# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hh00124.fasta.huge -Q ../query/KIAA0366.ptfa ./tmplib.23147 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0366, 1201 aa vs ./tmplib.23147 library 1986304 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.4206+/-0.00591; mu= 22.9224+/- 0.403 mean_var=132.4598+/-32.083, 0's: 0 Z-trim: 15 B-trim: 13 in 1/39 Lambda= 0.111438 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1312 ( 1471 res) fh11767 (1471) 1562 263.8 1.4e-70 KIAA1346 ( 999 res) fj00671 ( 999) 1429 242.2 3.1e-64 KIAA2029 ( 1021 res) pj01256 (1021) 1362 231.4 5.4e-61 KIAA0688 ( 849 res) hk03410 ( 849) 1130 194.0 8.4e-50 KIAA0605 ( 1031 res) hg03238a (1031) 579 105.5 4.3e-23 KIAA1233 ( 1023 res) fh08611 (1023) 284 58.1 8e-09 KIAA0960 ( 1502 res) hj05779s1 (1502) 269 56.0 5.2e-08 KIAA0762 ( 724 res) hk04668s1 ( 724) 255 53.2 1.7e-07 KIAA0021 ( 703 res) ha00117(revised) ( 703) 244 51.4 5.8e-07 KIAA1445 ( 1202 res) fg03469b (1202) 214 47.0 2.1e-05 KIAA1777 ( 954 res) fh19201x1 ( 954) 191 43.1 0.00025 KIAA2036 ( 1322 res) pf06513 (1322) 187 42.7 0.00045 KIAA1679 ( 1536 res) fh22954 (1536) 184 42.3 0.00068 KIAA0550 ( 1524 res) hh15909 (1524) 170 40.1 0.0032 >>KIAA1312 ( 1471 res) fh11767 (1471 aa) initn: 1428 init1: 407 opt: 1562 Z-score: 1359.3 bits: 263.8 E(): 1.4e-70 Smith-Waterman score: 1709; 32.476% identity (58.095% similar) in 1050 aa overlap (155-1072:5-1024) 130 140 150 160 170 180 KIAA03 PGSATYRIRKTEPLQTNCAYVGDIVDIPGTSVAISNCDGLAGMIKSDNEEYFIEPLERGK ...:: :.:. : ..: . .::::::. KIAA13 NSEHTAVISLCSGMLGTFRSHDGDYFIEPLQSMD 10 20 30 190 200 210 KIAA03 QME--EEKGRIHVVYKRSAVEQAP------IDMS--KDFHYRES---------------- ..: ::... :..:.::: .. : : : :. : ... KIAA13 EQEDEEEQNKPHIIYRRSAPQREPSTGRHACDTSEHKNRHSKDKKKTRARKWGERINLAG 40 50 60 70 80 90 220 230 240 250 260 270 KIAA03 DLEGLDD-LGT----VYGNIHQQLNE--TMRRRRHAGENDYNIEVLLGVDDSVVRFHGKE :. .:.. :.: .::: .. : : :: .. .:::. .:. .: .:: : KIAA13 DVAALNSGLATEAFSAYGNKTDNTREKRTHRRTKRFLSYPRFVEVLVVADNRMVSYHG-E 100 110 120 130 140 150 280 290 300 310 320 KIAA03 HVQNYLLTLMNIVNEIYHDESLGVHINVVLVRMIMLGYAK---SISLIERGNPSRSLENV ..:.:.::::.:: ::.: :.: ::.:.: .:.. . :::. : . .:.: KIAA13 NLQHYILTLMSIVASIYKDPSIGNLINIVIVNLIVIHNEQDGPSISF----NAQTTLKNF 160 170 180 190 200 330 340 350 360 370 380 KIAA03 CRWASQQQRSDLNHSEHHDHAIFLTRQDFGPAGMQ----GYAPVTGMCHPVRSCTLNHED :.: :. .. . ::: :..:::::. : . : : . .: : :::...... KIAA13 CQW---QHSKNSPGGIHHDTAVLLTRQDICRAHDKCDTLGLAELGTICDPYRSCSISEDS 210 220 230 240 250 260 390 400 410 420 430 440 KIAA03 GFSSAFVVAHETGHVLGMEHDGQGNRCGDETAMGS--VMAPLVQAAFHRYHWSRCSGQEL :.:.::..::: :::..: :: ..:.: .: . . :::: .. . . ::.:: . . KIAA13 GLSTAFTIAHELGHVFNMPHD-DNNKCKEEGVKSPQHVMAPTLNFYTNPWMWSKCSRKYI 270 280 290 300 310 320 450 460 470 480 490 KIAA03 KRYIHS-Y-DCLLDDPFDHDWPKLP-ELPGINYSMDEQCRFDFGVGYKMCTAFRTFDPCK ... . : .:::..: .. .: :: .:::: :....::.. :: : ..: . :. KIAA13 TEFLDTGYGECLLNEPESRPYP-LPVQLPGILYNVNKQCELIFGPGSQVCPYMMQ---CR 330 340 350 360 370 380 500 510 520 530 540 550 KIAA03 QLWCSHPDNPYF-CKTKKGPPLDGTECAAGKWCYKGHCMWKNANQQKQDGNWGSWTKFGS .:::.. .. . :.:.. : ::::: :: : : :. :. . ::.::::. ::. KIAA13 RLWCNNVNGVHKGCRTQHTPWADGTECEPGKHCKYGFCVPKEMDVPVTDGSWGSWSPFGT 390 400 410 420 430 440 560 570 580 590 600 610 KIAA03 CSRTCGTGVRFRTRQCNNPMPINGGQDCPGVNFEYQLCNTEECQKHFEDFRAQQCQQRNS :::::: :.. :.:: : : :::. : : .... :::: : :. .::: .:: . .. KIAA13 CSRTCGGGIKTAIRECNRPEPKNGGKYCVGRRMKFKSCNTEPCLKQKRDFRDEQCAHFDG 450 460 470 480 490 500 620 630 640 650 660 670 KIAA03 -HFEYQNTKHH--WLP-YEHPDPKKRCHLYCQSKETGDVAY--MKQLVHDGTHCSYKDPY ::. .. . :.: : : ::.:.: . .:..:: ... : ::: :. .: KIAA13 KHFNINGLLPNVRWVPKYSGILMKDRCKLFC--RVAGNTAYYQLRDRVIDGTPCG-QDTN 510 520 530 540 550 680 690 700 710 720 730 KIAA03 SICVRGECVKVGCDKEIGSNKVEDKCGVCGGDNSHCRTVKGTFTRTPRKLGYLKMFDIPP .:::.: : ..:::. ..:. .::::::::::: :.:: :::. . . :: . :: KIAA13 DICVQGLCRQAGCDHVLNSKARRDKCGVCGGDNSSCKTVAGTFNTV--HYGYNTVVRIPA 560 570 580 590 600 610 740 750 760 770 780 KIAA03 GARHVLIQEDEAS-----PHILAIKNQATGHYILNGKGEEAKSRTFIDLG---VEWD--- :: .. ... : . ::... . :...:::. . .. : .: ::.. KIAA13 GATNIDVRQHSFSGETDDDNYLALSS-SKGEFLLNGNFVVTMAKREIRIGNAVVEYSGSE 620 630 640 650 660 670 790 800 810 KIAA03 -----YNIEDDIES-----LHTDGPLHDPVI--VLIIPQEN------------------- : : ::. . . : :..: . . :: :. KIAA13 TAVERINSTDRIEQELLLQVLSVGKLYNPDVRYSFNIPIEDKPQQFYWNSHGPWQACSKP 680 690 700 710 720 730 820 830 840 850 KIAA03 ---DTRSSL-----TYKYIIHEDSVPTINSNNVIQEELDT---FEWALKSWSQVSKPCGG . . .: . . . .. . . . : : : ..: . : :. : :: KIAA13 CQGERKRKLVCTRESDQLTVSDQRCDRLPQPGHITEPCGTDCDLRWHVASRSECSAQCGL 740 750 760 770 780 790 860 870 880 890 900 910 KIAA03 GFQYTKYGCRRKS--DNKM--VHRSFCEANKKPKPIRRMCNIQECTHPLWVAEEWEHCTK :.. : . : :.: : .:: .. ::. :. :. ::. : : .:.: KIAA13 GYRTLDIYCAKYSRLDGKTEKVDDGFCSSHPKPSN-REKCS-GECNTGGWRYSAWTECSK 800 810 820 830 840 850 920 930 940 950 960 970 KIAA03 TCGSSGYQLRTVRCLQPLLDGTNRSVHSKYCMGDRPESRRPCNRVPCPAQWKTGPWSECS .: ..: : : . :. . : . .. : .. . . :.. ::: :::.: :::: KIAA13 SC-DGGTQRRRAICV----NTRNDVLDDSKCTHQEKVTIQRCSEFPCP-QWKSGDWSECL 860 870 880 890 900 980 990 1000 1010 1020 KIAA03 VTCGEGTEVRQVLCRAGDH------CDGE-KPESVRACQLPPCNDEPC--LGDKSIFCQM ::::.: . ::: :. :. :: : :: :...:: : : . :. :. : . KIAA13 VTCGKGHKHRQVWCQFGEDRLNDRMCDPETKPTSMQTCQQPECASWQAGPWGQCSVTCGQ 910 920 930 940 950 960 1030 1040 1050 1060 1070 KIAA03 --EVLARYCSIPGYNKLC----CESCSKRSSTL--------PPPYLLEAAETHDDVISNP .. : : : : .. :.. .. ..: ::: : ::. .. : : KIAA13 GYQLRAVKCIIGTYMSVVDDNDCNAATRPTDTQDCELPSCHPPP---AAPETRRSTYSAP 970 980 990 1000 1010 1020 1080 1090 1100 1110 1120 1130 KIAA03 SDLPRSLVMPTSLVPYHSETPAKKMSLSSISSVGGPNAYAAFRPNSKPDGANLRQRSAQQ KIAA13 RTQWRFGSWTPCSATCGKGTRMRYVSCRDENGSVADESACATLPRPVAKEECSVTPCGQW 1030 1040 1050 1060 1070 1080 >>KIAA1346 ( 999 res) fj00671 (999 aa) initn: 1008 init1: 239 opt: 1429 Z-score: 1245.2 bits: 242.2 E(): 3.1e-64 Smith-Waterman score: 1498; 31.637% identity (59.845% similar) in 904 aa overlap (82-930:112-968) 60 70 80 90 100 110 KIAA03 YLSHTLSASHKKRSARDVSSNPEQLFFNITAFGKDFHLRLKPNTQLVAPGAVVEWHETSL :: ... :.:.:.....::: ... KIAA13 LGRPSEEDEELVVPELERAPGHGTTRLRLHAFDQQLDLELRPDSSFLAPGFTLQ------ 90 100 110 120 130 120 130 140 150 160 170 KIAA03 VPGNITDPINNHQPGSATYRIRKTEPLQTNCAYVGDIVDIPGTSVAISNCDGLAGMIKSD :. ... :: : : ..: : : . :....:.: :.:. : . KIAA13 ---NV-----GRKSGSETPL---PETDLAHCFYSGTVNGDPSSAAALSLCEGVRGAFYLL 140 150 160 170 180 180 190 200 210 KIAA03 NEEYFIEPL----ER-GKQMEEEKG----RIHVVYKR---------SAVEQAPIDMSKDF .: :::.:: :: . :: ..:.. . ..:.. : .: KIAA13 GEAYFIQPLPAASERLATAAPGEKPPAPLQFHLLRRNRQGDVGGTCGVVDDEPRPTGKAE 190 200 210 220 230 240 220 230 240 250 260 KIAA03 HYRESD-LEGLDD------LGTVYGNIHQQLNE-TMRRRRHAGENDYNIEVLLGVDDSVV :.. :: :. . .. : . ..:..: .. . : .:..: .:.:.. KIAA13 TEDEDEGTEGEDEGPQWSPQDPALQGVGQPTGTGSIRKKRFVSSHRY-VETMLVADQSMA 250 260 270 280 290 300 270 280 290 300 310 320 KIAA03 RFHGKEHVQNYLLTLMNIVNEIYHDESLGVHINVVLVRMIMLGYAKSISLIERGNPSRSL .:::. ...:::::.... ..:. :. ...:.:..... .. . .: . .: KIAA13 EFHGS-GLKHYLLTLFSVAARLYKHPSIRNSVSLVVVKILVIHDEQKGPEVT-SNAALTL 310 320 330 340 350 360 330 340 350 360 370 380 KIAA03 ENVCRWASQQQRSDLNHSEHHDHAIFLTRQDFGPAGMQ-----GYAPVTGMCHPVRSCTL .: : : .:.. . .::.: ::..::::. : : :.: : .: : :::.. KIAA13 RNFCNWQKQHNPPSDRDAEHYDTAILFTRQDL--CGSQTCDTLGMADVGTVCDPSRSCSV 370 380 390 400 410 390 400 410 420 430 KIAA03 NHEDGFSSAFVVAHETGHVLGMEHDGQGNRCGDETAMGS---VMAPLVQAAFHRYHWSRC ..::...::..::: :::..: :: ....:.. ..... .:: ... : :: : KIAA13 IEDDGLQAAFTTAHELGHVFNMPHD-DAKQCASLNGVNQDSHMMASMLSNLDHSQPWSPC 420 430 440 450 460 470 440 450 460 470 480 490 KIAA03 SGQELKRYIHSY--DCLLDDPFDHDWPKLP-ELPGINYSMDEQCRFDFGVGYKMCTAFRT :. . .. . .::.: : .. .:: .::: .:. ..::.: :: : : . KIAA13 SAYMITSFLDNGHGECLMDKP--QNPIQLPGDLPGTSYDANRQCQFTFGEDSKHCPDAAS 480 490 500 510 520 530 500 510 520 530 540 KIAA03 FDPCKQLWCSHPDNPYF-CKTKKGPPLDGTECAAGKWCYKGHCMWKNANQQKQD----GN :. :::. .. . :.::. : ::: :. :::: .:.:. :. .... : :. KIAA13 --TCSTLWCTGTSGGVLVCQTKHFPWADGTSCGEGKWCINGKCVNKT-DRKHFDTPFHGS 540 550 560 570 580 590 550 560 570 580 590 600 KIAA03 WGSWTKFGSCSRTCGTGVRFRTRQCNNPMPINGGQDCPGVNFEYQLCNTEEC-QKHFEDF :: : .:.:::::: ::.. :.:.::.: :::. : : .:. :: :.: ... . : KIAA13 WGMWGPWGDCSRTCGGGVQYTMRECDNPVPKNGGKYCEGKRVRYRSCNLEDCPDNNGKTF 600 610 620 630 640 650 610 620 630 640 650 660 KIAA03 RAQQCQQRN--SHFEYQNTKH-HWLP-YEHPDPKKRCHLYCQSKETGDVAYMKQLVHDGT : .::. .: :. . . .:.: : .:: ::.: ::.: : .. : ::: KIAA13 REEQCEAHNEFSKASFGSGPAVEWIPKYAGVSPKDRCKLICQAKGIGYFFVLQPKVVDGT 660 670 680 690 700 710 670 680 690 700 710 720 KIAA03 HCSYKDPYSICVRGECVKVGCDKEIGSNKVEDKCGVCGGDNSHCRTVKGTFTRTPRKLGY :: : :.::.:.:::.:::. : :.: ::::::::..: :. ..:. : . : :: KIAA13 PCS-PDSTSVCVQGQCVKAGCDRIIDSKKKFDKCGVCGGNGSTCKKISGSVTSA--KPGY 720 730 740 750 760 770 730 740 750 760 770 KIAA03 LKMFDIPPGARHVLIQE-----DEASPHILAIKNQATGHYILNGKGEEAK-SRTFIDLGV .. :: :: .. ... .. . .:::: : : ::::: . . .. :: KIAA13 HDIITIPTGATNIEVKQRNQRGSRNNGSFLAIKA-ADGTYILNGDYTLSTLEQDIMYKGV 780 790 800 810 820 780 790 800 810 820 830 KIAA03 EWDYNIEDD-IESLHTDGPLHDPVIVLIIPQENDTRSSLTYKYIIHEDSVPTINSNNVIQ :. . .: ... .::..:. . .. : : .. : :.... . .: :.: KIAA13 VLRYSGSSAALERIRSFSPLKEPLTIQVLTVGNALRPKIKYTYFVKKKK----ESFNAIP 830 840 850 860 870 880 840 850 860 870 880 890 KIAA03 EELDTFE-WALKSWSQVSKPCGGGFQYTKYGCRRKSDNKMVHRSFCEANKKPKPIRRMCN :: :... :.. :: : :.: :: : . : : . :: : : KIAA13 ----TFSAWVIEEWGECSKSCELGWQRRLVECR---DINGQPASECAKEVKPASTRP-CA 890 900 910 920 930 900 910 920 930 940 950 KIAA03 IQECTHPLWVAEEWEHCTKTCGSSGYQLRTVRCLQPLLDGTNRSVHSKYCMGDRPESRRP . : : : :: :.::::. ::. :...:: KIAA13 DHPC--PQWQLGEWSSCSKTCGK-GYKKRSLKCLSHDGGVLSHESCDPLKKPKHFIDFCT 940 950 960 970 980 990 960 970 980 990 1000 1010 KIAA03 CNRVPCPAQWKTGPWSECSVTCGEGTEVRQVLCRAGDHCDGEKPESVRACQLPPCNDEPC KIAA13 MAECS >>KIAA2029 ( 1021 res) pj01256 (1021 aa) initn: 819 init1: 325 opt: 1362 Z-score: 1186.9 bits: 231.4 E(): 5.4e-61 Smith-Waterman score: 1700; 33.801% identity (59.883% similar) in 855 aa overlap (244-1062:80-905) 220 230 240 250 260 270 KIAA03 HYRESDLEGLDDLGTVYGNIHQQLNETMRRRRHAGENDYNIEVLLGVDDSVVRFHGKEHV : : .: . :.:.:. :: .... ::.:.. KIAA20 KKYMPQPPKEDLFILPDEYKSCLRHKRSLLRYHRNE-ELNVETLVVVDKKMMQNHGHENI 50 60 70 80 90 100 280 290 300 310 320 330 KIAA03 QNYLLTLMNIVNEIYHDESLGVHINVVLVRMIMLGYAKSISLIERGNPSRSLENVCRWAS .:.::..:.:. ...: ..: .::...: .:.: . .:. . ...: . :.: : KIAA20 TTYVLTILNMVSALFKDGTIGGNINIAIVGLILLEDEQP-GLVISHHADHTLSSFCQWQS 110 120 130 140 150 160 340 350 360 370 380 KIAA03 QQQRSDLNHSEHHDHAIFLTRQDFG-----PAGMQGYAPVTGMCHPVRSCTLNHEDGFSS . .: . .:::::.:: :. : :.::..::: ::::.:.. :.. KIAA20 GLMGKD---GTRHDHAILLTGLDICSWKNEPCDTLGFAPISGMCSKYRSCTINEDTGLGL 170 180 190 200 210 220 390 400 410 420 430 440 KIAA03 AFVVAHETGHVLGMEHDGQGNRCGDETAMGSVMAPLVQAAFHRYHWSRCSGQELKRYIHS ::..:::.:: .:: :::.:: : . . :..:.: . . . :: :: : :.... . KIAA20 AFTIAHESGHNFGMIHDGEGNMC--KKSEGNIMSPTLAGRNGVFSWSPCSRQYLHKFLST 230 240 250 260 270 280 450 460 470 480 490 500 KIAA03 YD--CLLDDPFDHDWPKLPE-LPGINYSMDEQCRFDFGVGYKMCTAFRTFDPCKQLWCSH . :: :.: : :: ::: :. . ::...:: :.: : :: ::: . KIAA20 AQAICLADQPKPVKEYKYPEKLPGELYDANTQCKWQFGEKAKLCMLDFKKDICKALWCHR 290 300 310 320 330 340 510 520 530 540 550 560 KIAA03 PDNPYFCKTKKGPPLDGTECAAGKWCYKGHCM-WKNANQQKQDGNWGSWTKFGSCSRTCG :.:: : .:: :. :: :.:. . . . . :.:..:.... :::::: KIAA20 IGRK--CETKFMPAAEGTICGHDMWCRGGQCVKYGDEGPKPTHGHWSDWSSWSPCSRTCG 350 360 370 380 390 400 570 580 590 600 610 620 KIAA03 TGVRFRTRQCNNPMPINGGQDCPGVNFEYQLCNTEECQKHFEDFRAQQCQQRNSHFEYQN :: :.: :.:: : .::. : : . .:::...: . :::: :: ..::. .... KIAA20 GGVSHRSRLCTNPKPSHGGKFCEGSTRTLKLCNSQKCPRDSVDFRAAQCAEHNSR-RFRG 410 420 430 440 450 630 640 650 660 670 680 KIAA03 TKHHWLPYEHPDPKKRCHLYCQSKETGDVAY-MKQLVHDGTHCSYKDPYSICVRGECVKV ...: :: . . . :.::: . : : . ... :.::: :: .: ..:. : : .: KIAA20 RHYKWKPYTQVEDQDLCKLYCIA-EGFDFFFSLSNKVKDGTPCS-EDSRNVCIDGICERV 460 470 480 490 500 510 690 700 710 720 730 740 KIAA03 GCDKEIGSNKVEDKCGVCGGDNSHCRTVKGTFTRTPRKLGYLKMFDIPPGARHVLIQEDE :::. .::. ::: ::::.:.:: : .: .:. . : .: :: ::: . : : . KIAA20 GCDNVLGSDAVEDVCGVCNGNNSACTIHRGLYTKHHHTNQYYHMVTIPSGARSIRIYEMN 520 530 540 550 560 570 750 760 770 780 790 800 KIAA03 ASPHILAIKNQATGHYILNGKGEEAKSRTFIDLGVEWDYNIE-DDIESLHTDGPLHDPVI .: ....: : .: :::. . :. .:: .. :.: . :: .. .: KIAA20 VSTSYISVRN-ALRRYYLNGHWTVDWPGRYKFSGTTFDYRRSYNEPENLIATGPTNETLI 580 590 600 610 620 630 810 820 830 840 850 860 KIAA03 VLIIPQENDTRSSLTYKYIIHEDSVPTINSNNVIQEELDTFEWALKSWSQVSKPCGGGFQ : .. : . .....: :.: ..... . .. ::. :. : :::: . KIAA20 VELLFQGRNP--GVAWEY-----SMPRLGTEKQPPAQ-PSYTWAIVR-SECSVSCGGGQM 640 650 660 670 680 870 880 890 900 910 KIAA03 YTKYGCRRKSDNKM-VHRSFCEANKKPKPIRRM--CNIQECTHPLWVAEEWEHCTKTCGS .. :: : : :. :. ::: : : .:. . :... : : : . .: :..:::. KIAA20 TVREGCYR--DLKFQVNMSFC--NPKTRPVTGLVPCKVSACP-PSWSVGNWSACSRTCGG 690 700 710 720 730 740 920 930 940 950 960 970 KIAA03 SGYQLRTVRCLQPLLDGTNRSVHSKYCMGDRPESRRPCNRVPCPAQWKTGPWSECSVTCG : : : :.: . . .. : .. : : ::. :: :: :..:::.::: ::: KIAA20 -GAQSRPVQCTRRV-HYDSEPVPASLCPQPAPSSRQACNSQSCPPAWSAGPWAECSHTCG 750 760 770 780 790 800 980 990 1000 1010 1020 KIAA03 EGTEVRQVLCRAGDH-----------CDGE-KPESVRACQLPPCNDEPCL-------GDK .: . : : :.. . : .: ::. .:: : :. : .. KIAA20 KGWRKRAVACKSTNPSARAQLLPDAVCTSEPKPRMHEACLLQRCHKPKKLQWLVSAWSQC 810 820 830 840 850 860 1030 1040 1050 1060 1070 KIAA03 SIFCQMEVLARY--CSIPGYNKLCCESCSKRSSTLPPPYL-LEAAETHDDVISNPSDLPR :. :. . :. :. . : ::. : :: : : :: : KIAA20 SVTCERGTQKRFLKCAEKYVSGKYRELASKKCSHLPKPSLELERACAPLPCPRHPPFAAA 870 880 890 900 910 920 1080 1090 1100 1110 1120 1130 KIAA03 SLVMPTSLVPYHSETPAKKMSLSSISSVGGPNAYAAFRPNSKPDGANLRQRSAQQAGSKT KIAA20 GPSRGSWFASPWSQCTASCGGGVQTRSVQCLAGGRPASGCLLHQKPSASLACNTHFCPIA 930 940 950 960 970 980 >>KIAA0688 ( 849 res) hk03410 (849 aa) initn: 846 init1: 248 opt: 1130 Z-score: 986.0 bits: 194.0 E(): 8.4e-50 Smith-Waterman score: 1226; 31.378% identity (56.505% similar) in 784 aa overlap (70-822:87-814) 40 50 60 70 80 90 KIAA03 LVTPVSTNLEGRYLSHTLSASHKKRSARDVSSNPEQLFFNITAFGKDFHLRLKPNTQLVA :..: .:. . :::. . :.:. .. . . KIAA06 LLPSARLASPLPREEEIVFPEKLNGSVLPGSGTPARLLCRLQAFGETLLLELEQDSGVQV 60 70 80 90 100 110 100 110 120 130 140 150 KIAA03 PGAVVEWHETSLVPGNITDPINNHQPGSATYRIRKTEPLQTNCAYVGDIVDIPGTSVAIS : .:.. :. . ... .:: :: .: : : ::: KIAA06 EGLTVQYL------GQAPELLGGAEPG--TY-------------LTGTINGDP-ESVASL 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 KIAA03 NCDG--LAGMIKSDNEEYFIEPLERGKQMEEEKGRIHVVYKRS-AVEQAPIDMSKDFHYR . :: : :... . : ..::: : :.. ..: : :.:. : KIAA06 HWDGGALLGVLQYRGAELHLQPLEGGTPNSAGGPGAHILRRKSPASGQGPMCNVKA---- 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 KIAA03 ESDLEGLDDLGTVYGNIHQQLNETMRRRRHAGENDYNIEVLLGVDDSVVRFHGKEHVQNY ::. . : .: :. . . .:.:. .::... ::: .. : KIAA06 --------PLGS-------PSPRPRRAKRFASLSRF-VETLVVADDKMAAFHGA-GLKRY 220 230 240 250 280 290 300 310 320 330 KIAA03 LLTLMNIVNEIYHDESLGVHINVVLVRMIMLGYAKSISLIERGNPS--RSLENVCRWASQ :::.: . . .. :. ...:..:...:: .. . .:: ..:.. : : KIAA06 LLTVMAAAAKAFKHPSIRNPVSLVVTRLVILGSGEEGPQV---GPSAAQTLRSFCAWQRG 260 270 280 290 300 310 340 350 360 370 380 390 KIAA03 QQRSDLNHSEHHDHAIFLTRQDF---GPAGMQGYAPVTGMCHPVRSCTLNHEDGFSSAFV . . . .: : ::..::::. . :.: : .: :.:::.. ..::..:::. KIAA06 LNTPEDSDPDHFDTAILFTRQDLCGVSTCDTLGMADVGTVCDPARSCAIVEDDGLQSAFT 320 330 340 350 360 370 400 410 420 430 440 KIAA03 VAHETGHVLGMEHDGQGNRC----GDETAMGSVMAPLVQAAFHRYHWSRCSGQELKRYI- .::: :::..: ::.. . : : .. ::::.. . . :: ::.. . .. KIAA06 AAHELGHVFNMLHDNS-KPCISLNGPLSTSRHVMAPVMAHVDPEEPWSPCSARFITDFLD 380 390 400 410 420 450 460 470 480 490 500 KIAA03 HSYD-CLLDDPFDHDWP-KLP-ELPGINYSMDEQCRFDFGVGYKMCTAFRTFDPCKQLWC ..: :::: : . : .:: .:: .:. :.::.. :: . : . :: ::: KIAA06 NGYGHCLLDKP---EAPLHLPVTFPGKDYDADRQCQLTFGPDSRHCPQLPP--PCAALWC 430 440 450 460 470 480 510 520 530 540 550 KIAA03 S-HPDNPYFCKTKKGPPLDGTECAAGKWCYKGHCMWKNANQQ---KQDGNWGSWTKFGSC : : .. .:.::..: ::: :. .. :. :.:. . :. : :.:: : .:.: KIAA06 SGHLNGHAMCQTKHSPWADGTPCGPAQACMGGRCLHMDQLQDFNIPQAGGWGPWGPWGDC 490 500 510 520 530 540 560 570 580 590 600 610 KIAA03 SRTCGTGVRFRTRQCNNPMPINGGQDCPGVNFEYQLCNTEECQKHFE-DFRAQQC---QQ ::::: ::.: .:.:. :.: :::. : : ... ::::.: :: .:: .. KIAA06 SRTCGGGVQFSSRDCTRPVPRNGGKYCEGRRTRFRSCNTEDCPTGSALTFREEQCAAYNH 550 560 570 580 590 600 620 630 640 650 660 670 KIAA03 RNSHFEYQNTKHHWLP-YEHPDPKKRCHLYCQSKETGDVAYMKQLVHDGTHCSYKDPYSI :.. :. :.: : :. .:.: ::.. : .. : ::: :: : :. KIAA06 RTDLFKSFPGPMDWVPRYTGVAPQDQCKLTCQARALGYYYVLEPRVVDGTPCS-PDSSSV 610 620 630 640 650 660 680 690 700 710 720 730 KIAA03 CVRGECVKVGCDKEIGSNKVEDKCGVCGGDNSHCRTVKGTFTRTPRKLGYLKMFDIPPGA ::.:.:...:::. :::.: ::: :::::.: : .:.: . . :: .. :: :: KIAA06 CVQGRCIHAGCDRIIGSKKKFDKCMVCGGDGSGCSKQSGSFRKF--RYGYNNVVTIPAGA 670 680 690 700 710 720 740 750 760 770 780 KIAA03 RHVLIQEDEASPH---ILAIKNQATGHYILNGKGEEAKSRTFIDL--GVEWDYNIEDDI- :.:.... : ::.: : : :::. : : . : .: :. KIAA06 THILVRQQGNPGHRSIYLALK-LPDGSYALNGEYTLMPSPTDVVLPGAVSLRYSGATAAS 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 KIAA03 ESLHTDGPLHDPVIVLIIPQENDTRSSLTYKYIIHEDSVPTINSNNVIQEELDTFEWALK :.: ::: .:. . .. : . : :.... KIAA06 ETLSGHGPLAQPLTLQVLVAGNPQDTRLRYSFFVPRPTPSTPRPTPQDWLHRRAQILEIL 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 KIAA03 SWSQVSKPCGGGFQYTKYGCRRKSDNKMVHRSFCEANKKPKPIRRMCNIQECTHPLWVAE KIAA06 RRRPWAGRK >>KIAA0605 ( 1031 res) hg03238a (1031 aa) initn: 809 init1: 275 opt: 579 Z-score: 506.5 bits: 105.5 E(): 4.3e-23 Smith-Waterman score: 616; 25.138% identity (42.265% similar) in 724 aa overlap (550-1025:130-845) 520 530 540 550 560 570 KIAA03 LDGTECAAGKWCYKGHCMWKNANQQKQDGNWGSWTKFGSCSRTCGTGVRFRTRQC----N :: :::. . ::.:: :: . :.: KIAA06 VAGDTVSTGSTDNSPTSNSLEGGTDATAFWWGEWTKWTAFSRSCGGGVTSQERHCLQQRR 100 110 120 130 140 150 580 590 600 610 620 630 KIAA03 NPMPINGGQDCPGVNFEYQLCNTEECQKHFEDFRAQQCQQRNSHFEYQNTKHHWLPYEHP . .: :.. : :.. .:::: ..:: ..:: .:: . ::: :.. :.: : .: KIAA06 KSVPGPGNRTCTGTSKRYQLCRVQECPPDGRSFREEQCVSFNSHV-YNGRTHQWKPL-YP 160 170 180 190 200 210 640 650 660 670 680 690 KIAA03 DP-----KKRCHLYCQSKETGDVAYMKQLVHDGTHCSYKDPYSICVRGECVKVGCDKEIG : .: : :.: . . :. : ..::: :. : ..:: :.: .::: . KIAA06 DDYVHISSKPCDLHCTTVD-GQRQLMVP-ARDGTSCKLTDLRGVCVSGKCEPIGCDGVLF 220 230 240 250 260 270 700 710 720 730 740 750 KIAA03 SNKVEDKCGVCGGDNSHCRTVKGTFTRTPRKLGYLKMFDIPPGARHVLIQEDEASPHILA :... ::::.: ::.: : : :.. . .::: . :: ::: . : : . : .:: KIAA06 STHTLDKCGICQGDGSSCTHVTGNYRKGNAHLGYSLVTHIPAGARDIQIVERKKSADVLA 280 290 300 310 320 330 760 770 KIAA03 IKNQATGHYILNGK------------GEEAKSRTFIDL---GVE---------------- . ..: :.:..::. : .: : .:. :.: KIAA06 LADEA-GYYFFNGNYKVDSPKNFNIAGTVVKYRRPMDVYETGIEYIVAQGPTNQGLNVMV 340 350 360 370 380 390 780 790 KIAA03 WD---------------------------YNIEDDIESLHTDG----------------- :. :.. .. :: :: KIAA06 WNQNGKSPSITFEYTLLQPPHESRPQPIYYGFSESAESQGLDGAGLMGFIPHNGSLYGQA 400 410 420 430 440 450 KIAA03 ----------------------------------------------------------PL :: KIAA06 SSERLGLDNRLFGHPGLDMELGPSQGQETNEVCEQAGGGACEGPPRGKGFRDRNVTGTPL 460 470 480 490 500 510 800 810 KIAA03 -----HDPVIVLIIPQE-----------------------NDT----------RSSLTYK . : . . :: :.: ::::. . KIAA06 TGDKDDEEVDTHFASQEFFSANAISDQLLGAGSDLKDFTLNETVNSIFAQGAPRSSLAES 520 530 540 550 560 570 820 830 840 KIAA03 YII----HEDSVPTI--------------NSN------NVIQEEL--------------- ... .: . : . ::. :: : KIAA06 FFVDYEENEGAGPYLLNGSYLELSSDRVANSSSEAPFPNVSTSLLTSAGNRTHKARTRPK 580 590 600 610 620 630 850 860 870 880 890 KIAA03 ---------DTFEWALKSWSQVSKPCGGGFQYTKYGCRRKSDNKMVHRSFCEANKKPKPI : ..: :.: : : : . . : : :. : :.:.: .:.:. KIAA06 ARKQGVSPADMYRWKLSSHEPCSATCTTGVMSAYAMCVRY-DGVEVDDSYCDALTRPEPV 640 650 660 670 680 690 900 910 920 930 940 KIAA03 RRMCNIQECTHPLWVAEEWEHCTKTCGSSGYQLRTVRCLQPLLDGTNRSVHSKYCMGD-- ...: .:: .: : . : .:..::: :::.:.::: . : : . ::.: : . KIAA06 HEFCAGREC-QPRWETSSWSECSRTCGE-GYQFRVVRCWKMLSPGFDSSVYSDLCEAAEA 700 710 720 730 740 750 950 960 970 980 990 1000 KIAA03 -RPESRRPCNRVPCPAQWKTGPWSECSVTCGEGTEV-RQVLCRAGDH-CD-GEKPESVRA ::: :. : : ::. . ::::.. ::: . : :.. : .. :: . .: . . KIAA06 VRPEERKTCRNPACGPQWEMSEWSECTAKCGERSVVTRDIRCSEDEKLCDPNTRPVGEKN 760 770 780 790 800 810 1010 1020 1030 1040 1050 KIAA03 CQLPPCNDE-------PCLGD-------KSIFCQMEVLARYCSIPGYNKLCCESCSKRSS : :::. . :: :. . ..:. KIAA06 CTGPPCDRQWTVSDWGPCSGSCGQGRTIRHVYCKTSDGRVVPESQCQMETKPLAIHPCGD 820 830 840 850 860 870 1060 1070 1080 1090 1100 1110 KIAA03 TLPPPYLLEAAETHDDVISNPSDLPRSLVMPTSLVPYHSETPAKKMSLSSISSVGGPNAY KIAA06 KNCPAHWLAQDWERCNTTCGRGVKKRLVLCMELANGKPQTRSGPECGLAKKPPEESTCFE 880 890 900 910 920 930 >>KIAA1233 ( 1023 res) fh08611 (1023 aa) initn: 465 init1: 184 opt: 284 Z-score: 250.2 bits: 58.1 E(): 8e-09 Smith-Waterman score: 379; 32.778% identity (56.111% similar) in 180 aa overlap (845-1012:39-213) 820 830 840 850 860 870 KIAA03 SLTYKYIIHEDSVPTINSNNVIQEELDTFEWALKSWSQVSKPCGGGFQYTKYGCRRKSDN : . ::. : :: :.: : . ... KIAA12 QQTVNDSLCDMVHRPPAMSQACNTEPCPPRWHVGSWGPCSATCGVGIQTRDVYCLHPGET 10 20 30 40 50 60 880 890 900 910 920 930 KIAA03 KMVHRSFCEANKKPKPIRRMCNIQECTHPLWVAEEWEHCTKTCGSSGYQLRTVRCLQPLL . :. ..::. .. :: .: : : :::..:..:::. : : : : : : : KIAA12 PAPPEE-CR-DEKPHALQ-ACNQFDCP-PGWHIEEWQQCSRTCGG-GTQNRRVTCRQLLT 70 80 90 100 110 120 940 950 960 970 980 990 KIAA03 DGTNRSVHSKYCMGDRPESRRPCNRVPCPAQWKTGPWSECSVTCGEGTEVRQVLCRAGDH ::. .. .. :.: . :.. : :. :: . .: ::.:::.:: : . :. .:. KIAA12 DGSFLNLSDELCQGPKASSHKSCARTDCPPHLAVGDWSKCSVSCGVGIQRRKQVCQRLAA 130 140 150 160 170 180 1000 1010 1020 1030 1040 KIAA03 CDGEKPES------------VRACQLPPCNDEPCLGDKSIFCQMEVLARYCSIPGYNKLC . : : ::.::.: :. KIAA12 KGRRIPLSEMMCRDLPGLPLVRSCQMPECSKIKSEMKTKLGEQGPQILSVQRVYIQTREE 190 200 210 220 230 240 >>KIAA0960 ( 1502 res) hj05779s1 (1502 aa) initn: 242 init1: 95 opt: 269 Z-score: 235.7 bits: 56.0 E(): 5.2e-08 Smith-Waterman score: 333; 23.387% identity (49.798% similar) in 496 aa overlap (550-1023:622-1065) 520 530 540 550 560 570 KIAA03 LDGTECAAGKWCYKGHCMWKNANQQKQDGNWGSWTKFGSCSRTCGTG---VRFRTRQ-CN ...:: :: .: : .: ..:. KIAA09 VGPKKCPESLRPETVRPCLLPCKKDCIVTPYSDWT---SCPSSCKEGDSSIRKQSRHRVI 600 610 620 630 640 580 590 600 610 620 630 KIAA03 NPMPINGGQDCPGVNFEYQLCNTEE-CQKH-FEDFRAQQCQQRNSHFEYQNTKHHWLPYE .: :::.:: .: . :.. . ::.. .. . ..:: . :. . KIAA09 IQLPANGGRDCTDPLYEEKACEAPQACQSYRWKTHKWRRCQL--VPWSVQQDSPGAQEGC 650 660 670 680 690 700 640 650 660 670 680 690 KIAA03 HPDPKKRCHLYCQSKETGDVAYMKQLVHDGTHC-SYKDPYSICVRGECVKVGCDKEIGSN : . : . :.... :... .:. : .: : ... : .. :. . . KIAA09 GPGRQARA-ITCRKQDGGQAG-----IHE---CLQYAGPVPALTQA-C-QIPCQDDCQLT 710 720 730 740 750 700 710 720 730 740 750 KIAA03 KVEDKCGVCGGDNSHCRTVKGTFTRTPRKLGYLKMFDIPPGARHVLIQEDEASPHILAIK . .: . :.:: . :: : :.. .: : . : :: : . : . KIAA09 SW-SKFSSCNGDCGAVRTRKRTLVGKSKKKEKCKNSHLYP-----LI-ETQYCP-CDKYN 760 770 780 790 800 760 770 780 790 800 810 KIAA03 NQATGHYILNGKGEEAKSRTFIDLGVEWDYNIEDDIESLHTDG-PLHDPVIVLIIPQEND : .:.. . :.: .... . :. : :.. .. . .. .: :. . KIAA09 AQPVGNWS-DCILPEGKVEVLLGMKVQGD--IKECGQGYRYQAMACYDQNGRLV-----E 810 820 830 840 850 820 830 840 850 860 870 KIAA03 TRSSLTYKYIIHEDSVPTINSNNVIQEELDTFEWALKSWSQVSKPCGGGFQYTKYGCRRK : .. :: . .: .. .. ::. .::. :: ::.: . . :.: KIAA09 TSRCNSHGYIEEACIIPCPSDCKLS-------EWS--NWSRCSKSCGSGVKVRSKWLREK 860 870 880 890 900 910 880 890 900 910 920 KIAA03 SDNKMVHRSFCEANKKPKPIRRM-CNIQECTHPLWVAEEWEHCTKT-------CGSSGYQ : . .. . . . :. ..:.. :::.: : : : :: : : KIAA09 PYNGGRPCPKLDHVNQAQVYEVVPCH-SDCNQYLWVTEPWSICKVTFVNMRENCGE-GVQ 920 930 940 950 960 930 940 950 960 970 KIAA03 LRTVRCLQPLLDGTNRSVHSKYCMGDR-PESRRPCNRVPCP-----AQWKTGPWSECSVT : :::.: :: .. :.. : .. : . : : ..::: ..: :::..: . KIAA09 TRKVRCMQNTADGPSEHVEDYLCDPEEMPLGSRVC-KLPCPEDCVISEW--GPWTQCVLP 970 980 990 1000 1010 1020 980 990 1000 1010 1020 1030 KIAA03 CGEGTEVRQVLCRAGDHCDGEKPESVRACQLPPCNDEPCLGDKSIFCQMEVLARYCSIPG :.... :: :..: :. :.: . ::: .:. . KIAA09 CNQSS-FRQ---RSADPIRQPADEG-RSCP-NAVEKEPCNLNKNCYHYDYNVTDWSTCQL 1030 1040 1050 1060 1070 1040 1050 1060 1070 1080 1090 KIAA03 YNKLCCESCSKRSSTLPPPYLLEAAETHDDVISNPSDLPRSLVMPTSLVPYHSETPAKKM KIAA09 SEKAVCGNGIKTRMLDCVRSDGKSVDLKYCEALGLEKNWQMNTSCMVECPVNCQLSDWSP 1080 1090 1100 1110 1120 1130 >>KIAA0762 ( 724 res) hk04668s1 (724 aa) initn: 334 init1: 95 opt: 255 Z-score: 226.4 bits: 53.2 E(): 1.7e-07 Smith-Waterman score: 261; 29.545% identity (54.545% similar) in 176 aa overlap (844-1011:423-582) 820 830 840 850 860 870 KIAA03 SSLTYKYIIHEDSVPTINSNNVIQEELDTFEWALKSWSQVSKPCGGGFQYTKYGCRRKSD :: .:: : :: :.. . .. . 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KIAA07 -DGSMCKAETSQAEKCM--MPE----CHTIPCLLSPWS--EWSDCSVTCGKGMRTRQRML 510 520 530 540 550 990 1000 1010 1020 1030 1040 KIAA03 RA----GDHCDGEKPESVRACQLPPCNDEPCLGDKSIFCQMEVLARYCSIPGYNKLCCES .. :: :. : :.:. :.:: : KIAA07 KSLAELGD-CN-EDLEQVEKCMLPECPIDCELTEWSQWSECNKSCGKGHVIRTRMIQMEP 560 570 580 590 600 610 >>KIAA0021 ( 703 res) ha00117(revised) (703 aa) initn: 232 init1: 91 opt: 244 Z-score: 216.9 bits: 51.4 E(): 5.8e-07 Smith-Waterman score: 373; 22.405% identity (49.423% similar) in 607 aa overlap (146-708:2-548) 120 130 140 150 160 170 KIAA03 ITDPINNHQPGSATYRIRKTEPLQTNCAYVGDIVDIPGTSVAISNCDGLAGMIKSDNEEY : . . ..:.:.:.: :: :... .: : KIAA00 QGYVEGVHNSSIALSDCFGLRGLLHLENASY 10 20 30 180 190 200 210 220 230 KIAA03 FIEPLERGKQMEEEKGRIHVVYKRSAVEQAPIDMSKDFHYRESDLEGLDDLGTVYGNIHQ ::::. ....: :..:. . : . :. . ..:.: . . . 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