# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/ef00443.fasta.nr -Q ../query/KIAA0382.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0382, 1443 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7824366 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9850+/-0.000189; mu= 11.8312+/- 0.011 mean_var=94.8774+/-18.417, 0's: 27 Z-trim: 45 B-trim: 22 in 1/66 Lambda= 0.131672 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|34395525|sp|Q9NZN5.1|ARHGC_HUMAN RecName: Full= (1544) 9501 1816.2 0 gi|114640823|ref|XP_001166795.1| PREDICTED: Rho gu (1525) 9496 1815.2 0 gi|114640821|ref|XP_001166830.1| PREDICTED: Rho gu (1544) 9496 1815.2 0 gi|114640825|ref|XP_508820.2| PREDICTED: Rho guani (1441) 9486 1813.3 0 gi|194212784|ref|XP_001917643.1| PREDICTED: simila (1734) 8775 1678.3 0 gi|77362757|dbj|BAD89994.2| guanine nucleotide exc (1544) 8752 1673.9 0 gi|73955010|ref|XP_536546.2| PREDICTED: similar to (1708) 8665 1657.4 0 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