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Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0198, 562 aa vs ./tmplib.23147 library 1986943 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3540+/-0.00769; mu= 12.2906+/- 0.522 mean_var=260.7924+/-65.533, 0's: 0 Z-trim: 62 B-trim: 103 in 1/39 Lambda= 0.079419 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1396 ( 551 res) hj08221 ( 551) 390 57.8 2.6e-09 KIAA1431 ( 891 res) fj00022 ( 891) 391 58.2 3.1e-09 KIAA0924 ( 617 res) hh02883 ( 617) 370 55.5 1.3e-08 KIAA1349 ( 752 res) fj00940 ( 752) 349 53.3 7.9e-08 KIAA1388 ( 599 res) fj06552 ( 599) 343 52.4 1.1e-07 KIAA1231 ( 1061 res) fh08195s1 (1061) 337 52.2 2.4e-07 KIAA1956 ( 680 res) fk08713 ( 680) 316 49.4 1e-06 KIAA2003 ( 460 res) ah02593 ( 460) 311 48.6 1.3e-06 KIAA0065 ( 848 res) ha00946 ( 848) 312 49.1 1.6e-06 KIAA1947 ( 608 res) fh23660 ( 608) 305 48.1 2.3e-06 KIAA2007 ( 580 res) fj01689 ( 580) 302 47.7 2.9e-06 KIAA1611 ( 813 res) fj12627 ( 813) 301 47.8 3.7e-06 KIAA0972 ( 702 res) hj06859 ( 702) 299 47.5 4e-06 KIAA1198 ( 553 res) fg01911 ( 553) 296 47.0 4.5e-06 KIAA1874 ( 579 res) hk07257s1 ( 579) 291 46.4 6.9e-06 KIAA0236 ( 1696 res) ha04654 (1696) 297 47.9 7.4e-06 KIAA1806 ( 481 res) fk00438 ( 481) 285 45.6 1e-05 KIAA1703 ( 1165 res) fj16891 (1165) 287 46.5 1.4e-05 KIAA1871 ( 821 res) hj05256s1 ( 821) 276 45.0 2.7e-05 KIAA0426 ( 613 res) hh01274 ( 613) 272 44.3 3.2e-05 KIAA1508 ( 573 res) hk06576 ( 573) 271 44.1 3.4e-05 KIAA1852 ( 948 res) fj01514 ( 948) 273 44.7 3.7e-05 KIAA1954 ( 468 res) fk02322 ( 468) 266 43.4 4.5e-05 KIAA1015 ( 841 res) hk03609(revised) ( 841) 269 44.2 4.8e-05 KIAA1710 ( 515 res) fj18457 ( 515) 264 43.3 5.6e-05 KIAA0412 ( 720 res) hg03242 ( 720) 266 43.7 5.6e-05 KIAA1829 ( 557 res) hj00069 ( 557) 261 43.0 7.3e-05 KIAA1827 ( 469 res) fk01409 ( 469) 256 42.3 0.0001 KIAA1962 ( 746 res) hm00158 ( 746) 252 42.2 0.00017 KIAA1948 ( 487 res) fh24556 ( 487) 247 41.3 0.00021 KIAA1020 ( 638 res) fg00473s1 ( 638) 248 41.6 0.00022 KIAA0798 ( 682 res) hk06584 ( 682) 248 41.6 0.00023 KIAA1982 ( 599 res) fk06527(revised) ( 599) 247 41.4 0.00023 KIAA1190 ( 174 res) hg03443a ( 174) 239 39.6 0.00023 KIAA0478 ( 1253 res) hh05955 (1253) 250 42.3 0.00026 KIAA1141 ( 914 res) hk01833 ( 914) 246 41.6 0.00031 KIAA0326 ( 927 res) hg00579 ( 927) 245 41.5 0.00034 KIAA1782 ( 545 res) aj00273 ( 545) 239 40.4 0.00042 KIAA1473 ( 574 res) fj03262 ( 574) 238 40.4 0.00046 KIAA2033 ( 766 res) ej00602s1 ( 766) 235 40.2 0.00068 KIAA1615 ( 484 res) fj13419 ( 484) 231 39.4 0.00074 KIAA1969 ( 595 res) fk06944 ( 595) 231 39.6 0.00082 KIAA1572 ( 492 res) fh23424 ( 492) 227 39.0 0.001 KIAA0557 ( 493 res) hh01334 ( 493) 223 38.5 0.0014 KIAA0335 ( 1484 res) pf00495 (1484) 225 39.6 0.0021 KIAA1588 ( 613 res) fj08823 ( 613) 219 38.2 0.0022 KIAA1339 ( 409 res) fj00071 ( 409) 216 37.6 0.0022 KIAA0441 ( 702 res) hh00601s1 ( 702) 219 38.3 0.0023 KIAA0048 ( 627 res) ha01311 ( 627) 218 38.1 0.0024 KIAA0569 ( 1318 res) hh02356 (1318) 216 38.4 0.004 >>KIAA1396 ( 551 res) hj08221 (551 aa) initn: 546 init1: 179 opt: 390 Z-score: 259.1 bits: 57.8 E(): 2.6e-09 Smith-Waterman score: 391; 27.027% identity (59.459% similar) in 222 aa overlap (91-311:202-409) 70 80 90 100 110 KIAA01 FAISLAMTTFFTSVPPWIQDAKQEEEVGWKLVPRPRGREAESQVKCQ-CEISGTPFSNGE :. . : . .:. ::. :. . : . 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KIAA09 KCEEKETLTCEKCPRVFNTRWYLEKHMNVTHRRMQ----ICDKCGKKFVLESELSLHQQT 250 260 270 280 290 300 100 110 120 130 140 150 KIAA01 EAESQVKC-QCEISGTPFSNGEKLRPHS--LPQPEQRPYSCPQLHCGKAFASKYKLYRHM . :....: .:. : :.. .:. : . .. .:: : : : . .. .:: KIAA09 DCEKNIQCVSCNKS---FKKLWSLHEHIKIVHGYAEKKFSCEI--CEKKFYTMAHVRKHM 310 320 330 340 350 160 170 180 190 200 210 KIAA01 ATHSAQKPHQCMYCDKMFHRKDHLRNHLQTHDPNKEALHCSECGKNYNTKLGYRRHLAMH ..:. . : : : : :.:. :. : :. .: ..: .: . .. : : :...: KIAA09 VAHTKDMPFTCETCGKSFKRSMSLKVHSLQHSGEKP-FRCENCDERFQYKYQLRSHMSIH 360 370 380 390 400 410 220 230 240 250 260 270 KIAA01 AASSGDLSCKVCLQTFESTQALLEHLKAHSRRVAGGAKEKKHPCDHCDRRFYTRKDVRRH . . .. :. : . :. : . ::.:.:. : :: :. : . : .: ...:: KIAA09 IGHK-QFMCQWCGKDFNMKQYFDEHMKTHT----G---EKPFICEICGKSFTSRPNMKRH 420 430 440 450 460 470 280 290 300 310 320 330 KIAA01 LVVHTGRKDFLCQYCAQRFGRKDHLTRHVKKSHSQELLKIKTEPVDMLGLLSCSSTVSVK .:::.: . :. :.::: .. : :.:... ... : ::.. .:.. 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KIAA12 --LQCGKAFREKDKLDQHLRFHGREGNCPLTCDLCNKGFISSTSLESHMKLHS-DQKTYS 450 460 470 480 490 500 200 210 220 230 240 250 KIAA01 CSECGKNYNTKLGYRRHLAMHAASSGDLSCKVCLQTFESTQALLEHLKA-HSRRVAGGAK : : .... . :.:.: ..: ..: .: . : . . .:... :: KIAA12 CIFCPESFDRLDLLKDHVAIHI-NDGYFTCPTCKKRFPDFIQVKKHVRSFHS-------- 510 520 530 540 550 260 270 280 290 300 310 KIAA01 EKKHPCDHCDRRFYTRKDVRRHLVVHTGRKDFLCQYCAQRFGRKDHLTRHVKKSHSQELL :: . : .::. : .: :.. :. ::::::. :...: :::.: .:... :. : KIAA12 EKIYQCTECDKAFCRPDKLRLHMLRHSDRKDFLCSTCGKQFKRKDKLREHMQRMHNPERE 560 570 580 590 600 610 320 330 340 350 360 370 KIAA01 KIKTEPVDMLGLLS--CSSTVSVKEELSPVLCMASRDVMGTKAFPGMLPMGMYGAHIPTM :.. .. .. .:: . .. ::: :: . ::: . : : : KIAA12 AKKADRISRSKTFKPRITSTDYDSFTFKCRLCM-----MGFRRR-GMLVNHLSKRH-PDM 620 630 640 650 660 380 390 400 410 420 430 KIAA01 PSTGVPHSLVHNTLPMGMSYPLESSPISSPAQLPPKYQLGSTSYLPDKLPKVEVDSFLAE ::. :::. 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