# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/ee00163.fasta.nr -Q ../query/KIAA0308.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0308, 2759 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7809438 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4609+/-0.000204; mu= 11.8280+/- 0.011 mean_var=138.3658+/-25.973, 0's: 40 Z-trim: 127 B-trim: 0 in 0/66 Lambda= 0.109033 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 45, opt: 33, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|87130801|gb|ABD24032.1| PRIC320 isoform 1 [Homo (2881) 18279 2889.1 0 gi|95147342|ref|NP_079410.4| chromodomain helicase (2881) 18268 2887.4 0 gi|114662479|ref|XP_001165654.1| PREDICTED: chromo (2883) 18261 2886.3 0 gi|114662481|ref|XP_510966.2| PREDICTED: chromodom (2882) 18244 2883.6 0 gi|49476336|gb|AAT66509.1| KISH2; hKISH2; Kismet h (2881) 18197 2876.2 0 gi|73949862|ref|XP_863483.1| PREDICTED: similar to (2886) 17715 2800.4 0 gi|194674785|ref|XP_586145.4| PREDICTED: similar t (2883) 17609 2783.7 0 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(2785) 13205 2091.0 0 gi|68164076|gb|AAY87153.1| ciprofibrate bound prot (1995) 13133 2079.5 0 gi|118096298|ref|XP_414088.2| PREDICTED: similar t (2891) 12865 2037.5 0 gi|211853152|gb|AAI68553.1| Unknown (protein for M (2753) 12554 1988.5 0 gi|189521372|ref|XP_001922536.1| PREDICTED: simila (2478) 10970 1739.3 0 gi|148679122|gb|EDL11069.1| mCG141427 [Mus musculu (2699) 9333 1481.9 0 gi|149032671|gb|EDL87541.1| rCG44314 [Rattus norve (2698) 9243 1467.7 0 gi|194208593|ref|XP_001915417.1| PREDICTED: simila (2818) 8522 1354.3 0 gi|194386618|dbj|BAG61119.1| unnamed protein produ (1108) 7261 1155.6 0 gi|189515794|ref|XP_697956.3| PREDICTED: similar t (3094) 6696 1067.1 0 gi|114620586|ref|XP_519780.2| PREDICTED: chromodom (3041) 6656 1060.8 0 gi|148877246|sp|Q9P2D1.3|CHD7_HUMAN RecName: Full= (2997) 6649 1059.7 0 gi|197246330|gb|AAI68549.1| Unknown (protein for M (2179) 6617 1054.5 0 gi|148877247|sp|A2AJK6.1|CHD7_MOUSE RecName: Full= (2986) 6559 1045.6 0 gi|123883232|sp|Q06A37.1|CHD7_CHICK 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