# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hg00467.fasta.huge -Q ../query/KIAA0323.ptfa ./tmplib.23147 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0323, 724 aa vs ./tmplib.23147 library 1986781 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4307+/-0.00767; mu= 12.5988+/- 0.522 mean_var=219.1604+/-51.402, 0's: 0 Z-trim: 4 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.086635 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1305 ( 1819 res) fh04045s1 (1819) 879 123.4 1.9e-28 KIAA0615 ( 943 res) hg01354a ( 943) 799 113.0 1.3e-25 KIAA1726 ( 624 res) pf01109 ( 624) 559 82.7 1.1e-16 >>KIAA1305 ( 1819 res) fh04045s1 (1819 aa) initn: 1293 init1: 644 opt: 879 Z-score: 602.6 bits: 123.4 E(): 1.9e-28 Smith-Waterman score: 879; 62.621% identity (85.437% similar) in 206 aa overlap (437-642:667-870) 410 420 430 440 450 460 KIAA03 PPAPEPPWHCGDRGDCGDRGDVGDRGDKQQGMARGRGPQWKRGARGGNLVTGTQRFKEAL : .: : : .... ::. ::..::: KIAA13 GQGQAGRQGPQSSGTLALSSKHQFQMEGLLGAWEGAPRQPPRHLQANSTVTSFQRYHEAL 640 650 660 670 680 690 470 480 490 500 510 520 KIAA03 QDPFTLCLANVPGQPDLRHIVIDGSNVAMVHGLQHYFSSRGIAIAVQYFWDRGHRDITVF . :: : :.. ::. ::..:::::.:::::::::.:: ::::.:::.::.::::..::: KIAA13 NTPFELNLSGEPGNQGLRRVVIDGSSVAMVHGLQHFFSCRGIAMAVQFFWNRGHREVTVF 700 710 720 730 740 750 530 540 550 560 570 580 KIAA03 VPQWRFSKDAKVRESHFLQKLYSLSLLSLTPSRVMDGKRISSYDDRFMVKLAEETDGIIV :: :...:. .::::::: ::.::..::.:::.. .::.:..:: ::::::::::::::: KIAA13 VPTWQLKKNRRVRESHFLTKLHSLKMLSITPSQLENGKKITTYDYRFMVKLAEETDGIIV 760 770 780 790 800 810 590 600 610 620 630 640 KIAA03 SNDQFRDLAEESEKWMAIIRERLLPFTFVGNLFMVPDDPLGRNGPTLDEFLKKPARTQGS .:.:.. : . :.: : ...:::::::.:::::::::::::.::::::::::: : KIAA13 TNEQIHILMNSSKKLM--VKDRLLPFTFAGNLFMVPDDPLGRDGPTLDEFLKKPNRLDTD 820 830 840 850 860 870 650 660 670 680 690 700 KIAA03 SKAQHPSRGFAEHGKQQQGREEEKGSGGIRKTRETERLRRQLLEVFWGQDHKVDFILQRE KIAA13 IGNFLKVWKTLPPSSASVTELSDDADSGPLESLPNMEEVREEKEERQDEEQRQGQGTQKA 880 890 900 910 920 930 >>KIAA0615 ( 943 res) hg01354a (943 aa) initn: 1090 init1: 798 opt: 799 Z-score: 551.5 bits: 113.0 E(): 1.3e-25 Smith-Waterman score: 936; 30.540% identity (52.260% similar) in 907 aa overlap (46-720:44-942) 20 30 40 50 60 70 KIAA03 LQPELQGSPAGWDSTEGWTWGDGEHGLGAAAMPTWGARPASPDRFAVSAEAENKVREQQP : :. .:: : :.:.. :: . ..... 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