# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hj00075.fasta.huge -Q ../query/KIAA0390.ptfa ./tmplib.23147 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0390, 1312 aa vs ./tmplib.23147 library 1986193 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.7739+/-0.00824; mu= 5.9616+/- 0.563 mean_var=265.1198+/-65.314, 0's: 0 Z-trim: 55 B-trim: 16 in 1/39 Lambda= 0.078769 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0222 ( 1204 res) ha02586 (1204) 1000 128.1 8.7e-30 KIAA1874 ( 579 res) hk07257s1 ( 579) 300 48.2 4.9e-06 KIAA1339 ( 409 res) fj00071 ( 409) 290 46.8 8.7e-06 KIAA1956 ( 680 res) fk08713 ( 680) 274 45.3 4.2e-05 KIAA1485 ( 1104 res) fj07037 (1104) 271 45.2 7.2e-05 KIAA1349 ( 752 res) fj00940 ( 752) 262 44.0 0.00012 KIAA0441 ( 702 res) hh00601s1 ( 702) 252 42.8 0.00024 KIAA1954 ( 468 res) fk02322 ( 468) 247 42.0 0.00028 KIAA2003 ( 460 res) ah02593 ( 460) 246 41.9 0.0003 KIAA1615 ( 484 res) fj13419 ( 484) 245 41.8 0.00034 KIAA1852 ( 948 res) fj01514 ( 948) 249 42.6 0.00037 KIAA2007 ( 580 res) fj01689 ( 580) 233 40.5 0.00096 KIAA0961 ( 530 res) hj05830 ( 530) 232 40.4 0.00099 KIAA0326 ( 927 res) hg00579 ( 927) 233 40.8 0.0013 KIAA1285 ( 785 res) hh11563(revised) ( 785) 228 40.2 0.0017 KIAA1388 ( 599 res) fj06552 ( 599) 224 39.5 0.002 KIAA1198 ( 553 res) fg01911 ( 553) 218 38.8 0.003 KIAA1710 ( 515 res) fj18457 ( 515) 217 38.7 0.0032 KIAA0557 ( 493 res) hh01334 ( 493) 216 38.5 0.0033 KIAA1809 ( 800 res) fk01629 ( 800) 218 39.0 0.0038 KIAA1190 ( 174 res) hg03443a ( 174) 206 36.8 0.0039 KIAA0360 ( 1019 res) hh00062s1 (1019) 218 39.2 0.0044 KIAA2033 ( 766 res) ej00602s1 ( 766) 211 38.2 0.0065 KIAA1871 ( 821 res) hj05256s1 ( 821) 211 38.2 0.0067 KIAA0972 ( 702 res) hj06859 ( 702) 208 37.8 0.0078 KIAA1829 ( 557 res) hj00069 ( 557) 205 37.3 0.0085 KIAA0569 ( 1318 res) hh02356 (1318) 211 38.5 0.009 >>KIAA0222 ( 1204 res) ha02586 (1204 aa) initn: 1224 init1: 377 opt: 1000 Z-score: 626.6 bits: 128.1 E(): 8.7e-30 Smith-Waterman score: 1254; 38.264% identity (62.219% similar) in 622 aa overlap (133-739:66-647) 110 120 130 140 150 160 KIAA03 EVDTSLNGRVDLQQFLNGQNLGIMSQMSDIEDDARKNRKYPCPLCGKRFRFNSILSLHMR : :. : . : .::: : :.: :: ::: KIAA02 AASVLRMDRNREAEMELRRGPSPTRAGRGHEVDGDKATCHTCCICGKSFPFQSSLSQHMR 40 50 60 70 80 90 170 180 190 200 210 220 KIAA03 THTGEKPFKCPYCDHRAAQKGNLKIHLRTHKLGNLGKGRGRVREENRLLHELEERAILRD ::::::.:::::::::.::::::::.:.:. :.: .:. : . : : .: KIAA02 KHTGEKPYKCPYCDHRASQKGNLKIHIRSHRTGTLIQGH----EPEAGEAPLGE---MRA 100 110 120 130 140 230 240 250 260 270 280 KIAA03 KQLKGSLLQPRPDLKPPPHAQQAPLAACTLALQANHSVPDVAHPVPSPKPASVQEDAVAP .. . .: . . . .. : . . : : .. . . ... .: :: KIAA02 SEGLDACASPTKSASACNRLLNGASQADGARVLNGASQADSGRVLLRSSKKGAEGSACAP 150 160 170 180 190 200 290 300 310 320 330 KIAA03 A---AGFRCTFCKGKFKKREELDRHIRILHKPYKCTLCDFAASQEEELISHVEKAHITAE . :. .:.:::..:.....:. :.. :::.:: ::..:. .:: :.::.:. ::::. KIAA02 GEAKAAVQCSFCKSQFERKKDLELHVHQAHKPFKCRLCSYATLREESLLSHIERDHITAQ 210 220 230 240 250 260 340 350 360 370 380 390 KIAA03 SAQGQGP----NGGGEQSANEFRCEVCGQVFSQAWFLKGHMRKHKDSFEHCCQICGRRFK . :.: :: : : .:: ::::::.:::.::::.::.::. ::.: :.::::::: KIAA02 GP-GSGEACVENGKPELSPGEFPCEVCGQAFSQTWFLKAHMKKHRGSFDHGCHICGRRFK 270 280 290 300 310 320 400 410 420 430 440 450 KIAA03 EPWFLKNHMKVHLNKLSVKNKSPSDPEVPVPMGGMSQEAH--ANLYSRYLSCLQSGFMTP ::::::::::.: : . ::. :. . . .... :: :.: : : : . : . KIAA02 EPWFLKNHMKAHGPKTGSKNRPKSELDPIATINNVVQEEVIVAGL-SLYEVCAKCGNLFT 330 340 350 360 370 380 460 470 480 490 500 510 KIAA03 DKAGLSEPSQLYGKGELPMKEKEALGKLLSPISSMAHGVPEGDKHSLLGCLNLVPPLKSS . .:. . .. .. :: .. .: :.: : :. .: :::: : .. KIAA02 NLDSLNAHNAIH-------RRVEA-SRTRAPAEEGAEG-PSDTKQFFLQCLNLRPSAAGD 390 400 410 420 430 520 530 540 550 560 570 KIAA03 CIERLQAAAKAAEMDPVNSYQAWQLMARGMAMEHGFLSKEHPLQRNHEDTLANAGVLFDK ::. ..::.::::::::::: .:: . : . :. :. . : . : ::: KIAA02 SCPGTQAGRRVAELDPVNSYQAWQLATRGKVAEPA----EY-LKYGAWDEALAGDVAFDK 440 450 460 470 480 490 580 590 600 610 620 KIAA03 EKREYVLVGADGSK--QKMPADLVHSTKVGSQRDLPS---KLDPLESSRDFLSHGLNQTL ..::::::. . : : :: : .: :. .::: ..: :. KIAA02 DRREYVLVSQEKRKREQDAPAAQGPPRKRASGPGDPAPAGHLDPRSAARP------NRRA 500 510 520 530 540 630 640 650 660 670 680 KIAA03 EYNLQGPGNMKEKPTECPDCGRVFRTYHQVVVHSRVHKRDRKGEE-DGLHVGLDERRGSG . : : : .:: .::..::::::.:.:::::.: :. .. :: ... : : KIAA02 AATT-GQG----KSSECFECGKIFRTYHQMVLHSRVHRRARRERDSDGDRAA---RARCG 550 560 570 580 590 690 700 710 720 730 740 KIAA03 SDQESQSVSRSTTPGSSNVTEESGVGGGLSQTGSAQEDSPHPSSPSSSDIGEEAGRSAGV : .:..:.:. ..:::. .. .: :.::.. : ::: . ..: . :. KIAA02 SLSEGDSASQPSSPGSACAAADSP-GSGLAD--EAAEDSGEEGAPEPAPGGQPRRCCFSE 600 610 620 630 640 650 750 760 770 780 790 800 KIAA03 QQPALLRDRSLGSAMKDCPYCGKTFRTSHHLKVHLRIHTGEKPYKCPHCDYAGTQSASLK KIAA02 EVTSTELSSGDQSHKMGDNASERDTGESKAGIAASVSILENSSRETSRRQEQHRFSMDLK 660 670 680 690 700 710 >>KIAA1874 ( 579 res) hk07257s1 (579 aa) initn: 620 init1: 164 opt: 300 Z-score: 200.2 bits: 48.2 E(): 4.9e-06 Smith-Waterman score: 310; 26.531% identity (48.639% similar) in 294 aa overlap (126-414:282-525) 100 110 120 130 140 150 KIAA03 LANQLGREVDTSLNGRVDLQQFLNGQNLGIMSQMSDIEDDAR--KNRK-YPCPLCGKRFR ..: :.. : :..: . : ::. : KIAA18 YWKSFNQKSVLITEDRVPKGSYAFHTLEKSLKQKSNLMKKQRTYKEKKPHKCNDCGELFT 260 270 280 290 300 310 160 170 180 190 200 210 KIAA03 FNSILSLHMRTHTGEKPFKCPYCDHRAAQKGNLKIHLRTHKLGNLGKGRGRVREENRLLH ..:.: :.:.::::::. : : . ....:: : ::: .:.: KIAA18 YHSVLIRHQRVHTGEKPYTCNECGKSFSHRANLTKHQRTH---------------TRILF 320 330 340 350 220 230 240 250 260 270 KIAA03 ELEERAILRDKQLKGSLLQPRPDLKPPPHAQQAPLAACTLALQANHSVPDVAHPVPSPKP : : . ..: : . . :. . : . :.:. : : KIAA18 ECSE---CKKTFTESSSLATHQRI----HVGERPYECNECGKGFNRSTHLVQH------- 360 370 380 390 400 280 290 300 310 320 330 KIAA03 ASVQEDAVAPAAGFRCTFCKGKFKKREELDRHIRIL--HKPYKCTLCDFAASQEEELISH .. . .: : ..:. : : . : .: : .::::: : : :. : .: KIAA18 -QLIHTGVKP---YECNECDKAFIHSSALIKHQRTHTGEKPYKCQECGKAFSHCSSLTKH 410 420 430 440 450 340 350 360 370 380 390 KIAA03 VEKAHITAESAQGQGPNGGGEQSANEFRCEVCGQVFSQAWFLKGHMRKHKDSFEHCCQIC ...: :. : ..: ::..:::. : :.: : . :. : KIAA18 -QRVHT------GEKP----------YECSECGKTFSQSTHLVQHQRIHTGEKPYECNEC 460 470 480 490 500 400 410 420 430 440 450 KIAA03 GRRFKEPWFLKNHMKVHLNKLSVKNKSPSDPEVPVPMGGMSQEAHANLYSRYLSCLQSGF :. :.. . .:...:..: : KIAA18 GKTFSRSSNFAKHQRIHIGKKPYKCSECGKAFIHSSALIQHQRTHTGEKPFRCNECGKSF 510 520 530 540 550 560 >>KIAA1339 ( 409 res) fj00071 (409 aa) initn: 442 init1: 235 opt: 290 Z-score: 195.7 bits: 46.8 E(): 8.7e-06 Smith-Waterman score: 302; 29.213% identity (52.060% similar) in 267 aa overlap (577-830:134-373) 550 560 570 580 590 600 KIAA03 HGFLSKEHPLQRNHEDTLANAGVLFDKEKREYVLVGADGSKQKMP-ADLVHSTKVGSQRD :. : :. :. : ::: ... : KIAA13 PVGEQVFSCHHCGKNLSQDMLLTHQCSHATEHPLPCAQCPKHFTPQADLSSTSQ-----D 110 120 130 140 150 610 620 630 640 650 660 KIAA03 LPSKLDPL--ESSRDFLSHGLNQTLEYNLQGPGNMKEKPTECPDCGRVFRTYHQVVVHSR :. : . .: : .: . : :.:. : :.: :::: . : ... : : KIAA13 HASETPPTCPHCARTF-THP--SRLTYHLR-VHNSTERPFPCPDCPKRFADQARLTSHRR 160 170 180 190 200 210 670 680 690 700 710 KIAA03 VHKRDRK------GEEDGLHVGLD-ERRGSGSDQE-SQSVSRSTTPGSSNVTEESGVGGG .: .: :. .:...: ..:: .... : : : . ... . KIAA13 AHASERPFRCAQCGRSFSLKISLLLHQRGHAQERPFSCPQCGIDFNGHSALIRHQMI--- 220 230 240 250 260 270 720 730 740 750 760 770 KIAA03 LSQTGSAQEDSPHPSSPSSSDIGEEAGRSAGVQQPALLRDRSLGSAMK--DCPYCGKTFR .:: . :.: . :... ... :: : : .. . .::.:::.: KIAA13 --HTG----ERPYPCTDCSKSF---------MRKEHLLNHRRLHTGERPFSCPHCGKSFI 280 290 300 310 780 790 800 810 820 830 KIAA03 TSHHLKVHLRIHTGEKPYKCPHCDYAGTQSASLKYHLERHHRERQNGAGPLSGQPPNQDH .::: : ::::::.:: : .: . . .:: ::. : .: . :::::: KIAA13 RKHHLMKHQRIHTGERPYPCSYCGRSFRYKQTLKDHLRSGHNGGCGGDSDPSGQPPNPPG 320 330 340 350 360 370 840 850 860 870 880 890 KIAA03 KDEMSSKASLFIRPDILRGAFKGLPGIDFRGGPASQQWTSGVLSSGDHSGQATGMSSEVP KIAA13 PLITGLETSGLGVNTEGLETNQWYGEGSGGGVL 380 390 400 >>KIAA1956 ( 680 res) fk08713 (680 aa) initn: 186 init1: 186 opt: 274 Z-score: 183.5 bits: 45.3 E(): 4.2e-05 Smith-Waterman score: 335; 21.862% identity (44.852% similar) in 709 aa overlap (126-817:70-676) 100 110 120 130 140 150 KIAA03 LANQLGREVDTSLNGRVDLQQFLNGQNLGIMSQMSDIEDDARKNRKYPCPLCGKRFRFNS .::.: . .. . : .:: . .. KIAA19 ENWVLISSLGCWCGSEDEEAPSKKSISIQRVSQVSTPGAGVSPKKAHSCEMCGAIL--GD 40 50 60 70 80 90 160 170 180 190 200 210 KIAA03 ILSL--HMRTHTGEKPFKCPYCDHRAAQKGNLKIHLRTHKLGNLGKGRGRVREENRLL-- :: : :. :: .: .: .. ...: : :. ::. : :. :. KIAA19 ILHLADHQGTHHKQKLHRCEAWGNKLYDSSN-----RPHQNQYLGEKPYRSSVEEALFVK 100 110 120 130 140 150 220 230 240 250 260 KIAA03 ----HELEERAIL--RDKQL---KGSLLQPRPDLKPPPHAQQAPLAACTLALQANHSVPD : :: .:. :.. .: ::: ... : . .: KIAA19 RCKFHVSEESSIFIQSGKDFLPSSGLLLQEATHTGEKSNSK--PECESPFQWGDTHYSCG 160 170 180 190 200 210 270 280 290 300 310 320 KIAA03 VAHPVPSPKPASVQEDAVAPAAGFRCTFCKGKFKKREELDRHIRIL--HKPYKCTLCDFA : : . ::.. . : : .:.: . .. : :. ..::.: : . KIAA19 ECMKHSSTKHVFVQQQRLPSREECYCWECGKSFSKYDSVSNHQRVHTGKRPYECGECGKS 220 230 240 250 260 270 330 340 350 360 370 380 KIAA03 ASQEEELISHVEKAHITAESAQGQGPNGGGEQSANEFRCEVCGQVFSQAWFLKGHMRKHK :.. :..: ...: :. : ..: ::. ::. : :.: : KIAA19 FSHKGSLVQH-QRVH------TGKRP----------YECGECGKSFSHKGSLVQHQRVHT 280 290 300 310 390 400 410 420 430 440 KIAA03 DSFEHCCQICGRRFKEPWFLKNHMKVHLNKLSVKNKSPSDPEVPVPMGGMSQEAHANLYS . : ::. :.. : .:..:: .. . . . . . :.. :. ... KIAA19 GERPYECGECGKSFSQNGTLIKHQRVHTGERPYECEECG--KCFTQKGNLIQHQRGHTSE 320 330 340 350 360 370 450 460 470 480 490 500 KIAA03 RYLSCLQSGFMTPDKAGLSEPSQLYGKGELPMKEKEALGKLLSPISSMAHGVPEGDKHSL : : . : .:. :.: ... . : :.. : :: .: . . .. KIAA19 RPYECEECGKCFSQKGTLTEHHRVHTR-ERPYECGEC-GKSFSRKGHL--------RNHQ 380 390 400 410 420 510 520 530 540 550 560 KIAA03 LGCLNLVPPLKSSCIERLQAAAKAAEMDPVNSYQAWQLMARGMAMEHGFLSKEHPLQRNH : . : : : .. .. .: ..: .. : .: . KIAA19 RGHTGERP---YECGECGKSFSR-----------------KGNLIQH---QRSHTGERPY 430 440 450 570 580 590 600 610 620 KIAA03 EDTLANAGVLFDKEKREYVLVGADGSKQKMPADLVHSTKVGSQRDLPSKLDPLESSRDFL : .: :. :... . . ::. . . . .: ...: : KIAA19 EC----------RECRKLF----RGKSHLIEHQRVHTGERPYECNECGK--SFQDSSGFR 460 470 480 490 500 630 640 650 660 670 680 KIAA03 SHGLNQTLEYNLQGPGNMKEKPTECPDCGRVFRTYHQVVVHSRVHKRDRKGEEDGLHVGL : .: : ::: :: .::. : ... : ::: .: : : KIAA19 VHQRVHT------G-----EKPFECSECGKSFPQSCSLLRHRRVHTGERPYE-----CG- 510 520 530 540 690 700 710 720 730 740 KIAA03 DERRGSGSDQESQSVSRSTTPGSSNVTEESGVGGGLSQTGSAQEDSPHPSSPSSSDIGEE . . : ..:.:. : ... : : . .. .. : .: KIAA19 ---ECGKSFHQSSSLLRHQKTHTAERPYECRECGKFFSSLLEHRRVHTGERPYEC---RE 550 560 570 580 590 750 760 770 780 790 KIAA03 AGRSAGVQQPALLRDRSLGSAMK--DCPYCGKTFRTSHHLKVHLRIHTGEKPYKCPHCDY :.. ... : .. . : . : .: :::.: . : : :.::::.::.: .: KIAA19 CGKTF-TRRSAHFKHQRLHTRGKPYECSECGKSFAETFSLTEHRRVHTGERPYECSECGK 600 610 620 630 640 650 800 810 820 830 840 850 KIAA03 AGTQSASLKYHLERHHRERQNGAGPLSGQPPNQDHKDEMSSKASLFIRPDILRGAFKGLP . .:.:: : .: : :: KIAA19 SFHRSSSLLRH-QRVHTERSPYK 660 670 680 >>KIAA1485 ( 1104 res) fj07037 (1104 aa) initn: 460 init1: 215 opt: 271 Z-score: 179.3 bits: 45.2 E(): 7.2e-05 Smith-Waterman score: 378; 23.077% identity (45.673% similar) in 832 aa overlap (70-817:57-796) 40 50 60 70 80 90 KIAA03 GQYAMSQKLHQITSQLSHAFPELHPRPNPEEKPPASLEEKAHVPMSGQPMGSQMALLANQ .:: :. :: . : . . KIAA14 REKASKRPRSQKTEKVQKISGKEARQLSGAKKPIISVVLTAHEAIPGATKIVPVEAGPPE 30 40 50 60 70 80 100 110 120 130 140 150 KIAA03 LGREVDTSLNGRVDLQQFLNGQNLGIMSQMSDIEDDARKNRKYP-------CPLCGKRFR : . .: . .:: . :. .: :.. :. ...: : : :.: :. KIAA14 TG--ATNSETTSADLVPRRGYQEYAI--QQTPYEQPMKSSRLGPTQLKIFTCEYCNKVFK 90 100 110 120 130 140 160 170 180 190 200 210 KIAA03 FNSILSLHMRTHTGEKPFKCPYCDHRAAQKGNLKIHLRTHKLGNLGKGRGRVREENRLLH :. :. :.: ::.:::.::: :.. .: :.::..::: : KIAA14 FKHSLQAHLRIHTNEKPYKCPQCSYASAIKANLNVHLRKHT------------------- 150 160 170 180 220 230 240 250 260 270 KIAA03 ELEERAILRDKQLKGSLLQPRPDLKPPPHAQQAPLAACTLA-LQANHSVPDVAHPVPSPK ... :... :. .: KIAA14 -----------------------------GEKFACDYCSFTCLSKGH------------- 190 200 280 290 300 310 320 KIAA03 PASVQEDAVAPAAGFRCTFCKGKFKKREELDRHIRILHKPYKCT-------LCDFAASQE .:. . : .: ::: :.. ..: .::: : : :: .. . KIAA14 -LKVHIERVHKKIKQHCRFCKKKYSDVKNLIKHIRDAHDPQDKKVKEALDELCLMTREGK 210 220 230 240 250 260 330 340 350 360 370 380 KIAA03 EELI--SHVEKAHITAESAQGQGPNGGGEQSANEFRCEVCGQVFSQAWFLKGHMRKHKDS ..:. :. . .. : . . :.. : ::.::. .. :. :.::: KIAA14 RQLLYDCHICERKFKNELDRDRHMLVHGDKWP--FACELCGHGATKYQALELHVRKH--P 270 280 290 300 310 390 400 410 420 430 KIAA03 FEHCCQICGRRFKEPWFLKNHMK-VH------LNKLSVKNKSPSDPEVPVPMGGMSQEAH : . : .: ..: :..:.: :: : : :.: : : : ..::: KIAA14 FVYVCAVCRKKFVSSIRLRTHIKEVHGAAQEALVFTSSINQSFCLLE---PGGDIQQEAL 320 330 340 350 360 370 440 450 460 470 480 490 KIAA03 ANLYSRYLSCLQSGFMTPDKAGLSEPSQLYGKGELPM--KEKEALGKLLSPISSMAHGVP .. :. .. : .:.: . : .: :: :: :.. .: .: : KIAA14 GD----QLQLVEEEFALQGVNALKEEA-CPGDTQLEEGRKEPEAPGEMPAPAVHLAS--P 380 390 400 410 420 500 510 520 530 KIAA03 EGDKHSLLGCLNLVPPLKSSCIERLQ--------------AAAKAAEMDPVNSYQAWQLM .... .: : . ..:: .. . : :.:: : . . ... KIAA14 QAESTALPPCELETTVVSSSDLHSQEVVSDDFLLKNDTSSAEAHAAPEKPPDMQHRSSVQ 430 440 450 460 470 480 540 550 560 570 580 590 KIAA03 ARGMAMEHGFLSKEHPLQRNHEDTLANAGVLFDKEKREYVLVG-ADGSK--QKMPA---D ..: .. .::: . ..:. :.. : . .. . .: : :. .. :: : KIAA14 TQGEVITL-LLSKAQSAGSDQESHGAQSP-LGEGQNMAVLSAGDPDPSRCLRSNPAEASD 490 500 510 520 530 540 600 610 620 630 640 KIAA03 LVHSTKVGSQRDLPSKLDPLESSRDFLSHGLNQTLEY--NLQGPG---NMKEK------P :. . .:. . . : ... . : :.. .. .:: .. :. KIAA14 LLPPV-AGGGDTITHQPDSCKAAPEHRS-GITAFMKVLNSLQKKQMNTSLCERIRKVYGD 550 560 570 580 590 600 650 660 670 680 690 KIAA03 TECPDCGRVFRTYHQVVVHSRVHKRDRKGEEDGLH---VGLDERRGSGSDQESQSVSRST :: ::..: . .: :.: :.. . : . . . ...:. . . KIAA14 LECEYCGKLFWYQVHFDMHVRTHTREHLYYCSQCHYSSITKNCLKRHVIQKHSNILLKCP 610 620 630 640 650 660 700 710 720 730 KIAA03 TPGSSNVTEES-------GVGGGLSQTG--------SAQED--------SPHPSSPSSSD : : . : .. : .:.. . : .:: . :: : : KIAA14 TDGCDYSTPDKYKLQAHLKVHTALDKRSYSCPVCEKSFSEDRLIKSHIKTNHPEV-SMST 670 680 690 700 710 720 740 750 760 770 780 790 KIAA03 IGEEAGRSAGVQQPALLRDRSLGSAMKDCPYCGKTF-RTSHHLKVHLRIHTGEKPYKCPH :.: :: :: .:. : ::: :::: : ... :. :. : : ::.:: KIAA14 ISEVLGRR--VQLKGLIGKR----AMK-CPYCDFYFMKNGSDLQRHIWAHEGVKPFKCSL 730 740 750 760 770 800 810 820 830 840 850 KIAA03 CDYAGTQSASLKYHLERHHRERQNGAGPLSGQPPNQDHKDEMSSKASLFIRPDILRGAFK :.:: ....:: :..:: :. KIAA14 CEYATRSKSNLKAHMNRHSTEKTHLCDMCGKKFKSKGTLKSHKLLHTADGKQFKCTVCDY 780 790 800 810 820 830 >>KIAA1349 ( 752 res) fj00940 (752 aa) initn: 791 init1: 203 opt: 262 Z-score: 175.6 bits: 44.0 E(): 0.00012 Smith-Waterman score: 479; 21.578% identity (48.829% similar) in 811 aa overlap (38-818:52-750) 10 20 30 40 50 60 KIAA03 PCSQGMEEASLCLGVSSAEPEAEPHLSGPVLNGQYAMSQKLHQI-TSQLSHAFPELHPRP ..: . .... .. ..: .: : : KIAA13 NATRTKAISEDLSQEAILEKLTENGLWDSRMEGLWKWNDRILRLQNNQENH----LSQRI 30 40 50 60 70 70 80 90 100 110 KIAA03 NPEEKPPASLE----EKAHVPMSG---QPMGS----QMALLANQLGREVDTSLNGRVDLQ : .: :.: . :. .: : . . : : ....:. .:: : :.. . KIAA13 IPLKKTPTSQRGFRFESILIPEPGIATEELHSRCQTQEENFTENLNLITDTHL-GKIICK 80 90 100 110 120 130 120 130 140 150 160 170 KIAA03 QFLNGQNLGIMSQMSDIEDDARKNRKYPCPLCGKRFRFNSILSLHMRTHTGEKPFKCPYC .. ... . :... . . :.. : : : : :.. :.: :.:::: :::..: : KIAA13 EMKGSKAIRQTSELTLGKKSNNKEKPYKCSTCEKAFHYRSLLIQHQRTHTKEKPYECNEC 140 150 160 170 180 190 180 190 200 210 220 230 KIAA03 DHRAAQKGNLKIHLRTHKLGNLGKGRGRVREENRLLHELEERAILRDKQLKGSLLQPRPD . .: . :. : . : :. . : .. :.. ...: ... : KIAA13 GKTFSQPSYLSQHKKIHT----GEKPYKCNECGK--------AFIASSSL---MVHQRI- 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 KIAA03 LKPPPHAQQAPLAACTLALQANHSVPDVAHPVPSPKPASVQEDAVAPAAGFRCTFCKGKF :... : ..:. : .: KIAA13 -----HTKEKP---------------------------------------YQCNVCGKSF 250 300 310 320 330 340 350 KIAA03 KKREELDRHIRIL--HKPYKCTLCDFAASQEEELISHVEKAHITAESAQGQGPNGGGEQS .. .:..: :: .:::::. : : :.. .: : :. .:. : KIAA13 SQCARLNQHQRIQTGEKPYKCSECGKAFSDKSKLARH-------QETHNGEKP------- 260 270 280 290 300 360 370 380 390 400 410 KIAA03 ANEFRCEVCGQVFSQAWFLKGHMRKHKDSFEHCCQICGRRFKEPWFLKNHMKVHLNKLSV ..:. ::..: . .:. :.. : . . :. ::. ::. ... :...: .. KIAA13 ---YKCDDCGKAFRNKSYLSVHQKTHTEEKPYQCNECGKSFKNTTIFNVHQRIHTGEKPF 310 320 330 340 350 420 430 440 450 460 470 KIAA03 KNKSPSDPEVPVPMGGMSQEAHANLYS--RYLSCLQSGFMTPDKAGLSEPSQLYGKGELP . . . .. : .: .. . : . : :...: .... :: : KIAA13 RCNECGKAY----RSNSSLIVHIRTHTGEKPYECNECGKAFNRIANFTEHQRIH-TGEKP 360 370 380 390 400 410 480 490 500 510 520 KIAA03 MKEKEALGKLLSPISSMA--HGVPEGDK-HSLLGCLNLVPPLKSSCI---ERLQAAAKAA .: .: :: . : .. : . :.: .. : . ..:: . .:... : KIAA13 YKCNEC-GKAFINYSCLTVHHRMHTGEKPYKCTECGKAF--MRSSSLIIHQRIHTEEKPY 420 430 440 450 460 470 530 540 550 560 570 KIAA03 EMDPVNSYQAWQLMARGMAMEHGFLSKEHPLQ-RNHEDTLANAGVLFDKEK-----REYV . . ..... .. ..... . . :.: . . : .... : ...: . : KIAA13 LCNECG--ESFRIKSH-LTVHQRIHTGEKPYKCTDCERAFTKMVNLKEHQKIHTGVKPYK 480 490 500 510 520 580 590 600 610 620 630 KIAA03 LVGADGSKQKMPADLVHS-TKVGSQRDLPSKLDPLESSRDFLSHGLNQTLEYNLQGPGNM : . .::. :..: . : : . : . : . .: .. . : KIAA13 CYDCGKSFRTKSYLIVHQRTHTGEK---PYKCN--ECEKAFTN--TSQLTVHQRRHTG-- 530 540 550 560 570 640 650 660 670 680 690 KIAA03 KEKPTECPDCGRVFRTYHQVVVHSRVHKRDRKGEEDGLHVGLDERRGSGSDQESQSVSRS ::: .: .::.:: . .:.:.: .. . . .... : :.. . KIAA13 -EKPYKCNECGKVFTSNSGFNTHQRTHTGEKPFKCNDCGKAFSQMVHV---TEHQKIHSG 580 590 600 610 620 630 700 710 720 730 740 750 KIAA03 TTPGSSNVTEESGVGGGLSQTGSAQEDSPHPSSPSSSDIGEEAGRSAGVQQPALLRDR-S : . .: : . :: . . . .: :.. . . :..: KIAA13 EKPYKCDVC------GKAFRRGSYLTVHWRTHTGEKPYTCKECGKGCITLSQLTLHQRIH 640 650 660 670 680 760 770 780 790 800 810 KIAA03 LGSAMKDCPYCGKTFRTSHHLKVHLRIHTGEKPYKCPHCDYAGTQSASLKYHLERHHRER : : :::.:::. . ::::.::::::::: .: : .:.:: : . :.:: KIAA13 TGERPYKCEECGKAFRTNSDFTVHLRMHTGEKPYKCNECGKAFRSSSSLTVHQRIHQRET 690 700 710 720 730 740 820 830 840 850 860 870 KIAA03 QNGAGPLSGQPPNQDHKDEMSSKASLFIRPDILRGAFKGLPGIDFRGGPASQQWTSGVLS : KIAA13 QLI 750 >>KIAA0441 ( 702 res) hh00601s1 (702 aa) initn: 451 init1: 196 opt: 252 Z-score: 169.8 bits: 42.8 E(): 0.00024 Smith-Waterman score: 287; 23.645% identity (46.552% similar) in 406 aa overlap (24-420:184-525) 10 20 30 40 50 KIAA03 KWFHFHFPCSQGMEEASLCLGVSSAEPEAEPHLSGPVLNGQ-YAMSQKLHQIT .:: : . .... : : : .... .. KIAA04 VIPNKKNDPPKRKRGRPKKVNTLQEEKSELAAEEEIQLRVNNSVQNRQNFVVKGDSGVLN 160 170 180 190 200 210 60 70 80 90 100 KIAA03 SQLS-HAFPELHP--RPNPEEKPPASLEEKAHVPMSGQPMGSQMALLANQLGREVDTSLN :.. . : .: .:. ::. :. .:. . : . . ..:: .. : : . KIAA04 EQIAAKEKEESEPTCEPSREEEMPVEKDEN-YDPKTEDGQASQSRYSKRRIWRSVKLK-- 220 230 240 250 260 270 110 120 130 140 150 160 KIAA03 GRVDLQQFLNGQNLGIMSQMSDIEDDARKNRKYP---CPLCGKRFRFNSILSLHMRTHTG : . . .. : ... :: : : ::: :..: .:..:.:.::: KIAA04 ---DYKLVGDQEDHGSAKRIC----GRRKRPGGPEARCKDCGKVFKYNHFLAIHQRSHTG 280 290 300 310 320 170 180 190 200 210 220 KIAA03 EKPFKCPYCDHRAAQKGNLKIHLRTHKLGNLGKGRGRVREENRLLHELEERAILRDKQLK :.:::: : . ::: .:..: : : :. . : : :. :.. : . KIAA04 ERPFKCNECGKGFAQKHSLQVHTRMHT-GERPYTCTVCSKALTTKHSLLEHMSLHSGQKS 330 340 350 360 370 380 230 240 250 260 270 280 KIAA03 GSLLQPRPDLKPPPHAQQAPLAACTLALQANHSVPDVAHPVPSPKPASVQEDAVAPAAGF . : .:. : . ....::.:. KIAA04 FTC-----DQCGKYFSQNRQLKS-HYRVHTGHSLPE------------------------ 390 400 410 290 300 310 320 330 340 KIAA03 RCTFCKGKFKKREELDRHIRIL--HKPYKCTLCDFAASQEEELISHVEKAHITAESAQGQ : :. :: .: .:.: .::. : .: . . . : .:. . : .:. KIAA04 -CKDCHRKFMDVSQLKKHLRTHTGEKPFTCEICGKSFTAKSSLQTHI-RIH------RGE 420 430 440 450 460 350 360 370 380 390 400 KIAA03 GPNGGGEQSANEFRCEVCGQVFSQAWFLKGHMRKHKDSFEHCCQICGRRFKEPWFLKNHM : . : .::. ::.. . : : . : :. .: . :: :. KIAA04 KP----------YSCGICGKSFSDSSAKRRHCILHTGKKPFSCPECNLQFARLDNLKAHL 470 480 490 500 510 410 420 430 440 450 460 KIAA03 KVHLNKLSVKNKSPSDPEVPVPMGGMSQEAHANLYSRYLSCLQSGFMTPDKAGLSEPSQL :.: :.: :: KIAA04 KIH-----SKEKHASDASSISGSSNTEEVRNILQLQPYQLSTSGEQEIQLLVTDSVHNIN 520 530 540 550 560 >>KIAA1954 ( 468 res) fk02322 (468 aa) initn: 687 init1: 182 opt: 247 Z-score: 168.7 bits: 42.0 E(): 0.00028 Smith-Waterman score: 339; 26.498% identity (49.211% similar) in 317 aa overlap (118-411:174-468) 90 100 110 120 130 140 KIAA03 PMGSQMALLANQLGREVDTSLNGRVDLQQFLNGQNLGIMSQMSDIEDDARKNRKYPCPLC : :... ..... : .. . : : KIAA19 CSLCGKAFQRSSSLVQHQRIHTGEKPYRCNLCGRSFRHGTSLTQHEVTHSGEKPFQCKEC 150 160 170 180 190 200 150 160 170 180 190 200 KIAA03 GKRFRFNSILSLHMRTHTGEKPFKCPYCDHRAAQKGNLKIHLRTHKLGNLGKGRGRVREE :: : : : : :::::::::.: : . .:. .: :.: :: :. .. . . KIAA19 GKAFSRCSSLVQHERTHTGEKPFECSICGRAFGQSPSLYKHMRIHKRGKPYQSSNYSIDF 210 220 230 240 250 260 210 220 230 240 250 260 KIAA03 NRLLHELEERAILRD-KQLK----GSLLQPRPDLKPPP--HAQQAPLAACTLALQANHSV .. .... : . :. . : .. :. :. . : : :. : KIAA19 KHSTSLTQDESTLTEVKSYHCNDCGEDFSHITDFTDHQRIHTAENPYD-CEQAF----SQ 270 280 290 300 310 270 280 290 300 KIAA03 PDVAHPVPSPKPASVQEDAVAPAAGF-------------RCTFCKGKFKKREELDRHIRI ..:: .: .: : ...: .:. : :..: : .: : KIAA19 QAISHPGEKPYQCNVCGKAFKRSTSFIEHHRIHTGEKPYECNECGEAFSRRSSLTQHERT 320 330 340 350 360 370 310 320 330 340 350 360 KIAA03 L--HKPYKCTLCDFAASQEEELISHVEKAHITAESAQGQGPNGGGEQSANEFRCEVCGQV .:::.: : : :: ::.: :..: :. : ..:. ::.. KIAA19 HTGEKPYECIDCGKAFSQSSSLIQH-ERTHT------GEKP----------YECNECGRA 380 390 400 410 420 370 380 390 400 410 420 KIAA03 FSQAWFLKGHMRKHKDSFEHCCQICGRRFKEPWFLKNHMKVHL-NKLSVKNKSPSDPEVP : . :. :.: : . :. ::. :.. : .:...: ::: KIAA19 FRKKTNLHDHQRIHTGEKPYSCKECGKNFSRSSALTKHQRIHTRNKL 430 440 450 460 430 440 450 460 470 480 KIAA03 VPMGGMSQEAHANLYSRYLSCLQSGFMTPDKAGLSEPSQLYGKGELPMKEKEALGKLLSP >>KIAA2003 ( 460 res) ah02593 (460 aa) initn: 335 init1: 174 opt: 246 Z-score: 168.1 bits: 41.9 E(): 0.0003 Smith-Waterman score: 275; 25.887% identity (48.582% similar) in 282 aa overlap (140-407:182-430) 110 120 130 140 150 160 KIAA03 GRVDLQQFLNGQNLGIMSQMSDIEDDARKNRKYPCPLCGKRFRFNSILSLHMRTHTGEKP : : : ::: : . :. : : :::::: KIAA20 GKTHYNCGEHTKAFSGKHTLVQQQRTLTTERCYICSECGKSFSKSYSLNDHWRLHTGEKP 160 170 180 190 200 210 170 180 190 200 210 220 KIAA03 FKCPYCDHRAAQKGNLKIHLRTHKLGNLGKGRGRVREENRLLHELEERAILRDKQLKGSL ..: : . :...: : :.: :: :: .: . : .. :..: KIAA20 YECRECGKSFRQSSSLIQHRRVHTA---------VRP-----HECDECGKLFSN--KSNL 220 230 240 250 230 240 250 260 270 KIAA03 LQPR---PDLKPPPHAQQAPLAACTLALQANHSVPDVAHPVPSPK--------PASVQED .. : .: .. . . :: ...: .: . . .... KIAA20 IKHRRVHTGERPYECSECGKSFSQRSALLQHRGVHTGERPYECSECGKFFTYHSSLIKHQ 260 270 280 290 300 310 280 290 300 310 320 330 KIAA03 AVAPAA-GFRCTFCKGKFKKREELDRHIRIL--HKPYKCTLCDFAASQEEELISHVEKAH : .. ..:. : .:.. : .: :. ..::::. : . ::. :..: . .: KIAA20 KVHSGSRPYECSECGKSFSQNSSLIEHHRVHTGERPYKCSECGKSFSQRSALLQH-RGVH 320 330 340 350 360 370 340 350 360 370 380 390 KIAA03 ITAESAQGQGPNGGGEQSANEFRCEVCGQVFSQAWFLKGHMRKHKDSFEHCCQICGRRFK :. : ..: ::. : . :. :.: : : . :. ::. : KIAA20 T------GERP----------YECSECGKFFPYSSSLRKHQRVHTGSRPYECSECGKSFT 380 390 400 410 400 410 420 430 440 450 KIAA03 EPWFLKNHMKVHLNKLSVKNKSPSDPEVPVPMGGMSQEAHANLYSRYLSCLQSGFMTPDK . : .: .:: KIAA20 QNSGLIKHRRVHTGEKPYECTECGKSFSHNSSLIKHQRIHSR 420 430 440 450 460 >>KIAA1615 ( 484 res) fj13419 (484 aa) initn: 658 init1: 155 opt: 245 Z-score: 167.3 bits: 41.8 E(): 0.00034 Smith-Waterman score: 321; 24.752% identity (49.175% similar) in 303 aa overlap (109-409:198-451) 80 90 100 110 120 130 KIAA03 KAHVPMSGQPMGSQMALLANQLGREVDTSLNGRVDLQQFLNGQNLGIMSQMSDIEDDARK .:. .. . :... . .:.. . KIAA16 KIHNEKFYKCKEYRRTFERVGKVTPLQRVHDGEKHFECSFCGKSFRVHAQLTRHQKIHTD 170 180 190 200 210 220 140 150 160 170 180 190 KIAA03 NRKYPCPLCGKRFRFNSILSLHMRTHTGEKPFKCPYCDHRAAQKGNLKIHLRTHKLGNLG .. : : ::: :::.: :. :.: ::::::.:: .:.. ...: : : : : KIAA16 EKTYKCMECGKDFRFHSQLTEHQRIHTGEKPYKCMHCEKVFRISSQLIEHQRIH----TG 230 240 250 260 270 280 200 210 220 230 240 250 KIAA03 KGRGRVREENRLLHELEERAILRDKQLKGSLLQPRPDLKPPPHAQQAPLAACTLALQANH . .: .. . .: : : .... . : : . . :: ... . KIAA16 EKPYACKECGKAFGVCRELA--RHQRIHTG--------KKPYECK-----ACGKVFRNSS 290 300 310 320 260 270 280 290 300 310 KIAA03 SVPDVAHPVPSPKPASVQEDAVAPAAGFRCTFCKGKFKKREELDRHIRIL--HKPYKCTL :. . . :: ..: :. : :: :: :: .:::.: KIAA16 SLTRHQRIHTGEKP-------------YKCKECEKAFGVGSELTRHERIHSGQKPYECKE 330 340 350 360 370 320 330 340 350 360 370 KIAA03 CDFAASQEEELISHVEKAHITAESAQGQGPNGGGEQSANEFRCEVCGQVFSQAWFLKGHM : ::.: .. : .:. : ..:.:::..: .. : :. KIAA16 CGKFFRLTSALIQH-QRIH------SGEKP----------YECKVCGKAFRHSSALTEHQ 380 390 400 410 380 390 400 410 420 430 KIAA03 RKHKDSFEHCCQICGRRFKEPWFLKNHMKVHLNKLSVKNKSPSDPEVPVPMGGMSQEAHA : : . :. ::. :.. . .:...: . KIAA16 RIHTGEKPYECKACGKAFRHSSSFTKHQRIHTDDKPYECKECGNSFSVVGHLTCQPKIYT 420 430 440 450 460 470 440 450 460 470 480 490 KIAA03 NLYSRYLSCLQSGFMTPDKAGLSEPSQLYGKGELPMKEKEALGKLLSPISSMAHGVPEGD KIAA16 GEKSFD 480 1312 residues in 1 query sequences 1986193 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:19:38 2008 done: Thu Dec 18 15:19:39 2008 Total Scan time: 0.780 Total Display time: 0.270 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]