# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/ha06690.fasta.huge -Q ../query/KIAA0274.ptfa ./tmplib.23147 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0274, 932 aa vs ./tmplib.23147 library 1986573 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3126+/-0.00535; mu= 15.8360+/- 0.365 mean_var=109.0405+/-25.276, 0's: 0 Z-trim: 6 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.122823 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0966 ( 1150 res) hj06369 (1150) 253 56.3 2.5e-08 KIAA0851 ( 607 res) hk06032 ( 607) 249 55.2 2.7e-08 KIAA0910 ( 1315 res) hg02207s1 (1315) 206 48.0 8.9e-06 KIAA0348 ( 1443 res) hg01551(revised) (1443) 189 45.0 7.6e-05 >>KIAA0966 ( 1150 res) hj06369 (1150 aa) initn: 508 init1: 131 opt: 253 Z-score: 241.3 bits: 56.3 E(): 2.5e-08 Smith-Waterman score: 481; 25.976% identity (53.153% similar) in 666 aa overlap (176-799:185-790) 150 160 170 180 190 200 KIAA02 GHAIYKVEDTNMIYIPNDSVRVTHPDEARYLRIFQNVDLSSNFYFSYSYDLSHSLQYNLT :..:.. : .::.: .:::..:.: . : KIAA09 IKSNVSAPNKKKVKESKEKEKLERRLLEELLKMFMD---SESFYYSLTYDLTNSVQRQST 160 170 180 190 200 210 210 220 230 240 250 260 KIAA02 VLR--MPL-EMLKSEMTQNRQESFDIFEDEGLITQGGSGVFGICSEPYMK-YVWNGELLD : :: . . ... :. ...: .:. :. . :... .: :: KIAA09 GERDGRPLWQKVDDRFFWNKY----MIQD---LTEIGTPDVDFWIIPMIQGFVQIEEL-- 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 KIAA02 IIKSTVHRDWLLYIIHGFCGQSKLLIYGRPVY-VTLIARRSSKFAGTRFLKRGANCEGDV ... : : . .: . .: . :.::.::: . :: :. .::.. .:.: KIAA09 VVNYTESSDDEKSSPETPPQESTCVDDIHPRFLVALISRRSRHRAGMRYKRRGVDKNGNV 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 KIAA02 ANEVETEQILCDASVMSFTAGSYSSYVQVRGSVPLYWSQDISTMMPKPPITLDQADPFAH :: :::::.. : . : :.::.:::::..::: . :.: . .. . :. 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KIAA08 AFDFHKECKNMR---WDRLSILLDQVAE-----MQDELSYFLV--------DSAGQVVAN 360 370 380 390 400 500 510 520 530 540 550 KIAA02 GRLQTGILRTNCVDCLDRTNTAQFMVGKCALAYQLYSLGLID-KPNLQFDTDAVRLFEEL : :..:.::.:::::::. : .... .: :: ::.. .:. . . ..... KIAA08 ---QEGVFRSNCMDCLDRTNVIQSLLARRSLQAQLQRLGVLHVGQKLEEQDEFEKIYKNA 410 420 430 440 450 560 570 580 590 600 610 KIAA02 YEDHGDTLSLQYGGSQLVHRVKTYRKIAPWTQHSKDIMQ---TLSRYYSNAFSDADRQDS . :.... . ::.:. .. . . . : : ::. .. :::.: :::. :::: KIAA08 WADNANACAKQYAGTGALK--TDFTRTGKRT-HLGLIMDGWNSMIRYYKNNFSDGFRQDS 460 470 480 490 500 510 620 630 640 650 660 670 KIAA02 INLFLGVFHPTEGKPHL-WELPTDFYLHHKNTMRLLPTRRSYTYWWTPEVIKHLPLPYDE :.:::: . : . : .: :. KIAA08 IDLFLGNYSVDELESHSPLSVPRDWKFLALPIIMVVAFSMCIICLLMAGDTWTETLAYVL 520 530 540 550 560 570 >>KIAA0910 ( 1315 res) hg02207s1 (1315 aa) initn: 417 init1: 175 opt: 206 Z-score: 195.6 bits: 48.0 E(): 8.9e-06 Smith-Waterman score: 471; 27.346% identity (54.045% similar) in 618 aa overlap (23-620:3-516) 10 20 30 40 50 KIAA02 GVFSPSLLGRSGGSCPVVGPPFAAAMPTAA-APIISSVQKLVLYETRARYFLVGSNNAET ::: ::.. : . :.: . : : : . KIAA09 GAAAARPTGSRAGGRLQDQSLPPQRQRERAASEERRMAFS 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 KIAA02 K-YRVL-KIDRTEPKDLVIIDDRHVYTQQEVRELLGRLD-LGNRTKMGQKGSSGLFRAVS : .:. :.: : .:.. :: .. . : . :.. : . ::. . .... KIAA09 KGFRIYHKLD--PPPFSLIVETRH--KEECLMFESGAVAVLSSAEKEAIKGTYS--KVLD 50 60 70 80 90 120 130 140 150 160 170 KIAA02 AFGVVGFVRFLEG----YYIVLITKRRKMADIGGHAIYKVEDTNMIYIPNDSVRVTHPDE :.:..: .:. : .:.::.: ... : ...: .:..: :.:. :: KIAA09 AYGLLGVLRLNLGDTMLHYLVLVTGCMSVGKIQESEVFRVTSTEFI-----SLRIDSSDE 100 110 120 130 140 180 190 200 210 220 230 KIAA02 ARYLRIFQNVDLSSNFYFSYSYDLSHSLQYNLTVLRMPLEMLKSEMTQNRQESFDIFEDE : .. . .. :.::::..: . . ::. .:.. : .. . :.:: KIAA09 DRISEVRKVLN-SGNFYFAWSAS-GISLDLSLNAHR----SMQEQTTDNR---------- 150 160 170 180 190 240 250 260 270 280 KIAA02 GLITQGGSGVFGICSEPYMKYVWNGEL-LDIIKSTVH-RDWLLYIIHGFCGQSKL-LIYG . :: : : . . :. :::: .. :: .. ::. KIAA09 --------------------FFWNQSLHLHLKHYGVNCDDWLLRLM---CGGVEIRTIYA 200 210 220 230 290 300 310 320 330 340 KIAA02 --RPVYVTLIARRSSKFAGTRFLKRGANCEGDVANEVETEQILCDASVMSFTAGSYSSYV . . . ::.: : . ::::: ::.: .: ::: :::::.. . : ::.. KIAA09 AHKQAKACLISRLSCERAGTRFNVRGTNDDGHVANFVETEQVV-------YLDDSVSSFI 240 250 260 270 280 350 360 370 380 390 400 KIAA02 QVRGSVPLYWSQDISTMMPKPPITLDQA-DPFAHVAALHFDQMFQRFGSPIIILNLVKER :.::::::.: : . .. . . .... . : . :: . . .:. ::. ::. . KIAA09 QIRGSVPLFWEQP-GLQVGSHRVRMSRGFEANAPAFDRHFRTLKNLYGKQIIV-NLLGSK 290 300 310 320 330 340 410 420 430 440 450 460 KIAA02 EKRKHERILSEELVAAVTYLNQFLPPEHT--IVYIPWDMAKYTKSKLCNVLDRLNVIAES : :..::. .. ... ::. : .. .:. ...:. . ..:. . . KIAA09 EG---EHMLSK------AFQSHLKASEHAADIQMVNFDYHQMVKG---GKAEKLHSVLKP 350 360 370 380 470 480 490 500 510 520 KIAA02 VVKKT---GFFVNRPDSYCSILRPDEKWNELGGCVIPTGRLQTGILRTNCVDCLDRTNTA :.: ::: ..: . : :.: .::::.:::::::.. 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