# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hh10127a.fasta.nr -Q ../query/KIAA0285.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0285, 658 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7823387 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2129+/-0.000194; mu= 8.1288+/- 0.011 mean_var=106.0902+/-20.402, 0's: 40 Z-trim: 45 B-trim: 193 in 1/65 Lambda= 0.124519 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|46577674|sp|O14523.3|C2C2L_HUMAN RecName: Full= ( 706) 4288 781.2 0 gi|114640722|ref|XP_508807.2| PREDICTED: transmemb ( 706) 4273 778.5 0 gi|30314483|dbj|BAC76048.1| DLNB23 [Homo sapiens] ( 707) 4266 777.2 0 gi|114640720|ref|XP_001164505.1| PREDICTED: transm ( 707) 4251 774.5 0 gi|109108932|ref|XP_001102496.1| PREDICTED: transm ( 707) 4220 769.0 0 gi|73955040|ref|XP_853252.1| PREDICTED: similar to ( 707) 4002 729.8 7.4e-208 gi|148693629|gb|EDL25576.1| mCG10723 [Mus musculus ( 706) 3987 727.1 4.8e-207 gi|157279342|gb|AAI53270.1| C2CD2L protein [Bos ta ( 707) 3984 726.6 6.9e-207 gi|55250059|gb|AAH85925.1| Transmembrane protein 2 ( 706) 3982 726.2 8.9e-207 gi|46577418|sp|Q80X80.2|C2C2L_MOUSE RecName: Full= ( 706) 3982 726.2 8.9e-207 gi|74149069|dbj|BAE32190.1| unnamed protein produc ( 706) 3977 725.3 1.7e-206 gi|12836471|dbj|BAB23671.1| unnamed protein produc ( 674) 3830 698.9 1.4e-198 gi|114640724|ref|XP_001164464.1| PREDICTED: transm ( 643) 3827 698.3 2e-198 gi|109108934|ref|XP_001102403.1| PREDICTED: transm ( 643) 3801 693.7 5.1e-197 gi|26333127|dbj|BAC30281.1| unnamed protein produc ( 654) 3540 646.8 6.7e-183 gi|126326554|ref|XP_001370465.1| PREDICTED: simila ( 711) 3498 639.3 1.3e-180 gi|194212759|ref|XP_001917455.1| PREDICTED: simila ( 557) 3452 630.9 3.4e-178 gi|34783996|gb|AAH56612.1| C2cd2l protein [Mus mus ( 530) 3227 590.5 4.8e-166 gi|119587863|gb|EAW67459.1| transmembrane protein ( 612) 2959 542.4 1.7e-151 gi|29612452|gb|AAH49875.1| C2cd2l protein [Mus mus ( 479) 2928 536.7 6.5e-150 gi|21619834|gb|AAH33083.1| C2CD2L protein [Homo sa ( 401) 2593 476.5 7.4e-132 gi|118101808|ref|XP_425792.2| PREDICTED: similar t ( 680) 2442 449.6 1.6e-123 gi|119587861|gb|EAW67457.1| transmembrane protein ( 407) 2370 436.5 8.6e-120 gi|126326556|ref|XP_001370485.1| PREDICTED: simila ( 717) 2298 423.7 1e-115 gi|23271789|gb|AAH35271.1| C2cd2l protein [Mus mus ( 361) 2073 383.1 9.1e-104 gi|30353962|gb|AAH52246.1| C2CD2L protein [Homo sa ( 327) 2064 381.4 2.6e-103 gi|115528172|gb|AAI24780.1| C2cd2-like [Danio reri ( 708) 1720 319.9 1.9e-84 gi|122891010|emb|CAM13146.1| novel protein similar ( 712) 1720 319.9 1.9e-84 gi|33874839|gb|AAH10071.2| C2CD2L protein [Homo sa ( 267) 1689 314.0 4.2e-83 gi|31455219|gb|AAH03598.2| C2CD2L protein [Homo sa ( 267) 1681 312.5 1.1e-82 gi|120577600|gb|AAI30099.1| LOC100037006 protein [ ( 684) 1509 281.9 4.7e-73 gi|47222508|emb|CAG02873.1| unnamed protein produc ( 704) 1098 208.1 8.1e-51 gi|149270188|ref|XP_921158.3| PREDICTED: hypotheti ( 276) 1035 196.5 1e-47 gi|148677534|gb|EDL09481.1| mCG1033299 [Mus muscul ( 180) 1030 195.5 1.3e-47 gi|149270119|ref|XP_001478994.1| PREDICTED: hypoth ( 492) 1035 196.7 1.6e-47 gi|197246675|gb|AAI68487.1| Unknown (protein for M ( 392) 887 170.0 1.3e-39 gi|118083937|ref|XP_416741.2| PREDICTED: similar t ( 707) 766 148.5 7.3e-33 gi|149742331|ref|XP_001491360.1| PREDICTED: C2 cal ( 696) 741 144.0 1.6e-31 gi|109065242|ref|XP_001106893.1| PREDICTED: hypoth ( 696) 736 143.1 3e-31 gi|74001475|ref|XP_544899.2| PREDICTED: hypothetic ( 711) 721 140.4 2e-30 gi|114684399|ref|XP_001135072.1| PREDICTED: simila ( 696) 709 138.2 8.7e-30 gi|7768739|dbj|BAA95528.1| C21orf258 [Homo sapiens ( 734) 698 136.3 3.6e-29 gi|85681926|sp|Q9Y426.2|CU025_HUMAN RecName: Full= ( 696) 697 136.1 3.9e-29 gi|149633835|ref|XP_001511393.1| PREDICTED: simila ( 810) 688 134.5 1.3e-28 gi|148671698|gb|EDL03645.1| RIKEN cDNA 5830404H04, ( 631) 636 125.1 7.2e-26 gi|74180716|dbj|BAE25577.1| unnamed protein produc ( 582) 634 124.7 8.6e-26 gi|74199524|dbj|BAE41447.1| unnamed protein produc ( 582) 631 124.2 1.3e-25 gi|149060266|gb|EDM10980.1| similar to RIKEN cDNA ( 631) 626 123.3 2.5e-25 gi|38382873|gb|AAH62389.1| Similar to RIKEN cDNA 5 ( 696) 626 123.3 2.7e-25 gi|149060267|gb|EDM10981.1| similar to RIKEN cDNA ( 569) 591 117.0 1.8e-23 >>gi|46577674|sp|O14523.3|C2C2L_HUMAN RecName: Full=C2 d (706 aa) initn: 4288 init1: 4288 opt: 4288 Z-score: 4165.6 bits: 781.2 E(): 0 Smith-Waterman score: 4288; 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