# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/ha06833.fasta.huge -Q ../query/KIAA0277.ptfa ./tmplib.23147 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0277, 583 aa vs ./tmplib.23147 library 1986922 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.2949+/-0.00552; mu= 18.1276+/- 0.377 mean_var=105.4922+/-24.501, 0's: 0 Z-trim: 8 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.124872 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0313 ( 1508 res) hg00186 (1508) 576 115.4 3.2e-26 KIAA0351 ( 590 res) hg01609 ( 590) 310 66.9 5.2e-12 KIAA0846 ( 691 res) hk05386 ( 691) 247 55.6 1.5e-08 KIAA0959 ( 820 res) hj05718 ( 820) 187 44.9 2.9e-05 KIAA1308 ( 745 res) fh08652 ( 745) 155 39.1 0.0015 >>KIAA0313 ( 1508 res) hg00186 (1508 aa) initn: 625 init1: 335 opt: 576 Z-score: 562.6 bits: 115.4 E(): 3.2e-26 Smith-Waterman score: 582; 29.341% identity (60.080% similar) in 501 aa overlap (65-535:422-914) 40 50 60 70 80 90 KIAA02 FDVPYFKYIDEEDEDDEWSSRSQSSTEDDSVDSLLSDRYVVVSGTP--EKILEHLLNDLH :::. : .. .: ..::: .: . 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