# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hh00083.fasta.huge -Q ../query/KIAA0362.ptfa ./tmplib.23147 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0362, 1108 aa vs ./tmplib.23147 library 1986397 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.9866+/-0.00714; mu= 2.3204+/- 0.483 mean_var=197.1933+/-48.645, 0's: 0 Z-trim: 16 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.091333 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0861 ( 982 res) hk06521 ( 982) 1419 200.3 1.1e-51 KIAA1909 ( 1287 res) ff10210 (1287) 490 78.0 9.6e-15 KIAA1112 ( 694 res) hj05505s1 ( 694) 361 60.8 8e-10 KIAA0424 ( 567 res) hh01267 ( 567) 303 53.0 1.4e-07 KIAA1639 ( 2584 res) af14886 (2584) 273 49.7 6.5e-06 KIAA0142 ( 802 res) ha01169 ( 802) 220 42.2 0.00035 KIAA1755 ( 1110 res) fg04230(revised) (1110) 213 41.4 0.00084 KIAA0337 ( 1609 res) hg01226 (1609) 209 41.1 0.0016 KIAA0006 ( 773 res) ha01154 ( 773) 203 40.0 0.0016 KIAA1362 ( 699 res) fj02381 ( 699) 185 37.6 0.0077 >>KIAA0861 ( 982 res) hk06521 (982 aa) initn: 2293 init1: 1407 opt: 1419 Z-score: 1019.7 bits: 200.3 E(): 1.1e-51 Smith-Waterman score: 2298; 43.019% identity (70.829% similar) in 881 aa overlap (179-1016:1-872) 150 160 170 180 190 200 KIAA03 VIDRRRDKWTSVKASVLRIAASFPANLQLVLVLRPTGFFQRTLSDIAFKFNRDDFKMKVP ..:::. :.:::..::..:. :..:::::: KIAA08 FILRPSRFIQRTFTDIGIKYYRNEFKMKVP 10 20 30 210 220 230 240 250 260 KIAA03 VIMLSSVPDLHGYIDKSQLTEDLGGTLDYCHSRWLCQRTAIESFALMVKQTAQMLQSFGT .::..:: ::::::::::::..:::::.: :..:. .:::::.::: .: ::::::.::. 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KIAA19 SPVAECLRSCHQEATSVAAEAFPGA---GVAVLKPHA---------LGKPWASQQDLWLQ 560 570 580 590 600 480 490 500 510 520 KIAA03 SLELHRRLETSMKWC--DEGIYLLASQPVDKCQSQDGAEAALQEIEKFLET----GAENK . . ::: ... : .. ::..: . ..:. : :. .: : :: . KIAA19 YPQTRLRLEEALSEAAPDPSLPPLAQSPPKHERAQE-AMRRHQKPPSFPSTDSGGGAWEP 610 620 630 640 650 660 530 540 550 560 570 580 KIAA03 IQELNAIYKEYESILNQD---LMEHVRKVFQKQASMEEV--FHRRQASLKKLAARQTRPV : :... . .:: : . ... . .. . : :. .: ...:. KIAA19 AQPLSGL-PGRALLCGQDGEPLGPGLCALWDPLSLLRGLPGAGATTAHLEDSSACSSEPT 670 680 690 700 710 720 590 600 610 KIAA03 QPVAPRP------EALAKS-----PCPSPGIR------------RGSENSSSEGGALRRG : .: :: . . :. : :. : : .: : .:. . . KIAA19 QTLASRPRKHPQKKMIKKTQSFEIPQPDSGPRDSCQPDHTSVFSKGLEVTSTVATEKKLP 730 740 750 760 770 780 620 630 640 650 660 KIAA03 PYRRAKSE-MSESRQGRGSAG----EEE--ESLAILR-RHVMSELLDTERAYVEELLCVL ...:.: ...::. . .: ::. .... : ::.:.:.. ::: :.. : :. KIAA19 LWQHARSPPVTQSRSLSSPSGLHPAEEDGRQQVGSSRLRHIMAEMIATEREYIRCLGYVI 790 800 810 820 830 840 670 680 690 700 710 720 KIAA03 EGYAAEMDNPLMAHLLSTGLHNKKDVLFGNMEEIYHFHNRIFLRELENYTDCPELVGRCF ..: ::. : : ::..:. :.:::.:... ::.. :::::: :: ::: : KIAA19 DNYFPEMER--MD--LPQGLRGKHHVIFGNLEKLHDFHQQHFLRELERCQHCPLAVGRSF 850 860 870 880 890 900 730 740 750 760 770 780 KIAA03 LERMEDFQIYEKYCQNKPRSESLWRQCSDCPFFQECQRKLDHKLSLDSYLLKPVQRITKY :.. :.: .: : .:::.:..: . .. ::.. ::.: :..: ::::.::::..:: KIAA19 LRHEEQFGMYVIYSKNKPQSDALLSSHGNA-FFKDKQRELGDKMDLASYLLRPVQRVAKY 910 920 930 940 950 790 800 810 820 830 840 KIAA03 QLLLKEMLKYSRNC---EGAE--DLQEALSSILGILKAVNDSMHLIAITGYDGNLGDLGK :::...:: . .: .: : .:. : . :. :: . . :: : : :: . :. KIAA19 ALLLQDLLKEA-SCGLAQGQELGELRAAEVVVCFQLRHGNDLLAMDAIRGCDVNLKEQGQ 960 970 980 990 1000 1010 850 860 870 880 890 900 KIAA03 LLMQGSFSVWTDHKRGHTKVKELARFKPMQRHLFLHEKAVLFCKKREENGEGYEKAPSYS : . : : .:. . ::.:: : .:: : .. .: . : KIAA19 LRCRDEFIVCCGRKK-------------YLRHVFLFEDLILFSKTQKVEG----SHDVYL 1020 1030 1040 1050 1060 910 920 930 940 950 960 KIAA03 YKQSLNMAAVGITENVKGDAKKFEIWYNARE---EVYIVQAPTPEIKAAWVNEIRKVLTS ::::.. : .:.:::: .. .::::. :. ..::.:: . :.:.::.. : ..: KIAA19 YKQSFKTAEIGMTENVGDSGLRFEIWFRRRQKSQDTYILQASSAEVKSAWTDVIGRILWR 1070 1080 1090 1100 1110 1120 970 980 990 1000 1010 1020 KIAA03 QLQACREASQHRALEQSQSLPLPAPTSTSPSRGNSRNIKKLEERKTDPLSLEGYVSSAPL : :: KIAA19 QALKSRELRIQEMASMGIGNQPFMDVKPRDRTPDCAVISDGAPKCAVMSDRVPDSIVKGT 1130 1140 1150 1160 1170 1180 >>KIAA1112 ( 694 res) hj05505s1 (694 aa) initn: 391 init1: 112 opt: 361 Z-score: 268.2 bits: 60.8 E(): 8e-10 Smith-Waterman score: 378; 26.139% identity (56.595% similar) in 417 aa overlap (634-1023:297-692) 610 620 630 640 650 660 KIAA03 SENSSSEGGALRRGPYRRAKSEMSESRQGRGSAGEEEESLAILRRHVMSELLDTERAYVE :.: : . : .: .:..:.:.::: :.. KIAA11 FPASFVRLRVNQDEPADDDAPLAGNSGAEDGGA-EAQSSKDQMRTNVINEILSTERDYIK 270 280 290 300 310 320 670 680 690 700 710 720 KIAA03 ELLCVLEGYAAEMDNPLMAHLLSTGLHNKKDVLFGNMEEIYHFHNRIFLRELENY--TDC .: . :::. . . : ..: ... ..:::.:.::. . . :.. ::. . KIAA11 HLRDICEGYVRQCRK--RADMFS---EEQLRTIFGNIEDIYRCQ-KAFVKALEQRFNRER 330 340 350 360 370 730 740 750 760 770 KIAA03 PEL--VGRCFLERMEDFQIYEKYCQNKPRS----ESLWRQCSDCPFFQEC---QRKLDHK :.: .: ::::.. ::::: .::.:.: . : . . ::. : :. .: KIAA11 PHLSELGACFLEHQADFQIYSEYCNNHPNACVELSRLTKLSKYVYFFEACRLLQKMID-- 380 390 400 410 420 430 780 790 800 810 820 830 KIAA03 LSLDSYLLKPVQRITKYQLLLKEMLKYSR-NCEGAEDLQEALSSILGILKAVNDSMHLIA .:::..:: :::.: :: : : :.:::.. . . .:.. :: .. .. . .:. . . KIAA11 ISLDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTHPQHRDFKDVEAALHAMKNVAQLINERKRRLE 440 450 460 470 480 490 840 850 860 870 880 KIAA03 ----ITGYDGNLGDL-GK-LLMQGSFSVWTDHKRGHTKVKELARFKPMQRHLFLHEKAVL :. ..... : :. ::...: ... . :.: . . : .:: .:: .. .. KIAA11 NIDKIAQWQSSIEDWEGEDLLVRSSELIYSGEL---TRVTQ-PQAKSQQRMFFLFDHQLI 500 510 520 530 540 550 890 900 910 920 930 KIAA03 FCKKREENGEGYEKAPSYSYKQSLNMAAVGITENVKGDAKK--------FEIWYNAREEV .::: . :: :.: .. ... : . :.. .: . KIAA11 YCKK------DLLRRDVLYYKGRLDMDGLEVVDLEDGKDRDLHVSIKNAFRLHRGATGDS 560 570 580 590 600 940 950 960 970 980 990 KIAA03 YIVQAPTPEIKAAWVNEIRKVLTSQLQACREAS-QHRALEQSQSLPLPAPTSTSPSRGNS ... . :: : :.. . . :.: .:.. . :...:.. : : . .. .. KIAA11 HLLCTRKPEQKQRWLKAFARE-REQVQLDQETGFSITELQRKQAM-LNASKQQVTGKPKG 610 620 630 640 650 660 1000 1010 1020 1030 1040 1050 KIAA03 RNIKKLEERKTDPLSLEGYVSSAPLTKPPEKGKGWSKTSHSLEAPEDDGGWSSAEEQINS : : : . : : .. KIAA11 RRTAAPPPRLPGPYPADIIPFSEPQSQAS 670 680 690 >>KIAA0424 ( 567 res) hh01267 (567 aa) initn: 300 init1: 88 opt: 303 Z-score: 228.1 bits: 53.0 E(): 1.4e-07 Smith-Waterman score: 325; 24.938% identity (57.284% similar) in 405 aa overlap (646-1026:154-523) 620 630 640 650 660 670 KIAA03 RGPYRRAKSEMSESRQGRGSAGEEEESLAILRRHVMSELLDTERAYVEELLCVLEGYAAE .: .:..:...::: :...: . ::: . KIAA04 EEGPSDVQNGHLDPNSDCLCLGRPLQNRDQMRANVINEIMSTERHYIKHLKDICEGYLKQ 130 140 150 160 170 180 680 690 700 710 720 730 KIAA03 MDNPLMAHLLSTGLHNKKDVLFGNMEEIYHFHNRIFLRELENY--TDCPEL--VGRCFLE . ..: .. :.:::.:.::.:. :.:.::. .: :.: .: :::: KIAA04 CRK--RRDMFS---DEQLKVIFGNIEDIYRFQMG-FVRDLEKQYNNDDPHLSEIGPCFLE 190 200 210 220 230 740 750 760 770 780 KIAA03 RMEDFQIYEKYCQNKPRS----ESLWRQCSDCPFFQEC---QRKLDHKLSLDSYLLKPVQ ... : :: .::.:. . .: .. ::. : :. .: ...:..:: ::: KIAA04 HQDGFWIYSEYCNNHLDACMELSKLMKDSRYQHFFEACRLLQQMID--IAIDGFLLTPVQ 240 250 260 270 280 290 790 800 810 820 830 840 KIAA03 RITKYQLLLKEMLKYSRNCEGAEDLQEA--LSSILGILKAVNDSMHLIAITGYDGNLGDL .: :: : : :.:::. :.: .. ... :.... :... :. : .. KIAA04 KICKYPLQLAELLKYT-----AQDHSDYRYVAAALAVMRNVTQQ-----INERKRRLENI 300 310 320 330 340 850 860 870 880 890 KIAA03 GKLLM-QGSFSVWT-----DHKRGHTKVKELAR-FKPM----QRHLFLHEKAVLFCKKRE :. . :.: : :.. . :.: ..:. :: .:: .. ...::: KIAA04 DKIAQWQASVLDWEGEDILDRSSELIYTGEMAWIYQPYGRNQQRVFFLFDHQMVLCKK-- 350 360 370 380 390 400 900 910 920 930 940 950 KIAA03 ENGEGYEKAPSYSYKQSLNMAAVGITENVKGDAKKFEIWYNAREEVYIVQAPTPEIKAAW . .. : :: ..: ... : :.. . .. . . : ::. . KIAA04 ---DLIRRDILY-YKGRIDMDKYEVVDIEDGRDDDFNV--SMKNAFKLHNKETEEIHLFF 410 420 430 440 450 960 970 980 990 1000 1010 KIAA03 VNEIRKVLTSQLQACREASQHRALEQSQSLPLPAPTSTSPSRGNSRNIKKLEERKTDPLS ...... . :.: :: ... ....... . : . .: . ...:. ..: . KIAA04 AKKLEEKIR-WLRAFRE--ERKMVQEDEKIGFEI--SENQKRQAAMTVRKVPKQK----G 460 470 480 490 500 1020 1030 1040 1050 1060 1070 KIAA03 LEGYVSSAPLTKPPEKGKGWSKTSHSLEAPEDDGGWSSAEEQINSSDAEEDGGLGPKKLV ... : : ::. KIAA04 VNSARSVPPSYPPPQDPLNHGQYLVPDGIAQSQVFEFTEPKRSQSPFWQNFSRLTPFKK 510 520 530 540 550 560 >>KIAA1639 ( 2584 res) af14886 (2584 aa) initn: 191 init1: 97 opt: 273 Z-score: 198.1 bits: 49.7 E(): 6.5e-06 Smith-Waterman score: 439; 28.228% identity (62.462% similar) in 333 aa overlap (634-955:297-615) 610 620 630 640 650 660 KIAA03 SENSSSEGGALRRGPYRRAKSEMSESRQGRGSAGEEEESLAILRRHVMSELLDTERAYVE : : :.: : : :..:::..:.:.:: KIAA16 SRQGWVSPAYLDRRLKLSPEWGAAEAPEFPGEAVSEDEYKARLSS-VIQELLSSEQAFVE 270 280 290 300 310 320 670 680 690 700 710 720 KIAA03 ELLCVLEGYAAEMDNPLMAHLLSTGLHNKKDVLFGNMEEIYHFHNRIFLRELENYTDCPE :: . . ... :. .. ..: :.: :...: .::. ::.::.. : . KIAA16 ELQFLQSHHLQHLER--CPHV-PIAVAGQKAVIFRNVRDIGRFHSSSFLQELQQ-CDTDD 330 340 350 360 370 380 730 740 750 760 770 KIAA03 LVGRCFLERMEDFQIYEKYCQNKPRSESLWRQCSDCPFFQECQRK--LDHKLS------L :. ::.. . :. : .. .. ..::. . . :... .. : : : KIAA16 DVAMCFIKNQAAFEQYLEFLVGRVQAESVVVSTAIQEFYKKYAEEALLAGDPSQPPPPPL 390 400 410 420 430 440 780 790 800 810 820 830 KIAA03 DSYLLKPVQRITKYQLLLKEMLKY-SRNCEGAEDLQEALSSILGILKAVNDSMHLIAITG . :: .::.:. .:: ::::... .:: .. :..: . . .. . .....:. . . KIAA16 QHYLEQPVERVQRYQALLKELIRNKARNRQNCALLEQAYAVVSALPQRAENKLHVSLMEN 450 460 470 480 490 500 840 850 860 870 880 890 KIAA03 YDGNLGDLGKLLMQGSFSVWTDHKRGHTKVKELARFKPMQRHLFLHEKAVLFCKKREENG : :.: ::. . :: : :: .: .. .: .::.:: .. ...:: :... KIAA16 YPGTLQALGEPIRQGHFIVW----EGAPGAR--MPWKGHNRHVFLFRNHLVICKPRRDS- 510 520 530 540 550 900 910 920 930 940 950 KIAA03 EGYEKAPSYSYKQSLNMAAVGITENVKGDAKKFEIWYNAREEV--YIVQAPTPEIKAAWV . :: ... ...... ....:.:: . ::.: . .. : :..:: : ::..:: KIAA16 --RTDTVSYVFRNMMKLSSIDLNDQVEGDDRAFEVWQEREDSVRKYLLQARTAIIKSSWV 560 570 580 590 600 610 960 970 980 990 1000 1010 KIAA03 NEIRKVLTSQLQACREASQHRALEQSQSLPLPAPTSTSPSRGNSRNIKKLEERKTDPLSL .:: KIAA16 KEICGIQQRLALPVWRPPDFEEELADCTAELGETVKLACRVTGTPKPVISWYKDGKAVQV 620 630 640 650 660 670 >>KIAA0142 ( 802 res) ha01169 (802 aa) initn: 145 init1: 62 opt: 220 Z-score: 167.0 bits: 42.2 E(): 0.00035 Smith-Waterman score: 235; 21.928% identity (51.796% similar) in 529 aa overlap (534-1032:130-629) 510 520 530 540 550 560 KIAA03 QDGAEAALQEIEKFLETGAENKIQELNAIYKEYESILNQDLMEHVRKVFQKQASMEEVFH : ..:. .:.: .. :.:: : .. KIAA01 LSSLVTLNKVTADIGLGSDSVCARPSSHRIKSFDSLGSQSLHTRTSKLFQGQYRSLDMTD 100 110 120 130 140 150 570 580 590 600 610 620 KIAA03 RRQASL---KKLAARQTRPVQPVAPRPEALAKSPCPSPGIRRGSENSSSEGGALRRGPYR . .: :. .:: . . ... . : .:. :. . : . . : KIAA01 NSNNQLVVRAKFNFQQTNEDELSFSKGDVIHVTRVEEGGWWEGTLNGRT--GWFPSNYVR 160 170 180 190 200 210 630 640 650 660 670 KIAA03 RAKSEMSESRQGRG---SAGEEEESLAILRRH---VMSELLDTERAYVEELLCVLEGYAA ..:. . : : . .. :: . . :....:.:: : .:: :: : KIAA01 EVKASEKPVSPKSGTLKSPPKGFDTTAINKSYYNVVLQNILETENEYSKELQTVLSTYL- 220 230 240 250 260 270 680 690 700 710 720 730 KIAA03 EMDNPLM-AHLLSTGLHNKKDVLFGNMEEIYHFHNRIFLRELENYTDCPEL---VGRCFL ::. .. ::.. . . :.::.::: :. ..... ::. : :: :: ::: KIAA01 ---RPLQTSEKLSSA---NISYLMGNLEEICSFQ-QMLVQSLEECTKLPEAQQRVGGCFL 280 290 300 310 320 740 750 760 770 780 KIAA03 ERMEDFQ-IYEKYCQNKPRSESLWRQCSDC--PFFQECQRKLDHKLSLDSYLLKPVQRIT . : ... .: :: :.: . .. . :. :.. . : : . : :: .:. KIAA01 NLMPQMKTLYLTYCANHPSAVNVLTEHSEELGEFMETKGASSPGILVLTTGLSKPFMRLD 330 340 350 360 370 380 790 800 810 820 830 840 KIAA03 KYQLLLKEMLKYSRNCE-GAEDLQEALSSILGILKAVND-----SMHLIAITGYDGNL-G :: ::::. .. .. . .:.:...... .. .. ..: .: : : KIAA01 KYPTLLKELERHMEDYHTDRQDIQKSMAAFKNLSAQCQEVRKRKELELQILTEAIRNWEG 390 400 410 420 430 440 850 860 870 880 890 900 KIAA03 DLGKLLMQGSFSVWTDHKRGHTKVKELARFKPMQRHLFLHEKAVLFCKKREENGEGYEKA : : : :. . . .. .. . . .:.:.: ...:. . . KIAA01 DDIKTL--GNVTYMS-----QVLIQCAGSEEKNERYLLLFPNVLLMLSASP-------RM 450 460 470 480 490 910 920 930 940 950 KIAA03 PSYSYKQSLNMAAVGIT--ENVKGDAKKFEIWYNAREEVYIVQAPTPEIKAAWVNEIRKV .. :. .: ... :: :. .. . ::: . :.. . ... ::....: KIAA01 SGFIYQGKLPTTGMTITKLEDSENHRNAFEISGSMIERILVSCNNQQDLQE-WVEHLQK- 500 510 520 530 540 550 960 970 980 990 1000 1010 KIAA03 LTSQLQACREASQHRALEQSQSLPLPAPTSTSPSRGNSRNIKKLEERKTDPL-SLEGY-- ... . . . . :..:: :.. : ....:. .: : : .: KIAA01 -QTKVTSVGNPTIKPHSVPSHTLP-SHPVTPSSKHADSKPAPLTPAYHTLPHPSHHGTPH 560 570 580 590 600 610 1020 1030 1040 1050 1060 1070 KIAA03 --VSSAPLTKPPEKGKGWSKTSHSLEAPEDDGGWSSAEEQINSSDAEEDGGLGPKKLVPG .. .:: .::. : :: KIAA01 TTINWGPL-EPPKTPKPWSLSCLRPAPPLRPSAALCYKEDLSKSPKTMKKLLPKRKPERK 620 630 640 650 660 670 >>KIAA1755 ( 1110 res) fg04230(revised) (1110 aa) initn: 146 init1: 85 opt: 213 Z-score: 160.1 bits: 41.4 E(): 0.00084 Smith-Waterman score: 329; 22.819% identity (53.523% similar) in 596 aa overlap (91-635:484-1052) 70 80 90 100 110 120 KIAA03 CSFYTCHGAAGDEIMHQDIVPLCAADIQDQLKKRFAYLSGGRGQDGSPVITFPDYPAFSE ...:.: : ::: . : :.. . : KIAA17 ASAGSPERGPTLEEEPPGPEPRIGALGVKVFRSRIACLPGGRDRAGRPLLLVSTTEGAWE 460 470 480 490 500 510 130 140 150 160 170 KIAA03 IP---DKEFQNVMTYLTSIPSLQDAGIGFILVIDRRRDKWTSVKASVLRIA-ASFPANLQ : .: ....:: .:: .: . :. ..:: ::. .:.:. . :. ::... KIAA17 APWCTVSEVTKLLSYLCTIPRPEDKAKGLAVLIDARRQPPQPGLVSALQATQAQVPASIR 520 530 540 550 560 570 180 190 200 210 220 230 KIAA03 LVLVL--RPTGFFQRTLSDIAFKFNRDDFKMKVPVIMLSSVPDLHGYIDKSQLTEDLGGT .: : . ... .:: : : : .:.:. : ..: ::: : : KIAA17 AILFLGEKEAALQLQTLPD-------------VQVEVLTSLKALSHHVDPSQLPAVLEGP 580 590 600 610 620 240 250 260 270 280 290 KIAA03 LDYCHSRWLCQRTAIESFALMVKQTAQMLQSFGTELAETELPNDVQSTSSVLCAHTEKKD . :::..:. .. : ..:....::. :. ... :. .: .. : : . KIAA17 FPYCHTEWVHFFQKLDPFLADLHQASSLLQASIEEFEKADPPGGMQEATRCLSKSKELME 630 640 650 660 670 680 300 310 320 330 340 350 KIAA03 KAKEDLRLA--LKEGHSVLESLRELQAEGSEPSVNQDQLDNQATVQRLLAQLNETEAAFD . .: : .:: . .: .:: ..:. . . : .. :.. : . ..: .. KIAA17 AVLRDPGLLGLQREGGA---TLARLQHDASRLDFSPDVRSHLAAATALYSLVDEQLHVLV 690 700 710 720 730 360 370 380 390 400 410 KIAA03 EFWAKHQQKLEQCLQLRHFEQGFREVKAILDAASQK-IATFTDIGNSLAHVEHLLRDLAS . ::: ..: ..: ....:. .. ... . ..: .:: ::. .. . KIAA17 TASNSLLGKLELRVRLGRLEAAIHQVSDWMEQEGRRCLQSLTPKDGSLETVEKAHAEFEN 740 750 760 770 780 790 420 430 440 450 460 KIAA03 FEEKSGVAVERARALSLDGEQLIGNKHYAVDSIRPKCQELRHLCDQ---FSAEIA----- : .... .:. :: .. :: .. . : .. : . :: . . :.:... KIAA17 FFLQAAAQYRRGLELSKQAAQLGATARGAGEAERAEFPELAAFASTQRAFQAKLTHFYMA 800 810 820 830 840 850 470 480 490 500 510 KIAA03 --RRRGLLSKSLELHRRLETSMKW----CDEGIYLLASQPVDKCQSQDGAEAALQEIEKF :.: : :.::: . : : :.. :.:. .:: . . .. ...... KIAA17 AERQRTDLETLLHLHR-FCKRMTWFHMDCQD---LMAQLRLDKTSRVSPGDQ--RRLHRY 860 870 880 890 900 910 520 530 540 550 560 570 KIAA03 LETGA-ENKIQELNAIYKEYESI----LNQDLMEHVRKVFQKQASMEEVFHRRQASLKKL :. : : ..: :. . :. :.:.: :..: .. . : ... . KIAA17 LQRLASEFPAEKLAAVGLQVASLSRAGLGQELWEEARIRHEEIWMLLEKALTHSSCPEAP 920 930 940 950 960 970 580 590 600 KIAA03 AARQTRPVQ-PVAPRPEALA----------KSPCPS------------PGIRRGSENSSS ::...:: . :: . .... . : : :: :: .: . KIAA17 AAHSARPERRGVAAKGQGVSVEVTSKGRWDQPPLDSLGMDHLPKSYWPPGPPRGEQNRTF 980 990 1000 1010 1020 1030 610 620 630 640 650 660 KIAA03 EGGALRRGPYRRAKSEMSESRQGRGSAGEEEESLAILRRHVMSELLDTERAYVEELLCVL ..:. : ..: .. .:...:.:: KIAA17 QAGS----PPQEA-GQAAEAEDGKGSHKLPDPAREHLLATTFFRQQPPRQSQVPRLTGGS 1040 1050 1060 1070 1080 >>KIAA0337 ( 1609 res) hg01226 (1609 aa) initn: 226 init1: 92 opt: 209 Z-score: 155.2 bits: 41.1 E(): 0.0016 Smith-Waterman score: 215; 21.826% identity (52.784% similar) in 449 aa overlap (646-1072:612-1035) 620 630 640 650 660 670 KIAA03 RGPYRRAKSEMSESRQGRGSAGEEEESLAILRRHVMSELLDTERAYVEELLCVLEGYAAE .:.:: :::::..::: : ...:: KIAA03 PSAEAKPPEAARPADEPTPASKCCSKPQVDMRKHVAMTLLDTEQSYVESLRTLMQGYMQP 590 600 610 620 630 640 680 690 700 710 720 730 KIAA03 MDNPLMAHLLSTGLHNKKDVLFGNMEEIYHFHNRIFLRELENYTDC---PELVGRCFLER . .: . : . .: : .: .. :. . :.. ::..... . . :: ... KIAA03 LKQPENSVLCDPSL---VDEIFDQIPELLEHHEQ-FLEQVRHCMQTWHAQQKVGALLVQS 650 660 670 680 690 740 750 760 770 780 KIAA03 M-EDF--QIYEKYCQNKPRSESLWRQCSDC-P----FFQECQRKLDHKLSLDSYLLKPVQ . .: .:: : .: ... : .. : :... .:. .: .:.. ..:::: KIAA03 FSKDVLVNIYSAYIDNFLNAKDAVRVAKEARPAFLKFLEQSMRENKEKQALSDLMIKPVQ 700 710 720 730 740 750 790 800 810 820 830 840 KIAA03 RITKYQLLLKEMLKYS-RNCEGAEDLQEALSSILGILKAVNDSMHLIAITGYDGNLGDLG :: .:.::.:..::.. .. : :: .: . . .: ... . . . . KIAA03 RIPRYELLVKDLLKHTPEDHPDHPLLLEAQRNIKQVAERINKGVRSAEEAERHARVLQEI 760 770 780 790 800 810 850 860 870 880 890 KIAA03 KLLMQGSFSVWTDHKRGHTKVKELARFKPM----QRHLFLHEKAVLFCKKREENGEGYEK . ..: .. . .: . . . . : . .: ::: .. ....: .. KIAA03 EAHIEGMEDLQAPLRR-FLRQEMVIEVKAIGGKKDRSLFLFTDLIVCTTLKRKSGSLRRS 820 830 840 850 860 870 900 910 920 930 940 950 KIAA03 APSYSYKQSLNMAAVGITENVKGDAKKFEI-WYNAREEVYIVQAPTPEIKAAWVNEIRKV . .:: :: .: :.:... : :.. :... . .:. ..:.:. KIAA03 S------MSLYTAA-----SVIDTASKYKMLWKLPLEDADIIKGAS---QATNRENIQKA 880 890 900 910 920 960 970 980 990 1000 1010 KIAA03 LTSQLQACREASQHRALEQSQSLPLPAPTSTSPSRGNSRNIKK-LEERKTDPLSLEGYVS .. . .: : :.:: .: . . : : ... : :.. .: .: KIAA03 ISRLDEDLTTLGQMSKL--SESLGFPHQSLDDALRDLSAAMHRDLSEKQ----ALCYALS 930 940 950 960 970 1020 1030 1040 1050 1060 1070 KIAA03 SAPLTKPPEKGKGWSKTSHSLEAPEDDG--GWSSAEEQINSSDAEEDGGLGPK--KLVPG : . . :. .: :. :. :. .: .. . . : . : :. : .: KIAA03 FPPTKLELCATRPEGTDSYIFEFPHPDARLGFEQAFDEAKRKLASSKSCLDPEFLKAIPI 980 990 1000 1010 1020 1030 1080 1090 1100 KIAA03 KYTVVADHEKGGPDALRVRSGDVVELVQEGDEGLW KIAA03 MKTRSGMQFSCAAPTLNSCPEPSPEVWVCNSDGYVGQVCLLSLRAEPDVEACIAVCSARI 1040 1050 1060 1070 1080 1090 >>KIAA0006 ( 773 res) ha01154 (773 aa) initn: 117 init1: 56 opt: 203 Z-score: 155.1 bits: 40.0 E(): 0.0016 Smith-Waterman score: 222; 23.544% identity (54.430% similar) in 395 aa overlap (650-1024:242-599) 620 630 640 650 660 670 KIAA03 RRAKSEMSESRQGRGSAGEEEESLAILRRHVMSELLDTERAYVEELLCVLEGYAAEMDNP :....::::. :..:: .: : : KIAA00 REIKSSERPLSPKAVKGFETAPLTKNYYTVVLQNILDTEKEYAKELQSLLVTYL----RP 220 230 240 250 260 680 690 700 710 720 730 KIAA03 LMAHL-LSTGLHNKKDVLFGNMEEIYHFHNRIF--LRELENYTDCPELVGRCFLERMEDF :... ::: . :.::.::. :.. . :.: .. . . :: :.: : : KIAA00 LQSNNNLST---VEVTSLLGNFEEVCTFQQTLCQALEECSKFPENQHKVGGCLLSLMPHF 270 280 290 300 310 320 740 750 760 770 780 790 KIAA03 Q-IYEKYCQNKPRSESLWRQCSD-CPFFQECQRKLDHK-LSLDSYLLKPVQRITKYQLLL . .: :: :.: . .. : :: :.: : . : : . : :: .:. :: :: KIAA00 KSMYLAYCANHPSAVNVLTQHSDELEQFMENQGASSPGILILTTNLSKPFMRLEKYVTLL 330 340 350 360 370 380 800 810 820 830 840 KIAA03 KEMLKYSRNCE-GAEDLQEALSSILGILKAVND-------SMHLIA--ITGYDG-NLGDL .:. .. .. . .:. .:. .. .. .: ..... : ...: .. .: KIAA00 QELERHMEDTHPDHQDILKAIVAFKTLMGQCQDLRKRKQLELQILSEPIQAWEGEDIKNL 390 400 410 420 430 440 850 860 870 880 890 900 KIAA03 GKLLMQGSFSVWTDHKRGHTKVKELARFKPMQRHLFLHEKAVLFCKKREENGEGYEKAPS :....... : . : . :: .:.:.: ..... . . . 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