# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hh00502s1.fasta.nr -Q ../query/KIAA0378.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0378, 970 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7801924 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7939+/-0.00021; mu= 6.5379+/- 0.012 mean_var=167.8645+/-32.611, 0's: 28 Z-trim: 175 B-trim: 455 in 2/63 Lambda= 0.098991 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|51701377|sp|O15083.3|ERC2_HUMAN RecName: Full=E ( 957) 6046 876.5 0 gi|114587437|ref|XP_516542.2| PREDICTED: cytomatri ( 957) 6040 875.7 0 gi|109038041|ref|XP_001101499.1| PREDICTED: simila ( 957) 6029 874.1 0 gi|149728580|ref|XP_001490805.1| PREDICTED: ELKS/R ( 957) 6021 872.9 0 gi|73985244|ref|XP_849232.1| PREDICTED: similar to ( 957) 6016 872.2 0 gi|119585719|gb|EAW65315.1| CAZ-associated structu ( 953) 6008 871.1 0 gi|51701400|sp|Q6PH08.2|ERC2_MOUSE RecName: Full=E ( 957) 6007 870.9 0 gi|51701368|sp|Q8K3M6.1|ERC2_RAT RecName: Full=ERC ( 957) 5985 867.8 0 gi|38231916|gb|AAR14796.1| CAST1/ERC2 splicing var ( 953) 5969 865.5 0 gi|38231912|gb|AAR14794.1| CAST1/ERC2 splicing var ( 960) 5945 862.1 0 gi|34783581|gb|AAH56760.1| ELKS/RAB6-interacting/C (1002) 5910 857.1 0 gi|126336711|ref|XP_001365767.1| PREDICTED: simila (1120) 5829 845.6 0 gi|73985242|ref|XP_541836.2| PREDICTED: similar to ( 863) 4859 706.9 1e-200 gi|189520472|ref|XP_001922876.1| PREDICTED: simila ( 960) 4759 692.7 2.2e-196 gi|149015705|gb|EDL75053.1| cytomatrix protein p11 ( 757) 4678 681.0 5.6e-193 gi|38231910|gb|AAR14793.1| CAST1/ERC2 splicing var ( 969) 4410 642.9 2.2e-181 gi|74180981|dbj|BAE27770.1| unnamed protein produc ( 977) 4384 639.2 2.9e-180 gi|149640307|ref|XP_001506116.1| PREDICTED: simila ( 991) 4347 633.9 1.1e-178 gi|6681583|dbj|BAA88763.1| ELKS [Homo sapiens] ( 948) 4342 633.2 1.8e-178 gi|73997546|ref|XP_868106.1| PREDICTED: similar to ( 948) 4341 633.0 2e-178 gi|73997548|ref|XP_868113.1| PREDICTED: similar to (1048) 4339 632.8 2.6e-178 gi|51701367|sp|Q811U3.1|RB6I2_RAT RecName: Full=EL ( 948) 4331 631.6 5.4e-178 gi|23664282|gb|AAN39293.1| ERC1b [Rattus norvegicu ( 948) 4325 630.7 9.8e-178 gi|119609343|gb|EAW88937.1| RAB6 interacting prote ( 944) 4312 628.9 3.5e-177 gi|119609339|gb|EAW88933.1| RAB6 interacting prote (1044) 4310 628.6 4.6e-177 gi|73997544|ref|XP_868102.1| PREDICTED: similar to (1044) 4309 628.5 5.1e-177 gi|149049596|gb|EDM02050.1| Rab6 interacting prote ( 944) 4301 627.3 1e-176 gi|151556922|gb|AAI49026.1| ERC2 protein [Bos taur ( 691) 4271 622.9 1.7e-175 gi|73997530|ref|XP_868074.1| PREDICTED: similar to ( 956) 4077 595.3 4.5e-167 gi|27530916|dbj|BAC54107.1| ELKS beta [Homo sapien ( 992) 3779 552.8 3e-154 gi|114642791|ref|XP_001151532.1| PREDICTED: RAB6-i (1092) 3778 552.7 3.5e-154 gi|73997538|ref|XP_868091.1| PREDICTED: similar to ( 992) 3777 552.5 3.6e-154 gi|118083050|ref|XP_001235143.1| PREDICTED: simila (1089) 3763 550.5 1.6e-153 gi|114642795|ref|XP_001151717.1| PREDICTED: RAB6-i (1088) 3756 549.5 3.1e-153 gi|119609346|gb|EAW88940.1| RAB6 interacting prote ( 988) 3755 549.3 3.2e-153 gi|27530920|dbj|BAC54109.1| ELKS delta [Homo sapie (1088) 3755 549.4 3.4e-153 gi|73997542|ref|XP_868099.1| PREDICTED: similar to (1088) 3755 549.4 3.4e-153 gi|149049598|gb|EDM02052.1| Rab6 interacting prote (1088) 3754 549.2 3.8e-153 gi|119893166|ref|XP_597487.3| PREDICTED: similar t (1088) 3752 549.0 4.6e-153 gi|148667201|gb|EDK99617.1| Rab6 interacting prote (1088) 3749 548.5 6.2e-153 gi|119609345|gb|EAW88939.1| RAB6 interacting prote ( 757) 3476 509.4 2.6e-141 gi|194377340|dbj|BAG57618.1| unnamed protein produ ( 724) 3416 500.8 9.8e-139 gi|73997532|ref|XP_868078.1| PREDICTED: similar to (1060) 3302 484.7 1e-133 gi|149015704|gb|EDL75052.1| cytomatrix protein p11 ( 721) 3202 470.2 1.5e-129 gi|26328215|dbj|BAC27848.1| unnamed protein produc ( 523) 3078 452.4 2.7e-124 gi|148692789|gb|EDL24736.1| DNA segment, Chr 14, E ( 492) 2975 437.6 6.9e-120 gi|45751568|gb|AAH68006.1| ERC1 protein [Homo sapi ( 627) 2882 424.5 8e-116 gi|189525418|ref|XP_001343173.2| PREDICTED: simila ( 796) 2753 406.1 3.3e-110 gi|47229697|emb|CAG06893.1| unnamed protein produc ( 919) 2615 386.5 3.1e-104 gi|73997536|ref|XP_868087.1| PREDICTED: similar to (1076) 2481 367.4 2e-98 >>gi|51701377|sp|O15083.3|ERC2_HUMAN RecName: Full=ERC p (957 aa) initn: 6046 init1: 6046 opt: 6046 Z-score: 4675.4 bits: 876.5 E(): 0 Smith-Waterman score: 6046; 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