# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hg00112s1.fasta.nr -Q ../query/KIAA0311.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0311, 2324 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7825527 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9431+/-0.000191; mu= 12.9195+/- 0.011 mean_var=95.4561+/-18.207, 0's: 34 Z-trim: 43 B-trim: 0 in 0/67 Lambda= 0.131272 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 43, opt: 31, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|116241243|sp|Q13023.3|AKAP6_HUMAN RecName: Full (2319) 15178 2886.5 0 gi|187952549|gb|AAI37233.1| A kinase (PRKA) anchor (2319) 15169 2884.8 0 gi|5360204|gb|AAA92354.2| A-kinase anchor protein (2319) 15153 2881.8 0 gi|114652538|ref|XP_509893.2| PREDICTED: A-kinase (2319) 15040 2860.4 0 gi|109083269|ref|XP_001115172.1| PREDICTED: simila (2319) 14779 2811.0 0 gi|119586336|gb|EAW65932.1| A kinase (PRKA) anchor (2077) 13597 2587.1 0 gi|73962691|ref|XP_850404.1| PREDICTED: similar to (2319) 13359 2542.0 0 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