# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hg00364.fasta.nr -Q ../query/KIAA0318.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0318, 1106 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7821796 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1235+/-0.000195; mu= 11.0911+/- 0.011 mean_var=107.6082+/-20.570, 0's: 36 Z-trim: 46 B-trim: 115 in 2/64 Lambda= 0.123638 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|41017589|sp|O15034.2|RIMB2_HUMAN RecName: Full= (1052) 7044 1267.9 0 gi|119618918|gb|EAW98512.1| RIMS binding protein 2 (1052) 7038 1266.8 0 gi|73994376|ref|XP_857096.1| PREDICTED: similar to (1074) 6052 1090.9 0 gi|109497120|ref|XP_001073349.1| PREDICTED: simila (1052) 5999 1081.5 0 gi|109495812|ref|XP_001064396.1| PREDICTED: simila (1049) 5950 1072.7 0 gi|41017516|sp|Q9JIR1.2|RIMB2_RAT RecName: Full=RI (1049) 5929 1069.0 0 gi|157169794|gb|AAI52822.1| RIMS binding protein 2 (1079) 5904 1064.5 0 gi|41393528|sp|Q80U40.2|RIMB2_MOUSE RecName: Full= (1072) 5887 1061.5 0 gi|148687582|gb|EDL19529.1| mCG15781, isoform CRA_ (1071) 5864 1057.4 0 gi|149063197|gb|EDM13520.1| RIM binding protein 2, (1069) 5844 1053.8 0 gi|109497118|ref|XP_001073406.1| PREDICTED: simila (1066) 5795 1045.1 0 gi|73994378|ref|XP_543356.2| PREDICTED: similar to (1300) 4451 805.4 0 gi|126323942|ref|XP_001378794.1| PREDICTED: simila (1419) 4313 780.8 0 gi|14043277|gb|AAH07632.1| RIMBP2 protein [Homo sa ( 645) 4279 774.5 0 gi|41017764|sp|Q8QFX1.1|RIMB2_CHICK RecName: Full= (1325) 4146 751.0 9.6e-214 gi|114647818|ref|XP_522561.2| PREDICTED: RIM-bindi (1108) 3776 685.0 6.2e-194 gi|116487757|gb|AAI25709.1| Hypothetical protein M (1084) 3681 668.0 7.7e-189 gi|149408920|ref|XP_001509104.1| PREDICTED: simila ( 721) 3673 666.4 1.5e-188 gi|148687583|gb|EDL19530.1| mCG15781, isoform CRA_ (1004) 3602 653.9 1.3e-184 gi|149063196|gb|EDM13519.1| RIM binding protein 2, (1001) 3560 646.4 2.3e-182 gi|109099262|ref|XP_001110445.1| PREDICTED: RIM-bi ( 661) 3293 598.6 3.6e-168 gi|189522829|ref|XP_691626.3| PREDICTED: si:ch211- (1092) 2582 472.0 7.9e-130 gi|189533907|ref|XP_001922201.1| PREDICTED: simila ( 887) 1882 347.0 2.6e-92 gi|149571230|ref|XP_001516490.1| PREDICTED: simila ( 619) 1602 297.0 2.1e-77 gi|194043601|ref|XP_001924670.1| PREDICTED: simila ( 417) 1580 292.9 2.4e-76 gi|8925886|gb|AAF81658.1|AF199336_1 RIM binding pr ( 265) 1527 283.3 1.2e-73 gi|47208456|emb|CAF92554.1| unnamed protein produc (1469) 1452 270.5 4.7e-69 gi|118100018|ref|XP_415717.2| PREDICTED: similar t (1869) 1336 249.9 9.5e-63 gi|193915759|gb|EDW14626.1| GI23219 [Drosophila mo (1547) 1262 236.6 7.8e-59 gi|34365485|emb|CAE46066.1| hypothetical protein [ ( 186) 1222 228.8 2.2e-57 gi|194165784|gb|EDW80685.1| GK11663 [Drosophila wi (1612) 1115 210.4 6.3e-51 gi|47223756|emb|CAF98526.1| unnamed protein produc (1886) 1106 208.9 2.1e-50 gi|149053794|gb|EDM05611.1| benzodiazapine recepto (1111) 1095 206.7 5.6e-50 gi|157019065|gb|EAA05991.4| AGAP003735-PA [Anophel (1295) 951 181.1 3.4e-42 gi|190627545|gb|EDV43069.1| GF18297 [Drosophila an (1554) 872 167.1 6.8e-38 gi|212510243|gb|EEB13454.1| hypothetical protein P ( 923) 857 164.2 2.9e-37 gi|52789430|gb|AAH83181.1| Bzrap1 protein [Mus mus ( 465) 846 162.0 6.8e-37 gi|194103002|gb|EDW25045.1| GL24476 [Drosophila pe (1211) 823 158.3 2.4e-35 gi|189238648|ref|XP_971584.2| PREDICTED: similar t (1290) 823 158.3 2.5e-35 gi|159163925|pdb|2CSP|A Chain A, Solution Structur ( 130) 762 146.6 8.4e-33 gi|125826510|ref|XP_001340852.1| PREDICTED: simila ( 203) 716 138.5 3.5e-30 gi|198432853|ref|XP_002124083.1| PREDICTED: simila (1262) 714 138.8 1.8e-29 gi|115750218|ref|XP_001202010.1| PREDICTED: hypoth (1250) 701 136.5 8.8e-29 gi|148683885|gb|EDL15832.1| benzodiazapine recepto (1672) 694 135.4 2.6e-28 gi|194183837|gb|EDW97448.1| GE24309 [Drosophila ya (1058) 688 134.1 3.9e-28 gi|190651763|gb|EDV49018.1| GG16925 [Drosophila er (1528) 645 126.6 1e-25 gi|47227810|emb|CAG08973.1| unnamed protein produc ( 218) 631 123.4 1.3e-25 gi|194199241|gb|EDX12817.1| GD19022 [Drosophila si (1162) 630 123.8 5.4e-25 gi|159163926|pdb|2CSQ|A Chain A, Solution Structur ( 97) 579 113.8 4.5e-23 gi|159163381|pdb|1WIE|A Chain A, Solution Structur ( 96) 578 113.7 5.1e-23 >>gi|41017589|sp|O15034.2|RIMB2_HUMAN RecName: Full=RIMS (1052 aa) initn: 7044 init1: 7044 opt: 7044 Z-score: 6788.7 bits: 1267.9 E(): 0 Smith-Waterman score: 7044; 100.000% identity (100.000% similar) in 1052 aa overlap (55-1106:1-1052) 30 40 50 60 70 80 KIAA03 TLVTRERDLAVKEKHQLQAKLENLEQVLKHMREAAERRQQLQLEHDQALAVLSAKQQEID :::::::::::::::::::::::::::::: gi|410 MREAAERRQQLQLEHDQALAVLSAKQQEID 10 20 30 90 100 110 120 130 140 KIAA03 LLQKSKVRELEEKCRTQSEQFNLLSRDLEKFRQHAGKIDLLGGSAVAPLDISTAPSKPFP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|410 LLQKSKVRELEEKCRTQSEQFNLLSRDLEKFRQHAGKIDLLGGSAVAPLDISTAPSKPFP 40 50 60 70 80 90 150 160 170 180 190 200 KIAA03 QFMNGLATSLGKGQESAIGGSSAIGEYIRPLPQPGDRPEPLSAKPTFLSRSGSARCRSES :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|410 QFMNGLATSLGKGQESAIGGSSAIGEYIRPLPQPGDRPEPLSAKPTFLSRSGSARCRSES 100 110 120 130 140 150 210 220 230 240 250 260 KIAA03 DMENERNSNTSKQRYSGKVHLCVARYSYNPFDGPNENPEAELPLTAGKYLYVYGDMDEDG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|410 DMENERNSNTSKQRYSGKVHLCVARYSYNPFDGPNENPEAELPLTAGKYLYVYGDMDEDG 160 170 180 190 200 210 270 280 290 300 310 320 KIAA03 FYEGELLDGQRGLVPSNFVDFVQDNESRLASTLGNEQDQNFINHSGIGLEGEHILDLHSP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|410 FYEGELLDGQRGLVPSNFVDFVQDNESRLASTLGNEQDQNFINHSGIGLEGEHILDLHSP 220 230 240 250 260 270 330 340 350 360 370 380 KIAA03 THIDAGITDNSAGTLDVNIDDIGEDIVPYPRKITLIKQLAKSVIVGWEPPAVPPGWGTVS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|410 THIDAGITDNSAGTLDVNIDDIGEDIVPYPRKITLIKQLAKSVIVGWEPPAVPPGWGTVS 280 290 300 310 320 330 390 400 410 420 430 440 KIAA03 SYNVLVDKETRMNLTLGSRTKALIEKLNMAACTYRISVQCVTSRGSSDELQCTLLVGKDV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|410 SYNVLVDKETRMNLTLGSRTKALIEKLNMAACTYRISVQCVTSRGSSDELQCTLLVGKDV 340 350 360 370 380 390 450 460 470 480 490 500 KIAA03 VVAPSHLRVDNITQISAQLSWLPTNSNYSHVIFLNEEEFDIVKAARYKYQFFNLRPNMAY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|410 VVAPSHLRVDNITQISAQLSWLPTNSNYSHVIFLNEEEFDIVKAARYKYQFFNLRPNMAY 400 410 420 430 440 450 510 520 530 540 550 560 KIAA03 KVKVLAKPHQMPWQLPLEQREKKEAFVEFSTLPAGPPAPPQDVTVQAGVTPATIRVSWRP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|410 KVKVLAKPHQMPWQLPLEQREKKEAFVEFSTLPAGPPAPPQDVTVQAGVTPATIRVSWRP 460 470 480 490 500 510 570 580 590 600 610 620 KIAA03 PVLTPTGLSNGANVTGYGVYAKGQRVAEVIFPTADSTAVELVRLRSLEAKGVTVRTLSAQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|410 PVLTPTGLSNGANVTGYGVYAKGQRVAEVIFPTADSTAVELVRLRSLEAKGVTVRTLSAQ 520 530 540 550 560 570 630 640 650 660 670 680 KIAA03 GESVDSAVAAVPPELLVPPTPHPRPAPQSKPLASSGVPETKDEHLGPHARMDEAWEQSRA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|410 GESVDSAVAAVPPELLVPPTPHPRPAPQSKPLASSGVPETKDEHLGPHARMDEAWEQSRA 580 590 600 610 620 630 690 700 710 720 730 740 KIAA03 PGPVHGHMLEPPVGPGRRSPSPSRILPQPQGTPVSTTVAKAMAREAAQRVAESSRLEKRS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|410 PGPVHGHMLEPPVGPGRRSPSPSRILPQPQGTPVSTTVAKAMAREAAQRVAESSRLEKRS 640 650 660 670 680 690 750 760 770 780 790 800 KIAA03 VFLERSSAGQYAASDEEDAYDSPDFKRRGASVDDFLKGSELGKQPHCCHGDEYHTESSRG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|410 VFLERSSAGQYAASDEEDAYDSPDFKRRGASVDDFLKGSELGKQPHCCHGDEYHTESSRG 700 710 720 730 740 750 810 820 830 840 850 860 KIAA03 SDLSDIMEEDEEELYSEMQLEDGGRRRPSGTSHNALKILGNPASAGRVDHMGRRFPRGSA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|410 SDLSDIMEEDEEELYSEMQLEDGGRRRPSGTSHNALKILGNPASAGRVDHMGRRFPRGSA 760 770 780 790 800 810 870 880 890 900 910 920 KIAA03 GPQRSRPVTVPSIDDYGRDRLSPDFYEESETDPGAEELPARIFVALFDYDPLTMSPNPDA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|410 GPQRSRPVTVPSIDDYGRDRLSPDFYEESETDPGAEELPARIFVALFDYDPLTMSPNPDA 820 830 840 850 860 870 930 940 950 960 970 980 KIAA03 AEEELPFKEGQIIKVYGDKDADGFYRGETCARLGLIPCNMVSEIQADDEEMMDQLLRQGF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|410 AEEELPFKEGQIIKVYGDKDADGFYRGETCARLGLIPCNMVSEIQADDEEMMDQLLRQGF 880 890 900 910 920 930 990 1000 1010 1020 1030 1040 KIAA03 LPLNTPVEKIERSRRSGRRHSVSTRRMVALYDYDPRESSPNVDVEAELTFCTGDIITVFG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|410 LPLNTPVEKIERSRRSGRRHSVSTRRMVALYDYDPRESSPNVDVEAELTFCTGDIITVFG 940 950 960 970 980 990 1050 1060 1070 1080 1090 1100 KIAA03 EIDEDGFYYGELNGQKGLVPSNFLEEVPDDVEVYLSDAPSHYSQDTPMRSKAKRKKSVHF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|410 EIDEDGFYYGELNGQKGLVPSNFLEEVPDDVEVYLSDAPSHYSQDTPMRSKAKRKKSVHF 1000 1010 1020 1030 1040 1050 KIAA03 IP :: gi|410 IP >>gi|119618918|gb|EAW98512.1| RIMS binding protein 2 [Ho (1052 aa) initn: 7344 init1: 7038 opt: 7038 Z-score: 6782.9 bits: 1266.8 E(): 0 Smith-Waterman score: 7038; 99.905% identity (99.905% similar) in 1052 aa overlap (55-1106:1-1052) 30 40 50 60 70 80 KIAA03 TLVTRERDLAVKEKHQLQAKLENLEQVLKHMREAAERRQQLQLEHDQALAVLSAKQQEID :::::::::::::::::::::::::::::: gi|119 MREAAERRQQLQLEHDQALAVLSAKQQEID 10 20 30 90 100 110 120 130 140 KIAA03 LLQKSKVRELEEKCRTQSEQFNLLSRDLEKFRQHAGKIDLLGGSAVAPLDISTAPSKPFP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|119 LLQKSKVRELEEKCRTQSEQFNLLSRDLEKFRQHAGKIDLLGGSAVAPLDISTAPSKPFP 40 50 60 70 80 90 150 160 170 180 190 200 KIAA03 QFMNGLATSLGKGQESAIGGSSAIGEYIRPLPQPGDRPEPLSAKPTFLSRSGSARCRSES :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|119 QFMNGLATSLGKGQESAIGGSSAIGEYIRPLPQPGDRPEPLSAKPTFLSRSGSARCRSES 100 110 120 130 140 150 210 220 230 240 250 260 KIAA03 DMENERNSNTSKQRYSGKVHLCVARYSYNPFDGPNENPEAELPLTAGKYLYVYGDMDEDG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|119 DMENERNSNTSKQRYSGKVHLCVARYSYNPFDGPNENPEAELPLTAGKYLYVYGDMDEDG 160 170 180 190 200 210 270 280 290 300 310 320 KIAA03 FYEGELLDGQRGLVPSNFVDFVQDNESRLASTLGNEQDQNFINHSGIGLEGEHILDLHSP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|119 FYEGELLDGQRGLVPSNFVDFVQDNESRLASTLGNEQDQNFINHSGIGLEGEHILDLHSP 220 230 240 250 260 270 330 340 350 360 370 380 KIAA03 THIDAGITDNSAGTLDVNIDDIGEDIVPYPRKITLIKQLAKSVIVGWEPPAVPPGWGTVS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|119 THIDAGITDNSAGTLDVNIDDIGEDIVPYPRKITLIKQLAKSVIVGWEPPAVPPGWGTVS 280 290 300 310 320 330 390 400 410 420 430 440 KIAA03 SYNVLVDKETRMNLTLGSRTKALIEKLNMAACTYRISVQCVTSRGSSDELQCTLLVGKDV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|119 SYNVLVDKETRMNLTLGSRTKALIEKLNMAACTYRISVQCVTSRGSSDELQCTLLVGKDV 340 350 360 370 380 390 450 460 470 480 490 500 KIAA03 VVAPSHLRVDNITQISAQLSWLPTNSNYSHVIFLNEEEFDIVKAARYKYQFFNLRPNMAY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|119 VVAPSHLRVDNITQISAQLSWLPTNSNYSHVIFLNEEEFDIVKAARYKYQFFNLRPNMAY 400 410 420 430 440 450 510 520 530 540 550 560 KIAA03 KVKVLAKPHQMPWQLPLEQREKKEAFVEFSTLPAGPPAPPQDVTVQAGVTPATIRVSWRP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|119 KVKVLAKPHQMPWQLPLEQREKKEAFVEFSTLPAGPPAPPQDVTVQAGVTPATIRVSWRP 460 470 480 490 500 510 570 580 590 600 610 620 KIAA03 PVLTPTGLSNGANVTGYGVYAKGQRVAEVIFPTADSTAVELVRLRSLEAKGVTVRTLSAQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|119 PVLTPTGLSNGANVTGYGVYAKGQRVAEVIFPTADSTAVELVRLRSLEAKGVTVRTLSAQ 520 530 540 550 560 570 630 640 650 660 670 680 KIAA03 GESVDSAVAAVPPELLVPPTPHPRPAPQSKPLASSGVPETKDEHLGPHARMDEAWEQSRA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|119 GESVDSAVAAVPPELLVPPTPHPRPAPQSKPLASSGVPETKDEHLGPHARMDEAWEQSRA 580 590 600 610 620 630 690 700 710 720 730 740 KIAA03 PGPVHGHMLEPPVGPGRRSPSPSRILPQPQGTPVSTTVAKAMAREAAQRVAESSRLEKRS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|119 PGPVHGHMLEPPVGPGRRSPSPSRILPQPQGTPVSTTVAKAMAREAAQRVAESSRLEKRS 640 650 660 670 680 690 750 760 770 780 790 800 KIAA03 VFLERSSAGQYAASDEEDAYDSPDFKRRGASVDDFLKGSELGKQPHCCHGDEYHTESSRG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|119 VFLERSSAGQYAASDEEDAYDSPDFKRRGASVDDFLKGSELGKQPHCCHGDEYHTESSRG 700 710 720 730 740 750 810 820 830 840 850 860 KIAA03 SDLSDIMEEDEEELYSEMQLEDGGRRRPSGTSHNALKILGNPASAGRVDHMGRRFPRGSA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|119 SDLSDIMEEDEEELYSEMQLEDGGRRRPSGTSHNALKILGNPASAGRVDHMGRRFPRGSA 760 770 780 790 800 810 870 880 890 900 910 920 KIAA03 GPQRSRPVTVPSIDDYGRDRLSPDFYEESETDPGAEELPARIFVALFDYDPLTMSPNPDA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|119 GPQRSRPVTVPSIDDYGRDRLSPDFYEESETDPGAEELPARIFVALFDYDPLTMSPNPDA 820 830 840 850 860 870 930 940 950 960 970 980 KIAA03 AEEELPFKEGQIIKVYGDKDADGFYRGETCARLGLIPCNMVSEIQADDEEMMDQLLRQGF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|119 AEEELPFKEGQIIKVYGDKDADGFYRGETCARLGLIPCNMVSEIQADDEEMMDQLLRQGF 880 890 900 910 920 930 990 1000 1010 1020 1030 1040 KIAA03 LPLNTPVEKIERSRRSGRRHSVSTRRMVALYDYDPRESSPNVDVEAELTFCTGDIITVFG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|119 LPLNTPVEKIERSRRSGRRHSVSTRRMVALYDYDPRESSPNVDVEAELTFCTGDIITVFG 940 950 960 970 980 990 1050 1060 1070 1080 1090 1100 KIAA03 EIDEDGFYYGELNGQKGLVPSNFLEEVPDDVEVYLSDAPSHYSQDTPMRSKAKRKKSVHF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|119 EIDEDGFYYGELNGQKGLVPSNFLEEVPDDVEVYLSDAPSHYSQDTPMRSKAKRKKSVHF 1000 1010 1020 1030 1040 1050 KIAA03 IP : gi|119 TP >>gi|73994376|ref|XP_857096.1| PREDICTED: similar to RIM (1074 aa) initn: 5644 init1: 3297 opt: 6052 Z-score: 5832.2 bits: 1090.9 E(): 0 Smith-Waterman score: 6166; 86.165% identity (93.500% similar) in 1077 aa overlap (55-1106:1-1074) 30 40 50 60 70 80 KIAA03 TLVTRERDLAVKEKHQLQAKLENLEQVLKHMREAAERRQQLQLEHDQALAVLSAKQQEID :::::::::::.:::.:::::: ::::::. gi|739 MREAAERRQQLELEHEQALAVLHAKQQEIE 10 20 30 90 100 110 120 KIAA03 LLQK-----------------SKVRELEEKCRTQSEQFNLLSRDLEKFRQHAGKIDLLGG :::: :::::::::::::::::.:::.::::.:::::::::::: gi|739 LLQKAQVEAKKEHEGAVQLLESKVRELEEKCRTQSEQFSLLSQDLEKLRQHAGKIDLLGG 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 KIAA03 SAVAPLDISTAPSKPFPQFMNGLATSLGKGQESAIGGSSAIGEYIRPLPQPGDRPEPLSA :: : ::. : .::: ::::::: :.::::::..:. ..::.:.:::: :.:.::::: gi|739 SAGASLDV-LASGKPFSQFMNGLAPSIGKGQESTLGSHTVIGDYLRPLPLPSDKPEPLSN 100 110 120 130 140 190 200 210 220 230 240 KIAA03 KPTFLSRSGSARCRSESDMENERNSNTSKQRYSGKVHLCVARYSYNPFDGPNENPEAELP ::.:: : .: ::: ::::.:::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|739 KPAFLLRPASPRCRFESDMDNERNSSTSKQRYSGKVHLCVARYSYNPFDGPNENPEAELP 150 160 170 180 190 200 250 260 270 280 290 300 KIAA03 LTAGKYLYVYGDMDEDGFYEGELLDGQRGLVPSNFVDFVQDNESRLASTLGNEQDQNFIN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::.:::::.:: gi|739 LTAGKYLYVYGDMDEDGFYEGELLDGQRGLVPSNFVDFVQDSESRLASTLGSEQDQNLIN 210 220 230 240 250 260 310 320 330 340 350 360 KIAA03 HSGIGLEGEHILDLHSPTHIDAGITDNSAGTLDVNIDDIGEDIVPYPRKITLIKQLAKSV ::.::::::.:::::. ::::.:.::..:::: ::.:.:::::::::::::::::::.:: gi|739 HSSIGLEGENILDLHASTHIDTGLTDDGAGTLGVNVDEIGEDIVPYPRKITLIKQLARSV 270 280 290 300 310 320 370 380 390 400 410 420 KIAA03 IVGWEPPAVPPGWGTVSSYNVLVDKETRMNLTLGSRTKALIEKLNMAACTYRISVQCVTS ::.:.:::::::::::: ::::::.:::..::::::::::::::: :::::::::::.:: gi|739 IVAWDPPAVPPGWGTVSCYNVLVDQETRVSLTLGSRTKALIEKLNTAACTYRISVQCITS 330 340 350 360 370 380 430 440 450 460 470 480 KIAA03 RGSSDELQCTLLVGKDVVVAPSHLRVDNITQISAQLSWLPTNSNYSHVIFLNEEEFDIVK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.:: gi|739 RGSSDELQCTLLVGKDVVVAPSHLRVDNITQISAQLSWLPTNSNYSHVIFLNEEELDVVK 390 400 410 420 430 440 490 500 510 520 530 540 KIAA03 AARYKYQFFNLRPNMAYKVKVLAKPHQMPWQLPLEQREKKEAFVEFSTLPAGPPAPPQDV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|739 AARYKYQFFNLRPNMAYKVKVLAKPHQMPWQLPLEQREKKEAFVEFSTLPAGPPAPPQDV 450 460 470 480 490 500 550 560 570 580 590 600 KIAA03 TVQAGVTPATIRVSWRPPVLTPTGLSNGANVTGYGVYAKGQRVAEVIFPTADSTAVELVR ::. :.:::::.:::.::.:: .::::::::.::::::::::::::: : ::: :::.:: gi|739 TVHPGATPATIQVSWKPPALTTAGLSNGANVSGYGVYAKGQRVAEVISPMADSIAVEVVR 510 520 530 540 550 560 610 620 630 640 650 660 KIAA03 LRSLEAKGVTVRTLSAQGESVDSAVAAVPPELLVPPTPHPRPAPQSKPLASSGVPETKDE ::::::::::::::::::::.::..::.::.:::::::::: :: ::::: :. ::::: gi|739 LRSLEAKGVTVRTLSAQGESTDSTTAAIPPDLLVPPTPHPRTAPTPKPLASVGALETKDE 570 580 590 600 610 620 670 680 690 700 710 720 KIAA03 HLGPHARMDEAWEQSRAPGPVHGHMLEPPV----GPGRRSPSPSRILPQPQGTPVSTTVA ::::: .::::::.:::.:::::::::: :::::::::::::::::::::::.:: gi|739 HLGPHITVDEAWEQGRAPAPVHGHMLEPPSLQGSGPGRRSPSPSRILPQPQGTPVSTSVA 630 640 650 660 670 680 730 740 750 760 770 780 KIAA03 KAMAREAAQRVAESSRLEKRSVFLERSSAGQYAASDEEDAYDSPDFKRRGASVDDFLKGS :::::::::::::::::::::.::::.: ::: :::::.:::::.:::::::::::::: gi|739 KAMAREAAQRVAESSRLEKRSIFLERGS-GQYMNSDEEDSYDSPDIKRRGASVDDFLKGS 690 700 710 720 730 740 790 800 810 820 830 840 KIAA03 ELGKQPHCCHGDEYHTESSRGSDLSDIMEEDEEELYSEMQLEDGGRRRPSGTSHNALKIL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|739 ELGKQPHCCHGDEYHTESSRGSDLSDIMEEDEEELYSEMQLEDGGRRRPSGTSHNALKIL 750 760 770 780 790 800 850 860 870 880 890 KIAA03 GNPASAGRVD---HMGRRFPRGSAGPQRSRPVTVPSIDDYG-RDRLSPDFYEESETDPGA :::.::::.: :.:::: ::::::::::. :::::.:. ::.::::::::::::::: gi|739 GNPVSAGRADRADHVGRRFSPGSAGPQRSRPMMVPSIDEYSERDHLSPDFYEESETDPGA 810 820 830 840 850 860 900 910 920 930 940 950 KIAA03 EELPARIFVALFDYDPLTMSPNPDAAEEELPFKEGQIIKVYGDKDADGFYRGETCARLGL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|739 EELPARIFVALFDYDPLTMSPNPDAAEEELPFKEGQIIKVYGDKDADGFYRGETCARLGL 870 880 890 900 910 920 960 970 980 990 1000 1010 KIAA03 IPCNMVSEIQADDEEMMDQLLRQGFLPLNTPVEKIERSRRSGRRHSVSTRRMVALYDYDP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:. : :::.:::::::: gi|739 IPCNMVSEIQADDEEMMDQLLRQGFLPLNTPVEKIERSRRSSRQPRV-TRRVVALYDYDP 930 940 950 960 970 980 1020 1030 1040 1050 1060 1070 KIAA03 RESSPNVDVEAELTFCTGDIITVFGEIDEDGFYYGELNGQKGLVPSNFLEEVPDDVEVYL ::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|739 RESSPNIDVEAELTFCTGDIITVFGEIDEDGFYYGELNGQKGLVPSNFLEEVPDDVEVYL 990 1000 1010 1020 1030 1040 1080 1090 1100 KIAA03 SDAPSHYSQDTPMRSKAKRKKSVHFIP ::.: :: .:: .:::::::::::: : gi|739 SDVPCHYPRDTLVRSKAKRKKSVHFTP 1050 1060 1070 >>gi|109497120|ref|XP_001073349.1| PREDICTED: similar to (1052 aa) initn: 5434 init1: 3725 opt: 5999 Z-score: 5781.3 bits: 1081.5 E(): 0 Smith-Waterman score: 5999; 84.811% identity (93.774% similar) in 1060 aa overlap (55-1106:1-1052) 30 40 50 60 70 80 KIAA03 TLVTRERDLAVKEKHQLQAKLENLEQVLKHMREAAERRQQLQLEHDQALAVLSAKQQEID :::::::::::.:::.::::.:.::::::. gi|109 MREAAERRQQLELEHEQALAILNAKQQEIQ 10 20 30 90 100 110 120 130 140 KIAA03 LLQKSKVRELEEKCRTQSEQFNLLSRDLEKFRQHAGKIDLLGGSAVAPLDISTAPSKPFP :::.:::::::::::.::::::::::::::::::::.:::::...:: ::. ::.::: gi|109 LLQQSKVRELEEKCRVQSEQFNLLSRDLEKFRQHAGSIDLLGSNSVALLDVPLAPGKPFS 40 50 60 70 80 90 150 160 170 180 190 200 KIAA03 QFMNGLATSLGKGQESAIGGSSAIGEYIRPLPQPGDRPEPLSAKPTFLSRSGSARCRSES :.:::::::. ::.:. : :.::.:: : ::. : .::.:: ::.: ::: :: gi|109 QYMNGLATSIHKGHEGPTGHYSVIGDYI---PLSGDKLESPCVKPSFLLRSSSPRCRFES 100 110 120 130 140 210 220 230 240 250 260 KIAA03 DMENERNSNTSKQRYSGKVHLCVARYSYNPFDGPNENPEAELPLTAGKYLYVYGDMDEDG .:...:.:: ::. ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|109 EMDDDRSSNKSKHSSSGKVHLCVARYSYNPFDGPNENPEAELPLTAGKYLYVYGDMDEDG 150 160 170 180 190 200 270 280 290 300 310 320 KIAA03 FYEGELLDGQRGLVPSNFVDFVQDNESRLASTLGNEQDQNFINHSGIGLEGEHILDLHSP :::::::::::::::::::::.::::::.:.:::.::::::.:::::.:: . :: :::: gi|109 FYEGELLDGQRGLVPSNFVDFIQDNESRFAGTLGSEQDQNFLNHSGISLERDSILHLHSP 210 220 230 240 250 260 330 340 350 360 370 380 KIAA03 THIDAGITDNSAGTLDVNIDDIGEDIVPYPRKITLIKQLAKSVIVGWEPPAVPPGWGTVS :..:.:::::..:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|109 TQVDSGITDNGGGTLDVNIDDIGEDIVPYPRKITLIKQLAKSVIVGWEPPAVPPGWGTVS 270 280 290 300 310 320 390 400 410 420 430 440 KIAA03 SYNVLVDKETRMNLTLGSRTKALIEKLNMAACTYRISVQCVTSRGSSDELQCTLLVGKDV ::::::::::::.:.:: :::::::::: ::::::::::::::::.:::::::::::::: gi|109 SYNVLVDKETRMSLALGRRTKALIEKLNTAACTYRISVQCVTSRGNSDELQCTLLVGKDV 330 340 350 360 370 380 450 460 470 480 490 500 KIAA03 VVAPSHLRVDNITQISAQLSWLPTNSNYSHVIFLNEEEFDIVKAARYKYQFFNLRPNMAY :::::.::::::::::::::::::::::::.:::::::.::::::::::::::::::::: gi|109 VVAPSQLRVDNITQISAQLSWLPTNSNYSHIIFLNEEELDIVKAARYKYQFFNLRPNMAY 390 400 410 420 430 440 510 520 530 540 550 560 KIAA03 KVKVLAKPHQMPWQLPLEQREKKEAFVEFSTLPAGPPAPPQDVTVQAGVTPATIRVSWRP ::::::.:::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::.: :...:::.: gi|109 KVKVLAQPHQMPWQLPLEQREKKEACVEFSTLPAGPPAPPQDVTVQAGATTASVQVSWKP 450 460 470 480 490 500 570 580 590 600 610 620 KIAA03 PVLTPTGLSNGANVTGYGVYAKGQRVAEVIFPTADSTAVELVRLRSLEAKGVTVRTLSAQ :.:::::::::::::::::::::::::::: ::::..:::::::::::::.:.::::::: gi|109 PALTPTGLSNGANVTGYGVYAKGQRVAEVIAPTADGAAVELVRLRSLEAKAVSVRTLSAQ 510 520 530 540 550 560 630 640 650 660 670 680 KIAA03 GESVDSAVAAVPPELLVPPTPHPRPAPQSKPLASSGVPETKDEHLGPHARMDEAWEQSRA :::.:::.::.::.:::::.:::: :: :::::. .::: ::::...::.::::: gi|109 GESMDSALAAIPPDLLVPPAPHPRTAPPPKPLASD--MDTKD--LGPHVKVDESWEQSRP 570 580 590 600 610 620 690 700 710 720 730 740 KIAA03 PGPVHGHMLEPP----VGPGRRSPSPSRILPQPQGTPVSTTVAKAMAREAAQRVAESSRL :::.:::::::: .::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::.:: gi|109 PGPAHGHMLEPPDMHSTGPGRRSPSPSRILPQPQGAPVSTTVAKAMAREAAQRVAESNRL 630 640 650 660 670 680 750 760 770 780 790 800 KIAA03 EKRSVFLERSSAGQYAASDEEDAYDSPDFKRRGASVDDFLKGSELGKQPHCCHGDEYHTE ::::.:::.:::: :: :::::.: ::. ::::.::::::::::::.::::::::::::: gi|109 EKRSLFLEQSSAGPYANSDEEDGYASPEVKRRGTSVDDFLKGSELGQQPHCCHGDEYHTE 690 700 710 720 730 740 810 820 830 840 850 KIAA03 SSRGSDLSDIMEEDEEELYSEMQLEDGGRRRPSGTSHNALKILGNPASAGRVD---HMGR ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: : :: : :..: gi|109 SSRGSDLSDIMEEDEEELYSEMQLEDGGRRRPSGTSHNALKILGNSALMGRGDRMEHVSR 750 760 770 780 790 800 860 870 880 890 900 910 KIAA03 RFPRGSAGPQRSRPVTVPSIDDY-GRDRLSPDFYEESETDPGAEELPARIFVALFDYDPL :. ....:::: ::.. ::::.: :::.::::::.::::::::::::::::::::::::: gi|109 RYSHSGGGPQRHRPMA-PSIDEYTGRDHLSPDFYDESETDPGAEELPARIFVALFDYDPL 810 820 830 840 850 860 920 930 940 950 960 970 KIAA03 TMSPNPDAAEEELPFKEGQIIKVYGDKDADGFYRGETCARLGLIPCNMVSEIQADDEEMM ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::: gi|109 TMSPNPDAAEEELPFKEGQIIKVYGDKDADGFYRGETCARLGLIPCNMVSEIHADDEEMM 870 880 890 900 910 920 980 990 1000 1010 1020 1030 KIAA03 DQLLRQGFLPLNTPVEKIERSRRSGRRHSVSTRRMVALYDYDPRESSPNVDVEAELTFCT :::::::::::::::::::::::::: ::: ::::::::::::::::::::::::: ::: gi|109 DQLLRQGFLPLNTPVEKIERSRRSGRGHSVPTRRMVALYDYDPRESSPNVDVEAELLFCT 930 940 950 960 970 980 1040 1050 1060 1070 1080 1090 KIAA03 GDIITVFGEIDEDGFYYGELNGQKGLVPSNFLEEVPDDVEVYLSDAPSHYSQDTPMRSKA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::: :::.: :::.:: gi|109 GDIITVFGEIDEDGFYYGELNGQKGLVPSNFLEEVPDDVEVHLSDAPPHYSHDPPMRTKA 990 1000 1010 1020 1030 1040 1100 KIAA03 KRKKSVHFIP :::::::: : gi|109 KRKKSVHFTP 1050 >>gi|109495812|ref|XP_001064396.1| PREDICTED: similar to (1049 aa) initn: 3918 init1: 3725 opt: 5950 Z-score: 5734.1 bits: 1072.7 E(): 0 Smith-Waterman score: 5950; 84.791% identity (93.821% similar) in 1052 aa overlap (55-1098:1-1044) 30 40 50 60 70 80 KIAA03 TLVTRERDLAVKEKHQLQAKLENLEQVLKHMREAAERRQQLQLEHDQALAVLSAKQQEID :::::::::::.:::.::::.:.::::::. gi|109 MREAAERRQQLELEHEQALAILNAKQQEIQ 10 20 30 90 100 110 120 130 140 KIAA03 LLQKSKVRELEEKCRTQSEQFNLLSRDLEKFRQHAGKIDLLGGSAVAPLDISTAPSKPFP :::.:::::::::::.::::::::::::::::::::.:::::...:: ::. ::.::: gi|109 LLQQSKVRELEEKCRVQSEQFNLLSRDLEKFRQHAGSIDLLGSNSVALLDVPLAPGKPFS 40 50 60 70 80 90 150 160 170 180 190 200 KIAA03 QFMNGLATSLGKGQESAIGGSSAIGEYIRPLPQPGDRPEPLSAKPTFLSRSGSARCRSES :.:::::::. ::.:. : :.::.:: : ::. : .::.:: ::.: ::: :: gi|109 QYMNGLATSIHKGHEGPTGHYSVIGDYI---PLSGDKLESPCVKPSFLLRSSSPRCRFES 100 110 120 130 140 210 220 230 240 250 260 KIAA03 DMENERNSNTSKQRYSGKVHLCVARYSYNPFDGPNENPEAELPLTAGKYLYVYGDMDEDG .:...:.:: ::. ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|109 EMDDDRSSNKSKHSSSGKVHLCVARYSYNPFDGPNENPEAELPLTAGKYLYVYGDMDEDG 150 160 170 180 190 200 270 280 290 300 310 320 KIAA03 FYEGELLDGQRGLVPSNFVDFVQDNESRLASTLGNEQDQNFINHSGIGLEGEHILDLHSP :::::::::::::::::::::.::::::.:.:::.::::::.:::::.:: . :: :::: gi|109 FYEGELLDGQRGLVPSNFVDFIQDNESRFAGTLGSEQDQNFLNHSGISLERDSILHLHSP 210 220 230 240 250 260 330 340 350 360 370 380 KIAA03 THIDAGITDNSAGTLDVNIDDIGEDIVPYPRKITLIKQLAKSVIVGWEPPAVPPGWGTVS :..:.:::::..:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|109 TQVDSGITDNGGGTLDVNIDDIGEDIVPYPRKITLIKQLAKSVIVGWEPPAVPPGWGTVS 270 280 290 300 310 320 390 400 410 420 430 440 KIAA03 SYNVLVDKETRMNLTLGSRTKALIEKLNMAACTYRISVQCVTSRGSSDELQCTLLVGKDV ::::::::::::.:.:: :::::::::: ::::::::::::::::.:::::::::::::: gi|109 SYNVLVDKETRMSLALGRRTKALIEKLNTAACTYRISVQCVTSRGNSDELQCTLLVGKDV 330 340 350 360 370 380 450 460 470 480 490 500 KIAA03 VVAPSHLRVDNITQISAQLSWLPTNSNYSHVIFLNEEEFDIVKAARYKYQFFNLRPNMAY :::::.::::::::::::::::::::::::.:::::::.::::::::::::::::::::: gi|109 VVAPSQLRVDNITQISAQLSWLPTNSNYSHIIFLNEEELDIVKAARYKYQFFNLRPNMAY 390 400 410 420 430 440 510 520 530 540 550 560 KIAA03 KVKVLAKPHQMPWQLPLEQREKKEAFVEFSTLPAGPPAPPQDVTVQAGVTPATIRVSWRP ::::::.:::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::.: :...:::.: gi|109 KVKVLAQPHQMPWQLPLEQREKKEACVEFSTLPAGPPAPPQDVTVQAGATTASVQVSWKP 450 460 470 480 490 500 570 580 590 600 610 620 KIAA03 PVLTPTGLSNGANVTGYGVYAKGQRVAEVIFPTADSTAVELVRLRSLEAKGVTVRTLSAQ :.:::::::::::::::::::::::::::: ::::..:::::::::::::.:.::::::: gi|109 PALTPTGLSNGANVTGYGVYAKGQRVAEVIAPTADGAAVELVRLRSLEAKAVSVRTLSAQ 510 520 530 540 550 560 630 640 650 660 670 680 KIAA03 GESVDSAVAAVPPELLVPPTPHPRPAPQSKPLASSGVPETKDEHLGPHARMDEAWEQSRA :::.:::.::.::.:::::.:::: :: :::::. .::: ::::...::.::::: gi|109 GESMDSALAAIPPDLLVPPAPHPRTAPPPKPLASD--MDTKD--LGPHVKVDESWEQSRP 570 580 590 600 610 620 690 700 710 720 730 740 KIAA03 PGPVHGHMLEPP----VGPGRRSPSPSRILPQPQGTPVSTTVAKAMAREAAQRVAESSRL :::.:::::::: .::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::.:: gi|109 PGPAHGHMLEPPDMHSTGPGRRSPSPSRILPQPQGAPVSTTVAKAMAREAAQRVAESNRL 630 640 650 660 670 680 750 760 770 780 790 800 KIAA03 EKRSVFLERSSAGQYAASDEEDAYDSPDFKRRGASVDDFLKGSELGKQPHCCHGDEYHTE ::::.:::.:::: :: :::::.: ::. ::::.::::::::::::.::::::::::::: gi|109 EKRSLFLEQSSAGPYANSDEEDGYASPEVKRRGTSVDDFLKGSELGQQPHCCHGDEYHTE 690 700 710 720 730 740 810 820 830 840 850 KIAA03 SSRGSDLSDIMEEDEEELYSEMQLEDGGRRRPSGTSHNALKILGNPASAGRVD---HMGR ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: : :: : :..: gi|109 SSRGSDLSDIMEEDEEELYSEMQLEDGGRRRPSGTSHNALKILGNSALMGRGDRMEHVSR 750 760 770 780 790 800 860 870 880 890 900 910 KIAA03 RFPRGSAGPQRSRPVTVPSIDDY-GRDRLSPDFYEESETDPGAEELPARIFVALFDYDPL :. ....:::: ::.. ::::.: :::.::::::.::::::::::::::::::::::::: gi|109 RYSHSGGGPQRHRPMA-PSIDEYTGRDHLSPDFYDESETDPGAEELPARIFVALFDYDPL 810 820 830 840 850 860 920 930 940 950 960 970 KIAA03 TMSPNPDAAEEELPFKEGQIIKVYGDKDADGFYRGETCARLGLIPCNMVSEIQADDEEMM ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::: gi|109 TMSPNPDAAEEELPFKEGQIIKVYGDKDADGFYRGETCARLGLIPCNMVSEIHADDEEMM 870 880 890 900 910 920 980 990 1000 1010 1020 1030 KIAA03 DQLLRQGFLPLNTPVEKIERSRRSGRRHSVSTRRMVALYDYDPRESSPNVDVEAELTFCT :::::::::::::::::::::::::: ::: ::::::::::::::::::::::::: ::: gi|109 DQLLRQGFLPLNTPVEKIERSRRSGRGHSVPTRRMVALYDYDPRESSPNVDVEAELLFCT 930 940 950 960 970 980 1040 1050 1060 1070 1080 1090 KIAA03 GDIITVFGEIDEDGFYYGELNGQKGLVPSNFLEEVPDDVEVYLSDAPSHYSQDTPMRSKA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::: :::.: :::.:: gi|109 GDIITVFGEIDEDGFYYGELNGQKGLVPSNFLEEVPDDVEVHLSDAPPHYSHDPPMRTKA 990 1000 1010 1020 1030 1040 1100 KIAA03 KRKKSVHFIP :: gi|109 KRVSQPP >>gi|41017516|sp|Q9JIR1.2|RIMB2_RAT RecName: Full=RIMS-b (1049 aa) initn: 3897 init1: 3704 opt: 5929 Z-score: 5713.8 bits: 1069.0 E(): 0 Smith-Waterman score: 5929; 84.411% identity (93.726% similar) in 1052 aa overlap (55-1098:1-1044) 30 40 50 60 70 80 KIAA03 TLVTRERDLAVKEKHQLQAKLENLEQVLKHMREAAERRQQLQLEHDQALAVLSAKQQEID :::::::::::.:::.::::.:.::::::. gi|410 MREAAERRQQLELEHEQALAILNAKQQEIQ 10 20 30 90 100 110 120 130 140 KIAA03 LLQKSKVRELEEKCRTQSEQFNLLSRDLEKFRQHAGKIDLLGGSAVAPLDISTAPSKPFP :::.:::::::::::.::::::::::::::::::::.:::::...:: ::. ::.::: gi|410 LLQQSKVRELEEKCRVQSEQFNLLSRDLEKFRQHAGSIDLLGSNSVALLDVPLAPGKPFS 40 50 60 70 80 90 150 160 170 180 190 200 KIAA03 QFMNGLATSLGKGQESAIGGSSAIGEYIRPLPQPGDRPEPLSAKPTFLSRSGSARCRSES :.:::::::. ::.:. : :.::.:: : ::. : .::.:: ::.: ::: :: gi|410 QYMNGLATSIHKGHEGPTGHYSVIGDYI---PLSGDKLESPCVKPSFLLRSSSPRCRFES 100 110 120 130 140 210 220 230 240 250 260 KIAA03 DMENERNSNTSKQRYSGKVHLCVARYSYNPFDGPNENPEAELPLTAGKYLYVYGDMDEDG .:...:.:: ::. ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|410 EMDDDRSSNKSKHSSSGKVHLCVARYSYNPFDGPNENPEAELPLTAGKYLYVYGDMDEDG 150 160 170 180 190 200 270 280 290 300 310 320 KIAA03 FYEGELLDGQRGLVPSNFVDFVQDNESRLASTLGNEQDQNFINHSGIGLEGEHILDLHSP :::::::::::::::::::::.::::::.:.:::.::::::.:::::.:: . :: :::: gi|410 FYEGELLDGQRGLVPSNFVDFIQDNESRFAGTLGSEQDQNFLNHSGISLERDSILHLHSP 210 220 230 240 250 260 330 340 350 360 370 380 KIAA03 THIDAGITDNSAGTLDVNIDDIGEDIVPYPRKITLIKQLAKSVIVGWEPPAVPPGWGTVS :..:.:::::..:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|410 TQVDSGITDNGGGTLDVNIDDIGEDIVPYPRKITLIKQLAKSVIVGWEPPAVPPGWGTVS 270 280 290 300 310 320 390 400 410 420 430 440 KIAA03 SYNVLVDKETRMNLTLGSRTKALIEKLNMAACTYRISVQCVTSRGSSDELQCTLLVGKDV ::::::::::::.:.:: :::::::::: ::::::::::::::::.:::::::::::::: gi|410 SYNVLVDKETRMSLALGRRTKALIEKLNTAACTYRISVQCVTSRGNSDELQCTLLVGKDV 330 340 350 360 370 380 450 460 470 480 490 500 KIAA03 VVAPSHLRVDNITQISAQLSWLPTNSNYSHVIFLNEEEFDIVKAARYKYQFFNLRPNMAY :::::.::::::::::::::::::::::::.:::::::.::::::::::::::::::::: gi|410 VVAPSQLRVDNITQISAQLSWLPTNSNYSHIIFLNEEELDIVKAARYKYQFFNLRPNMAY 390 400 410 420 430 440 510 520 530 540 550 560 KIAA03 KVKVLAKPHQMPWQLPLEQREKKEAFVEFSTLPAGPPAPPQDVTVQAGVTPATIRVSWRP ::::::.::::::::::::::: :: ::::::::::::::::::::::.: :...:::.: gi|410 KVKVLAQPHQMPWQLPLEQREKDEACVEFSTLPAGPPAPPQDVTVQAGATTASVQVSWKP 450 460 470 480 490 500 570 580 590 600 610 620 KIAA03 PVLTPTGLSNGANVTGYGVYAKGQRVAEVIFPTADSTAVELVRLRSLEAKGVTVRTLSAQ :.:::::::::::::::::::::::::::: :::...:::::::::::::.:.::::::: gi|410 PALTPTGLSNGANVTGYGVYAKGQRVAEVIAPTANGAAVELVRLRSLEAKAVSVRTLSAQ 510 520 530 540 550 560 630 640 650 660 670 680 KIAA03 GESVDSAVAAVPPELLVPPTPHPRPAPQSKPLASSGVPETKDEHLGPHARMDEAWEQSRA :::.:::.::.::.:::::.:::: :: :::.:. .::: ::::...::.::::: gi|410 GESMDSALAAIPPDLLVPPAPHPRTAPPPKPLTSD--MDTKD--LGPHVKVDESWEQSRP 570 580 590 600 610 620 690 700 710 720 730 740 KIAA03 PGPVHGHMLEPP----VGPGRRSPSPSRILPQPQGTPVSTTVAKAMAREAAQRVAESSRL :::.:::::::: .::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::.:.: gi|410 PGPAHGHMLEPPDMHSTGPGRRSPSPSRILPQPQGAPVSTTVAKAMAREAAQRVAETSKL 630 640 650 660 670 680 750 760 770 780 790 800 KIAA03 EKRSVFLERSSAGQYAASDEEDAYDSPDFKRRGASVDDFLKGSELGKQPHCCHGDEYHTE ::::.:::.:::: :: :::::.: ::. ::::.::::::::::::.::::::::::::: gi|410 EKRSLFLEQSSAGPYANSDEEDGYASPEVKRRGTSVDDFLKGSELGQQPHCCHGDEYHTE 690 700 710 720 730 740 810 820 830 840 850 KIAA03 SSRGSDLSDIMEEDEEELYSEMQLEDGGRRRPSGTSHNALKILGNPASAGRVD---HMGR ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: : :: : :..: gi|410 SSRGSDLSDIMEEDEEELYSEMQLEDGGRRRPSGTSHNALKILGNSALMGRGDRMEHVSR 750 760 770 780 790 800 860 870 880 890 900 910 KIAA03 RFPRGSAGPQRSRPVTVPSIDDY-GRDRLSPDFYEESETDPGAEELPARIFVALFDYDPL :. ....:::: ::.. ::::.: :::.::::::.::::::::::::::::::::::::: gi|410 RYSHSGGGPQRHRPMA-PSIDEYTGRDHLSPDFYDESETDPGAEELPARIFVALFDYDPL 810 820 830 840 850 860 920 930 940 950 960 970 KIAA03 TMSPNPDAAEEELPFKEGQIIKVYGDKDADGFYRGETCARLGLIPCNMVSEIQADDEEMM ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::: gi|410 TMSPNPDAAEEELPFKEGQIIKVYGDKDADGFYRGETCARLGLIPCNMVSEIHADDEEMM 870 880 890 900 910 920 980 990 1000 1010 1020 1030 KIAA03 DQLLRQGFLPLNTPVEKIERSRRSGRRHSVSTRRMVALYDYDPRESSPNVDVEAELTFCT :::::::::::::::::::::::::: ::: ::::::::::::::::::::::::: ::: gi|410 DQLLRQGFLPLNTPVEKIERSRRSGRGHSVPTRRMVALYDYDPRESSPNVDVEAELLFCT 930 940 950 960 970 980 1040 1050 1060 1070 1080 1090 KIAA03 GDIITVFGEIDEDGFYYGELNGQKGLVPSNFLEEVPDDVEVYLSDAPSHYSQDTPMRSKA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::: :::.: :::.:: gi|410 GDIITVFGEIDEDGFYYGELNGQKGLVPSNFLEEVPDDVEVHLSDAPPHYSHDPPMRTKA 990 1000 1010 1020 1030 1040 1100 KIAA03 KRKKSVHFIP :: gi|410 KRVSQPP >>gi|157169794|gb|AAI52822.1| RIMS binding protein 2 [sy (1079 aa) initn: 5402 init1: 2818 opt: 5904 Z-score: 5689.5 bits: 1064.5 E(): 0 Smith-Waterman score: 5985; 83.118% identity (92.066% similar) in 1084 aa overlap (55-1106:1-1079) 30 40 50 60 70 80 KIAA03 TLVTRERDLAVKEKHQLQAKLENLEQVLKHMREAAERRQQLQLEHDQALAVLSAKQQEID :::::::::::.:::.:::: :.::::::. gi|157 MREAAERRQQLELEHEQALAFLNAKQQEIQ 10 20 30 90 100 110 120 KIAA03 LLQK------------------------SKVRELEEKCRTQSEQFNLLSRDLEKFRQHAG :::. :::::::::::.::::::::::::::::::.: gi|157 LLQQAQVEAKKEHEGAVQLLENTLDCMQSKVRELEEKCRVQSEQFNLLSRDLEKFRQHTG 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 KIAA03 KIDLLGGSAVAPLDISTAPSKPFPQFMNGLATSLGKGQESAIGGSSAIGEYIRPLPQPGD .:::::.:.:: ::. ::.:::::.:::::::. ::.:. : :.::.:: : :: gi|157 SIDLLGSSSVALLDVPLAPGKPFPQYMNGLATSIHKGHEGPTGHYSVIGDYI---PLSGD 100 110 120 130 140 190 200 210 220 230 240 KIAA03 RPEPLSAKPTFLSRSGSARCRSESDMENERNSNTSKQRYSGKVHLCVARYSYNPFDGPNE . : .::.:: ::.: ::: ::.:.:.::::.::: ::::::::::::::::::::: gi|157 KLESPCVKPSFLLRSSSPRCRFESEMDNDRNSNNSKQSSSGKVHLCVARYSYNPFDGPNE 150 160 170 180 190 200 250 260 270 280 290 300 KIAA03 NPEAELPLTAGKYLYVYGDMDEDGFYEGELLDGQRGLVPSNFVDFVQDNESRLASTLGNE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::.:::.: gi|157 NPEAELPLTAGKYLYVYGDMDEDGFYEGELLDGQRGLVPSNFVDFIQDNESRLAGTLGSE 210 220 230 240 250 260 310 320 330 340 350 360 KIAA03 QDQNFINHSGIGLEGEHILDLHSPTHIDAGITDNSAGTLDVNIDDIGEDIVPYPRKITLI :::::.:::::.:: . :: :::::..:.:::::..::::::::::::: :::::::::: gi|157 QDQNFLNHSGISLERDSILHLHSPTQVDSGITDNGGGTLDVNIDDIGEDTVPYPRKITLI 270 280 290 300 310 320 370 380 390 400 410 420 KIAA03 KQLAKSVIVGWEPPAVPPGWGTVSSYNVLVDKETRMNLTLGSRTKALIEKLNMAACTYRI ::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.:: :::::::::: ::::::: gi|157 KQLAKSVIVGWEPPAVPPGWGTVSSYNVLVDKETRMSLALGRRTKALIEKLNTAACTYRI 330 340 350 360 370 380 430 440 450 460 470 480 KIAA03 SVQCVTSRGSSDELQCTLLVGKDVVVAPSHLRVDNITQISAQLSWLPTNSNYSHVIFLNE :::::::::.:::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::.::::: gi|157 SVQCVTSRGNSDELQCTLLVGKDVVVAPSQLRVDNITQISAQLSWLPTNSNYSHIIFLNE 390 400 410 420 430 440 490 500 510 520 530 540 KIAA03 EEFDIVKAARYKYQFFNLRPNMAYKVKVLAKPHQMPWQLPLEQREKKEAFVEFSTLPAGP ::.:::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::: :::::::::: gi|157 EELDIVKAARYKYQFFNLRPNMAYKVKVLAQPHQMPWQLPLEQREKKEACVEFSTLPAGP 450 460 470 480 490 500 550 560 570 580 590 600 KIAA03 PAPPQDVTVQAGVTPATIRVSWRPPVLTPTGLSNGANVTGYGVYAKGQRVAEVIFPTADS :::::::::.::.: :...:::.::.:::::::::::::::::::::::::::: ::::. gi|157 PAPPQDVTVHAGATAASVQVSWKPPALTPTGLSNGANVTGYGVYAKGQRVAEVIAPTADG 510 520 530 540 550 560 610 620 630 640 650 660 KIAA03 TAVELVRLRSLEAKGVTVRTLSAQGESVDSAVAAVPPELLVPPTPHPRPAPQSKPLASSG :::::.::::::::.:.:::::.::::.:::.::.::.:::::.:::: :: :::::. gi|157 TAVELIRLRSLEAKAVSVRTLSVQGESMDSALAAIPPDLLVPPAPHPRTAPPPKPLASD- 570 580 590 600 610 620 670 680 690 700 710 KIAA03 VPETKDEHLGPHARMDEAWEQSRAPGPVHGHMLEPP----VGPGRRSPSPSRILPQPQGT .:::.:::::...::.:::::.:::.:::::::: .::::::::::::::::::. gi|157 -MDTKDQHLGPHVKVDESWEQSRSPGPAHGHMLEPPDMHSAGPGRRSPSPSRILPQPQGA 630 640 650 660 670 680 720 730 740 750 760 770 KIAA03 PVSTTVAKAMAREAAQRVAESSRLEKRSVFLERSSAGQYAASDEEDAYDSPDFKRRGASV :::::::::::::::::::::.::::::.:::.::::::. :::::.: ::. ::::.:: gi|157 PVSTTVAKAMAREAAQRVAESNRLEKRSLFLEQSSAGQYTNSDEEDGYASPEVKRRGTSV 690 700 710 720 730 740 780 790 800 810 820 830 KIAA03 DDFLKGSELGKQPHCCHGDEYHTESSRGSDLSDIMEEDEEELYSEMQLEDGGRRRPSGTS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|157 DDFLKGSELGKQPHCCHGDEYHTESSRGSDLSDIMEEDEEELYSEMQLEDGGRRRPSGTS 750 760 770 780 790 800 840 850 860 870 880 890 KIAA03 HNALKILGNPASAGRVD---HMGRRFPRGSAGPQRSRPVTVPSIDDY-GRDRLSPDFYEE ::::::::: . ::.: :..::. ....: .: ::. .::::.: :::.::::::.: gi|157 HNALKILGNSTLMGRADRMEHVSRRYSHSGGGSHRHRPAMAPSIDEYTGRDHLSPDFYDE 810 820 830 840 850 860 900 910 920 930 940 950 KIAA03 SETDPGAEELPARIFVALFDYDPLTMSPNPDAAEEELPFKEGQIIKVYGDKDADGFYRGE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|157 SETDPGAEELPARIFVALFDYDPLTMSPNPDAAEEELPFKEGQIIKVYGDKDADGFYRGE 870 880 890 900 910 920 960 970 980 990 1000 1010 KIAA03 TCARLGLIPCNMVSEIQADDEEMMDQLLRQGFLPLNTPVEKIERSRRSGRRHSVSTRRMV ::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::: ::: ::::: gi|157 TCARLGLIPCNMVSEIHADDEEMMDQLLRQGFLPLNTPVEKIERSRRSGRGHSVPTRRMV 930 940 950 960 970 980 1020 1030 1040 1050 1060 1070 KIAA03 ALYDYDPRESSPNVDVEAELTFCTGDIITVFGEIDEDGFYYGELNGQKGLVPSNFLEEVP :::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|157 ALYDYDPRESSPNVDVEAELPFCTGDIITVFGEIDEDGFYYGELNGQKGLVPSNFLEEVP 990 1000 1010 1020 1030 1040 1080 1090 1100 KIAA03 DDVEVYLSDAPSHYSQDTPMRSKAKRKKSVHFIP :::::.::::: :::.: :::::::::::::: : gi|157 DDVEVHLSDAPPHYSHDPPMRSKAKRKKSVHFTP 1050 1060 1070 >>gi|41393528|sp|Q80U40.2|RIMB2_MOUSE RecName: Full=RIMS (1072 aa) initn: 5571 init1: 2818 opt: 5887 Z-score: 5673.2 bits: 1061.5 E(): 0 Smith-Waterman score: 5990; 83.473% identity (92.665% similar) in 1077 aa overlap (55-1106:1-1072) 30 40 50 60 70 80 KIAA03 TLVTRERDLAVKEKHQLQAKLENLEQVLKHMREAAERRQQLQLEHDQALAVLSAKQQEID :::::::::::.:::.:::: :.::::::. gi|413 MREAAERRQQLELEHEQALAFLNAKQQEIQ 10 20 30 90 100 110 120 KIAA03 LLQK-----------------SKVRELEEKCRTQSEQFNLLSRDLEKFRQHAGKIDLLGG :::. :::::::::::.::::::::::::.:::::.:.:::::. gi|413 LLQQAQVEAKKEHEGAVQLLESKVRELEEKCRVQSEQFNLLSRDLQKFRQHTGSIDLLGS 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 KIAA03 SAVAPLDISTAPSKPFPQFMNGLATSLGKGQESAIGGSSAIGEYIRPLPQPGDRPEPLSA :.:: ::. ::.:::::.:::::::. ::.:. : :.::.:: : ::. : . gi|413 SSVALLDVPLAPGKPFPQYMNGLATSIHKGHEGPTGHYSVIGDYI---PLSGDKLESPCV 100 110 120 130 140 190 200 210 220 230 240 KIAA03 KPTFLSRSGSARCRSESDMENERNSNTSKQRYSGKVHLCVARYSYNPFDGPNENPEAELP ::.:: ::.: ::: ::.:.:.::::.::: :::::::::::::::::::::::::::: gi|413 KPSFLLRSSSPRCRFESEMDNDRNSNNSKQSSSGKVHLCVARYSYNPFDGPNENPEAELP 150 160 170 180 190 200 250 260 270 280 290 300 KIAA03 LTAGKYLYVYGDMDEDGFYEGELLDGQRGLVPSNFVDFVQDNESRLASTLGNEQDQNFIN ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::.:::.::::::.: gi|413 LTAGKYLYVYGDMDEDGFYEGELLDGQRGLVPSNFVDFIQDNESRLAGTLGSEQDQNFLN 210 220 230 240 250 260 310 320 330 340 350 360 KIAA03 HSGIGLEGEHILDLHSPTHIDAGITDNSAGTLDVNIDDIGEDIVPYPRKITLIKQLAKSV ::::.:: . :: :::::..:.:::::..::::::::::::: ::::::::::::::::: gi|413 HSGISLERDSILHLHSPTQVDSGITDNGGGTLDVNIDDIGEDTVPYPRKITLIKQLAKSV 270 280 290 300 310 320 370 380 390 400 410 420 KIAA03 IVGWEPPAVPPGWGTVSSYNVLVDKETRMNLTLGSRTKALIEKLNMAACTYRISVQCVTS :::::::::::::::::::::::::::::.:.:: :::::::::: :::::::::::::: gi|413 IVGWEPPAVPPGWGTVSSYNVLVDKETRMSLALGRRTKALIEKLNTAACTYRISVQCVTS 330 340 350 360 370 380 430 440 450 460 470 480 KIAA03 RGSSDELQCTLLVGKDVVVAPSHLRVDNITQISAQLSWLPTNSNYSHVIFLNEEEFDIVK ::.:::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::.:::::::.:::: gi|413 RGNSDELQCTLLVGKDVVVAPSQLRVDNITQISAQLSWLPTNSNYSHIIFLNEEELDIVK 390 400 410 420 430 440 490 500 510 520 530 540 KIAA03 AARYKYQFFNLRPNMAYKVKVLAKPHQMPWQLPLEQREKKEAFVEFSTLPAGPPAPPQDV :::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::: ::::::::::::::::: gi|413 AARYKYQFFNLRPNMAYKVKVLAQPHQMPWQLPLEQREKKEACVEFSTLPAGPPAPPQDV 450 460 470 480 490 500 550 560 570 580 590 600 KIAA03 TVQAGVTPATIRVSWRPPVLTPTGLSNGANVTGYGVYAKGQRVAEVIFPTADSTAVELVR ::.::.: :...:::.::.:::::::::::::::::::::::::::: ::::.:::::.: gi|413 TVHAGATAASVQVSWKPPALTPTGLSNGANVTGYGVYAKGQRVAEVIAPTADGTAVELIR 510 520 530 540 550 560 610 620 630 640 650 660 KIAA03 LRSLEAKGVTVRTLSAQGESVDSAVAAVPPELLVPPTPHPRPAPQSKPLASSGVPETKDE :::::::.:.:::::.::::.:::.::.::.:::::.:::: :: :::::. .:::. gi|413 LRSLEAKAVSVRTLSVQGESMDSALAAIPPDLLVPPAPHPRTAPPPKPLASD--MDTKDQ 570 580 590 600 610 620 670 680 690 700 710 720 KIAA03 HLGPHARMDEAWEQSRAPGPVHGHMLEPP----VGPGRRSPSPSRILPQPQGTPVSTTVA :::::...::.:::::.:::.:::::::: .::::::::::::::::::.::::::: gi|413 HLGPHVKVDESWEQSRSPGPAHGHMLEPPDMHSAGPGRRSPSPSRILPQPQGAPVSTTVA 630 640 650 660 670 680 730 740 750 760 770 780 KIAA03 KAMAREAAQRVAESSRLEKRSVFLERSSAGQYAASDEEDAYDSPDFKRRGASVDDFLKGS ::::::::::::::.::::::.:::.::.:::. :::::.: ::. ::::.::::::::: gi|413 KAMAREAAQRVAESNRLEKRSLFLEQSSVGQYTNSDEEDGYASPEVKRRGTSVDDFLKGS 690 700 710 720 730 740 790 800 810 820 830 840 KIAA03 ELGKQPHCCHGDEYHTESSRGSDLSDIMEEDEEELYSEMQLEDGGRRRPSGTSHNALKIL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|413 ELGKQPHCCHGDEYHTESSRGSDLSDIMEEDEEELYSEMQLEDGGRRRPSGTSHNALKIL 750 760 770 780 790 800 850 860 870 880 890 KIAA03 GNPASAGRVD---HMGRRFPRGSAGPQRSRPVTVPSIDDY-GRDRLSPDFYEESETDPGA :: . ::.: :..::. ....: .: ::. .::::.: :::.::::::.:::::::: gi|413 GNSTLMGRADRMEHVSRRYSHSGGGSHRHRPAMAPSIDEYTGRDHLSPDFYDESETDPGA 810 820 830 840 850 860 900 910 920 930 940 950 KIAA03 EELPARIFVALFDYDPLTMSPNPDAAEEELPFKEGQIIKVYGDKDADGFYRGETCARLGL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|413 EELPARIFVALFDYDPLTMSPNPDAAEEELPFKEGQIIKVYGDKDADGFYRGETCARLGL 870 880 890 900 910 920 960 970 980 990 1000 1010 KIAA03 IPCNMVSEIQADDEEMMDQLLRQGFLPLNTPVEKIERSRRSGRRHSVSTRRMVALYDYDP :::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::: ::: :::::::::::: gi|413 IPCNMVSEIHADDEEMMDQLLRQGFLPLNTPVEKIERSRRSGRGHSVPTRRMVALYDYDP 930 940 950 960 970 980 1020 1030 1040 1050 1060 1070 KIAA03 RESSPNVDVEAELTFCTGDIITVFGEIDEDGFYYGELNGQKGLVPSNFLEEVPDDVEVYL ::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.: gi|413 RESSPNVDVEAELPFCTGDIITVFGEIDEDGFYYGELNGQKGLVPSNFLEEVPDDVEVHL 990 1000 1010 1020 1030 1040 1080 1090 1100 KIAA03 SDAPSHYSQDTPMRSKAKRKKSVHFIP :::: :::.: :::::::::::::: : gi|413 SDAPPHYSHDPPMRSKAKRKKSVHFTP 1050 1060 1070 >>gi|148687582|gb|EDL19529.1| mCG15781, isoform CRA_a [M (1071 aa) initn: 5519 init1: 2818 opt: 5864 Z-score: 5651.0 bits: 1057.4 E(): 0 Smith-Waterman score: 5967; 83.380% identity (92.479% similar) in 1077 aa overlap (55-1106:1-1071) 30 40 50 60 70 80 KIAA03 TLVTRERDLAVKEKHQLQAKLENLEQVLKHMREAAERRQQLQLEHDQALAVLSAKQQEID :::::::::::.:::.:::: :.::::::. gi|148 MREAAERRQQLELEHEQALAFLNAKQQEIQ 10 20 30 90 100 110 120 KIAA03 LLQK-----------------SKVRELEEKCRTQSEQFNLLSRDLEKFRQHAGKIDLLGG :::. :::::::::::.::::::::::::::::::.:.:::::. gi|148 LLQQAQVEAKKEHEGAVQLLESKVRELEEKCRVQSEQFNLLSRDLEKFRQHTGSIDLLGS 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 KIAA03 SAVAPLDISTAPSKPFPQFMNGLATSLGKGQESAIGGSSAIGEYIRPLPQPGDRPEPLSA :.:: ::. ::.:::::.:::::::. ::.:. : :.::.:: : ::. : . gi|148 SSVALLDVPLAPGKPFPQYMNGLATSIHKGHEGPTGHYSVIGDYI---PLSGDKLESPCV 100 110 120 130 140 190 200 210 220 230 240 KIAA03 KPTFLSRSGSARCRSESDMENERNSNTSKQRYSGKVHLCVARYSYNPFDGPNENPEAELP ::.:: ::.: ::: ::.:.:.::::.::: :::::::::::::::::::::::::::: gi|148 KPSFLLRSSSPRCRFESEMDNDRNSNNSKQSSSGKVHLCVARYSYNPFDGPNENPEAELP 150 160 170 180 190 200 250 260 270 280 290 300 KIAA03 LTAGKYLYVYGDMDEDGFYEGELLDGQRGLVPSNFVDFVQDNESRLASTLGNEQDQNFIN ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::.:::.::::::.: gi|148 LTAGKYLYVYGDMDEDGFYEGELLDGQRGLVPSNFVDFIQDNESRLAGTLGSEQDQNFLN 210 220 230 240 250 260 310 320 330 340 350 360 KIAA03 HSGIGLEGEHILDLHSPTHIDAGITDNSAGTLDVNIDDIGEDIVPYPRKITLIKQLAKSV ::::.:: . :: :::::..:.:::::..::::::::::::: ::::::::::::::::: gi|148 HSGISLERDSILHLHSPTQVDSGITDNGGGTLDVNIDDIGEDTVPYPRKITLIKQLAKSV 270 280 290 300 310 320 370 380 390 400 410 420 KIAA03 IVGWEPPAVPPGWGTVSSYNVLVDKETRMNLTLGSRTKALIEKLNMAACTYRISVQCVTS :::::::::::::::::::::::::::::.:.:: :::::::::: :::::::::::::: gi|148 IVGWEPPAVPPGWGTVSSYNVLVDKETRMSLALGRRTKALIEKLNTAACTYRISVQCVTS 330 340 350 360 370 380 430 440 450 460 470 480 KIAA03 RGSSDELQCTLLVGKDVVVAPSHLRVDNITQISAQLSWLPTNSNYSHVIFLNEEEFDIVK ::.:::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::.:::::::.:::: gi|148 RGNSDELQCTLLVGKDVVVAPSQLRVDNITQISAQLSWLPTNSNYSHIIFLNEEELDIVK 390 400 410 420 430 440 490 500 510 520 530 540 KIAA03 AARYKYQFFNLRPNMAYKVKVLAKPHQMPWQLPLEQREKKEAFVEFSTLPAGPPAPPQDV :::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::: ::::::::::::::::: gi|148 AARYKYQFFNLRPNMAYKVKVLAQPHQMPWQLPLEQREKKEACVEFSTLPAGPPAPPQDV 450 460 470 480 490 500 550 560 570 580 590 600 KIAA03 TVQAGVTPATIRVSWRPPVLTPTGLSNGANVTGYGVYAKGQRVAEVIFPTADSTAVELVR ::.::.: :...:::.::.:::::::::::::::::::::::::::: ::::.:::::.: gi|148 TVHAGATAASVQVSWKPPALTPTGLSNGANVTGYGVYAKGQRVAEVIAPTADGTAVELIR 510 520 530 540 550 560 610 620 630 640 650 660 KIAA03 LRSLEAKGVTVRTLSAQGESVDSAVAAVPPELLVPPTPHPRPAPQSKPLASSGVPETKDE :::::::.:.:::::.::::.:::.::.::.:::::.:::: :: :::::. .:::. gi|148 LRSLEAKAVSVRTLSVQGESMDSALAAIPPDLLVPPAPHPRTAPPPKPLASD--MDTKDQ 570 580 590 600 610 620 670 680 690 700 710 720 KIAA03 HLGPHARMDEAWEQSRAPGPVHGHMLEPP----VGPGRRSPSPSRILPQPQGTPVSTTVA :::::...::.:::::.:::.:::::::: .::::::::::::::::::.::::::: gi|148 HLGPHVKVDESWEQSRSPGPAHGHMLEPPDMHSAGPGRRSPSPSRILPQPQGAPVSTTVA 630 640 650 660 670 680 730 740 750 760 770 780 KIAA03 KAMAREAAQRVAESSRLEKRSVFLERSSAGQYAASDEEDAYDSPDFKRRGASVDDFLKGS ::::::::::::::.::::::.:::.::.:::. :::::.: ::. ::::.::::::::: gi|148 KAMAREAAQRVAESNRLEKRSLFLEQSSVGQYTNSDEEDGYASPEVKRRGTSVDDFLKGS 690 700 710 720 730 740 790 800 810 820 830 840 KIAA03 ELGKQPHCCHGDEYHTESSRGSDLSDIMEEDEEELYSEMQLEDGGRRRPSGTSHNALKIL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|148 ELGKQPHCCHGDEYHTESSRGSDLSDIMEEDEEELYSEMQLEDGGRRRPSGTSHNALKIL 750 760 770 780 790 800 850 860 870 880 890 KIAA03 GNPASAGRVD---HMGRRFPRGSAGPQRSRPVTVPSIDDY-GRDRLSPDFYEESETDPGA :: . ::.: :..::. ....: .: ::. .::::.: :::.::::::.:::::::: gi|148 GNSTLMGRADRMEHVSRRYSHSGGGSHRHRPAMAPSIDEYTGRDHLSPDFYDESETDPGA 810 820 830 840 850 860 900 910 920 930 940 950 KIAA03 EELPARIFVALFDYDPLTMSPNPDAAEEELPFKEGQIIKVYGDKDADGFYRGETCARLGL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|148 EELPARIFVALFDYDPLTMSPNPDAAEEELPFKEGQIIKVYGDKDADGFYRGETCARLGL 870 880 890 900 910 920 960 970 980 990 1000 1010 KIAA03 IPCNMVSEIQADDEEMMDQLLRQGFLPLNTPVEKIERSRRSGRRHSVSTRRMVALYDYDP :::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::: ::: :::::::::::: gi|148 IPCNMVSEIHADDEEMMDQLLRQGFLPLNTPVEKIERSRRSGRGHSVPTRRMVALYDYDP 930 940 950 960 970 980 1020 1030 1040 1050 1060 1070 KIAA03 RESSPNVDVEAELTFCTGDIITVFGEIDEDGFYYGELNGQKGLVPSNFLEEVPDDVEVYL ::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.: gi|148 RESSPNVDVEAELPFCTGDIITVFGEIDEDGFYYGELNGQKGLVPSNFLEEVPDDVEVHL 990 1000 1010 1020 1030 1040 1080 1090 1100 KIAA03 SDAPSHYSQDTPMRSKAKRKKSVHFIP :::: :::. ::::::::: :::: : gi|148 SDAPPHYSHHPPMRSKAKRK-SVHFTP 1050 1060 1070 >>gi|149063197|gb|EDM13520.1| RIM binding protein 2, iso (1069 aa) initn: 5549 init1: 3725 opt: 5844 Z-score: 5631.8 bits: 1053.8 E(): 0 Smith-Waterman score: 5955; 83.473% identity (92.293% similar) in 1077 aa overlap (55-1106:1-1069) 30 40 50 60 70 80 KIAA03 TLVTRERDLAVKEKHQLQAKLENLEQVLKHMREAAERRQQLQLEHDQALAVLSAKQQEID :::::::::::.:::.::::.:.::::::. gi|149 MREAAERRQQLELEHEQALAILNAKQQEIQ 10 20 30 90 100 110 120 KIAA03 LLQK-----------------SKVRELEEKCRTQSEQFNLLSRDLEKFRQHAGKIDLLGG :::. :::::::::::.::::::::::::::::::::.:::::. gi|149 LLQQAQVEAKKEHEGAVQLLESKVRELEEKCRVQSEQFNLLSRDLEKFRQHAGSIDLLGS 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 KIAA03 SAVAPLDISTAPSKPFPQFMNGLATSLGKGQESAIGGSSAIGEYIRPLPQPGDRPEPLSA ..:: ::. ::.::: :.:::::::. ::.:. : :.::.:: : ::. : . gi|149 NSVALLDVPLAPGKPFSQYMNGLATSIHKGHEGPTGHYSVIGDYI---PLSGDKLESPCV 100 110 120 130 140 190 200 210 220 230 240 KIAA03 KPTFLSRSGSARCRSESDMENERNSNTSKQRYSGKVHLCVARYSYNPFDGPNENPEAELP ::.:: ::.: ::: ::.:...:.:: ::. :::::::::::::::::::::::::::: gi|149 KPSFLLRSSSPRCRFESEMDDDRSSNKSKHSSSGKVHLCVARYSYNPFDGPNENPEAELP 150 160 170 180 190 200 250 260 270 280 290 300 KIAA03 LTAGKYLYVYGDMDEDGFYEGELLDGQRGLVPSNFVDFVQDNESRLASTLGNEQDQNFIN ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::.:.:::.::::::.: gi|149 LTAGKYLYVYGDMDEDGFYEGELLDGQRGLVPSNFVDFIQDNESRFAGTLGSEQDQNFLN 210 220 230 240 250 260 310 320 330 340 350 360 KIAA03 HSGIGLEGEHILDLHSPTHIDAGITDNSAGTLDVNIDDIGEDIVPYPRKITLIKQLAKSV ::::.:: . :: :::::..:.:::::..::::::::::::::::::::::::::::::: gi|149 HSGISLERDSILHLHSPTQVDSGITDNGGGTLDVNIDDIGEDIVPYPRKITLIKQLAKSV 270 280 290 300 310 320 370 380 390 400 410 420 KIAA03 IVGWEPPAVPPGWGTVSSYNVLVDKETRMNLTLGSRTKALIEKLNMAACTYRISVQCVTS :::::::::::::::::::::::::::::.:.:: :::::::::: :::::::::::::: gi|149 IVGWEPPAVPPGWGTVSSYNVLVDKETRMSLALGRRTKALIEKLNTAACTYRISVQCVTS 330 340 350 360 370 380 430 440 450 460 470 480 KIAA03 RGSSDELQCTLLVGKDVVVAPSHLRVDNITQISAQLSWLPTNSNYSHVIFLNEEEFDIVK ::.:::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::.:::::::.:::: gi|149 RGNSDELQCTLLVGKDVVVAPSQLRVDNITQISAQLSWLPTNSNYSHIIFLNEEELDIVK 390 400 410 420 430 440 490 500 510 520 530 540 KIAA03 AARYKYQFFNLRPNMAYKVKVLAKPHQMPWQLPLEQREKKEAFVEFSTLPAGPPAPPQDV :::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::: ::::::::::::::::: gi|149 AARYKYQFFNLRPNMAYKVKVLAQPHQMPWQLPLEQREKKEACVEFSTLPAGPPAPPQDV 450 460 470 480 490 500 550 560 570 580 590 600 KIAA03 TVQAGVTPATIRVSWRPPVLTPTGLSNGANVTGYGVYAKGQRVAEVIFPTADSTAVELVR :::::.: :...:::.::.:::::::::::::::::::::::::::: ::::..:::::: gi|149 TVQAGATTASVQVSWKPPALTPTGLSNGANVTGYGVYAKGQRVAEVIAPTADGAAVELVR 510 520 530 540 550 560 610 620 630 640 650 660 KIAA03 LRSLEAKGVTVRTLSAQGESVDSAVAAVPPELLVPPTPHPRPAPQSKPLASSGVPETKDE :::::::.:.::::::::::.:::.::.::.:::::.:::: :: :::::. .::: gi|149 LRSLEAKAVSVRTLSAQGESMDSALAAIPPDLLVPPAPHPRTAPPPKPLASD--MDTKD- 570 580 590 600 610 620 670 680 690 700 710 720 KIAA03 HLGPHARMDEAWEQSRAPGPVHGHMLEPP----VGPGRRSPSPSRILPQPQGTPVSTTVA ::::...::.::::: :::.:::::::: .::::::::::::::::::.::::::: gi|149 -LGPHVKVDESWEQSRPPGPAHGHMLEPPDMHSTGPGRRSPSPSRILPQPQGAPVSTTVA 630 640 650 660 670 680 730 740 750 760 770 780 KIAA03 KAMAREAAQRVAESSRLEKRSVFLERSSAGQYAASDEEDAYDSPDFKRRGASVDDFLKGS ::::::::::::::.::::::.:::.:::: :: :::::.: ::. ::::.::::::::: gi|149 KAMAREAAQRVAESNRLEKRSLFLEQSSAGPYANSDEEDGYASPEVKRRGTSVDDFLKGS 690 700 710 720 730 740 790 800 810 820 830 840 KIAA03 ELGKQPHCCHGDEYHTESSRGSDLSDIMEEDEEELYSEMQLEDGGRRRPSGTSHNALKIL :::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|149 ELGQQPHCCHGDEYHTESSRGSDLSDIMEEDEEELYSEMQLEDGGRRRPSGTSHNALKIL 750 760 770 780 790 800 850 860 870 880 890 KIAA03 GNPASAGRVD---HMGRRFPRGSAGPQRSRPVTVPSIDDY-GRDRLSPDFYEESETDPGA :: : :: : :..::. ....:::: ::.. ::::.: :::.::::::.:::::::: gi|149 GNSALMGRGDRMEHVSRRYSHSGGGPQRHRPMA-PSIDEYTGRDHLSPDFYDESETDPGA 810 820 830 840 850 860 900 910 920 930 940 950 KIAA03 EELPARIFVALFDYDPLTMSPNPDAAEEELPFKEGQIIKVYGDKDADGFYRGETCARLGL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|149 EELPARIFVALFDYDPLTMSPNPDAAEEELPFKEGQIIKVYGDKDADGFYRGETCARLGL 870 880 890 900 910 920 960 970 980 990 1000 1010 KIAA03 IPCNMVSEIQADDEEMMDQLLRQGFLPLNTPVEKIERSRRSGRRHSVSTRRMVALYDYDP :::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::: ::: :::::::::::: gi|149 IPCNMVSEIHADDEEMMDQLLRQGFLPLNTPVEKIERSRRSGRGHSVPTRRMVALYDYDP 930 940 950 960 970 980 1020 1030 1040 1050 1060 1070 KIAA03 RESSPNVDVEAELTFCTGDIITVFGEIDEDGFYYGELNGQKGLVPSNFLEEVPDDVEVYL ::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.: gi|149 RESSPNVDVEAELLFCTGDIITVFGEIDEDGFYYGELNGQKGLVPSNFLEEVPDDVEVHL 990 1000 1010 1020 1030 1040 1080 1090 1100 KIAA03 SDAPSHYSQDTPMRSKAKRKKSVHFIP :::: :::.: :::.:::::::::: : gi|149 SDAPPHYSHDPPMRTKAKRKKSVHFTP 1050 1060 1106 residues in 1 query sequences 2693465022 residues in 7827732 library sequences Tcomplib [34.26] (8 proc) start: Wed Mar 4 12:42:19 2009 done: Wed Mar 4 12:45:54 2009 Total Scan time: 1776.160 Total Display time: 0.920 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]