# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/ha06353.fasta.huge -Q ../query/KIAA0292.ptfa ./tmplib.23147 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0292, 1716 aa vs ./tmplib.23147 library 1985789 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.2315+/-0.0101; mu= -15.2850+/- 0.683 mean_var=510.4377+/-123.462, 0's: 0 Z-trim: 3 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.056768 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1820 ( 1644 res) hh01321 (1644) 729 75.8 8.7e-14 >>KIAA1820 ( 1644 res) hh01321 (1644 aa) initn: 478 init1: 296 opt: 729 Z-score: 339.3 bits: 75.8 E(): 8.7e-14 Smith-Waterman score: 913; 25.580% identity (51.822% similar) in 1509 aa overlap (3-1389:207-1601) 10 20 30 KIAA02 SSFPSPQRFSQSGQSYDGSYNVNAGSQYEGHN ::. .: : .::. : . ... : :.. 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