# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/bf03307.fasta.nr -Q ../query/KIAA0342.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0342, 2467 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7826766 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4386+/-0.000184; mu= 15.5399+/- 0.010 mean_var=83.2144+/-16.101, 0's: 44 Z-trim: 46 B-trim: 22 in 1/65 Lambda= 0.140597 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 44, opt: 32, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|119584883|gb|EAW64479.1| hCG2042887, isoform CR (2826) 16451 3348.5 0 gi|205816263|sp|O15050.4|LBA1_HUMAN RecName: Full= (2925) 16451 3348.5 0 gi|148806872|ref|NP_055646.1| lupus brain antigen (2375) 15838 3224.1 0 gi|109484014|ref|XP_236660.4| PREDICTED: hypotheti (2998) 13836 2818.1 0 gi|205816200|sp|Q8BV79.3|LBA1_MOUSE RecName: Full= (2999) 13773 2805.4 0 gi|149260429|ref|XP_920722.3| PREDICTED: similar t (3015) 13773 2805.4 0 gi|148677025|gb|EDL08972.1| mCG140503 [Mus musculu (2633) 13436 2737.0 0 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