# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hg00276.fasta.huge -Q ../query/KIAA0317.ptfa ./tmplib.23147 2
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007
Please cite:
 W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

 KIAA0317, 826 aa
 vs ./tmplib.23147 library

1986679 residues in  2037 sequences
  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.4649+/-0.00479; mu= 18.2927+/- 0.327
 mean_var=82.9332+/-19.602, 0's: 0 Z-trim: 15  B-trim: 0 in 0/40
 Lambda= 0.140835

FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2
 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width:  16
The best scores are:                                      opt bits E(2037)
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KIAA1320  ( 567 res)   fh13757                     ( 567)  588 129.7 8.8e-31
KIAA0093  ( 927 res)   ha00935                     ( 927)  586 129.5 1.6e-30
KIAA0010  ( 1086 res)   ha00408                    (1086)  532 118.6 3.5e-27
KIAA0322  ( 1614 res)   hg00462s1                  (1614)  503 113.0 2.7e-25
KIAA1625  ( 859 res)   hh15184                     ( 859)  500 112.0 2.8e-25
KIAA1301  ( 1581 res)   fg06833                    (1581)  500 112.3   4e-25
KIAA0896  ( 2820 res)   hk08890s2                  (2820)  385 89.3 6.3e-18
KIAA0045  ( 2005 res)   ha00941                    (2005)  291 70.0 2.9e-12
KIAA1131  ( 2168 res)   pf08614                    (2168)  277 67.2 2.2e-11
KIAA1593  ( 953 res)   fj09260                     ( 953)  254 62.1 3.3e-10
KIAA0614  ( 3006 res)   hg01176s2                  (3006)  182 48.1 1.7e-05
KIAA0032  ( 1054 res)   ha01920                    (1054)  145 40.0  0.0016
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>>KIAA0312  ( 3192 res)   ff01724                         (3192 aa)
 initn: 748 init1: 197 opt: 716  Z-score: 776.6  bits: 156.6 E(): 3.9e-38
Smith-Waterman score: 723;  34.596% identity (67.172% similar) in 396 aa overlap (442-825:2812-3191)

             420       430       440       450       460       470 
KIAA03 PPVELSCKERNILAATFIRSLHKNIGGSETFQDKVNFFQRELRQVHMKRPHSKVTLKVSR
                                     :. : ..:..::...     .  ....: :
KIAA03 TVLNQILRQSTTHLADGPFAVLVDYIRVLDFDVKRKYFRQELERLDEGLRKEDMAVHVRR
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KIAA03 HALLESSLKATRNFSISDWSKNFEVVFQDEEALDWGGPRREWFELICKALFDTTNQLFTR
         ..:.: .  .  :  . .. . .::. ::. : ::  :::. .: . .:.    :: :
KIAA03 DHVFEDSYRELHRKSPEEMKNRLYIVFEGEEGQDAGGLLREWYMIISREMFNPMYALF-R
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KIAA03 FSDNNQALVHPNPNR---PAHLRLKMYEFAGRLVGKCLYESSLGGAYKQLVRARFTRSFL
        : ....    ::.    : ::  ....:.::.:.: .:..       .:..  ::::: 
KIAA03 TSPGDRVTYTINPSSHCNPNHL--SYFKFVGRIVAKAVYDN-------RLLECYFTRSFY
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KIAA03 AQIIGLRMHYKYFETDDPEFYKSKVCFILNNDMSEM--ELVFAEEKYNKSGQLDKVVELM
        .:.:  ..:  .:..: .::.. : ..:.::.: .  .:.:. :  .. : . .: .: 
KIAA03 KHILGKSVRYTDMESEDYHFYQGLV-YLLENDVSTLGYDLTFSTE-VQEFG-VCEVRDLK
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KIAA03 TGGAQTPVTNANKIFYLNLLAQYRLASQVKEEVEHFLKGLNELVPENLLAIFDENELELL
        .::.  ::. ::  :..:. :.:... .....  ::.:. :..:. :..:: :.:::::
KIAA03 PNGANILVTEENKKEYVHLVCQMRMTGAIRKQLAAFLEGFYEIIPKRLISIFTEQELELL
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KIAA03 MCGTGDISVSDFKAHAVVVGGSWHFREKVMRWFWTVVSSLTQEELARLLQFTTGSSQLPP
       . :   :...:.:...     ...     ..::: .. :. : . :..:::.::.:..: 
KIAA03 ISGLPTIDIDDLKSNTEY--HKYQSNSIQIQWFWRALRSFDQADRAKFLQFVTGTSKVPL
     3070      3080        3090      3100      3110      3120      

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KIAA03 GGFAAL-----CPSFQIIAAPTHST--LPTAHTCFNQLCLPTYDSYEEVHRMLQLAISEG
        :::::       .:::     .::  ::.:::::::: ::.:.:.:....:: :::.: 
KIAA03 QGFAALEGMNGIQKFQI-HRDDRSTDRLPSAHTCFNQLDLPAYESFEKLRHMLLLAIQEC
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     820      
KIAA03 CEGFGML
        ::::. 
KIAA03 SEGFGLA
        3190  

>>KIAA0439  ( 995 res)   hj00462                          (995 aa)
 initn: 615 init1: 260 opt: 593  Z-score: 647.2  bits: 131.0 E(): 6.2e-31
Smith-Waterman score: 764;  30.986% identity (59.859% similar) in 568 aa overlap (306-823:448-991)

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KIAA03 IIVLSEDEKNIVERNVSTSGVSIYFEAYLYNATNCSSTPWHL--PPMHMTSSQRRPSTAV
                                     .::: ..   ::  : ..   :   :....
KIAA04 KGRTYYVNHNNRTTTWTRPIMQLAEDGASGSATNSNN---HLIEPQIRRPRSLSSPTVTL
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KIAA03 D---EEDEDSPSECHTPEKVKKPK--KVYCYVSPK-QFSVKEFYLKIIP-WRLYTFRVCP
       .   :  .::: .  . . ...:.  .   : ::: : .: . .:   : :..   :. :
KIAA04 SAPLEGAKDSPVRRAVKDTLSNPQSPQPSPYNSPKPQHKVTQSFLP--PGWEM---RIAP
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KIAA03 -GTKF---------SYLGPD---PVH--KLLTLVVDD-GIQPP-----VELSCKERNILA
        :  :         ..  :    :::  .  .:  .: :  ::     ..:. .   :  
KIAA04 NGRPFFIDHNTKTTTWEDPRLKFPVHMRSKTSLNPNDLGPLPPGWEERIHLDGRTFYIDH
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KIAA03 ATFI------RSLHKNIGG-----SETFQDKVNFFQRELRQVHMKRPHSKVTLKVSRHAL
        . :      :  .  : :     :. :..: ..:...:..     :. .  .:. :. .
KIAA04 NSKITQWEDPRLQNPAITGPAVPYSREFKQKYDYFRKKLKK-PADIPN-RFEMKLHRNNI
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KIAA03 LESSLKATRNFSISDWSKN-FEVVFQDEEALDWGGPRREWFELICKALFDTTNQLFTRFS
       .: : .   . .  :  :  . . :..:..::.::  :::: :. : .:.    ::   .
KIAA04 FEESYRRIMSVKRPDVLKARLWIEFESEKGLDYGGVAREWFFLLSKEMFNPYYGLFEYSA
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KIAA03 DNNQAL-VHPNPNRPAHLRLKMYEFAGRLVGKCLYESSLGGAYKQLVRARFTRSFLAQII
        .: .: ..:: .   . .:... : ::..:  .....:  ..       : : :  ...
KIAA04 TDNYTLQINPNSGLCNEDHLSYFTFIGRVAGLAVFHGKLLDGF-------FIRPFYKMML
       710       720       730       740       750              760

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KIAA03 GLRMHYKYFETDDPEFYKSKVCFILNNDMSEMELVFA--EEKYNKSGQLDKVVELMTGGA
       : ..  . .:. : :.:.: . .::.:: .:..:.:   ::..... :.:    :  .:.
KIAA04 GKQITLNDMESVDSEYYNS-LKWILENDPTELDLMFCIDEENFGQTYQVD----LKPNGS
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KIAA03 QTPVTNANKIFYLNLLAQYRLASQVKEEVEHFLKGLNELVPENLLAIFDENELELLMCGT
       .  ::: ::  :..:. :.:....:..... ::.:..::.: .:. ::::::::::::: 
KIAA04 EIMVTNENKREYIDLVIQWRFVNRVQKQMNAFLEGFTELLPIDLIKIFDENELELLMCGL
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KIAA03 GDISVSDFKAHAVVVGGSWHFREKVMRWFWTVVSSLTQEELARLLQFTTGSSQLPPGGFA
       ::..:.:.. :..  .: .   . :..::: .:  .  :.  :::::.::.:..: .:::
KIAA04 GDVDVNDWRQHSIYKNG-YCPNHPVIQWFWKAVLLMDAEKRIRLLQFVTGTSRVPMNGFA
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KIAA03 ALCPS-----FQIIAAPTHSTLPTAHTCFNQLCLPTYDSYEEVHRMLQLAISEGCEGFGM
        :  :     : :    .   :: ::::::.: :: :...:.... : .:. :. .::  
KIAA04 ELYGSNGPQLFTIEQWGSPEKLPRAHTCFNRLDLPPYETFEDLREKLLMAV-ENAQGFEG
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KIAA03 L 
         
KIAA04 VD
         

>>KIAA1320  ( 567 res)   fh13757                          (567 aa)
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Smith-Waterman score: 684;  33.414% identity (64.649% similar) in 413 aa overlap (430-825:172-566)

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KIAA03 KLLTLVVDDGIQPPVELSCKERNILAATFIRSLHKNIGGSETFQDKVNFFQRELRQVH--
                                     : .:  :  .. :.:. ..: ..:.. .  
KIAA13 DEVLKCFVNRNPKIIFDHFHFLLECPELMSRFMH--IIKAQPFKDRCEWFYEHLHSGQPD
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KIAA03 ---MKRP-HSKVTLKVSRHALLESSLKATRNFSISDWSKNFEVVFQDEEALDWGGPRREW
          ..:: . .  : : : ....:: ... . . .  .... : :. ::..  :   :::
KIAA13 SDMVHRPVNENDILLVHRDSIFRSSCEVVSKANCAKLKQGIAVRFHGEEGMGQG-VVREW
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KIAA03 FELICKALFDTTNQLFTRFSDNNQALVHPNPNR---PAHLRLKMYEFAGRLVGKCLYESS
       :... . . .    :::. .:..    .:: :    : ::  ....:::...:  :    
KIAA13 FDILSNEIVNPDYALFTQSADGTT--FQPNSNSYVNPDHL--NYFRFAGQILGLAL----
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KIAA03 LGGAYKQLVRARFTRSFLAQIIGLRMHYKYFETDDPEFYKSKVCFILNNDMSEM--ELVF
           ..:::   :::::  .:.:. ..:.   . :::. :. . .::.::.:..  ::.:
KIAA13 ---NHRQLVNIYFTRSFYKHILGIPVNYQDVASIDPEYAKN-LQWILDNDISDLGLELTF
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KIAA03 AEEKYNKSGQLDKVVELMTGGAQTPVTNANKIFYLNLLAQYRLASQVKEEVEHFLKGLNE
       . :  .  : ...:  :  ::..  ::. ::  :..:... :..  .. ... ::.:.. 
KIAA13 SVET-DVFGAMEEV-PLKPGGGSILVTQNNKAEYVQLVTELRMTRAIQPQINAFLQGFHM
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KIAA03 LVPENLLAIFDENELELLMCGTGDISVSDFKAHAVVVGGSWHFREKVMRWFWTVVSSLTQ
       ..: .:. .::: :::::. :  .:.:::.  ..  ..: .. .. :..::: :: ..::
KIAA13 FIPPSLIQLFDEYELELLLSGMPEIDVSDWIKNTEYTSG-YEREDPVIQWFWEVVEDITQ
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KIAA03 EELARLLQFTTGSSQLPPGGFAALC-----PSFQIIAAP-THSTLPTAHTCFNQLCLPTY
       :: . ::::.::::..: :::: .       .: : :.: : . :::. ::.:.: :: :
KIAA13 EERVLLLQFVTGSSRVPHGGFANIMGGSGLQNFTIAAVPYTPNLLPTSSTCINMLKLPEY
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KIAA03 DSYEEVHRMLQLAISEGCEGFGML
        : : ..  : .:.  :  :. : 
KIAA13 PSKEILKDRLLVALHCGSYGYTMA
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>>KIAA0093  ( 927 res)   ha00935                          (927 aa)
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KIAA03 DIIVLSEDEKNIVERNVSTSGVSIYFEAYLYNATNCSSTPWHLPPMHMT-SSQRRPSTAV
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KIAA00 EQPTLPVLLPTSSGLPPGWEEKQDERGRSYYVDHNSRTTTWTKPTVQATVETSQLTSSQS
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KIAA03 DEEDEDSPSECHTPEKVKKPKKVYCYVSPKQFSVKE------FYL----KIIPWRLYTFR
       .   ... :   . ..: .:...     :: . :..      :..    :   :.   ..
KIAA00 SAGPQSQASTSDSGQQVTQPSEIEQGFLPKGWEVRHAPNGRPFFIDHNTKTTTWEDPRLK
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KIAA03 VCPGT---KFSY-----LGPDPVHKLLTLVVDDG----IQPPVELSCKERNILAATFIRS
       . :.    : :      ::: :       .  ::    :.  .. .  :   :  . : .
KIAA00 I-PAHLRGKTSLDTSNDLGPLP-PGWEERTHTDGRIFYINHNIKRTQWEDPRLENVAITG
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KIAA03 LHKNIGGSETFQDKVNFFQRELRQVHMKRPHSKVTLKVSRHALLESSLKATRNFSISDWS
           .  :. .. : .::.:.:.. .   :. :  .:. : ..::.: .   . . .:. 
KIAA00 --PAVPYSRDYKRKYEFFRRKLKK-QNDIPN-KFEMKLRRATVLEDSYRRIMGVKRADFL
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KIAA03 KN-FEVVFQDEEALDWGGPRREWFELICKALFDTTNQLFTRFSDNNQAL-VHPNPNRPAH
       :  . . :. :..::.::  :::: :: : .:.    ::   . .: .: ..:: .   .
KIAA00 KARLWIEFDGEKGLDYGGVAREWFFLISKEMFNPYYGLFEYSATDNYTLQINPNSGLCNE
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KIAA03 LRLKMYEFAGRLVGKCLYESSLGGAYKQLVRARFTRSFLAQIIGLRMHYKYFETDDPEFY
        .:....: ::..:  .:...:  ..       : : :  ...   .  . .:. : :.:
KIAA00 DHLSYFKFIGRVAGMAVYHGKLLDGF-------FIRPFYKMMLHKPITLHDMESVDSEYY
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KIAA03 KSKVCFILNNDMSEMELVFA--EEKYNKSGQLDKVVELMTGGAQTPVTNANKIFYLNLLA
       .: . .::.:: .:..: :   :: .... :     :: .::..  ::: ::  :. :. 
KIAA00 NS-LRWILENDPTELDLRFIIDEELFGQTHQH----ELKNGGSEIVVTNKNKKEYIYLVI
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KIAA03 QYRLASQVKEEVEHFLKGLNELVPENLLAIFDENELELLMCGTGDISVSDFKAHAVVVGG
       :.:.........  : .:. ::.:..:. ::::::::::::: ::..:.:.. :.   .:
KIAA00 QWRFVNRIQKQMAAFKEGFFELIPQDLIKIFDENELELLMCGLGDVDVNDWREHTKYKNG
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KIAA03 SWHFREKVMRWFWTVVSSLTQEELARLLQFTTGSSQLPPGGFAALC----P-SFQIIAAP
        .   ..:..::: .:  . .:.  :::::.::.:..: .::: :     : :: .    
KIAA00 -YSANHQVIQWFWKAVLMMDSEKRIRLLQFVTGTSRVPMNGFAELYGSNGPQSFTVEQWG
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KIAA03 THSTLPTAHTCFNQLCLPTYDSYEEVHRMLQLAISEGCEGFGML 
       :   :: ::::::.: :: :.:.::.   ::.:: :. .::    
KIAA00 TPEKLPRAHTCFNRLDLPPYESFEELWDKLQMAI-ENTQGFDGVD
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>>KIAA0010  ( 1086 res)   ha00408                         (1086 aa)
 initn: 426 init1: 278 opt: 532  Z-score: 579.8  bits: 118.6 E(): 3.5e-27
Smith-Waterman score: 533;  30.490% identity (58.422% similar) in 469 aa overlap (377-823:654-1083)

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KIAA00 FCPPNHWLSEQEDIKADKVTQLYVPASRHVWR---FR-----RMGRIGP------LQSTL
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KIAA03 DDGIQ-PPVELSCKERNILAATFIRSLHKNIGGSETFQDKVNFFQREL----RQVHMKRP
       : :.. ::. .: .::.. . : .  .         :...:..::: .    ..:.   :
KIAA00 DVGLESPPLSVS-EERQLAVLTELPFV-------VPFEERVKIFQRLIYADKQEVQGDGP
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KIAA03 H-SKVTLKVSRHALLESSLKATRNFSISDWSKNFEVVFQ-----DEEALDWGGPRREWFE
         . ... . :. . :..       .  : .: ..: .      :: ..: ::  ::...
KIAA00 FLDGINVTIRRNYIYEDAYDKLSPENEPDLKKRIRVHLLNAHGLDEAGIDGGGIFREFLN
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KIAA03 LICKALFDTTNQLFTRFSDNNQALVHPNPNRPAHLRL-----KMYEFAGRLVGKCLYESS
        . :. :.  :: :  :. .:..:..:::   :.. .     . : : .:..:: :::. 
KIAA00 ELLKSGFNP-NQGF--FKTTNEGLLYPNP--AAQMLVGDSFARHYYFLARMLGKALYEN-
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KIAA03 LGGAYKQLVRARFTRSFLAQIIGLR--MHYKYFETDDPEFYKSKVCFI--LNNDMSEMEL
             .::.  :.  ::....:    .  ... . ::: ::. . :.   ..:. :. :
KIAA00 ------MLVELPFAGFFLSKLLGTSADVDIHHLASLDPEVYKN-LLFLKSYEDDVEELGL
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KIAA03 VFAEEKYNKSGQLDKVVELMTGGAQTPVTNANKIFYLNLLAQYRLASQVKEEVEHFLKGL
        :.  . :  :.  .::::  :: . :::.::.: :..:.:.:::  :....   : .::
KIAA00 NFTVVN-NDLGEA-QVVELKFGGKDIPVTSANRIAYIHLVADYRLNRQIRQHCLAFRQGL
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KIAA03 NELVPENLLAIFDENELELLMCGTG-DISVSDFKAHAVVVGGSWHFREKVMRWFWTVVSS
        ..:  . : .::..:...:. :.   ::. :.:. .   :: .   . :.. :: :: .
KIAA00 ANVVSLEWLRMFDQQEIQVLISGAQVPISLEDLKSFTNYSGG-YSADHPVIKVFWRVVEG
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KIAA03 LTQEELARLLQFTTGSSQLPPGGFAALCPSFQIIAAPTH-STLPTAHTCFNQLCLPTYDS
       .:.::  .::.:.:. :. :  ::  : :.: :  . .    :::: ::.: : :: . .
KIAA00 FTDEEKRKLLKFVTSCSRPPLLGFKELYPAFCIHNGGSDLERLPTASTCMNLLKLPEFYD
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KIAA03 YEEVHRMLQLAISEGCEGFGML
          ..  :  :: :   ::   
KIAA00 ETLLRSKLLYAI-ECAAGFELS
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>>KIAA0322  ( 1614 res)   hg00462s1                       (1614 aa)
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Smith-Waterman score: 643;  33.503% identity (63.706% similar) in 394 aa overlap (442-825:1235-1613)

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KIAA03 PPVELSCKERNILAATFIRSLHKNIGGSETFQDKVNFFQRELRQVHMKRPHSKVTLKVSR
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KIAA03 SPRCSPCSSPQNSPGLQRASARAPSPYRRDFEAKLRNFYRKLEAKGFGQGPGKIKLIIRR
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KIAA03 HALLESSLKATRNFSISDWSKN-FEVVFQDEEALDWGGPRREWFELICKALFDTTNQLFT
         :::.... .  .: .. ..: . :.:  ::.::..:: ::.: :. . ::.    :: 
KIAA03 DHLLEGTFNQVMAYSRKELQRNKLYVTFVGEEGLDYSGPSREFFFLLSQELFNPYYGLF-
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KIAA03 RFSDNNQALVHPNPNRP-AHLRLKMYEFAGRLVGKCLYESSLGGAYKQLVRARFTRSFLA
       ..: :.   :. .:    .. .:. ..:.::..:  :        .. :. : ::: :  
KIAA03 EYSANDTYTVQISPMSAFVENHLEWFRFSGRILGLAL-------IHQYLLDAFFTRPFYK
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        .. :    . .:  : ::..: . .. .:.... ..:.:.  :: .   ::. .  :: 
KIAA03 ALLRLPCDLSDLEYLDEEFHQS-LQWMKDNNITDILDLTFTVNEEVF---GQVTER-ELK
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       .:::.: ::. ::  :.. ....:.   : ...: ...:. :.:   :...::  ::::.
KIAA03 SGGANTQVTEKNKKEYIERMVKWRVERGVVQQTEALVRGFYEVVDSRLVSVFDARELELV
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KIAA03 MCGTGDISVSDFKAHAVVVGGSWHFREKVMRWFWTVVSSLTQEELARLLQFTTGSSQLPP
       . ::..:...:.. ..   :: .:  . :.::::..:  ...:.  :::::.::.:..: 
KIAA03 IAGTAEIDLNDWRNNTEYRGG-YHDGHLVIRWFWAAVERFNNEQRLRLLQFVTGTSSVPY
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KIAA03 GGFAALCPS-----FQIIAAPTHSTLPTAHTCFNQLCLPTYDSYEEVHRMLQLAISEGCE
        :::::  :     : :      ..:: ::::::.: :: : ::  ... :  :. :   
KIAA03 EGFAALRGSNGLRRFCIEKWGKITSLPRAHTCFNRLDLPPYPSYSMLYEKLLTAVEE-TS
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KIAA03 GFGML
        ::. 
KIAA03 TFGLE
    1610    

>>KIAA1625  ( 859 res)   hh15184                          (859 aa)
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KIAA03 ELSCKERNILAATFIRSLHKNIGGSETFQDKVNFFQRELRQVHMKRPHSKVTLKVSRHAL
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KIAA16 EPSQPLPLPSEGSLEDEELPAQRYERDLVQKLKVLRHELSLQQPQAGHCRI--EVSREEI
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KIAA03 LESSLKATRNFSISDWSKNFEVVFQDEEALDWGGPRREWFELICKALFDTTNQLFTRFSD
       .: : .   ..  .: .: . : :. ::.::.::  :::. :.:. ...    :: ..: 
KIAA16 FEESYRQIMKMRPKDLKKRLMVKFRGEEGLDYGGVAREWLYLLCHEMLNPYYGLF-QYST
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KIAA03 NNQALVHPNPNR---PAHLRLKMYEFAGRLVGKCLYESSLGGAYKQLVRARFTRSFLAQI
       .:  ... ::.    : ::  ....:.::..:  ...    : :   . . ::  :  :.
KIAA16 DNIYMLQINPDSSINPDHL--SYFHFVGRIMGLAVFH----GHY---INGGFTVPFYKQL
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KIAA03 IGLRMHYKYFETDDPEFYKSKVCFILNNDMSE-MELVFAEEKYNKSGQLDKVVELMTGGA
       .:  .. . .:. :::..:: : .::.::..  .. .:  : .:  :.. .  ::  .: 
KIAA16 LGKPIQLSDLESVDPELHKSLV-WILENDITPVLDHTFCVE-HNAFGRILQH-ELKPNGR
              630       640        650       660        670        

              660       670       680       690       700       710
KIAA03 QTPVTNANKIFYLNLLAQYRLASQVKEEVEHFLKGLNELVPENLLAIFDENELELLMCGT
       ..:::. ::  :. : ...:.   .. .   . ::.:::.:..::  ::..::::.. : 
KIAA16 NVPVTEENKKEYVRLYVNWRFMRGIEAQFLALQKGFNELIPQHLLKPFDQKELELIIGGL
       680       690       700       710       720       730       

              720          730       740       750       760       
KIAA03 GDISVSDFKAHAVV---VGGSWHFREKVMRWFWTVVSSLTQEELARLLQFTTGSSQLPPG
         :...:.:... .   :. :     ...:::: .: .. .:. ::::::.:::...:  
KIAA16 DKIDLNDWKSNTRLKHCVADS-----NIVRWFWQAVETFDEERRARLLQFVTGSTRVPLQ
       740       750            760       770       780       790  

       770                 780       790       800       810       
KIAA03 GFAALCPS----------FQIIAAPTHSTLPTAHTCFNQLCLPTYDSYEEVHRMLQLAIS
       :: ::  :          ...: : : ..:: ::::::.. .: :.:::.... :  :. 
KIAA16 GFKALQGSTGAAGPRLFTIHLIDANT-DNLPKAHTCFNRIDIPPYESYEKLYEKLLTAVE
            800       810        820       830       840       850 

       820      
KIAA03 EGCEGFGML
       : : ::.. 
KIAA16 ETC-GFAVE
                

>>KIAA1301  ( 1581 res)   fg06833                         (1581 aa)
 initn: 527 init1: 201 opt: 500  Z-score: 542.8  bits: 112.3 E(): 4e-25
Smith-Waterman score: 640;  32.995% identity (62.690% similar) in 394 aa overlap (442-825:1202-1580)

             420       430       440       450       460       470 
KIAA03 PPVELSCKERNILAATFIRSLHKNIGGSETFQDKVNFFQRELRQVHMKRPHSKVTLKVSR
                                     :. :.  : :.:.   . .  .:. : . :
KIAA13 SPRGSPVSSPQNSPGTQRANARAPAPYKRDFEAKLRNFYRKLETKGYGQGPGKLKLIIRR
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KIAA03 HALLESSLKATRNFSISDWSKN-FEVVFQDEEALDWGGPRREWFELICKALFDTTNQLFT
         :::....   ..: .: ..: . :.:  ::.::..:: ::.: :. . ::.    :: 
KIAA13 DHLLEDAFNQIMGYSRKDLQRNKLYVTFVGEEGLDYSGPSREFFFLVSRELFNPYYGLF-
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KIAA03 RFSDNNQALVHPNPNRP-AHLRLKMYEFAGRLVGKCLYESSLGGAYKQLVRARFTRSFLA
       ..: :.   :. .:    .  . . ..:.::..:  :        .. :. : ::: :  
KIAA13 EYSANDTYTVQISPMSAFVDNHHEWFRFSGRILGLAL-------IHQYLLDAFFTRPFYK
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KIAA03 QIIGLRMHYKYFETDDPEFYKSKVCFILNNDMSE-MELVFA--EEKYNKSGQLDKVVELM
        .. .    . .:  : ::..: . .. .::. . ..:.:.  :: .   ::. .  :: 
KIAA13 ALLRILCDLSDLEYLDEEFHQS-LQWMKDNDIHDILDLTFTVNEEVF---GQITER-ELK
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KIAA03 TGGAQTPVTNANKIFYLNLLAQYRLASQVKEEVEHFLKGLNELVPENLLAIFDENELELL
        :::. :::. ::  :.. ....:.   : ...: ...:. :.:   :...::  ::::.
KIAA13 PGGANIPVTEKNKKEYIERMVKWRIERGVVQQTESLVRGFYEVVDARLVSVFDARELELV
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KIAA03 MCGTGDISVSDFKAHAVVVGGSWHFREKVMRWFWTVVSSLTQEELARLLQFTTGSSQLPP
       . ::..:..::.. ..   :: .:  . :.::::..:  ...:.  :::::.::.:..: 
KIAA13 IAGTAEIDLSDWRNNTEYRGG-YHDNHIVIRWFWAAVERFNNEQRLRLLQFVTGTSSIPY
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KIAA03 GGFAALCPS-----FQIIAAPTHSTLPTAHTCFNQLCLPTYDSYEEVHRMLQLAISEGCE
        :::.:  :     : .      ..:: ::::::.: :: : :.  ... :  :. :   
KIAA13 EGFASLRGSNGPRRFCVEKWGKITALPRAHTCFNRLDLPPYPSFSMLYEKLLTAVEE-TS
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KIAA03 GFGML
        ::. 
KIAA13 TFGLE
       1580 

>>KIAA0896  ( 2820 res)   hk08890s2                       (2820 aa)
 initn: 353 init1: 167 opt: 385  Z-score: 413.7  bits: 89.3 E(): 6.3e-18
Smith-Waterman score: 385;  28.254% identity (59.683% similar) in 315 aa overlap (523-823:2520-2819)

            500       510       520       530       540       550  
KIAA03 NFEVVFQDEEALDWGGPRREWFELICKALFDTTNQLFTRFSDNNQALVHPNPNRPAHLRL
                                     : .  ::  .. .....  : :.. .. ::
KIAA08 DSSEKVQENRKRHGSSRSVVDMDLDDTDDGDDNAPLF--YQPGKRGFYTPRPGKNTEARL
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KIAA03 KMYEFAGRLVGKCLYESSLGGAYKQLVRARFTRSFLAQIIGLRMHYKYFETDDPEFYKSK
       . ..  ::..: :: ..       .:    ..:  .  ..: ..... :   :: .:.: 
KIAA08 NCFRNIGRILGLCLLQN-------ELCPITLNRHVIKVLLGRKVNWHDFAFFDPVMYESL
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KIAA03 VCFILNNDMSE-------MELVFAEE--KYNKSGQLDKVVELMTGGAQTPVTNANKIFYL
         .:: .. :.       :.:.:: .  : . .::    :::. .:.. :::  :   :.
KIAA08 RQLILASQSSDADAVFSAMDLAFAIDLCKEEGGGQ----VELIPNGVNIPVTPQNVYEYV
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KIAA03 NLLAQYRLASQVKEEVEHFLKGLNELVPENLLAIFDENELELLMCGTGDISVSDFKAHAV
          :..:.   ... .. . ::: ...:.: :  .  ....::. : :...:. . . . 
KIAA08 RKYAEHRMLVVAEQPLHAMRKGLLDVLPKNSLEDLTAEDFRLLVNGCGEVNVQMLISFTS
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KIAA03 VVGGSWHFREKVM---RWFWTVVSSLTQEELARLLQFTTGSSQLPPG--GFAALCPSFQI
           : .  ::..   ::::..: .... :   :. : :.: .:: .  ::  . ::. :
KIAA08 FNDESGENAEKLLQFKRWFWSIVEKMSMTERQDLVYFWTSSPSLPASEEGFQPM-PSITI
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KIAA03 IAAPTHSTLPTAHTCFNQLCLPTYDSYEEVHRMLQLAISEGCEGFGML
          :  . ::::.::...: .: :.: . ... : :::.    ::   
KIAA08 -RPPDDQHLPTANTCISRLYVPLYSSKQILKQKLLLAIKTKNFGFV  
         2780      2790      2800      2810      2820  

>>KIAA0045  ( 2005 res)   ha00941                         (2005 aa)
 initn: 356 init1: 125 opt: 291  Z-score: 312.2  bits: 70.0 E(): 2.9e-12
Smith-Waterman score: 312;  26.238% identity (51.733% similar) in 404 aa overlap (454-825:1608-2004)

           430       440       450       460       470       480   
KIAA03 LAATFIRSLHKNIGGSETFQDKVNFFQRELRQVHMKRPHSKVTLKVSRHALLESSLKATR
                                     :.  .:. .: .    : .:.:: . .   
KIAA00 LLDTNPEINQSDSQDSRVAPRLDRKKRTVNREELLKQAESVMQDLGSSRAMLEIQYENEV
      1580      1590      1600      1610      1620      1630       

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KIAA03 NFSISDWSKNFEVVFQDEEALDWGGPRREWFELICKALFDTTNQLFTRFSDNNQ---ALV
       . ...   . . .: :. .  : :  : :   :         .:  :.. .: :   :: 
KIAA00 GTGLGPTLEFYALVSQELQRADLGLWRGEEVTLSN----PKGSQEGTKYIQNLQGLFALP
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KIAA03 HPNPNRPAHL-RLKM-YEFAGRLVGKC-----LYESSLGGA-YKQLVRAR--FTRSFLAQ
            .:::. ..:: ..: :.:..:      : .  ::   :: ..: .  .:   : .
KIAA00 FGRTAKPAHIAKVKMKFRFLGKLMAKAIMDFRLVDLPLGLPFYKWMLRQETSLTSHDLFD
          1700      1710      1720      1730      1740      1750   

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KIAA03 IIGLRMHYKYFETDDPEFYKSKVCFILNNDMSEMELVFAEEKYNKSG------QLDKV--
       :  .  .  :   :   . ..:  .  ......  : .: :  . .:       :: .  
KIAA00 IDPVVARSVYHLED---IVRQKKRLEQDKSQTKESLQYALETLTMNGCSVEDLGLDFTLP
          1760         1770      1780      1790      1800      1810

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KIAA03 ----VELMTGGAQTPVTNANKIFYLNLLAQYRLASQVKEEVEHFLKGLNELVPENLLAIF
           .::  :: . :::  :   :: :.  . :   :... . :  :.. . : . :  :
KIAA00 GFPNIELKKGGKDIPVTIHNLEEYLRLVIFWALNEGVSRQFDSFRDGFESVFPLSHLQYF
             1820      1830      1840      1850      1860      1870

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KIAA03 DENELELLMCGT-GDISVSDFKAHAVVVGGSWHFREKVMRWFWTVVSSLTQEELARLLQF
         .::. :.::. .:   .    .      ..    ....... ..::. .:.   .:::
KIAA00 YPEELDQLLCGSKADTWDAKTLMECCRPDHGYTHDSRAVKFLFEILSSFDNEQQRLFLQF
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KIAA03 TTGSSQLPPGGFAALCPSFQIIAAPTHST------LPTAHTCFNQLCLPTYDSYEEVHRM
       .::: .:: ::: .: : . :.    .::      ::.. :: : : :: :.: : ... 
KIAA00 VTGSPRLPVGGFRSLNPPLTIVRKTFESTENPDDFLPSVMTCVNYLKLPDYSSIEIMREK
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             820      
KIAA03 LQLAISEGCEGFGML
       : .:  :: ..: . 
KIAA00 LLIAAREGQQSFHLS
             2000     




826 residues in 1 query   sequences
1986679 residues in 2037 library sequences
 Scomplib [34.26]
 start: Thu Dec 18 15:16:11 2008 done: Thu Dec 18 15:16:12 2008
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Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]