# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hg00378.fasta.nr -Q ../query/KIAA0319.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0319, 1109 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7821539 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7601+/-0.000193; mu= 11.9266+/- 0.011 mean_var=96.5638+/-18.423, 0's: 42 Z-trim: 61 B-trim: 30 in 1/66 Lambda= 0.130517 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|194383062|dbj|BAG59087.1| unnamed protein produ (1063) 6991 1327.6 0 gi|194379034|dbj|BAG58068.1| unnamed protein produ (1027) 6824 1296.1 0 gi|219519164|gb|AAI44629.1| Unknown (protein for M (1011) 6297 1196.9 0 gi|74221737|dbj|BAE28638.1| unnamed protein produc ( 985) 4035 770.9 0 gi|148698327|gb|EDL30274.1| expressed sequence AU0 (1122) 3018 579.5 3.5e-162 gi|148698326|gb|EDL30273.1| expressed sequence AU0 (1055) 3007 577.4 1.4e-161 gi|118101658|ref|XP_417781.2| PREDICTED: hypotheti ( 780) 2997 575.4 4.1e-161 gi|149023971|gb|EDL80468.1| rCG31424 [Rattus norve (1056) 2990 574.2 1.3e-160 gi|26335463|dbj|BAC31432.1| unnamed protein produc (1085) 2989 574.0 1.5e-160 gi|26351215|dbj|BAC39244.1| unnamed protein produc (1085) 2989 574.0 1.5e-160 gi|123244433|emb|CAM19270.1| likely ortholog of H. (1085) 2989 574.0 1.5e-160 gi|18027398|gb|AAL55781.1|AF289597_1 unknown [Homo ( 946) 2959 568.3 6.8e-159 gi|114555487|ref|XP_513307.2| PREDICTED: polycysti (1049) 2959 568.4 7.3e-159 gi|24559836|gb|AAN61054.1| polycystic kidney disea (1049) 2959 568.4 7.3e-159 gi|189054402|dbj|BAG37175.1| unnamed protein produ (1049) 2956 567.8 1.1e-158 gi|112616471|gb|AAG24389.2|AF275679_1 PP791 protei (1049) 2953 567.2 1.6e-158 gi|149694073|ref|XP_001503729.1| PREDICTED: simila (1051) 2951 566.9 2.1e-158 gi|119890475|ref|XP_001252715.1| PREDICTED: simila (1043) 2928 562.5 4.2e-157 gi|21739925|emb|CAD38985.1| hypothetical protein [ ( 746) 2923 561.5 6.2e-157 gi|126330167|ref|XP_001363786.1| PREDICTED: simila (1057) 2901 557.4 1.4e-155 gi|109001967|ref|XP_001102000.1| PREDICTED: simila (1015) 2825 543.1 2.8e-151 gi|55731402|emb|CAH92415.1| hypothetical protein [ ( 691) 2709 521.1 7.9e-145 gi|10436632|dbj|BAB14874.1| unnamed protein produc ( 691) 2708 520.9 9e-145 gi|125845506|ref|XP_001335068.1| PREDICTED: simila (1048) 2707 520.9 1.4e-144 gi|73977168|ref|XP_539600.2| PREDICTED: similar to (1052) 2670 513.9 1.8e-142 gi|148700523|gb|EDL32470.1| mCG116690 [Mus musculu (1076) 2476 477.4 1.8e-131 gi|18381142|gb|AAH22154.1| AU040320 protein [Mus m ( 603) 2171 419.8 2.2e-114 gi|210132104|gb|EEA79771.1| hypothetical protein B ( 596) 2058 398.5 5.7e-108 gi|94733530|emb|CAK04276.1| novel protein [Danio r ( 763) 1950 378.3 9e-102 gi|66532488|ref|XP_395372.2| PREDICTED: similar to (1124) 1952 378.8 9.3e-102 gi|156222022|gb|EDO42871.1| predicted protein [Nem ( 652) 1937 375.8 4.4e-101 gi|156543112|ref|XP_001605458.1| PREDICTED: simila (1029) 1931 374.8 1.3e-100 gi|74149588|dbj|BAE36422.1| unnamed protein produc ( 487) 1795 348.9 3.9e-93 gi|7295169|gb|AAF50494.1| CG7565, isoform A [Droso (1069) 1785 347.3 2.6e-92 gi|194118598|gb|EDW40641.1| GM24974 [Drosophila se (1019) 1784 347.1 2.9e-92 gi|194196057|gb|EDX09633.1| GD13023 [Drosophila si (1042) 1782 346.7 3.8e-92 gi|21749121|dbj|BAC03536.1| unnamed protein produc ( 491) 1775 345.1 5.4e-92 gi|194180214|gb|EDW93825.1| GE20376 [Drosophila ya (1071) 1778 346.0 6.5e-92 gi|190653162|gb|EDV50405.1| GG14923 [Drosophila er (1069) 1774 345.2 1.1e-91 gi|198151324|gb|EAL30377.2| GA20444 [Drosophila ps (1103) 1768 344.1 2.5e-91 gi|190582312|gb|EDV22385.1| hypothetical protein T ( 676) 1762 342.8 3.7e-91 gi|189239768|ref|XP_966476.2| PREDICTED: similar t (1211) 1750 340.8 2.8e-90 gi|148698328|gb|EDL30275.1| expressed sequence AU0 ( 700) 1745 339.6 3.5e-90 gi|193897986|gb|EDV96852.1| GH16502 [Drosophila gr (1062) 1738 338.5 1.2e-89 gi|194161800|gb|EDW76701.1| GK19891 [Drosophila wi (1147) 1736 338.1 1.7e-89 gi|26340310|dbj|BAC33818.1| unnamed protein produc ( 684) 1729 336.6 2.8e-89 gi|190624869|gb|EDV40393.1| GF10486 [Drosophila an (1074) 1729 336.8 3.9e-89 gi|157016682|gb|EAA10200.4| AGAP008639-PA [Anophel (1010) 1727 336.4 4.9e-89 gi|212514641|gb|EEB16918.1| conserved hypothetical ( 973) 1724 335.8 7e-89 gi|194154613|gb|EDW69797.1| GJ13453 [Drosophila vi (1055) 1716 334.3 2.1e-88 >>gi|194383062|dbj|BAG59087.1| unnamed protein product [ (1063 aa) initn: 6991 init1: 6991 opt: 6991 Z-score: 7111.3 bits: 1327.6 E(): 0 Smith-Waterman score: 6991; 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