# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/ha01026.fasta.huge -Q ../query/KIAA0167.ptfa ./tmplib.23147 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0167, 844 aa vs ./tmplib.23147 library 1986661 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.6788+/-0.00866; mu= -0.7041+/- 0.587 mean_var=278.0553+/-64.637, 0's: 0 Z-trim: 11 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.076915 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1099 ( 864 res) hk07834 ( 864) 1381 167.1 7.3e-42 KIAA1975 ( 597 res) aj01061 ( 597) 1208 147.7 3.4e-36 KIAA1716 ( 804 res) hj06603 ( 804) 429 61.4 4.4e-10 KIAA0041 ( 781 res) ha00469s1 ( 781) 407 59.0 2.3e-09 KIAA1249 ( 949 res) hh04184 ( 949) 401 58.4 4.2e-09 KIAA0050 ( 796 res) ha01557 ( 796) 381 56.1 1.8e-08 KIAA0400 ( 1022 res) hg01091 (1022) 379 56.0 2.4e-08 KIAA0580 ( 1631 res) hj00601s1 (1631) 340 51.9 6.6e-07 KIAA0782 ( 1281 res) hk05405s1 (1281) 333 51.0 9.7e-07 KIAA0148 ( 704 res) fh23975 ( 704) 302 47.3 7e-06 >>KIAA1099 ( 864 res) hk07834 (864 aa) initn: 2509 init1: 1259 opt: 1381 Z-score: 843.4 bits: 167.1 E(): 7.3e-42 Smith-Waterman score: 2895; 55.825% identity (79.369% similar) in 824 aa overlap (5-812:57-845) 10 20 30 KIAA01 PGKTGLGNMHAQRQFV-VAAVRAEVRRHEVAKQA : .:. :.:.. ::.:::..: : .. KIAA10 LPGGCGAPGSAARGPRGAGRRRRGARGSGRGACTMNYQQQLANSAAIRAEIQRFESVHPN 30 40 50 60 70 80 40 50 60 70 80 90 KIAA01 LNRLRKLAERVDDPELQDSIQASLDSIREAVINSQEWTLSRSIPELRLGVLGDARSGKSS . . .: :::..: ::..:. . .:..: .::::::::::.:::..:..:. ::::. KIAA10 IYSIYELLERVEEPVLQNQIREHVIAIEDAFVNSQEWTLSRSVPELKVGIVGNLASGKSA 90 100 110 120 130 140 100 110 120 130 140 150 KIAA01 LIHRFLTGSYQVLEKTESEQYKKEMLVDGQTHLVLIREEAGAPDAKFSGWADAVIFVFSL :.::.:::.: :. :. ..:::..::::..:.:::.:.: :.:.:. :.::::::::: KIAA10 LVHRYLTGTYVQEESPEGGRFKKEIVVDGQSYLLLIRDEGGPPEAQFAMWVDAVIFVFSL 150 160 170 180 190 200 160 170 180 190 200 210 KIAA01 EDENSFQAVSRLHGQLSSLRGEGRGGLALALVGTQDRISASSPRVVGDARARALCADMKR ::: :::.: . ...... :. .. . :.:::::: ::...:::. ::::: : :.:: KIAA10 EDEISFQTVYHYYSRMANYRNTSE--IPLVLVGTQDAISSANPRVIDDARARKLSNDLKR 210 220 230 240 250 260 220 230 240 250 260 KIAA01 CSYYETCATYGLNVDRVFQEVAQKVVTLRKQQQL-LAACKSLPSSPSHSAA-STPVAG-- :.::::::::::::.::::.::::.:. ::.::: .. :::::.:::::.. :. :.. KIAA10 CTYYETCATYGLNVERVFQDVAQKIVATRKKQQLSIGPCKSLPNSPSHSSVCSAQVSAVH 270 280 290 300 310 320 270 280 290 300 310 320 KIAA01 --QASNGGHT-SDYSSSLPSSPNVGHRELRAEAAAVAGLSTPGSLHRAAKRRTSLFANRR :.:::: . ::::::.::.:.....::: .. .: .:: ... .:::..::..:. KIAA10 ISQTSNGGGSLSDYSSSVPSTPSISQKELRIDVPPTA--NTPTPVRKQSKRRSNLFTSRK 330 340 350 360 370 380 330 340 350 360 370 380 KIAA01 GSD--SEKRSLDSRGETTGSGRAIPIKQSFLLKRSGNSLNKEWKKKYVTLSSNGFLLYHP ::: .::..:.::... ::::::::::..::::::.::::::::::::: .:: : ::: KIAA10 GSDPDKEKKGLESRADSIGSGRAIPIKQGMLLKRSGKSLNKEWKKKYVTLCDNGVLTYHP 390 400 410 420 430 440 390 400 410 420 430 440 KIAA01 SINDYIHSTHGKEMDLLRTTVKVPGKRPPRAISAFGP--SASINGLVKDMSTVQMGEGLE :..::....::::.::::::::::::::::: :: .: : . ::: ::::.... KIAA10 SLHDYMQNVHGKEIDLLRTTVKVPGKRPPRATSACAPISSPKTNGLSKDMSSLHI----- 450 460 470 480 490 450 460 470 480 490 500 KIAA01 ATTPMPSPSPSPSSLQPPPDQTSKHLLKPDRNLARALSTDCTPSGDLSPLSREPPPSPMV ::.: : .:. .. .. . :. :: . .::::: . KIAA10 ----------SPNS---------------DTGLGDSVCSSPSISSTTSP-KLDPPPSPHA 500 510 520 530 510 520 530 540 550 KIAA01 --KKQRRKKLTTPSKTEGSAGQAEE--ENFEFLIVSSTGQTWHFEAASFEERDAWVQAIE ::.:::: :. :..: .: ::: :::::.::: :::::::::...::::::::::: KIAA10 NRKKHRRKKSTSNFKADGLSGTAEEQEENFEFIIVSLTGQTWHFEATTYEERDAWVQAIE 540 550 560 570 580 590 560 570 580 590 600 610 KIAA01 SQILASLQCCESSKVKLRTDSQSEAVAIQAIRNAKGNSICVDCGAPNPTWASLNLGALIC :::::::: ::::: : : :::::.:.:.::: .::: :::: . ::.:::::::::.: KIAA10 SQILASLQSCESSKNKSRLTSQSEAMALQSIRNMRGNSHCVDCETQNPNWASLNLGALMC 600 610 620 630 640 650 620 630 640 650 660 670 KIAA01 IECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPRELTLVLTAIGNDTANRVWESDTRGRAKPSRDSS :::::::::::::::::::::::::: :: :...:::. :: ::: ...::.::: ::. KIAA10 IECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPIELIKVMSSIGNELANSVWEESSQGRTKPSVDST 660 670 680 690 700 710 680 690 700 710 720 730 KIAA01 REERESWIRAKYEQLLFLAPLSTSEEPLGRQLWAAVQAQDVATVLLLLAHARHGPLDTSV :::.: :::::::: :::::: .: ::..: :. .:. :..:::::. . .. . KIAA10 REEKERWIRAKYEQKLFLAPLPCTELSLGQHLLRATADEDLRTAILLLAHGSRDEVNETC 720 730 740 750 760 770 740 750 760 770 780 790 KIAA01 EDPQLRSPLHLAAELAHVVITQLLLWYGADVAARDAQGRTALFYARQAGSQLCADILLQH . . :. :::: . ..::..:::.:::.::.::::.: ::: :::::.:: : :.:::. KIAA10 GEGDGRTALHLACRKGNVVLAQLLIWYGVDVTARDAHGNTALAYARQASSQECIDVLLQY 780 790 800 810 820 830 800 810 820 830 840 KIAA01 GCPGEGGSAATTPSAATTPSITATPSPRRRSSAASVGRADAPVALV ::: : .::. KIAA10 GCPDERFVLMATPNLSRRNNNRNNSSGRVPTII 840 850 860 >>KIAA1975 ( 597 res) aj01061 (597 aa) initn: 1461 init1: 1176 opt: 1208 Z-score: 741.6 bits: 147.7 E(): 3.4e-36 Smith-Waterman score: 1604; 48.457% identity (73.140% similar) in 551 aa overlap (259-803:79-595) 230 240 250 260 270 280 KIAA01 RVFQEVAQKVVTLRKQQQLLAACKSLPSSPSHSAASTPVAGQASNGGHTSDYSSSLPSSP : . ... .. . ..:: ..::::.: .: KIAA19 TIISVTLEIHHHITERDADRSLTILDEQLYSFAFSTVHITKKRNGGGSLNNYSSSIPLTP 50 60 70 80 90 100 290 300 310 320 330 340 KIAA01 NVGHRELRAEAAAVAGLSTPGSLHRAAKRRTSLFANRRGSDSEK--RSLDSRGETTGSGR ......: . .: .:: . . . ..::....::: .: ..:.:...: :::: KIAA19 STSQEDLYFSVPPTA--NTPTPICKQSMGWSNLFTSEKGSDPDKGRKALESHADTIGSGR 110 120 130 140 150 160 350 360 370 380 390 400 KIAA01 AIPIKQSFLLKRSGNSLNKEWKKKYVTLSSNGFLLYHPSINDYIHSTHGKEMDLLRTTVK ::::::..::::::. : : :::::::: ::: : :. :..::... : ::.:: .:.: KIAA19 AIPIKQGMLLKRSGKWL-KTWKKKYVTLCSNGVLTYYSSLGDYMKNIHKKEIDLRTSTIK 170 180 190 200 210 220 410 420 430 440 450 460 KIAA01 VPGKRPPRAISAFGP--SASINGLVKDMSTVQMGEGLEATTPMPSPSPSPSSLQPPPDQT :::: : : :: .: :.. ::: ::: ...:. . . : ::: KIAA19 VPGKWPSLATSACAPISSSKSNGLSKDMEALHMSANSDIGLG-DSICFSPS--------- 230 240 250 260 270 470 480 490 500 510 520 KIAA01 SKHLLKPDRNLARALSTDCTPSGDLSPLSREPPPSPMVKKQR--RKKLTTPSKTEGSAGQ .:. .:. .: :::: ..:.. .:: :. : .: .. KIAA19 --------------ISSTTSPKLNL-------PPSPHANKKKHLKKKSTNNLKDDGLSST 280 290 300 310 530 540 550 560 570 580 KIAA01 AEEENFEFLIVSSTGQTWHFEAASFEERDAWVQAIESQILASLQCCESSKVKLRTDSQSE ::::. .:.::: :::: ::.:...::::::::::.:::::::: ::::: : . :::: KIAA19 AEEEEEKFMIVSVTGQTCHFKATTYEERDAWVQAIQSQILASLQSCESSKSKSQLTSQSE 320 330 340 350 360 370 590 600 610 620 630 640 KIAA01 AVAIQAIRNAKGNSICVDCGAPNPTWASLNLGALICIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDD :.:.:.:.: .::: :::: . :: :::::::.:.:::::::::.:::.:::::::.::: KIAA19 AMALQSIQNMRGNSHCVDCETQNPKWASLNLGVLMCIECSGIHRSLGTRLSRVRSLELDD 380 390 400 410 420 430 650 660 670 680 690 700 KIAA01 WPRELTLVLTAIGNDTANRVWESDTRGRAKPSRDSSREERESWIRAKYEQLLFLAPLSTS :: :: :...:::: :: .::....:..::: .:.:::.: :::.:::. :::::: . KIAA19 WPVELRKVMSSIGNDLANSIWEGSSQGQTKPSIESTREEKERWIRSKYEHKLFLAPLPCT 440 450 460 470 480 490 710 720 730 740 750 760 KIAA01 EEPLGRQLWAAVQAQDVATVLLLLAHARHGPLDTSVEDPQLRSPLHLAAELAHVVITQLL : ::..: :. .:. :..:::::. . .. . . . . :::: . ..::..::: KIAA19 ELSLGQHLLRATADEDLRTAILLLAHGSREEVNETCGEGDGCTALHLACRKGNVVLAQLL 500 510 520 530 540 550 770 780 790 800 810 820 KIAA01 LWYGADVAARDAQGRTALFYARQAGSQLCADILLQHGCPGEGGSAATTPSAATTPSITAT .:::.:: ::::.: ::: :::::.:: : ..:::.::: : KIAA19 IWYGVDVMARDAHGNTALTYARQASSQECINVLLQYGCPDECV 560 570 580 590 830 840 KIAA01 PSPRRRSSAASVGRADAPVALV >>KIAA1716 ( 804 res) hj06603 (804 aa) initn: 520 init1: 330 opt: 429 Z-score: 272.9 bits: 61.4 E(): 4.4e-10 Smith-Waterman score: 469; 38.916% identity (68.473% similar) in 203 aa overlap (525-704:330-531) 500 510 520 530 540 550 KIAA01 EPPPSPMVKKQRRKKLTTPSKTEGSAGQAEEENFEFLIVSSTGQTWHFEAASFEERDAWV :. : : ..: : .. ..: : . :.::: KIAA17 QLVYQKKLKDALTVVVDDLRLCSVKPCEDIERRFCFEVLSPT-KSCMLQADSEKLRQAWV 300 310 320 330 340 350 560 570 580 590 KIAA01 QAIESQILASLQ----CCES-----------SKVKLRTDSQSEAV----AIQAIRNAKGN ::....: .. . : : :.. ::.. ..: ..: .... :: KIAA17 QAVQASIASAYRESPDSCYSERLDRTASPSTSSIDSATDTRERGVKGESVLQRVQSVAGN 360 370 380 390 400 410 600 610 620 630 640 650 KIAA01 SICVDCGAPNPTWASLNLGALICIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPRELTLVLTAIG : : ::: :.: :::.:::.:.:::::::::.::.: :.:::: ::.: :: .. .: KIAA17 SQCGDCGQPDPRWASINLGVLLCIECSGIHRSLGVHCSKVRSLTLDSWEPELLKLMCELG 420 430 440 450 460 470 660 670 680 690 700 710 KIAA01 NDTANRVWESDTRGRA--KPSRDSSREERESWIRAKYEQLLFL--APLSTSEEPLGRQLW :...:...:.. .: . ::. .:::...:.::. :: . :: ::.. . : KIAA17 NSAVNQIYEAQCEGAGSRKPTASSSRQDKEAWIKDKYVEKKFLRKAPMAPALEAPRRWRV 480 490 500 510 520 530 720 730 740 750 760 770 KIAA01 AAVQAQDVATVLLLLAHARHGPLDTSVEDPQLRSPLHLAAELAHVVITQLLLWYGADVAA KIAA17 QKCLRPHSSPRAPTARRKVRLEPVLPCVAALSSVGTLDRKFRRDSLFCPDELDSLFSYFD 540 550 560 570 580 590 >>KIAA0041 ( 781 res) ha00469s1 (781 aa) initn: 438 init1: 321 opt: 407 Z-score: 259.8 bits: 59.0 E(): 2.3e-09 Smith-Waterman score: 439; 38.725% identity (64.216% similar) in 204 aa overlap (525-709:328-529) 500 510 520 530 540 550 KIAA01 EPPPSPMVKKQRRKKLTTPSKTEGSAGQAEEENFEFLIVSSTGQTWHFEAASFEERDAWV :. : : .:: : .. ..: : . :.::. KIAA00 QLVYQKKFKDNPTVVVEDLRLCTVKHCEDIERRFCFEVVSPT-KSCMLQADSEKLRQAWI 300 310 320 330 340 350 560 570 580 590 KIAA01 QAIESQILASLQCC--ESSKVKLRT-------DSQSEA--------VAIQAIRNAKGNSI .:....: .. . :: :. .. :: .:. :.: .. ::. KIAA00 KAVQTSIATAYREKGDESEKLDKKSSPSTGSLDSGNESKEKLLKGESALQRVQCIPGNAS 360 370 380 390 400 410 600 610 620 630 640 650 KIAA01 CVDCGAPNPTWASLNLGALICIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPRELTLVLTAIGND : ::: .: :::.::: .:::::::::.::.:.:.:::: :: : :: .. .::: KIAA00 CCDCGLADPRWASINLGITLCIECSGIHRSLGVHFSKVRSLTLDTWEPELLKLMCELGND 420 430 440 450 460 470 660 670 680 690 700 710 KIAA01 TANRVWESDTR--GRAKPSRDSSREERESWIRAKYEQLLFLAPLSTSEEPLGRQLWAAVQ . :::.:.... : :: . ..:.:.:..::::: . :. : : : .: KIAA00 VINRVYEANVEKMGIKKP-QPGQRQEKEAYIRAKYVERKFVDKYSISLSPPEQQKKFVSK 480 490 500 510 520 530 720 730 740 750 760 770 KIAA01 AQDVATVLLLLAHARHGPLDTSVEDPQLRSPLHLAAELAHVVITQLLLWYGADVAARDAQ KIAA00 SSEEKRLSISKFGPGDQVRASAQSSVRSNDSGIQQSSDDGRESLPSTVSANSLYEPEGER 540 550 560 570 580 590 >>KIAA1249 ( 949 res) hh04184 (949 aa) initn: 287 init1: 287 opt: 401 Z-score: 255.2 bits: 58.4 E(): 4.2e-09 Smith-Waterman score: 401; 29.825% identity (61.754% similar) in 285 aa overlap (524-797:201-478) 500 510 520 530 540 550 KIAA01 REPPPSPMVKKQRRKKLTTPSKTEGSAGQAEEENFEFLIVSSTGQTWHFEAASFEERDAW ....:... : ..:.::.: . .. :: KIAA12 NGILTISHATSNRQPAKLNLLTCQVKPNAEDKKSFDLI---SHNRTYHFQAEDEQDYVAW 180 190 200 210 220 560 570 580 590 600 610 KIAA01 VQAIESQILASLQCC---ESSKVKLRTDSQSEAVAIQAIRNAKGNSICVDCGAPNPTWAS .... .. .: :.: . .. ..:. :. .. ::.:: :::. .::: : KIAA12 ISVLTNSKEEALTMAFRGEQSAGENSLEDLTKAI-IEDVQRLPGNDICCDCGSSEPTWLS 230 240 250 260 270 280 620 630 640 650 660 670 KIAA01 LNLGALICIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPRELTLVLTAIGNDTANRVWESDTRGR ::: : :::::::::..:.:.::..::.:: :. .::.. : . :.. . KIAA12 TNLGILTCIECSGIHREMGVHISRIQSLELDKLGTSELLLAKNVGNNSFNDIMEANLPSP 290 300 310 320 330 340 680 690 700 710 720 KIAA01 A-KPSRDSSREERESWIRAKYEQLLFLAPL-STSEEPLGRQLWAAVQAQDVATVLLLLAH . ::. .:. :. .: ::: . : ::: :. .: :....:. . :. .. KIAA12 SPKPTPSSDMTVRKEYITAKYVDHRFSRKTCSTSSAKLN-ELLEAIKSRDL--LALIQVY 350 360 370 380 390 400 730 740 750 760 770 780 KIAA01 ARHGPLDTSVEDP--QL-RSPLHLA---AELAHVVITQLLLWYGADVAARDAQGRTALFY :. : . .: .: .. :::: :. . . ....:. ... . : : :.: : KIAA12 AEGVELMEPLLEPGQELGETALHLAVRTADQTSLHLVDFLVQNCGNLDKQTALGNTVLHY 410 420 430 440 450 460 790 800 810 820 830 840 KIAA01 ARQAGSQLCADILLQHGCPGEGGSAATTPSAATTPSITATPSPRRRSSAASVGRADAPVA . .. : .::. KIAA12 CSMYSKPECLKLLLRSKPTVDIVNQAGETALDIAKRLKATQCEDLLSQAKSGKFNPHVHV 470 480 490 500 510 520 >>KIAA0050 ( 796 res) ha01557 (796 aa) initn: 556 init1: 304 opt: 381 Z-score: 244.1 bits: 56.1 E(): 1.8e-08 Smith-Waterman score: 398; 35.146% identity (60.251% similar) in 239 aa overlap (586-811:464-699) 560 570 580 590 600 610 KIAA01 AIESQILASLQCCESSKVKLRTDSQSEAVAIQAIRNAKGNSICVDCGAPNPTWASLNLGA . .... ::. : :: : : :::.:::. KIAA00 GSGHLAIGSAATLGSGGMARGREPGGVGHVVAQVQSVDGNAQCCDCREPAPEWASINLGV 440 450 460 470 480 490 620 630 640 650 660 670 KIAA01 LICIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPRELTLVLTAIGNDTANRVWESDTRGRA--KP .::.::::::.::.:.:.:::: ::.: ::. .. .:: :...:. ... : :: KIAA00 TLCIQCSGIHRSLGVHFSKVRSLTLDSWEPELVKLMCELGNVIINQIYEARVEAMAVKKP 500 510 520 530 540 550 680 690 700 710 720 730 KIAA01 SRDSSREERESWIRAKYEQLLFLAPLSTSEEPLGRQLWAAVQAQDVATVLLLLAHARHGP . . ::.:.:.::.::: . ::. : : ::. . . . . : : KIAA00 GPSCSRQEKEAWIHAKYVEKKFLTKLP---EIRGRRGGRGRPRGQPPVPPKPSIRPRPGS 560 570 580 590 600 610 740 750 760 770 780 KIAA01 LDTSVEDPQLR-SPLHLAAEL----AHVVITQLL---LWYGADVAARDA--QGRTALFYA : .. : :. . :: .: : .: . : .:::: .. .. : :. : KIAA00 LRSKPEPPSEDLGSLHPGALLFRASGHPPSLPTMADALAHGADVNWVNGGQDNATPLIQA 620 630 640 650 660 670 790 800 810 820 830 840 KIAA01 RQAGSQLCADILLQHGCP-GEGGSAATTPSAATTPSITATPSPRRRSSAASVGRADAPVA :.: : ..:::.: ... ::. : KIAA00 TAANSLLACEFLLQNGANVNQADSAGRGPLHHATILGHTGLACLFLKRGADLGARDSEGR 680 690 700 710 720 730 >>KIAA0400 ( 1022 res) hg01091 (1022 aa) initn: 335 init1: 285 opt: 379 Z-score: 241.6 bits: 56.0 E(): 2.4e-08 Smith-Waterman score: 379; 29.474% identity (58.596% similar) in 285 aa overlap (525-797:377-658) 500 510 520 530 540 550 KIAA01 EPPPSPMVKKQRRKKLTTPSKTEGSAGQAEEENFEFLIVSSTGQTWHFEAASFEERDAWV ::. : ..: .:.::.: . .: . :. KIAA04 KNGFLTISHGTANRPPAKLNLLTCQVKTNPEEKKCFDLISHD-RTYHFQAEDEQECQIWM 350 360 370 380 390 400 560 570 580 590 600 610 KIAA01 QAIESQILASLQCCESSKVKLRTDSQSEAVA---IQAIRNAKGNSICVDCGAPNPTWASL ...... .:. .. . .. . .. :. .. ::..: :::::.::: : KIAA04 SVLQNSKEEALNNAFKGDDNTGENNIVQELTKEIISEVQRMTGNDVCCDCGAPDPTWLST 410 420 430 440 450 460 620 630 640 650 660 KIAA01 NLGALICIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPRELTLVLTAIGNDTANRVWES--DTRG ::: : :::::::::.::.: ::..:: :: :. ::: :.. : .. KIAA04 NLGILTCIECSGIHRELGVHYSRMQSLTLDVLGTSELLLAKNIGNAGFNEIMECCLPAED 470 480 490 500 510 520 670 680 690 700 710 720 KIAA01 RAKPSRDSSREERESWIRAKYEQLLFLAPLSTSEEPLGRQLWAAVQAQDVATVLLLLAHA .::. :. . :...: ::: . . ... ..: ::...:. :: :.: KIAA04 SVKPNPGSDMNARKDYITAKYIERRYARKKHADNAAKLHSLCEAVKTRDIFG--LLQAYA 530 540 550 560 570 580 730 740 750 760 770 780 KIAA01 RHGPLDTSVEDPQLRSP----LHLAA---ELAHVVITQLLLWYGADVAARDAQGRTALFY : .. . . : ::::. . . . :...:. .... . ..: ::: : KIAA04 DGVDLTEKIPLANGHEPDETALHLAVRSVDRTSLHIVDFLVQNSGNLDKQTGKGSTALHY 590 600 610 620 630 640 790 800 810 820 830 840 KIAA01 ARQAGSQLCADILLQHGCPGEGGSAATTPSAATTPSITATPSPRRRSSAASVGRADAPVA . . : .::. KIAA04 CCLTDNAECLKLLLRGKASIEIANESGETPLDIAKRLKHEHCEELLTQALSGRFNSHVHV 650 660 670 680 690 700 >>KIAA0580 ( 1631 res) hj00601s1 (1631 aa) initn: 322 init1: 200 opt: 340 Z-score: 215.8 bits: 51.9 E(): 6.6e-07 Smith-Waterman score: 362; 29.032% identity (57.348% similar) in 279 aa overlap (525-797:572-828) 500 510 520 530 540 550 KIAA01 EPPPSPMVKKQRRKKLTTPSKTEGSAGQAEEENFEFLIVSSTGQTWHFEAASFEERDAWV ...::.. . ... : : . .:.. :. KIAA05 CKNEQDFKSGLGITIIPMNVANVKQVDRTVKQSFEII---TPYRSFSFTAETEKEKQDWI 550 560 570 580 590 560 570 580 590 600 610 KIAA01 QAIESQILASLQCCESSKVKLRTDSQSEAVAIQAIRNAKGNSICVDCGAPNPTWASLNLG .:....: .: :. . . : ..: :.:: ::.: :::.:: KIAA05 EAVQQSIAETL---------------SDYEVAEKIWFNESNRSCADCKAPDPDWASINLC 600 610 620 630 640 620 630 640 650 660 670 KIAA01 ALICIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDD--WPRELTLVLTAIGNDTANRVWESDTRGRAK ..:: .:.: ::.:: . :.:::: .: : :: .. .::: :: : .. . . 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KIAA05 -ADVMCATGDPVHSTP-YLLAKKAGQSLQMEFLYHNKFSDFPQHDIHSEGVLSQESSQST 770 780 790 800 810 820 790 800 810 820 830 840 KIAA01 QLCADILLQHGCPGEGGSAATTPSAATTPSITATPSPRRRSSAASVGRADAPVALV :: :.: : KIAA05 FLC-DFLYQAPSAASKLSSEKKLLEETNKKWCVLEGGFLSYYENDKSTTPNGTININEVI 830 840 850 860 870 >>KIAA0782 ( 1281 res) hk05405s1 (1281 aa) initn: 344 init1: 216 opt: 333 Z-score: 212.9 bits: 51.0 E(): 9.7e-07 Smith-Waterman score: 361; 30.242% identity (59.677% similar) in 248 aa overlap (519-762:317-547) 490 500 510 520 530 540 KIAA01 LSPLSREPPPSPMVKKQRRKKLTTPSKTEGSAGQAEEENFEFLIVSSTGQTWHFEAASFE :.:...: . . . ... . . : : : KIAA07 LYVAVVGDKVQLYKNLEEYHLGIGITFIDMSVGNVKEVDRRSFDLTTPYRIFSFSADSEL 290 300 310 320 330 340 550 560 570 580 590 600 KIAA01 ERDAWVQAIESQILASLQCCESSKVKLRTDSQSEAVAIQAIRNAKGNSICVDCGAPNPTW :.. :..:... : .:. .:.: : : : : .:.:::::.: : KIAA07 EKEQWLEAMQGAIAEALS---TSEVAER------------IWAAAPNRFCADCGAPQPDW 350 360 370 380 390 610 620 630 640 650 660 KIAA01 ASLNLGALICIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDD--WPRELTLVLTAIGNDTANRVWESD ::.:: ..:: .:.: ::.::. .:.:::: .: : . : .. .:: ..:: : .. 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KIAA07 VPPSEALQPSSSPSTRRCHLEAKYREGKYRRYHPLFGNQEELDKALCAAVTTTDLAETQA 460 470 480 490 500 510 730 740 750 760 770 780 KIAA01 LLAHARHGPLDTSVEDPQLRSPLHLAAELAHVVITQLLLWYGADVAARDAQGRTALFYAR ::. . . .. ::. .:: :: . .... ..: KIAA07 LLGCG--AGINCFSGDPEAPTPLALAEQAGQTLQMEFLRNNRTTEVPRLDSMKPLEKHYS 520 530 540 550 560 790 800 810 820 830 840 KIAA01 QAGSQLCADILLQHGCPGEGGSAATTPSAATTPSITATPSPRRRSSAASVGRADAPVALV KIAA07 VVLPTVSHSGFLYKTASAGKLLQDRRAREEFSRRWCVLGDGVLSYFENERAVTPNGEIRA 570 580 590 600 610 620 >>KIAA0148 ( 704 res) fh23975 (704 aa) initn: 394 init1: 261 opt: 302 Z-score: 197.4 bits: 47.3 E(): 7e-06 Smith-Waterman score: 428; 33.333% identity (65.753% similar) in 219 aa overlap (593-797:29-244) 570 580 590 600 610 620 KIAA01 ASLQCCESSKVKLRTDSQSEAVAIQAIRNAKGNSICVDCGAPNPTWASLNLGALICIECS ... .:.::..:.:.:::.: :...: :: KIAA01 SAAATAAFAVPRPLVPRRWEVGAMSKRLRSSEVCADCSGPDPSWASVNRGTFLCDECC 10 20 30 40 50 630 640 650 660 670 KIAA01 GIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPRELTLVLTAIGNDTANRVWE-------SDTRGRAKPS- ..::.:: :.:.:: : :: : .. .. :. :: .:: : :: : . KIAA01 SVHRSLGRHISQVRHLKHTPWPPTLLQMVETLYNNGANSIWEHSLLDPASIMSGRRKANP 60 70 80 90 100 110 680 690 700 710 720 KIAA01 RDSSREERESWIRAKYEQLLFLAPL------STSEEPLGRQLWAAVQAQDVATVLLLLAH .:. . .. .:::::..: :. : :.. . :..:: ..:.. .. : : ::. KIAA01 QDKVHPNKAEFIRAKYQMLAFVHRLPCRDDDSVTAKDLSKQLHSSVRTGNLETCLRLLSL 120 130 140 150 160 170 730 740 750 760 770 780 KIAA01 ARHGPLDTSVEDPQLRSPLHLAAELAHVVITQLLLWYGADVAARDAQGRTALFYARQAGS : . . . .:::.:.. .... ..:: :::: ...:..:.: . ::::.: KIAA01 ---GAQANFFHPEKGNTPLHVASKAGQILQAELLAVYGADPGTQDSSGKTPVDYARQGGH 180 190 200 210 220 230 790 800 810 820 830 840 KIAA01 QLCADILLQHGCPGEGGSAATTPSAATTPSITATPSPRRRSSAASVGRADAPVALV . :. :.. KIAA01 HELAERLVEIQYELTDRLAFYLCGRKPDHKNGQHFIIPQMADRRLSLDLSELAKAAKKKL 240 250 260 270 280 290 844 residues in 1 query sequences 1986661 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:10:05 2008 done: Thu Dec 18 15:10:06 2008 Total Scan time: 0.630 Total Display time: 0.220 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]