# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hg01842.fasta.huge -Q ../query/KIAA0354.ptfa ./tmplib.23147 2
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007
Please cite:
 W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

 KIAA0354, 730 aa
 vs ./tmplib.23147 library

1986775 residues in  2037 sequences
  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4892+/-0.0081; mu= 10.9645+/- 0.553
 mean_var=259.6451+/-63.463, 0's: 0 Z-trim: 64  B-trim: 0 in 0/40
 Lambda= 0.079595

FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2
 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width:  16
The best scores are:                                      opt bits E(2037)
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KIAA1951  ( 679 res)   fj05532                     ( 679)  240 41.2  0.0004
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KIAA1490  ( 749 res)   fj08103                     ( 749)  236 40.8 0.00058
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KIAA1508  ( 573 res)   hk06576                     ( 573)  211 37.7  0.0037
KIAA2007  ( 580 res)   fj01689                     ( 580)  211 37.8  0.0037
KIAA1431  ( 891 res)   fj00022                     ( 891)  213 38.3   0.004
KIAA1947  ( 608 res)   fh23660                     ( 608)  210 37.7  0.0041
KIAA0441  ( 702 res)   hh00601s1                   ( 702)  209 37.7  0.0048
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KIAA0924  ( 617 res)   hh02883                     ( 617)  207 37.3  0.0053
KIAA0412  ( 720 res)   hg03242                     ( 720)  207 37.4  0.0057
KIAA1710  ( 515 res)   fj18457                     ( 515)  201 36.5  0.0078
KIAA1948  ( 487 res)   fh24556                     ( 487)  200 36.4  0.0082
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KIAA1982  ( 599 res)   fk06527(revised)            ( 599)  199 36.4  0.0098


>>KIAA0997  ( 646 res)   hk08613                          (646 aa)
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            30        40        50        60        70        80   
KIAA03 PTSSDTAESDRRGVTASFSEEEGGGARLRIMDFPGHFEQIFQQLNYQRLHGQLCDCVIVV
                                     :  :.:   ..:::: ::  : :::: :..
KIAA09                             QKMAKPSHSSYVLQQLNNQREWGFLCDCCIAI
                                           10        20        30  

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KIAA03 GNRHFKAHRSVLAACSTHFRALFSVAEGDQTMNMIQLDSEVVTAEAFAALIDMMYTSTLM
        . .:.::..::::::..:: .:   . ...  ...:..  ..:: :  ....:: . .:
KIAA09 DDIYFQAHKAVLAACSSYFRMFF--MNHQHSTAQLNLSNMKISAECFDLILQFMYLGKIM
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KIAA03 LGESNVMDVLLAASHLHLNSVVKACKHYLTTRTLPMSPPSERVQ-EQSARMQRSFMLQQL
        . :.  .  .: ..:.: .:   : . .       :  :  .. .:...:   : ... 
KIAA09 TAPSSFEQFKVAMNYLQLYNV-PDCLEDIQDADCSSSKCSSSASSKQNSKMI--FGVRMY
              100       110        120       130       140         

            210       220       230             240        250     
KIAA03 GLSIVSSALNSSQNGEEQPAPMSSSMRSNLDQRT------PFPMRRLHKRKQ-SAEERAR
         ... .. ....   :  . ...    . :...      : :.  . :... :     .
KIAA09 EDTVARNGNEANRWCAEPSSTVNTPHNREADEESLQLGNFPEPLFDVCKKSSVSKLSNPK
       150       160       170       180       190       200       

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KIAA03 QRLRPSIDESAISDVTPENGPSGVHSREEFFSPDSLKIVDNPKA-DGMTDNQEDSAIMFD
       .:.   . .:   :    .        :. ..  . .. .: ..   ..: .. .   . 
KIAA09 ERVSRRFGRSFTCDSCGFGFSCEKLLDEHVLTCTNRHLYQNTRSYHRIVDIRDGKDSNIK
       210       220       230       240       250       260       

          320        330          340       350       360       370
KIAA03 QSFGTQEDAQVPS-QSDNSAGNMAQL---SMASRATQVETSFDQEAAPEKSSFQCENPEV
         :: ...... : :.:.  :. .:    : .. ...  .. ..: : :..:        
KIAA09 AEFGEKDSSKTFSAQTDKYRGDTSQAADDSASTTGSRKSSTVESEIASEEKS--------
       270       280       290       300       310                 

              380       390       400           410       420      
KIAA03 GLGEKEHMRVVVKSEPLSSPEPQDEVSDVT----SQAEGSESVEVEGVVVSAEKIDLSPE
            :. :...: ::     : ::..: .    .. . .::.. .      :  :   :
KIAA09 --RAAERKRIIIKMEP--EDIPTDELKDFNIIKVTDKDCNESTDND------ELEDEPEE
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KIAA03 SSDRSFSDPQSSTDRVGDIHILEVTNNLEHKSTFSISN---FLNKSRGNNFTANQNNDDN
          : . . . :  . :        ..:. . . : ..   . :    :: .  :.. .:
KIAA09 PFYRYYVEEDVSIKKSG-------RKTLKPRMSVSADERGGLENMRPPNNSSPVQEDAEN
     370       380              390       400       410       420  

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KIAA03 IPNTTSDCRLESEAPYLLSPEAGPAGGPSSAPGSHVENPFSEPADSHFVRPMQEVMGLPC
            ..:.: .    :   :   .   :   ..:.::  .    ....     : :   
KIAA09 -----ASCELCG----LTITEEDLS---SHYLAKHIENICACGKCGQIL-----VKGRQ-
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KIAA03 VQTSGYQGGEQFGMDFSRSGLGLHSSFSRVMIGSPRGGASNFPYYRRIAPKMPVVTSVRS
       .:  . . ::   .:.. .:::  ..  .. .       :..   : .  .:  . . :.
KIAA09 LQEHAQRCGEP--QDLTMNGLG--NTEEKMDLEENPDEQSEI---RDMFVEM--LDDFRD
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KIAA03 SQIPENSTSSQLMMNGATSSFENGHPSQPGPPQLTRASADVLSKC------KKALSEHNV
       ..   :: ... ... ..  :.   :.     .     .. .:.:      :.:. :.: 
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KIAA03 LVVEGARKYACKICCKTFLTLTDCKKHIRVHTGEKPYACLKCGKRFSQSSHLYKHSKTTC
          .  ::. :..: : :      ..:  ::: :: ..:  :::.: .  .:  :.    
KIAA09 R--DHRRKHFCNLCGKGFYQRCHLREHYTVHTKEKQFVCQTCGKQFLRERQLRLHNDMHK
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KIAA03 LRWQSSNLPSTLL  
                      
KIAA09 GMASGEIGPSKPVEK
             640      

>>KIAA1020  ( 638 res)   fg00473s1                        (638 aa)
 initn: 468 init1: 182 opt: 274  Z-score: 187.2  bits: 45.1 E(): 2.6e-05
Smith-Waterman score: 341;  22.895% identity (50.074% similar) in 677 aa overlap (54-712:46-630)

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KIAA03 PTSSDTAESDRRGVTASFSEEEGGGARLRIMDFPGHFEQIFQQLNYQRLHGQLCDCVIVV
                                     :..:.: .:.. ::: :: .: ::: .:.:
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KIAA03 GNRHFKAHRSVLAACSTHFRALFSVAEGDQTMNMIQLDSEVVTAEAFAALIDMMYTSTLM
        :  :.::..:::: : .:..:   .  :   :.:.::...:.. .:  ..:..::. :.
KIAA10 ENSIFRAHKNVLAASSIYFKSL---VLHD---NLINLDTDMVSSTVFQQILDFIYTGKLL
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KIAA03 LG----ESNVMDVLLAASHLHLNSVVKACKHYLTTRTLPMSPPSERVQEQSARMQRSFML
        .    : :   .: :::.:.:  ..  :.. :     :..  : :.   :. : :    
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KIAA03 QQLGLSIVSSA----LNSSQNGEEQPAPMSSSMRSNLDQRTPFPMRRLHKRKQSAEERAR
       :.:. . : .:    : ....: . :  . ..  :. :.   :    :   .:.. .   
KIAA10 QRLSTASVIQARYRGLVDGRKGAHAPQELPQAKGSD-DEL--F----LGGSNQDSVQGLG
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KIAA03 QRLRPSIDESAISDVTPE-NGPSGVHSREEFFSPDSLKIVDNPKADGMTDNQEDSAIMFD
       . . :.  :....  .   :: ::   .:  .. .. .    : . :   . .:.: . :
KIAA10 RAVCPAGGEAGLGGCSSSTNGSSGGCEQELGLDLSKKSPPLPPATPGPHLTPDDAAQLSD
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KIAA03 QSFGTQEDAQVPSQSDNSAGNMAQLSMASRATQVETSFDQEAAPEKSSFQCENPEVGLGE
       .. :.   :..:  . :::      :..  .   .  .: :.: ..     : :  :   
KIAA10 SQHGSPPAASAPPVA-NSA------SYSELGGTPDEPMDLEGAEDNHLSLLEAP--GGQP
      300       310              320       330       340           

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KIAA03 KEHMRVVVKSEPLSSPEPQDEVSDVTSQAEGSESVEVEGVVVSAEKIDLSPESSDRSFSD
       .. .:  ....  .. ::          . ::            :. . .:..       
KIAA10 RKSLRHSTRKKEWGKKEP----------VAGSPF----------ERREAGPKGP-----C
     350       360                 370                 380         

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KIAA03 PQSSTDRVGDIHILEVTNNLEHKSTFSISNFLNKSRGNNFTANQNNDDNIPNTTSDCRLE
       :    . :::    .: :..  ...   . .     :.     .....:  ... :    
KIAA10 PGEEGEGVGD----RVPNGILASGAGPSGPY-----GEPPYPCKEEEENGKDASED----
          390           400       410            420       430     

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KIAA03 SEAPYLLSPEAGPAGGPSSAPGSHVENPFSEPADSHFVRPMQEVMGLPCVQTSGYQGGEQ
              : ..:  :: . : . ..   . . .        .  . .::..  :. ..::
KIAA10 -------SAQSGSEGGSGHASAHYM---YRQEGYETVSYGDNLYVCIPCAK--GFPSSEQ
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KIAA03 FGMDF-SRSGLGLH-SSFSRVMIGSPRGGASNFPYYRRIAPKMPVVTSVRSSQIPENSTS
       ..    ...   :  .  .    ::  ::: .       ::.   ..  :  .    :. 
KIAA10 LNAHVETHTEEELFIKEEGAYETGS--GGAEE-EAEDLSAPSAAYTAEPRPFK---CSVC
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KIAA03 SQLMMNGAT-SSFENGHP-SQPGPPQLTRASADVLSKCKKALSEHNVLVVE-----GARK
        . . . ::  . :. :  ..: : ..          : : ........ .     : . 
KIAA10 EKTYKDPATLRQHEKTHWLTRPFPCNI----------CGKMFTQRGTMTRHMRSHLGLKP
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KIAA03 YACKICCKTFLTLTDCKKHIRVHTGEKPYACLKCGKRFSQSSHLYKHSKTTCLRWQSSNL
       .::  :   :       .:.:::.::::: :  :: .:.:. .: .:             
KIAA10 FACDECGMRFTRQYRLTEHMRVHSGEKPYECQLCGGKFTQQRNLISHLRMHTSPS     
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         730
KIAA03 PSTLL

>>KIAA1227  ( 1069 res)   fh04710                         (1069 aa)
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KIAA03 SDTAESDRRGVTASFSEEEGGGARLRIMDFPGHFEQIFQQLNYQRLHGQLCDCVIVVGNR
                                     :.:  .... :: .::.::::: ...::..
KIAA12                   TQAMEGLLHYINPAHAISLLSALNEERLKGQLCDVLLIVGDQ
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KIAA03 HFKAHRSVLAACSTHFRALFSVAEGDQTMNMIQLDSEVVTAEAFAALIDMMYTSTLMLGE
       .:.::..:::: : .:..::.  : .......:::      .::  .....:.:.:.. .
KIAA12 KFRAHKNVLAASSEYFQSLFTNKE-NESQTVFQLD--FCEPDAFDNVLNYIYSSSLFVEK
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KIAA03 SNVMDVLLAASHLHLNSVVKACKHYLTTRTLPMSPPSERV---QEQSARMQRSFMLQQLG
       :..  :   .  : .. ...  ..      .:  :  ..:   ..... ..:: .. :  
KIAA12 SSLAAVQELGYSLGISFLTNIVSK-TPQAPFPTCPNRKKVFVEDDENSSQKRSVIVCQSR
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KIAA03 LSIVSSALNSSQ---NGEEQPAPMSSSMRSNLDQ-RTPFPMRRLHKRKQSAEERARQRLR
           .......:   .   .:.: : ....: .. ..: :.. ::.   :  :..  .  
KIAA12 NEAQGKTVSQNQPDVSHTSRPSP-SIAVKANTNKPHVPKPIEPLHN--LSLTEKSWPK--
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KIAA03 PSIDESAISDVTPENGPSGVHSREEFFSPDSLKIVDNPKADGMTDNQ--EDSAIMFDQSF
          : :..   . :.  ::  : ..   :. ...:   : ...  ..  .:   : :.. 
KIAA12 ---DSSVVYAKSLEH--SG--SLDD---PNRISLV---KRNAVLPSKPLQDREAM-DDKP
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KIAA03 GTQEDAQVPS-QSDNSAGNMAQLSMASRATQVETSFDQEAAPEKSSFQCENPEVGLGEKE
       :..  .:.:. .. . : .  .  . :  .. :: .  . . .:.. : :. ..    : 
KIAA12 GVS--GQLPKGKALELALKRPRPPVLSVCSSSETPYLLKET-NKGNGQGEDRNLLYYSKL
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KIAA03 HMRVVVKSEPLSSPEPQDEVSD-VTSQAEGSESVEVEGVVVSAEKIDLSPESSDRSFSDP
        . :. .:   :. .  :. .  : :  . : :.. . : : . .:::  .::. : :  
KIAA12 GL-VIPSSGSGSGNQSIDRSGPLVKSLLRRSLSMDSQ-VPVYSPSIDL--KSSQGSSS--
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KIAA03 QSSTDRVGDIH-ILEVTNNLEHKSTFSISN----FLNKSRGNNFTANQNNDDNIPNTTSD
         :.:  :..   :   ..:.  :  .  .     :.  :  .:.:.:..: .  . ...
KIAA12 -VSSDAPGNVLCALSQKSSLKDCSEKTALDDRPQVLQPHRLRSFSASQSTDREGASPVTE
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KIAA03 CRLESEAPYLLSPEAGPAGGPSSAPGSHVENPFSEPADSHFVRPMQEVMGLPCVQTSGYQ
        :...:              :::        :.:.:.:  ..:     . .  . :..  
KIAA12 VRIKTE--------------PSS--------PLSDPSD--IIR-----VTVGDAATTAAA
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KIAA03 GGEQFGMDFSRSGLGLHSSFSRVMIGSPRGGASNFPYYRRIAPKMPVVTSVRSSQIPENS
       .. .   :.: .    ....::.    :  .   :   ::. :   . .. ..: . :..
KIAA12 SSSSVTRDLSLKTEDDQKDMSRL----P--AKRRFQADRRL-PFKKLKVNEHGSPVSEDN
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KIAA03 TSSQLMMNGATSSFENGHPSQPGPPQLTRASADVLSKCKKALSEHNVLVVEGAR---KYA
                    ::.:     . : :  :.    .  :  ..:     .::.:   :. 
KIAA12 -------------FEEG-----SSPTLLDADFPDSDLNKDEFGE-----LEGTRPNKKFK
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KIAA03 CKICCKTFLTLTDCKKHIRV-HTGEKPYACLKCGKRFSQSSHLYKHSKTTCLRWQSSNLP
       :: : : : . .  ..:. . :. ::::::  : :::  . ... : .:           
KIAA12 CKHCLKIFRSTAGLHRHVNMYHNPEKPYACDICHKRFHTNFKVWTHCQTQHGIVKNPSPA
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KIAA03 STLL                                                        
                                                                   
KIAA12 SSSHAVLDEKFQRKLIDIVREREIKKALIIKLRRGKPGFQGQSSSQAQQVIKRNLRSRAK
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>>KIAA0414  ( 492 res)   hh00161                          (492 aa)
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KIAA03 KSRNGDAGQDVPTSSDTAESDRRGVTASFSEEEGGGARLRIMDFPGHFEQIFQQLNYQRL
                                     : : :   .:. .::     :.:.:: :: 
KIAA04       NKFIFGLEFVLIFLSLVAPNKICDEMEPGTNSFRV-EFPDFSSTILQKLNQQRQ
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KIAA03 HGQLCDCVIVVGNRHFKAHRSVLAACSTHF--RALFSVAEGDQTMNMIQLDSEVVTAEAF
       .:::::  ::: .. :.::..:::: : .:  ..:..     ..  ..  :  :.. ..:
KIAA04 QGQLCDVSIVVQGHIFRAHKAVLAASSPYFCDQVLLK-----NSRRIVLPD--VMNPRVF
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KIAA03 AALIDMMYTSTLMLGESNVMDVLLAASHLHLNSVVKACKHYL----TTRTLPMSPPSERV
         ..   ::. :..   .... : ::: :..  ::  : . :    :.    ..  :.. 
KIAA04 ENILLSSYTGRLVMPAPEIVSYLTAASFLQMWHVVDKCTEVLEGNPTVLCQKLNHGSDHQ
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KIAA03 QEQSARMQ---RSFMLQQLGLSIVSSALNSSQNGEEQPAPMSSSMRSNLDQRTPFPMRRL
       . .:. ..   .:: : . : .   .: .  ..::..    .. . :.: ..  .:    
KIAA04 SPSSSSYNGLVESFELGSGGHTDFPKA-QELRDGENEEESTKDELSSQLTEHEYLPSNSS
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KIAA03 HKRKQSAEERARQRLRPSIDESAISDVT-PE-NGPSGV-HSREEFFSPDSLKIVDNPKAD
        .. . . : : :  . . ..::    : :  . :: . :.:    .:. :.       .
KIAA04 TEHDRLSTEMASQDGEEGASDSAEFHYTRPMYSKPSIMAHKRWIHVKPERLE----QACE
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KIAA03 GMTDNQEDSAIMFDQSFGTQEDAQVPSQSD-NSAGNMAQLSMASRATQVETSFDQEAAPE
       ::     :    .:.   :.    : ..   . .:   .. .. .  .::. ::..:  .
KIAA04 GM-----DVHATYDEHQVTESINTVQTEHTVQPSGVEEDFHIGEK--KVEAEFDEQA--D
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KIAA03 KSSFQCENPEVGLGEKEHMRVVVKSEPLSSPEPQDEVSDVTSQAEGSESVE-VEGVVVSA
       .:... .    : . .:       :   :. .   . ....  :  ::..: : :.   :
KIAA04 ESNYDEQVDFYGSSMEEF------SGERSDGNLIGHRQEAALAAGYSENIEMVTGIKEEA
            340       350             360       370       380      

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KIAA03 EKIDLS------PESSDRSFSDPQSSTDRVGDIHILEVTNNLEHKSTFSISNFLNKSRGN
        .. .:      : .  .::.  .:. ::  ..:.                         
KIAA04 SHLGFSATDKLYPCQCGKSFTH-KSQRDRHMSMHLGLRPYGCGVCGKKFKMKHHLVGHMK
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KIAA03 NFTANQNNDDNIPNTTSDCRLESEAPYLLSPEAGPAGGPSSAPGSHVENPFSEPADSHFV
                                                                   
KIAA04 IHTGIKPYECNICAKRFMWRDSFHRHVTSCTKSYEAAKAEQNTTEAN             
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>>KIAA1951  ( 679 res)   fj05532                          (679 aa)
 initn: 356 init1: 170 opt: 240  Z-score: 165.9  bits: 41.2 E(): 0.0004
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KIAA03 TSGYQGGEQFGMDFSRSGLGLHSSFSRVMIGSPRGGASNFPYYRRIAPKMPVVTSVRSSQ
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KIAA19 ANPLHRCRCGKTFSNMTKFLYHRRTHAGKSGAPPTGATAPPAPAEPTPPPP--PPAPPAQ
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KIAA03 IPENSTSSQLMMNGATSSFENGHPSQPGPPQLTRASADVLSK-CKKALSEHNVLVVE-GA
       .:  . :...   ...: .   . .  :::.  :    : .:  :: .  .: : .. : 
KIAA19 LPCPQCSKSF---ASASRLSRHRRAVHGPPE-RRHRCGVCGKGFKKLIHVRNHLRTHTGE
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KIAA03 RKYACKICCKTFLTLTDCKKHIRVHTGEKPYACLKCGKRFSQSSHLYKHSKTTCLRWQSS
       : . :. : ::: .:.. ..:  .::: .:: :: :::::.:::.: .: .         
KIAA19 RPFQCHSCGKTFASLANLSRHQLTHTGARPYQCLDCGKRFTQSSNLQQHRRLHLRPVAFA
        510       520       530       540       550       560      

           730                                                     
KIAA03 NLPSTLL                                                     
                                                                   
KIAA19 RAPRLPITGLYNKSPYYCGTCGRWFRAMAGLRLHQRVHARARTLTLQPPRSPSPAPPPPP
        570       580       590       600       610       620      

>>KIAA1129  ( 625 res)   hg04330                          (625 aa)
 initn: 221 init1: 114 opt: 235  Z-score: 163.1  bits: 40.6 E(): 0.00057
Smith-Waterman score: 235;  34.959% identity (67.480% similar) in 123 aa overlap (57-178:68-187)

         30        40        50        60        70        80      
KIAA03 SDTAESDRRGVTASFSEEEGGGARLRIMDFPGHFEQIFQQLNYQRLHGQLCDCVIVVGNR
                                     :.:. . :. .:  : .  ::: .::. . 
KIAA11 TMEGESVKLSSQTLIQAGDDEKNQRTITVNPAHMGKAFKVMNELRSKQLLCDVMIVAEDV
        40        50        60        70        80        90       

         90       100       110        120       130       140     
KIAA03 HFKAHRSVLAACSTHFRALFSVAEGDQTMNMIQ-LDSEVVTAEAFAALIDMMYTSTLMLG
       ...::: :::::: .: :.:.   ::.. .  . .. . : ..... :::..::. . . 
KIAA11 EIEAHRVVLAACSPYFCAMFT---GDMSESKAKKIEIKDVDGQTLSKLIDYIYTAEIEVT
       100       110          120       130       140       150    

         150       160       170       180       190       200     
KIAA03 ESNVMDVLLAASHLHLNSVVKACKHYLTTRTLPMSPPSERVQEQSARMQRSFMLQQLGLS
       : ::. .: ::: :.: .: . :  .: ..  :                           
KIAA11 EENVQVLLPAASLLQLMDVRQNCCDFLQSQLHPTNCLGIRAFADVHTCTDLLQQANAYAE
          160       170       180       190       200       210    

         210       220       230       240       250       260     
KIAA03 IVSSALNSSQNGEEQPAPMSSSMRSNLDQRTPFPMRRLHKRKQSAEERARQRLRPSIDES
                                                                   
KIAA11 QHFPEVMLGEEFLSLSLDQVCSLISSDKLTVSSEEKVFEAVISWINYEKETRLEHMAKLM
          220       230       240       250       260       270    

>>KIAA1490  ( 749 res)   fj08103                          (749 aa)
 initn: 176 init1: 144 opt: 236  Z-score: 163.0  bits: 40.8 E(): 0.00058
Smith-Waterman score: 236;  35.246% identity (63.934% similar) in 122 aa overlap (59-178:195-312)

       30        40        50        60        70        80        
KIAA03 TAESDRRGVTASFSEEEGGGARLRIMDFPGHFEQIFQQLNYQRLHGQLCDCVIVVGNRHF
                                     : :: :....    . :::: ...::::..
KIAA14 GHRLSSTGHSMTPQSDLDSSSSEEFYQAVHHAEQTFRKMESYLKQQQLCDVILIVGNRKI
          170       180       190       200       210       220    

       90       100         110       120       130       140      
KIAA03 KAHRSVLAACSTHFRALFS--VAEGDQTMNMIQLDSEVVTAEAFAALIDMMYTSTLMLGE
        ::: ::.. : .: :.:.  : :. :     ..  : .  .:.  :... ::. : : :
KIAA14 PAHRLVLSSVSDYFAAMFTSDVCEAKQE----EIKMEGIDPNALWDLVQFAYTGCLELKE
          230       240       250           260       270       280

        150       160       170       180       190       200      
KIAA03 SNVMDVLLAASHLHLNSVVKACKHYLTTRTLPMSPPSERVQEQSARMQRSFMLQQLGLSI
       ... ..: ::  :.: .::..: :.:     :                            
KIAA14 DTIENLLAAACLLQLPQVVEVCCHFLMKLLHPSNCLGIRAFADAQGCIELMKVAHSYTME
              290       300       310       320       330       340

        210       220       230       240       250       260      
KIAA03 VSSALNSSQNGEEQPAPMSSSMRSNLDQRTPFPMRRLHKRKQSAEERARQRLRPSIDESA
                                                                   
KIAA14 NIMEVIRNQEFLLLPAEELHKLLASDDVNVPDEETIFHALMMWVKYDMQSRCNDLSMLLA
              350       360       370       380       390       400

>>KIAA1900  ( 582 res)   fk07650                          (582 aa)
 initn: 222 init1: 131 opt: 227  Z-score: 158.4  bits: 39.6 E(): 0.001
Smith-Waterman score: 227;  36.364% identity (73.737% similar) in 99 aa overlap (74-172:1-97)

            50        60        70        80        90       100   
KIAA03 EEGGGARLRIMDFPGHFEQIFQQLNYQRLHGQLCDCVIVVGNRHFKAHRSVLAACSTHFR
                                     : ::: .... ...:.::..:::::: .::
KIAA19                               GILCDITLIAEEQKFHAHKAVLAACSDYFR
                                             10        20        30

           110       120       130       140       150       160   
KIAA03 ALFSVAEGDQTMNMIQLDSEVVTAEAFAALIDMMYTSTLMLGESNVMDVLLAASHLHLNS
       :.::.   ..  . ..: .  ::. ..   ... ::. ..:  . ..::: :.:::.:  
KIAA19 AMFSLCMVESGADEVNLHG--VTSLGLKQALEFAYTGQILLEPGVIQDVLAAGSHLQLLE
               40          50        60        70        80        

           170       180       190       200       210       220   
KIAA03 VVKACKHYLTTRTLPMSPPSERVQEQSARMQRSFMLQQLGLSIVSSALNSSQNGEEQPAP
       ... :.:::                                                   
KIAA19 LLNLCSHYLIQELNSFNYLDLYRLADLFNLTLLEKAVIDFLVKHLSELLKSRPEEVLTLP
       90       100       110       120       130       140        

>>KIAA1559  ( 544 res)   fh19195                          (544 aa)
 initn: 801 init1: 195 opt: 225  Z-score: 157.5  bits: 39.3 E(): 0.0012
Smith-Waterman score: 225;  35.789% identity (66.316% similar) in 95 aa overlap (622-714:138-231)

             600       610       620       630       640       650 
KIAA03 APKMPVVTSVRSSQIPENSTSSQLMMNGATSSFENGHPSQPGPPQLTRASADVLSKCKKA
                                     :..:. . .: :    .. ... ..  :. 
KIAA15 EIYSFQWDIMERIKSYSLQGSIFRNDWECKSKIEGEKEQQEGYFGQVKITSEKMTTYKRH
       110       120       130       140       150       160       

               660       670       680       690       700         
KIAA03 --LSEHNVLVVEGARKYACKICCKTFLTLTDCKKHIRVHTGEKPYACLKCGKRFSQSSHL
         :.:... : .: . : :: : :::.  .  ..:.:.::::::: : .::. : : .::
KIAA15 NFLTEYQI-VHNGEKVYECKECRKTFIRRSTLSQHLRIHTGEKPYKCKECGQAFRQRAHL
       170        180       190       200       210       220      

     710       720       730                                       
KIAA03 YKHSKTTCLRWQSSNLPSTLL                                       
        .: :                                                       
KIAA15 IRHHKLHTGEKPYECKECGKAFTVLQELTQHQRLHTGEKPYECKECGKAFRVHQQLARHQ
        230       240       250       260       270       280      

>>KIAA0132  ( 637 res)   ha01449s1                        (637 aa)
 initn: 134 init1: 103 opt: 225  Z-score: 156.8  bits: 39.4 E(): 0.0013
Smith-Waterman score: 225;  30.147% identity (62.500% similar) in 136 aa overlap (48-178:61-194)

        20        30        40        50        60        70       
KIAA03 DAGQDVPTSSDTAESDRRGVTASFSEEEGGGARLRIMDFPGHFEQIFQQLNYQRLHGQLC
                                     : :   . .  : .: :  .:  ::  :::
KIAA01 PLQSQCPEGAGDAVMYASTECKAEVTPSQHGNRTFSYTLEDHTKQAFGIMNELRLSQQLC
               40        50        60        70        80        90

        80             90       100       110       120       130  
KIAA03 DCVIVVGNR-----HFKAHRSVLAACSTHFRALFSVAEGDQTMNMIQLDSEVVTAEAFAA
       : .. :  .     .: ::. :::. :  :.:.:. .  .: :.......  .  ...  
KIAA01 DVTLQVKYQDAPAAQFMAHKVVLASSSPVFKAMFTNGLREQGMEVVSIEG--IHPKVMER
              100       110       120       130       140          

            140       150       160       170       180       190  
KIAA03 LIDMMYTSTLMLGESNVMDVLLAASHLHLNSVVKACKHYLTTRTLPMSPPSERVQEQSAR
       ::.. ::... .::. :. :. .:   ...:::.::. .:. .  :              
KIAA01 LIEFAYTASISMGEKCVLHVMNGAVMYQIDSVVRACSDFLVQQLDPSNAIGIANFAEQIG
      150       160       170       180       190       200        

            200       210       220       230       240       250  
KIAA03 MQRSFMLQQLGLSIVSSALNSSQNGEEQPAPMSSSMRSNLDQRTPFPMRRLHKRKQSAEE
                                                                   
KIAA01 CVELHQRAREYIYMHFGEVAKQEEFFNLSHCQLVTLISRDDLNVRCESEVFHACINWVKY
      210       220       230       240       250       260        




730 residues in 1 query   sequences
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Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]