# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hg01551mrp1.fasta.nr -Q ../query/KIAA0348.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0348, 1443 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7800800 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3052+/-0.000206; mu= 11.0316+/- 0.011 mean_var=139.8220+/-26.678, 0's: 45 Z-trim: 110 B-trim: 252 in 1/67 Lambda= 0.108464 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|60416428|sp|O15056.3|SYNJ2_HUMAN RecName: Full= (1496) 9722 1534.2 0 gi|25361067|gb|AAN73051.1| synaptojanin 2A [Homo s (1288) 8010 1266.3 0 gi|126311234|ref|XP_001381377.1| PREDICTED: simila (1490) 7813 1235.5 0 gi|194227462|ref|XP_001492268.2| PREDICTED: synapt (1452) 7615 1204.5 0 gi|164664533|ref|NP_001106824.1| synaptojanin 2 is (1479) 7381 1167.9 0 gi|194670195|ref|XP_596626.4| PREDICTED: similar t (2094) 7299 1155.2 0 gi|149028315|gb|EDL83731.1| synaptojanin 2, isofor (1479) 7174 1135.5 0 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.::::::::::::::::.::::::::::::::::::::.:: :::.:.:.:.::. gi|739 SMASMSPTANSCLLEENFDFTTLDYESEGDILEDDEDYLVDELNQSVVSDGEMGADNLSE 970 980 990 1000 1010 1020 1000 1010 1020 1030 1040 1050 KIAA03 VPGPTALAPPSKSPALTKKKQHPTYKDDADLVELKRELEAVGEFRHRSPSRSLSVPNRPR . :: . :::::::::::::::::::::::::.::::::.:::::::::::::.::: gi|739 A--STAAVSASKSPALTKKKQHPTYKDDADLVELKQELEAVGDFRHRSPSRSLSVPTRPR 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1060 1070 1080 1090 1100 1110 KIAA03 PPQPPQRPPPPTGLMVKKSASDASISSGTHGQYSILQTARLLPGAPQQPPKARTGISKPY ::.:::::::::::::::::::.::::::::::::::::.:::::::. :::: :::::: gi|739 PPHPPQRPPPPTGLMVKKSASDVSISSGTHGQYSILQTAKLLPGAPQEAPKARMGISKPY 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1120 1130 1140 1150 1160 1170 KIAA03 NVKQIKTTNAQEAEAAIRCLLEARGGASEEALSAVAPRDLEASSEPEPTPGAAKPETPQA ::::::::::::::::::::::::::. :::.: : :: .. :.::: ::: gi|739 NVKQIKTTNAQEAEAAIRCLLEARGGTPGEALNAPALRD-QGPSKPEPPAGAA------- 1150 1160 1170 1180 1190 1180 1190 1200 1210 1220 1230 KIAA03 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