   fj12627                          (813 aa)
 initn: 7917 init1: 1646 opt: 1665  Z-score: 1232.3  bits: 238.7 E(): 1.6e-63
Smith-Waterman score: 1789;  44.479% identity (65.630% similar) in 643 aa overlap (105-685:1-641)

           80        90       100       110       120       130    
KIAA04 SVRPPGAPLSQLCGPGGDVMAAAVLTDRAQVSVTFDDVAVTFTKEEWGQLDLAQRTLYQE
                                     : .:: :::. :..:::  :: ::: ::..
KIAA16                               VRLTFRDVAIEFSQEEWKCLDPAQRILYRD
                                             10        20        30

          140       150       160       170                        
KIAA04 VMLENCGLLVSLGCPVPKAELICHLEHGQEPWTRKE-------------------DLS--
       :::::   :::::      ..:  ::.:.:::: :                    :.   
KIAA16 VMLENYWNLVSLGLCHFDMNIISMLEEGKEPWTVKSCVKIARKPRTRECVKGVVTDIPPK
               40        50        60        70        80        90

              180                      190        200       210    
KIAA04 ---QDTCPGDKGK---------------PKTTEPTTCEPALS-EGISLQGQVTQGNSVDS
          .:  : .:..               :   . .  ::  . . .  : .   ::    
KIAA16 CTIKDLLPKEKSSTEAVFHTVVLERHESPDIEDFSFKEPQKNVHDFECQWRDDTGNYKGV
              100       110       120       130       140       150

          220                 230        240         250       260 
KIAA04 QLGQAE---DQ-------DGLSEMQEG-HFRPGIDPQE--KSPGKMSPECDGLGTADGVC
        ..: :   ::       . : . : :  :.  .   .  .. :::  ::. .  . .  
KIAA16 LMAQKEGKRDQRDRRDIENKLMNNQLGVSFHSHLPELQLFQGEGKMY-ECNQVEKSTNNG
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             270       280           290            300       310  
KIAA04 SRIGQEQVSPGDRVRSHNSCESGK----DPMIQEEENN-----FKCSECGKVFNKKHLLA
       : ..  :  :.. :..: : .  .    . . :... :     .::.::::.:...  :.
KIAA16 SSVSPLQQIPSS-VQTHRSKKYHELNHFSLLTQRRKANSCGKPYKCNECGKAFTQNSNLT
     210       220        230       240       250       260        

            320       330       340       350       360       370  
KIAA04 GHEKIHSGVKPYECTECGKTFIKSTHLLQHHMIHTGERPYECMECGKAFNRKSYLTQHQR
       .:..:::: :::.:.::::::   ..:  :..:::::.::.: ::::.: ..:::. :.:
KIAA16 SHRRIHSGEKPYKCSECGKTFTVRSNLTIHQVIHTGEKPYKCHECGKVFRHNSYLATHRR
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            380       390       400       410       420       430  
KIAA04 IHSGEKPYKCNECGKAFTHRSNFVLHNRRHTGEKSFVCTECGQVFRHRPGFLRHYVVHSG
       ::.::::::::::::::  .::.. :.  ::::: : :.:::..: .   .. :. .:.:
KIAA16 IHTGEKPYKCNECGKAFRGHSNLTTHQLIHTGEKPFKCNECGKLFTQNSHLISHWRIHTG
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KIAA04 ENPYECLECGKVFKHRSYLMWHQQTHTGEKPYECSECGKVFLESAALIHHYVIHTGEKPF
       :.::.: ::::.:. :: :  ::  :::::::.:.::::::  .. : .:  .::::::.
KIAA16 EKPYKCNECGKAFSVRSSLAIHQTIHTGEKPYKCNECGKVFRYNSYLGRHRRVHTGEKPY
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KIAA04 ECLECGKAFNHRSYLKRHQRIHTGEKPFVCSECGKAFTHCSTFILHKRAHTGEKPFECKE
       .: ::::::. .: :  :: :::: ::: :.::.:.::. : .  :.: ::::::..:.:
KIAA16 KCNECGKAFSMHSNLATHQVIHTGTKPFKCNECSKVFTQNSQLANHRRIHTGEKPYKCNE
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KIAA04 CGKAFSNRKDLIRHFSIHTGEKPYECVECGKAFTRMSGLTRHKRIHSGEKPYECVECGKS
       :::::: :..:  : .::.:::::.:.::::.::. : :  :. ::::::::.: :::: 
KIAA16 CGKAFSVRSSLTTHQAIHSGEKPYKCIECGKSFTQKSHLRSHRGIHSGEKPYKCNECGKV
      510       520       530       540       550       560        

            620       630       640       650       660       670  
KIAA04 FCWSTNLIRHAIIHTGEKPYKCSECGKAFSRSSSLTQHQRMHTGKNPISVTDVGRPFTSG
       :  ...: ::  .:::::::::..::.:::  :::: :: .:::..: .  . :. :  .
KIAA16 FAQTSQLARHWRVHTGEKPYKCNDCGRAFSDRSSLTFHQAIHTGEKPYKCHECGKVFRHN
      570       580       590       600       610       620        

            680       690       700       710       720            
KIAA04 QTSVTLRELLLGKDFLNVTTEANILPEETSSSASDQPYQRETPQVSSL            
       .  .: :..  :.                                               
KIAA16 SYLATHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSMHSNLTTHKVIHTGEKPYKCNQCGKVFTQNSHLA
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>>KIAA1956  ( 680 res)   fk08713                          (680 aa)
 initn: 2929 init1: 1483 opt: 1664  Z-score: 1232.2  bits: 238.5 E(): 1.6e-63
Smith-Waterman score: 1701;  41.892% identity (69.088% similar) in 592 aa overlap (104-671:6-581)

            80        90       100       110       120       130   
KIAA04 GSVRPPGAPLSQLCGPGGDVMAAAVLTDRAQVSVTFDDVAVTFTKEEWGQLDLAQRTLYQ
                                     : .:.:.::::.:..:::. :. .:: ::.
KIAA19                          TPAIMQGTVAFEDVAVNFSQEEWSLLSEVQRCLYH
                                        10        20        30     

           140       150       160          170       180       190
KIAA04 EVMLENCGLLVSLGCPVPKAELICHLEHGQEPWTRK---EDLSQDTCPGDKGKPKTTEPT
       .:::::  :. ::::        :  :  . :  ..   . .:: . ::   .:: ..  
KIAA19 DVMLENWVLISSLGC-------WCGSEDEEAPSKKSISIQRVSQVSTPGAGVSPKKAHSC
          40        50               60        70        80        

               200       210       220       230             240   
KIAA04 T-CEPALSEGISLQGQVTQGNSVDSQLGQAEDQDGLSEMQEGHFRP------GIDPQEKS
         :   :.. . :  .  ::.   ..: . :     ... ..  ::      :  : ..:
KIAA19 EMCGAILGDILHLADH--QGTHHKQKLHRCEAWG--NKLYDSSNRPHQNQYLGEKPYRSS
       90       100         110       120         130       140    

             250        260                  270       280         
KIAA04 --PGKMSPECD-GLGTADGVCSRIG-----------QEQVSPGDRVRSHNSCESGKDPMI
          . .  .:   ..  ...  . :           :: .  :..  :.  :::   :. 
KIAA19 VEEALFVKRCKFHVSEESSIFIQSGKDFLPSSGLLLQEATHTGEKSNSKPECES---PF-
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KIAA04 QEEENNFKCSECGKVFNKKHLLAGHEKIHSGVKPYECTECGKTFIKSTHLLQHHMIHTGE
       :  .....:.:: :  . ::... .... :  . : : ::::.: :   . .:. .:::.
KIAA19 QWGDTHYSCGECMKHSSTKHVFVQQQRLPSREECY-CWECGKSFSKYDSVSNHQRVHTGK
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KIAA04 RPYECMECGKAFNRKSYLTQHQRIHSGEKPYKCNECGKAFTHRSNFVLHNRRHTGEKSFV
       ::::: ::::.:..:. :.::::.:.:..::.:.::::.:.:....: :.: ::::. . 
KIAA19 RPYECGECGKSFSHKGSLVQHQRVHTGKRPYECGECGKSFSHKGSLVQHQRVHTGERPYE
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KIAA04 CTECGQVFRHRPGFLRHYVVHSGENPYECLECGKVFKHRSYLMWHQQTHTGEKPYECSEC
       : :::. : .   ...:  ::.:: :::: :::: : ... :. ::. ::.:.:::: ::
KIAA19 CGECGKSFSQNGTLIKHQRVHTGERPYECEECGKCFTQKGNLIQHQRGHTSERPYECEEC
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KIAA04 GKVFLESAALIHHYVIHTGEKPFECLECGKAFNHRSYLKRHQRIHTGEKPFVCSECGKAF
       :: : ....: .:. .:: :.:.:: ::::.:.....:. ::: ::::.:. :.::::.:
KIAA19 GKCFSQKGTLTEHHRVHTRERPYECGECGKSFSRKGHLRNHQRGHTGERPYECGECGKSF
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KIAA04 THCSTFILHKRAHTGEKPFECKECGKAFSNRKDLIRHFSIHTGEKPYECVECGKAFTRMS
       .. ...: :.:.::::.:.::.:: : : ... ::.:  .::::.:::: ::::.:   :
KIAA19 SRKGNLIQHQRSHTGERPYECRECRKLFRGKSHLIEHQRVHTGERPYECNECGKSFQDSS
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KIAA04 GLTRHKRIHSGEKPYECVECGKSFCWSTNLIRHAIIHTGEKPYKCSECGKAFSRSSSLTQ
       :.  :.:.:.::::.:: ::::::  : .:.::  .::::.::.:.::::.: .:::: .
KIAA19 GFRVHQRVHTGEKPFECSECGKSFPQSCSLLRHRRVHTGERPYECGECGKSFHQSSSLLR
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KIAA04 HQRMHTGKNPISVTDVGRPFTSGQTSVTLRELLLGKDFLNVTTEANILPEETSSSASDQP
       ::. ::.. :    . :. :.:                                      
KIAA19 HQKTHTAERPYECRECGKFFSSLLEHRRVHTGERPYECRECGKTFTRRSAHFKHQRLHTR
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KIAA04 VGSVRPPGAPLSQLCGPGGDVMAAAVLTDRAQVSVTFDDVAVTFTKEEWGQLDLAQRTLY
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KIAA07 LNRNLRQIQRRQRQSIPGAGHFPQQKKMINAQELLTLEDVTVEFTWEEWQLLGPFQKDLY
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KIAA04 QEVMLENCGLLVSLGCPVPKAELICHLEHGQEPWTRKEDLSQDTCPGDKGKPKTTEPTTC
       ..::::  . :.:.:  : : . . .::.:.:::: ...  .  :: ..      .    
KIAA07 RDVMLEIYSNLLSMGYQVSKPDALSKLERGEEPWTMEDERHSRICPENNEVDDHLQDHLE
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KIAA04 EPALSEGISLQGQVTQGNSVDSQLGQA----EDQDGLSEMQEGHFRPGID--PQEKS-PG
       .  . ...    . .  ... ::  .     :..: . :.    .. ...   :.::   
KIAA07 NQRMLKSVEQYHEHNAFGNTASQTKSLCLFRENHDTF-ELYIKTLKSNLSLVNQNKSCEI
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KIAA04 KMSPECDGLGTA--DGVCSRI-GQEQVSPGDRVRSHNSCESGKDPMIQEEENNFKCSECG
       . : . .: : .   :   .. .  . : . .. : .: . .:    .: :.:  :::::
KIAA07 NNSTKFSGDGKSFLHGNYEELYSAAKFSVSTKANSTKS-QVSKHQRTHEIEKNHVCSECG
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KIAA04 KVFNKKHLLAGHEKIHSGVKPYECTECGKTFIKSTHLLQHHMIHTGERPYECMECGKAFN
       :.: ::  :. ::..:.: ::: :: :.:.: ....: .:. ::  :. . : ::::.:.
KIAA07 KAFVKKSQLTDHERVHTGEKPYGCTLCAKVFSRKSRLNEHQRIHKREKSFICSECGKVFT
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KIAA04 RKSYLTQHQRIHSGEKPYKCNECGKAFTHRSNFVLHNRRHTGEKSFVCTECGQVFRHRPG
        :: : .::: :.::::: ::::::.:  . :...:.: ::::::..:.:::. :  .  
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KIAA04 FLRHYVVHSGENPYECLECGKVFKHRSYLMWHQQTHTGEKPYECSECGKVFLESAALIHH
       .. :  .:.::.:: : :::: :  . :.. ::..::::::: :.:::: :  .. .:.:
KIAA07 LIIHQRTHTGEKPYICSECGKGFTTKHYVIIHQRNHTGEKPYICNECGKGFTMKSRMIEH
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KIAA04 YVIHTGEKPFECLECGKAFNHRSYLKRHQRIHTGEKPFVCSECGKAFTHCSTFILHKRAH
          ::::::. : ::::.: ..: :  ::: :: :: ..::::::.::  : .:.:.:.:
KIAA07 QRTHTGEKPYICSECGKGFPRKSNLIVHQRNHTVEKSYLCSECGKGFTVKSMLIIHQRTH
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KIAA04 TGEKPFECKECGKAFSNRKDLIRHFSIHTGEKPYECVECGKAFTRMSGLTRHKRIHSGEK
       :::::. :.::::.:  .. :: :   :::::::.: ::::.:   :::  :.: :.:::
KIAA07 TGEKPYTCSECGKGFPLKSRLIVHQRTHTGEKPYRCSECGKGFIVNSGLMLHQRTHTGEK
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KIAA04 PYECVECGKSFCWSTNLIRHAIIHTGEKPYKCSECGKAFSRSSSLTQHQRMHTGKNPISV
       :: : ::::.: ...::. :   ::::::. ::::::.:. .  :  ::..:: ..    
KIAA07 PYICNECGKGFAFKSNLVVHQRTHTGEKPFMCSECGKGFTMKRYLIVHQQIHTEEKSCIC
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KIAA04 TDVGRPFTSGQTSVTLRELLLGKDFLNVTTEANILPEETSSSASDQPYQRETPQVSSL  
       .. :: :.. .: ..:..                                          
KIAA07 SECGRGFAK-ETELALHKQVHTGEKPYGCNECGKGFTMKSRLIVHQRTHTGEKPFVCSEC
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KIAA04 ENCGLLVSLGCPVPKAELICHLEHGQEPWTRKEDLSQDTCPGDKGKPKTTEPTTCEPALS
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KIAA19 ETCSSLLKDILHLAEHDGTHPKRTAKLYLHQKEHLREKLTRSDEGRPSFVNDSV-HLAKR
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KIAA04 EGISLQGQVTQGNSVDSQLGQAEDQDGLSEMQEGHFRPGIDPQEKSPGKMSPECDGLGTA
       .   .::   .  . ::.: :   ..: .  .. :   :..  ..  :. .  :   :  
KIAA19 NLTCMQGG--KDFTGDSDLQQQALHSGWKPHRDTH---GVEAFQS--GQNNYSCTQCGK-
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KIAA04 DGVCSRIGQEQVSPGDRVRSHNSCESGK-----DPMIQEEENN-----FKCSECGKVFNK
       :   ..   :. .   . : ..  : ::     . .:....:.     .:::::::.:. 
KIAA19 DFCHQHTLFEHQKIHTEERPYECSECGKLFRYNSDLIKHQRNHTGERPYKCSECGKAFSL
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KIAA04 KHLLAGHEKIHSGVKPYECTECGKTFIKSTHLLQHHMIHTGERPYECMECGKAFNRKSYL
       :. .. :.:::.: .::::.::::.:....:::::. :::  ::: : ::::::  ...:
KIAA19 KYNVVQHQKIHTGERPYECSECGKAFLRKSHLLQHQRIHTRPRPYVCSECGKAFLTQAHL
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KIAA04 TQHQRIHSGEKPYKCNECGKAFTHRSNFVLHNRRHTGEKSFVCTECGQVFRHRPGFLRHY
       . ::.::.::.:: :::::: : . : .. :.. ::::. : : :::. :     .. : 
KIAA19 VGHQKIHTGERPYGCNECGKYFMYSSALIRHQKVHTGERPFYCCECGKFFMDSCTLIIHQ
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KIAA04 VVHSGENPYECLECGKVFKHRSYLMWHQQTHTGEKPYECSECGKVFLESAALIHHYVIHT
        ::.::.:::: :::: :..:: :. ::..:::::::::::::: :.....:: :  .::
KIAA19 RVHTGEKPYECNECGKFFRYRSTLIRHQKVHTGEKPYECSECGKFFMDTSTLIIHQRVHT
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KIAA04 GEKPFECLECGKAFNHRSYLKRHQRIHTGEKPFVCSECGKAFTHCSTFILHKRAHTGEKP
       ::::.:: .::: : .   :.::::.:.::.:. :::::: :.   :.  :.:.::::.:
KIAA19 GEKPYECNKCGKFFRYCFTLNRHQRVHSGERPYECSECGKFFVDSCTLKSHQRVHTGERP
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KIAA04 FECKECGKAFSNRKDLIRHFSIHTGEKPYECVECGKAFTRMSGLTRHKRIHSGEKPYECV
       :::. :::.:  :. :  :  :::::.:::: :::: : . :.  ::.: : ::. .::.
KIAA19 FECSICGKSFRCRSTLDTHQRIHTGERPYECSECGKFFRHNSNHIRHRRNHFGERSFECT
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KIAA04 ECGKSFCWSTNLIRHAIIHTGEKPYKCSECGKAFSRSSSLTQHQRMHTGKNPISVTDVGR
       :::. :  ...::::  .:: :. ::::.::: :  ::.: .:.:.:::..:   .. :.
KIAA19 ECGRVFSQNSHLIRHQKVHTRERTYKCSKCGKFFMDSSTLISHERVHTGEKPYECSECGK
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KIAA04 PFTSGQTSVTLRELLLGKDFLNVTTEANILPEETSSSASDQPYQRETPQVSSL
        :  ... .  :..  :.                                   
KIAA19 VFRYNSSLIKHRRIHTGERPYQCSECGRVFNQNSHLIQHQKVHTR        
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>>KIAA0065  ( 848 res)   ha00946                          (848 aa)
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KIAA00 GECNPTREWAVSSELSPSFQEQNKMNKVEQKSQESVSFKDVTVGFTQEEWQHLDPSQRAL
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KIAA04 YQEVMLENCGLLVSLGCPVPKAELICHLEHGQEPWTRKEDLSQDTCP---GDKGKPKTTE
       :..::::: . :::.:  : : :.: .:..:.::: ..:.. ... :   .:. : .. :
KIAA00 YRDVMLENYSNLVSVGYCVHKPEVIFRLQQGEEPWKQEEEFPSQSFPVWTADHLKERSQE
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KIAA04 PT---------------TCEPALSEGISLQGQVTQ-------------GNSVDS------
                        : : .   :: .. .:..             : : ..      
KIAA00 NQSKHLWEVVFINNEMLTKEQGDVIGIPFNVDVSSFPSRKMFCQCDSCGMSFNTVSELVI
          140       150       160       170       180       190    

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KIAA04 ----QLGQAEDQ----------------------------DGLSEMQEG-----------
            ::.  :.                            . ::. .:            
KIAA00 SKINYLGKKSDEFNACGKLLLNIKHDETHTQEKNEVLKNRNTLSHHEETLQHEKIQTLEH
          200       210       220       230       240       250    

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KIAA04 HFRPGIDPQ----------EKSPGKMSPECDGLGTADGVC--SRIGQEQVSPG-DR----
       .:. .:  .          .:  .    .::    .  .:  : .  .:.::. :     
KIAA00 NFEYSICQETLLEKAVFNTQKRENAEENNCDYNEFGRTLCDSSSLLFHQISPSRDNHYEF
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KIAA04 --------VRS-----------HNSC-ESGKD-------PMIQEE---ENNFKCSECGKV
               :.:           : .: :::..         .:.    :..:.:.::::.
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KIAA04 FNKKHLLAGHEKIHSGVKPYECTECGKTFIKSTHLLQHHMIHTGERPYECMECGKAFNRK
       : .:  :. :...:.: ::..:.:: :.:  ...: .:.  ::::.:.:: ::::::..:
KIAA00 FWEKSHLTRHQRVHTGQKPFQCNECEKAFWDKSNLTKHQRSHTGEKPFECNECGKAFSHK
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KIAA04 SYLTQHQRIHSGEKPYKCNECGKAFTHRSNFVLHNRRHTGEKSFVCTECGQVFRHRPGFL
       : :: ::: :.:::::.:: :::.: ..:... :.: ::: : . : :::. ::    . 
KIAA00 SALTLHQRTHTGEKPYQCNACGKTFCQKSDLTKHQRTHTGLKPYECYECGKSFRVTSHLK
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KIAA04 RHYVVHSGENPYECLECGKVFKHRSYLMWHQQTHTGEKPYECSECGKVFLESAALIHHYV
        :  .:.::.:.::::::: :...: :  ::. : :.: :::. :::.: ... : .: .
KIAA00 VHQRTHTGEKPFECLECGKSFSEKSNLTQHQRIHIGDKSYECNACGKTFYHKSLLTRHQI
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KIAA04 IHTGEKPFECLECGKAFNHRSYLKRHQRIHTGEKPFVCSECGKAFTHCSTFILHKRAHTG
       :::: ::.:: ::::.:  .: :  ::: :::.:::.: :::: :.: ::.  : :.:::
KIAA00 IHTGWKPYECYECGKTFCLKSDLTVHQRTHTGQKPFACPECGKFFSHKSTLSQHYRTHTG
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KIAA04 EKPFECKECGKAFSNRKDLIRHFSIHTGEKPYECVECGKAFTRMSGLTRHKRIHSGEKPY
       :::.::.:::: : :.. : .:   ::::::::: :::::: . : ::.:.::: :::::
KIAA00 EKPYECHECGKIFYNKSYLTKHNRTHTGEKPYECNECGKAFYQKSQLTQHQRIHIGEKPY
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KIAA04 ECVECGKSFCWSTNLIRHAIIHTGEKPYKCSECGKAFSRSSSLTQHQRMHTGKNPISVTD
       .: ::::.:: .. :: :   :: ::::::.::::.:  .:.:  :.: :::..:   ..
KIAA00 KCNECGKAFCHKSALIVHQRTHTQEKPYKCNECGKSFCVKSGLIFHERKHTGEKPYECNE
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KIAA04 VGRPFTSGQTSVTLRELLLGKDFLNVTTEANILPEETSSSASDQPYQRETPQVSSL    
        :. :   ..:.:.                                              
KIAA00 CGK-FFRHKSSLTVHHRAHTGEKSCQCNECGKIFYRKSELAQHQRSHTGEKPYECNTCRK
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>>KIAA0326  ( 927 res)   hg00579                          (927 aa)
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Smith-Waterman score: 1584;  44.970% identity (68.836% similar) in 507 aa overlap (163-669:89-581)

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KIAA04 QEVMLENCGLLVSLGCPVPKAELICHLEHGQEPWTRKEDLSQDTCPGDKGKPKTTEPTTC
                                     .:   :.:. ...   :: ..   .. .: 
KIAA03 MEPETALWGPDLQGPEQSPNDAHRGAESENEEESPRQESSGEEIIMGDPAQSPESKDST-
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KIAA04 EPALSEGISLQGQVTQGNSVDSQLGQAEDQDGLSEMQEGHFRPGIDPQEKSPGKMSPECD
       : .: :  : . .: :.    . ::...  :   ..      : . :   .:.  .  :.
KIAA03 EMSL-ERSSQDPSVPQNPP--TPLGHSNPLD--HQIPLDPPAPEVVP---TPSDWTKACE
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KIAA04 GLGTADGVCSRIGQEQVSPGDRVRSHNSCESGKDPMIQEEENNFKCSECGKVFNKKHLLA
       . .   :. .  ..  : :...  :     .:. :   :.   . :.:::: :..   : 
KIAA03 A-SWQWGALTTWNSPPVVPANEP-SLRELVQGR-PAGAEKP--YICNECGKSFSQWSKLL
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KIAA04 GHEKIHSGVKPYECTECGKTFIKSTHLLQHHMIHTGERPYECMECGKAFNRKSYLTQHQR
        :..::.: .:  :.::::.: .:.::.::.  ::::.::.: .::: :. .: :.::::
KIAA03 RHQRIHTGERPNTCSECGKSFTQSSHLVQHQRTHTGEKPYKCPDCGKCFSWSSNLVQHQR
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KIAA04 IHSGEKPYKCNECGKAFTHRSNFVLHNRRHTGEKSFVCTECGQVFRHRPGFLRHYVVHSG
        :.:::::::.:: ::::. .:.. :.: ::::: . : :: ..: .   ...: ..:.:
KIAA03 THTGEKPYKCTECEKAFTQSTNLIKHQRSHTGEKPYKCGECRRAFYRSSDLIQHQATHTG
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KIAA04 ENPYECLECGKVFKHRSYLMWHQQTHTGEKPYECSECGKVFLESAALIHHYVIHTGEKPF
       :.::.: :::: : .   :. ::. :.:::::.:.:::: :..:. : .:   ::::::.
KIAA03 EKPYKCPECGKRFGQNHNLLKHQKIHAGEKPYRCTECGKSFIQSSELTQHQRTHTGEKPY
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KIAA04 ECLECGKAFNHRSYLKRHQRIHTGEKPFVCSECGKAFTHCSTFILHKRAHTGEKPFECKE
       :::::::.:.: : : .::: :  : :: :  :::.::  .:.. :.:.::::.:..: :
KIAA03 ECLECGKSFGHSSTLIKHQRTHLREDPFKCPVCGKTFTLSATLLRHQRTHTGERPYKCPE
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       :::.::  ..:: :  :: ::.:: :..:::.:   : : ::.:::.:::::.: .::::
KIAA03 CGKSFSVSSNLINHQRIHRGERPYICADCGKSFIMSSTLIRHQRIHTGEKPYKCSDCGKS
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KIAA04 FCWSTNLIRHAIIHTGEKPYKCSECGKAFSRSSSLTQHQRMHTGKNPISVTDVGRPFTSG
       :  :..::.:   ::::::::: ::::.::.::.:  : : :  .: .  .: :. :   
KIAA03 FIRSSHLIQHRRTHTGEKPYKCPECGKSFSQSSNLITHVRTHMDENLFVCSDCGKAFLEA
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KIAA04 QTSVTLRELLLGKDFLNVTTEANILPEETSSSASDQPYQRETPQVSSL            
                                                                   
KIAA03 HELEQHRVIHERGKTPARRAQGDSLLGLGDPSLLTPPPGAKPHKCLVCGKGFNDEGIFMQ
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>>KIAA1508  ( 573 res)   hk06576                          (573 aa)
 initn: 1559 init1: 1559 opt: 1569  Z-score: 1163.3  bits: 225.5 E(): 1.1e-59
Smith-Waterman score: 1595;  43.738% identity (67.103% similar) in 535 aa overlap (170-679:47-566)

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KIAA04 CGLLVSLGCPVPKAELICHLEHGQEPWTRKEDLSQDTCP-GDKGKPKTTEPTTCEPALSE
                                     :.:::   : .: .  :.     : :.: .
KIAA15 NLCFLSISLLSGCWCGAVDEGAPSAESVSVEELSQGRTPKADTSTDKSHPCEICTPVLRD
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KIAA04 ---GISLQ----GQ--VTQGNSVDSQLGQAEDQDGLSEMQEGHFRPGIDPQEKS------
           : ::    ::     : : :  ...   :  :.....:.    .: .. :      
KIAA15 ILQMIELQASPCGQKLYLGGASRDFWMSSNLHQ--LQKLDNGEKLFKVDGDQASFMMNCR
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KIAA04 ---PGKMSPECDG-LGTADGVCSRIGQEQVSPG-----DRVRSHNSCESGKDPMIQEEEN
           ::  :   : .:   .. : . :.::.:      .:.: :    .:. :.      
KIAA15 FHVSGK--PFTFGEVGRDFSATSGLLQHQVTPTIERPHSRIR-HLRVPTGRKPL------
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KIAA04 NFKCSECGKVFNKKHLLAGHEKIHSGVKPYECTECGKTFIKSTHLLQHHMIHTGERPYEC
         : .:  : : .: ..  :..  :: .::.:.::::.: .:. .:.:.  :   : .::
KIAA15 --KYTESRKSFREKSVFIQHQRADSGERPYKCSECGKSFSQSSGFLRHRKAHGRTRTHEC
           190       200       210       220       230       240   

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KIAA04 MECGKAFNRKSYLTQHQRIHSGEKPYKCNECGKAFTHRSNFVLHNRRHTGEKSFVCTECG
        ::::.:.::..::::::.:.::.:: :.::::.: . : .. :.: ::::. . :.:::
KIAA15 SECGKSFSRKTHLTQHQRVHTGERPYDCSECGKSFRQVSVLIQHQRVHTGERPYECSECG
           250       260       270       280       290       300   

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KIAA04 QVFRHRPGFLRHYVVHSGENPYECLECGKVFKHRSYLMWHQQTHTGEKPYECSECGKVFL
       . : :  .. ::  .:..  :::: :::: :.: . :. : ..::: .:::::::::.: 
KIAA15 KSFSHSTNLYRHRSAHTSTRPYECSECGKSFSHSTNLFRHWRVHTGVRPYECSECGKAFS
           310       320       330       340       350       360   

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KIAA04 ESAALIHHYVIHTGEKPFECLECGKAFNHRSYLKRHQRIHTGEKPFVCSECGKAFTHCST
        .  ::::  .::::.:. : ::::.:...: : .:::.::::.:. ::::::.:.. : 
KIAA15 CNIYLIHHQRFHTGERPYVCSECGKSFGQKSVLIQHQRVHTGERPYECSECGKVFSQSSG
           370       380       390       400       410       420   

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       .. :.::::  ::.::.:: :.:: . ::::: ..::::.::::  :::.: : . : ::
KIAA15 LFRHRRAHTKTKPYECSECEKSFSCKTDLIRHQTVHTGERPYECSVCGKSFIRKTHLIRH
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KIAA04 KRIHSGEKPYECVECGKSFCWSTNLIRHAIIHTGEKPYKCSECGKAFSRSSSLTQHQRMH
       . .:..:.:::: :::::.  :. :..:  .::::.::.: ::::.:.:.. : ::. .:
KIAA15 QTVHTNERPYECDECGKSYSQSSALLQHRRVHTGERPYECRECGKSFTRKNHLIQHKTVH
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KIAA04 TGKNPISVTDVGRPFTSGQTSVTLRELLLGKDFLNVTTEANILPEETSSSASDQPYQRET
       ::. :   .. :. :.  :.:  ::                                   
KIAA15 TGERPYECSECGKSFS--QSSGLLRHRRVHVQ                            
           550         560       570                               

>>KIAA2007  ( 580 res)   fj01689                          (580 aa)
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KIAA04 VRPPGAPLSQLCGPGGDVMAAAVLTDRAQVSVTFDDVAVTFTKEEWGQLDLAQRTLYQEV
                                     ::::::.:: :: :::  :: .::.::..:
KIAA20                              DSVTFDDLAVDFTPEEWTLLDPTQRNLYRDV
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KIAA04 MLENCGLLVSLGCPVPKAELICHLEHGQEPWTRKEDLSQDTCPGDKGKPKTTEPTTCEPA
       ::::   :...:  . :  ::  ::. .   ... :.. .     : . :: : .  . .
KIAA20 MLENYKNLATVGYQLFKPSLISWLEQEESRTVQRGDFQASEW---KVQLKTKELALQQDV
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KIAA04 LSE----GISLQGQVTQGNSVDSQLGQAEDQDGLSEMQEGHFRPGIDPQEKSPGKMSPEC
       :.:    ::.. :. . :.  : .  :  : ..     . : :      ..: . .  ::
KIAA20 LGEPTSSGIQMIGSHNGGEVSDVK--QCGDVSSEHSCLKTHVRT-----QNSENTF--EC
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KIAA04 DGLGTADGVCSRIGQEQVSPGDRVRSHNSCESG----KDPMIQEE---ENNFKCSECGKV
              ::     ....: :..    ..: ..     : . :.    :. : ::. :: 
KIAA20 ----YLYGVDFLTLHKKTSTGEQRSVFSQCGKAFSLNPDVVCQRTCTGEKAFDCSDSGKS
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KIAA04 F-NKKHLLAGHEKIHSGVKPYECTECGKTFIKSTHLLQHHMIHTGERPYECMECGKAFNR
       : :..::  :: . :.: . .:  :::. ::.:: :  . . : .:.::.: ::::.:  
KIAA20 FINHSHL-QGHLRTHNGESLHEWKECGRGFIHSTDLAVRIQTHRSEKPYKCKECGKGFRY
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KIAA04 KSYLTQHQRIHSGEKPYKCNECGKAFTHRSNFVLHNRRHTGEKSFVCTECGQVFRHRPGF
       ..::. :.  :.:..::.:.:::::::.  ... : . ::::: . : .::..:     .
KIAA20 SAYLNIHMGTHTGDNPYECKECGKAFTRSCQLTQHRKTHTGEKPYKCKDCGRAFTVSSCL
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KIAA04 LRHYVVHSGENPYECLECGKVFKHRSYLMWHQQTHTGEKPYECSECGKVFLESAALIHHY
        .:. .: ::.:::: ::: .: . : :  : .:::.. :.::. ::: : .:. :  :.
KIAA20 SQHMKIHVGEKPYECKECGIAFTRSSQLTEHLKTHTAKDPFECKICGKSFRNSSCLSDHF
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KIAA04 VIHTGEKPFECLECGKAFNHRSYLKRHQRIHTGEKPFVCSECGKAFTHCSTFILHKRAHT
        :::: ::..: .:::::.. : : .: : :.::.:. :.::::::.. : .  : :.::
KIAA20 RIHTGIKPYKCKDCGKAFTQNSDLTKHARTHSGERPYECKECGKAFARSSRLSEHTRTHT
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KIAA04 GEKPFECKECGKAFSNRKDLIRHFSIHTGEKPYECVECGKAFTRMSGLTRHKRIHSGEKP
       ::::::: .:::::.  ..:  :. :::::::.::.:::::::. :.:. : : ::..::
KIAA20 GEKPFECVKCGKAFAISSNLSGHLRIHTGEKPFECLECGKAFTHSSSLNNHMRTHSAKKP
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KIAA04 YECVECGKSFCWSTNLIRHAIIHTGEKPYKCSECGKAFSRSSSLTQHQRMHTGKNPISVT
       . :.::::.: . : .  :  ::::::::::..:::.:: :.:.  :.: :::..:    
KIAA20 FTCMECGKAFKFPTCVNLHMRIHTGEKPYKCKQCGKSFSYSNSFQLHERTHTGEKPYECK
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KIAA04 DVGRPFTSGQTSVTLRELLLGKDFLNVTTEANILPEETSSSASDQPYQRETPQVSSL
       . :. :.:...                                              
KIAA20 ECGKAFSSSSSFRNHERRHADERLSA                               
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>>KIAA1349  ( 752 res)   fj00940                          (752 aa)
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KIAA04 NSVDSQLGQAEDQDGLSEMQEGHFRPGIDPQEKSPGKMSPECDGLGTADGVCSRIGQEQV
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KIAA13 VHQRIHTKEKPYQCNVCGKSFSQCARLNQHQRIQTGEKPYKCSECGKAFSDKSKLARHQE
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KIAA04 SP-GDRVRSHNSCESG---KDPM-----IQEEENNFKCSECGKVFNKKHLLAGHEKIHSG
       .  :..  . ..: ..   :. .      . ::. ..:.:::: :..  ..  :..::.:
KIAA13 THNGEKPYKCDDCGKAFRNKSYLSVHQKTHTEEKPYQCNECGKSFKNTTIFNVHQRIHTG
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KIAA04 VKPYECTECGKTFIKSTHLLQHHMIHTGERPYECMECGKAFNRKSYLTQHQRIHSGEKPY
        ::..:.::::.. ... :. :   ::::.:::: :::::::: . .:.:::::.:::::
KIAA13 EKPFRCNECGKAYRSNSSLIVHIRTHTGEKPYECNECGKAFNRIANFTEHQRIHTGEKPY
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KIAA04 KCNECGKAFTHRSNFVLHNRRHTGEKSFVCTECGQVFRHRPGFLRHYVVHSGENPYECLE
       ::::::::: . : ...:.: ::::: . :::::..: .  ... :  .:. :.:: : :
KIAA13 KCNECGKAFINYSCLTVHHRMHTGEKPYKCTECGKAFMRSSSLIIHQRIHTEEKPYLCNE
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KIAA04 CGKVFKHRSYLMWHQQTHTGEKPYECSECGKVFLESAALIHHYVIHTGEKPFECLECGKA
       ::. :. .:.:  ::. :::::::.:..: ..: . . : .:  :::: ::..: .:::.
KIAA13 CGESFRIKSHLTVHQRIHTGEKPYKCTDCERAFTKMVNLKEHQKIHTGVKPYKCYDCGKS
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KIAA04 FNHRSYLKRHQRIHTGEKPFVCSECGKAFTHCSTFILHKRAHTGEKPFECKECGKAFSNR
       :  .:::  ::: ::::::. :.:: ::::. : . .:.: ::::::..:.::::.:.. 
KIAA13 FRTKSYLIVHQRTHTGEKPYKCNECEKAFTNTSQLTVHQRRHTGEKPYKCNECGKVFTSN
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KIAA04 KDLIRHFSIHTGEKPYECVECGKAFTRMSGLTRHKRIHSGEKPYECVECGKSFCWSTNLI
       . .  :   ::::::..: .:::::..:  .:.:..::::::::.:  :::.:  .. : 
KIAA13 SGFNTHQRTHTGEKPFKCNDCGKAFSQMVHVTEHQKIHSGEKPYKCDVCGKAFRRGSYLT
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KIAA04 RHAIIHTGEKPYKCSECGKAFSRSSSLTQHQRMHTGKNPISVTDVGRPF-TSGQTSVTLR
        :   ::::::: :.::::.    :.:: :::.:::. : .  . :. : :... .: ::
KIAA13 VHWRTHTGEKPYTCKECGKGCITLSQLTLHQRIHTGERPYKCEECGKAFRTNSDFTVHLR
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KIAA04 ELLLGKDFLNVTTEANILPEETSSSASDQPYQRETPQVSSL
        .  :.   . .  .. .   .: .. .. .::::  .   
KIAA13 -MHTGEKPYKCNECGKAFRSSSSLTVHQRIHQRETQLI   
          720       730       740       750     

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Smith-Waterman score: 1691;  45.668% identity (68.412% similar) in 554 aa overlap (107-657:15-545)

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KIAA14                 AKTLGPPGSLETGVLTFRDVAIEFSLEEWQCLDTAQQNLYRNVM
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KIAA04 LENCGLLVSLGCPVPKAELICHLEHGQEPWTRKEDLSQDTCPGDKGKPKTTEPTTCEPAL
       :::   :: .:  . : .::  ::.:.:::. :           . .  .  :..:    
KIAA14 LENYRNLVFVGIAASKPDLITCLEQGKEPWNVK-----------RHEMVAEPPVVCSYFA
           50        60        70                   80        90   

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KIAA04 SEGISLQGQVTQGNSVDSQLGQAEDQDGLSEMQEGHFRPGIDPQEKSPGKMSPEC-DGLG
        .    ::.    :  .. . .   . :  ..:  ..  ..:       :.  :: .::.
KIAA14 RDLWPKQGK---KNYFQKVILRRYKKCGCENLQLRKYCKSMD-----ECKVHKECYNGLN
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KIAA04 TADGVCSRIGQEQVSPGDRVRS--HNSCESGKDPMIQEEENNFKCSECGKVFNKKHLLAG
            :    :...   :.  .  :.  .:..  . .  ...:::.:: : :     :: 
KIAA14 Q----CLTTTQNKIFQCDKYVKVFHKFSNSNRHTIRHTGKKSFKCKECEKSFCMLSHLAQ
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KIAA04 HEKIHSGVKPYECTECGKTFIKSTHLLQHHMIHTGERPYECMECGKAFNRKSYLTQHQRI
       :..:::: :::.: ::::.. ....:  :. ::::..::.: :::::::: :.:: :. :
KIAA14 HKRIHSGEKPYKCKECGKAYNETSNLSTHKRIHTGKKPYKCEECGKAFNRLSHLTTHKII
             210       220       230       240       250       260 

           380       390       400       410       420       430   
KIAA04 HSGEKPYKCNECGKAFTHRSNFVLHNRRHTGEKSFVCTECGQVFRHRPGFLRHYVVHSGE
       :.:.:::::.::::::.. .:.. :.: ::::: . : :::..: .   .  : ..:.::
KIAA14 HTGKKPYKCEECGKAFNQSANLTTHKRIHTGEKPYKCEECGRAFSQSSTLTAHKIIHAGE
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KIAA04 NPYECLECGKVFKHRSYLMWHQQTHTGEKPYECSECGKVFLESAALIHHYVIHTGEKPFE
       .::.: ::::.:.. : :  :.  ::::: :.: ::::.: . . :  :  ::.::::..
KIAA14 KPYKCEECGKAFSQSSTLTTHKIIHTGEKFYKCEECGKAFSQLSHLTTHKRIHSGEKPYK
             330       340       350       360       370       380 

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KIAA04 CLECGKAFNHRSYLKRHQRIHTGEKPFVCSECGKAFTHCSTFILHKRAHTGEKPFECKEC
       : ::::::.. : :  :.:::.::: . :  :.:::.. : .  ::: ::::::..:.::
KIAA14 CEECGKAFKQSSTLTTHKRIHAGEKFYKCEVCSKAFSRFSHLTTHKRIHTGEKPYKCEEC
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KIAA04 GKAFSNRKDLIRHFSIHTGEKPYECVECGKAFTRMSGLTRHKRIHSGEKPYECVECGKSF
       ::::.  ..:  :  ::::::::.: ::::::.. : :..:: ::.:::::.  ::::.:
KIAA14 GKAFNLSSQLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLSKHKVIHTGEKPYKYEECGKAF
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