# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hg00009.fasta.nr -Q ../query/KIAA0303.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0303, 2137 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7766918 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9915+/-0.000218; mu= 9.1558+/- 0.012 mean_var=201.5661+/-38.661, 0's: 43 Z-trim: 297 B-trim: 121 in 1/65 Lambda= 0.090337 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 43, opt: 31, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|57547570|gb|AAW52510.1| serine/threonine protei (2434) 14360 1886.4 0 gi|119571705|gb|EAW51320.1| similar to microtubule (2429) 14355 1885.7 0 gi|148727255|ref|NP_055998.1| microtubule associat (2434) 14342 1884.0 0 gi|215274130|sp|O15021.3|MAST4_HUMAN RecName: Full (2626) 14342 1884.1 0 gi|119571706|gb|EAW51321.1| similar to microtubule (2451) 12358 1625.5 0 gi|109464300|ref|XP_226732.4| PREDICTED: similar t (2617) 10929 1439.2 0 gi|38075057|ref|XP_283179.2| PREDICTED: microtubul (2618) 10871 1431.7 0 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