# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/ha01026.fasta.nr -Q ../query/KIAA0167.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0167, 844 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7815142 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8174+/-0.000195; mu= 11.2681+/- 0.011 mean_var=108.8954+/-20.945, 0's: 23 Z-trim: 78 B-trim: 145 in 1/65 Lambda= 0.122905 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|15625582|gb|AAL04171.1|AF413077_1 centaurin gam ( 836) 5455 978.6 0 gi|109097489|ref|XP_001116290.1| PREDICTED: centau ( 836) 5385 966.2 0 gi|194212311|ref|XP_001917890.1| PREDICTED: centau ( 835) 5285 948.4 0 gi|109480648|ref|XP_576238.2| PREDICTED: similar t ( 836) 5248 941.9 0 gi|119617454|gb|EAW97048.1| centaurin, gamma 1, is ( 856) 3345 604.4 6.2e-170 gi|170650694|ref|NP_001116244.1| centaurin, gamma (1192) 3011 545.4 5.3e-152 gi|97535883|sp|Q99490.2|AGAP2_HUMAN RecName: Full= (1192) 3011 545.4 5.3e-152 gi|114644123|ref|XP_509171.2| PREDICTED: centaurin (1192) 3002 543.8 1.6e-151 gi|193783765|dbj|BAG53747.1| unnamed protein produ ( 848) 2993 542.0 3.8e-151 gi|119892427|ref|XP_581013.3| PREDICTED: similar t (1188) 2977 539.3 3.5e-150 gi|109097487|ref|XP_001116285.1| PREDICTED: centau (1192) 2976 539.2 3.9e-150 gi|73968517|ref|XP_538251.2| PREDICTED: similar to ( 744) 2970 537.9 5.9e-150 gi|97046551|sp|Q3UHD9.1|AGAP2_MOUSE RecName: Full= (1186) 2933 531.5 7.7e-148 gi|81900368|sp|Q8CGU4.1|AGAP2_RAT RecName: Full=Ar (1186) 2921 529.4 3.4e-147 gi|116487949|gb|AAI25888.1| Zgc:153779 [Danio reri ( 827) 2814 510.3 1.3e-141 gi|9716661|gb|AAF97595.1| nuclear GTPase PIKE [Rat ( 753) 2335 425.3 4.6e-116 gi|74184734|dbj|BAE27969.1| unnamed protein produc ( 681) 1390 257.7 1.2e-65 gi|80978937|ref|NP_001032213.1| centaurin, gamma 2 ( 804) 1390 257.8 1.3e-65 gi|149633412|ref|XP_001508850.1| PREDICTED: simila ( 681) 1389 257.5 1.3e-65 gi|80978934|ref|NP_055729.2| centaurin, gamma 2 is ( 804) 1382 256.4 3.6e-65 gi|109101576|ref|XP_001082744.1| PREDICTED: simila ( 804) 1382 256.4 3.6e-65 gi|15625584|gb|AAL04172.1|AF413078_1 centaurin gam ( 804) 1381 256.2 4.1e-65 gi|119591485|gb|EAW71079.1| centaurin, gamma 2, is ( 804) 1381 256.2 4.1e-65 gi|194665937|ref|XP_001788943.1| PREDICTED: simila ( 899) 1380 256.0 5e-65 gi|148708153|gb|EDL40100.1| centaurin, gamma 2 [Mu ( 804) 1373 254.8 1.1e-64 gi|51315986|sp|Q8BXK8.1|AGAP1_MOUSE RecName: Full= ( 857) 1373 254.8 1.1e-64 gi|74184704|dbj|BAE27957.1| unnamed protein produc ( 857) 1367 253.7 2.4e-64 gi|7023161|dbj|BAA91862.1| unnamed protein product ( 426) 1359 252.0 3.8e-64 gi|194374627|dbj|BAG62428.1| unnamed protein produ ( 696) 1360 252.4 4.8e-64 gi|114584112|ref|XP_001148486.1| PREDICTED: centau ( 538) 1358 251.9 5.1e-64 gi|26330696|dbj|BAC29078.1| unnamed protein produc ( 414) 1356 251.5 5.4e-64 gi|160332373|sp|Q9UPQ3.4|AGAP1_HUMAN RecName: Full ( 857) 1360 252.5 5.6e-64 gi|109101574|ref|XP_001082607.1| PREDICTED: simila ( 857) 1360 252.5 5.6e-64 gi|119591484|gb|EAW71078.1| centaurin, gamma 2, is ( 857) 1359 252.3 6.3e-64 gi|118093312|ref|XP_421880.2| PREDICTED: similar t (1213) 1361 252.8 6.4e-64 gi|73994179|ref|XP_848466.1| PREDICTED: similar to ( 936) 1359 252.3 6.8e-64 gi|194211459|ref|XP_001915945.1| PREDICTED: simila ( 946) 1358 252.2 7.7e-64 gi|189520208|ref|XP_001921526.1| PREDICTED: simila ( 857) 1347 250.2 2.8e-63 gi|126341186|ref|XP_001371571.1| PREDICTED: simila ( 872) 1334 247.9 1.4e-62 gi|29476829|gb|AAH48300.1| CENTG3 protein [Homo sa ( 403) 1326 246.1 2.1e-62 gi|194210144|ref|XP_001495190.2| PREDICTED: centau ( 871) 1325 246.3 4.2e-62 gi|149046527|gb|EDL99352.1| centaurin, gamma 3 (pr ( 538) 1321 245.4 4.9e-62 gi|149046528|gb|EDL99353.1| centaurin, gamma 3 (pr ( 682) 1321 245.5 5.7e-62 gi|52545657|emb|CAC09448.2| hypothetical protein [ ( 356) 1312 243.6 1.1e-61 gi|14042076|dbj|BAB55097.1| unnamed protein produc ( 360) 1312 243.6 1.1e-61 gi|119574410|gb|EAW54025.1| centaurin, gamma 3, is ( 683) 1312 243.9 1.7e-61 gi|97535922|sp|Q96P47.2|AGAP3_HUMAN RecName: Full= ( 875) 1312 244.0 2.1e-61 gi|15625586|gb|AAL04173.1|AF413079_1 centaurin gam ( 876) 1312 244.0 2.1e-61 gi|110227613|ref|NP_114152.3| centaurin, gamma 3 i ( 911) 1312 244.0 2.1e-61 gi|21755825|dbj|BAC04766.1| unnamed protein produc ( 467) 1307 242.8 2.5e-61 >>gi|15625582|gb|AAL04171.1|AF413077_1 centaurin gamma1 (836 aa) initn: 5455 init1: 5455 opt: 5455 Z-score: 5229.1 bits: 978.6 E(): 0 Smith-Waterman score: 5455; 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