# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/pf00495.fasta.nr -Q ../query/KIAA0335.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0335, 1484 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7809019 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5285+/-0.000193; mu= 13.5135+/- 0.011 mean_var=89.6734+/-17.540, 0's: 42 Z-trim: 130 B-trim: 812 in 1/65 Lambda= 0.135439 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|109896331|sp|Q6AHZ1.2|Z518A_HUMAN RecName: Full (1483) 9860 1938.0 0 gi|50949959|emb|CAH10523.1| hypothetical protein [ (1483) 9854 1936.8 0 gi|109090081|ref|XP_001100415.1| PREDICTED: simila (1481) 9456 1859.0 0 gi|149689802|ref|XP_001501837.1| PREDICTED: simila (1489) 8398 1652.3 0 gi|194041773|ref|XP_001928172.1| PREDICTED: simila (1491) 8197 1613.0 0 gi|205831216|sp|B2RRF6.1|ZF518_MOUSE RecName: Full (1478) 6595 1300.0 0 gi|80478067|gb|AAI09046.1| ZNF518A protein [Homo s ( 953) 6284 1239.1 0 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