# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hg00246.fasta.huge -Q ../query/KIAA0315.ptfa ./tmplib.23147 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0315, 1841 aa vs ./tmplib.23147 library 1985664 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.2503+/-0.00546; mu= 24.8866+/- 0.371 mean_var=111.5727+/-27.156, 0's: 0 Z-trim: 12 B-trim: 152 in 1/39 Lambda= 0.121421 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 42, opt: 30, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0620 ( 1985 res) hg04174 (1985) 1967 357.2 2.2e-98 KIAA0407 ( 2143 res) hg01339 (2143) 1671 305.4 9.4e-83 KIAA0463 ( 1963 res) hg00942 (1963) 1128 210.2 3.9e-54 KIAA1550 ( 1462 res) ff03434 (1462) 1114 207.6 1.8e-53 KIAA1206 ( 1912 res) fg04331 (1912) 1005 188.6 1.2e-47 KIAA1739 ( 963 res) pj00464 ( 963) 205 48.0 1.3e-05 KIAA1445 ( 1202 res) fg03469b (1202) 205 48.2 1.4e-05 KIAA1619 ( 869 res) fj14720 ( 869) 186 44.6 0.00012 KIAA1745 ( 893 res) pj01678 ( 893) 165 41.0 0.0016 KIAA1479 ( 1022 res) fh17949 (1022) 151 38.6 0.0091 >>KIAA0620 ( 1985 res) hg04174 (1985 aa) initn: 2140 init1: 725 opt: 1967 Z-score: 1858.1 bits: 357.2 E(): 2.2e-98 Smith-Waterman score: 3340; 34.716% identity (62.212% similar) in 1953 aa overlap (8-1838:93-1978) 10 20 30 KIAA03 RGAMALQLWALTLLGLLGAGASLRPRKLDFFRSEKEL : : ::: ::: :. : : KIAA06 PRAAGGAPLSARAAAASPPPFQTPPRCPVPLLLLLLLGAARAGALEIQRR---FPSPTPT 70 80 90 100 110 40 50 60 70 80 90 KIAA03 NHLAVDEASGVVYLGAVNALYQLD-AKLQLEQQVATGPALDNKKC-TPPIEASQC-HEAE :..:.: :.:.:::.::: ::::. :.:.:: ..:.::. :. : .: . ..: : . 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KIAA06 PLAPVPTGGSQNILVPLANTAFFQGAALECSFGLEEIFEAVWVNESVVRCDQVVLHTTRK 820 830 840 850 860 870 740 750 760 770 780 790 KIAA03 NETLPLHLYVKSY-GKNIDSK--LHVTLYNCSFGRSDCSLCRAANP-DYRCAWCGGQSRC ....:: : .:. .. .:: . : .:::..: ::: : . . . : : : : KIAA06 SQVFPLSLQLKGRPARFLDSPEPMTVMVYNCAMGSPDCSQCLGREDLGHLCMWSDG---C 880 890 900 910 920 930 800 810 820 830 840 KIAA03 VYEA-LCNTTSECPPPVITRIQPETGPLGGGIRITILGSNLGVQAGDIQR-ISVAGRNCS .. : .. :: : : :.: .::: :: .:: : ::: . .:. . . ..: : KIAA06 RLRGPLQPMAGTCPAPEIRAIEPLSGPLDGGTLLTIRGRNLGRRLSDVAHGVWIGGVACE 940 950 960 970 980 990 850 860 870 880 890 900 KIAA03 FQPERYSVSTRIVCVIEAAETPFTGGVEVDVFGKLGRSPPNVQFTFQQPKPLSVEPQQGP :.::.:: .:::: : :..: : :.. .: :.: .:.. : :.:: .:: KIAA06 PLPDRYTVSEEIVCVTGPAPGPLSGVVTVNA-SKEGKSRD--RFSYVLPLVHSLEPTMGP 1000 1010 1020 1030 1040 1050 910 920 930 940 950 960 KIAA03 QAGGTTLTIHGTHLDTGSQEDVRVTLNGVPC-KVTKFGAQLQCVTGPQATRGQMLLEVSY .:::: .::::. : .::. .: :. . :: .. . ... :. : . . . : . 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KIAA06 SCDIQIVSDRIIHCSVNESLGA--------AVGQLP-ITIQVGNFNQTIATLQLGGSETA 1290 1300 1310 1320 1330 1200 1210 1220 1230 1240 1250 KIAA03 VPLSLILPLVIVPMVVVIAVSVYCYWRKSQQAEREYEKIKSQLEGLEESVRDRCKKEFTD . .:... :.. .. :.:. :.: ::..::: ..: :.: .: ..:.. .: :.. KIAA06 IIVSIVICSVLL-LLSVVALFVFC--TKSRRAERYWQKTLLQMEEMESQIREEIRKGFAE 1340 1350 1360 1370 1380 1260 1270 1280 1290 1300 KIAA03 LMIEMEDQTNDVHEA-GIPVLDYKTYTDRVFF------------LPSK----DGDKDVMI :. .: : :...... ::: :.:: .. :.:: :::. .:..... KIAA06 LQTDMTDLTKELNRSQGIPFLEYKHFVTRTFFPKCSSLYEERYVLPSQTLNSQGSSQAQE 1390 1400 1410 1420 1430 1440 1310 1320 1330 1340 1350 KIAA03 T----GKLDIPEPRRPVVEQALYQFSNLLNSKSFLINFIHTLENQREFSARAKVYFASLL : :. ::: :: .:... ::.:::.: ::: :.:.::.:..:..: . .:::: KIAA06 THPLLGEWKIPESCRPNMEEGISLFSSLLNNKHFLIVFVHALEQQKDFAVRDRCSLASLL 1450 1460 1470 1480 1490 1500 1360 1370 1380 1390 1400 1410 KIAA03 TVALHGKLEYYTDIMHTLFLELLEQYVVAKNPKLMLRRSETVVERMLSNWMSICLYQYLK :.::::::::::.::. :...:.. . ::::::::::.:.:::.::.::::::.:. :. KIAA06 TIALHGKLEYYTSIMKELLVDLIDASA-AKNPKLMLRRTESVVEKMLTNWMSICMYSCLR 1510 1520 1530 1540 1550 1560 1420 1430 1440 1450 1460 1470 KIAA03 DSAGEPLYKLFKAIKHQVEKGPVDAVQKKAKYTLNDTGLLGDDVEYAPLTVSVIVQDEGV ...:::.. :. :::.:..:: .::. ::.::::. :: ...: : ...: : :. KIAA06 ETVGEPFFLLLCAIKQQINKGSIDAITGKARYTLNEEWLLRENIEAKPRNLNVSFQGCGM 1570 1580 1590 1600 1610 1620 1480 1490 1500 1510 1520 1530 KIAA03 DAIPVKVLNCDTISQVKEKIIDQVYRGQPCSCWPRPDSVVLEWRPGST-AQILSDLDLTS :.. :.... ::..::::::.. .. : : ::: ..: ::: .:: . :: ::: :: KIAA06 DSLSVRAMDTDTLTQVKEKILEAFCKNVPYSQWPRAEDVDLEWFASSTQSYILRDLDDTS 1630 1640 1650 1660 1670 1680 1540 1550 1560 1570 1580 1590 KIAA03 QREGRWKRVNTLMHYNVRDGATLILSKVGVSQQPEDSQQDLPGERHALLEEENRVWHLVR : :..::: ::.. .::.: .: . ... .:: :.. .::: KIAA06 VVEDGRKKLNTLAHYKIPEGASLAMSLIDKKDNTLGRVKDLDTEKY---------FHLVL 1690 1700 1710 1720 1730 1600 1610 1620 1630 1640 1650 KIAA03 PTDEVDEGKSKRGSVKEKERTKAITEIYLTRLLSVKGTLQQFVDNFFQSVLAPGHAVPP- ::::. : :. : ....: :.. :::::::::.:::::.:.:..:...:. . :: KIAA06 PTDELAEPKK---SHRQSHRKKVLPEIYLTRLLSTKGTLQKFLDDLFKAILSIREDKPPL 1740 1750 1760 1770 1780 1790 1660 1670 1680 1690 1700 1710 KIAA03 AVKYFFDFLDEQAEKHNIQDEDTIHIWKTNSLPLRFWVNILKNPHFIFDVHVHEVVDASL :::::::::.:::::..:.: ::.::::::::::::::::::::.:.::. . .:: : KIAA06 AVKYFFDFLEEQAEKRGISDPDTLHIWKTNSLPLRFWVNILKNPQFVFDIDKTDHIDACL 1800 1810 1820 1830 1840 1850 1720 1730 1740 1750 1760 1770 KIAA03 SVIAQTFMDACTRTEHKLSRDSPSNKLLYAKEISTYKKMVEDYYKGIRQMVQVSDQDMNT :::::.:.:::. .. .:..:::.::::::::: :.:.:. ::: :..:. .:.:.::. 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KIAA04 DACYTREGRAEDGTEVAYIEYDVNSDCAQLPVDTLDAYPCGSDHTPSPMASRVPLEATPI 350 360 370 380 390 400 390 400 410 420 430 440 KIAA03 LQRGGLNLTAVTVAAENNHTVAFLGTSDGRILKVYLTPDGTSSEYDSILVEINKRVKRDL :. :..::::.:. :..::.:::: :.:.. .::: : . . :.. .. .. :.::: KIAA04 LEWPGIQLTAVAVTMEDGHTIAFLGDSQGQLHRVYLGPGSDGHPYSTQSIQQGSAVSRDL 410 420 430 440 450 460 450 460 470 480 490 500 KIAA03 VLSGDLGSLYAMTQDKVFRLPVQECLSYPTCTQCRDSQDPYCGWCVVEGRCTRKAECPRA ...: . ::.:::. ....:: : .. :..: .::::::::. :::.:..:: :. KIAA04 TFDGTFEHLYVMTQSTLLKVPVASCAQHLDCASCLAHRDPYCGWCVLLGRCSRRSECSRG 470 480 490 500 510 520 510 520 530 540 550 560 KIAA03 EEASHWLWSRSK--SCVAVTSAQPQNMSRRAQGEVQLTVSPLPALSEEDELLCLFGESPP . .:::: . .:. :.. .: :.::. :: :.: :: : . : ::: KIAA04 QGPEQWLWSFQPELGCLQVAAMSPANISREETREVFLSVPDLPPLWPGESYSCHFGEHQS 530 540 550 560 570 580 570 580 590 600 610 620 KIAA03 HPARVEGEAVICNSP--SSIPVTPPGQDHVAVTIQLLLRRGNIFLTSYQYPFYDCRQAMS :: . : .:.: :: : :: : : :.:.:... :: : . ... . :::: . KIAA04 -PALLTGSGVMCPSPDPSEAPVLPRGADYVSVSVE--LRFGAVVIAKTSLSFYDCVAVTE 590 600 610 620 630 640 630 640 650 KIAA03 LEENLPCISCVSNRWTCQWDLRYHECRE-------------------------------- :. . : .:::.:: :.: . : : . KIAA04 LRPSAQCQACVSSRWGCNWCVWQHLCTHKASCDAGPMVASHQSPLVSPDPPARGGPSPSP 650 660 670 680 690 700 660 KIAA03 -------ASPNPE----------------------------------DGIVRA------- :.: :. .: . . KIAA04 PTAPKALATPAPDTLPVEPGAPSTATASDISPGASPSLLSPWGPWAGSGSISSPGSTGSP 710 720 730 740 750 760 670 KIAA03 -HMEDSCPQ--------------------------------------------------- : : : :. KIAA04 LHEEPSPPSPQNGPGTAVPAPTDFRPSATPEDLLASPLSPSEVAAVPPADPGPEALHPTV 770 780 790 800 810 820 KIAA03 -------------FLG-------------------------------------------- : : KIAA04 PLDLPPATVPATTFPGAMGSVKPALDWLTREGGELPEADEWTGGDAPAFSTSTLLSGDGD 830 840 850 860 870 880 680 690 700 KIAA03 -------PSPLVIPMNHETDVNFQG--------------KNLDTVKGSSL---HV----- :.::..: . . . . : ...:.::.: :: KIAA04 SAELEGPPAPLILPSSLDYQYDTPGLWELEEATLGASSCPCVESVQGSTLMPVHVEREIR 890 900 910 920 930 940 710 720 730 KIAA03 --GSDLLKFME-P----VTMQESGTFAF-------RTP------------KLSHDA-NET : .: :.. : .:. : . . : .::..: . KIAA04 LLGRNLHLFQDGPGDNECVMELEGLEVVVEARVECEPPPDTQCHVTCQQHQLSYEALQPE 950 960 970 980 990 1000 740 750 760 770 780 790 KIAA03 LPLHLYVKSYGK-NIDSK--LHVTLYNCSFGRSDCSLCRAANPDYRCAWCGGQS-RCVYE : . :... :. .:: :::.::.:: :..::: :..: :.: :.:: :. ::: . 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KIAA04 FGATERRLQRGQFKYTLDPNITSAGPTKSFLSGGREICVRGQNLDVVQTPRIRVTVVSRM 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1030 1040 1050 1060 1070 KIAA03 LQSWQP--------PREAESLQPM-TVVGTDYVFH-NDTKVVFL-SPAVPEEPEAYNLTV :: : :. : :: : . . : :..... .::.: :: . : KIAA04 LQPSQGLGRRRRVVPETACSLGPSCSSQQFEEPCHVNSSQLITCRTPALPGLPEDPWVRV 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1080 1090 1100 1110 1120 KIAA03 LIEMDGHRALLRT-EAGAFEYVPDPTF-----ENFTGGVKKQVNKLIHARGTNLNKAMTL . .:. . : . : : :::. :. : ... .... ..: ::. ::. 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KIAA04 LWRRLNTLQHYKVPDGATVALVPCLTKHVLRENQDYVPGERTPMLEDVDEGGIRPWHLVK 1840 1850 1860 1870 1880 1890 1600 1610 1620 1630 1640 1650 KIAA03 PTDEVDEGKSKRGSVK--EKERTKAITEIYLTRLLSVKGTLQQFVDNFFQSVLAPGHAVP :.:: . . .:::.. :.::.::: :::::::::.:::::.:::..:: .:. .. :: KIAA04 PSDEPEPPRPRRGSLRGGERERAKAIPEIYLTRLLSMKGTLQKFVDDLFQVILSTSRPVP 1900 1910 1920 1930 1940 1950 1660 1670 1680 1690 1700 1710 KIAA03 PAVKYFFDFLDEQAEKHNIQDEDTIHIWKTNSLPLRFWVNILKNPHFIFDVHVHEVVDAS :::::::.:::::..:.:.:.::::::::::::::::.::.:::.:.:::.. . .:: KIAA04 LAVKYFFDLLDEQAQQHGISDQDTIHIWKTNSLPLRFWINIIKNPQFVFDVQTSDNMDAV 1960 1970 1980 1990 2000 2010 1720 1730 1740 1750 1760 1770 KIAA03 LSVIAQTFMDACTRTEHKLSRDSPSNKLLYAKEISTYKKMVEDYYKGIRQMVQVSDQDMN : ::::::::::: ..:::.:::: ::::::..: ::.::: :: ::: : .:::.:: KIAA04 LLVIAQTFMDACTLADHKLGRDSPINKLLYARDIPRYKRMVERYYADIRQTVPASDQEMN 2020 2030 2040 2050 2060 2070 1780 1790 1800 1810 1820 1830 KIAA03 THLAEISRAHTDSLNTLVALHQLYQYTQKYYDEIINALEEDPAAQKMQLAFRLQQIAAAL . :::.: .. .:.. ::::.::.: .::::.::.::::: .::::::..::::::::. KIAA04 SVLAELSWNYSGDLGARVALHELYKYINKYYDQIITALEEDGTAQKMQLGYRLQQIAAAV 2080 2090 2100 2110 2120 2130 1840 KIAA03 ENKVTDL ::::::: KIAA04 ENKVTDL 2140 >>KIAA0463 ( 1963 res) hg00942 (1963 aa) initn: 2251 init1: 718 opt: 1128 Z-score: 1063.8 bits: 210.2 E(): 3.9e-54 Smith-Waterman score: 3321; 33.213% identity (62.725% similar) in 1945 aa overlap (16-1834:96-1959) 10 20 30 40 KIAA03 RGAMALQLWALTLLGLLGAGASLRPRKLDFFRSEKE---LNHLAV ::. :. : ... :.::.. .:::.: KIAA04 APLSMEQRRPWPRALEVDSRSVVLLSVVWVLLAPPAAGMP-QFSTFHSENRDWTFNHLTV 70 80 90 100 110 120 50 60 70 80 90 100 KIAA03 DEASGVVYLGAVNALYQLDAKLQLEQQVATGPALDNKKCTPPIEASQCHEA-EMTDNVNQ ...:.::.::.: .:.: ..: .. ::: :::.: ::. .. : :. .:.:::. 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KIAA04 TLALVSHFDIFYIYGFASGGFVYFLTVQPETPEGVAINSAGDLFYTSRIVRLCKDDPKFH 310 320 330 340 350 360 270 280 290 300 310 KIAA03 SYLEMDLQCRDPDIH----AAAF----GTCLAASVAAPGSGRVLYAVFSRDSRSSGGP-- ::. . . : .. ::. : :: . .. ::.:.::. ... : KIAA04 SYVSLPFGCTRAGVEYRLLQAAYLAKPGDSLAQAFNITSQDDVLFAIFSKGQKQYHHPPD 370 380 390 400 410 420 320 330 340 350 360 370 KIAA03 GAGLCLFPLDKVHAKMEANRNACYTGTREARDIFYKPFHGDIQCGGHAPGSSKSFPCGSE ..:: ::. .. .... ..:: : :. . . :.:: .:: . :: . KIAA04 DSALCAFPIRAINLQIKGRLQSCYQG--EGNLELNWLLGKDVQCT-KAPVPIDDNFCGLD 430 440 450 460 470 380 390 400 410 420 KIAA03 HLPYPLGSRDGLRGTAVLQRGGLNLTAVTVAAENNHTVAFLGTSDGRILKVYLT-PDGTS . :::. ..: .. . .:.:. . :...:.:.::..:.. :. : . KIAA04 -INQPLGGSTPVEGLTLYTTSRDRMTSVASYVYNGYSVVFVGTKSGKLKKIRADGPPHGG 480 490 500 510 520 530 430 440 450 460 470 480 KIAA03 SEYDSILV-EINKRVKRDLVLSGDLGSLYAMTQDKVFRLPVQECLSYPTCTQCRDSQDPY .:. . : . .. . ::...: : ::.:.. .: :.::. : .: :: .: .: ::. KIAA04 VQYEMVSVLKDGSPILRDMAFSIDQRYLYVMSERQVTRVPVESCEQYTTCGECLSSGDPH 540 550 560 570 580 590 490 500 510 520 530 540 KIAA03 CGWCVVEGRCTRKAECPRAEEASHWLWSRSKSCVAVTSAQPQNMSRRAQGEV-QLTVSPL ::::.... :.:. .: .: : ... : :. ::.. ...:...: .... .:.:: KIAA04 CGWCALHNMCSRRDKCQQAWEPNRFAASISQ-CVSL-AVHPSSISVSEHSRLLSLVVSDA 600 610 620 630 640 650 550 560 570 580 590 600 KIAA03 PALSEEDELLCLFGESPPHPARVEGEAVICNSPS--SIPVTPPGQDHVAVTIQLLLRR-G : :: . : ::. ..: : ::: ::. ..:: : :: .. .:: .. : KIAA04 PDLSAG--IACAFGNLTEVEGQVSGSQVICISPGPKDVPVIPLDQDWFGLELQLRSKETG 660 670 680 690 700 710 610 620 630 640 650 660 KIAA03 NIFLTSYQYPFYDCRQAMSLEENLPCISCVSNRWTCQWDLRYHECREASPNP---EDGIV .::... .. ::.: .: .: :.:::.. . :.: . : . .:. ..: KIAA04 KIFVST-EFKFYNC-SAHQL-----CLSCVNSAFRCHWCKYRNLCTH-DPTTCSFQEG-- 720 730 740 750 760 670 680 690 700 710 KIAA03 RAHMEDSCPQFLGPSPLVIPMNHETDVNFQGKNLDTVKGSS------LHVGSDLLKFMEP : .. ..:::.. ..::... ......:: .... :.. . . . : KIAA04 RINISEDCPQLVPTEEILIPVGEVKPITLKARNLPQPQSGQRGYECVLNIQGAIHRV--P 770 780 790 800 810 820 720 730 740 750 760 770 KIAA03 VTMQESGTFAFRTPKLSHDANETLPLHL-YVKSYGKN--IDSK--LHVTLYNCSFGRSDC . .:.. .. . ..:. . : . .. .. : ::. :.: ::.:. : .: KIAA04 ALRFNSSSVQCQNSSYQYDGMDISNLAVDFAVVWNGNFIIDNPQDLKVHLYKCAAQRESC 830 840 850 860 870 880 780 790 800 810 KIAA03 SLCRAANPDYRCAWCGGQSRCVYEALCNTTS-----------ECPPPVITRIQPETGPLG .:: :. ..:.::.:. ::. . :.. : .: : ::.: .:: KIAA04 GLCLKADRKFECGWCSGERRCTLHQHCTSPSSPWLDWSSHNVKCSNPQITEILTVSGPPE 890 900 910 920 930 940 820 830 840 850 860 870 KIAA03 GGIRITILGSNLGVQAGDI-QRISVAGRNCSFQPERYSVSTRIVCVIEAAETPFTGGVEV :: :.:: : :::.. ..: ....::: :. : .: .. .::: . : . :.: KIAA04 GGTRVTIHGVNLGLDFSEIAHHVQVAGVPCTPLPGEYIIAEQIVCEMGHALVGTTSG--- 950 960 970 980 990 880 890 900 910 920 930 KIAA03 DVFGKLGRSPPNV------QFTFQQPKPLSVEPQQGPQAGGTTLTIHGTHLDTGSQEDVR : .:. :. :.:: .:. ::..: .::..::: .:: : .: .:: .: KIAA04 PVRLCIGECKPEFMTKSHQQYTFVNPSVLSLNPIRGPESGGTMVTITGHYLGAGS--SVA 1000 1010 1020 1030 1040 1050 940 950 960 970 980 990 KIAA03 VTLNGVPCKVT-KFGAQLQCVTGPQATR-GQMLLEVSYGGSPVPNPGIFFTYRENPVLRA : :.. :. . ... ::. :... : . . :: . : . .. : : ..: .. 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KIAA04 NLTGQHK-------------VMVHVGGMVFSPGSV---SVISDSLLTLPAIVSIAAGGSL 1280 1290 1300 1310 1220 1230 1240 1250 1260 1270 KIAA03 MVVVIAVSVYCYWRKSQQAEREYEKIKSQLEGLEESVRDRCKKEFTDLMIEMEDQTNDVH ..... . . : :::.. . .... :...:: : .::. :..:. .... :.:. KIAA04 LLIIVIIVLIAYKRKSRENDLTLKRLQMQMDNLESRVALECKEAFAELQTDINELTSDLD 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1280 1290 1300 1310 1320 1330 KIAA03 EAGIPVLDYKTYTDRVFFLPSKDGDKDVMITGKLDIPEPRRPVVEQALYQFSNLLNSKSF ..::: :::.::. ::.: : : .: . .:.. . ::.:: :..:.:.: : KIAA04 RSGIPYLDYRTYAMRVLF-P---GIEDHPVLRELEVQGNGQQHVEKALKLFAQLINNKVF 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1340 1350 1360 1370 1380 1390 KIAA03 LINFIHTLENQREFSARAKVYFASLLTVALHGKLEYYTDIMHTLFLELLEQYVVAKN-PK :..::.::: :: :: : . :::. ..:.:.::: ::... :. .:... . :: :: KIAA04 LLTFIRTLELQRSFSMRDRGNVASLIMTGLQGRLEYATDVLKQLLSDLIDKNLENKNHPK 1440 1450 1460 1470 1480 1490 1400 1410 1420 1430 1440 1450 KIAA03 LMLRRSETVVERMLSNWMSICLYQYLKDSAGEPLYKLFKAIKHQVEKGPVDAVQKKAKYT :.:::.:.:.:.::.::... :...::. :::::. :. :::.:.::::.::. .:.:. KIAA04 LLLRRTESVAEKMLTNWFAFLLHKFLKECAGEPLFMLYCAIKQQMEKGPIDAITGEARYS 1500 1510 1520 1530 1540 1550 1460 1470 1480 1490 1500 KIAA03 LNDTGLLGDDVEYAPLTVSVIVQD-EGVDAIPVKVLNCDTISQVKEKIIDQVYRGQPCSC :.. :. ...:: : .. . : :. :::::::::::.::::::.: ::.. : : KIAA04 LSEDKLIRQQIEYKTLILNCVNPDNENSPEIPVKVLNCDTITQVKEKILDAVYKNVPYSQ 1560 1570 1580 1590 1600 1610 1510 1520 1530 1540 1550 1560 KIAA03 WPRPDSVVLEWRPGSTAQI-LSDLDLTSQREGRWKRVNTLMHYNVRDGATLIL------- :: .. :::: : :.. :.: :.:.. :: :::.::::::.: : ... : KIAA04 RPRAVDMDLEWRQGRIARVVLQDEDITTKIEGDWKRLNTLMHYQVSDRSVVALVPKQTSS 1620 1630 1640 1650 1660 1670 1570 1580 1590 1600 KIAA03 ---------SKVGVSQQPEDSQQDLPGERHAL----------LEEENRVWHLVRPTDEVD :....:. ::. : .: :: .:::::. :. : KIAA04 YNIPASASISRTSISRY--DSSFRYTGSPDSLRSRAPMITPDLESGVKVWHLVKNHDHGD 1680 1690 1700 1710 1720 1730 1610 1620 1630 1640 1650 KIAA03 EGKSKRGSVKEKERTKAITEIYLTRLLSVKGTLQQFVDNFFQSVLAP---GHAVPPAVKY . .. ::: : ..::::::::..:::::.:::..:..... : :.: :.:: KIAA04 QKEGDRGS-------KMVSEIYLTRLLATKGTLQKFVDDLFETLFSTVHRGSALPLAIKY 1740 1750 1760 1770 1780 1660 1670 1680 1690 1700 1710 KIAA03 FFDFLDEQAEKHNIQDEDTIHIWKTNSLPLRFWVNILKNPHFIFDVHVHEVVDASLSVIA .::::::::..:.:.: :. : ::.: ::::::::..:::.:.::.: ..:: :::.: KIAA04 MFDFLDEQADRHSIHDTDVRHTWKSNCLPLRFWVNVIKNPQFVFDIHKGSITDACLSVVA 1790 1800 1810 1820 1830 1840 1720 1730 1740 1750 1760 1770 KIAA03 QTFMDACTRTEHKLSRDSPSNKLLYAKEISTYKKMVEDYYKGIRQMVQVSDQDMNTHLAE :::::.:. .::.:..:::::::::::.: .::. :: :: : .. .::::::..::: KIAA04 QTFMDSCSTSEHRLGKDSPSNKLLYAKDIPSYKSWVERYYADIAKLPAISDQDMNAYLAE 1850 1860 1870 1880 1890 1900 1780 1790 1800 1810 1820 1830 KIAA03 ISRAHTDSLNTLVALHQLYQYTQKYYDEIINALEEDPAAQKMQLAFRLQQIAAALENKVT :: :. .: : ::...:.:..:: .:.:.:::.: :....::....:. :. KIAA04 QSRLHAVEFNMLSALNEIYSYVSKYSEELIGALEQDEQARRQRLAYKVEQLINAMSIES 1910 1920 1930 1940 1950 1960 1840 KIAA03 DL >>KIAA1550 ( 1462 res) ff03434 (1462 aa) initn: 1948 init1: 701 opt: 1114 Z-score: 1051.8 bits: 207.6 E(): 1.8e-53 Smith-Waterman score: 2852; 35.306% identity (64.366% similar) in 1521 aa overlap (396-1830:1-1454) 370 380 390 400 410 420 KIAA03 PCGSEHLPYPLGSRDGLRGTAVLQRGGLNLTAVTVAAENNHTVAFLGTSDGRILKVYLT- :.: . . .::..::.::..:.. :. . KIAA15 TSVIAYVYKNHSLAFVGTKSGKLKKIRVDG 10 20 30 430 440 450 460 470 480 KIAA03 PDGTSSEYDSILVEINKRVKRDLVLSGDLGSLYAMTQDKVFRLPVQECLSYPTCTQCRDS : :.. .:... : : ::...: : .:: :.. .. :.::. : .: .: .: : KIAA15 PRGNALQYETVQVVDPGPVLRDMAFSKDHEQLYIMSERQLTRVPVESCGQYQSCGECLGS 40 50 60 70 80 90 490 500 510 520 530 540 KIAA03 QDPYCGWCVVEGRCTRKAECPRAEEASHWLWSRSKSCVAVTSAQPQNMSRRAQGEVQLTV ::.:::::... :::: .: :..: .. :. :.:: .: ..:.:.: .: .: :.. KIAA15 GDPHCGWCVLHNTCTRKERCERSKEPRRFA-SEMKQCVRLT-VHPNNISV-SQYNVLLVL 100 110 120 130 140 550 560 570 580 590 KIAA03 SP--LPALSEEDELLCLFGESPPHPARVEGEAVICNSPSS--IP--VTPPGQDHVAVTIQ .: :: . : : . . : :. . : ::.. .: .: : :: .: .: KIAA15 ETYNVPELSAG--VNCTFEDLSEMDGLVVGNQIQCYSPAAKEVPRIITENG-DHHVVQLQ 150 160 170 180 190 200 600 610 620 630 640 650 KIAA03 LLLRRGNIFLTSYQYPFYDCRQAMSLEENLPCISCVSNRWTCQWDLRYHECREASPNP-- : .. .. ..: .. ::.: : :.::: . . :.: : : . .:. KIAA15 LKSKETGMTFASTSFVFYNCSVHNS------CLSCVESPYRCHWCKYRHVCTH-DPKTCS 210 220 230 240 250 660 670 680 690 700 710 KIAA03 -EDGIVRAHMEDSCPQFLGPSPLVIPMNHETDVNFQGKNLDTVKGSSLHVGSDLLKFME- ..: :... ..:::.: . ...:.. .....::: . .: . : . . .. KIAA15 FQEG--RVKLPEDCPQLLRVDKILVPVEVIKPITLKAKNLP--QPQSGQRGYECILNIQG 260 270 280 290 300 310 720 730 740 750 760 KIAA03 -----PVTMQESGTFAFRTPKLSHDANE--TLPLHLYVKSYGK-NIDSKLH--VTLYNCS :. .:.. .. . :... : .::..: : :. :::. . : ::.:. KIAA15 SEQRVPALRFNSSSVQCQNTSYSYEGMEINNLPVELTVVWNGHFNIDNPAQNKVHLYKCG 320 330 340 350 360 370 770 780 790 800 810 KIAA03 FGRSDCSLCRAANPDYRCAWCGGQSRCVYEALC-----------NTTSECPPPVITRIQP : .:.:: :.::. :.:: : ..:. . : .. :.: : ::.: : KIAA15 AMRESCGLCLKADPDFACGWCQGPGQCTLRQHCPAQESQWLELSGAKSKCTNPRITEIIP 380 390 400 410 420 430 820 830 840 850 860 870 KIAA03 ETGPLGGGIRITILGSNLGVQAGDI-QRISVAGRNCSFQPERYSVSTRIVCVI-EAAETP ::: :: ..:: : :::.. :: ....::: .:: . : . .::: . :: . KIAA15 VTGPREGGTKVTIRGENLGLEFRDIASHVKVAGVECSPLVDGYIPAEQIVCEMGEAKPSQ 440 450 460 470 480 490 880 890 900 910 920 KIAA03 FTGGVEVDV-FGKLGRSPPNVQFTFQQPKPLS-VEPQQGPQAGGTTLTIHGTHLDTGSQE .: ::. : . . :. . . :: ..:..::..::: .:: ::.:..:: KIAA15 HAGFVEICVAVCRPEFMARSSQLYYFMTLTLSDLKPSRGPMSGGTQVTITGTNLNAGS-- 500 510 520 530 540 550 930 940 950 960 970 980 KIAA03 DVRVTLNGVPCKVTKFG-AQLQCVTGPQATRGQMLLEVSYGGSPVPNPGIFFTYRENPVL .: : .. :: . . . . : : . .: . :. . . . . : : :.:.. KIAA15 NVVVMFGKQPCLFHRRSPSYIVCNTTSSDEVLEMKVSVQVDRAKI-HQDLVFQYVEDPTI 560 570 580 590 600 610 990 1000 1010 1020 1030 KIAA03 RAFEPLRSFASGGRSINVTGQGFSLIQRFAM---------VVIAEPLQSWQPPREAESLQ .:: :..::. : : : ..::: . . : : :.. : KIAA15 VRIEPEWSIVSGNTPIAVWGTHLDLIQNPQIRAKHGGKEHINICEVLNA----TEMTCQA 620 630 640 650 660 1040 1050 1060 1070 1080 1090 KIAA03 PMTVVGTDYVFHNDTKVVFLSPAVPEEPEAYNLTVLIEMDGHRALLRTEAGAFEYVPDPT : ..: :. ..: . :.:: ... .:. ..:: . : : :.:. KIAA15 PALALGPDH--QSD---------LTERPEEFGFI----LDNVQSLLILNKTNFTYYPNPV 670 680 690 700 710 1100 1110 1120 1130 1140 1150 KIAA03 FENF--TGGVKKQVNKLIHARGTNLNKAMTLQEAE----AFVGAERCTMKTLTETDLYCE :: : .: .. . . : .: :: .. ... ..:: . ::. :.....: :: KIAA15 FEAFGPSGILELKPGTPIILKGKNLIPPVAGGNVKLNYTVLVGEKPCTV-TVSDVQLLCE 720 730 740 750 760 770 1160 1170 1180 1190 1200 1210 KIAA03 PPEVQPPPKRRQKRDTTHNLPEFIVKFGSREWVLGRVEYDTRVSDVPLSL--ILPLVIVP :.. :.: ... :. :. : : . : :::: :. .... KIAA15 SPNLIG----RHK---------VMARVGGMEYSPGMVYI---APDSPLSLPAIVSIAVAG 780 790 800 810 1220 1230 1240 1250 1260 KIAA03 --MVVVIAVSVYCYWRKSQQAEREYEKIKSQLEGLEESVRDRCKKEFTDLMIEMEDQTND ... :.. . : :::.... .... :...:: : .::. :..:. .... :.: KIAA15 GLLIIFIVAVLIAYKRKSRESDLTLKRLQMQMDNLESRVALECKEAFAELQTDIHELTSD 820 830 840 850 860 870 1270 1280 1290 1300 1310 1320 KIAA03 VHEAGIPVLDYKTYTDRVFFLPSKDGDKDVMITGKLDIPEPRRPVVEQALYQFSNLLNSK . :::: :::.::: ::.: : : .: . :..: :. ::..: :..:.:.: KIAA15 LDGAGIPFLDYRTYTMRVLF-P---GIEDHPVLRDLEVPGYRQERVEKGLKLFAQLINNK 880 890 900 910 920 930 1330 1340 1350 1360 1370 1380 KIAA03 SFLINFIHTLENQREFSARAKVYFASLLTVALHGKLEYYTDIMHTLFLELLEQYVVAKN- ::..::.:::.:: :: : . :::. ..:..:::: ::... :. .:... . .:: KIAA15 VFLLSFIRTLESQRSFSMRDRGNVASLIMTVLQSKLEYATDVLKQLLADLIDKNLESKNH 940 950 960 970 980 990 1390 1400 1410 1420 1430 1440 KIAA03 PKLMLRRSETVVERMLSNWMSICLYQYLKDSAGEPLYKLFKAIKHQVEKGPVDAVQKKAK :::.:::.:.:.:.::.::... ::..::. :::::..:: :::.:.::::.::. .:. KIAA15 PKLLLRRTESVAEKMLTNWFTFLLYKFLKECAGEPLFSLFCAIKQQMEKGPIDAITGEAR 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1450 1460 1470 1480 1490 1500 KIAA03 YTLNDTGLLGDDVEYAPLTVSVIVQDEGVDA-IPVKVLNCDTISQVKEKIIDQVYRGQPC :.:.. :. ....: :..: . :.. . .:::.::::::.::::::.: .... :: KIAA15 YSLSEDKLIRQQIDYKTLVLSCVSPDNANSPEVPVKILNCDTITQVKEKILDAIFKNVPC 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1510 1520 1530 1540 1550 1560 KIAA03 SCWPRPDSVVLEWRPGSTAQ-ILSDLDLTSQREGRWKRVNTLMHYNVRDGATLIL-SK-- : :. .. :::: :: :. ::.: :.:.. :. :::.::: ::.: ::... : :: KIAA15 SHRPKAADMDLEWRQGSGARMILQDEDITTKIENDWKRLNTLAHYQVPDGSVVALVSKQV 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1570 1580 1590 1600 KIAA03 --------VGVSQQPEDSQQDL---PGERHAL----------LEEENRVWHLVRPTDEVD ::. .. ... : .: :: ..::::. .. : KIAA15 TAYNAVNNSTVSRTSASKYENMIRYTGSPDSLRSRTPMITPDLESGVKMWHLVKNHEHGD 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1610 1620 1630 1640 1650 KIAA03 EGKSKRGSVKEKERTKAITEIYLTRLLSVKGTLQQFVDNFFQSVLAPGH---AVPPAVKY . .. ::: : ..::::::::..:::::.:::..:..... .: :.: :.:: KIAA15 QKEGDRGS-------KMVSEIYLTRLLATKGTLQKFVDDLFETIFSTAHRGSALPLAIKY 1240 1250 1260 1270 1280 1660 1670 1680 1690 1700 1710 KIAA03 FFDFLDEQAEKHNIQDEDTIHIWKTNSLPLRFWVNILKNPHFIFDVHVHEVVDASLSVIA .::::::::.::.:.: . : ::.: ::::::::..:::.:.::.: . ..:: :::.: KIAA15 MFDFLDEQADKHGIHDPHVRHTWKSNCLPLRFWVNMIKNPQFVFDIHKNSITDACLSVVA 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1720 1730 1740 1750 1760 1770 KIAA03 QTFMDACTRTEHKLSRDSPSNKLLYAKEISTYKKMVEDYYKGIRQMVQVSDQDMNTHLAE :::::.:. .::.:..:::::::::::.: .::. :: ::. : .: .::::::..::: KIAA15 QTFMDSCSTSEHRLGKDSPSNKLLYAKDIPSYKNWVERYYSDIGKMPAISDQDMNAYLAE 1350 1360 1370 1380 1390 1400 1780 1790 1800 1810 1820 1830 KIAA03 ISRAHTDSLNTLVALHQLYQYTQKYYDEIINALEEDPAAQKMQLAFRLQQIAAALENKVT :: : . .::. :: ....:. :: .::.. :..: :..::..:.:. KIAA15 QSRMHMNEFNTMSALSEIFSYVGKYSEEILGPLDHDDQCGKQKLAYKLEQVITLMSLDS 1410 1420 1430 1440 1450 1460 1840 KIAA03 DL >>KIAA1206 ( 1912 res) fg04331 (1912 aa) initn: 3090 init1: 948 opt: 1005 Z-score: 947.5 bits: 188.6 E(): 1.2e-47 Smith-Waterman score: 4277; 40.821% identity (66.334% similar) in 1901 aa overlap (37-1841:57-1912) 10 20 30 40 50 60 KIAA03 QLWALTLLGLLGAGASLRPRKLDFFRSEKELNHLAVDEASGVVYLGAVNALYQLDAKLQL :::::. . :..:.:::: :.::. .::: KIAA12 PFGLCLLLLLLSPPPLPLTGAHRFSAPNTTLNHLALAPGRGTLYVGAVNRLFQLSPELQL 30 40 50 60 70 80 70 80 90 100 110 120 KIAA03 EQQVATGPALDNKKCTPPIEASQCHEAEMTDNVNQLLLLDPPRKRLVECGSLFKGICALR : ..:::..:. :.: . ..: .:..:::.:::::.. ..:: ::.. .:.: : KIAA12 EAVAVTGPVIDSPDCVPFRDPAECPQAQLTDNANQLLLVSSRAQELVACGQVRQGVCETR 90 100 110 120 130 140 130 140 150 160 170 180 KIAA03 ALSNISLRLFYEDGSGEKSFVASNDEGVATVGLVSSTGPGGDRVLFVGKG-NGPHDNGII :.... :. . :. .:::.: :::::::: :: : .:.:..: : . : KIAA12 RLGDVAEVLYQAEDPGDGQFVAANTPGVATVGLVVPL-PGRD-LLLVARGLAGKLSAG-- 150 160 170 180 190 200 190 200 210 220 230 240 KIAA03 VSTRLLDRTDSREAFEAYTDHATYKAGYLSTNTQQFVAAFEDGPYVFFVFNQQD-KHPAR : . . . . : . . .: .: ....:.:: :. ..::: .. . :. KIAA12 VPPLAIRQLAGSQPFSS-EGLGRLVVGDFSDYNNSYVGAFADARSAYFVFRRRGARAQAE 210 220 230 240 250 260 250 260 270 280 290 300 KIAA03 NRTLLARMCREDPNYYSYLEMDLQCRDPDIHAAAFGTCLAASVAAPGSGRVLYAVFSRDS :. .::.: : : :::.:. : :. . ::: :::. : .::. KIAA12 YRSYVARVCLGDTNLYSYVEVPLACQGQGLIQAAF--------LAPGT---LLGVFAAGP 270 280 290 300 310 310 320 330 340 350 360 KIAA03 RSSGGPGAGLCLFPLDKVHAKMEANRNACYT-GTREARDIFYKPFHGDI--QCGGHAPGS : : :.:: ::. .. :.:: : ::: : : . . .: : KIAA12 R---GTQAALCAFPMVELGASMEQARRLCYTAGGRGPSGAEEATVEYGVTSRCVTLPLDS 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 KIAA03 SKSFPCGSEHLPYPLGSRDGLRGTAVLQRGGLNLTAVTVAAENNHTVAFLGTSDGRILKV .:.:::.:: : :...:. :. .:. : ..::.. ..: .:::: ..:.. :: KIAA12 PESYPCGDEHTPSPIAGRQPLEVQPLLKLGQ-PVSAVAALQADGHMIAFLGDTQGQLYKV 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 KIAA03 YLTPDGTSSE-YDSILV-EINKRVKRDLVLSGDLGSLYAMTQDKVFRLPVQECLSYPTCT .: :.... : : : .. .. ::.:... . ::..: .: :.:: : ..: :. KIAA12 FL--HGSQGQVYHSQQVGPPGSAISPDLLLDSSGSHLYVLTAHQVDRIPVAACPQFPDCA 430 440 450 460 470 480 480 490 500 510 520 530 KIAA03 QCRDSQDPYCGWCVVEGRCTRKAECPRAEEASHWLWSRSKS--CVAVTSAQPQNMSRRAQ .: ..::: :::::..::::::..: :: . ..:::: .. :. . : : . :. : KIAA12 SCLQAQDPLCGWCVLQGRCTRKGQCGRAGQLNQWLWSYEEDSHCLHIQSLLPGHHPRQEQ 490 500 510 520 530 540 540 550 560 570 580 590 KIAA03 GEVQLTVSPLPALSEEDELLCLFGESPPHPARVEGEAVICNSP--SSIPVTPPGQDHVAV :.: :.: :: :. .. . : ::. :.::: : : .: ...:..::: :::.: KIAA12 GQVTLSVPRLPILDADEYFHCAFGDYDSL-AHVEGPHVACVTPPQDQVPLNPPGTDHVTV 550 560 570 580 590 600 600 610 620 630 640 650 KIAA03 TIQLLLRRGNIFLTSYQYPFYDCRQAMSLEENLPCISCVSNRWTCQWDLRYHECR--EAS . :... .. ... .. :::: ...:: :: .::.. : :.: . .: : KIAA12 PLALMFE--DVTVAATNFSFYDCSAVQALEAAAPCRACVGSIWRCHWCPQSSHCVYGEHC 610 620 630 640 650 660 660 670 680 690 700 KIAA03 PNPEDGIVRAHMED-------SCPQFLG-PSPLVIPMNHETDVNFQGKNLDTVKG--SSL :. : : :. : .::: : .: ..:.. :. . .. .::. .: .:. KIAA12 PEGERTIYSAQEVDIQVRGPGACPQVEGLAGPHLVPVGWESHLALRVRNLQHFRGLPASF 670 680 690 700 710 720 710 720 730 740 750 KIAA03 HVGSDLLKFME--PVTMQE----SGTFAFRTPKLSHDANET-LPLHLYV-KSYGKNIDSK : .: .. :.:..: :: . .. .. . .. ::. .:: .. .. .:. KIAA12 HCWLELPGELRGLPATLEETAGDSGLIHCQAHQFYPSMSQRELPVPIYVTQGEAQRLDNT 730 740 750 760 770 780 760 770 780 790 800 KIAA03 --LHVTLYNCSFGRSDCSLCRAANPDYRCAWCG-GQSRCVYEALCNTTSE---CPPPVIT :.: ::.:..:. ::: :.::: . : ::. :: : : :: . :: : : KIAA12 HALYVILYDCAMGHPDCSHCQAANRSLGCLWCADGQPACRYGPLCPPGAVELLCPAPSID 790 800 810 820 830 840 810 820 830 840 850 860 KIAA03 RIQPETGPLGGGIRITILGSNLGVQAGDIQR-ISVAGRNCSFQPERYSVSTRIVCVIEAA ..: ::: ::. .:::::::: .:.: .:::.: :. .: : .:.::::: : KIAA12 AVEPLTGPPEGGLALTILGSNLGRAFADVQYAVSVASRPCNPEPSLYRTSARIVCVTSPA 850 860 870 880 890 900 870 880 890 900 910 920 KIAA03 ETPFTGGVEVDVFGKLGRSPPNV---QFTFQQPKPLSVEPQQGPQAGGTTLTIHGTHLDT . :: :.: . .. ::.. .::.:.: ::. :. ::::::: :::.: ::.: KIAA12 PNGTTGPVRVAIKSQ----PPGISSQHFTYQDPVLLSLSPRWGPQAGGTQLTIRGQHLQT 910 920 930 940 950 930 940 950 960 970 980 KIAA03 GSQEDVRVTLNGVPCKVTK--FGAQLQCVTGPQATRGQMLLEVSYGGSPVPNPGIFFTYR :.. .. : .: :: . . . : : :::. :. . : .: . . : : KIAA12 GGNTSAFV--GGQPCPILEPVCPEAIVCRTRPQAAPGEAAVLVVFGHAQRTLLASPFRYT 960 970 980 990 1000 1010 990 1000 1010 1020 1030 KIAA03 ENPVLRAFEPLRSFASGGRSINVTGQGFSLIQRFAMVVI-----------AEPLQSWQPP :: : : :: :: .::: : : : :....:: . : :.: :. :: KIAA12 ANPQLVAAEPSASFRGGGRLIRVRGTGLDVVQRPLLSVWLEADAEVQASRAQP-QDPQPR 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1040 1050 1060 1070 1080 KIAA03 RE--AESLQPMTVVGT-------DYVFHNDTKVVFL--SPAVPEEPEAYNLTVLIEMDGH : : . .:.. . . : ... ..: :::::. .:. :.. .:. KIAA12 RSCGAPAADPQACIQLGGGLLQCSTVCSVNSSSLLLCRSPAVPD--RAHPQRVFFTLDNV 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1090 1100 1110 1120 1130 KIAA03 RALLRTEAGA--FEYVPDPTFENFT--GGVKK---QVNKLIHARGTNLNKAMTLQEAEAF .. . . .:. : : :.: . .. : .. . .... ..: .:: ... .:... KIAA12 QVDFASASGGQGFLYQPNPRLAPLSREGPARPYRLKPGHVLDVEGEGLNLGISKEEVRVH 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1140 1150 1160 1170 1180 1190 KIAA03 VGAERCTMKTLTETDLYCEPPEVQPPPKRRQKRDTTHNLPEFIVKFGSREWVLGRVEYDT .: .: .::::.: :::::: : : . .::.:.:..:. . .:: :.:.. KIAA12 IGRGECLVKTLTRTHLYCEPPAHAPQPA------NGSGLPQFVVQMGNVQLALGPVQYEA 1200 1210 1220 1230 1240 1200 1210 1220 1230 1240 1250 KIAA03 R--VSDVPLSLILPLVIVPMVVVIAVSVYC--YWRKSQQAEREYEKIKSQLEGLEESVRD . .: :. . . :.. :: . : .::.:: :.:.:. :::.:: .: : KIAA12 EPPLSAFPVEAQAGVGMGAAVLIAAVLLLTLMYRHKSKQALRDYQKVLVQLESLETGVGD 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1260 1270 1280 1290 1300 KIAA03 RCKKEFTDLMIEMEDQTNDVHEAGIPVLDYKTYTDRVFFLPSKDGDKDVMITGKLDIP-- .:.::::::: :: : ..:.. .::: :::.::..:.:: :.. : . : . : KIAA12 QCRKEFTDLMTEMTDLSSDLEGSGIPFLDYRTYAERAFF-PGHGG---CPLQPKPEGPGE 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1310 1320 1330 1340 1350 1360 KIAA03 EPRRPVVEQALYQFSNLLNSKSFLINFIHTLENQREFSARAKVYFASLLTVALHGKLEYY . . .:.:.: :.::::::: ::...:::::.: :: : . . ::::..:::::::: KIAA12 DGHCATVRQGLTQLSNLLNSKLFLLTLIHTLEEQPSFSQRDRCHVASLLSLALHGKLEYL 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1370 1380 1390 1400 1410 1420 KIAA03 TDIMHTLFLELLEQYVVAKNPKLMLRRSETVVERMLSNWMSICLYQYLKDSAGEPLYKLF ::::.::. .: .:: .::::::::.::.::..:.::.::::: .:.. :::::: :: KIAA12 TDIMRTLLGDLAAHYV-HRNPKLMLRRTETMVEKLLTNWLSICLYAFLREVAGEPLYMLF 1430 1440 1450 1460 1470 1480 1430 1440 1450 1460 1470 1480 KIAA03 KAIKHQVEKGPVDAVQKKAKYTLNDTGLLGDDVEYAPLTVSVIVQDEGVDA--------I .::..::.::::::: ::: ::::. :: .:::. :::. :.: . : . KIAA12 RAIQYQVDKGPVDAVTGKAKRTLNDSRLLREDVEFQPLTLMVLVGPGAGGAAGSSEMQRV 1490 1500 1510 1520 1530 1540 1490 1500 1510 1520 1530 KIAA03 PVKVLNCDTISQVKEKIIDQVYRGQPCSCWPRPDSVVLEWRPGSTAQI-LSDLDLTSQRE :..::. :::.:::::..::::.: : : : .. :::: : .... ::: :::: . KIAA12 PARVLDTDTITQVKEKVLDQVYKGTPFSQRPSVHALDLEWRSGLAGHLTLSDEDLTSVTQ 1550 1560 1570 1580 1590 1600 1540 1550 1560 1570 1580 1590 KIAA03 GRWKRVNTLMHYNVRDGATL-ILSKVGVSQQPEDS-QQDLP-GERHALLE--EENRV--W ..:::.:::.::.: ::::. .. .. .. .: : : :: :: ::. : : KIAA12 NHWKRLNTLQHYKVPDGATVGLVPQLHRGSTISQSLAQRCPLGENIPTLEDGEEGGVCLW 1610 1620 1630 1640 1650 1660 1600 1610 1620 1630 1640 1650 KIAA03 HLVRPTDEVDEGKSKRGSVKEKE--RTKAITEIYLTRLLSVKGTLQQFVDNFFQSVLAPG :::. :.: . .: . .:..:.: :.::: :::::::::.:::::.:::. ::..:. . KIAA12 HLVKATEEPEGAKVRCSSLREREPARAKAIPEIYLTRLLSMKGTLQKFVDDTFQAILSVN 1670 1680 1690 1700 1710 1720 1660 1670 1680 1690 1700 1710 KIAA03 HAVPPAVKYFFDFLDEQAEKHNIQDEDTIHIWKTNSLPLRFWVNILKNPHFIFDVHVHEV . .: ::::.::.::: ::::.:.: :.:::::::: :::::: ::::..::::.: . KIAA12 RPIPIAVKYLFDLLDELAEKHGIEDPGTLHIWKTNSLLLRFWVNALKNPQLIFDVRVSDN 1730 1740 1750 1760 1770 1780 1720 1730 1740 1750 1760 1770 KIAA03 VDASLSVIAQTFMDACTRTEHKLSRDSPSNKLLYAKEISTYKKMVEDYYKGIRQMVQVSD ::: :.::::::.:.:: .:::..:::: ::::::.:: ::.::: :: ::: .: KIAA12 VDAILAVIAQTFIDSCTTSEHKVGRDSPVNKLLYAREIPRYKQMVERYYADIRQSSPASY 1790 1800 1810 1820 1830 1840 1780 1790 1800 1810 1820 1830 KIAA03 QDMNTHLAEISRAHTDSLNTLVALHQLYQYTQKYYDEIINALEEDPAAQKMQLAFRLQQI :.::. :::.: .:.. . : ::..::.. ..:::.::.::::::..::.::: ::::. KIAA12 QEMNSALAELSGNYTSAPHCLEALQELYNHIHRYYDQIISALEEDPVGQKLQLACRLQQV 1850 1860 1870 1880 1890 1900 1840 KIAA03 AAALENKVTDL :: .::::::: KIAA12 AALVENKVTDL 1910 >>KIAA1739 ( 963 res) pj00464 (963 aa) initn: 258 init1: 173 opt: 205 Z-score: 192.9 bits: 48.0 E(): 1.3e-05 Smith-Waterman score: 284; 24.346% identity (53.320% similar) in 497 aa overlap (40-498:186-656) 10 20 30 40 50 60 KIAA03 ALTLLGLLGAGASLRPRKLDFFRSEKELNHLAVDEASGVVYLGAVNALYQLDAKLQLEQQ :.. : .:..:.:: .::. .. . :: : KIAA17 SCPSAAMLTPAELATVVRRFSQTGIQDFLTLTLTEPTGLLYVGAREALFAFSME-ALELQ 160 170 180 190 200 210 70 80 90 100 110 120 KIAA03 VATGPALDNKKCTPPIEASQCHEAEMTDNVNQLLLLDPPR-KRLVECGSL-FKGICALRA : . .: : : : . ..:. : . .:.: ..: ::. :. :. KIAA17 GAISWEAPVEKKT---ECIQKGKNNQTECFNFIRFLQPYNASHLYVCGTYAFQPKCTYVN 220 230 240 250 260 270 130 140 150 160 170 180 KIAA03 LSNISLRL-FYEDGSGEKSF-VASNDEGVATVG-LVSSTGP---GGDRVLFVGKGNGPHD . ...:. .:::.:. . :.. :. . : : :.: : . ... .. ::: KIAA17 MLTFTLEHGEFEDGKGKCPYDPAKGHAGLLVDGELYSATLNNFLGTEPIIL--RNMGPHH 280 290 300 310 320 190 200 210 220 230 KIAA03 NGIIVSTRLLDRTDSREAFEAYTDHATYKAGYLSTNTQQFVAAFEDGPYVFFVFNQQ--- . ..:. : :: : . .: :. .. .:.. : :.: : .. KIAA17 S---MKTEYL-------AFWLNEPHFVGSA-YVPESVGSFTG---DDDKVYFFFRERAVE 330 340 350 360 370 240 250 260 270 280 KIAA03 -DKHPARNRTLLARMCREDPN--------YYSYLEMDLQCRDPDIHAAAFGTCLAASVAA : . . . .::.:. : . . ..:. : : :. . :. : . KIAA17 SDCYAEQVVARVARVCKGDMGGARTLQRKWTTFLKARLACSAPNWQLY-FNQLQAMHTLQ 380 390 400 410 420 430 290 300 310 320 330 340 KIAA03 PGS--GRVLYAVFSRDSRSSGGPGAGLCLFPLDKVHAKMEANRNACYTGTRE---ARDIF : . ....::. .. . ...: . :.... .:. . . ... : KIAA17 DTSWHNTTFFGVFQ--AQWGDMYLSAICEYQLEEIQRVFEGPYKEYHEEAQKWDRYTDPV 440 450 460 470 480 490 350 360 370 380 390 KIAA03 YKPFHGDIQCGGHA-PGSSKSFPCGSEHLPY----PLGSRD-GLRGT-AVLQRGGLNLTA .: :. . : : ..:. .. : . :: .. : : . .: . : :.: KIAA17 PSPRPGSCINNWHRRHGYTSSLELPDNILNFVKKHPLMEEQVGPRWSRPLLVKKGTNFTH 500 510 520 530 540 550 400 410 420 430 440 450 KIAA03 -----VTVAAENNHTVAFLGTSDGRILK-VYLTPDGTSSEYDSILVEINKRVKRDLVLSG :: ..:: :.::.:: .:: : : : : ... ... :.:::: KIAA17 LVADRVTGLDGATYTVLFIGTGDGWLLKAVSLGPWVHLIEELQLF---DQEPMRSLVLSQ 560 570 580 590 600 460 470 480 490 500 510 KIAA03 DLGSLYAMTQDKVFRLPVQECLSYPTCTQCRDSQDPYCGWCVVEGRCTRKAECPRAEEAS . :.: ..... .::: .:..: .:..: ..::::.: : .:: KIAA17 SKKLLFAGSRSQLVQLPVADCMKYRSCADCVLARDPYCAWSVNTSRCVAVGGHSGSLLIQ 610 620 630 640 650 660 520 530 540 550 560 570 KIAA03 HWLWSRSKSCVAVTSAQPQNMSRRAQGEVQLTVSPLPALSEEDELLCLFGESPPHPARVE KIAA17 HVMTSDTSGICNLRGSKKVRPTPKNITVVAGTDLVLPCHLSSNLAHARWTFGGRDLPAEQ 670 680 690 700 710 720 >>KIAA1445 ( 1202 res) fg03469b (1202 aa) initn: 187 init1: 73 opt: 205 Z-score: 192.0 bits: 48.2 E(): 1.4e-05 Smith-Waterman score: 271; 21.818% identity (52.727% similar) in 550 aa overlap (23-534:162-659) 10 20 30 40 50 KIAA03 RGAMALQLWALTLLGLLGAGASLRPRKLDF-FRSEKELNHLAVDEASGVVYL :.: .: . . .....::.: ... . . KIAA14 LSSSQDVSSEPSSEQQLCALSKHPTVAFEDLQPWVSNFTYPGARDFSQLALDPSGNQLIV 140 150 160 170 180 190 60 70 80 90 100 KIAA03 GAVNALYQLD-AKLQLEQQVATGPALDNKK-CTPPIEASQCHEAEMTDNVNQLLLLDPPR :: : :..:. :...: : . . . :... : :. . : .: ..:.. KIAA14 GARNYLFRLSLANVSLLQATEWASSEDTRRSC-----QSKGKTEEECQNYVRVLIVAG-- 200 210 220 230 240 110 120 130 140 150 160 KIAA03 KRLVECGS-LFKGICALRALSNISLRLFYEDGSGEKSFVASNDEGVATVGLVSSTGP--G ... ::. :. .:. : ..:.: .: .. . : .....:: : . KIAA14 RKVFMCGTNAFSPMCTSRQVGNLSRTTEKINGVARCPY----DPRHNSTAVISSQGELYA 250 260 270 280 290 300 170 180 190 200 210 220 KIAA03 GDRVLFVGKGNGPHDNGIIVSTRLLDRTDSREAFEAYTDHATYKAGYLSTNTQQFVAAFE . . : :. : .: : : . : : :.. .: : .::::.. KIAA14 ATVIDFSGR-----DPAIYRS--LGSGPPLRT--------AQYNSKWL--NEPNFVAAYD 310 320 330 340 230 240 250 260 270 KIAA03 DGPYVFFVFNQQDKHPARNRTL---LARMCRED--------PNYYSYLEMDLQCRDPDIH : ...: . .. . .::. .::.:..: .. .... :.: : . KIAA14 IGLFAYFFLRENAVEHDCGRTVYSRVARVCKNDVGGRFLLEDTWTTFMKARLNCSRPG-E 350 360 370 380 390 400 280 290 300 310 320 330 KIAA03 AAAFGTCLAASVAAPGSGRVLYAVFSRDSRSSGGPGAGLCLFPLDKVHAKMEANRNACYT . . . : .. : . ..:.::. . : . ....: : :. . ... KIAA14 VPFYYNELQSAFHLPEQD-LIYGVFTTNVNSIA--ASAVCAFNLSAISQAFNGPFRY-QE 410 420 430 440 450 340 350 360 370 KIAA03 GTREARDIFYKPFHGDIQCGG---HAPG---SSKSFPCG------SEHL----PYPLGSR . : : . .:. ..::: .:. . .:. . :: . : : .. KIAA14 NPRAAWLPIANPIP-NFQCGTLPETGPNENLTERSLQDAQRLFLMSEAVQPVTPEPCVTQ 460 470 480 490 500 510 380 390 400 410 420 430 KIAA03 DGLRGTAVLQRGGLNLTAVTVAAENNHTVAFLGTSDGRILKVYLTPD----GTSSEYDSI :..: . .. ..:. : .. . : ..:: .: :::. : . : : . KIAA14 DSVRFSHLV----VDLVQ---AKDTLYHVLYIGTESGTILKALSTASRSLHGCYLEELHV 520 530 540 550 560 570 440 450 460 470 480 490 KIAA03 LVEINKRVKRDLVLSGDLGSLYAMTQDKVFRLPVQECLSYPTCTQCRDSQDPYCGWCVVE : .. :.: . . .:.. .: :.:.:...: .: . : ..:::::: . KIAA14 LPPGRREPLRSLRILHSARALFVGLRDGVLRVPLERCAAYRSQGACLGARDPYCGW---D 580 590 600 610 620 500 510 520 530 540 550 KIAA03 GRCTRKAECPRAEEASHW-LWSRSKSCVAVTSAQPQNMSRRAQGEVQLTVSPLPALSEED :. : : :..:. ::... .:. .:..: KIAA14 GKQQR---CSTLEDSSNMSLWTQN-----ITACPVRNVTRDGGFGPWSPWQPCEHLDGDN 630 640 650 660 670 560 570 580 590 600 610 KIAA03 ELLCLFGESPPHPARVEGEAVICNSPSSIPVTPPGQDHVAVTIQLLLRRGNIFLTSYQYP KIAA14 SGSCLCRARSCDSPRPRCGGLDCLGPAIHIANCSRNGAWTPWSSWALCSTSCGIGFQVRQ 680 690 700 710 720 730 >>KIAA1619 ( 869 res) fj14720 (869 aa) initn: 258 init1: 136 opt: 186 Z-score: 175.3 bits: 44.6 E(): 0.00012 Smith-Waterman score: 290; 23.173% identity (50.544% similar) in 643 aa overlap (7-583:30-621) 10 20 KIAA03 RGAMALQLWALTLLGLLGA----GASLR-P-RKLD-- .:: : ::..: : : ::: : :.:: KIAA16 ASHSPPPQPVTLAPFGGLVSLGLPRKMWGRLWPL-LLSILTATAVPGPSLRRPSRELDAT 10 20 30 40 50 30 40 50 60 70 KIAA03 --------------FFRSE-KELNHLAVDEASGVVYLGAVNALYQLDAKLQLEQQVATGP :... .. . : ..:::. . .:: .::..:.:. ... : KIAA16 PRMTIPYEELSGTRHFKGQAQNYSTLLLEEASARLLVGARGALFSLSAN-----DIGDGA 60 70 80 90 100 110 80 90 100 110 120 KIAA03 ALDNKKCTPPIEASQCHEA---EMTDNVNQLLLLDP-PRKRLVECGS-LFKGICALRALS . . . : :.::. ..:. :.. .:. .: ::. :. .:: KIAA16 HKEIHWEASPEMQSKCHQKGKNNQTECFNHVRFLQRLNSTHLYACGTHAFQPLCAAIDAE 120 130 140 150 160 170 130 140 150 160 170 180 KIAA03 NISLRLFYEDGSGEKSFVASNDEGVATVGLVSSTGPGGDRVLFVGKGNGPHDNGIIVSTR ..: .:.:. :: : . . .::. . : :... .. : .: KIAA16 AFTLPTSFEEGK-EKC---PYDPARGFTGLIIDGG------LYTATRYEFRSIPDIRRSR 180 190 200 210 220 190 200 210 220 230 KIAA03 LLDRTDSREAFEAYTDHATYKAGYLSTNTQQFVAAFEDGPYVFFV----------FNQQD ..:. . . : . . : ... ... .: : ::. :.:. KIAA16 HPHSLRTEETPMHWLNDAEFVFSVLVRESKASAVGDDDKVYYFFTERATEEGSGSFTQSR 230 240 250 260 270 280 240 250 260 270 280 290 KIAA03 KHPARNRTLLARMCRED--------PNYYSYLEMDLQCRDPDIHAAAFGTCLAASVAAPG . : .::.:. : .. :.:. : :. : .. . :.: :. : KIAA16 SSHRVAR--VARVCKGDLGGKKILQKKWTSFLKARLICHIP-LYETLRGVC---SLDAET 290 300 310 320 330 300 310 320 330 340 KIAA03 SGRV-LYAVFSRDSRSSGGPGAGLCLFPLDKVHAKMEANRNACYTGTRE---ARDIFYKP :.:. .::.:. ... . ....: . : ...: . . :.:. . .: KIAA16 SSRTHFYAAFTLSTQWKTLEASAICRYDLAEIQAVFAGPYMEYQDGSRRWGRYEGGVPEP 340 350 360 370 380 390 350 360 370 380 390 KIAA03 FHGD-IQCGGHAPG--SSKSFPCGSEHLP--YPLGSRDGL--RGTAVLQRGG-----LNL :. : . .. : ::...: . .:: .: . :: .: . . :. 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KIAA16 DVLLPCDQPSNLARALWLLNGSMGLSDGQGGYRVGVDGLLVTDAQPEHSGNYGCYAEENG 610 620 630 640 650 660 >>KIAA1745 ( 893 res) pj01678 (893 aa) initn: 200 init1: 121 opt: 165 Z-score: 155.3 bits: 41.0 E(): 0.0016 Smith-Waterman score: 278; 21.928% identity (49.145% similar) in 643 aa overlap (9-599:98-707) 10 20 30 KIAA03 RGAMALQLWALTLLGLLGAGASLRPRKLDFFRSEKEL- :::. : :. :: :.: : : KIAA17 LAAPWGALPPRPPLLLLLLLLLLLQPPPPTWALSPRISLPLGSEERP----FLRFEAEHI 70 80 90 100 110 120 40 50 60 70 80 KIAA03 -NHLAV--DEASGVVYLGAVNALYQLDAKLQL-----EQQVATGPALDNKK-CTPPIEAS :. :. .. . ..:.:: .::. :...:.. :.. : ..:. :. . 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