# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hg01339.fasta.huge -Q ../query/KIAA0407.ptfa ./tmplib.23147 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0407, 2143 aa vs ./tmplib.23147 library 1985362 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.6308+/-0.0113; mu= -11.1444+/- 0.760 mean_var=651.5857+/-159.606, 0's: 0 Z-trim: 12 B-trim: 8 in 1/39 Lambda= 0.050244 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 43, opt: 31, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1206 ( 1912 res) fg04331 (1912) 3067 239.6 6.4e-63 KIAA0315 ( 1841 res) hg00246 (1841) 1671 138.3 1.8e-32 KIAA0620 ( 1985 res) hg04174 (1985) 1145 100.3 5.7e-21 KIAA0463 ( 1963 res) hg00942 (1963) 902 82.6 1.1e-15 KIAA1550 ( 1462 res) ff03434 (1462) 892 81.7 1.6e-15 >>KIAA1206 ( 1912 res) fg04331 (1912 aa) initn: 4747 init1: 1242 opt: 3067 Z-score: 1221.4 bits: 239.6 E(): 6.4e-63 Smith-Waterman score: 5833; 46.912% identity (66.037% similar) in 2170 aa overlap (4-2143:20-1912) 10 20 30 40 KIAA04 SSRPCQVTMPALGPALLQALWAGWVLTLQPLPPTA---FTPNGT : .. : .: :: : :. ::: :. :. .: KIAA12 TERMCHAAQETPLLHHFMAPVMARWPPFGLCLLLLL-----LSPPPLPLTGAHRFSAPNT 10 20 30 40 50 50 60 70 80 90 100 KIAA04 YLQHLARDPTSGTLYLGATNFLFQLSPGLQLEATVSTGPVLDSRDCLPPVMPDECPQAQP :.::: : ::::.::.: :::::: :::::.. ::::.:: ::.: : :::::: KIAA12 TLNHLALAPGRGTLYVGAVNRLFQLSPELQLEAVAVTGPVIDSPDCVPFRDPAECPQAQL 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 KIAA04 TNNPNQLLLVSPGA--LVVCGSVHQGVCEQRRLGQLEQLLLRPERPGDTQYVAANDPAVS :.: ::::::: : ::.::.:.::::: ::::.. ..: . : ::: :.:::: :.:. KIAA12 TDNANQLLLVSSRAQELVACGQVRQGVCETRRLGDVAEVLYQAEDPGDGQFVAANTPGVA 120 130 140 150 160 170 160 170 180 190 200 210 KIAA04 TVGLVAQGLAGEPLLFVGRGYTSRGVGGGIPPITTRALWPPDPQAAFSYEETAKLAVGRL :::::. : :. ::.:.:: ... ...:.::.. : : .: :: : ..:.:: . KIAA12 TVGLVVP-LPGRDLLLVARGLAGK-LSAGVPPLAIRQLAGSQP---FSSEGLGRLVVGDF 180 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 270 KIAA04 SEYSHHFVSAFARGASAYFLFLRRDLQAQSRAFRAYVSRVCLRDQHYYSYVELPLACEGG :.:.. .:.::: . ::::.: :: .::.. .:.::.:::: : . :::::.::::.: KIAA12 SDYNNSYVGAFADARSAYFVFRRRGARAQAE-YRSYVARVCLGDTNLYSYVEVPLACQG- 240 250 260 270 280 280 290 300 310 320 330 KIAA04 RYGLIQAAAVATSREVAHGEVLFAAFSSAAPPTVGRPPSAAAGASGA-SALCAFPLDEVD :::::: .: . .:...: ::: :. .::::::. :. KIAA12 -QGLIQAAFLAPG-------TLLGVF--------------AAGPRGTQAALCAFPMVELG 290 300 310 320 340 350 360 370 380 390 KIAA04 RLANRTRDACYTREGRAEDGTEVAYIEYDVNSDCAQLPVDTLDAYPCGSDHTPSPMASRV ...: ::: ::. .:.: : .:: :.: :. ::.:. ..::::..:::::.:.: KIAA12 ASMEQARRLCYTAGGRGPSGAEEATVEYGVTSRCVTLPLDSPESYPCGDEHTPSPIAGRQ 330 340 350 360 370 380 400 410 420 430 440 450 KIAA04 PLEATPILEWPGIQLTAVAVTMEDGHTIAFLGDSQGQLHRVYLGPGSDGHPYSTQSI-QQ :::. :.:. : ..:::. . ::: ::::::.::::..:.: ::.:. : .:.. KIAA12 PLEVQPLLKL-GQPVSAVAALQADGHMIAFLGDTQGQLYKVFLH-GSQGQVYHSQQVGPP 390 400 410 420 430 440 460 470 480 490 500 510 KIAA04 GSAVSRDLTFDGTFEHLYVMTQSTLLKVPVASCAQHLDCASCLAHRDPYCGWCVLLGRCS :::.: :: .:.. ::::.: . ..:::.: : :::::: .:: :::::: :::. KIAA12 GSAISPDLLLDSSGSHLYVLTAHQVDRIPVAACPQFPDCASCLQAQDPLCGWCVLQGRCT 450 460 470 480 490 500 520 530 540 550 560 570 KIAA04 RRSECSRGQGPEQWLWSFQPELGCLQVAAMSPANISREETREVFLSVPDLPPLWPGESYS :...:.:. .:::::.. . ::.. .. :.. :.: .: :::: :: : : . KIAA12 RKGQCGRAGQLNQWLWSYEEDSHCLHIQSLLPGHHPRQEQGQVTLSVPRLPILDADEYFH 510 520 530 540 550 560 580 590 600 610 620 630 KIAA04 CHFGEHQSPALLTGSGVMCPSPDPSEAPVLPRGADYVSVSVELRFGAVVIAKTSLSFYDC : ::...: : . : : : .: ...:. : :.:.:.: . : : :..: :..::::: KIAA12 CAFGDYDSLAHVEGPHVACVTPPQDQVPLNPPGTDHVTVPLALMFEDVTVAATNFSFYDC 570 580 590 600 610 620 640 650 660 670 680 690 KIAA04 VAVTELRPSAQCQACVSSRWGCNWCVWQHLCTHKASCDAGPMVASHQSPLVSPDPPARGG :: :. .: :.:::.: : :.:: . :.. : KIAA12 SAVQALEAAAPCRACVGSIWRCHWCPQSSHCVYGEHC----------------------- 630 640 650 660 700 710 720 730 740 750 KIAA04 PSPSPPTAPKALATPAPDTLPVEPGAPSTATASDISPGASPSLLSPWGPWAGSGSISSPG KIAA12 ------------------------------------------------------------ 760 770 780 790 800 810 KIAA04 STGSPLHEEPSPPSPQNGPGTAVPAPTDFRPSATPEDLLASPLSPSEVAAVPPADPGPEA :: KIAA12 ----------------------------------PE------------------------ 820 830 840 850 860 870 KIAA04 LHPTVPLDLPPATVPATTFPGAMGSVKPALDWLTREGGELPEADEWTGGDAPAFSTSTLL :. .:.. . KIAA12 ------------------------------------------------GERTIYSAQEV- 670 880 890 900 910 920 930 KIAA04 SGDGDSAELEGPPAPLILPSSLDYQYDTPGLWELEEATLGASSCPCVESVQGSTLMPVHV : : :: .:: ::.. : :.:: KIAA12 ----------------------DIQVRGPG------------ACPQVEGLAGPHLVPVGW 680 690 700 940 950 960 970 980 990 KIAA04 EREIRLLGRNLHLFQDGPGDNECVMELEGLEVVVEARVECEPPPDTQCHVTCQQHQLSYE : .. : :::. :. :.. .: .:: : . : .: : :. . :: ::. KIAA12 ESHLALRVRNLQHFRGLPASFHCWLELPGELRGLPATLE-ETAGDSGL-IHCQAHQFYPS 710 720 730 740 750 1000 1010 1020 1030 1040 1050 KIAA04 ALQPELRVGLFLRRAGRLRVDSAEGLHVVLYDCSVGHGDCSRCQTAMPQYGCVWCEGERP : :: : ... .. :.:....:.:.::::..:: :::.::.: . ::.:: .: KIAA12 MSQRELPVPIYVTQGEAQRLDNTHALYVILYDCAMGHPDCSHCQAANRSLGCLWCADGQP 760 770 780 790 800 810 1060 1070 1080 1090 1100 1110 KIAA04 RCVTREACGEAEAVATQCPAPLIHSVEPLTGPVDGGTRVTIRGSNLGQHVQDVLGMVTVA : : . :: :::: : .::::::: .:: .:: :::::. :: :.:: KIAA12 ACRYGPLCPPG-AVELLCPAPSIDAVEPLTGPPEGGLALTILGSNLGRAFADVQYAVSVA 820 830 840 850 860 870 1120 1130 1140 1150 1160 1170 KIAA04 GVPCAVDAQEYEVSSSLVCITGASGEEVAGATAVEVPGRGRGVSEHDFAYQDPKVHSIFP . :: . . :..:. .::.:. . . ..: . : . .. :.: . :.:::: . :. : KIAA12 SRPCNPEPSLYRTSARIVCVTSPAPNGTTGPVRVAIKSQPPGISSQHFTYQDPVLLSLSP 880 890 900 910 920 930 1180 1190 1200 1210 1220 1230 KIAA04 ARGPRAGGTRLTLNGSKLLTGRLEDIRVVVGDQPCHLLPEQQSEQLRCETSPRPTPATLP ::.::::.::. :..: :: . . :: ::: .: : . :.: :. .:. KIAA12 RWGPQAGGTQLTIRGQHLQTGG--NTSAFVGGQPCPILEPVCPEAIVCRTRPQAAPGEAA 940 950 960 970 980 990 1240 1250 1260 1270 1280 1290 KIAA04 VAVWFGATERRLQRGQFKYTLDPNITSAGPTKSFLSGGREICVRGQNLDVVQTPRIRV-- : : :: ..: : . :.:: .:....: :. :: .::: : ::: .::::: : . : KIAA12 VLVVFGHAQRTLLASPFRYTANPQLVAAEPSASFRGGGRLIRVRGTGLDVVQRPLLSVWL 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1300 1310 1320 1330 1340 KIAA04 ----TVVSRMLQPSQGLGRRRRVVPET---AC-SLGPSCSSQQFEEPCHVNSSQLITCRT : . ::.. :: .: . :: .:: . : : ::::.:. ::. KIAA12 EADAEVQASRAQPQDPQPRRSCGAPAADPQACIQLGGGL--LQCSTVCSVNSSSLLLCRS 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1350 1360 1370 1380 1390 1400 KIAA04 PALPGLPEDPWVRVEFILDNLVFDFATLNPTP-FSYEADPTLQPLNPEDPTMPFRHKPGS ::.: . : :: : :::. :::. . : :. .: : ::. : :. :.: ::: KIAA12 PAVPDRAH-PQ-RVFFTLDNVQVDFASASGGQGFLYQPNPRLAPLSREGPARPYRLKPGH 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1410 1420 1430 1440 1450 1460 KIAA04 VFSVEGENLDLAMSKEEVVAMIGDGPCVVKTLTRHHLYCEPPVEQPLPRHHALREAPDSL :..::::.:.:..::::: . :: : :.:::::: :::::::.. : : . . .: KIAA12 VLDVEGEGLNLGISKEEVRVHIGRGECLVKTLTRTHLYCEPPAHAPQPANGS------GL 1180 1190 1200 1210 1220 1470 1480 1490 1500 1510 1520 KIAA04 PEFTVQMGNLRFSLGHVQYDGESP-GAFPVAAQVGLGVGTSLLALGVIIIVLMYRRKSKQ :.:.:::::....:: :::..: : .:::: ::.:.:.:...: .:....::::.:::: KIAA12 PQFVVQMGNVQLALGPVQYEAEPPLSAFPVEAQAGVGMGAAVLIAAVLLLTLMYRHKSKQ 1230 1240 1250 1260 1270 1280 1530 1540 1550 1560 1570 1580 KIAA04 ALRDYKKVQIQLENLESSVRDRCKKEFTDLMTEMTDLTSDLLGSGIPFLDYKVYAERIFF :::::.:: .:::.::..: :.:.:::::::::::::.::: :::::::::..:::: :: KIAA12 ALRDYQKVLVQLESLETGVGDQCRKEFTDLMTEMTDLSSDLEGSGIPFLDYRTYAERAFF 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1590 1600 1610 1620 1630 1640 KIAA04 PGHRESPLH-RDLGVPESRR-PTVEQGLGQLSNLLNSKLFLTKFIHTLESQRTFSARDRA ::: ::. . : :. . ::.::: :::::::::::: .::::: : .:: ::: KIAA12 PGHGGCPLQPKPEGPGEDGHCATVRQGLTQLSNLLNSKLFLLTLIHTLEEQPSFSQRDRC 1350 1360 1370 1380 1390 1400 1650 1660 1670 1680 1690 1700 KIAA04 YVASLLTVALHGKLEYFTDILRTLLSDLVAQYVAKNPKLMLRRTETVVEKLLTNWMSICL .:::::..::::::::.:::.::::.::.:.:: .:::::::::::.::::::::.:::: KIAA12 HVASLLSLALHGKLEYLTDIMRTLLGDLAAHYVHRNPKLMLRRTETMVEKLLTNWLSICL 1410 1420 1430 1440 1450 1460 1710 1720 1730 1740 1750 1760 KIAA04 YTFVRDSVGEPLYMLFRGIKHQVDKGPVDSVTGKAKYTLNDNRLLREDVEYRPLTLNALL :.:.:. .:::::::::.:..::::::::.:::::: ::::.::::::::..:::: .: KIAA12 YAFLREVAGEPLYMLFRAIQYQVDKGPVDAVTGKAKRTLNDSRLLREDVEFQPLTLMVL- 1470 1480 1490 1500 1510 1520 1770 1780 1790 1800 1810 KIAA04 AVGPGAGEAQG------VPVKVLDCDTISQAKEKMLDQLYKGVPLTQRPDPRTLDVEWRS :::::: : : ::..::: :::.:.:::.:::.:::.:..:::. ..::.:::: KIAA12 -VGPGAGGAAGSSEMQRVPARVLDTDTITQVKEKVLDQVYKGTPFSQRPSVHALDLEWRS 1530 1540 1550 1560 1570 1580 1820 1830 1840 1850 1860 1870 KIAA04 GVAGHLILSDEDVTSEVQGLWRRLNTLQHYKVPDGATVALVPCLTKH--VLRENQDYVP- :.:::: :::::.:: .:. :.::::::::::::::::.::: : . . . . : KIAA12 GLAGHLTLSDEDLTSVTQNHWKRLNTLQHYKVPDGATVGLVPQLHRGSTISQSLAQRCPL 1590 1600 1610 1620 1630 1640 1880 1890 1900 1910 1920 1930 KIAA04 GERTPMLEDVDEGGIRPWHLVKPSDEPEPPRPRRGSLRGGERERAKAIPEIYLTRLLSMK :: : ::: .:::. ::::: ..::: . : .::: : ::::::::::::::::: KIAA12 GENIPTLEDGEEGGVCLWHLVKATEEPEGAKVRCSSLREREPARAKAIPEIYLTRLLSMK 1650 1660 1670 1680 1690 1700 1940 1950 1960 1970 1980 1990 KIAA04 GTLQKFVDDLFQVILSTSRPVPLAVKYFFDLLDEQAQQHGISDQDTIHIWKTNSLPLRFW ::::::::: ::.:::..::.:.::::.:::::: :..::: : :.:::::::: :::: KIAA12 GTLQKFVDDTFQAILSVNRPIPIAVKYLFDLLDELAEKHGIEDPGTLHIWKTNSLLLRFW 1710 1720 1730 1740 1750 1760 2000 2010 2020 2030 2040 2050 KIAA04 INIIKNPQFVFDVQTSDNMDAVLLVIAQTFMDACTLADHKLGRDSPINKLLYARDIPRYK .: .::::..:::..:::.::.: ::::::.:.:: ..::.:::::.:::::::.::::: KIAA12 VNALKNPQLIFDVRVSDNVDAILAVIAQTFIDSCTTSEHKVGRDSPVNKLLYAREIPRYK 1770 1780 1790 1800 1810 1820 2060 2070 2080 2090 2100 2110 KIAA04 RMVERYYADIRQTVPASDQEMNSVLAELSWNYSGDLGARVALHELYKYINKYYDQIITAL .:::::::::::. ::: :::::.::::: ::.. ::.:::..:..::::::.:: KIAA12 QMVERYYADIRQSSPASYQEMNSALAELSGNYTSAPHCLEALQELYNHIHRYYDQIISAL 1830 1840 1850 1860 1870 1880 2120 2130 2140 KIAA04 EEDGTAQKMQLGYRLQQIAAAVENKVTDL ::: ..::.::. ::::.:: :::::::: KIAA12 EEDPVGQKLQLACRLQQVAALVENKVTDL 1890 1900 1910 >>KIAA0315 ( 1841 res) hg00246 (1841 aa) initn: 3300 init1: 1036 opt: 1671 Z-score: 674.7 bits: 138.3 E(): 1.8e-32 Smith-Waterman score: 4466; 39.304% identity (62.227% similar) in 2155 aa overlap (13-2143:2-1841) 10 20 30 40 50 KIAA04 SSRPCQVTMPALGPALLQALWAGWVLTL----QPLPPTA--FTPNGTYLQHLARDPTSGT : :: ::: .: : : : : . :.::: : .::. KIAA03 RGAMALQ-LWALTLLGLLGAGASLRPRKLDFFRSEKELNHLAVDEASGV 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 KIAA04 LYLGATNFLFQLSPGLQLEATVSTGPVLDSRDCLPPVMPDECPQAQPTNNPNQLLLVSPG .::::.: :.::. :::: :.:::.::.. : ::. ..: .:. :.: :::::..: KIAA03 VYLGAVNALYQLDAKLQLEQQVATGPALDNKKCTPPIEASQCHEAEMTDNVNQLLLLDPP 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 KIAA04 A--LVVCGSVHQGVCEQRRLGQLEQLLLRPERPGDTQYVAANDPAVSTVGLVAQ-GLAGE :: :::. .:.: : :... :. . :. ..::.:: .:.:::::.. : .:. KIAA03 RKRLVECGSLFKGICALRALSNISLRLFYEDGSGEKSFVASNDEGVATVGLVSSTGPGGD 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 KIAA04 PLLFVGRGYTSRGVGGGIPPITTRALWPPDPQAAF-SYEETAKLAVGRLSEYSHHFVSAF .::::.: . .:: ..:: : : . :: .: . : .: :: ...::.:: KIAA03 RVLFVGKGNGPHD--NGII-VSTRLLDRTDSREAFEAYTDHATYKAGYLSTNTQQFVAAF 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 KIAA04 ARGASAYFLFLRRDLQAQSRAFRAYVSRVCLRDQHYYSYVELPLACE-----GGRYGLIQ : ..:.: ..: . .: :. ..:.: .: .::::.:. : :. .. .: KIAA03 EDGPYVFFVFNQQD-KHPARN-RTLLARMCREDPNYYSYLEMDLQCRDPDIHAAAFGTCL 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 KIAA04 AAAVATSREVAHGEVLFAAFSSAAPPTVGRPPSAAAGASGASALCAFPLDEVDRLANRTR ::.::. . :.::.:.:: : ..:. ::. :: ::::.: . .: KIAA03 AASVAAP---GSGRVLYAVFSR---------DSRSSGGPGAG-LCLFPLDKVHAKMEANR 290 300 310 320 330 350 360 370 380 390 400 KIAA04 DACYTREGRAEDGTEVAYIEYDVNSDCAQLPVDTLDAYPCGSDHTPSPMASRVPLEATPI .:::: .:.: . : . . .:. . ..::::.: : :..:: :..: . KIAA03 NACYTGTREARD---IFYKPFHGDIQCGGHAPGSSKSFPCGSEHLPYPLGSRDGLRGTAV 340 350 360 370 380 410 420 430 440 450 460 KIAA04 LEWPGIQLTAVAVTMEDGHTIAFLGDSQGQLHRVYLGPGSDGHPYSTQSIQQGSAVSRDL :. :..::::.:. :..::.:::: :.:.. .::: : . . :.. .. .. :.::: KIAA03 LQRGGLNLTAVTVAAENNHTVAFLGTSDGRILKVYLTPDGTSSEYDSILVEINKRVKRDL 390 400 410 420 430 440 470 480 490 500 510 520 KIAA04 TFDGTFEHLYVMTQSTLLKVPVASCAQHLDCASCLAHRDPYCGWCVLLGRCSRRSECSRG ...: . ::.:::. ....:: : .. :..: .::::::::. :::.:..:: :. KIAA03 VLSGDLGSLYAMTQDKVFRLPVQECLSYPTCTQCRDSQDPYCGWCVVEGRCTRKAECPRA 450 460 470 480 490 500 530 540 550 560 570 580 KIAA04 QGPEQWLWSFQPELGCLQVAAMSPANISREETREVFLSVPDLPPLWPGESYSCHFGEHQS . .:::: . .:. :.. .: :.::. :: :.: :: : . : ::: KIAA03 EEASHWLWSRSK--SCVAVTSAQPQNMSRRAQGEVQLTVSPLPALSEEDELLCLFGESPP 510 520 530 540 550 560 590 600 610 620 630 640 KIAA04 -PALLTGSGVMCPSPDPSEAPVLPRGADYVSVSVEL--RFGAVVIAKTSLSFYDCVAVTE :: . : .:.: : :: :: : : :.:.:...: : : . ... . :::: . KIAA03 HPARVEGEAVICNS--PSSIPVTPPGQDHVAVTIQLLLRRGNIFLTSYQYPFYDCRQAMS 570 580 590 600 610 620 650 660 670 680 690 700 KIAA04 LRPSAQCQACVSSRWGCNWCVWQHLCTHKASCDAGPMVASHQSPLVSPDPPARGGPSPSP :. . : .:::.:: :.: . : : . KIAA03 LEENLPCISCVSNRWTCQWDLRYHECRE-------------------------------- 630 640 650 710 720 730 740 750 760 KIAA04 PTAPKALATPAPDTLPVEPGAPSTATASDISPGASPSLLSPWGPWAGSGSISSPGSTGSP :.: :. .: . . KIAA03 -------ASPNPE----------------------------------DGIVRA------- 660 770 780 790 800 810 820 KIAA04 LHEEPSPPSPQNGPGTAVPAPTDFRPSATPEDLLASPLSPSEVAAVPPADPGPEALHPTV : : : :. KIAA03 -HMEDSCPQ--------------------------------------------------- 670 830 840 850 860 870 880 KIAA04 PLDLPPATVPATTFPGAMGSVKPALDWLTREGGELPEADEWTGGDAPAFSTSTLLSGDGD : : KIAA03 -------------FLG-------------------------------------------- 890 900 910 920 930 940 KIAA04 SAELEGPPAPLILPSSLDYQYDTPGLWELEEATLGASSCPCVESVQGSTLMPVHVEREIR :.::..: . . . . : ...:.::.: :: KIAA03 -------PSPLVIPMNHETDVNFQG--------------KNLDTVKGSSL---HV----- 680 690 700 950 960 970 980 990 1000 KIAA04 LLGRNLHLFQDGPGDNECVMELEGLEVVVEARVECEPPPDTQCHVTCQQHQLSYEALQPE : .: :.. : .:. : . . : .::..: . KIAA03 --GSDLLKFME-P----VTMQESGTFAF-------RTP------------KLSHDA-NET 710 720 730 1010 1020 1030 1040 1050 1060 KIAA04 LRVGLFLRRAGRLRVDSAEGLHVVLYDCSVGHGDCSRCQTAMPQYGCVWCEGERPRCVTR : . :... :. .:: :::.::.:: :..::: :..: :.: :.:: :. ::: . 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KIAA03 YGGSPVPNPGIFFTYRENPVLRAFEPLRSFASGGRSINVTGQGFSLIQ--RFAMVVIAEP 970 980 990 1000 1010 1020 1310 1320 1330 1340 1350 1360 KIAA04 LQPSQGLGRRRRVVPETACSLGPSCSSQQFEEPCHVNSSQLITCRTPALPGLPEDPWVRV :: : :. : :: : . . : :..... .::.: :: . : KIAA03 LQSWQP--------PREAESLQPM-TVVGTDYVFH-NDTKVVFL-SPAVPEEPEAYNLTV 1030 1040 1050 1060 1070 1370 1380 1390 1400 1410 1420 KIAA04 EFILDNLVFDFATLNPTPFSYEADPTLQPLNPEDPTMPFRHKPGSVFSVEGENLDLAMSK . .:. . : . : : :::. :. : ... .... ..: ::. ::. 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KIAA03 RWKRVNTLMHYNVRDGATLILSKVGVSQQPEDSQQDLPGERHALLEEEN----RVWHLVR 1550 1560 1570 1580 1590 1900 1910 1920 1930 1940 1950 KIAA04 PSDEPEPPRPRRGSLRGGERERAKAIPEIYLTRLLSMKGTLQKFVDDLFQVILSTSRPVP :.:: . . .:::.. :.::.::: :::::::::.:::::.:::..:: .:. .. :: KIAA03 PTDEVDEGKSKRGSVK--EKERTKAITEIYLTRLLSVKGTLQQFVDNFFQSVLAPGHAVP 1600 1610 1620 1630 1640 1650 1960 1970 1980 1990 2000 2010 KIAA04 LAVKYFFDLLDEQAQQHGISDQDTIHIWKTNSLPLRFWINIIKNPQFVFDVQTSDNMDAV :::::::.:::::..:.:.:.::::::::::::::::.::.:::.:.:::.. . .:: KIAA03 PAVKYFFDFLDEQAEKHNIQDEDTIHIWKTNSLPLRFWVNILKNPHFIFDVHVHEVVDAS 1660 1670 1680 1690 1700 1710 2020 2030 2040 2050 2060 2070 KIAA04 LLVIAQTFMDACTLADHKLGRDSPINKLLYARDIPRYKRMVERYYADIRQTVPASDQEMN : ::::::::::: ..:::.:::: ::::::..: ::.::: :: ::: : .:::.:: KIAA03 LSVIAQTFMDACTRTEHKLSRDSPSNKLLYAKEISTYKKMVEDYYKGIRQMVQVSDQDMN 1720 1730 1740 1750 1760 1770 2080 2090 2100 2110 2120 2130 KIAA04 SVLAELSWNYSGDLGARVALHELYKYINKYYDQIITALEEDGTAQKMQLGYRLQQIAAAV . :::.: .. .:.. ::::.::.: .::::.::.::::: .::::::..::::::::. KIAA03 THLAEISRAHTDSLNTLVALHQLYQYTQKYYDEIINALEEDPAAQKMQLAFRLQQIAAAL 1780 1790 1800 1810 1820 1830 2140 KIAA04 ENKVTDL ::::::: KIAA03 ENKVTDL 1840 >>KIAA0620 ( 1985 res) hg04174 (1985 aa) initn: 2489 init1: 757 opt: 1145 Z-score: 468.3 bits: 100.3 E(): 5.7e-21 Smith-Waterman score: 3179; 32.905% identity (56.807% similar) in 2255 aa overlap (4-2140:86-1978) 10 20 30 KIAA04 SSRPCQVTMPALGPALLQALWAGWVLTLQPLPP : . .: : :: : :: .: .: : KIAA06 PAHARMAPRAAGGAPLSARAAAASPPPFQTPPRCPVPLLLLLLLGAARAG-ALEIQRRFP 60 70 80 90 100 110 40 50 60 70 80 90 KIAA04 TAFTPNGTYLQHLARDPTSGTLYLGATNFLFQLS-PGLQLEATVSTGPVLDSRDCLPPVM . ::.... : : ..::.::.:.: :.::: .:.::: ...::: :: : : . 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KIAA06 HCS--------VNESLGAAVGQLP-ITIQVGNFNQTIATLQLGGSE-----TAIIVSIVI 1300 1310 1320 1330 1510 1520 1530 1540 1550 1560 KIAA04 GTSLLALGVIIIVLMYRRKSKQALRDYKKVQIQLENLESSVRDRCKKEFTDLMTEMTDLT . :: :.:. . ... ::..: : ..:. .:.:..::..:.. .: :..:.:.::::: KIAA06 CSVLLLLSVVAL-FVFCTKSRRAERYWQKTLLQMEEMESQIREEIRKGFAELQTDMTDLT 1340 1350 1360 1370 1380 1390 1570 1580 1590 KIAA04 SDLLGS-GIPFLDYKVYAERIFFP--------------------GHRES----PLHRDLG ..: : :::::.:: .. : ::: : .. :: . 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KIAA06 LCAIKQQINKGSIDAITGKARYTLNEEWLLRENIEAKPRNLNVSF---QGCG-MDSLSVR 1580 1590 1600 1610 1620 1630 1780 1790 1800 1810 1820 1830 KIAA04 VLDCDTISQAKEKMLDQLYKGVPLTQRPDPRTLDVEWRSGVAGHLILSDEDVTSEVQGLW ..: ::..:.:::.:. . :.:: .: : . .:.:: .. . :: : : :: :. KIAA06 AMDTDTLTQVKEKILEAFCKNVPYSQWPRAEDVDLEWFASSTQSYILRDLDDTSVVEDGR 1640 1650 1660 1670 1680 1690 1840 1850 1860 1870 1880 1890 KIAA04 RRLNTLQHYKVPDGATVALVPCLTKHVLRENQDYVPGERTPMLEDVDEGGIRPWHLVKPS ..:::: :::.:.::..:. : ...: . :. ..:.: . .::: :. KIAA06 KKLNTLAHYKIPEGASLAMS-------LIDKKDNTLGR----VKDLDTE--KYFHLVLPT 1700 1710 1720 1730 1740 1900 1910 1920 1930 1940 1950 KIAA04 DE-PEPPRPRRGSLRGGERERAKAIPEIYLTRLLSMKGTLQKFVDDLFQVILST--SRPV :: :: . .: : .: :..:::::::::: :::::::.::::..::: ..: KIAA06 DELAEPKKSHRQS------HRKKVLPEIYLTRLLSTKGTLQKFLDDLFKAILSIREDKP- 1750 1760 1770 1780 1790 1960 1970 1980 1990 2000 2010 KIAA04 PLAVKYFFDLLDEQAQQHGISDQDTIHIWKTNSLPLRFWINIIKNPQFVFDVQTSDNMDA :::::::::.:.:::...:::: ::.:::::::::::::.::.::::::::.. .:..:: KIAA06 PLAVKYFFDFLEEQAEKRGISDPDTLHIWKTNSLPLRFWVNILKNPQFVFDIDKTDHIDA 1800 1810 1820 1830 1840 1850 2020 2030 2040 2050 2060 2070 KIAA04 VLLVIAQTFMDACTLADHKLGRDSPINKLLYARDIPRYKRMVERYYADIRQTVPASDQEM : ::::.:.:::...: .::.::: ::::::..::.:...:.::: .:.. .: :.::: KIAA06 CLSVIAQAFIDACSISDLQLGKDSPTNKLLYAKEIPEYRKIVQRYYKQIQDMTPLSEQEM 1860 1870 1880 1890 1900 1910 2080 2090 2100 2110 2120 2130 KIAA04 NSVLAELSWNYSGDLGARVALHELYKYINKYYDQIITALEEDGTAQKMQLGYRLQQIAAA :. ::: : .:...... ::. :.::: ..: ::..::: . ::.. :: ....:..: KIAA06 NAHLAEESRKYQNEFNTNVAMAEIYKYAKRYRPQIMAALEANPTARRTQLQHKFEQVVAL 1920 1930 1940 1950 1960 1970 2140 KIAA04 VENKVTDL .:... KIAA06 MEDNIYECYSEA 1980 >>KIAA0463 ( 1963 res) hg00942 (1963 aa) initn: 2717 init1: 697 opt: 902 Z-score: 373.2 bits: 82.6 E(): 1.1e-15 Smith-Waterman score: 3340; 32.278% identity (56.962% similar) in 2212 aa overlap (24-2136:94-1959) 10 20 30 40 50 KIAA04 SSRPCQVTMPALGPALLQALWAGWVLTLQPLPPTAFTPNGTYLQHLARDPT-- ::: ::.: :. . .. :: : KIAA04 TAAPLSMEQRRPWPRALEVDSRSVVLLSVVWVLLA---PPAAGMPQFSTFHSENRDWTFN 70 80 90 100 110 120 60 70 80 90 100 KIAA04 -------SGTLYLGATNFLFQLSPGLQLEATVSTGPVLDSRDCLPPVMPDECPQAQP-TN .:..:.:: : ...:. .: .... .::: :...: ::.. . : .. :: KIAA04 HLTVHQGTGAVYVGAINRVYKLTGNLTIQVAHKTGPEEDNKSCYPPLIVQPCSEVLTLTN 130 140 150 160 170 180 110 120 130 140 150 160 KIAA04 NPNQLLLV--SPGALVVCGSVHQGVCEQRRLGQLEQLLLRPERPGDTQYVAANDPAVSTV : :.::.. : . :..:::..::::. :: .: .:..: . . .:... . . . 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KIAA04 EQDEQARRQRLAYKVEQLINAMSIES 1940 1950 1960 >>KIAA1550 ( 1462 res) ff03434 (1462 aa) initn: 2602 init1: 639 opt: 892 Z-score: 370.6 bits: 81.7 E(): 1.6e-15 Smith-Waterman score: 2823; 32.694% identity (58.061% similar) in 1774 aa overlap (414-2132:1-1454) 390 400 410 420 430 440 KIAA04 PCGSDHTPSPMASRVPLEATPILEWPGIQLTAVAVTMEDGHTIAFLGDSQGQLHRVYL-G :.: . . .:..::.: ..:.:... . : KIAA15 TSVIAYVYKNHSLAFVGTKSGKLKKIRVDG 10 20 30 450 460 470 480 490 500 KIAA04 PGSDGHPYSTQSIQQGSAVSRDLTFDGTFEHLYVMTQSTLLKVPVASCAQHLDCASCLAH : ... : : .. . . : ::..:. :.::.:.. : .::: ::.:. .:. ::. KIAA15 PRGNALQYETVQVVDPGPVLRDMAFSKDHEQLYIMSERQLTRVPVESCGQYQSCGECLGS 40 50 60 70 80 90 510 520 530 540 550 560 KIAA04 RDPYCGWCVLLGRCSRRSECSRGQGPEQWLWSFQPELG-CLQVAAMSPANISREETREVF ::.:::::: . :.:. .: :.. :.. : :. :.... . : ::: . .. 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KIAA15 VLETYNVPELSAG--VNCTFEDLSEMDGLVVGNQIQCYSPAAKEVPRIITENGDHHVVQL 150 160 170 180 190 200 620 630 640 650 660 670 KIAA04 ELRFG--AVVIAKTSLSFYDCVAVTELRPSAQCQACVSSRWGCNWCVWQHLCTHKASCDA .:. ....:.::. ::.: . .: .:: : . :.:: ..:.::: KIAA15 QLKSKETGMTFASTSFVFYNCSV------HNSCLSCVESPYRCHWCKYRHVCTHD----- 210 220 230 240 250 680 690 700 710 720 730 KIAA04 GPMVASHQSPLVSPDPPARGGPSPSPPTAPKALATPAPDTLPVEPGAPSTATASDISPGA : . : : KIAA15 -PKTCSFQE--------------------------------------------------- 260 740 750 760 770 780 790 KIAA04 SPSLLSPWGPWAGSGSISSPGSTGSPLHEEPSPPSPQNGPGTAVPAPTDFRPSATPEDLL KIAA15 ------------------------------------------------------------ 800 810 820 830 840 850 KIAA04 ASPLSPSEVAAVPPADPGPEALHPTVPLDLPPATVPATTFPGAMGSVKPALDWLTREGGE : :: KIAA15 --------------------------------------------GRVK------------ 860 870 880 890 900 910 KIAA04 LPEADEWTGGDAPAFSTSTLLSGDGDSAELEGPPAPLILPSSLDYQYDTPGLWELEEATL ::: KIAA15 LPE--------------------------------------------------------- 920 930 940 950 960 970 KIAA04 GASSCPCVESVQGSTLMPVHVEREIRLLGRNLHLFQDGPGDNECVMELEGLEVVVEA-RV .:: . :. . :.::.: . : : ..:: :.: ::.....: : : : : KIAA15 ---DCPQLLRVD-KILVPVEVIKPITLKAKNLPQPQSGQRGYECILNIQGSEQRVPALRF 270 280 290 300 310 320 980 990 1000 1010 1020 1030 KIAA04 ECEPPPDTQCHVTCQQHQLSYEALQ-PELRVGLFLRRAGRLRVDSAEGLHVVLYDCSVGH . . : ::. . :::... .: : : . :.. .:. .: :: :.. . KIAA15 N-------SSSVQCQNTSYSYEGMEINNLPVELTVVWNGHFNIDNPAQNKVHLYKCGAMR 330 340 350 360 370 1040 1050 1060 1070 1080 KIAA04 GDCSRCQTAMPQYGCVWCEGERPRCVTREACGEAEA-------VATQCPAPLIHSVEPLT .:. : : :...: ::.: .:. :. : :. . ..: : : . :.: KIAA15 ESCGLCLKADPDFACGWCQGP-GQCTLRQHCPAQESQWLELSGAKSKCTNPRITEIIPVT 380 390 400 410 420 430 1090 1100 1110 1120 1130 1140 KIAA04 GPVDGGTRVTIRGSNLGQHVQDVLGMVTVAGVPCAVDAQEYEVSSSLVCITG-ASGEEVA :: .:::.::::: ::: . .:. . : :::: :. .. : . ..:: : :. . : KIAA15 GPREGGTKVTIRGENLGLEFRDIASHVKVAGVECSPLVDGYIPAEQIVCEMGEAKPSQHA 440 450 460 470 480 490 1150 1160 1170 1180 1190 1200 KIAA04 GATAVEVP-GRGRGV--SEHDFAYQDPKVHSIFPARGPRAGGTRLTLNGSKLLTGRLEDI : . . : : . . : . . .. . .. :.::: .:::..:..:..: .: .. KIAA15 GFVEICVAVCRPEFMARSSQLYYFMTLTLSDLKPSRGPMSGGTQVTITGTNLNAG--SNV 500 510 520 530 540 550 1210 1220 1230 1240 1250 1260 KIAA04 RVVVGDQPCHLLPEQQSEQLRCETSPRPTPATLPVAVWFGATERRLQRGQFKYTLDPNIT :. : ::: :. ... . :.:. . :.: .. . : :.:. ::.:. KIAA15 VVMFGKQPC-LFHRRSPSYIVCNTTSSDEVLEMKVSVQVDRAKIH-QDLVFQYVEDPTIV 560 570 580 590 600 610 1270 1280 1290 1300 1310 1320 KIAA04 SAGPTKSFLSGGREICVRGQNLDVVQTPRIRVTVVSRMLQPSQGLGRRRRVVPETACSLG : :..::. : : : .::..:.:.::. ..: :... . KIAA15 RIEPEWSIVSGNTPIAVWGTHLDLIQNPQIRA---------KHG-GKEHINI-------- 620 630 640 650 1330 1340 1350 1360 1370 KIAA04 PSCSSQQFEEPCHVNSSQLITCRTPAL---PGLPEDPWVRVE---FILDNLVFDFATLNP :.: .. .::..::: : : : : ::::: : .. :: KIAA15 -----------CEVLNATEMTCQAPALALGPDHQSDLTERPEEFGFILDN-VQSLLILNK 660 670 680 690 700 1380 1390 1400 1410 1420 1430 KIAA04 TPFSYEADPTLQPLNPEDPTMPFRHKPGSVFSVEGENLDLAMS----KEEVVAMIGDGPC : :.: .:... .. :. .. :::. . ..:.:: .. : . ....:. :: KIAA15 TNFTYYPNPVFEAFG---PSGILELKPGTPIILKGKNLIPPVAGGNVKLNYTVLVGEKPC 710 720 730 740 750 1440 1450 1460 1470 1480 1490 KIAA04 VVKTLTRHHLYCEPPVEQPLPRHHALREAPDSLPEFTVQMGNLRFSLGHVQYDGESPGAF .: :.. .: :: : . . ::... ...:....: : : .:: .. KIAA15 TV-TVSDVQLLCESP--NLIGRHKVM-----------ARVGGMEYSPGMVYIAPDSPLSL 760 770 780 790 800 1500 1510 1520 1530 1540 1550 KIAA04 PVAAQVGLGVGTSLLALGVIIIVLMYRRKSKQALRDYKKVQIQLENLESSVRDRCKKEFT : : :...:. .:: . .. ... :.:::... :..:.:..:::: : .::. :. KIAA15 P--AIVSIAVAGGLLIIFIVAVLIAYKRKSRESDLTLKRLQMQMDNLESRVALECKEAFA 810 820 830 840 850 860 1560 1570 1580 1590 1600 1610 KIAA04 DLMTEMTDLTSDLLGSGIPFLDYKVYAERIFFPGHRESPLHRDLGVPESRRPTVEQGLGQ .:.:.. .::::: :.:::::::..:. :..::: .. :. ::: :: :. ::.:: KIAA15 ELQTDIHELTSDLDGAGIPFLDYRTYTMRVLFPGIEDHPVLRDLEVPGYRQERVEKGLKL 870 880 890 900 910 920 1620 1630 1640 1650 1660 1670 KIAA04 LSNLLNSKLFLTKFIHTLESQRTFSARDRAYVASLLTVALHGKLEYFTDILRTLLSDLVA ...:.:.:.:: .::.::::::.:: :::. ::::. ..:..:::: ::.:. ::.::. KIAA15 FAQLINNKVFLLSFIRTLESQRSFSMRDRGNVASLIMTVLQSKLEYATDVLKQLLADLID 930 940 950 960 970 980 1680 1690 1700 1710 1720 1730 KIAA04 QYV-AKN-PKLMLRRTETVVEKLLTNWMSICLYTFVRDSVGEPLYMLFRGIKHQVDKGPV . . .:: :::.:::::.:.::.::::... :: :... .::::. :: .::.:..:::. KIAA15 KNLESKNHPKLLLRRTESVAEKMLTNWFTFLLYKFLKECAGEPLFSLFCAIKQQMEKGPI 990 1000 1010 1020 1030 1040 1740 1750 1760 1770 1780 1790 KIAA04 DSVTGKAKYTLNDNRLLREDVEYRPLTLNALLAVGPGAGEAQGVPVKVLDCDTISQAKEK :..::.:.:.:....:.:....:. :.:. :.: ... ::::.:.::::.:.::: KIAA15 DAITGEARYSLSEDKLIRQQIDYKTLVLSC---VSPDNANSPEVPVKILNCDTITQVKEK 1050 1060 1070 1080 1090 1800 1810 1820 1830 1840 1850 KIAA04 MLDQLYKGVPLTQRPDPRTLDVEWRSGVAGHLILSDEDVTSEVQGLWRRLNTLQHYKVPD .:: ..:.:: ..:: .:.:::.: ....::.:::.:..... :.::::: ::.::: KIAA15 ILDAIFKNVPCSHRPKAADMDLEWRQGSGARMILQDEDITTKIENDWKRLNTLAHYQVPD 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1860 1870 1880 1890 KIAA04 GATVALVPC-LTKH-------VLR------ENQDYVPGE------RTPMLEDVDEGGIRP :..:::: .: . : : ::. : ::::. :.:.. 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KIAA15 AISDQDMNAYLAEQSRMHMNEFNTMSALSEIFSYVGKYSEEILGPLDHDDQCGKQKLAYK 1400 1410 1420 1430 1440 1450 2130 2140 KIAA04 LQQIAAAVENKVTDL :.:. KIAA15 LEQVITLMSLDS 1460 2143 residues in 1 query sequences 1985362 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:20:21 2008 done: Thu Dec 18 15:20:23 2008 Total Scan time: 1.080 Total Display time: 1.150 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]