# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/ha02538.fasta.huge -Q ../query/KIAA0230.ptfa ./tmplib.23147 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0230, 1496 aa vs ./tmplib.23147 library 1986009 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.3089+/-0.00594; mu= 22.8761+/- 0.405 mean_var=119.1715+/-28.998, 0's: 0 Z-trim: 42 B-trim: 131 in 1/39 Lambda= 0.117487 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1568 ( 1380 res) fh22308 (1380) 597 113.8 2.3e-25 KIAA0813 ( 1618 res) pf00581 (1618) 490 95.8 7.1e-20 KIAA1514 ( 1598 res) fh00815(revised) (1598) 457 90.2 3.4e-18 KIAA0343 ( 1187 res) hg01457 (1187) 416 83.1 3.6e-16 KIAA1465 ( 785 res) fh13187 ( 785) 411 81.9 5.3e-16 KIAA0756 ( 1222 res) ff01911 (1222) 412 82.4 5.8e-16 KIAA0814 ( 1559 res) fh16048 (1559) 410 82.2 8.4e-16 KIAA1355 ( 1189 res) fj01564 (1189) 402 80.7 1.9e-15 KIAA1580 ( 640 res) fj04979 ( 640) 399 79.7 1.9e-15 KIAA1484 ( 700 res) fj06928 ( 700) 372 75.2 4.8e-14 KIAA1132 ( 2092 res) hh01132s1 (2092) 376 76.7 5.3e-14 KIAA1163 ( 437 res) hj05329 ( 437) 343 70.0 1.2e-12 KIAA0918 ( 966 res) hk09360(revised) ( 966) 345 70.9 1.4e-12 KIAA1867 ( 779 res) fj18636 ( 779) 343 70.4 1.5e-12 KIAA1531 ( 1206 res) ph00937 (1206) 334 69.2 5.5e-12 KIAA0848 ( 988 res) hk05607 ( 988) 311 65.1 7.5e-11 KIAA0405 ( 706 res) hg01274 ( 706) 306 64.0 1.1e-10 KIAA0992 ( 772 res) hk07554 ( 772) 297 62.6 3.4e-10 KIAA1496 ( 920 res) fj09513 ( 920) 297 62.7 3.7e-10 KIAA1556 ( 1595 res) fh18619 (1595) 294 62.6 7e-10 KIAA1904 ( 821 res) af00058 ( 821) 276 59.1 4.2e-09 KIAA1851 ( 523 res) hg04492 ( 523) 273 58.2 4.7e-09 KIAA1910 ( 760 res) fh21867 ( 760) 272 58.3 6.4e-09 KIAA0806 ( 1073 res) hk04165(revised) (1073) 271 58.4 8.6e-09 KIAA1061 ( 693 res) hj00491 ( 693) 267 57.4 1.1e-08 KIAA1297 ( 2242 res) fg03883 (2242) 264 57.7 2.8e-08 KIAA0416 ( 529 res) hh00236 ( 529) 254 55.0 4.4e-08 KIAA0644 ( 887 res) hj03618 ( 887) 256 55.7 4.5e-08 KIAA1916 ( 542 res) hg01117 ( 542) 250 54.4 7.1e-08 KIAA0657 ( 1237 res) hk01859s1 (1237) 251 55.1 9.6e-08 KIAA1246 ( 832 res) hh00149a ( 832) 240 53.0 2.9e-07 KIAA1854 ( 572 res) fg02232 ( 572) 234 51.7 4.8e-07 KIAA1497 ( 730 res) hg01608 ( 730) 218 49.1 3.6e-06 KIAA1628 ( 980 res) fh14247(revised) ( 980) 197 45.8 4.9e-05 KIAA1263 ( 850 res) hj00608 ( 850) 193 45.0 7.3e-05 KIAA0862 ( 584 res) hk06532 ( 584) 191 44.4 7.6e-05 KIAA0563 ( 1652 res) fh23589 (1652) 191 45.2 0.00013 KIAA1777 ( 954 res) fh19201x1 ( 954) 166 40.5 0.0018 KIAA1639 ( 2584 res) af14886 (2584) 161 40.4 0.0055 KIAA1469 ( 662 res) fj01881 ( 662) 154 38.2 0.0063 >>KIAA1568 ( 1380 res) fh22308 (1380 aa) initn: 367 init1: 254 opt: 597 Z-score: 547.4 bits: 113.8 E(): 2.3e-25 Smith-Waterman score: 757; 30.303% identity (58.788% similar) in 495 aa overlap (234-711:107-581) 210 220 230 240 250 260 KIAA02 LRLDSNTLHCDCEILWLADLLKTYAESGNAQAAAICEYPRRIQGRSVATITPEELNCERP ... .: : :..:. . :. : KIAA15 KDDPRSHRMLLPSGSLFFLRIVHGRRSKPDEGSYVC-VARNYLGEAVSRNASLEVALLRD 80 90 100 110 120 130 270 280 290 300 310 320 KIAA02 RITSEPQDADVTSGNTVYFTCRA-EGNPKPEIIWLRNNNELSMKTDSRLNLLDDGTLMIQ . ..: :. :..:. . . :. .:.:.: : : ... ... : . :... : :::. 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KIAA15 RCSVSPTGDLTITNIQRSDAGYYICQALTVAGSILAKAQLEVTDVLTDRPPPIILQGPAN 370 380 390 400 410 420 560 570 580 590 600 KIAA02 TTVEVGANVQLPCSSQGEPEPAITWNKDGVQVT-ESGKFHISPEGFLTINDVGPADAGRY :. : ... : :.. :.: :.:.: :.: .. . :. .: : :... .:.: : KIAA15 QTLAVDGTALLKCKATGDPLPVISWLKEGFTFPGRDPRATIQEQGTLQIKNLRISDTGTY 430 440 450 460 470 480 610 620 630 640 650 660 KIAA02 ECVARNTIGSASVSMVLSVNVPD--VSRNGDPFVATSIVEAIATVDRAINSTRTHLFDS- ::: .. : .: : ::.:. .:.: : : . . . .. . :.. . : KIAA15 TCVATSSSGETSWSAVLDVTESGATISKNYD----LSDLPGPPSKPQVTDVTKNSVTLSW 490 500 510 520 530 540 670 680 690 700 710 720 KIAA02 RPRSPNDLLALFRYPRDPYTVEQARAGEIFERTLQLIQEHVQHGLMVDLNGTSYHYNDLV .: .:. : : . : .: .. . : . .::. : KIAA15 QPGTPGTL------PASAYIIEAF--SQSVSNSWQTVANHVKTTLYTVRGLRPNTIYLFM 550 560 570 580 590 730 740 750 760 770 780 KIAA02 SPQYLNLIANLSGCTAHRRVNNCSDMCFHQKYRTHDGTCNNLQHPMWGASLTAFERLLKS KIAA15 VRAINPQGLSDPSPMSDPVRTQDISPPAQGVDHRQVQKELGDVLVRLHNPVVLTPTTVQV 600 610 620 630 640 650 >>KIAA0813 ( 1618 res) pf00581 (1618 aa) initn: 374 init1: 374 opt: 490 Z-score: 448.7 bits: 95.8 E(): 7.1e-20 Smith-Waterman score: 490; 35.510% identity (61.224% similar) in 245 aa overlap (53-289:366-606) 30 40 50 60 70 80 KIAA02 RGPGRRCLLALVLFCAWGTLAVVAQKPGAGCPSRCLCFRTTVRCMHLLLEAVPAVAPQT- ::. : : : : : :.:: :.: KIAA08 NVAEVQKSEFSCSGQGEAGRVPTCTLSSGSCPAMCTCSNGIVDCRGKGLTAIPANLPETM 340 350 360 370 380 390 90 100 110 120 130 140 KIAA02 SILDLRFNRIREIQPGAFRRLRNLNTLLLNNNQIKRIPSGAFEDLENLKYLYLYKNEIQS . . :..: :. : :::: :.: . :.:::: .: ::. :..:. : :: :.: . KIAA08 TEIRLELNGIKSIPPGAFSPYRKLRRIDLSNNQIAEIAPDAFQGLRSLNSLVLYGNKITD 400 410 420 430 440 450 150 160 170 180 190 200 KIAA02 IDRQAFKGLASLEQLYLHFNQIETLDPDSFQHLPKLERLFLHNNRITHLVPGTFNHLESM . : .: :: .:. : :. :.:. . ::.:: : .: : :..:.: :. :::. :... KIAA08 LPRGVFGGLYTLQLLLLNANKINCIRPDAFQDLQNLSLLSLYDNKIQSLAKGTFTSLRAI 460 470 480 490 500 510 210 220 230 240 250 260 KIAA02 KRLRLDSNTLHCDCEILWLADLLKTYA-ESGNAQAAAICEYPRRIQGRSVATITPEELNC . :.: .: . :::.. ::::.:.: :...:. : :::. .. .. : ... : KIAA08 QTLHLAQNPFICDCNLKWLADFLRTNPIETSGAR----CASPRRLANKRIGQIKSKKFRC 520 530 540 550 560 570 270 280 290 300 310 KIAA02 ER------PRITSEPQDADVTSGNTVYFTCRAEGNPKPEIIWLRNNNELSMKTDSRLNLL : . ... .: . :: :.: KIAA08 SAKEQYFIPGTEDYQLNSECNSDVVCPHKCRCEANVVECSSLKLTKIPERIPQSTAELRL 580 590 600 610 620 630 320 330 340 350 360 370 KIAA02 DDGTLMIQNTQETDQGIYQCMAKNVAGEVKTQEVTLRYFGSPARPTFVIQPQNTEVLVGE KIAA08 NNNEISILEATGMFKKLTHLKKINLSNNKVSEIEDGAFEGAASVSELHLTANQLESIRSG 640 650 660 670 680 690 >>KIAA1514 ( 1598 res) fh00815(revised) (1598 aa) initn: 181 init1: 176 opt: 457 Z-score: 418.6 bits: 90.2 E(): 3.4e-18 Smith-Waterman score: 460; 28.723% identity (57.713% similar) in 376 aa overlap (280-639:3-371) 250 260 270 280 290 300 KIAA02 VATITPEELNCERPRITSEPQDADVTSGNTVYFTCRAEGNPKPEIIWLRNNNELSMKTDS : . :.:.: : : : : .. . .. . KIAA15 KVVDIPCQAKGVPPPSITWYKDAAVVEVEKLT 10 20 30 310 320 330 340 350 360 KIAA02 RLNLLDDGTLMIQNTQETDQGIYQCMAKNVAGEVKTQEVTLRYFGSPARPTFVIQPQNTE :. .:: :.:.. : :..::.:.:.::::.:. : : : :... : .. KIAA15 RFRQRNDGGLQISGLVPDDTGMFQCFARNAAGEVQTS--TYLAVTSIA-PNITRGPLDST 40 50 60 70 80 370 380 390 400 410 420 KIAA02 VLVGESVTLECSATGHPPPRISWTRGDR--TPLPVD-PRVNITPSGGLYIQNVVQGDSGE :. : ::.: : ..: : : :.: .:.: . :. :: . ::.: :. . .:.: KIAA15 VIDGMSVVLACETSGAPRPAITWQKGERILASGSVQLPRFTPLESGSLLISPTHISDAGT 90 100 110 120 130 140 430 440 450 460 470 480 KIAA02 YACSATNNIDSVHATAFIIVQALPQFTVTPQDRVVIEGQTVDFQCEAKGNPPPVI--AWT :.: :::. .:.: ..: : ..: :::. ::.: ... : . .: .: : KIAA15 YTCLATNSRGVDEASADLVVWARTRITKPPQDQSVIKGTQASMVCGVTHDPRVTIRYIWE 150 160 170 180 190 200 490 500 510 520 530 540 KIAA02 KGGSQLSVDR--RHLVLSSGTLRISGVALHDQGQYECQAVNIIGSQKVVAHLTVQPRVTP : :. :... : . .:.:.:: . : : : :.... :... ::: :. KIAA15 KDGATLGTESHPRIRLDRNGSLHISQTWSGDIGTYTCRVISAGGNDSRSAHLRVRQLPHA 210 220 230 240 250 260 550 560 570 580 590 KIAA02 VFASIPSDTTVEVGA-NVQLPCSSQGEPEPAITWNKDGVQVTESGK------FHISPEGF . . .::: : :. .:. : : . ....:.. ..:.. KIAA15 PEHPVATLSTVERRAINLTWTKPFDGNS-PLIRYI---LEMSENNAPWTVLLASVDPKAT 270 280 290 300 310 320 600 610 620 630 640 650 KIAA02 -LTINDVGPADAGRYECVARNTIGSASVSM-VLSVNVPDVSRNGDPFVATSIVEAIATVD .:.. . :: . ... : : .:... : . :..:. .. : KIAA15 SVTVKGLVPARSYQFRLCAVNDVGKGQFSKDTERVSLPEEPPTAPPQNVIASGRTNQSIM 330 340 350 360 370 380 660 670 680 690 700 710 KIAA02 RAINSTRTHLFDSRPRSPNDLLALFRYPRDPYTVEQARAGEIFERTLQLIQEHVQHGLMV KIAA15 IQWQPPPESHQNGILKGYIIRYCLAGLPVGYQFKNITDADVNNLLLEDLIIWTNYEIEVA 390 400 410 420 430 440 >>KIAA0343 ( 1187 res) hg01457 (1187 aa) initn: 271 init1: 183 opt: 416 Z-score: 382.2 bits: 83.1 E(): 3.6e-16 Smith-Waterman score: 587; 33.167% identity (59.102% similar) in 401 aa overlap (246-631:239-624) 220 230 240 250 260 270 KIAA02 EILWLADLLKTYAESGNAQAAAICEYPRRIQGRSVATITPEELNCERPRITSEPQ----D : :: .:. . . ::: :. . KIAA03 LYFSNVLPEDTREDYICYARFNHTQTIQQKQPISVKVISAKS-SRERPPTFLTPEGNASN 210 220 230 240 250 260 280 290 300 310 320 330 KIAA02 ADVTSGNTVYFTCRAEGNPKPEIIWLRNNNELSMKTDSRLNLLDDGTLMIQNTQETDQGI . ::.. . : ::: : : : : .... : . :. . ::.: ...:.:.: KIAA03 KEELRGNVLSLECIAEGLPTPIIYWAKEDGMLPKNRTVYKNF--EKTLQIIHVSEADSGN 270 280 290 300 310 320 340 350 360 370 380 390 KIAA02 YQCMAKNVAGEVKTQEVTLRYFGSPARPTFVIQPQNTEVLVGESVTLECSATGHPPPRIS :::.:::. : .. . ...: : : .. ::: . ::. :: : :.:.: :::: KIAA03 YQCIAKNALGAIH-HTISVRV---KAAPYWITAPQNLVLSPGEDGTLICRANGNPKPRIS 330 340 350 360 370 380 400 410 420 430 440 KIAA02 W-TRGDRTPL---PVDPRVNITPSGGLYIQNVVQGDSGEYACSATNNIDSVHATAFIIVQ : : : .:. : :: .: . . ..:: . .:. : :.:.:. . :.::. : KIAA03 WLTNG--VPIEIAPDDPSRKID-GDTIIFSNVQERSSAVYQCNASNEYGYLLANAFVNVL 390 400 410 420 430 450 460 470 480 490 500 KIAA02 ALPQFTVTPQDRV--VIEGQTVDFQCEAKGNPPPVIAWTKG--GSQLSVDRRHLVLSSGT : : .:: . . :: .. . ..: :.: :.: : :: :: : : ... .:: KIAA03 AEPPRILTPANTLYQVIANRPALLDCAFFGSPLPTIEWFKGAKGSALHEDI-YVLHENGT 440 450 460 470 480 490 510 520 530 540 550 560 KIAA02 LRISGVALHDQ-GQYECQAVNIIGSQKVVAHLTVQPRVTPVFASIPSDTTVEVGANVQLP :.: :: .:. : : : : : .: : .:: .. . : . : ..:. :. :.. KIAA03 LEIP-VAQKDSTGTYTCVARNKLGMAKNEVHLEIKDATWIV--KQPEYAVVQRGSMVSFE 500 510 520 530 540 550 570 580 590 600 610 620 KIAA02 CSSQGEPEPAIT--WNKDGVQVTESGKFHISPEGFLTINDVGPADAGRYECVARNTIGSA :. . . ..: : ::. .. . .: .. . :.. ::. :.: : ::: .:. :. KIAA03 CKVKHDHTLSLTVLWLKDNRELPSDERFTVDKD-HLVVADVSDDDSGTYTCVANTTLDSV 560 570 580 590 600 610 630 640 650 660 670 680 KIAA02 SVSMVLSVNVPDVSRNGDPFVATSIVEAIATVDRAINSTRTHLFDSRPRSPNDLLALFRY :.: :::: .: KIAA03 SASAVLSVVAPTPTPAPVYDVPNPPFDLELTDQLDKSVQLSWTPGDDNNSPITKFIIEYE 620 630 640 650 660 670 >>KIAA1465 ( 785 res) fh13187 (785 aa) initn: 355 init1: 308 opt: 411 Z-score: 379.2 bits: 81.9 E(): 5.3e-16 Smith-Waterman score: 412; 28.431% identity (55.882% similar) in 306 aa overlap (12-296:14-312) 10 20 30 40 KIAA02 SRPWWLRASERPSAPSAMAKRSRGP-----GRRCLLALV-----LFCAWGTLAVVAQK :. : . .:. .: .:: : : . :. .:. :.:... KIAA14 GHNTCVYLAWAIFPALPRRVWRRGFSPRTFTESRRILGAAMFPLRALWLVWALLGVAGS- 10 20 30 40 50 50 60 70 80 90 100 KIAA02 PGAGCPSRCLCFRTTVR----CMHLLLEAVPAVAP-QTSILDLRFNRIREIQPGAFRRLR :: : : .. : . :. :: : ... :.: :.: .. ::: . KIAA14 ----CPEPCACVDKYAHQFADCAYKELREVPEGLPANVTTLSLSANKITVLRRGAFADVT 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 KIAA02 NLNTLLLNNNQIKRIPSGAFEDLENLKYLYLYKNEIQSIDRQAFKGLASLEQLYLHFNQI ....: : .:... . ::. : .:: : : .: :.:. . ...:..:. : .. :.. KIAA14 QVTSLWLAHNEVRTVEPGALAVLSQLKNLDLSHNFISSFPWSDLRNLSALQLLKMNHNRL 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 KIAA02 ETLDPDSFQHLPKLERLFLHNNRITHLVPGTFNHLESMKRLRLDSNTLHCDCEILWLADL .: :.. :: :. : ..:::. :.::::. : ....:.: : .:: : ..:: KIAA14 GSLPRDALGALPDLRSLRINNNRLRTLAPGTFDALSALSHLQLYHNPFHCGCGLVWLQAW 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 KIAA02 LKTYAESGNAQAAAICEYPRRIQGRSVATITPEELNCERPRI--TSEPQ----DADVTSG . : . : : .:: : . : : : : . ..:: . . .: KIAA14 AASTRVSLPEPDSIACASPPALQGVPVYRL-PA-LPCAPPSVHLSAEPPLEAPGTPLRAG 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 330 KIAA02 NTVYFTCRAEGNPKPEIIWLRNNNELSMKTDSRLNLLDDGTLMIQNTQETDQGIYQCMAK . . : :.:.: :.. : KIAA14 LAFVLHCIADGHPTPRLQWQLQIPGGTVVLEPPVLSGEDDGVGAEEGEGEGDGDLLTQTQ 300 310 320 330 340 350 >>KIAA0756 ( 1222 res) ff01911 (1222 aa) initn: 319 init1: 190 opt: 412 Z-score: 378.4 bits: 82.4 E(): 5.8e-16 Smith-Waterman score: 503; 28.395% identity (56.296% similar) in 405 aa overlap (241-636:294-682) 220 230 240 250 260 270 KIAA02 LHCDCEILWLADLLKTYAESGNAQAAAICEYPRRIQGRSVATITPEELNCERPRITSEPQ .: ..:.:: :: . :. :. : KIAA07 FHFTHTIQQKNPFTLKVLTNHPYNDSSLRNHPDMYSARGVAERTPSFM---YPQGTASSQ 270 280 290 300 310 320 280 290 300 310 320 330 KIAA02 DADVTSGNTVYFTCRAEGNPKPEIIWLRNNNELSMKTDSRLNLLDDGTLMIQNTQETDQG : : . . : : : : :.: : .....: . :. . .: : :..: :.: KIAA07 M--VLRGMDLLLECIASGVPTPDIAWYKKGGDLPSDKAKFENF--NKALRITNVSEEDSG 330 340 350 360 370 340 350 360 370 380 390 KIAA02 IYQCMAKNVAGEVKTQEVTLRYFGSPARPTFVIQPQNTEVLVGESVTLECSATGHPPPRI : :.:.: : .. . ...: : : .. .:.: . ::. : : :.:.: : . KIAA07 EYFCLASNKMGSIR-HTISVRV---KAAPYWLDEPKNLILAPGEDGRLVCRANGNPKPTV 380 390 400 410 420 430 400 410 420 430 440 KIAA02 SWTRGDRTPLPVDPRVNITPSGGLYIQNVVQGDS-GEYACSATNNIDSVHATAFIIVQAL .: . . . : : .: : .: .: . : :...:. . :.::. : . KIAA07 QWMVNGEPLQSAPPNPNREVAGDTIIFRDTQISSRAVYQCNTSNEHGYLLANAFVSVLDV 440 450 460 470 480 490 450 460 470 480 490 500 KIAA02 PQFTVTPQD---RVVIEGQTVDFQCEAKGNPPPVIAWTKGGSQLSVDR-RHLVLSSGTLR : ..:.. ::.. ..: ..: :.: :.. : :.:. ..: . : .:.:. KIAA07 PPRMLSPRNQLIRVILYNRT-RLDCPFFGSPIPTLRWFKNGQGSNLDGGNYHVYENGSLE 500 510 520 530 540 550 510 520 530 540 550 560 KIAA02 ISGVALHDQGQYECQAVNIIGSQKVVAHLTVQ-PRVTPVFASIPSDTTVEVGANVQLPCS :. . .::: : : :.::.:. . ..: :. : : .. .: : ... :..::: : KIAA07 IKMIRKEDQGIYTCVATNILGKAENQVRLEVKDP--TRIY-RMPEDQVARRGTTVQLECR 560 570 580 590 600 570 580 590 600 610 620 KIAA02 SQGEP--EPAITWNKDGVQVTESGKFHISPEGFLTINDVGPADAGRYECVARNTIGSASV . .: . ...: :: . :. . . ::: :. : : : ::: . . . . KIAA07 VKHDPSLKLTVSWLKDD-EPLYIGNRMKKEDDSLTIFGVAERDQGSYTCVASTELDQDLA 610 620 630 640 650 660 630 640 650 660 670 680 KIAA02 SMVLSV-NVPDVSRNGDPFVATSIVEAIATVDRAINSTRTHLFDSRPRSPNDLLALFRYP . :.: . :: :. KIAA07 KAYLTVLGRPDRPRDLELTDLAERSVRLTWIPGDANNSPITDYVVQFEEDQFQPGVWHDH 670 680 690 700 710 720 >>KIAA0814 ( 1559 res) fh16048 (1559 aa) initn: 883 init1: 335 opt: 410 Z-score: 375.6 bits: 82.2 E(): 8.4e-16 Smith-Waterman score: 491; 34.459% identity (58.784% similar) in 296 aa overlap (8-276:27-313) 10 20 30 KIAA02 SRPWWLRASERPSAPSAMAKRSRGPGR--RCLLALVLFCAW :: : .: .:: : : : :::.: : KIAA08 LRRPLPRPPALPARLLGLHASCPAEAASSRSGALHTMAPGWAGVGAAVRARLALALALA- 10 20 30 40 50 40 50 60 70 80 90 KIAA02 GTLAVVAQKPGAGCPSRCLCFRTTVRCMHLLLEAVPAVAPQTSI-LDLRFNRIREIQPGA .:.. :...::..: : ..: : : :.::: :... ::: : : .: KIAA08 ---SVLSGPPAVACPTKCTCSAASVDCHGLGLRAVPRGIPRNAERLDLDRNNITRITKMD 60 70 80 90 100 110 100 110 120 130 KIAA02 FRRLRNLNTLLLNNNQIKRIPSGAFEDLENLKYLYLYKN--------------------- : :.:: .: :..::.. : :::.::..:. : : :: KIAA08 FAGLKNLRVLHLEDNQVSVIERGAFQDLKQLERLRLNKNKLQVLPELLFQSTPKLTRLDL 120 130 140 150 160 170 140 150 160 170 180 190 KIAA02 ---EIQSIDRQAFKGLASLEQLYLHFNQIETLDPDSFQHLPKLERLFLHNNRITHLVPGT .::.: :.::.:......: : :.: .. .:. : :: : :.:: :.... . 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KIAA13 PVRANPPLLFVSWTKDGKALQLDKFPG-WSQGTEGSLIIALGNEDALGEYSCTPYNSLGT 360 370 380 390 400 410 530 540 550 560 570 580 KIAA02 QKVVAHLTVQPRVTPVFASIPSDTTV-EVGANVQLPCSSQGEPEPAITWNKDGVQVTESG : .. :.: :.. ::: .. .:::.::.: :...:.: : . .: KIAA13 AGPSPVTRVLLKAPPAFIERPKEEYFQEVGRELLIPCSAQGDPPPVVSWTKVGRGL--QG 420 430 440 450 460 470 590 600 610 620 630 640 KIAA02 KFHISPEGFLTINDVGPADAGRYECVARNTIGSASVSMVLSVNVPDVSRNGDPFVATSIV . ... .. : . . :..:: : :.. : :. .: : .: : :.:.. 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KIAA15 CMVSNSVGNT-TASATLNVTAATTTPFSYFSTVTVETM--EPSQDEARTTDNNVGPTPVV 430 440 450 460 470 480 400 410 420 430 440 450 KIAA02 SWTRGDRTPLPVDPRVNITPSGGLYIQNVVQGDSGEYACSATNNIDSVHATAFIIVQALP .: . : . :. . . . : :.. .:: .:: : :. ::. . 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KIAA14 RE-------DDLETCATPEHLTDRYFWSIPEEEFLCEPPLITRQAGGRALVVEGQAVSLR 200 210 220 230 240 290 300 310 320 330 340 KIAA02 CRAEGNPKPEIIWLRNNNELSMKTDSRLNLLDDGTLMIQNTQETDQGIYQCMAKNVAGE- ::: :.:.: . :. ...: . ..:: . :::: . : :.: . :.:.:.::: KIAA14 CRAVGDPEPVVHWVAPDGRL-LGNSSRTRVRGDGTLDVTITTLRDSGTFTCIASNAAGEA 250 260 270 280 290 300 350 360 370 380 390 KIAA02 ---VKTQEVTLRYFGSP-ARPTFVIQPQNTEVLVGESVTLECSATGHPPPRISWTRGDRT :.. : : .. : : : . .: .... KIAA14 TAPVEVCVVPLPLMAPPPAAPPPLTEPGSSDIATPGRPGANDSAAERRLVAAELTSNSVL 310 320 330 340 350 360 400 410 420 430 440 450 KIAA02 PLPVDPRVNITPSGGLYIQNVVQGDSGEYACSATNNIDSVHATAFIIVQALPQFTVTPQD KIAA14 IRWPAQRPVPGIRMYQVQYNSSVDDSLVYRMIPSTSQTFLVNDLAAGRAYDLCVLAVYDD 370 380 390 400 410 420 1496 residues in 1 query sequences 1986009 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:12:33 2008 done: Thu Dec 18 15:12:35 2008 Total Scan time: 0.810 Total Display time: 0.390 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]