# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/ha02768.fasta.huge -Q ../query/KIAA0211.ptfa ./tmplib.23147 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0211, 1317 aa vs ./tmplib.23147 library 1986188 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.2911+/-0.00987; mu= 2.0146+/- 0.672 mean_var=442.9374+/-106.621, 0's: 0 Z-trim: 36 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.060940 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1629 ( 1329 res) fh20517 (1329) 1586 155.0 8e-38 KIAA1441 ( 1258 res) hg02860b (1258) 641 71.8 8e-13 KIAA0478 ( 1253 res) hh05955 (1253) 293 41.2 0.0013 KIAA1388 ( 599 res) fj06552 ( 599) 271 38.8 0.0033 KIAA2033 ( 766 res) ej00602s1 ( 766) 258 37.9 0.0083 >>KIAA1629 ( 1329 res) fh20517 (1329 aa) initn: 2758 init1: 806 opt: 1586 Z-score: 770.9 bits: 155.0 E(): 8e-38 Smith-Waterman score: 2841; 40.244% identity (64.558% similar) in 1312 aa overlap (51-1272:31-1298) 30 40 50 60 70 80 KIAA02 YGDRGRGGSKAERGGPYLPRIPVSPCQHPAMGDMKTPDFDDLLAAFDIPDPTSLDAKEAI :::::::::::::::::::: .: : :: KIAA16 ECSRVTVTEHWSKVFPKGQGSQEHLLKLMTMGDMKTPDFDDLLAAFDIPD--MVDPKAAI 10 20 30 40 50 90 100 110 120 130 KIAA02 QTPSEENESPLKPPGICMDESVSLSHSGSAPDVPAVSVIVKNTSRQESFEA-EKDHITPS .. ...:: .: . :.: :. :. :: .:::::::. .: :. ::: .:. KIAA16 ESGHDDHESHMKQNAHGEDDS----HAPSSSDV-GVSVIVKNVRNIDSSEGGEKDGHNPT 60 70 80 90 100 110 140 150 160 170 180 190 KIAA02 L--LHNGFRGSDLPPDPHNCGKFDSTFMNGDSARSFPGKLEPPKSEPL---PTFNQFSPI ::::: . ...:: .. :.:.:. : . : :: ::.::::: KIAA16 GNGLHNGF---------LTASSLDS--YSKDGAKSLKGDV--PASEVTLKDSTFSQFSPI 120 130 140 150 160 200 210 220 230 240 KIAA02 SSPEPEDPIKDNGFGIKPKHSD--SYFPPPLGCGAVGGP---VLEALAKFPVPELHMFDH :: : : . : . : : : . :.. :.::. . . KIAA16 SSAEEFDDDEKIEVDDPPDKEDMRSSFRSNVLTGSAPQQDYDKLKALGGENSSKTGLSTS 170 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 300 KIAA02 FCKKEPKPEPLPLGSQQEHEQSGQN--TVEPHKDPDATRFFGEALEFNSHP--SNSIGES .. : . ..: : :. : . :: : .: . :. .: : . .. KIAA16 GNVEKNK------AVKRETEASSINLSVYEPFK----VRKAEDKLKESSDKVLENRVLDG 230 240 250 260 270 310 320 330 340 350 360 KIAA02 KGLARELGTCS--SVPPRQRLKPAHSKLSSCVAALVALQAKRVASVTKEDQPGHTKDLSG : :. : . : :: : . . ::::::.::..::.::..:: . .. ..... :. 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KIAA16 DHIKSMHGTLKSIEGPPNLGINLPLSI-KPATQNSANQNKEDTKSMNGKEKLEKKSPSPV 990 1000 1010 1020 1030 1020 1030 1040 1050 1060 1070 KIAA02 HRRVEARPRLRNTGWTCQECQEWVPDRESYVSHMKKSHGRTLKRYPCRQCEQSFHTPNSL .. .:.. .. . :::: ::. .:. :.::..: ::. .:..:::::..:: . .:: KIAA16 KKSMETK-KVASPGWTCWECDCLFMQRDVYISHVRKEHGKQMKKHPCRQCDKSFSSSHSL 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1080 1090 1100 1110 1120 1130 KIAA02 RKHIRNNHDTVKKFYTCGYCTEDSPSFPRPSLLESHISLMHGIRNPDLSQ----TSKVKP .: : .: ..: :.:..: .. .: . .::.:..:::::..:::.. :.. . KIAA16 CRHNRIKHKGIRKVYACSHCPDSRRTFTKRLMLEKHVQLMHGIKDPDLKEMTDATNEEET 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1140 1150 1160 1170 1180 1190 KIAA02 PGGHSPQVNHLKRPVSGVGDAPGTSNGATVSSTKRHK-SLFQ---CAKCSFATDSGLEFQ .. .: :: . :: .. :. : ..:. :: :.:.:.. :.:. KIAA16 EIKEDTKVPSPKRKLEEPVLEFRPPRGAITQPLKKLKINVFKVHKCAVCGFTTENLLQFH 1160 1170 1180 1190 1200 1210 1200 1210 1220 1230 1240 1250 KIAA02 SHIPQHQVDSSTAQCLLCGLCYTSASSLSRHLFIVHKVRDQEEEEEEEAAAAEMAVEVAE :::::. :.:. :: ::::::: :::::::::::... . ....:. . : KIAA16 EHIPQHKSDGSSYQCRECGLCYTSHVSLSRHLFIVHKLKEPQPVSKQNGAGEDNQQENKP 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1260 1270 1280 1290 1300 1310 KIAA02 PEEGSGEEVPMETRENGLEECAGEPLSADPEARRLLGPAPEDDGGHNDHSQPQASQDQDS .: . . . :. . :: KIAA16 SHEDESPDGAVSDRKCKV--CAKTFETEAALNTHMRTHGMAFIKSKRMSSAEK 1280 1290 1300 1310 1320 >>KIAA1441 ( 1258 res) hg02860b (1258 aa) initn: 2075 init1: 519 opt: 641 Z-score: 322.1 bits: 71.8 E(): 8e-13 Smith-Waterman score: 2174; 36.124% identity (59.171% similar) in 1254 aa overlap (51-1229:22-1182) 30 40 50 60 70 80 KIAA02 YGDRGRGGSKAERGGPYLPRIPVSPCQHPAMGDMKTPDFDDLLAAFDIPDPTSLDAKEAI :::::::::::::::::::: .::.::: KIAA14 ELSFPLLSLDFGAHQGLGSADMGDMKTPDFDDLLAAFDIPD---IDANEAI 10 20 30 40 90 100 110 120 KIAA02 QTPSEENESPLKP----PGICMD-ESVSLSHSGSAPDVPA--------------VSVIVK .. ::::.: : ::. . :... . .:..: ::: :::::: KIAA14 HSGPEENEGPGGPGKPEPGVGSESEDTAAASAGDGPGVPAQASDHGLPPPDISVVSVIVK 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 KIAA02 NTSRQESFEAEKDHITPSLLHNGFRGSDLPPDPHNCGKFDSTFMNGDSARSFPGKLEPPK :: :. :: . . . . .. : :: .... : :. :.:: . : KIAA14 NTVCPEQSEALAGGSAGDGAQAAGVTKEGPVGPH---RMQNGF--GSPEPSLPGTPHSPA 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 KIAA02 SEPLPTFNQFSPISSPEPEDPIKDNGFGIKP-KHSDSYFPPPLGCGAVGGPVLE-ALAKF :... . . . : : . :: .: ::: .:: .. .:. : ::. KIAA14 PPSGGTWKE-KGMEGKTPLDLFAH--FGPEPGDHSDP-LPP-----SAPSPTREGALTPP 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 290 KIAA02 PVP---ELHMFDHFCKKEPKPEPLPLGSQQEHEQSGQNTVEPHKDPDATRFFGEALEFNS : : :: . . . : : :::. . :.. ::. :.. : . : KIAA14 PFPSSFELAQENGPGMQPPVSSP-PLGALK------QESCSPHH-PQVLAQQGSG----S 220 230 240 250 260 300 310 320 330 340 350 KIAA02 HPSNSIGESKGLARELGTCSSVPPRQRLKPAHSKLSSCVAALVALQAKRVASVTKEDQPG :. : .. . .: :: . : .. . . :.. .. . .:: KIAA14 SPK---------ATDIPASASPPPVAGV-PFFKQSPGHQSPLASPKVPVCQPLKEED--- 270 280 290 300 360 370 380 390 400 410 KIAA02 HTKDLSGPTKESSKGSPKMPKSPKSPRSPLEATRKSIKPSDSPRSICSDSSSKGSPSVAA : ::. .:: : ::.:: : :: .: .:. ::. .. KIAA14 ---DDEGPVDKSS------PGSPQSPSSGAEA---------------ADEDSNDSPASSS 310 320 330 340 420 430 440 450 460 470 KIAA02 SSPPAIPKVRIKTIKTSSGEIKRTVTRILPDPDDPSKSPVGSPLGSAIAEAPSEMPGDEV : : :::::::::: :.: ::::.. ::: :. :.. :. .::: . . KIAA14 SRPL---KVRIKTIKTSCGNITRTVTQVPSDPDPPA--PLAE--GAFLAEASLLKLSPAT 350 360 370 380 390 480 490 500 510 520 530 KIAA02 PVEEHFPEAGTNSGSPQGAR-KGDESMTKASDSSSPSCSSGPRVPKGAA--PGSQTGKKQ :. : .... :. :.: :: . . ...: . . : . :. ::. :. . KIAA14 PTSEGPKVVSVQLGD--GTRLKGTVLPVATIQNASTAMLMAASVARKAVVLPGG-TATSP 400 410 420 430 440 450 540 550 560 570 580 590 KIAA02 QSTALQASTLAPANLLPKAVHLANLNLVPHSV-AASVTAKSSVQRRSQPQLTQMSVPLVH . : .. :.: . :::: :.:. ..: .:::. . . . :. .: KIAA14 KMIAKNVLGLVP-QALPKADGRAGLGTGGQKVNGASVVMVQPSKTATGPSTGGGTV---- 460 470 480 490 500 510 600 610 620 630 640 650 KIAA02 QVKKAAPLIVEVFNKVLHSSNPVPLYAPNLSPPADSRIHVPASGYCCLECGDAFALEKSL .... .::.:::.:.:.: .: : :::::::.. . .: .:: ::::::::.::::: KIAA14 -ISRTQSSLVEAFNKILNSKNLLPAYRPNLSPPAEAGLALPPTGYRCLECGDAFSLEKSL 520 530 540 550 560 660 670 680 690 700 710 KIAA02 SQHYGRRSVHIEVLCTLCSKTLLFFNKCSLLRHARDHKSKGLVMQCSQLLVKPISADQMF ..:: :::..::: :. :.. :.:::::::: :::.::.::::::::.:...:.. ::: KIAA14 ARHYDRRSMRIEVTCNHCARRLVFFNKCSLLLHAREHKDKGLVMQCSHLVMRPVALDQMV 570 580 590 600 610 620 720 730 740 750 760 KIAA02 VSAPVNSTAPAAPAPSSSP--------KHGLTSGSA----SPPPPALPLYPDPVRLIRYS . .. :.: : :.: .: ..:: . :.::: .: : KIAA14 GQPDITPLLPVAVPPVSGPLALPALGKGEGAITSSAITTVAAEAPVLPLSTEPPAAPATS 630 640 650 660 670 680 770 780 790 800 810 KIAA02 ----IKCLECHKQMRDYMVLAAHFQRTTEETEGLT---CQVCQMLLPNQCSFCAHQRIHA ..::::..: :: .:::::. . : : : .: :.:::.::: ::::.: KIAA14 AYTCFRCLECKEQCRDKAGMAAHFQQLGPPAPGATSNVCPTCPMMLPNRCSFSAHQRMHK 690 700 710 720 730 740 820 830 840 850 860 870 KIAA02 HKSPYCCPECGVLCRSAYFQTHVKENCLHYARKVGYRCIHCGVVHLTLALLKSHIQERHC .. :. ::::: .: ::::..: ::: .:.::::: :.:: . .::::: :: KIAA14 NRPPHVCPECGGNFLQANFQTHLREACLHVSRRVGYRCPSCSVVFGGVNSIKSHIQTSHC 750 760 770 780 790 800 880 890 900 910 920 930 KIAA02 QVFHKCAFCPMAFKTASSTADHSATQHPTQPHRPSQLIYKCS-CEMVFNKKRHIQQHFYQ .::::: .::::::.. :. : .:::. . ..:::::. :. ::..: ...:: : KIAA14 EVFHKCPICPMAFKSGPSAHAHLYSQHPSFQTQQAKLIYKCAMCDTVFTHKPLLSSHFDQ 810 820 830 840 850 860 940 950 960 970 980 990 KIAA02 NVSKTQVGVFKCPECPLLFVQKPELMQHVKSTHGVPRNVDELSNLQSSAD--TSSSRPGS .. .:.::::: :::::.:: ...:.:.:: : ..: .. ... : ...: KIAA14 HLLPQRVSVFKCPSCPLLFAQKRTMLEHLKNTHQSGR-LEETAGKGAGGALLTPKTEPEE 870 880 890 900 910 920 1000 1010 1020 1030 KIAA02 RVPTE---PPATSVAARSSS---LPSG-RWGRPEAHRRVEARPR-LRNTG-----WTCQE . .. ::: .. :: .::. . :: . : : . :.. : ::: KIAA14 LAVSQGGAAPATEESSSSSEEEEVPSSPEPPRPAKRPRRELGSKGLKGGGGGPGGWTCGL 930 940 950 960 970 980 1040 1050 1060 1070 1080 1090 KIAA02 CQEWVPDRESYVSHMKKSHGRTLKRYPCRQCEQSFHTPNSLRKHIRNNHDTVKKFYTCGY :. : :.:. ::.:::: ::...:..::: ::.:: . :::.:.: ::. .:. : : : KIAA14 CHSWFPERDEYVAHMKKEHGKSVKKFPCRLCERSFCSAPSLRRHVRVNHEGIKRVYPCRY 990 1000 1010 1020 1030 1040 1100 1110 1120 1130 1140 KIAA02 CTEDSPSFPRPSLLESHISLMHGI--------RNPDLSQTS--KVKPPGGHSPQVNHL-- ::: . .: .::.:... ::. :. :.. : ... :: . : . KIAA14 CTEGKRTFSSRLILEKHVQVRHGLQLGAQSPGRGTTLARGSSARAQGPGRKRRQSSDSCS 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1150 1160 1170 1180 1190 1200 KIAA02 KRPVSGVGDAPGTSNGATVSSTKRHKSLFQCAKCSFATDSGLEFQSHIPQHQVDSSTAQC ..: : . : . .: .. : : . ..:. : :: . .:.... :: KIAA14 EEPDSTTPPAKSPRGG---PGSGGHGPL------RYRSSSSTE-QSLMMGLRVEDGAQQC 1110 1120 1130 1140 1150 1210 1220 1230 1240 1250 1260 KIAA02 LLCGLCYTSASSLSRHLFIVHKVRDQEEEEEEEAAAAEMAVEVAEPEEGSGEEVPMETRE : ::::..: .::::: :: :: : KIAA14 LDCGLCFASPGSLSRHRFISHKKRRGVGKASALGLGDGEEEAPPSRSDPDGGDSPLPASG 1160 1170 1180 1190 1200 1210 >>KIAA0478 ( 1253 res) hh05955 (1253 aa) initn: 271 init1: 115 opt: 293 Z-score: 156.8 bits: 41.2 E(): 0.0013 Smith-Waterman score: 352; 20.308% identity (47.619% similar) in 714 aa overlap (442-1119:466-1141) 420 430 440 450 460 470 KIAA02 PSVAASSPPAIPKVRIKTIKTSSGEIKRTVTRILPDPDDPSKSPVGSPLGSAIAEAPSEM : . :.::: :. : : ::. 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