# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hf00402s1.fasta.nr -Q ../query/KIAA0301.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0301, 3210 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7807701 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3173+/-0.000197; mu= 12.5936+/- 0.011 mean_var=123.2099+/-23.496, 0's: 31 Z-trim: 118 B-trim: 57 in 1/64 Lambda= 0.115545 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 46, opt: 34, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|119568930|gb|EAW48545.1| MDN1, midasin homolog (5596) 21399 3580.9 0 gi|24212017|sp|Q9NU22.2|MDN1_HUMAN RecName: Full=M (5596) 21393 3579.9 0 gi|114608501|ref|XP_518639.2| PREDICTED: MDN1, mid (5596) 21263 3558.2 0 gi|109072060|ref|XP_001091687.1| PREDICTED: MDN1, (4067) 20772 3476.2 0 gi|194216266|ref|XP_001915456.1| PREDICTED: simila (5604) 18785 3145.1 0 gi|50949890|emb|CAH10492.1| hypothetical protein [ (2810) 18667 3125.2 0 gi|73973475|ref|XP_867968.1| PREDICTED: similar to (5517) 18531 3102.8 0 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[Drosophila ps (5732) 2023 351.0 3.2e-92 gi|194162322|gb|EDW77223.1| GK22253 [Drosophila wi (5492) 1998 346.8 5.5e-91 gi|190621204|gb|EDV36728.1| GF11804 [Drosophila an (5485) 1985 344.6 2.5e-90 gi|194177262|gb|EDW90873.1| GE13493 [Drosophila ya (4467) 1946 338.0 1.9e-88 gi|108869006|gb|EAT33231.1| conserved hypothetical (5189) 1938 336.8 5.5e-88 gi|194142339|gb|EDW58745.1| GJ18392 [Drosophila vi (5496) 1898 330.1 5.8e-86 gi|193902649|gb|EDW01516.1| GH20407 [Drosophila gr (5298) 1870 325.4 1.4e-84 gi|10727627|gb|AAF58611.2| CG13185, isoform B [Dro (5303) 1870 325.4 1.4e-84 gi|47212768|emb|CAF95225.1| unnamed protein produc (5257) 1843 320.9 3.2e-83 gi|210091807|gb|EEA40049.1| hypothetical protein B (5716) 1833 319.3 1.1e-82 gi|189242069|ref|XP_972555.2| PREDICTED: similar t (1362) 1616 282.6 3e-72 gi|110759130|ref|XP_623414.2| PREDICTED: similar t (3173) 1592 278.9 8.8e-71 gi|221121355|ref|XP_002162241.1| PREDICTED: simila (3094) 1548 271.6 1.4e-68 gi|193688092|ref|XP_001947406.1| PREDICTED: simila (4848) 1521 267.2 4.4e-67 gi|212512289|gb|EEB15082.1| midasin, putative [Ped (4604) 1503 264.2 3.4e-66 gi|28850391|gb|AAO53165.1| similar to midasin, a l (5864) 1429 252.0 2.1e-62 gi|194110893|gb|EDW32936.1| GL10246 [Drosophila pe (5279) 1409 248.6 1.9e-61 gi|157400293|gb|ABV53770.1| CG13185, isoform C [Dr (5547) 1391 245.6 1.6e-60 gi|157020145|gb|EAA04265.4| AGAP007388-PA [Anophel (5799) 1354 239.5 1.2e-58 gi|16198327|gb|AAL14009.1| SD07158p [Drosophila me ( 727) 1340 236.3 1.3e-58 gi|190582917|gb|EDV22988.1| hypothetical protein T ( 474) 1315 232.0 1.7e-57 gi|198415084|ref|XP_002124042.1| PREDICTED: simila ( 364) 1299 229.2 9.1e-57 gi|190659206|gb|EDV56419.1| GG22625 [Drosophila er ( 679) 1275 225.5 2.3e-55 gi|167870255|gb|EDS33638.1| conserved hypothetical ( 632) 1269 224.4 4.4e-55 gi|163775934|gb|EDQ89556.1| predicted protein [Mon (5349) 1280 227.1 5.8e-55 gi|194125416|gb|EDW47459.1| GM20404 [Drosophila se (5137) 1231 218.9 1.6e-52 gi|199432871|emb|CAR65833.1| DEHA2E15620p [Debaryo (4999) 1219 216.9 6.4e-52 gi|190347321|gb|EDK39570.2| hypothetical protein P (4897) 1207 214.9 2.5e-51 gi|146416635|ref|XP_001484287.1| hypothetical prot (4897) 1191 212.2 1.6e-50 gi|211588657|emb|CAP86774.1| Pc20g14450 [Penicilli (4921) 1154 206.1 1.2e-48 >>gi|119568930|gb|EAW48545.1| MDN1, midasin homolog (yea (5596 aa) initn: 21399 init1: 21399 opt: 21399 Z-score: 19267.9 bits: 3580.9 E(): 0 Smith-Waterman score: 21399; 100.000% identity (100.000% similar) in 3210 aa overlap (1-3210:2387-5596) 10 20 30 KIAA03 FSEACWEVYVCSQHSPANRKLVQALLEKHV :::::::::::::::::::::::::::::: gi|119 GSPTSSVSTLIQTAILIVQYLQRGLSLDRAFSEACWEVYVCSQHSPANRKLVQALLEKHV 2360 2370 2380 2390 2400 2410 40 50 60 70 80 90 KIAA03 SSLRAHETWGDSILGMGLWPDSVPSALFATEDSHLSTVRRDGQILVYCLNRMSMKTSSWT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|119 SSLRAHETWGDSILGMGLWPDSVPSALFATEDSHLSTVRRDGQILVYCLNRMSMKTSSWT 2420 2430 2440 2450 2460 2470 100 110 120 130 140 150 KIAA03 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.:::::::::.::::..:::.:: ::.:...:::.::::::: gi|148 LVLCRYLLGLTELLPAHQRQEYMQNCEHLLLGNTQAFHHVDQTMGNIGGQEALPKELLCL 3130 3140 3150 3160 3170 3180 820 830 840 850 860 870 KIAA03 LLTSLHHFVGEGESKRSLPEPAQRGSLWVSLGLLQIQTWLPQARFDPAVKREYKLNYVKE ::::::.:.::::.:..::: :.:: :::::::::::::::.::::::::. ::: :... gi|148 LLTSLHYFIGEGEGKQNLPEAARRGRLWVSLGLLQIQTWLPRARFDPAVKKAYKLRYAQD 3190 3200 3210 3220 3230 3240 880 890 900 910 920 930 KIAA03 ELHQLQCEWKTRNLSSQLQTGRDLEDEVVVSYSHPHVRLLRQRMDRLDNLTCHLLKKQAF ::.::::: ::::: :.:::::::::....:. :::..:: ::...:..:. : ::::: gi|148 ELRQLQCELKTRNLLSHLQTGRDLEDDIITSHFHPHIKLLPQRISQLESLVHSLSKKQAF 3250 3260 3270 3280 3290 3300 940 950 960 970 980 990 KIAA03 RPQLPAYESLVQEIHHYVTSIAKAPAVQDLLTRLLQALHIDGPRSAQVAQSLLKEEASWQ ::.::.::.::::::::::::::. :::::: ::::::: :::.:::: :.::::::::: gi|148 RPHLPSYETLVQEIHHYVTSIAKVTAVQDLLMRLLQALHTDGPKSAQVLQNLLKEEASWQ 3310 3320 3330 3340 3350 3360 1000 1010 1020 1030 1040 1050 KIAA03 QSHHQFRKRLSEEYTFYPDAVSPLQASILQLQHGMRLVASELHTSLYSSMVGADRLGTLA 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