# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hf00223s1.fasta.huge -Q ../query/KIAA0294.ptfa ./tmplib.23147 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0294, 1405 aa vs ./tmplib.23147 library 1986100 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.2235+/-0.0074; mu= -4.9232+/- 0.500 mean_var=209.0553+/-50.241, 0's: 0 Z-trim: 17 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.088704 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1626 ( 1284 res) fg01925(revised) (1284) 2353 314.9 5.8e-86 KIAA0337 ( 1609 res) hg01226 (1609) 530 81.7 1.2e-15 KIAA1066 ( 1346 res) ah03682 (1346) 351 58.7 8.1e-09 KIAA0516 ( 1382 res) hg00484s2 (1382) 340 57.3 2.2e-08 KIAA1362 ( 699 res) fj02381 ( 699) 284 50.0 1.8e-06 KIAA1256 ( 1676 res) hh15293 (1676) 286 50.5 3.1e-06 KIAA1112 ( 694 res) hj05505s1 ( 694) 274 48.7 4.3e-06 KIAA1415 ( 1621 res) hg04328s1 (1621) 271 48.5 1.1e-05 KIAA0424 ( 567 res) hh01267 ( 567) 237 43.9 9.8e-05 KIAA0142 ( 802 res) ha01169 ( 802) 222 42.1 0.00049 KIAA0006 ( 773 res) ha01154 ( 773) 213 40.9 0.0011 KIAA1010 ( 1315 res) hj05262(revised) (1315) 193 38.5 0.0097 >>KIAA1626 ( 1284 res) fg01925(revised) (1284 aa) initn: 2585 init1: 1098 opt: 2353 Z-score: 1635.1 bits: 314.9 E(): 5.8e-86 Smith-Waterman score: 3217; 46.147% identity (72.860% similar) in 1168 aa overlap (271-1403:132-1283) 250 260 270 280 290 KIAA02 PTSEDQVGREDSALARWAADPANTAWMENPEEAIYDDVPRENSDS-EPD---EMIYDDVE :..:::::: :. :. .: ...:.:.. KIAA16 ADAAFSGARHSSWKRKSSRRIDRFTFPALEEDVIYDDVPCESPDAHQPGAERNLLYEDAH 110 120 130 140 150 160 300 310 320 330 340 350 KIAA02 NGDEGGNSSLEYGWSSSEFESYEEQSDSECKNGI---PRSFLRSNHKKQLSHDLTRLKEH . . .. . :::::::::: :.: : : . : . : . . .:: :::::::. KIAA16 RAG-APRQAEDLGWSSSEFESYSEDSGEEAKPEVEVEPAKH-RVSFQPKLSPDLTRLKER 170 180 190 200 210 360 370 380 390 400 410 KIAA02 YEKKMRDLMASTVGVVEIQQLRQKHELKMQKLVKAAKDGTKDGLERTRAAVKRGRSFIRT : . ::..: :: ..:.:..:.. :: .:.::::.:::::::.:: :: : ::.. KIAA16 YARTKRDILALRVGGRDMQELKHKYDCKMTQLMKAAKSGTKDGLEKTRMAVMRKVSFLHR 220 230 240 250 260 270 420 430 440 450 460 470 KIAA02 KSLIAQDHRSSLEEEQNLF-IDV-DCKHPEAILTPMPEGLSQQQVVRRYILGSVVDSEKN :..... : ::...:. ..: : : : : ::::::: ::::::.::::.:.:: . KIAA16 KDVLGD----SEEEDMGLLEVSVSDIKPPAPELGPMPEGLSPQQVVRRHILGSIVQSEGS 280 290 300 310 320 330 480 490 500 510 520 530 KIAA02 YVDALKRILEQYEKPLSEMEPKVLSERKLKTVFYRVKEILQCHSLFQIALASRVSEWDSV ::..:::::..:..:: :::::.:: :: ..::.::::::.:::.:::::.:::.::::. KIAA16 YVESLKRILQDYRNPLMEMEPKALSARKCQVVFFRVKEILHCHSMFQIALSSRVAEWDST 340 350 360 370 380 390 540 550 560 570 580 590 KIAA02 EMIGDVFVASFSKSMVLDAYSEYVNNFSTAVAVLKKTCATKPAFLEFLKQEQEASPDRTT : :::.::::::::::::.::.:::::..:....::.: ::::::::::..: ::::.: KIAA16 EKIGDLFVASFSKSMVLDVYSDYVNNFTSAMSIIKKACLTKPAFLEFLKRRQVCSPDRVT 400 410 420 430 440 450 600 610 620 630 640 650 KIAA02 LYSLMMKPIQRFPQFILLLQDMLKNTSKGHPDRLPLQMALTELETLAEKLNERKRDADQR ::.::.:::::::::::::::::::: .:::::: ::.::::::::::::::.:: ::: KIAA16 LYGLMVKPIQRFPQFILLLQDMLKNTPRGHPDRLSLQLALTELETLAEKLNEQKRLADQV 460 470 480 490 500 510 660 670 680 690 700 710 KIAA02 CEVKQIAKAINERY-LNKLLSSGSRYLIRSDDMIETVYNDRGEIVKTKERRVFMLNDVLM :..:..:....: :::::.::.: :. . . ::::.:::...:.::::::.:::.:. KIAA16 AEIQQLTKSVSDRSSLNKLLTSGQRQLLLCETLTETVYGDRGQLIKSKERRVFLLNDMLV 520 530 540 550 560 570 720 730 740 750 760 KIAA02 CATVSSRPSH-------DSRVMSSQRYLLKWSVPLGHVDAIEYGSSAGTGEHSRHLAVHP ::... .:.. .: : . .:..::.. : .:...: :...:: ... : : KIAA16 CANINFKPANHRGQLEISSLVPLGPKYVVKWNTALPQVQVVEVGQDGGTYDKDNVLIQHS 580 590 600 610 620 630 770 780 790 800 810 820 KIAA02 PESLAVVANAKPNKVYMGPGQLYQDLQNLLHDLNVIGQITQLIGNLKGNYQNLNQSVAHD . : ... ::::.:: .:.:.::.: .:: :. ::: ::..:.:.:::::..::.: KIAA16 GAKKASASGQAQNKVYLGPPRLFQELQDLQKDLAVVEQITLLISTLHGTYQNLNMTVAQD 640 650 660 670 680 690 830 840 850 860 870 880 KIAA02 WTSGLQRLILKKEDEIRAADCCRIQLQLPGKQDKSGRPTFFTAVFNTFTPAIKESWVNSL : .::::. ::.::..:. ::..: :::: :::::: : .:: : .: : :::: : KIAA16 WCLALQRLMRVKEEEIHSANKCRLRLLLPGKPDKSGRPISFMVVFITPNPLSKISWVNRL 700 710 720 730 740 750 890 900 910 920 930 940 KIAA02 QMAKLALEEENHMGWFCVEDDGNHIKKEKHPLLVGHMPVMVAKQQEFKIECAAYNPE--P ..::..:.:::. ::.: ..: . :.:. .:.. .. ... ...: : KIAA16 HLAKIGLREENQPGWLCPDEDKKSKAPFWCPILACCIPAFSSRALSLQLGALVHSPVNCP 760 770 780 790 800 810 950 960 970 980 990 1000 KIAA02 YLNNESQPDSFSTAHGFLWIGSCTHQMG-QIAIVSFQNSTPKVIECFNVESRILCMLYVP :. . : : .:.::.:. . : :. : :.. .:.... : . . .::: :.: KIAA16 LLGFSAV--STSLPQGYLWVGGGQEGAGGQVEIFSLNRPSPRTVKSFPLAAPVLCMEYIP 820 830 840 850 860 870 1010 1020 1030 1040 1050 KIAA02 -VEEKRREPGAPPDPETPAVRASDVPTICVGTEEGSISIYKSSQGSKKVRLQHFFTPEKS .::. . : :. :. ::::.: ..::: .:.: . . . : .: . KIAA16 ELEEEAESRDESPTVADPS--ATVHPTICLGLQDGSILLYSSVDTGTQC-LVSCRSPGLQ 880 890 900 910 920 930 1060 1070 1080 1090 1100 1110 KIAA02 TVMSLACTSQSLYAGLVNGAVASYARAPDGS-WDSE-PQKVIKLGVLPVRSLLMMEDTLW :. : . : ::: .:..:.: :. : :: : : . .: :::.:: .::..: KIAA16 PVLCLRHSPFHLLAGLQDGTLAAYPRTSGGVLWDLESPPVCLTVGPGPVRTLLSLEDAVW 940 950 960 970 980 990 1120 1130 1140 1150 1160 1170 KIAA02 AASGGQVFIISVETHAVEGQLEAHQEEGMVISHMAVSGVGIWIAFTSGSTLRLFHTETLK :. : .: .. . : . ..::::.:.. ..::. .: :.:.::.::...::::::::. KIAA16 ASCGPRVTVLEATTLQPQQSFEAHQDEAVSVTHMVKAGSGVWMAFSSGTSIRLFHTETLE 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1180 1190 1200 1210 1220 1230 KIAA02 HLQDINIATPVHNMLPGHQRLSVTSLLVCHGLLMVGTSLGVLVALPVPRLQGIPKVTGRG :::.::::: . .:::...: :::::.:.::: :::. ::.: ::::::.::::.::.: KIAA16 HLQEINIATRTTFLLPGQKHLCVTSLLICQGLLWVGTDQGVIVLLPVPRLEGIPKITGKG 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1240 1250 1260 1270 1280 1290 KIAA02 MVSYHAHNSPVKFIVLATALHEKDKDKSRDSLAPGPEPQDEDQKDA-----LPSGGAGSS ::: ..: .:: :...::.. : .: . : ::. . ::. :. .:.. .: KIAA16 MVSLNGHCGPVAFLAVATSILAPDILRSDQEEAEGPRAE-EDKPDGQAHEPMPDSHVGRE 1120 1130 1140 1150 1160 1300 1310 1320 1330 1340 1350 KIAA02 LSQGDPDAAIWLGDSLGSMTQKSDLSSSSGSLSLSHGSSSLEHRSEDSTIYDLLKDP-VS :.. .: : : : .. : . . :.. ::: ::..::.. :: : KIAA16 LTR---KKGILLQYRLRSTAHLPGPLLSMREPAPADGAA-LEHSEEDGSIYEMADDPDVW 1170 1180 1190 1200 1210 1220 1360 1370 1380 1390 1400 KIAA02 LRSK--ARRAKKAKASSALVVCGGQGHRR----VHRKARQPHQEELAPTVMVWQIPLLNI .::. :: :.. . :. .. ::::.: . ..:: : :...::.::. KIAA16 VRSRPCARDAHRKEICSVAIISGGQGYRNFGSALGSSGRQAPCGETDSTLLIWQVPLML 1230 1240 1250 1260 1270 1280 >>KIAA0337 ( 1609 res) hg01226 (1609 aa) initn: 446 init1: 270 opt: 530 Z-score: 372.9 bits: 81.7 E(): 1.2e-15 Smith-Waterman score: 765; 24.015% identity (53.987% similar) in 1041 aa overlap (436-1335:585-1603) 410 420 430 440 450 KIAA02 RGRSFIRTKSLIAQDHRSSLEEEQNLFIDVDCKHPEAIL-----TPMPEGLSQQQV-VRR . : ::: :: . :. :: .:. KIAA03 QYMLNLHSGEVPAPVPVDMPCLPLAAPPSAEAKPPEAARPADEPTPASKCCSKPQVDMRK 560 570 580 590 600 610 460 470 480 490 500 510 KIAA02 YILGSVVDSEKNYVDALKRILEQYEKPLSEMEPKVLSERKL-KTVFYRVKEILQCHSLFQ .. ...:.:..::..:. ... : .::.. : .:: . .: .: .. :.:. : : KIAA03 HVAMTLLDTEQSYVESLRTLMQGYMQPLKQPENSVLCDPSLVDEIFDQIPELLEHHEQFL 620 630 640 650 660 670 520 530 540 550 560 570 KIAA02 IALASRVSEWDSVEMIGDVFVASFSKSMVLDAYSEYVNNFSTAVAVLKKTCATKPAFLEF . .. : . . .: ..: ::::..... :: :..:: .: ... . ..::::.: KIAA03 EQVRHCMQTWHAQQKVGALLVQSFSKDVLVNIYSAYIDNFLNAKDAVRVAKEARPAFLKF 680 690 700 710 720 730 580 590 600 610 620 630 KIAA02 LKQEQEASPDRTTLYSLMMKPIQRFPQFILLLQDMLKNTSKGHPDRLPLQMALTELETLA :.: .. . .. .: .::.::.::.:.. ::..:.::.: . :::. : : ... .: KIAA03 LEQSMRENKEKQALSDLMIKPVQRIPRYELLVKDLLKHTPEDHPDHPLLLEAQRNIKQVA 740 750 760 770 780 790 640 650 660 670 680 690 KIAA02 EKLNERKRDADQRCEVKQIAKAINERYLNKL--LSSGSRYLIRSDDMIETVYNDRGEIVK :..:. :.:.. . .. . : : ... . :.. : ..:.. .::. : KIAA03 ERINKGVRSAEEAERHARVLQEI-EAHIEGMEDLQAPLRRFLRQEMVIEV-----KAIGG 800 810 820 830 840 700 710 720 730 740 KIAA02 TKERRVFMLNDVLMCATVSSRPSHDSR-----------VMSSQRYLLKWSVPLGHVDAIE :.: .:...:...:.:.. . . : . ....: . :..:: .: :. KIAA03 KKDRSLFLFTDLIVCTTLKRKSGSLRRSSMSLYTAASVIDTASKYKMLWKLPLEDADIIK 850 860 870 880 890 900 750 760 770 780 790 KIAA02 YGSSAGTGEHSRHLAVHPPESLAVVANAKPNKVYMG-PGQ----LYQDLQNLLH-DLNVI .:.: . :. .. . :.:..... . . .: : : .::. .: ::. KIAA03 GASQATNRENIQKAISRLDEDLTTLGQMSKLSESLGFPHQSLDDALRDLSAAMHRDLSEK 910 920 930 940 950 960 800 810 820 830 840 KIAA02 GQITQLIG------NLKGNYQNLNQSVAHDWTSGLQRLILKKE-DEIR-----AADCCRI . .. .: .. . ..: .. :: ... :: . . .: KIAA03 QALCYALSFPPTKLELCATRPEGTDSYIFEFPHPDARLGFEQAFDEAKRKLASSKSCLDP 970 980 990 1000 1010 1020 850 860 870 880 890 KIAA02 QL--QLPGKQDKSGRPTFFTA-VFNTFTPAIKESWV-NSL----QMAKLALEEENHMGW- .. .: . .:: .: ..:. : :: :: :. :.:. : . KIAA03 EFLKAIPIMKTRSGMQFSCAAPTLNSCPEPSPEVWVCNSDGYVGQVCLLSLRAEPDVEAC 1030 1040 1050 1060 1070 1080 900 910 920 930 KIAA02 --------FCVED-DGNHIKKEKHPLLVGHMPVMVAKQQ---EFKIECAAYN-------- .:. : . . ...: . : .: . :. .: :: . KIAA03 IAVCSARILCIGAVPGLQPRCHREPPPSLRSPPETAPEPAGPELDVEAAADEEAATLAEP 1090 1100 1110 1120 1130 1140 940 950 960 970 980 KIAA02 -PEPYLNNESQPDSFSTAHGFLWIGSCTHQMGQIAIVSFQNSTPK-------------VI :.: :. ... . : : :. .. . : ..:.:. . KIAA03 GPQPCLHISIAGSGLEMTPG-LGEGDPRPELVPFDSDSDDESSPSPSGTLQSQASRSTIS 1150 1160 1170 1180 1190 1200 990 1000 1010 1020 KIAA02 ECFNVE---SRILCMLYVPVEEKRREPG--------APPDP--ETP----AVRAS----- :. : : . :...::: .: : .: :.: : KIAA03 SSFGNEETPSSKEATAETTSSEEEQEPGFLPLSGSFGPGGPCGTSPMDGRALRRSSHGSF 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1030 1040 1050 1060 KIAA02 ------DV----P-----TICVGTEEGSISIYKSSQGSK----KVRLQHFFTPEKSTVMS :. : .. .:::.: . .:.::.. . ...::: ..: KIAA03 TRGSLEDLLSVDPEAYQSSVWLGTEDGCVHVYQSSDSIRDRRNSMKLQH-----AASVTC 1270 1280 1290 1300 1310 1320 1070 1080 1090 1100 1110 1120 KIAA02 LACTSQSLYAGLVNGAVASYARAPDGSWDSEPQKVIKLGVL--PVRSLLMMEDTLWAASG . .......:.:: .. : : :: . : . ::. :. ... . :: . KIAA03 ILYLNNQVFVSLANGELVVYQREAGHFWDPQNFKSVTLGTQGSPITKMVSVGGRLWCGCQ 1330 1340 1350 1360 1370 1380 1130 1140 1150 1160 1170 1180 KIAA02 GQVFIISVETHAVEGQLEAHQEEGMVISHMAVSGVGIWIAFTSGSTLRLFHTETLKHLQD ..:...: .: .: .. . :. . .. :. :..:.:... ... . :.: .:...: . KIAA03 NRVLVLSPDTLQLEHMFYVGQDSSRCVACMVDSSLGVWVTLKGSAHVCLYHPDTFEQLAE 1390 1400 1410 1420 1430 1440 1190 1200 1210 1220 1230 KIAA02 INIATPVHNMLPG-------HQR--LSVTSLLVCHGLLMVGTSLGVLVALPV-PRLQGIP .... ::: :: : :. : .:.::::. :: :::: ::....:. : . : KIAA03 VDVTPPVHRMLAGSDAIIRQHKAACLRITALLVCEELLWVGTSAGVVLTMPTSPGTVSCP 1450 1460 1470 1480 1490 1500 1240 1250 1260 1270 1280 KIAA02 KV----TGRGMVSYHAHNSPVKFIVLATALHEKDKDKSRDSLAPGPEPQDEDQKDALPS- .. :: : ..:.. :.:.. :.. : . . : : : : . . ::: KIAA03 RAPLSPTGLG----QGHTGHVRFLA---AVQLPD---GFNLLCPTPPPPPDTGPEKLPSL 1510 1520 1530 1540 1550 1290 1300 1310 1320 1330 1340 KIAA02 GGAGSSLSQGD-PDAAIWLGDSLGSMTQKSDLSSSSGSLSLSHG-SSSLEHRSEDSTIYD : .: : : : :. . :::..:: : . : ..: .: KIAA03 EHRDSPWHRGPAPARPKMLVISGGDGYEDFRLSSGGGSSSETVGRDDSTNHLLLWRV 1560 1570 1580 1590 1600 1350 1360 1370 1380 1390 1400 KIAA02 LLKDPVSLRSKARRAKKAKASSALVVCGGQGHRRVHRKARQPHQEELAPTVMVWQIPLLN >>KIAA1066 ( 1346 res) ah03682 (1346 aa) initn: 297 init1: 167 opt: 351 Z-score: 250.2 bits: 58.7 E(): 8.1e-09 Smith-Waterman score: 351; 29.956% identity (63.877% similar) in 227 aa overlap (1005-1224:961-1181) 980 990 1000 1010 1020 1030 KIAA02 SFQNSTPKVIECFNVESRILCMLYVPVEEKRREPGAPPDPETPAVRASDVPTICVGTEEG : :: :: .. .: .::. .:...: KIAA10 EHVFTDPAPTPSSGPQPGSENGPEPDSSSTRPEPEPSGDPT--GAGSSAAPTMWLGAQNG 940 950 960 970 980 1040 1050 1060 1070 1080 1090 KIAA02 SISIYKSSQGSKKVRLQHFFTPEKSTVMSLACTSQSLYAGLVNGAVASYARAPDGSWDSE . .... . :: : . :..:.::. .. . ..:..:..: . :. ::.:: KIAA10 WLYVHSAVANWKKC--LHSIK-LKDSVLSLVHVKGRVLVALADGTLAIFHRGEDGQWDLS 990 1000 1010 1020 1030 1040 1100 1110 1120 1130 1140 1150 KIAA02 PQKVIKLGVLP---VRSLLMMEDTLWAASGGQVFIISVETHAVEGQLEAHQEEGMVISHM ... :: : .: . .. : .: . ..: .:. .: .: ...:: .. . .. KIAA10 NYHLMDLG-HPHHSIRCMAVVYDRVWCGYKNKVHVIQPKTMQIEKSFDAHPRRESQVRQL 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1160 1170 1180 1190 1200 KIAA02 AVSGVGIWIAFTSGSTLRLFHTETLKHLQDINIATPVHNMLP----GHQRLSVTSLLVCH : : :.:... :::::.:..: .::::..: : .:: : . . .:.::: KIAA10 AWIGDGVWVSIRLDSTLRLYHAHTHQHLQDVDIEPYVSKMLGTGKLGFSFVRITALLVAG 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1210 1220 1230 1240 1250 1260 KIAA02 GLLMVGTSLGVLVALPVPRLQGIPKVTGRGMVSYHAHNSPVKFIVLATALHEKDKDKSRD . : :::. ::....:. KIAA10 SRLWVGTGNGVVISIPLTETVVLHRGQLLGLRANKTSPTSGEGARPGGIIHVYGDDSSDR 1170 1180 1190 1200 1210 1220 >>KIAA0516 ( 1382 res) hg00484s2 (1382 aa) initn: 334 init1: 169 opt: 340 Z-score: 242.4 bits: 57.3 E(): 2.2e-08 Smith-Waterman score: 352; 26.102% identity (58.983% similar) in 295 aa overlap (1021-1292:1027-1317) 1000 1010 1020 1030 1040 1050 KIAA02 SRILCMLYVPVEEKRREPGAPPDPETPAVRASDVPTICVGTEEGSISIYKSSQGSKKVRL .: .::. .:...: . ...: .: KIAA05 QSSNDSDAYKDQISVLPNEQDLVREEAQKMSSLLPTMWLGAQNGCLYVHSSVAQWRKC-- 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1100 KIAA02 QHFFTPEKSTVMSLACTSQSLYAGLVNGAVASYARAPDGSWDSEPQKVIKLGVLP---VR : . :....:.. .. . ..:..:..: . :. ::.:: ... :: : .: KIAA05 LHSIK-LKDSILSIVHVKGIVLVALADGTLAIFHRGVDGQWDLSNYHLLDLGR-PHHSIR 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1110 1120 1130 1140 1150 1160 KIAA02 SLLMMEDTLWAASGGQVFIISVETHAVEGQLEAHQEEGMVISHMAVSGVGIWIAFTSGST . ...: .: . ....... .. .: ...:: .. . ..: : :.:... :: KIAA05 CMTVVHDKVWCGYRNKIYVVQPKAMKIEKSFDAHPRKESQVRQLAWVGDGVWVSIRLDST 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1170 1180 1190 1200 1210 1220 KIAA02 LRLFHTETLKHLQDINIATPVHNMLP----GHQRLSVTSLLVCHGLLMVGTSLGVLVALP :::.:..: .::::..: : .:: : . . .:.:.: . : :::. ::....: KIAA05 LRLYHAHTYQHLQDVDIEPYVSKMLGTGKLGFSFVRITALMVSCNRLWVGTGNGVIISIP 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1230 1240 1250 1260 1270 KIAA02 VP---RLQGIP-KVTGRGMVSYHAHNS----PVKFIVLATALHEK-----DKDKSRDSLA . . .:.: . : . : .:: : :: . : . .: . .: KIAA05 LTETNKTSGVPGNRPGSVIRVYGDENSDKVTPGTFIPYCSMAHAQLCFHGHRDAVKFFVA 1240 1250 1260 1270 1280 1290 1280 1290 1300 1310 1320 KIAA02 -PGP--EPQDEDQKDALPSGGAGSSLSQGDPDAAIWLGDSLGSMTQKSDLSSSSGSLSLS :: ::. .. : . :: : KIAA05 VPGQVISPQSSSSGTDLTGDKAGPSAQEPGSQTPLKSMLVISGGEGYIDFRMGDEGGESE 1300 1310 1320 1330 1340 1350 >>KIAA1362 ( 699 res) fj02381 (699 aa) initn: 200 init1: 125 opt: 284 Z-score: 208.0 bits: 50.0 E(): 1.8e-06 Smith-Waterman score: 292; 25.769% identity (58.462% similar) in 260 aa overlap (460-713:206-452) 430 440 450 460 470 480 KIAA02 NLFIDVDCKHPEAILTPMPEGLSQQQVVRRYILGSVVDSEKNYVDALKRILEQYEKPLS- .: ...::: .::.:: . ... .. KIAA13 DDVSSESSKGEPDPLEDKQDEDNGMKSKVHHIAKEIMSSEKVFVDVLKLLHIDFRDAVAH 180 190 200 210 220 230 490 500 510 520 530 540 KIAA02 ---EMEPKVLSERKLKTVFYRVKEILQCHSLFQIALASRVSEWDSVEMIGDVFVASFSKS .. :. .: :. ..: . .. . . . : :. .: . :.:.:: .:. KIAA13 ASRQLGKPVIEDRILNQILYYLPQLYELNRDLLKELEERMLHWTEQQRIADIFV---KKG 240 250 260 270 280 290 550 560 570 580 590 600 KIAA02 MVLDAYSEYVNNFSTAVAVLKKTCATKPAFLEFLKQEQEASP--DRTTLYSLMMKPIQRF : :: :...:. .:.: . : .:.: .. : : :: .: ..::.::. KIAA13 PYLKMYSTYIKEFDKNIALLDEQCKKNPGFAAVVR-EFEMSPCCANLALKHYLLKPVQRI 300 310 320 330 340 350 610 620 630 640 650 660 KIAA02 PQFILLLQDMLKNTSKGHPDRLPLQMALTELETLAEKLNERKRDADQRCEVKQIAKAINE ::. ::: :.::: . : : ::. . .:.. :. ...:. .. :: ..: KIAA13 PQYRLLLTDYLKNLIEDAGDYRDTQDALAVVIEVANHANDTMKQGDNFQKLMQIQYSLNG 360 370 380 390 400 410 670 680 690 700 710 720 KIAA02 RYLNKLLSSGSRYLIRSDDMIETVYNDRGEIVKTKERRVFMLNDVLMCATVSSRPSHDSR .. .... : : ... ... .: . . : :..::.:. .: KIAA13 HH--EIVQPG-RVFLKEGILMKL---SRKVM---QPRMFFLFNDALLYTTPVQSGMYKLN 420 430 440 450 460 730 740 750 760 770 780 KIAA02 VMSSQRYLLKWSVPLGHVDAIEYGSSAGTGEHSRHLAVHPPESLAVVANAKPNKVYMGPG KIAA13 NMLSLAGMKVRKPTQEAYQNELKIESVERSFILSASSATERDEWLEAISRAIEEYAKKRI 470 480 490 500 510 520 >>KIAA1256 ( 1676 res) hh15293 (1676 aa) initn: 163 init1: 135 opt: 286 Z-score: 203.8 bits: 50.5 E(): 3.1e-06 Smith-Waterman score: 286; 27.536% identity (59.058% similar) in 276 aa overlap (451-710:1179-1439) 430 440 450 460 470 KIAA02 HRSSLEEEQNLFIDVDCKHPEAILTPMPEGLSQQQVVRRYILGSV---VDSEKNYVDALK :. .: ..: : . ...:. :. :. KIAA12 NGVTGLFPSNYVKMTTDSDPSQQWCADLQTLDTMQPIERKRQGYIHELIQTEERYMADLQ 1150 1160 1170 1180 1190 1200 480 490 500 510 520 530 KIAA02 RILEQYEKPLSEMEPKVLSERKLKTVFYRVKEILQCHSLFQIALASRVS---EWDSVEMI ..: ..: .. : :.: .. .: ::... .. . :: : . : :.:: KIAA12 LVVEVFQKRMA--ESGFLTEGEMALIFVNWKELIMSNTKLLKALRVRKKTGGEKMPVQMI 1210 1220 1230 1240 1250 1260 540 550 560 570 580 590 KIAA02 GDVFVASFSKSMVLDAYSEYVNNFSTAVAVLKKTCATKPAFLEFLKQEQEASPDRTT--- ::...: .:. ..:: .. . ...:.:.. : ::::. :: : KIAA12 GDILAAELSH---MQAYIRFCSCQLNGAALLQQKTDEDTDFKEFLKKL--ASDPRCKGMP 1270 1280 1290 1300 1310 1320 600 610 620 630 640 KIAA02 LYSLMMKPIQRFPQFILLLQDMLKNTSKGHPDRLPLQMALTELETLAEKLNE--RKRDAD : :...::.::. .. ::....:.:: ..: :. :..:: . : : ..:: :... . KIAA12 LSSFLLKPMQRITRYPLLIRSILENTPESHADHSSLKLALERAEELCSQVNEGVREKENS 1330 1340 1350 1360 1370 1380 650 660 670 680 690 700 KIAA02 QRCEVKQI---AKAINERYLNKLLSS--GSRYLIRSDDMIETVYNDRGEIVKTKERRVFM .: : : ... :. . . :.. : : :..: . .: : :: . :. KIAA12 DRLEWIQAHVQCEGLAEQLIFNSLTNCLGPRKLLHSGKLYKTKSN--------KELHGFL 1390 1400 1410 1420 1430 710 720 730 740 750 760 KIAA02 LNDVLMCATVSSRPSHDSRVMSSQRYLLKWSVPLGHVDAIEYGSSAGTGEHSRHLAVHPP .:: :. KIAA12 FNDFLLLTYMVKQFAVSSGSEKLFSSKSNAQFKMYKTPIFLNEVLVKLPTDPSSDEPVFH 1440 1450 1460 1470 1480 1490 >>KIAA1112 ( 694 res) hj05505s1 (694 aa) initn: 141 init1: 141 opt: 274 Z-score: 201.2 bits: 48.7 E(): 4.3e-06 Smith-Waterman score: 274; 25.094% identity (59.925% similar) in 267 aa overlap (449-711:300-555) 420 430 440 450 460 470 KIAA02 QDHRSSLEEEQNLFIDVDCKHPEAILTPMPEGLSQQQVVRRYILGSVVDSEKNYVDALKR :. :... .: ... ....:..:. :. KIAA11 SFVRLRVNQDEPADDDAPLAGNSGAEDGGAEAQSSKDQMRTNVINEILSTERDYIKHLRD 270 280 290 300 310 320 480 490 500 510 520 530 KIAA02 ILEQYEKPLSEMEPKVLSERKLKTVFYRVKEILQCHSLFQIALASRVS-EWDSVEMIGDV : : : . . . ..::..:.:.: ...: .:.. : :: .: . : . .: KIAA11 ICEGYVRQCRK-RADMFSEEQLRTIFGNIEDIYRCQKAFVKALEQRFNRERPHLSELGAC 330 340 350 360 370 380 540 550 560 570 580 590 KIAA02 FVASFSKSMVLDAYSEYVNNFSTAVAVLKK-TCATKPA-FLEFLKQEQEASPDRTTLYSL :. . .. :::: :: .: . :.. : .: . :.: . :. .: .. KIAA11 FLEHQADFQI---YSEYCNNHPNACVELSRLTKLSKYVYFFEACRLLQKMID--ISLDGF 390 400 410 420 430 440 600 610 620 630 640 650 KIAA02 MMKPIQRFPQFILLLQDMLKNTSKGHPDRLPLQMALTELETLAEKLNERKRDADQRCEVK .. :.:.. .. : : ..:: : : : .. :: ....:. .::::: .. .. KIAA11 LLTPVQKICKYPLQLAELLKYTHPQHRDFKDVEAALHAMKNVAQLINERKRRLENIDKIA 450 460 470 480 490 500 660 670 680 690 700 710 KIAA02 QIAKAINERYLNKLLSSGSRYLIRSDDMIETVYNDRGEIVKTKERRVFMLNDVLM-CATV : ..:.. . :: .:. :: : .. ... . .:...: :... :. : KIAA11 QWQSSIEDWEGEDLLVRSSE-LIYSGELTRVTQPQ----AKSQQRMFFLFDHQLIYCKKD 510 520 530 540 550 720 730 740 750 760 770 KIAA02 SSRPSHDSRVMSSQRYLLKWSVPLGHVDAIEYGSSAGTGEHSRHLAVHPPESLAVVANAK KIAA11 LLRRDVLYYKGRLDMDGLEVVDLEDGKDRDLHVSIKNAFRLHRGATGDSHLLCTRKPEQK 560 570 580 590 600 610 >>KIAA1415 ( 1621 res) hg04328s1 (1621 aa) initn: 136 init1: 136 opt: 271 Z-score: 193.7 bits: 48.5 E(): 1.1e-05 Smith-Waterman score: 271; 24.444% identity (60.000% similar) in 315 aa overlap (452-749:5-308) 430 440 450 460 470 KIAA02 RSSLEEEQNLFIDVDCKHPEAILTPMPEGLSQQQV-VRRYILGSVVDSEKNYVDALKRI- :..:. .: .:. .. .:..:: .:. . KIAA14 AARESERQLRLRLCVLNEILGTERDYVGTLRFLQ 10 20 30 480 490 500 510 520 530 KIAA02 ---LEQYEKPLSEMEPKVLSERKLKTVFYRVKEILQCHSLFQIALASRVS-EWDSVEMIG :.. .. ... : :.:...:..: ...::. :. : :: . : .: . .: KIAA14 SAFLHRIRQNVADSVEKGLTEENVKVLFSNIEDILEVHKDFLAALEYCLHPEPQSQHELG 40 50 60 70 80 90 540 550 560 570 580 590 KIAA02 DVFVASFSKSMVLDAYSEYVNNFSTAVAVLKKTCATKPAFLEFLKQEQEASPDRTT---L .::. .: : : :: .: :. .: . :. :: . . . .:: : KIAA14 NVFLKFKDKFCV---YEEYCSNHEKALRLLVELNKI-PTVRAFLLSCMLLGGRKTTDIPL 100 110 120 130 140 150 600 610 620 630 640 650 KIAA02 YSLMMKPIQRFPQFILLLQDMLKNTSKGHPDRLPLQMALTELETLAEKLNERKRDADQRC . ...::::. .. :::... : : :::. .: :: ..:. ..:: ::. .. KIAA14 EGYLLSPIQRICKYPLLLKELAKRTPGKHPDHPAVQSALQAMKTVCSNINETKRQMEKLE 160 170 180 190 200 210 660 670 680 690 700 710 KIAA02 EVKQIAKAINERYLNKLLSSGSRYLIRSDDMIETVYNDRGEIVKTKERRVFMLNDVLM-C ..:. . : : . .. :.. :. . ... . :.: .:: :.....:. : KIAA14 ALEQLQSHI-EGWEGSNLTDICTQLLLQGTLLKI---SAGNI---QERAFFLFDNLLVYC 220 230 240 250 260 720 730 740 750 760 KIAA02 -----ATVSSRPSHDSRVMSSQRYLLKWSV--PLGHVDAIEYGSSAGTGEHSRHLAVHPP .: :.. .. .. .... :... . . .:. .: :.. KIAA14 KRKSRVTGSKKSTKRTKSINGSLYIFRGRINTEVMEVENVEDGTADYHSNGYTVTNGWKI 270 280 290 300 310 320 770 780 790 800 810 820 KIAA02 ESLAVVANAKPNKVYMGPGQLYQDLQNLLHDLNVIGQITQLIGNLKGNYQNLNQSVAHDW KIAA14 HNTAKNKWFVCMAKTAEEKQKWLDAIIREREQRESLKLGMERDAYVMIAEKGEKLYHMMM 330 340 350 360 370 380 >>KIAA0424 ( 567 res) hh01267 (567 aa) initn: 126 init1: 126 opt: 237 Z-score: 176.9 bits: 43.9 E(): 9.8e-05 Smith-Waterman score: 237; 23.509% identity (57.193% similar) in 285 aa overlap (434-711:129-401) 410 420 430 440 450 460 KIAA02 VKRGRSFIRTKSLIAQDHRSSLEEEQNLFIDVDCKH--PEAILTPMPEGLSQQQVVRRYI ::. : :.. . . :.... .: . KIAA04 GQIDDEEGWFPASFVRLWVNQEDEVEEGPSDVQNGHLDPNSDCLCLGRPLQNRDQMRANV 100 110 120 130 140 150 470 480 490 500 510 520 KIAA02 LGSVVDSEKNYVDALKRILEQYEKPLSEMEPKVLSERKLKTVFYRVKEILQCHSLFQIAL .. ....:..:. :: : : : : . . ..:...::..: ...: . . : : KIAA04 INEIMSTERHYIKHLKDICEGYLKQCRKRRD-MFSDEQLKVIFGNIEDIYRFQMGFVRDL 160 170 180 190 200 210 530 540 550 560 570 KIAA02 ASRVSEWDS-VEMIGDVFVASFSKSMVLDAYSEYVNNFSTAVAVLKKTCATK--PAFLEF .. .. : . :: :. . . :::: :: : :.: . :.: KIAA04 EKQYNNDDPHLSEIGPCFLEHQDGFWI---YSEYCNNHLDACMELSKLMKDSRYQHFFEA 220 230 240 250 260 270 580 590 600 610 620 630 KIAA02 LKQEQEASPDRTTLYSLMMKPIQRFPQFILLLQDMLKNTSKGHPDRLPLQMALTELETLA . :. .. .... :.:.. .. : : ..:: :.. : : . ::. ..... KIAA04 CRLLQQMID--IAIDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTAQDHSDYRYVAAALAVMRNVT 280 290 300 310 320 330 640 650 660 670 680 690 KIAA02 EKLNERKRDADQRCEVKQIAKAINERYLNKLLSSGSRYLIRSDDMIETVYNDRGEIVKTK ...::::: .. .. : .. . . .:. .:. :: . .: .:. :. . KIAA04 QQINERKRRLENIDKIAQWQASVLDWEGEDILDRSSE-LIYTGEMAW-IYQPYGR----N 340 350 360 370 380 700 710 720 730 740 750 KIAA02 ERRVFMLND--VLMCATVSSRPSHDSRVMSSQRYLLKWSVPLGHVDAIEYGSSAGTGEHS ..:::.: : ...: KIAA04 QQRVFFLFDHQMVLCKKDLIRRDILYYKGRIDMDKYEVVDIEDGRDDDFNVSMKNAFKLH 390 400 410 420 430 440 >>KIAA0142 ( 802 res) ha01169 (802 aa) initn: 111 init1: 111 opt: 222 Z-score: 164.3 bits: 42.1 E(): 0.00049 Smith-Waterman score: 222; 20.968% identity (57.419% similar) in 310 aa overlap (448-749:237-529) 420 430 440 450 460 470 KIAA02 AQDHRSSLEEEQNLFIDVDCKHPEAILTPMPEGLSQQQVVRRY---ILGSVVDSEKNYVD :.:.. . . : .: .....:..: KIAA01 RTGWFPSNYVREVKASEKPVSPKSGTLKSPPKGFDTTAINKSYYNVVLQNILETENEYSK 210 220 230 240 250 260 480 490 500 510 520 530 KIAA02 ALKRILEQYEKPLSEMEPKVLSERKLKTVFYRVKEILQCHSLFQIALASRVSEWDSVEMI :. .: : .::. : :: ... .. ..:: . .... .: .. .. . . KIAA01 ELQTVLSTYLRPLQTSEK--LSSANISYLMGNLEEICSFQQMLVQSLEECTKLPEAQQRV 270 280 290 300 310 320 540 550 560 570 580 590 KIAA02 GDVFVASFSKSMVLDAYSEYVNNFSTAVAVLKKTCATKPAFLEFLKQEQEASPDRTTLYS : :. . . .: : : : .:: :: . . . ::.. . .:: .: . KIAA01 GGCFLNLMPQMKTL--YLTYCANHPSAVNVLTEH---SEELGEFMETKGASSPGILVLTT 330 340 350 360 370 600 610 620 630 640 650 KIAA02 LMMKPIQRFPQFILLLQDMLKNTSKGHPDRLPLQMALTELETLAEKLNE-RKRDADQRCE . ::..:. .. ::... .. : :: .: ... ...:. . .: ::: .. : KIAA01 GLSKPFMRLDKYPTLLKELERHMEDYHTDRQDIQKSMAAFKNLSAQCQEVRKR---KELE 380 390 400 410 420 430 660 670 680 690 700 710 KIAA02 VKQIAKAINERYLNKLLSSGS-RYLIRSDDMIETVYNDRGEIVKTKERRVFMLNDVLMCA .. ...:: . . . . :. :. :. .:. . .. . .:: .... .::. KIAA01 LQILTEAIRNWEGDDIKTLGNVTYM--SQVLIQCAGSE-----EKNERYLLLFPNVLLML 440 450 460 470 480 720 730 740 750 760 KIAA02 TVSSRPS---HDSRVMSSQRYLLKWSVPLGHVDAIEYGSSAGTGEHSRHLAVHPPESLAV ..: : : ..... .. . : .: .:.: ..: KIAA01 SASPRMSGFIYQGKLPTTGMTITKLEDSENHRNAFEISGSMIERILVSCNNQQDLQEWVE 490 500 510 520 530 540 770 780 790 800 810 820 KIAA02 VANAKPNKVYMGPGQLYQDLQNLLHDLNVIGQITQLIGNLKGNYQNLNQSVAHDWTSGLQ KIAA01 HLQKQTKVTSVGNPTIKPHSVPSHTLPSHPVTPSSKHADSKPAPLTPAYHTLPHPSHHGT 550 560 570 580 590 600 1405 residues in 1 query sequences 1986100 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:14:58 2008 done: Thu Dec 18 15:14:59 2008 Total Scan time: 0.800 Total Display time: 0.450 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]