# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/ee08846s1.fasta.huge -Q ../query/KIAA0324.ptfa ./tmplib.23147 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0324, 2800 aa vs ./tmplib.23147 library 1984705 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 20.3609+/-0.0158; mu= -54.5754+/- 1.069 mean_var=1018.5624+/-242.337, 0's: 0 Z-trim: 24 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.040187 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 45, opt: 33, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1853 ( 708 res) hj04155 ( 708) 616 52.9 4.9e-07 KIAA0536 ( 1028 res) hg03863 (1028) 539 48.5 1.5e-05 KIAA1019 ( 2309 res) fg00188s1 (2309) 465 44.4 0.00055 KIAA0553 ( 1450 res) pf08859 (1450) 446 43.2 0.00081 KIAA0904 ( 1535 res) ha00554 (1535) 434 42.5 0.0014 KIAA0170 ( 2090 res) ha02399 (2090) 438 42.8 0.0015 KIAA0164 ( 929 res) ha02373 ( 929) 380 39.3 0.008 KIAA1187 ( 813 res) fk03027 ( 813) 375 38.9 0.0088 >>KIAA1853 ( 708 res) hj04155 (708 aa) initn: 977 init1: 248 opt: 616 Z-score: 218.2 bits: 52.9 E(): 4.9e-07 Smith-Waterman score: 646; 31.942% identity (56.806% similar) in 551 aa overlap (217-737:187-708) 190 200 210 220 230 240 KIAA03 FGISDSYVDGSSFDPQRRAREAKQPAPEPPKPYSLVRESSSSRSPTPKQKKKKKKKDRGR . .: .... . :. . ::::::. : . 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KIAA05 KHKHKHKHKKHKRKEVIDASDKEGMSPAKRTKLDDLALLEDLEKQRAL-IKAELDNELME 90 100 110 120 130 140 350 360 370 380 390 KIAA03 GRSPSPA--------SGRRGEGDAPF-SEPGTTSTQRPSSPETATKQPSSPYEDKDKDK- :. : :: . ::. .. :. :. : :: . . .. : ..: KIAA05 GKVQSGMGLILQGYESGSEEEGEIHEKARNGNRSSTRSSSTKGKLELVDNKITTKKRSKS 150 160 170 180 190 200 400 410 420 430 440 450 KIAA03 KEKSATRPSPSPERSSTGPEPPAPTPLLAERHGGSPQPLATTPLSQEPVNPPSEASPTRD . : :: . ..:. : : .. :. : . .. . ::. : ..: KIAA05 RSKERTRHRSDKKKSKGGIE------IVKEKTTRSKSK------ERKKSKSPSKRSKSQD 210 220 230 240 250 460 470 480 490 500 KIAA03 RS-PPKSPEKLPQSSSSESSPPSPQPTKVSRHASSSPESPKPAPAPGSHREISSSPTSKN .. ::: .:. . .. :: ::. . .:. .. : .: ... KIAA05 QARKSKSPTLRRRSQEKIGKARSPTDDKVKIEDKSKSKDRKKSPI-----------INES 260 270 280 290 300 510 520 530 540 550 560 KIAA03 RSHGRAKRDKSHSHTPSRRMGRSRSPATAKRGRSRSRTPTKRGHSRSRSPQWRRSRSAQR ::. :.:...: : :.:.. .:.::. : . .. ..: :..:. 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KIAA05 PIRRRSRSPLRRSRSPRRRSRSPRRRDRGRRSRSRLRR-RSRSRGGRRRRSRSKVKEDKF 470 480 490 500 510 520 740 750 760 770 780 790 KIAA03 RGR-SRSRTPRRGRSRSRSL----VRRGRSHSRTPQRR-GRSGSSSERKNKSRTSQRRSR .: :.. .. : . .: :.. .. ::: :.. .. : .. : KIAA05 KGSLSEGMKVEQESSSDDNLEDFDVEEEDEEALIEQRRIQRQAIVQKYKYLAEDS----- 530 540 550 560 570 580 800 810 820 830 840 KIAA03 SNSSPEMKKSRISSRRSRSLSSP-----RSKAKSRLSLRRSLSGSSPCPKQKSQTPPRRS . : : .: :: :.:: :: : : . :.... : : . .. KIAA05 NMSVPSEPSSPQSSTRTRS-PSPDDILERVAADVKEYERENVDTFEASVKAKHNLMTVEQ 590 600 610 620 630 850 860 870 880 890 900 KIAA03 RSGSSQTKAKSRTPPRRSRSSSSPPPKQKSKTPSRQSHSSSSPHPKVKSGTPPRQGSITS .:::: : KIAA05 NNGSSQKKLLAPDMFTESDDMFAAYFDSARLRAAGIGKDFKENPNLRDNWTDAEGYYRVN 640 650 660 670 680 690 >>KIAA1019 ( 2309 res) fg00188s1 (2309 aa) initn: 568 init1: 297 opt: 465 Z-score: 163.4 bits: 44.4 E(): 0.00055 Smith-Waterman score: 663; 30.279% identity (52.457% similar) in 753 aa overlap (341-1020:1589-2296) 320 330 340 350 360 KIAA03 STSADSASSSDTSRSRSRSAAAKTHTTALAGRSPSPASGRRGEGDAPFS-EPGTTSTQRP : : . : :. . .::. :: .:.:.. KIAA10 AGTSPVGEIGEEKILPTSETKQCTVLDTYPGVSEADA-GETLSSTGPFALEPDATGTSKG 1560 1570 1580 1590 1600 1610 370 380 390 400 410 KIAA03 SSPETATKQPSSPYEDKD-----KDKKEKS--ATRPSPSPERSSTGPEPPAPTPL----- ::. : : .: .. .: :: . : . :: : : KIAA10 IEFTTASTLSLVNKYDVDLSLTTQDTEHDMVISTSPSGGSEADIEGPLPAKDIHLDLPSN 1620 1630 1640 1650 1660 1670 420 430 440 450 460 KIAA03 --LAERHGGSPQPLATTPLSQEPVNPPSEASPTRDRSPPKSPEKLPQSSSS-------ES :. . : :. . . . :.:.: . . :: : ::.:. : :. KIAA10 NNLVSKDTEEPLPVKESDQTLAALLSPKESSGGEKEVPPPPKETLPDSGFSANIEDINEA 1680 1690 1700 1710 1720 1730 470 480 490 500 510 520 KIAA03 SPPSPQ-PTKVSRHAS--SSPESPKPAPAPGSHRE-----ISSSPTSKNRSHGRAKRDKS . : : . : .: .. :.: : : : .:: : ..: .. : : KIAA10 DLVRPLLPKDMERLTSLRAGIEGPLLASDVGRDRSAASPVVSSMPERASESSSEEKDD-- 1740 1750 1760 1770 1780 1790 530 540 550 560 570 KIAA03 HSHTPSRRMGRSRSPATAKRGRSRSRTPTKRGHS-RSRSPQWRRSRSAQRWGRSRSPQRR . .. .. . ...:.... :: : :::: .::.:... .:.:. . : KIAA10 --YEIFVKVKDTHEKSKKNKNRDKGEKEKKRDSSLRSRS---KRSKSSEHKSRKRTSESR 1800 1810 1820 1830 1840 1850 580 590 600 610 620 630 KIAA03 GRSRSPQRPGWSRSRNTQRRGRSRSARRGRSHSRSPATRGR------SRSRTPARRGRSR .:.: .: . :.:. .: :.:::: :: :: .::: .:.:.: .:..:: KIAA10 SRAR--KRSSKSKSHRSQTRSRSRSRRRRRSSRSRSKSRGRRSVSKEKRKRSPKHRSKSR 1860 1870 1880 1890 1900 640 650 660 670 680 690 KIAA03 SRTPARRRSRSRTPTRR-RSRSRTPARRGRSRSRTPARRRSRTRSPVRRRSRSRSPARRS : :.:: :: . :.:::::.:: :::.::.::: :.:: :::: : ::.: KIAA10 ER--KRKRSSSRDNRKTVRARSRTPSRR--SRSHTPSRRR-RSRSVGRRRSFSISPSR-- 1910 1920 1930 1940 1950 1960 700 710 720 730 740 KIAA03 GRSRSRTPARRGRSRSRTPARRGRSRSRTPARRSGRSRSRTPARRGRS---RSRTPRRGR :::::.: :::::.:: ::::.::: :::.::.:. ::::: : : KIAA10 ---RSRTPSR----RSRTPSRR----SRTPSRRS-----RTPSRRSRTPSRRSRTPSR-R 1970 1980 1990 2000 750 760 770 780 790 800 KIAA03 SRSRSLVRRGRSHSRTPQRRGRSGSSSERKNKSRTSQRRSRSNSSPEMKKSRISSRRSRS ::::.::: :: : .: : :: . :. ::. ::.:: :: ...: : .: . KIAA10 RRSRSVVRR-RSFSISPVRLRRS-RTPLRRRFSRSPIRRKRSRSS---ERGR-SPKRLTD 2010 2020 2030 2040 2050 810 820 830 840 850 KIAA03 LSSPR--SKAKSRLSLRRSLSGSSPCPKQKSQTPPR-----RSRSGSSQT-----KAKSR :.. . ::. . . .: :. : :: ..::.. : :. KIAA10 LDKAQLLEIAKANAAAMCAKAGVPLPPNLKPAPPPTIEEKVAKKSGGATIEELTEKCKQI 2060 2070 2080 2090 2100 2110 860 870 880 890 900 KIAA03 TPPRRSRSSSSPPPK---QKSKTPSRQSH--SSSSPHP-----KVKSGTP-PRQGSITSP . ... . :. .. . : : . : :.: .. .. : : ....: KIAA10 AQSKEDDDVIVNKPHVSDEEEEEPPFYHHPFKLSEPKPIFFNLNIAAAKPTPPKSQVTLT 2120 2130 2140 2150 2160 2170 910 920 930 940 950 KIAA03 QANEQSVTPQRRSCFESSPDPELKSRTP-SRHSCSGSSPPRVKSSTPP------RQSPSR . : :.: .. : .: ... ... : ::. : ::. : KIAA10 KEFPVSSGSQHR---KKEADSVYGEWVPVEKNGEENKDDDNVFSSNLPSEGRVKRQGRVR 2180 2190 2200 2210 2220 2230 960 970 980 990 1000 1010 KIAA03 SSSPQPKVKAIISPRQRSHSGSSSPSPS-RVTSRTTPRRSRSVSPCSNV-ESRLLPRYSH . :: .. . : : :.. : . :.. .. ...: .. :. :::.. KIAA10 RQMKQPAASHLTVTRCNSLCGTKPQSEKHRIAENSVITSLPNIGPSLHLWEGS--PRYNY 2240 2250 2260 2270 2280 2290 1020 1030 1040 1050 1060 1070 KIAA03 SGSSSPDTKVKPETPPRQSHSGSISPYPKVKAQTPPGPSLSGSKSPCPQEKSKDSLVQSC .: KIAA10 LASRFASRLYSSRFWW 2300 >>KIAA0553 ( 1450 res) pf08859 (1450 aa) initn: 184 init1: 184 opt: 446 Z-score: 160.4 bits: 43.2 E(): 0.00081 Smith-Waterman score: 621; 24.326% identity (49.191% similar) in 1484 aa overlap (1018-2431:127-1445) 990 1000 1010 1020 1030 1040 KIAA03 RVTSRTTPRRSRSVSPCSNVESRLLPRYSHSGSSSPDTKVKPETPPRQSHSGSISPYPKV :. : : : : : :. : .. : KIAA05 QEFDNHINSYDHAHKQRLKDLKQREFARNVSSRSRKDEK-KQEKALRRLH--ELAEQRK- 100 110 120 130 140 150 1050 1060 1070 1080 1090 1100 KIAA03 KAQTPPG--PSLSGSKSPCPQEKSKD----SLVQSCPGSLSLCA-GVKSSTPPGESYFGV .:. :: : .. . .: ..: : ..: :. . :. : . :: : . .: KIAA05 QAECAPGSGPMFKPTTVAVDEEGGEDDKDESATNSGTGATASCGLGSEFSTDKGGPFTAV 160 170 180 190 200 210 1110 1120 1130 1140 1150 KIAA03 SSLQLKGQSQTSPDHRSDTSSPEVRQSHSESPSLQSKSQTSPKGGRSRS---SSPVTELA . . : .: .: :. : .... . .: :: : : : : ..:: .: KIAA05 QITNTTGLAQ-APGLASQGISFGIKNNLG-TP-LQ-------KLGVSFSFAKKAPV-KLE 220 230 240 250 260 1160 1170 1180 1190 1200 KIAA03 SRSPIRQDRGEFSAS-----PMLKSGMSPEQSRFQSDSSSY---PTVDSNSLLGQSRLET : . . .:..: ..: : ::. . :. .::.:: : . : : : . KIAA05 SIASVFKDHAEEGTSEDGTKPDEKSSDQGLQKVGDSDGSSNLDGKKEDEDPQDGGS-LAS 270 280 290 300 310 320 1210 1220 1230 1240 1250 1260 KIAA03 AESKEKMALPPQEDATASPPRQKDKFSPFPVQDRPESS-LVF-KDTLRTPPRERSGAGSS . :: : . .: : :. :. . : . .:. :.: . . . . . .. KIAA05 TLSKLKR-MKREEGAGATEPEYYHYIPPAHCKVKPNFPFLLFMRASEQMDGDNTTHPKNA 330 340 350 360 370 1270 1280 1290 1300 1310 1320 KIAA03 PETKEQNSALPTSSQDEELMEVVEKSEEPAGQILSHLSSELKEMS-TSNFESSPEVEERP ::.:. .: : : . . . : . .:..: . :: : : : . ..: . KIAA05 PESKKGSSPKPKSC-------IKAAASQGAEKTVSEVSEQPKETSMTEPSEPGSKAEAKK 380 390 400 410 420 430 1330 1340 1350 1360 1370 1380 KIAA03 AVSLTLDQSQSQASLEAVEVPSMASSWGGPHFSPEHKELSNSPLRENSFGSPLEFRNSGP : : . :. :::. : ...:.. . :.. : : . : KIAA05 A----LGGDVSDQSLES-------------H----SQKVSETQMCESN--SSKETSLATP 440 450 460 1390 1400 1410 1420 1430 1440 KIAA03 LGTEMNTGFSSEVKEDLNGPFLNQLETDPSLDMKEQSTRSSGHSSSELSPDAVEKAGMSS : : :.: . .:::. : : : .. : KIAA05 AGKE-----SQEGPKHPTGPFFPVLSKDESTALQW--------------P---------- 470 480 490 500 1450 1460 1470 1480 1490 1500 KIAA03 NQSISSPVLDAVPRTPSRERSSSASSPEMKDGLPRTPSRRSRSGSSPGLRDGSGTPSRHS : .: . :: : . ..: : :. . :... .: .: :. :. KIAA05 -----SELLIFTKAEPSISYSCNPLYFDFK--LSRNKDARTKGTEKP--KD-IGSSSKDH 510 520 530 540 550 1510 1520 1530 1540 1550 1560 KIAA03 LSGSSPGMKDIPRTPSRGRSECDSSPEPKALPQTPRPRSRSPSSPELNNKCLTPQRERSG :.: .:: :.... : . . . .. : .:.: .. : .... : KIAA05 LQGLDPG------EPNKSK-EVGG----EKIVRSSGGRMDAPAS---GSACSGLNKQEPG 560 570 580 590 1570 1580 1590 1600 1610 1620 KIAA03 SESSVDQKTVARTPLGQRSRSGSSQELDVKPSASPQERSESDSSPDSKAKTRTPLRQRSR . . . . ..:. ... :::.:.. ..... .: : : .. ...: KIAA05 GSHGSETEDTGRSLPSKKERSGKSHR--------HKKKKKHKKSSKHKRKHKADTEEKSS 600 610 620 630 640 1630 1640 1650 1660 1670 1680 KIAA03 SGSSPEVDSKSRLSPRRSRSGSSPEVKDKPRAAPRAQSGSDSSPEPKAPAPRALPRRSRS .. : : ..: . :.. ..:.: :. :. :. . ...:: : :: :: :. KIAA05 KAESGEKSKKRKKRKRKKNKSSAPA--DSERG-PKPEPPGSGSPAP----PR---RRRRA 650 660 670 680 690 1690 1700 1710 1720 1730 1740 KIAA03 GSSSKGRG-PSPEGSSSTESSPEHPPKSRTARRGSRSSPEPKTKSRTPPRRRSSRSSPEL ..:. :. :. ::::. .. : : . .:.: : :.. :: . :.. . KIAA05 QDDSQRRSLPAEEGSSGKKD--EGGGGSSSQDHGGR-----KHKGELPPSSCQRRAGTK- 700 710 720 730 740 750 1750 1760 1770 1780 1790 1800 KIAA03 TRKARLSRRSRSASSSPETRSRTPPR-HRRSPSVSSPEPAEKSRSSR--RRRSASSPR-- :..: :.::. .:.. .. . . : :..::: : : :.. .:. : :: :. : KIAA05 -RSSRSSHRSQPSSGDEDSDDASSHRLHQKSPSQYSEEEEEEDSGSEHSRSRSRSGRRHS 760 770 780 790 800 1810 1820 1830 1840 1850 1860 KIAA03 TKTTSRRGRSPSPKPRGLQRSRSRSRREKTRTTRRRDRSGSSQSTSRRRQRSRSRSRVTR .. .:::. : : . : ::.: . . : : :. :.: . : . . .. KIAA05 SHRSSRRSYSSSSDASSDQSCYSRQRSYSDDS--YSDYSDRSRRHSKRSHDSDDSDYASS 810 820 830 840 850 860 1870 1880 1890 1900 1910 KIAA03 RRRGGSGYHSRSPARQESSRTSSRRR-RGRSRTPPTSRKRSRSRTSPAPWKRSRSRA-SP ..: : :. : . .. : . :. : :.::.: ::.:.:::.: .::. :. : KIAA05 KHR--SKRHKYSSSDDDYSLSCSQSRSRSRSHTRERSRSRGRSRSSSCSRSRSKRRSRST 870 880 890 900 910 920 1920 1930 1940 1950 1960 1970 KIAA03 ATHRRSRSRTPLISRRRSRSRTSPVSRRRSRSRT---SVTRRRSRSRASPVSRRRSRSRT ..: .:::. :: :::: :: .: ::.:. ..: .: . . . ::.. KIAA05 TAHSWQRSRS--YSRDRSRSTRSPSQRSGSRKRSWGHESPEERHSGRRDFIRSKIYRSQS 930 940 950 960 970 980 1980 1990 2000 2010 2020 KIAA03 PPVTRRRSRSRTPTTRRR-----SRSRTPPVTRRR---SRSRTPPVTRRRSRSRTSPITR : : .:.. : . :.. :: .:. . . . : :. . KIAA05 PHYFRS-GRGEGPGKKDDGRGDDSKATGPPSQNSNIGTGRGSEGDCSPEDKNSVTAKLLL 990 1000 1010 1020 1030 1040 2030 2040 2050 2060 2070 2080 KIAA03 RRSRSRTSPVTRRRSRSRTSPVTRRRSRSRTSPVTRRRSRSRTPPAIRRRSRSRTPLLPR .. .:: : :. : :. .: .. . . . . ::.. . :.:: KIAA05 EKIQSR--KVERKPSVSEEVQATPNKAGPKLKDPPQGYFGPKLPPSLGNK-----PVLPL 1050 1060 1070 1080 1090 2090 2100 2110 2120 2130 2140 KIAA03 --KRSRSRSPLAIRRRSRSRTPRTARGKRSLTRSPPAIRRRSASGSS--SDRSRSAT--P : .:.: .. .: : . ..: :. : . : . :... . : KIAA05 IGKLPATRKP--NKKCEESGLERGEEQEQSETEEGPPGSSDALFGHQFPSEETTGPLLDP 1100 1110 1120 1130 1140 1150 2150 2160 2170 2180 2190 KIAA03 PATRNHSGSRTP--PVA-LNSSRMS-CF-SRPSMSPTPLDRCRSPGMLEPLGSSRTPMSV : ...:: : ::: :.. : :. . :..: . : . :: : :: : : KIAA05 PPEESKSGEATADHPVAPLGTPAHSDCYPGDPTISHNYLPDPSDGDTLESLDSSSQPGPV 1160 1170 1180 1190 1200 1210 2200 2210 2220 2230 2240 2250 KIAA03 LQQAGGSMMDGPGPRIPD--HQRTSVPENHAQSRIALALTAISLGTARPPPSMSAAGLAA .:.. : :: : . .: . : . .. . : : : . KIAA05 ----ESSLL----PIAPDLEHFPSYAPPSGDPS----------IESTDGAEDASLAPLES 1220 1230 1240 1250 2260 2270 2280 2290 2300 2310 KIAA03 R-MSQVPAPVPLMS-LRTAPAANLASRIPAASAAAMNLASARTPAIPTAVNLADSRTPAA . .. .: . .: :. : .. ... : .. :. ..: .:: : :.. . ::. KIAA05 QPITFTPEEMEKYSKLQQAAQQHIQQQLLAKQVKAFPASAALAPATP-ALQPIHIQQPAT 1260 1270 1280 1290 1300 1310 2320 2330 2340 2350 2360 KIAA03 AAAMNLASPRTAV-------APSAVNL-ADPRT-PTAPAVNLAGAR-TPAALAALSLTGS :.: .... . :. : .:... :. : : . .. . :: .:. :: : KIAA05 ASATSITTVQHAILQHHAAAAAAAIGIHPHPHPQPLAQVHHIPQPHLTPISLS--HLTHS 1320 1330 1340 1350 1360 1370 2370 2380 2390 2400 2410 KIAA03 GTPPTAANYPSSSRTPQAPASANLVGPRSAH-----ATAPVNIAGSRTAAALAPASLTSA : :.. .: :::: :: . : : :. .: : ::: : : KIAA05 IIPGHPATFLASHPIHIIPASAIHPGPFTFHPVPHAALYPTLLA-PRPAAAAATALHLHP 1380 1390 1400 1410 1420 1430 2420 2430 2440 2450 2460 2470 KIAA03 RMAPALSGANLTSPRVPLSAYERVSGRTSPPLLDRARSRTPPSAPSQSRMTSERAPSPSS . : .:: .: : KIAA05 LLHPIFSGQDLQHPPSHGT 1440 1450 >>KIAA0904 ( 1535 res) ha00554 (1535 aa) initn: 303 init1: 185 opt: 434 Z-score: 156.3 bits: 42.5 E(): 0.0014 Smith-Waterman score: 556; 22.642% identity (48.022% similar) in 1643 aa overlap (346-1906:56-1534) 320 330 340 350 360 370 KIAA03 SASSSDTSRSRSRSAAAKTHTTALAGRSPSPASGRRGEGDAPFSEPGTTSTQRPSSP--E : : :.: : : :...: .::: KIAA09 VELGLGGWVGVAFWSAGELFSLLQVRGKGMPNSERHG-GKKDGS-GGASGTLQPSSGGGS 30 40 50 60 70 80 380 390 400 410 420 430 KIAA03 TATKQPSSPYEDKDKDKKEKSATRPSPSPERSSTGPEPPAPTPLLAERHGGSPQPLATTP . ... . . :...: .:: .: : . ::. .: . . 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KIAA09 TSAVSSQANSQ-PPVQV---SVKTQVSVTAAI-PHLKTSTLPPLPLPPLLPGDDDMDSPK 650 660 670 680 690 700 1000 1010 1020 1030 1040 1050 KIAA03 SVSPCSNVESRLLPRYSHSGSSSPDTKVKPETPPRQSHSGSISP--YPKVKAQTPPG-PS . : . :... : : .. : . :: : .:..:: :. :: ::: : KIAA09 ETLPSKPVKKEKEQRTRHLLTDLP---LPPELP-----GGDLSPPDSPEPKAITPPQQPY 710 720 730 740 750 1060 1070 1080 1090 1100 1110 KIAA03 LSGSKSPCPQ----EKSKDSLVQSCPGSLSLCAGVKSSTPPGESYFGVSSLQLKGQSQTS . : ::. ...... . : .... . . ::. .: : . KIAA09 KKRPKICCPRYGERRQTESDWGKRCVDKFDIIGII------GEGTYG--------QVYKA 760 770 780 790 1120 1130 1140 1150 1160 1170 KIAA03 PDHRSDTSSPEVRQSHSESPSLQSKSQTSPKGGRSRSSSPVTELASRSPIRQDRGEFSAS :. ::. : .:.. . : : :.: . . .:: . .. KIAA09 KDK--DTG---------ELVALKKVRLDNEKEG-----FPITAIREIKILRQLIHRSVVN 800 810 820 830 840 1180 1190 1200 1210 1220 KIAA03 PMLKSGMSPEQSR--FQSDSSSYPTV------DSNSLLGQSRLETAESKEKMALPPQEDA .: .. .:. :..:.... : : .:: .. .. .:.. : . .. KIAA09 --MKEIVTDKQDALDFKKDKGAFYLVFEYMDHDLMGLLESGLVHFSEDHIKSFMKQLMEG 850 860 870 880 890 900 1230 1240 1250 1260 1270 1280 KIAA03 TASPPRQKDKFSPFPVQDRPESSLVFKDTLRTPPRERSGAG--SSPETKEQ-NSALPTSS ... : .: :....... . . . : .: :.. :... KIAA09 LEYCHKKN-----FLHRDIKCSNILLNNSGQIKLADFGLARLYNSEESRPYTNKVITLWY 910 920 930 940 950 1290 1300 1310 1320 1330 1340 KIAA03 QDEELMEVVEKSEEPAGQILSHLSSELKEMSTSNFESSPEVEERPAVSLTLDQSQSQASL . ::. . :. :: .. : . : :. : ..: . ..: : : . . : KIAA09 RPPELL-LGEERYTPAIDVWS-CGCILGEL----FTKKPIFQ----ANLELAQLELISRL 960 970 980 990 1000 1350 1360 1370 1380 1390 1400 KIAA03 EAVEVPSMASSWGGPHFSPEHKELSNSPLRENSFGSPLEFRNSGPLGTEMNTGFSSEVKE . :.. : :. .: : :.. ..: : :.. : . KIAA09 CGSPCPAV---W------PDVIKL---PYF-NTMKPKKQYRRR--LREEFS--FIPSAAL 1010 1020 1030 1040 1410 1420 1430 1440 KIAA03 DLNGPFLNQLETDPSLD-MKEQSTRSSGHSSSELS----PDAVEK-------AGMSSNQS :: . ..: ::: ::. .:. .. ::: :: . . : KIAA09 DL---LDHMLTLDPSKRCTAEQTLQSDFLKDVELSKMAPPDLPHWQDCHELWSKKRRRQR 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1450 1460 1470 1480 1490 1500 KIAA03 ISSPVLDAVP--RTPSRERSSSASSPEMKDGLPRTPSRRSRSGSSPGLRDGSGTPSRHSL :. :.. : .: .: .:..:. .:.. : :. .:: . :: KIAA09 QSGVVVEEPPPSKTSRKETTSGTSTEPVKNSSPAPPQ------PAPG-KVESG------- 1110 1120 1130 1140 1150 1510 1520 1530 1540 1550 1560 KIAA03 SGSSPGMKDIPRTPSRGRSECD------SSPEPKALPQTPRPRSRSPSSPELNNKCLTPQ .:.. :. :: : . ..:: .: ..:: . . :.::.... . . KIAA09 AGDAIGLADI--TQQLNQSELAVLLNLLQSQTDLSIPQMAQLLN-IHSNPEMQQQLEALN 1160 1170 1180 1190 1200 1570 1580 1590 1600 1610 1620 KIAA03 RERSGSESSVDQKTVARTPLGQRSRSGSSQELDVKPSASPQERSESDSSPDSKAKTRTPL . :. ...:. ..: ..: . . . . ::: : :..:.: . . . : KIAA09 QSISALTEATSQQQDSETMAPEESLKEAPSAPVILPSAE-QMTLEASSTPADMQNILAVL 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1630 1640 1650 1660 1670 1680 KIAA03 RQRSRSGSSPEVDSKSRLSPRRSRSGSSPEVKDKPRAAPRAQSGSDSSPEPKAPAPRALP .. . . : . : : ..:.:. . . :. ... ::: .: : : KIAA09 LSQLMKTQEPA----GSLEENNSDKNSGPQGPRRTPTMPQEEAAEKRPPEPPGPPPPPPP 1270 1280 1290 1300 1310 1320 1690 1700 1710 1720 1730 1740 KIAA03 RRSRSGSSSKGRGPSPEGSSSTESSP-EHPPKSRTARRGSRSSPEPKTKSRTPPRRRSSR : ::. : :.: : : .: :.:: . .. : .... : KIAA09 ------------PPLVEGDLS--SAPQELNPAVTAALLQLLSQPEAEPPGHLPHEHQALR 1330 1340 1350 1360 1750 1760 1770 1780 1790 KIAA03 SSPELTRKARLSRRSRSASSSPETRSRTPPRHRRSPSVSSPEPAEKSRSSRRRRSAS-SP : . . : :. . ...::: . .:. . . : .. . : :.: : KIAA09 PM-EYSTRPR-PNRTYGNTDGPETGFSAIDTDERNSGPALTESLVQTLVKNRTFSGSLSH 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1800 1810 1820 1830 1840 1850 KIAA03 RTKTTSRRGRSPS--PKPRGLQRSRSRSRREKTRTTRRRDRSGSSQSTSRRRQRSRSRSR ...: .: . : . :. .: . . :::.:. . . . .. .. KIAA09 LGESSSYQGTGSVQFPGDQDLRFARVPLALHPVVGQPFLKAEGSSNSVVHAETKLQNYGE 1430 1440 1450 1460 1470 1480 1860 1870 1880 1890 1900 1910 KIAA03 VTRRRRG----GSGYHSRSPARQESSRTSSRRRRGRSRTPPTSRKRSRSRTSPAPWKRSR . : :.: : .:.. : . .. :: .:.:: . .:.: : KIAA09 LGPGTTGASSSGAGLHWGGPTQ---SSAYGKLYRGPTRVPP---RGGRGRGVPY 1490 1500 1510 1520 1530 1920 1930 1940 1950 1960 1970 KIAA03 SRASPATHRRSRSRTPLISRRRSRSRTSPVSRRRSRSRTSVTRRRSRSRASPVSRRRSRS >>KIAA0170 ( 2090 res) ha02399 (2090 aa) initn: 201 init1: 164 opt: 438 Z-score: 155.6 bits: 42.8 E(): 0.0015 Smith-Waterman score: 625; 21.613% identity (49.095% similar) in 1823 aa overlap (740-2496:177-1829) 710 720 730 740 750 760 KIAA03 TPARRGRSRSRTPARRSGRSRSRTPARRGRSRSRTPRRGRSRSRS-LVRRGRSHSRTPQR :. : ...:. : : .: .. ....: KIAA01 TVEETPRVQGETQPQRLLLAEDSEEEVDFLSERRMVKKSRTTSSSVIVPESDEEGHSPVL 150 160 170 180 190 200 770 780 790 800 810 820 KIAA03 RGRSGSSSERKNKSRTSQRRSRSNSSPEMKKSRISSRRSRSLSSPRSKAKSRLSLRRSLS : . . : :. . ...: ... ..::. .. . .:.:. .. : KIAA01 GGLGPPFAFNLN----SDTDVEEGQQPATEEASSAARRGATVEAKQSEAEVVTEIQ--LE 210 220 230 240 250 260 830 840 850 860 870 880 KIAA03 GSSPCPKQKSQTPPRRSRSGSSQTKA----KSRTPPRRSRSSSSPPPKQKSKTPSRQSHS ..: :.... . .:.. . : . :: .. ... .. :.. KIAA01 KDQPLVKERDNDTKVKRGAGNGVVPAGVILERSQPPGEDSDTDVDDDSRPPGRPAEVHLE 270 280 290 300 310 320 890 900 910 920 930 940 KIAA03 SSSPHPKVKSGTPPRQGSITSPQANEQSVTPQRRSCFES--SPDPELKSRTPSRHSCSGS ..: . : : .. : : :. . ..:. :.. . : . . ..: .:: KIAA01 RAQPFGFIDSDTDAEEERI--P-ATPVVIPMKKRKIFHGVGTRGPGAPGLAHLQESQAGS 330 340 350 360 370 950 960 970 980 990 1000 KIAA03 SPPRVKSSTPPRQSPSRSSSPQPKVKAIISPRQRSHSGSSSPSPSRVTSRTTPRRSRSVS . :. . :. : ..:. . ... . ... .. . .. : .. KIAA01 DTD-VEEGKAPQAVPLEKSQASMVINSDTDDEEEVSAALTLAHLKESQPAIWNRDAEEDM 380 390 400 410 420 430 1010 1020 1030 1040 1050 KIAA03 PCSNVESRLLPRYSHSGSSSPDTKVKPETPPRQSHSGSISPYPKVKA-----QTPPGPSL : : :: : . . . :: :. : : ... . .. . :..: . : . KIAA01 PQRVV---LLQRSQTTTERDSDTDVEEEELPVENREAVLKDHTKIRALVRAHSEKDQPPF 440 450 460 470 480 490 1060 1070 1080 1090 1100 1110 KIAA03 SGSKSPCPQEKSKDSL-VQSCPGSLS--LCAGVKSSTPPGESYFGVSSLQLKGQSQTSPD . : . .::. .. .. .: . . . :.. .::: . . ... :.. .. .. : KIAA01 GDSDDSVEADKSSPGIHLERSQASTTVDINTQVEKEVPPGSAIMHIKKHQVSVEGTNQTD 500 510 520 530 540 550 1120 1130 1140 1150 1160 1170 KIAA03 HRSDTSSPE--VRQSHSESPSLQSKSQTSPKGGRSRSSSPVTEL-ASRSPIRQDRGEFSA .. ...: . : :. :.. .:. . : : ..: :... :. : . : : : KIAA01 VKA-VGGPAKLLVVSLEEAWPLHGDCETDAEEGTSLTASVVADVRKSQLPAEGDAGAEWA 560 570 580 590 600 610 1180 1190 1200 1210 1220 1230 KIAA03 SPMLKSGMSPEQSRFQSDSSSYPTVDSNSLLGQSRLETAESKEKMALPPQEDATASPPRQ . .::. :... . ... :... .. : :: :. ... . . .. :.. KIAA01 AAVLKQ----ERAHEVGAQGGPPVAQVEQDLPISR----ENLTDLVVDTDTLGESTQPQR 620 630 640 650 660 1240 1250 1260 1270 1280 1290 KIAA03 KDKFSPFPVQDRPESSLVFKDTLRTPPRERSGAGSSPETKEQNSALPTSSQDEELMEVVE . : ..: . ::. ... :.: . : . .: : .. .: KIAA01 EGAQVPTG-REREQHVGGTKDS-------EDNYGDSEDLDLQATQCFLENQGLEAVQSME 670 680 690 700 710 1300 1310 1320 1330 1340 KIAA03 KSEEPAGQILSHLSSELKEMSTSNFESSPEVEERPAVSLTLDQSQSQASLEAVEVP--SM .::. .. .:: : .:... ..: : :. . . : .. : . KIAA01 --DEPTQAFMLTPPQELGP-SHCSFQTTGTLDE-PWEVLATQPFCLRESEDSETQPFDTH 720 730 740 750 760 770 1350 1360 1370 1380 1390 1400 KIAA03 ASSWGGPHFSPEHKELSNSPLRENSFGSPLEFRNSGPLGTEMNTGFSSEVKEDLNGPFLN ..: : .:: . ... . :. ... : .. :. .:. : . :: . KIAA01 LEAYG-PCLSPPRAIPGDQHPESPVHTEPMGIQGRGRQTVDKVMGIPKETAERV-GPERG 780 790 800 810 820 830 1410 1420 1430 1440 1450 1460 KIAA03 QLETDPSLDMKEQSTRSSGHSSSELSPDAVEKAGMSSNQSISSPVLDAVPRTPSRERSSS :: . . :..: .:. ::. :. .. .:. . . : .:..:. KIAA01 PLERETEKLLPERQTDVTGEE--ELT-----KGKQDREQK------QLLARDTQRQESD- 840 850 860 870 1470 1480 1490 1500 1510 1520 KIAA03 ASSPEMKDGLPRTPSRRSRSGSSPGLRDGSGTPSRHSLSGSSPGM---KDIPRTPSRGRS :.: .: .:.: . . .. . .. . . :. ... : : .: KIAA01 ------KNGESASP-ERDRESLKVEIETSEEIQEKQVQKQTLPSKAFEREVER-PVANR- 880 890 900 910 920 1530 1540 1550 1560 1570 1580 KIAA03 ECDSSPEPKALPQTPRPRSRSPSSPELNNKCLTPQRERSGSESSV---DQKTVARTPLGQ ::: . . .:.. :. . . :: ... : : .: : . .:. . KIAA01 ECDPAELEEKVPKVILERDTQRGEPEGGSQDQKGQASSPTPEPGVGAGDLPGPTSAPVPS 930 940 950 960 970 980 1590 1600 1610 1620 1630 1640 KIAA03 RSRSGSSQELDVKPSASPQERSESDSSPDSKAKTRTPLRQRSRSGSSPEVDSKSRLSPRR :.::. .: .:: : .. . . : : .. :: .. .:. .. :: KIAA01 GSQSGGRG----SP-VSP--RRHQKGLLNCKMP---PAEKASRIRAAEKVSRGDQESPDA 990 1000 1010 1020 1030 1650 1660 1670 1680 1690 KIAA03 SRSGSSPEVKDKPRAAPRAQSGSDSSPEPK-APA-PRALP--RRSRSGSSSKGRGPSPEG . ::. :. .:: . .: : .: : : :..:. .:.. .::. KIAA01 CLPPAVPEAPAPPQKPLNSQSQKHLAPPPLLSPLLPSIKPTVRKTRQDGSQE----APEA 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1700 1710 1720 1730 1740 1750 KIAA03 SSSTESSPEHP-PKSRTARRGSRSSPEPKTKSRTPPRRRSSRS---SPELTRKARLSRRS :.: : :: :: :: :..:: .: : :.. :. .: . .:. : .: :: . KIAA01 PLSSELEPFHPKPKIRT-RKSSRMTPFPATSAAPEPHPSTSTAQPVTPKPTSQATRSRTN 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1760 1770 1780 1790 1800 1810 KIAA03 RSASSSPETRSRTPPRHRRSPSVSSPEPAEK-SRSSRRRRSASSPRTKTTSRRGRSPSPK ::. ..:: : :. . : :...: .: :. .: :.: :: .: : : KIAA01 RSSVKTPEPVVPTAPELQPSTSTDQPVTSEPTSQVTRGRKSRSSVKTPETV------VPT 1160 1170 1180 1190 1200 1820 1830 1840 1850 1860 1870 KIAA03 PRGLQRSRSRSRREKTRTTRRRDRSGSSQSTSRRRQRSRSRSRVTRRRRGGSGYHSRSPA :: : : .: .. : ::.: :..:: .. . : : KIAA01 ALELQPSTSTDRPVTSEPT--------SQATRGRKNRSSVKTPEPVVPTAPELQPSTSTD 1210 1220 1230 1240 1250 1880 1890 1900 1910 1920 1930 KIAA03 RQESSRTSSRRRRGRSRTPPTSRKRSRSRTSPAPWKRSRSRASPATHRRSRSRTPLISRR . .:. . . ::: ..:: .: : : . . :.: .: :: . : KIAA01 QPVTSEPTYQATRGR-------KNRSSVKT-PEPVVPTAPELRPSTST-DRPVTPKPTSR 1260 1270 1280 1290 1300 1940 1950 1960 1970 1980 1990 KIAA03 RSRSRT--SPVSRRRSRSRTSVTRRRSRSRASPVSRRRSRSRTPPVTRRRSRSRTPTTRR .:::: : :. .. :. . : : .:: :: : : .:::: . KIAA01 TTRSRTNMSSVKTPETVVPTAPELQISTSTDQPV--------TPKPTSRTTRSRTNMSSV 1310 1320 1330 1340 1350 1360 2000 2010 2020 2030 2040 2050 KIAA03 RSRSRTPPVTRRR--SRSRTPPVTRRRSRSRTSPITRRRSRSRTSPVTRRRSRSRTSPVT .. : :.. . : : ::: . . ::.. . :: ..: : : . . : : KIAA01 KNPESTVPIAPELPPSTSTEQPVTPEPT-SRATRGRKNRSSGKT-PETLVPTAPKLEPST 1370 1380 1390 1400 1410 2060 2070 2080 2090 2100 2110 KIAA03 RRRSRSRTSPVTRRRSRSRTPPAIRRRSRSRTPLLPRKRSRSRSPLAIRRRSRSRTPRTA . : : . .:.:: . . .. .: :. . . . . . :.. : . KIAA01 STDQPVTPEP-TSQATRGRTNRSSVKTPETVVPTAPELQPSTSTDQPVTPEPTSQATR-G 1420 1430 1440 1450 1460 1470 2120 2130 2140 2150 2160 KIAA03 RGKRSLTRSP----PAIRRRSASGSSSDRSRSATPPAT-----RNHSGSRTPPVALNSSR : :: ...: :. . .:: .:.:. .. : . .:.:. .:: ... .. KIAA01 RTDRSSVKTPETVVPTAPELQAS-ASTDQPVTSEPTSRTTRGRKNRSSVKTPETVVPAA- 1480 1490 1500 1510 1520 1530 2170 2180 2190 2200 2210 2220 KIAA03 MSCFSRPSMSP-TPLDRCRSPGMLEPLGSSRTPMSVLQQAGGSMMDGPGPRIPDHQRTSV : ..: : :: .: :: .::. . .... . .. : :. : .. 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KIAA01 --DGFREEKNYKLKETGYVVERPST-TKDKHKEEDKNSERITVKKETQSPEQVKSEKLKD 460 470 480 490 500 510 1170 1180 1190 1200 1210 1220 KIAA03 -FSASPMLKSGMSP-EQSRFQSDSS-SYPTVDSNSLLGQSRLETAESKEKMALPPQEDAT :. :: :..... :.: :. .: . :.: . : : ::: : .:.. KIAA01 LFDYSPPLHKNLDAREKSTFREESPLRIKMIASDS-------HRPEVKLKMAPVPLDDSN 520 530 540 550 560 1230 1240 1250 1260 1270 1280 KIAA03 ASPPRQKDKFSP----FPVQDRPESSLVFKDTLRTPPRERSGAGSSPETKEQNSALPTSS ::.. :. . : .: : .. : .: .: .. .: KIAA01 RPASLTKDRLLASTLVHSVKKEQEFRSIF-DHIKLPQASKS---TSESFIQHIVSL---- 570 580 590 600 610 620 1290 1300 1310 1320 1330 KIAA03 QDEELMEVVEKSEEPAGQILSHLSSELKEMST--SNFESSPEVEERPAVSLTLDQSQSQA . .: :. . :.. :.. . .. . :. ..:::...: .: . ..... KIAA01 ----VHHVKEQYFKSAAMTLNERFTSYQKATEEHSTRQKSPEIHRRIDISPSTLRKHTRL 630 640 650 660 670 1340 1350 1360 1370 1380 1390 KIAA03 SLEAVEVPSMASSWGGPHFSPEHKELSNSPLRENSFGSPLEFRNSGPLGTEMNTGFSSEV . : .: . .. : .. . .: .. :. . : . :... :.. ..: .. 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KIAA11 AAVLTSPPAPA-PPVTPSKPMAGTTDREEATRLLAEKRRQAREQREREEQERRLQAERDK 550 560 570 580 590 600 2800 residues in 1 query sequences 1984705 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:16:30 2008 done: Thu Dec 18 15:16:33 2008 Total Scan time: 1.350 Total Display time: 1.000 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]