# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/ha07065.fasta.nr -Q ../query/KIAA0257.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0257, 1805 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7814793 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7763+/-0.000208; mu= 9.0335+/- 0.012 mean_var=145.9679+/-27.402, 0's: 25 Z-trim: 60 B-trim: 0 in 0/65 Lambda= 0.106156 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 42, opt: 30, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|158518638|sp|Q92545.2|TM131_HUMAN RecName: Full (1834) 11941 1842.1 0 gi|150456424|ref|NP_056163.1| RW1 protein [Homo sa (1883) 11941 1842.1 0 gi|119622321|gb|EAX01916.1| hCG1735290, isoform CR (1834) 11927 1839.9 0 gi|114579058|ref|XP_515638.2| PREDICTED: RW1 prote (1883) 11893 1834.7 0 gi|114579060|ref|XP_001155973.1| PREDICTED: RW1 pr (1770) 11657 1798.6 0 gi|73970090|ref|XP_531794.2| PREDICTED: similar to (1765) 11242 1735.0 0 gi|148682564|gb|EDL14511.1| transmembrane protein (1817) 10875 1678.8 0 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m ( 594) 3413 535.6 5.1e-149 gi|210124217|gb|EEA71915.1| hypothetical protein B (1833) 2502 396.5 1.1e-106 gi|210121973|gb|EEA69682.1| hypothetical protein B (1812) 2497 395.7 1.9e-106 gi|194387016|dbj|BAG59874.1| unnamed protein produ ( 322) 1851 296.1 3.4e-77 gi|112180425|gb|AAH36841.1| TMEM131 protein [Homo ( 263) 1755 281.3 7.8e-73 gi|156552485|ref|XP_001602004.1| PREDICTED: simila (1798) 1764 283.5 1.2e-72 gi|198430551|ref|XP_002123137.1| PREDICTED: simila (2440) 1709 275.2 5.1e-70 gi|156220855|gb|EDO41717.1| predicted protein [Nem ( 920) 1542 249.2 1.3e-62 gi|47218903|emb|CAG05669.1| unnamed protein produc (1848) 1525 246.9 1.3e-61 gi|193903685|gb|EDW02552.1| GH22058 [Drosophila gr (1656) 1210 198.6 3.9e-47 gi|189236393|ref|XP_970963.2| PREDICTED: similar t (1506) 1199 196.9 1.2e-46 gi|212515008|gb|EEB17219.1| transmembrane protein, (1845) 1174 193.1 1.9e-45 gi|194157164|gb|EDW72065.1| GK10747 [Drosophila wi (1616) 1149 189.2 2.5e-44 gi|194110832|gb|EDW32875.1| GL10117 [Drosophila pe (1744) 1131 186.5 1.8e-43 gi|215505408|gb|EEC14902.1| conserved hypothetical (1141) 1064 176.1 1.6e-40 gi|198137196|gb|EAL26444.2| GA21027 [Drosophila ps (1694) 1062 175.9 2.6e-40 gi|193910387|gb|EDW09254.1| GI19143 [Drosophila mo (1682) 1037 172.1 3.7e-39 gi|108878290|gb|EAT42515.1| conserved hypothetical (1931) 1028 170.8 1.1e-38 gi|126331471|ref|XP_001375836.1| PREDICTED: hypoth (1612) 985 164.1 9e-37 gi|118089752|ref|XP_420366.2| PREDICTED: hypotheti (1686) 985 164.1 9.3e-37 gi|165971482|gb|AAI58192.1| LOC100144926 protein [ (1055) 950 158.6 2.7e-35 gi|109464986|ref|XP_001054490.1| PREDICTED: simila (1533) 942 157.5 8.4e-35 gi|12053359|emb|CAB66866.1| hypothetical protein [ (1239) 929 155.4 2.8e-34 gi|182691583|sp|A2VDJ0.2|T131L_HUMAN RecName: Full (1609) 929 155.5 3.4e-34 gi|196114949|ref|NP_001124479.1| hypothetical prot (1610) 929 155.5 3.4e-34 gi|123787495|sp|Q3U3D7.1|T131L_MOUSE RecName: Full (1597) 928 155.4 3.8e-34 gi|194208388|ref|XP_001499777.2| PREDICTED: simila (1461) 927 155.2 4e-34 gi|221126657|ref|XP_002158596.1| PREDICTED: simila (1098) 924 154.6 4.4e-34 gi|38566238|gb|AAH62940.1| D930015E06Rik protein [ (1386) 924 154.7 5.3e-34 gi|193787309|dbj|BAG52515.1| unnamed protein produ (1054) 915 153.2 1.1e-33 >>gi|158518638|sp|Q92545.2|TM131_HUMAN RecName: Full=Tra (1834 aa) initn: 11941 init1: 11941 opt: 11941 Z-score: 9883.9 bits: 1842.1 E(): 0 Smith-Waterman score: 11941; 100.000% identity (100.000% similar) in 1805 aa overlap (1-1805:30-1834) 10 20 30 KIAA02 GGLLQTETTLGLSSYQQKSISLYRGNCRPIR ::::::::::::::::::::::::::::::: gi|158 MTLVVAAARAEKEAFVQSESIIEVLRFDDGGLLQTETTLGLSSYQQKSISLYRGNCRPIR 10 20 30 40 50 60 40 50 60 70 80 90 KIAA02 FEPPMLDFHEQPVGMPKMEKVYLHNPSSEETITLVSISATTSHFHASFFQNRKILPGGNT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|158 FEPPMLDFHEQPVGMPKMEKVYLHNPSSEETITLVSISATTSHFHASFFQNRKILPGGNT 70 80 90 100 110 120 100 110 120 130 140 150 KIAA02 SFDVVFLARVVGNVENTLFINTSNHGVFTYQVFGVGVPNPYRLRPFLGARVPVNSSFSPI 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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::: gi|114 FTEQPPSPLPKSKGKGKPLQRKVKPPKKQEEKEKKGKGKSQEDELKDSLADDDSSSTTTE 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1360 1370 1380 1390 1400 1410 KIAA02 TSNPDTEPLLKEDTEKQKGKQAMPEKHESEMSQVKQKSKKLLNIKKEIPTDVKPSSLELP ::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|114 TSNPDTELLLKEDTEKQKGKQAMPEKHESEMSQVKQKSKKLLNIKKEIPTDVKPSSLELP 1430 1440 1450 1460 1470 1480 1420 1430 1440 1450 1460 1470 KIAA02 YTPPLESKQRRNLPSKIPLPTAMTSGSKSRNAQKTKGTSKLVDNRPPALAKFLPNSQELG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|114 YTPPLESKQRRNLPSKIPLPTAMTSGSKSRNAQKTKGTSKLVDNRPPALAKFLPNSQELG 1490 1500 1510 1520 1530 1540 1480 1490 1500 1510 1520 1530 KIAA02 NTSSSEGEKDSPPPEWDSVPVHKPGSSTDSLYKLSLQTLNADIFLKQRQTSPTPASPSPP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|114 NTSSSEGEKDSPPPEWDSVPVHKPGSSTDSLYKLSLQTLNADIFLKQRQTSPTPASPSPP 1550 1560 1570 1580 1590 1600 1540 1550 1560 1570 1580 1590 KIAA02 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