# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/ha02570.fasta.huge -Q ../query/KIAA0229.ptfa ./tmplib.23147 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0229, 1180 aa vs ./tmplib.23147 library 1986325 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.8895+/-0.00872; mu= 0.4323+/- 0.591 mean_var=325.1388+/-80.025, 0's: 0 Z-trim: 20 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.071128 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1139 ( 1124 res) hk00330 (1124) 566 72.8 3.3e-13 KIAA0379 ( 1059 res) hh00505s1 (1059) 393 55.0 7e-08 KIAA1223 ( 1089 res) pg00513 (1089) 355 51.1 1.1e-06 KIAA0957 ( 693 res) hj05670 ( 693) 348 50.2 1.3e-06 KIAA0697 ( 2486 res) hk04486s1 (2486) 352 51.3 2.2e-06 KIAA1334 ( 989 res) fh15842 ( 989) 333 48.8 4.8e-06 KIAA1250 ( 1777 res) pf01137 (1777) 328 48.6 9.9e-06 KIAA0396 ( 627 res) hg00180s1 ( 627) 318 47.0 1e-05 KIAA1728 ( 1644 res) pg00239 (1644) 302 45.9 6e-05 KIAA1785 ( 617 res) fh12727 ( 617) 276 42.7 0.0002 KIAA1876 ( 803 res) pf01162s1 ( 803) 278 43.1 0.00021 KIAA1255 ( 1232 res) hh14633s1 (1232) 256 41.0 0.0013 KIAA1758 ( 1662 res) fh20539(revised) (1662) 255 41.1 0.0017 >>KIAA1139 ( 1124 res) hk00330 (1124 aa) initn: 539 init1: 292 opt: 566 Z-score: 329.0 bits: 72.8 E(): 3.3e-13 Smith-Waterman score: 607; 29.018% identity (52.679% similar) in 672 aa overlap (156-809:1-545) 130 140 150 160 170 180 KIAA02 GYTPLHHAALNGHKDVVEVLLRNDALTNVADSKGCYPLHLAAWKGDAQIVRLLIHQGPSH ::.: ::: :::.: . ::::.. . . KIAA11 DSNGMRPLHYAAWQGRLEPVRLLLRASAA- 10 20 190 200 210 220 230 240 KIAA02 TRVNEQNNDNETALHCAAQYGHTEVVKVLLEELTDPTMRNNKFETPLDLAALYGRLEVVK :: . :.. :: :::::: :: ..::.. ..: . :. .:::::: .:::.:.. KIAA11 --VNAASLDGQIPLHLAAQYGHYEVSEMLLQHQSNPCLVNKAKKTPLDLACEFGRLKVAQ 30 40 50 60 70 80 250 260 270 280 290 KIAA02 MLLNAH--PNLLS------CNTKKHTPLHLAARNGHKAVVQVLLDAGMDSNYQTEMGSAL .:::.: :: :. . :::::::.:::. :.. :: ::.. : ::. :.:: KIAA11 LLLNSHLCVALLEGEAKDPCDPNYTTPLHLAAKNGHREVIRQLLRAGIEINRQTKTGTAL 90 100 110 120 130 140 300 310 320 330 340 350 KIAA02 HEAALFGKTDVVQILLAAGTDVNIKDNHGLTALDTVRELP-SQKSQQIAALIEDH--MTG :::::.:::.::..:: .:.::::..... :::: : .. :: :..: :... . KIAA11 HEAALYGKTEVVRLLLEGGVDVNIRNTYNQTALDIVNQFTTSQASREIKQLLREASGILK 150 160 170 180 190 200 360 370 380 390 400 410 KIAA02 KRSTKEVDKTPPPQPPLISSMDSIS---QKSQGDVEKAVTELIIDFDANAEEEGPYEALY :. :. . : . . : :. :. .: . . : ..: . : KIAA11 VRALKDFWNLHDPTALNVRAGDVITVLEQHPDGRWKGHIHE---------SQRGTDRIGY 210 220 230 240 250 420 430 440 450 460 KIAA02 NAISCHSLDSMASGRSSDQDSTNKEAEAAGVKPAGVRP--RERPPPPAKPPPDEEEEDHI .. ..: : .. : :. .:: . : :::. :: : KIAA11 FP---PGIVEVVSKR------VGIPAARLPSAPTPLRPGFSRTPQPPAEEPP------H- 260 270 280 290 300 470 480 490 500 510 520 KIAA02 DKKYFPLTASEVLSMRPRIHGSAAREEDEHPYELLLTAETKKVVLVDGKTKDHRRSSSSR ::: :.. ::. : . : : .. : .:.. . : :. KIAA11 -----PLTYSQL----PRVGLSP-----DSP------AGDRNSVGSEGSVGSIR---SAG 310 320 330 530 540 550 560 570 580 KIAA02 SQDSAEGQDGQVPEQFSGLL-HGSSPVCEVGQDPFQLLCTAGQSHPDGSPQQGACHKASM : .:.:: .:. : ::: ....:. .:.: :.: KIAA11 SGQSSEGTNGHGP----GLLIENAQPLPSAGED--QVL---------------------- 340 350 360 370 590 600 610 620 630 640 KIAA02 QLEETGVHAPGASQPSALDQSKRVGYLTGLPTTNSRSHPETLTHTASPHPGGAEEGDRSG :: :: :. :. : .: :: . .:. . :. :: . KIAA11 ---------PGLHPPSLADN------LSHRPLANCRSGEQIFTQDVRPEQ--LLEG--KD 380 390 400 410 650 660 670 680 690 700 KIAA02 ARSRAPPTSKPKAELKLSRSLSKS-DSDLLTCSPTEDATMGSRSESLSNCSIGKKRLEKS :.. :. . : .. :. . : .. :: : .:: . . KIAA11 AQAIHNWLSEFQLEGYTAHFLQAGYDVPTISRMTPEDLT-----------AIGVTKPGHR 420 430 440 450 460 710 720 730 740 750 760 KIAA02 PSFASEWDEIEKIMSSIGEGIDFSQERQKISGSRTLEQSVGEWLESIGLQQYESKLLLNG ..::: .. ::.: . . .. ::: ..:: ::...:. .: KIAA11 KKIASEIAQL-----SIAEWLP-----------SYIPTDLLEWLCALGLPQYHKQLVSSG 470 480 490 500 770 780 790 800 810 820 KIAA02 FDDVHFLGSNVMEEQDLRDIGISDPQHRRKLLQAARSLPKVKALGYDGNSPPSVPSWLDS .:.. .... . :: :..::.. :..::. ... : ... KIAA11 YDSMGLVADLTWEE--LQEIGVNKLGHQKKLMLGVKRLAELRRGLLQGEALSEGGRRLAK 510 520 530 540 550 560 830 840 850 860 870 880 KIAA02 LGLQDYVHSFLSSGYSSIDTVKNLWELELVNVLKVQLLGHRKRIIASLADRPYEEPPQKP KIAA11 GPELMAIEGLENGEGPATAGPRLLTFQGSELSPELQAAMAGGGPEPLPLPPARSPSQESI 570 580 590 600 610 620 >>KIAA0379 ( 1059 res) hh00505s1 (1059 aa) initn: 443 init1: 233 opt: 393 Z-score: 233.4 bits: 55.0 E(): 7e-08 Smith-Waterman score: 393; 37.387% identity (65.766% similar) in 222 aa overlap (111-330:65-282) 90 100 110 120 130 140 KIAA02 GGGGGSGGGGGGSGGGGGGLGSSSHPLSSLLSMWRGPNVNCVDSTGYTPLHHAALNGHKD : . : :: :: ::::.:. . .. KIAA03 FKKEDVNFQDNEKRTPLHAAAYLGDAEIIELLILSGARVNAKDSKWLTPLHRAVASCSEE 40 50 60 70 80 90 150 160 170 180 190 200 KIAA02 VVEVLLRNDALTNVADSKGCYPLHLAAWKGDAQIVRLLIHQGPSHTRVNEQNNDNETALH .:.:::...: .:. :.. :::.:: . .. .. :. : . :: .. ..:::: KIAA03 AVQVLLKHSADVNARDKNWQTPLHIAAANKAVKCAEALV---PLLSNVNVSDRAGRTALH 100 110 120 130 140 150 210 220 230 240 250 260 KIAA02 CAAQYGHTEVVKVLLEELTDPTMRNNKFETPLDLAALYGRLEVVKMLLNAHPNLLSCNTK :: :: :.::.:: . .. . ..: . . :: .:..::::.:.. : ..:. : KIAA03 HAAFSGHGEMVKLLLSRGANINAFDKKDRRAIHWAAYMGHIEVVKLLVS-HGAEVTCKDK 160 170 180 190 200 210 270 280 290 300 310 KIAA02 K-HTPLHLAARNGHKAVVQVLLDAGMDSNYQTEMGSA-LHEAALFGKTDVVQILLAAGTD : .:::: :: .: .::. ::: :.: : . .:.. :: : :. ::. :. :. KIAA03 KSYTPLHAAASSGMISVVKYLLDLGVDMNEPNAYGNTPLHVACYNGQDVVVNELIDCGAI 220 230 240 250 260 270 320 330 340 350 360 370 KIAA02 VNIKDNHGLTALDTVRELPSQKSQQIAALIEDHMTGKRSTKEVDKTPPPQPPLISSMDSI :: :...:.: : KIAA03 VNQKNEKGFTPLHFAAASTHGALCLELLVGNGADVNMKSKDGKTPLHMTALHGRFSRSQT 280 290 300 310 320 330 >>KIAA1223 ( 1089 res) pg00513 (1089 aa) initn: 715 init1: 195 opt: 355 Z-score: 212.2 bits: 51.1 E(): 1.1e-06 Smith-Waterman score: 402; 24.034% identity (51.502% similar) in 699 aa overlap (35-675:427-1078) 10 20 30 40 50 60 KIAA02 GREGVVSPAGLGGALPGDGKFGSPSRLGCSLGEGVQRVAALGMGKEQELLEAARTGHLPA : :: : . . :: :: :: . KIAA12 RGAEVDHCDKDGMTPLLVAAYEGHVDVVDLLLEGGADVDHTDNNGRTPLLAAASMGHASV 400 410 420 430 440 450 70 80 90 100 110 120 KIAA02 VEKLLSGKRLSSGFGGGGGGGSGGGGGGSGGGGGGLGSSSHPLSSLLSMWRGPNVNCVDS :. :: : :.. . . : . ... :. . . .::. :: . : :. KIAA12 VNTLL--------FWGAAVDSIDSEGRTVLSIASAQGNV-EVVRTLLD--RGLDENHRDD 460 470 480 490 500 130 140 150 160 170 180 KIAA02 TGYTPLHHAALNGHKDVVEVLLRNDALTNVADSKGCYPLHLAAWKGDAQIVRLLIHQGPS .:.:::: ::..::. . :.:... : :: :. : :. ::. .: . :..:.. . KIAA12 AGWTPLHMAAFEGHRLICEALIEQGARTNEIDNDGRIPFILASQEGHYDCVQILLE---N 510 520 530 540 550 560 190 200 210 220 230 KIAA02 HTRVNEQNNDNETALHCAAQYGHTEVVKVLLEELTD---------PTMRNNKFETPLDLA .. ..... :...::. :: :: ..:..:. . .: ::. .:. : .: KIAA12 KSNIDQRGYDGRNALRVAALEGHRDIVELLFSHGADVNCKDADGRPTLYILALENQLTMA 570 580 590 600 610 620 240 250 260 270 KIAA02 ALY------------------------GRLEVVKMLLNAHPNLLSCNTKKHTPLHLAARN . :..:.:..:. : .. . ...:.. :. :: . KIAA12 EYFLENGANVEASDAEGRTALHVSCWQGHMEMVQVLIAYHADVNAADNEKRSALQSAAWQ 630 640 650 660 670 680 280 290 300 310 320 330 KIAA02 GHKAVVQVLLDAGMDSNYQTEMG-SALHEAALFGKTDVVQILLAAGTDVNIKDNHGLTAL :: :::.:.. : .. ..: .:: :: :. ::::.:: :.: : :. : ::. KIAA12 GHVKVVQLLIEHGAVVDHTCNQGATALCIAAQEGHIDVVQVLLEHGADPNHADQFGRTAM 690 700 710 720 730 740 340 350 360 370 380 KIAA02 DTVRELPSQKSQQIAALIEDHMTGKRSTKEVDKTP------PPQPPLISSMDSISQKSQ- : .. .:: :.: . : : . . .: : : :...:.. ::. KIAA12 ---RVAAKNGHSQIIKLLEKY--GASSLNGCSPSPVHTMEQKPLQSLSSKVQSLTIKSNS 750 760 770 780 790 390 400 410 420 430 KIAA02 ------GDVEKAVTELIID--FDANAEEEGPYEALYNAISCHSLDSMASGRSSDQDSTNK ::.. .. : .. :.: .. : : .:. :...:. .:.. KIAA12 SGSTGGGDMQPSLRGLPNGPTHAFSSPSESPDSTVDRQKSSLSNNSLKSSKNSSLRTTSS 800 810 820 830 840 850 440 450 460 470 480 490 KIAA02 EAEAAGVKPAGVRPRERPPPPAKPPPDEEEEDHIDKKYFPLTASEVLSMRPRIHGSAARE : : : : . ..:... .: . :. . : .. . KIAA12 TATAQTV-------------PIDSFHNLSFTEQIQQHSLPRSRSRQSIVSPSSTTQSLGQ 860 870 880 890 900 500 510 520 530 540 550 KIAA02 EDEHPYELLLTAETKKVVLVDGKTKDHRRSSSSRSQDSAE-GQDGQVPEQFSGLLHGSSP . : . ...: . :. . :....:..::. :. :. .: . .:.: KIAA12 SHNSPSSEFEWSQVKPSL------KSTKASKGGKSENSAKSGSAGKKAKQSN----SSQP 910 920 930 940 950 560 570 580 590 600 KIAA02 -VCEVGQDPFQLLCTAGQSHPDGSPQQGACHKASMQLEETGVHAPGASQPSAL------D : : . :. ..: . :.: .. . .. . : :: . : . KIAA12 KVLEYEMTQFDRRGPIAKSGTAAPPKQMPAESQCKIMIPSAQQEIGRSQQQFLIHQQSGE 960 970 980 990 1000 1010 610 620 630 640 650 660 KIAA02 QSKRVGYLTGLPTTNSRSHPETLTHTASPHPGGAEEGDRSGARS-RAPPTSKPKAELKLS :.:: : .:. :. . .:. : ... :. ::. . .. :.:. . :: . KIAA12 QKKRNGIMTN-PNYHLQSNQVFLGRVSVPRT----MQDRGHQEVLEGYPSSETELSLKQA 1020 1030 1040 1050 1060 670 680 690 700 710 720 KIAA02 RSLSKSDSDLLTCSPTEDATMGSRSESLSNCSIGKKRLEKSPSFASEWDEIEKIMSSIGE .:. :: KIAA12 LKLQIEGSDPSFNYKKETPL 1070 1080 >>KIAA0957 ( 693 res) hj05670 (693 aa) initn: 389 init1: 224 opt: 348 Z-score: 210.5 bits: 50.2 E(): 1.3e-06 Smith-Waterman score: 386; 25.835% identity (52.197% similar) in 569 aa overlap (115-673:33-548) 90 100 110 120 130 140 KIAA02 GSGGGGGGSGGGGGGLGSSSHPLSSLLSMWRGPNVNCVDSTGYTPLHHAALNGHKDVVEV .: : : . : :::: :: .:: ::.. KIAA09 SQQDAVAALSERLLVAAYKGQTENVVQLINKGARVA-VTKHGRTPLHLAANKGHLPVVQI 10 20 30 40 50 60 150 160 170 180 190 200 KIAA02 LLRNDALTNVADSKGCYPLHLAAWKGDAQIVRLLIHQGPSHTRVNEQNNDNETALHCAAQ ::. .: :. :: :. :...:. :::.: . : :..:..:::: :. KIAA09 LLKAGCDLDVQDDGDQTALHRATVVGNTEIIAALIHEGCALDR---QDKDGNTALHEASW 70 80 90 100 110 210 220 230 240 250 260 KIAA02 YGHTEVVKVLLEELTDPTMRNNKFETPLDLAALYGRLEVVKMLLNAHPNLLSCNTKKHTP .: .. .:.:.. .. .:. .: : :: .. . ...:: : :. : KIAA09 HGFSQSAKLLVKAGANVLAKNKAGNTALHLACQNSHSQSTRVLLLAGSRADLKNNAGDTC 120 130 140 150 160 170 270 280 290 300 310 320 KIAA02 LHLAARNGHKAVVQVLLDAGMDSNYQTEMG-SALHEAALFGKTDVVQILLAAGTDVNIKD ::.::: .: .....:: : . . ... : .::: :: ... :..::: ::.:..: . KIAA09 LHVAARYNHLSIIRLLLTAFCSVHEKNQAGDTALHVAAALNHKKVAKILLEAGADTTIVN 180 190 200 210 220 230 330 340 350 360 370 380 KIAA02 NHGLTALDTVRELPSQKSQQIAALIEDHMTGKRSTKEVDKTPPPQPPLISSMDSISQKSQ : : : :.:.: ... ..: :. :. :. . :: :: .....: KIAA09 NAGQTPLETARY---HNNPEVALLLTKAPQGSVSAGD---TP-------SSEQAVARK-- 240 250 260 270 280 390 400 410 420 430 440 KIAA02 GDVEKAVTELIIDFDANAEEEGPYEALYNAISCHSLDSMASGRSSDQDSTNKEAEAAGVK :.: :.. .. . .: : : .::. ... : . KIAA09 ---EEAREEFLSASPEPRAKDDRRRKSRPKVSAFS-DPTPP---ADQQPGHQKNLHAHNH 290 300 310 320 330 450 460 470 480 490 500 KIAA02 PAGVRPRERPPPPAKPPPDEEEEDHIDKKYFPLTASEVLSMRPRIHGSAAREEDEHPYEL : : :.: : ::: : . .. : ... :. :.: : . : KIAA09 PKK-RNRHRCSSP--PPPHEFRAYQLYTLY---RGKDGKVMQAPINGCRC-EPLINKLEN 340 350 360 370 380 510 520 530 540 550 560 KIAA02 LLTAETKKVVLVDGKTKDHRRSSSSRSQDSAEGQDGQVPEQFSGLLHGSSPVCEVGQDPF : : .... :...:. .. .. ..... : . . . : . : . KIAA09 QLEATVEEIKAELGSVQDKMNTKLGQMENKTQHQMRVLDKLMVERLSAERTEC------L 390 400 410 420 430 440 570 580 590 600 610 620 KIAA02 QLLCTAGQSHPDGSPQQGACHKASMQLE-ETGVHAPGASQPSALDQSKRVGYLTGLPTT- . : :.: : ..: .. :. : .: . . :. ..:. . :.: KIAA09 NRL----QQHSDTEKHEGEKRQISLVDELKTWCMLKIQNLEQKLSGDSRACRAKSTPSTC 450 460 470 480 490 630 640 650 660 670 KIAA02 NSRSHPETLTHTASPHPGGAEEGDRSGARSRAPPTSKPK-------AELKLSRSLSKSDS .: . . :. ::.: : .: : ::. .:: : .:.. ::.:: KIAA09 ESSTGVDQLVVTAGP----AAASDSS------PPVVRPKEKALNSTATQRLQQELSSSDC 500 510 520 530 540 680 690 700 710 720 730 KIAA02 DLLTCSPTEDATMGSRSESLSNCSIGKKRLEKSPSFASEWDEIEKIMSSIGEGIDFSQER KIAA09 TGSRLRNVKVQTALLPMNEAARSDQQAGPCVNRGTQTKKSGKSGPTRHRAQQPAASSTCG 550 560 570 580 590 600 >>KIAA0697 ( 2486 res) hk04486s1 (2486 aa) initn: 789 init1: 220 opt: 352 Z-score: 206.4 bits: 51.3 E(): 2.2e-06 Smith-Waterman score: 383; 25.335% identity (51.118% similar) in 671 aa overlap (108-749:947-1587) 80 90 100 110 120 130 KIAA02 FGGGGGGGSGGGGGGSGGGGGGLGSSSHPLSSLLSMWRGPNVNC-VDSTGYTPLHHAALN :..: .. . ... ..:. : : : . KIAA06 ASAMSNTPTHSIAASISQPQTPTPSPIISPSAMLPIYPAIDIDAQTESNHDTALTLACAG 920 930 940 950 960 970 140 150 160 170 180 190 KIAA02 GHKDVVEVLLRNDALTNVADSKGCYPLHLAAWKGDAQIVRLLIHQGPSHTRVNEQNNDNE ::...:..::. : . :.:: :: ::: : . .:..:. .: . .:...:. KIAA06 GHEELVQTLLERGASIEHRDKKGFTPLILAATAGHVGVVEILLDNGADIEAQSERTKDTP 980 990 1000 1010 1020 1030 200 210 220 230 240 250 KIAA02 TALHCAAQYGHTEVVKVLLEELTDPTMRNNKFETPLDLAALYGRLEVVKMLLNAHPNLLS .: :.. :. :::..:: . .. :: . :::.::: : ....:.:::: .. : KIAA06 LSLACSG--GRQEVVELLLARGANKEHRNVSDYTPLSLAASGGYVNIIKILLNAGAEINS 1040 1050 1060 1070 1080 1090 260 270 280 290 300 310 KIAA02 CNTKKH--TPLHLAARNGHKAVVQVLLDAGMDSNYQTEMG--SALHEAALFGKTDVVQIL . .: .:: ::: ::: :.:..::: : : : : : . .:: : . :.:.::..: KIAA06 RTGSKLGISPLMLAAMNGHTAAVKLLLDMGSDINAQIETNRNTALTLACFQGRTEVVSLL 1100 1110 1120 1130 1140 1150 320 330 340 350 360 370 KIAA02 LAAGTDVNIKDNHGLTALDTVRELPSQKSQQIAALIEDHMTGKRSTKEVDKTPPPQPPLI : ..:. . . ::: : : : ... .. : : .: . :: : KIAA06 LDRKANVEHRAKTGLTPL---MEAASGGYAEVGRVLLD--------KGADVNAPPVP--- 1160 1170 1180 1190 1200 380 390 400 410 420 KIAA02 SSMDSISQKSQGDVEKAVTELIIDFDANAE--EEGPYEALYNAISCHSLDSMA----SGR :: :. . . ::.: :. . .. :. : . :: . .: KIAA06 SSRDTALTIAADKGHYKFCELLIGRGAHIDVRNKKGNTPLWLAANGGHLDVVQLLVQAGA 1210 1220 1230 1240 1250 1260 430 440 450 460 470 KIAA02 SSDQ-DSTNKEAEAAGVKPAGVRP-RERPPPPAKPPPDEEEEDHI----DKKYFP---LT . : :. . :. . . :. : . : : : .: ::... : KIAA06 DVDAADNRKITPLMAAFRKGHVKVVRYLVKEVNQFPSDSECMRYIATITDKEMLKKCHLC 1270 1280 1290 1300 1310 1320 480 490 500 510 520 530 KIAA02 ASEVLSMRPRIHGSAAREEDEHPYEL---LLTAETKKVVLVDG--KTKDHRRSSSSRSQD ... . : . : .. . :: : :.....:. : :..::... ... KIAA06 MESIVQAKDRQAAEANKNASILLEELDLEKLREESRRLALAAKREKRKEKRRKKKEEQRR 1330 1340 1350 1360 1370 1380 540 550 560 570 580 590 KIAA02 SAEGQDGQVPEQFSGLLHGSSPVCEVGQDPFQLLC--TAGQSHPDGSPQQGACHKASMQL . : ... :.: . .: ..: : .: . : . .: KIAA06 KLEEIEAKNKENFELQAAQEKEKLKVEDEPEVLTEPPSATTTTTIGISATWTTLAGSHGK 1390 1400 1410 1420 1430 1440 600 610 620 630 640 KIAA02 EETGVHAPGASQPSALDQ--SKRVGYLTGLPTTNSRSHPETLTHTASPHPGGAEEGDRSG ... . . .... . .. . : . : : :.:: . . : . .: :: .. KIAA06 RNNTITTTSSKRKNRKNKITPENVQIIFDDPLPISYSQPEKV-NGESKSSSTSESGDSDN 1450 1460 1470 1480 1490 650 660 670 680 690 700 KIAA02 ARSRAPPTSKPKAELKLSRSLSKSDSDLLTCSPTEDATMGSRSESLSNCSIGKKRLEKSP : :. . : . : : :::. ::. .: : ... : :. .:: KIAA06 MR-----ISSCSDESSNSNSSRKSDNH----SPAVVTTTVSSKKQPSVLVTFPKEERKSV 1500 1510 1520 1530 1540 1550 710 720 730 740 750 760 KIAA02 SFASEWDEIEKIMSSIGEGIDFSQERQKISGSRTLEQSVGEWLESIGLQQYESKLLLNGF : . :. .:.:: . : :: : . :. KIAA06 SGKASI----KLSETISEGTSNSLSTCTKSGPSPLSSPNGKLTVASPKRGQKREEGWKEV 1560 1570 1580 1590 1600 770 780 790 800 810 820 KIAA02 DDVHFLGSNVMEEQDLRDIGISDPQHRRKLLQAARSLPKVKALGYDGNSPPSVPSWLDSL KIAA06 VRRSKKVSVPSTVISRVIGRGGCNINAIREFTGAHIDIDKQKDKTGDRIITIRGGTESTR 1610 1620 1630 1640 1650 1660 >>KIAA1334 ( 989 res) fh15842 (989 aa) initn: 589 init1: 158 opt: 333 Z-score: 200.4 bits: 48.8 E(): 4.8e-06 Smith-Waterman score: 333; 29.225% identity (60.915% similar) in 284 aa overlap (107-388:10-281) 80 90 100 110 120 130 KIAA02 GFGGGGGGGSGGGGGGSGGGGGGLGSSSHPLSSLLSMWRGPNVNCVDSTGYTPLHHAALN ..:: . .: ..: ... : .:. : KIAA13 SFGRLNALNMKSLKAKFRKSDTNEWNKND-DRLLQAVEN 10 20 30 140 150 160 170 180 190 KIAA02 GHKDVVEVLL-RNDALTNVADSKGCYPLHLAAWKGDAQIVRLLIHQGPSHTRVNEQNNDN : . : :: .. : .. ::.: .:::: :: .. .:..: .: . :. :.. . KIAA13 GDAEKVASLLGKKGASATKHDSEGKTAFHLAAAKGHVECLRVMITHG---VDVTAQDTTG 40 50 60 70 80 90 200 210 220 230 240 250 KIAA02 ETALHCAAQYGHTEVVKVLLEELTDPTMRNNKFETPLDLAALYGRLEVVKMLLNAHPNLL ..::: ::. .: : .. ::. ... .: : :: : :..:..: . . . KIAA13 HSALHLAAKNSHHECIRKLLQSKCPAESVDSSGKTALHYAAAQGCLQAVQILCEHKSPIN 100 110 120 130 140 150 260 270 280 290 300 310 KIAA02 SCNTKKHTPLHLAARNGHKAVVQVLLDAGMDSNYQTEMG-SALHEAALFGKTDVVQILLA . . :: ::..:::. . . ::: : : : ... : .:: : .:....:. :. KIAA13 LKDLDGNIPLLLAVQNGHSEICHFLLDHGADVNSRNKSGRTALMLACEIGSSNAVEALIK 160 170 180 190 200 210 320 330 340 350 360 370 KIAA02 AGTDVNIKDNHGLTALDTVRELPSQKSQQIAALIEDHMTGKRSTKEVDKTPPPQPPLISS :.:.:. :. : .:: :. :.. : :.. . .: : ...: : .: .. KIAA13 KGADLNLVDSLGYNALHY-----SKLSEN--AGIQSLLLSKIS-QDADLKTPTKPKQHDQ 220 230 240 250 260 380 390 400 410 420 430 KIAA02 MDSISQKSQGDVEKAVTELIIDFDANAEEEGPYEALYNAISCHSLDSMASGRSSDQDSTN ...::.. .: .: KIAA13 VSKISSERSGTPKKRKAPPPPISPTQLSDVSSPRSITSTPLSGKESVFFAEPPFKAEISS 270 280 290 300 310 320 >>KIAA1250 ( 1777 res) pf01137 (1777 aa) initn: 390 init1: 162 opt: 328 Z-score: 194.8 bits: 48.6 E(): 9.9e-06 Smith-Waterman score: 328; 34.722% identity (61.574% similar) in 216 aa overlap (116-330:100-312) 90 100 110 120 130 140 KIAA02 SGGGGGGSGGGGGGLGSSSHPLSSLLSMWRGPNVNCVDSTGYTPLHHAALNGHKDVVEVL : :.. : :.: : : .:. ::::.: KIAA12 CNLEDLDNWTALISASKEGHVHIVEELLKCGVNLEHRDMGGWTALMWACYKGRTDVVELL 70 80 90 100 110 120 150 160 170 180 190 200 KIAA02 LRNDALTNVADSKGCYPLHLAAWKGDAQIVRLLIHQGPSHTRVNEQNNDNETALHCAAQY : . : .:. . ::. :: .: :.::.::...: ..:: ... . : : ::. KIAA12 LSHGANPSVTGLYSVYPIIWAAGRGHADIVHLLLQNG---AKVNCSDKYGTTPLVWAARK 130 140 150 160 170 180 210 220 230 240 250 260 KIAA02 GHTEVVKVLLEELTDPTMRNNKFETPLDLAALYGRLEVVKMLLNAHPNLLSCNTKKHTPL :: : :: :: .: ... . : : .:. : . :: .:. .::. . .: : KIAA12 GHLECVKHLLAMGADVDQEGANSMTALIVAVKGGYTQSVKEILKRNPNVNLTDKDGNTAL 190 200 210 220 230 240 270 280 290 300 310 320 KIAA02 HLAARNGHKAVVQVLLDAGMDSNYQTEMG-SALHEAALFGKTDVVQILLAAGTDVNIKDN .:...:: .:: ::::: : . : ..: :. :....:. :: .:..:. . KIAA12 MIASKEGHTEIVQDLLDAGTYVNIPDRSGDTVLIGAVRGGHVEIVRALLQKYADIDIRGQ 250 260 270 280 290 300 330 340 350 360 370 380 KIAA02 HGLTALDTVRELPSQKSQQIAALIEDHMTGKRSTKEVDKTPPPQPPLISSMDSISQKSQG . ::: KIAA12 DNKTALYWAVEKGNATMVRDILQCNPDTEICTKDGETPLIKATKMRNIEVVELLLDKGAK 310 320 330 340 350 360 >>KIAA0396 ( 627 res) hg00180s1 (627 aa) initn: 376 init1: 201 opt: 318 Z-score: 194.4 bits: 47.0 E(): 1e-05 Smith-Waterman score: 318; 31.488% identity (55.363% similar) in 289 aa overlap (162-436:49-327) 140 150 160 170 180 190 KIAA02 HAALNGHKDVVEVLLRNDALTNVADSKGCYPLHLAAWKGDAQIVRLLIHQGPSHTRVNEQ :: .:: .: :..::::.. : ::. : KIAA03 TLAALLLNRSESDIRYLLGYVSQQGGQRSTPLIIAARNGHAKVVRLLLE----HYRVQTQ 20 30 40 50 60 70 200 210 220 230 240 KIAA02 NN----------DNETALHCAAQYGHTEVVKVLLEELTDPTMRNNKFETPLDLAALYGRL .. :. ::: ::: :: ::::.:. . .. . . ::: : . ::: KIAA03 QTGTVRFDGYVIDGATALWCAAGAGHFEVVKLLVSHGANVNHTTVTNSTPLRAACFDGRL 80 90 100 110 120 130 250 260 270 280 290 300 KIAA02 EVVKMLLNAHPNLLSCNTKKHTPLHLAARNGHKAVVQVLLDAGMDSNYQTEMG-SALHEA ..::.:.. . :. : .: : .:: .:: ::. ::. : : ... : .::: : KIAA03 DIVKYLVENNANISIANKYDNTCLMIAAYKGHTDVVRYLLEQRADPNAKAHCGATALHFA 140 150 160 170 180 190 310 320 330 340 350 360 KIAA02 ALFGKTDVVQILLAAGTDVNIKDNHGLTALDTVRELPSQKSQQIAALIEDHMTGKRSTKE : :. :.:. :. . . . ..::.: : .. : : :.. . :. .:: : KIAA03 AEAGHIDIVKELIKWRAAIVV-NGHGMTPLKVAAE--SCKADVVELLLSHADCDRRSRIE 200 210 220 230 240 250 370 380 390 400 410 KIAA02 -VDKTPPPQPPLISSMDSISQKSQGDVEKAVTELIIDFDANAEEE--GPYEALYNAISCH .. ..: : :. . :. : . : : :.: : .: : :. KIAA03 ALELLGASFANDRENYDII--KTYHYLYLAMLERFQDGDNILEKEVLPPIHAYGNRTECR 260 270 280 290 300 420 430 440 450 460 470 KIAA02 SLDSMASGRSSDQDSTNKEAEAAGVKPAGVRPRERPPPPAKPPPDEEEEDHIDKKYFPLT . . . : :. :.:. . : KIAA03 NPQELESIRQ-DRDALHMEGLIVRERILGADNIDVSHPIIYRGAVYADNMEFEQCIKLWL 310 320 330 340 350 360 >>KIAA1728 ( 1644 res) pg00239 (1644 aa) initn: 637 init1: 181 opt: 302 Z-score: 180.7 bits: 45.9 E(): 6e-05 Smith-Waterman score: 305; 32.589% identity (59.821% similar) in 224 aa overlap (121-330:743-965) 100 110 120 130 140 KIAA02 GGSGGGGGGLGSSSHPLSSLLSMWRGPNVNCVDST---GYTPLHHAALNGHKDVVEVLLR :.:.: :.: : .:: :: .: .: . KIAA17 TEVLNNAPILCVQSHLGHEEVVTLLLEFGACLDGTSENGMTALCYAAAAGHMKLVCLLTK 720 730 740 750 760 770 150 160 170 180 190 200 KIAA02 NDALTNVADSKG-CYPLHLAAWKGDAQIVRLLI----HQGPSHTRVNEQNNDNETALHCA . . .. :.:: : .: .: .: ..:.. :. :: . . .... . :: : KIAA17 KGVRVDHLDKKGQCALVH-SALRGHGDILQYLLTCEWSPGPPQPGTLRKSHALQQALTAA 780 790 800 810 820 830 210 220 230 240 250 KIAA02 AQYGHTEVVKVLLEELTDPTMRNNKF-----ETPLDLAALYGRLEVVKMLLNAHPNLLSC :..::. ::. :: . .. : :: : :: :.::: ..::. . KIAA17 ASMGHSSVVQCLLGMEKEHEVEVNGTDTLWGETALTAAAGRGKLEVCELLLGHGAAVSRT 840 850 860 870 880 890 260 270 280 290 300 310 KIAA02 NTKKHTPLHLAARNGHKAVVQVLLDAGMDSNYQTEMG-SALHEAALFGKTDVVQILLAAG : . :: :::.:: .:..::. : : : . ..: . : :: :. ..:..::. : KIAA17 NRRGVPPLFCAARQGHWQIVRLLLERGCDVNLSDKQGRTPLMVAACEGHLSTVEFLLSKG 900 910 920 930 940 950 320 330 340 350 360 370 KIAA02 TDVNIKDNHGLTALDTVRELPSQKSQQIAALIEDHMTGKRSTKEVDKTPPPQPPLISSMD . .. :..::.:: KIAA17 AALSSLDKEGLSALSWACLKGHRAVVQYLVEEGAAIDQTDKNGRTPLDLAAFYGDAETVL 960 970 980 990 1000 1010 >>KIAA1785 ( 617 res) fh12727 (617 aa) initn: 228 init1: 169 opt: 276 Z-score: 171.2 bits: 42.7 E(): 0.0002 Smith-Waterman score: 282; 31.651% identity (61.468% similar) in 218 aa overlap (128-330:5-218) 100 110 120 130 140 150 KIAA02 GGLGSSSHPLSSLLSMWRGPNVNCVDSTGYTPLHHAALNGHKDVVEVLLRNDALTNVAD- : . .:: .:. .. :: . . .:.. KIAA17 MDLKTAVFNAARDGKLRLLTKLLASKSKEEVSSL 10 20 30 160 170 180 190 200 KIAA02 ----SKGCYPLHLAAWKGDAQIVRLLIHQGPSHTRVNEQNN-DNETA-----LHCAAQYG ..: :: .:: : ..:..:..: . .:. . : :.:: : :. : KIAA17 ISEKTNGATPLLMAARYGHLDMVEFLLEQCSASIEVGGSVNFDGETIEGAPPLWAASAAG 40 50 60 70 80 90 210 220 230 240 250 260 KIAA02 HTEVVKVLLEE---LTDPTMRNNKFETPLDLAALYGRLEVVKMLLNAHPNLLSCNTKKHT : .::. ::.. ... :. :. ::: : . :.::.::.:.. . .: : . :: KIAA17 HLKVVQSLLNHGASVNNTTLTNS---TPLRAACFDGHLEIVKYLVEHKADLEVSNRHGHT 100 110 120 130 140 150 270 280 290 300 310 320 KIAA02 PLHLAARNGHKAVVQVLLDAGMDSNYQTEMG-SALHEAALFGKTDVVQILLAAGTDVNIK : .. .::: ..: ::. : : : .. : .:::. : :. :....:: . .. : KIAA17 CLMISCYKGHKEIAQYLLEKGADVNRKSVKGNTALHDCAESGSLDIMKMLLMYCAKME-K 160 170 180 190 200 210 330 340 350 360 370 380 KIAA02 DNHGLTALDTVRELPSQKSQQIAALIEDHMTGKRSTKEVDKTPPPQPPLISSMDSISQKS :..:.: : KIAA17 DGYGMTPLLSASVTGHTNIVDFLTHHAQTSKTERINALELLGATFVDKKRDLLGALKYWK 220 230 240 250 260 270 1180 residues in 1 query sequences 1986325 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:12:31 2008 done: Thu Dec 18 15:12:32 2008 Total Scan time: 0.750 Total Display time: 0.340 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]